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医学院校生物化学教学改革反思 预览
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作者 罗育 蔡丹昭 +3 位作者 贺菽嘉 耀 曾麒燕 蓝秀万 《基础医学教育》 2019年第7期518-520,共3页
生物化学是医学院校中一门重要的基础课程。随着我国教育改革的发展,对该课程的教学提出了新的要求,针对这些要求,文章从教学对象、教学目标、教学内容、教学方法等方面进行了总结与反思,以此提高教学能力,改善教学效果来适应当前教育... 生物化学是医学院校中一门重要的基础课程。随着我国教育改革的发展,对该课程的教学提出了新的要求,针对这些要求,文章从教学对象、教学目标、教学内容、教学方法等方面进行了总结与反思,以此提高教学能力,改善教学效果来适应当前教育教学改革的发展。 展开更多
关键词 生物化学 教学改革 教学反思
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虚拟实验促进生物化学实验教学改革实践 预览
2
作者 晁耐霞 周青鸟 +2 位作者 王峰 耀 蓝秀万 《基础医学教育》 2018年第11期1017-1019,共3页
虚拟实验教学是现代生物化学实验教学的有效补充,也是现代实验教育改革发展的前沿。文章着重介绍了广西医科大学生物化学与分子生物学教研室教师设计的虚拟软件、构建虚实结合的实验教学体系、引导学生充分利用虚拟软件进行自主学习、... 虚拟实验教学是现代生物化学实验教学的有效补充,也是现代实验教育改革发展的前沿。文章着重介绍了广西医科大学生物化学与分子生物学教研室教师设计的虚拟软件、构建虚实结合的实验教学体系、引导学生充分利用虚拟软件进行自主学习、指导大学生利用虚拟实验训练辅助课外创新科研课题的开展和提高教师业务水平等具体的改革实践。最后,文章也对虚实结合实验教学实践中的不足进行了思考与总结。 展开更多
关键词 生物化学 实验教学 虚拟实验 教学改革
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雷帕霉素靶蛋白与自噬在衰老中的交互作用
3
作者 王俊杰 蓝秀万 耀 《中国生物化学与分子生物学报》 CSCD 北大核心 2018年第5期494-501,共8页
衰老是一个非常复杂的过程,与细胞和组织中累积的各种大分子(DNA、蛋白质和脂质)损伤密不可分,并且是由细胞中不同的信号通道共同调控的结果,而雷帕霉素靶标途径就是其中的一种。该途径整合了各种来自细胞内外的信号以调控细胞的生长... 衰老是一个非常复杂的过程,与细胞和组织中累积的各种大分子(DNA、蛋白质和脂质)损伤密不可分,并且是由细胞中不同的信号通道共同调控的结果,而雷帕霉素靶标途径就是其中的一种。该途径整合了各种来自细胞内外的信号以调控细胞的生长、增殖和代谢。越来越多证据表明,雷帕霉素靶蛋白(target of rapamycin,TOR)控制着细胞和组织老化的速度,影响着整个机体衰老过程。另外TOR参与调控自噬的发生,而自噬能使生物大分子和细胞器降解并回收重复利用。多种生物模型研究发现,衰老其实是与自噬的不足有关联。本文对TOR和自噬在衰老过程中的作用和相互关系进行综述,为发展与老年疾病相关的新型治疗方法提供思路。 展开更多
关键词 衰老 寿命 雷帕霉素靶蛋白 自噬
甜瓜鲨烯合酶基因克隆及酶分子结构分析 预览 被引量:1
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作者 黄海霞 苏何玲 +5 位作者 史云龙 肖雅伦 谭燕莲 梁杨浩 刘永明 耀 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期373-379,387共8页
葫芦素类是主要分布于葫芦科植物中具有多种医药活性的四环三萜类化合物,目前药用葫芦素原料主要从甜瓜蒂中提取。该研究从甜瓜中克隆葫芦素类合成关键酶——鲨烯合酶(SQS)的基因,并对其序列进行了生物信息学分析。结果表明:DNA测序... 葫芦素类是主要分布于葫芦科植物中具有多种医药活性的四环三萜类化合物,目前药用葫芦素原料主要从甜瓜蒂中提取。该研究从甜瓜中克隆葫芦素类合成关键酶——鲨烯合酶(SQS)的基因,并对其序列进行了生物信息学分析。结果表明:DNA测序和BLASTRefSeqGene分析表明,克隆的甜瓜SQS基因片段具有完整的该酶基因开放阅读框架(ORF)序列。ORF分析显示,甜瓜SQS由417氨基酸残基构成,等电点为7.56。对推衍的甜瓜SQS氨基酸序列分析结果提示,该酶二级结构以α螺旋为主。结构域预测结果表明,SQS属于异戊二烯合酶家族,具有法呢酰基二磷酸及镁离子的结合位点。三级结构预测提示,甜瓜SQS为单体酶,其活性中心主要由几个α螺旋围绕形成的穴状结构。磷酸化位点分析显示,S(48)处于酶活性中心相关(47)VSRSF(52)的模体中,而S(196)是正选择位点,提示这两处磷酸化位点可能是甜瓜SQS酶活性调节的关键部位。以甜瓜SQS基因ORF序列构建系统发生树的系统发生分类结果与形态学分类结果一致。该研究结果为葫芦素类的生物合成调控研究提供了新的线索和实验依据。 展开更多
关键词 甜瓜 鲨烯合酶 基因克隆 序列分析
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马氏珠母贝肉酶解条件优化及其产物活性分析 预览
5
作者 付晶晶 张艳雯 +1 位作者 耀 孙健 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期119-126,共8页
【目的】优化超声波辅助酶解马氏珠母贝肉工艺条件,并对酶解产物进行自由基清除活性分析,为马氏珠母贝肉的高值化利用提供参考依据。【方法】以马氏珠母贝肉为原料,采用单因素及响应面试验分析酶解温度、加酶量、超声功率和酶解时间对... 【目的】优化超声波辅助酶解马氏珠母贝肉工艺条件,并对酶解产物进行自由基清除活性分析,为马氏珠母贝肉的高值化利用提供参考依据。【方法】以马氏珠母贝肉为原料,采用单因素及响应面试验分析酶解温度、加酶量、超声功率和酶解时间对珠母贝肉蛋白质水解度的影响,确定最佳工艺参数,并测定酶解产物对羟基自由基(·OH)、超氧自由基(O2^-)及DPPH自由基(DPPH·)的清除能力。【结果】影响马氏珠母贝肉酶解效果的4个因素主次顺序为:超声波功率〉加酶量〉酶解温度〉酶解时间,其中酶解温度、加酶量和超声波功率影响极显著(P〈0.01),酶解时间及加酶量与超声波功率的交互作用影响显著(P〈0.05)。马氏珠母贝肉最佳超声波辅助酶解条件为:酶解温度48℃、加酶量2200 U/g、超声波功率13%(总输出功率900 W)、酶解时间12 min,在此条件下的蛋白质水解度为21.937%,与预测值(22.140%)的相对误差为0.92%。酶解产物对·OH、和DPPH·的清除能力随酶解产物质量浓度的增加而增强,当质量浓度为2.0 mg/m L时,清除率分别为68.85%、83.62%和82.36%。【结论】优化得到的超声波辅助酶解马氏珠母贝肉工艺参数准确可靠,酶解时间显著缩短,酶解产物具有明显的清除自由基活性,可作为具有抗氧化作用的保健食品、保健酒等产品的优质原料。 展开更多
关键词 马氏珠母贝肉 超声波辅助酶解 响应面法 清除自由基活性
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青皮苦瓜鲨烯合酶基因ORF序列的克隆和正选择分析 被引量:1
6
作者 钱沽颖 马成通 +4 位作者 晁耐霞 陈奇聪 蓝秀万 孙健 耀 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期2114-2124,共11页
为研究葫芦科植物中三萜皂苷生物合成通路中的关键酶鲨烯合酶的分子进化,克隆青皮苦瓜鲨烯合酶基因的cDNA序列,并进行正选择分析。根据葫芦科植物之间的同源性设计青皮苦瓜鲨烯合酶引物。采用3’RACE和5’RACE快速扩增技术分两步进行... 为研究葫芦科植物中三萜皂苷生物合成通路中的关键酶鲨烯合酶的分子进化,克隆青皮苦瓜鲨烯合酶基因的cDNA序列,并进行正选择分析。根据葫芦科植物之间的同源性设计青皮苦瓜鲨烯合酶引物。采用3’RACE和5’RACE快速扩增技术分两步进行巢式PCR扩增鲨烯合酶ORF序列。根据克隆出来的青皮苦瓜编码框序列以及在GenBank数据库中完整的陆生植物鲨烯合酶编码框序列信息,用贝叶斯方法和PAML4软件进行鲨烯合酶的正选择分析。青皮苦瓜鲨烯合酶基因cDNA的克隆,命名为MeSS,其cDNA序列全长为1548bp,ORF1251bp,编码417个氨基酸残基。通过正选择运算,检测到33个正选择位点,其正选择位点主要集中在第二跨膜区及其两侧。本研究成功克隆得到青皮苦瓜鲨烯合酶基因全长cDNA序列并对其正选择分析,在三萜合成通路上为鲨烯合酶的定点突变提供重要参考。 展开更多
关键词 青皮苦瓜 基因克隆 鲨烯合酶 正选择
白皮黄瓜鲨烯合酶基因cDNA克隆及生物信息学分析 被引量:3
7
作者 马成通 钱洁颖 +4 位作者 刘镛 陶晨陈 苏荷玲 晁耐霞 耀 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期183-189,共7页
为认识葫芦科植物中葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因结构特征,克隆白皮黄瓜鲨烯合酶(squalene synthase,SS)基因c DNA并进行生物信息学分析。根据葫芦科植物绞股蓝、罗汉果、红花栝楼等的鲨烯合酶基因cDNA序列,设计白皮黄瓜鲨烯... 为认识葫芦科植物中葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因结构特征,克隆白皮黄瓜鲨烯合酶(squalene synthase,SS)基因c DNA并进行生物信息学分析。根据葫芦科植物绞股蓝、罗汉果、红花栝楼等的鲨烯合酶基因cDNA序列,设计白皮黄瓜鲨烯合酶引物,分别采用3'RACE和5'RACE技术扩增鲨烯合酶基因3'端和5'端。获得白皮黄瓜鲨烯合酶基因的两个cDNA克隆,命名为CsSS1和CsSS2,其cDNA序列全长分别为1 627 bp和1 534 bp,都编码417个氨基酸残基,分子质量为47.6 k D。成功克隆得到白皮黄瓜鲨烯合酶基因全长cDNA序列并对其进行序列分析,后续可用于葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因正选择位点功能分析。 展开更多
关键词 白皮黄瓜 鲨烯合酶 RACE 基因克隆 生物信息学分析
佛手瓜鲨烯合酶基因克隆及酶分子结构分析 预览
8
作者 苏何玲 肖雅伦 +4 位作者 谭燕莲 梁斌 谷云艳 刘永明 耀 《安徽农业科学》 CAS 2016年第32期142-146,共5页
[目的]克隆佛手瓜鲨烯合酶(SQS)基因,并基于克隆的SQS序列分析该酶的分子结构,为佛手瓜生物活性成分的利用提供理论依据。[方法]根据SQS基因5'末端保守序列和3'race方法扩增的佛手瓜SQS基因3'末端序列设计佛手瓜SQS基因克隆引物。... [目的]克隆佛手瓜鲨烯合酶(SQS)基因,并基于克隆的SQS序列分析该酶的分子结构,为佛手瓜生物活性成分的利用提供理论依据。[方法]根据SQS基因5'末端保守序列和3'race方法扩增的佛手瓜SQS基因3'末端序列设计佛手瓜SQS基因克隆引物。扩增的佛手瓜SQS基因片段插入p GEM-T Easy Vector后经DNA测序。应用生物信息学方法分析克隆序列的开放阅读框架(ORF)、酶蛋白的疏水性/亲水性和蛋白质磷酸化位点,预测酶蛋白的二级结构、结构域、三级结构和跨膜区。以布朗葡萄藻为outgroup,应用MEGA 5.0进行UPGMA算法构建系统树,并进行1 000次的Bootstrap测试。[结果]佛手瓜SQS由417氨基酸残基构成,等电点为6.983。构象预测提示该酶二级结构以α螺旋为主,是一种只有三级结构的单体酶,其活性中心是主要由几个α螺旋围绕形成的穴状结构,酶蛋白肽链中具有1个跨膜区。结构域分析表明SQS属于异戊二烯合酶家族。磷酸化位点分析显示该酶共有17个磷酸化位点,其中,S^48位于与酶活性中心相关模体中,而S^196为陆生植物SQS基因的正选择位点。以佛手瓜SQS基因ORF序列构建系统发生树得到的系统发生分类结果与形态学分类结果一致。[结论]佛手瓜SQS是由417氨基酸残基构成的单体酶,具有1个跨膜区和17个磷酸化位点,其中,S48和S196可能是佛手瓜SQS酶活性调节的关键性磷酸化位点。 展开更多
关键词 佛手瓜 鲨烯合酶 基因克隆 结构分析
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红花栝楼鲨烯合酶基因的克隆及其序列分析 被引量:5
9
作者 陶晨陈 马成通 +4 位作者 耀 周青鸟 苏荷玲 晁耐霞 罗育 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1034-1041,共8页
目的克隆红花栝楼鲨烯合酶(squalene synthase,SS)的基因并进行序列分析,为进一步研究葫芦科植物三萜合成通路关键酶SS的正选择位点与功能的关联性分析奠定基础。方法根据绞股蓝与罗汉果SS基因c DNA比对分析的结果,设计SS的5’端简并... 目的克隆红花栝楼鲨烯合酶(squalene synthase,SS)的基因并进行序列分析,为进一步研究葫芦科植物三萜合成通路关键酶SS的正选择位点与功能的关联性分析奠定基础。方法根据绞股蓝与罗汉果SS基因c DNA比对分析的结果,设计SS的5’端简并引物,采用3’RACE扩增红花栝楼SS全长c DNA基因。结果获得红花栝楼SS c DNA全长共1 466个核苷酸,其中包括一个含有1 254个核苷酸的开放读码框,编码417个氨基酸残基。通过NCBI的Blast比对,发现红花栝楼SS基因编码的氨基酸序列与已知植物SS基因编码的氨基酸序列同源性为78%~94%,核苷酸的同源性为74%~93%。结论成功克隆了红花栝楼SS的全长c DNA,为进一步研究红花栝楼SS基因结构、基因表达、基因突变提供了基础,并为葫芦科植物三萜合成通路关键酶SS的正选择位点与功能的关联性分析提供了数据支持。 展开更多
关键词 红花栝楼 鲨烯合酶 RACE 基因克隆 序列分析
绞股蓝法呢基焦磷酸合酶基因的克隆及其序列分析 预览 被引量:6
10
作者 蒋东 唐银琳 +1 位作者 陶晨陈 耀 《生物技术通讯》 CAS 2014年第2期198-202,共5页
目的:克隆并分析绞股蓝法呢基焦磷酸合酶(FPS)基因的全长序列。方法:参照罗汉果法呢基焦磷酸合酶基因,设计扩增绞股蓝FPS基因的3’RACE引物,采用3'RACE和5'RACE法克隆绞股蓝FPS基因全长eDNA。结果:获得绞股蓝FPS基因全长eDNA... 目的:克隆并分析绞股蓝法呢基焦磷酸合酶(FPS)基因的全长序列。方法:参照罗汉果法呢基焦磷酸合酶基因,设计扩增绞股蓝FPS基因的3’RACE引物,采用3'RACE和5'RACE法克隆绞股蓝FPS基因全长eDNA。结果:获得绞股蓝FPS基因全长eDNA序列共1288个核苷酸,包含一个1026核苷酸的开放读框,编码342个氨基酸残基,推断该蛋白的相对分子质量为3.94x10^4。NCBIBlast结果显示绞股蓝FPS基因编码蛋白的氨基酸序列与已知的植物FPS氨基酸序列的同源性为91%~74%,核酸序列的同源性为88%-78%。结论:克隆了绞股蓝FPS基因全长eDNA序列,为进一步研究绞股蓝FPS基因的表达及三萜皂苷合成通路关键酶分子的进化奠定了基础。 展开更多
关键词 绞股蓝 法呢基焦磷酸合酶 基因克隆 序列分析
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人体代谢与疾病课程教学案例的设计及应用 预览 被引量:2
11
作者 耀 贺菽嘉 +6 位作者 蔡丹昭 晁耐霞 凌敏 黄勇奇 林文珍 赵瑞强 罗育 《基础医学教育》 2013年第3期230-233,共4页
在医学教育国际标准“本土化”的背景下,进行课程整合,将传统的生物化学课程中与人体代谢有关的部分内容,结合临床问题,设计人体代谢与疾病整合课程,为这门整合课程设计ffn,~教学案例,从而为开展PBL、CBL、TBL等模式的教学提供相... 在医学教育国际标准“本土化”的背景下,进行课程整合,将传统的生物化学课程中与人体代谢有关的部分内容,结合临床问题,设计人体代谢与疾病整合课程,为这门整合课程设计ffn,~教学案例,从而为开展PBL、CBL、TBL等模式的教学提供相应的素材。 展开更多
关键词 人体代谢与疾病 整合课程 教学案例
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分子医学教学实验室开放管理模式的实践与探索 预览 被引量:2
12
作者 晁耐霞 王启辉 +4 位作者 胡振华 蔡丹昭 贺菽嘉 蓝秀万 耀 《基础医学教育》 2013年第12期1080-1081,共2页
实验室的开放是实验室管理发展的必然趋势,开放管理模式的建设是实验开放良好运转的基础。文章以广西医科大学基础医学院分子医学教学实验室开放管理模式的建设实践出发,从开放内容、实验室管理规章制度、具有实时监控功能的实验室管... 实验室的开放是实验室管理发展的必然趋势,开放管理模式的建设是实验开放良好运转的基础。文章以广西医科大学基础医学院分子医学教学实验室开放管理模式的建设实践出发,从开放内容、实验室管理规章制度、具有实时监控功能的实验室管理系统平台和实验队伍四个方面探讨实验室的开放管理模式的构建。 展开更多
关键词 实验室开放 开放模式 实践与探索
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医学院校生物技术专业建设和人才培养的思考 被引量:5
13
作者 孙健 姜毅 +3 位作者 付晶晶 耀 凌敏 蔡丹昭 《轻工科技》 2013年第6期165-166,214共3页
通过对生物技术与医药行业发展之间关系的阐述,明确医药生物技术人才培养的必要性。在充分了解生物技术专业现状的基础上,提出创办具有医药特色的生物技术专业的具体方法:通过优化课程体系,改变授课方式,增强学生实践能力以及建立优秀... 通过对生物技术与医药行业发展之间关系的阐述,明确医药生物技术人才培养的必要性。在充分了解生物技术专业现状的基础上,提出创办具有医药特色的生物技术专业的具体方法:通过优化课程体系,改变授课方式,增强学生实践能力以及建立优秀的教学团队等措施提高毕业生的综合素质和创新能力,为我国医药生物技术产业的可持续发展提供人才的匹配与支持。 展开更多
关键词 医学院校 生物技术 专业建设 人才培养
陆生植物鲨烯合酶适应性进化正选择位点分析 被引量:5
14
作者 刘镛 耀 +3 位作者 胡艳玲 晁耐霞 唐银琳 蒋东 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期91-97,共7页
鲨烯合酶是三萜类皂苷生物合成途径中的关键酶,其活性的高低决定了三萜皂苷、植物甾醇等后续次生代谢物的含量.对鲨烯合酶进行正选择位点分析,可为识 别重要的功能位点提供有意义的信息.本研究在克隆获得五加科三七、葫芦科绞股蓝... 鲨烯合酶是三萜类皂苷生物合成途径中的关键酶,其活性的高低决定了三萜皂苷、植物甾醇等后续次生代谢物的含量.对鲨烯合酶进行正选择位点分析,可为识 别重要的功能位点提供有意义的信息.本研究在克隆获得五加科三七、葫芦科绞股蓝鲨烯合酶cDNA的基础上,结合GenBank中所登载的植物鲨烯合酶cDNA序列信息,利用位点模型检测并分析了38种陆生植物鲨烯合酶的适应性进化.结果显示,进化上相对保守的鲨烯合酶受到正选择作用,检测到的21个正选择位点大部分集中于第2跨膜区及其两侧,其中189S、194S、196S、265I、389P、390T、408A、410R和414N等9 个位点很可能与鲨烯合酶的活性有关.本研究从分子进化角度为调控三萜类化合物的生物合成提供了一个新的思路. 展开更多
关键词 鲨烯合酶 适应性进化 正选择 陆生植物
DNA条形码(ITS2)在葫芦科鉴定中应用价值的评估 预览 被引量:1
15
作者 唐银琳 刘镛 +4 位作者 姚辉 陈振东 耀 徐鹏 蒋东 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期631-638,共8页
探讨在纳入分析数据时,数据信息的选择对ITS2序列作为DNA条形码在葫芦科植物中鉴定能力的影响。首先,建立由葫芦科植物ITS2序列组成的3个资料组,其中Dataset1为实验样本,Dataset2由实验样本及Gen-Bank数据库样本组合,Dataset3为从Datas... 探讨在纳入分析数据时,数据信息的选择对ITS2序列作为DNA条形码在葫芦科植物中鉴定能力的影响。首先,建立由葫芦科植物ITS2序列组成的3个资料组,其中Dataset1为实验样本,Dataset2由实验样本及Gen-Bank数据库样本组合,Dataset3为从Dataset2中去除部分序列后所得。通过比较3个资料组的种间、种内的变异、Barcoding Gap及鉴定成功率,评估纳入分析的数据选择差异对ITS2鉴定能力的影响。结果显示ITS2序列在3个资料组属水平上的鉴定成功率均达到100%;种水平上,用BLAST1法鉴定成功率分别为100%、67.8%、90.6%,Nearest Distance法鉴定成功率分别为100%、52.5%、66.5%。可见纳入分析的数据选择有差异时,会导致鉴定成功率的较大变化。3个资料组中,ITS2分析仅有Dataset2的Barcoding Gap不够显著。因此对于DNA条形码分析中的数据纳入标准,值得进一步研究。 展开更多
关键词 葫芦科 ITS2 鉴定 应用价值 纳入标准
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在《代谢异常与疾病》课程中开展PBL与CBL的教学研究 预览 被引量:3
16
作者 凌敏 耀 +2 位作者 贺菽嘉 赵瑞强 罗育 《西北医学教育》 2012年第3期550-551,579共3页
在《代谢异常与疾病》课程中实施PBL与CBL的教学实践,开展"以学生为中心"和"自主学习"为主要内容的教育方式,探索有利于培养学生创新性思维和终身学习能力的多元化教学方法。
关键词 代谢异常与疾病 PBL CBL 教学法
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基于DNA条形码(ITS2)的绞股蓝与其混伪品的分子鉴定方法分析 预览 被引量:1
17
作者 刘镛 唐银琳 +2 位作者 耀 蒋东 《中外医疗》 2012年第29期105-106,共2页
目的探讨基于ITS2序列的绞股蓝与其混伪品鉴定的新方法。方法从GenBank中下载绞股蓝及其混伪品的ITS2序列,用软件MEGA4.0等进行相关数据分析,通过ITS2数据库预测ITS2二级结构,并用最大简约法构建系统发育树。结果绞股蓝与其混伪品的ITS... 目的探讨基于ITS2序列的绞股蓝与其混伪品鉴定的新方法。方法从GenBank中下载绞股蓝及其混伪品的ITS2序列,用软件MEGA4.0等进行相关数据分析,通过ITS2数据库预测ITS2二级结构,并用最大简约法构建系统发育树。结果绞股蓝与其混伪品的ITS2序列存在差异,其二级结构在4个螺旋区的茎环数目、大小、位置以及螺旋发出时的角度均有明显差异,绞股蓝最大种内K2P遗传距离远远小于其与混伪品的最小种间K2P遗传距离,构建的系统发育树显示绞股蓝与其混伪品可明显分开。结论基于DNA条形码的ITS2序列为绞股蓝及其混伪品的准确、简便鉴定提供了新的分子鉴定方法。 展开更多
关键词 绞股蓝 ITS2序列 混伪品 分子鉴定
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3种广西钩藤属药用植物的RAPD多态性分析 预览 被引量:1
18
作者 徐鹏 耀 +5 位作者 黄瑞松 周娟 罗育 李科志 唐银琳 刘镛 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期 703-705,共3页
目的运用随机扩增多态性技术探索广西钩藤属药用植物的遗传多态性,为其种质鉴定提供依据。方法采用优化的试剂盒提取法提取大叶钩藤、白钩藤、毛钩藤3种植物的总DNA。用经过筛选的18条10个碱基的随机引物进行PCR扩增。结果优化后的试剂... 目的运用随机扩增多态性技术探索广西钩藤属药用植物的遗传多态性,为其种质鉴定提供依据。方法采用优化的试剂盒提取法提取大叶钩藤、白钩藤、毛钩藤3种植物的总DNA。用经过筛选的18条10个碱基的随机引物进行PCR扩增。结果优化后的试剂盒提取法可有效获取3种钩藤属植物的基因组DNA,18条随机引物扩增得到条带共260条,其中多态性条带231条,多态率达到88.9%,扩增效果好。按UPGMA法进行聚类分析,计算其遗传相似系数,结果显示,5份钩藤供试材料聚为3类。结论 3种广西钩藤属药用植物的聚类结果与其种和地理区域远近一致,与形态学观察可能存在差异。所得RAPD标记可用于钩藤属药用植物的多态性研究,并为今后开发遗传鉴定的分子标记奠定基础。 展开更多
关键词 钩藤属 基因组DNA RAPD 多态性
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采用随机引物组合对绞股蓝作RAPD分析及SCAR鉴定 预览 被引量:3
19
作者 罗育 耀 +2 位作者 周娟 李科志 徐鹏 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期243-247,共5页
为寻找简单、可重复的分子鉴定方法,对绞股蓝(Gynostemma pentaphyllum(Thunb.)Makino)新鲜品、药材干品及其混淆品乌蔹莓(Cayratia japonica(Thunb.)Gagnep)进行了鉴定。首先从2000余条10碱基的随机引物中筛选出20条,并以... 为寻找简单、可重复的分子鉴定方法,对绞股蓝(Gynostemma pentaphyllum(Thunb.)Makino)新鲜品、药材干品及其混淆品乌蔹莓(Cayratia japonica(Thunb.)Gagnep)进行了鉴定。首先从2000余条10碱基的随机引物中筛选出20条,并以5条为1组随机分成4组,然后采用RAPD方法对7份不同来源的绞股蓝新鲜品进行扩增,对扩增得到的绞股蓝特征条带进行基因克隆、测序,分析序列特征,再设计特异性引物,最后.用绞股蓝新鲜品、药材干品及其混淆品乌蔹莓等样品进行PCR验证。结果显示:RAPD扩增能够得到7份绞股蓝新鲜品重复的共有特征条带;经基因克隆、测序并设计特异性引物后进行PCR验证,获得了绞股蓝特异序列扩增区域标志(Sequence—characterized amplified region maker,SCAR)。初步建立了区分绞股蓝及其混淆品乌蔹莓的分子鉴定标准,并首次将SCAR应用于绞股蓝分子鉴定中。 展开更多
关键词 绞股蓝 随机引物组合 RAPD SCAR 分子鉴定标准
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绞股蓝鲨烯环氧酶基因的克隆与序列分析 预览 被引量:10
20
作者 蒋军富 李雄英 +3 位作者 耀 罗育 周娟 赵瑞强 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期 1520-1526,共7页
根据已报道植物鲨烯环氧酶(squalene epoxidase,SE)基因cDNA序列的保守区域设计引物,利用RT-PCR和RACE技术,对绞股蓝SE基因进行克隆及序列分析.结果表明,绞股蓝SE基因cDNA全长为1 818 bp,编码一个由525个氨基酸残基组成的多肽.绞股蓝S... 根据已报道植物鲨烯环氧酶(squalene epoxidase,SE)基因cDNA序列的保守区域设计引物,利用RT-PCR和RACE技术,对绞股蓝SE基因进行克隆及序列分析.结果表明,绞股蓝SE基因cDNA全长为1 818 bp,编码一个由525个氨基酸残基组成的多肽.绞股蓝SE基因编码的氨基酸序列中含有52.4%的非极性疏水性氨基酸,26.1%极性中性氨基酸,9.0%酸性氨基酸,12.6%碱性氨基酸.Blast结果显示,绞股蓝SE基因核苷酸序列与其他已报道的植物SE基因相似性为73%~82%,推导的氨基酸序列相似性为63.2%~79.4%.SE氨基酸序列进化分析发现,绞股蓝SE与绿珊瑚、拟南芥亲缘关系较近. 展开更多
关键词 绞股蓝 鲨烯环氧酶 RACE 克隆 序列分析
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