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草鱼脂酰辅酶A合成酶4基因全长cDNA分子克隆及表达调控 预览
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作者 韩振 高琦 +4 位作者 许建和 易乐飞 申欣 丁祝进 程汉良 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期2442-2450,共9页
本试验采用反转录PCR(RT-PCR)技术克隆草鱼脂酰辅酶A合成酶4(ACSL4)基因全长cDNA,利用实时荧光定量PCR技术研究ACSL4基因在草鱼大脑、心脏、脾脏、肝胰脏、肌肉、肾脏、肠系膜脂肪、前肠、中肠、后肠10种组织中的表达情况,并对投喂不同... 本试验采用反转录PCR(RT-PCR)技术克隆草鱼脂酰辅酶A合成酶4(ACSL4)基因全长cDNA,利用实时荧光定量PCR技术研究ACSL4基因在草鱼大脑、心脏、脾脏、肝胰脏、肌肉、肾脏、肠系膜脂肪、前肠、中肠、后肠10种组织中的表达情况,并对投喂不同淀粉源饲料以及饥饿再投喂0、3、6、12和24h后草鱼肝胰脏中ACSL4基因表达情况进行研究。结果显示:草鱼ACSL4基因cDNA全长2418bp,其开放阅读框2121bp,共编码706个氨基酸;草鱼ACSL4蛋白的氨基酸序列包含1个跨膜结构域、1个脂肪酸绑定基序和1个ATP/AMP绑定基序。草鱼ACSL4mRNA在大脑和脾脏中相对表达量较高,显著高于其他组织(P<0.05),在肌肉中相对表达量最低;投喂不同淀粉源饲料对草鱼肝胰脏中ACSL4mRNA相对表达量无显著影响(P>0.05);饥饿再投喂12h后,草鱼肝胰脏中ACSL4mRNA相对表达量达到最高值,显著高于其他时间段(P<0.05),24h后恢复至最初水平。本试验从草鱼10种混合组织中克隆了ACSL4基因全长cDNA,其所编码的氨基酸序列的主要功能性位点脂肪酸绑定基序和ATP/AMP绑定基序在不同物种间高度保守;草鱼ACSL4基因主要在大脑和脾脏中表达;饲料中淀粉源对草鱼肝胰脏中ACSL4基因的表达无显著影响;在饥饿再投喂12h后,草鱼肝胰脏中ACSL4mRNA相对表达量达到最高值,随后显著下降至最初水平。 展开更多
关键词 草鱼 长链脂酰辅酶A合成酶4 分子克隆 表达调控
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正交各向异性材料结构热变形和热应力分析的无网格法计算模型及应用
2
作者 张建平 王树森 +2 位作者 龚曙光 申欣 胡慧瑶 《复合材料学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1558-1567,共10页
利用无网格伽辽金法(Element-free Galerkin,EFG)建立了正交各向异性材料结构热变形和热应力分析的计算模型,并推导了正交各向异性材料结构热弹性问题的EFG法离散控制方程。选择复合材料冷却栅管算例验证了计算模型和程序的正确性,利用... 利用无网格伽辽金法(Element-free Galerkin,EFG)建立了正交各向异性材料结构热变形和热应力分析的计算模型,并推导了正交各向异性材料结构热弹性问题的EFG法离散控制方程。选择复合材料冷却栅管算例验证了计算模型和程序的正确性,利用该计算模型分析了具有不同材料方向角及热导率因子、热膨胀系数因子和主次泊松比因子的汽轮机叶轮,得到了其热变形总位移和Mises应力,讨论了材料方向角和上述正交各向异性材料因子对其热变形总位移和Mises应力的影响规律,给出了这些参数的合理取值范围,并选取一组参数与各向同性材料结构进行了热变形和热应力对比分析。结果表明,基于EFG法的热变形总位移和Mises应力的计算精度比有限元法高,材料方向角同时影响热变形总位移和Mises应力的大小和方向,而正交各向异性材料因子只影响热变形总位移和Mises应力的大小,不影响其方向。在复合材料结构设计过程中,合理选取材料方向角和正交各向异性材料因子可有效减小结构热变形和热应力。 展开更多
关键词 正交各向异性材料 无网格法 热变形 热应力 材料方向角
基于核基因的无柄目分子系统发育研究 预览
3
作者 李咏琪 蔡月凤 +4 位作者 沈思瑜 宋隽 阎斌伦 程汉良 申欣 《淮海工学院学报》 CAS 2018年第1期88-92,共5页
无柄目是潮间带生态以及海洋污损生物研究中的模式生物.对无柄目17科77属274种的4种核基因(RP-Ⅱ,EF1,18 S,H3)618条核酸序列分别进行了多序列比对及系统发育分析.基于3种核基因RP-Ⅱ,18 S和H 3的进化树显示,在藤壶亚目Balanomorpha... 无柄目是潮间带生态以及海洋污损生物研究中的模式生物.对无柄目17科77属274种的4种核基因(RP-Ⅱ,EF1,18 S,H3)618条核酸序列分别进行了多序列比对及系统发育分析.基于3种核基因RP-Ⅱ,18 S和H 3的进化树显示,在藤壶亚目Balanomorpha中,古藤壶科Archaeobalanidae、藤壶科Balanidae和塔藤壶科Pyrgomatidae形成单系总科Balanoidea;小藤壶科Chthamalidae与笠藤壶科Tetraclitidae成为单系总科Balanoidea的姊妹进化分支,小藤壶科位于系统进化树的基部.基于RP-Ⅱ,EF1和H3的进化树显示,笠藤壶科和小藤壶科是单系群,而藤壶科和古藤壶科是否为单系群尚需进一步探讨 展开更多
关键词 无柄目 核基因 分子系统发育 单系群
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基于项目驱动的食品与生物工程类大学生创新能力培养研究 预览
4
作者 王灵昭 盘赛昆 +3 位作者 张俊杰 董志国 徐军田 申欣 《淮海工学院学报:人文社会科学版》 2018年第4期138-140,共3页
中国特色社会主义进入新时代,要加快建设创新型国家,必须重视大学生的创新能力培养。基于对食品与生物工程类大学生培养的探索,论述了创新能力与大学生培养目标定位的关系、项目驱动大学生创新能力培养的研究必要性、项目驱动大学生创... 中国特色社会主义进入新时代,要加快建设创新型国家,必须重视大学生的创新能力培养。基于对食品与生物工程类大学生培养的探索,论述了创新能力与大学生培养目标定位的关系、项目驱动大学生创新能力培养的研究必要性、项目驱动大学生创新能力培养的策略和方法等系列内容,为大学生创新能力培养提供了理论和技术支持。 展开更多
关键词 TRIZ理论 项目驱动 大学生 创新能力
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煤矸石与石油焦混合燃烧特性及动力学分析 预览
5
作者 宋长忠 石欣颖 申欣 《工业加热》 CAS 2018年第2期28-30,34共4页
采用非等温热重法研究DTA-DTG曲线,对国内大庆原油精炼后的石油焦和锡盟煤矸石混合掺烧。根据不同燃烧温度区间的反应机理不同,进行动力学研究。并计算出活化能、频率因子、燃烧特征参数、燃烧特征指数,分析混合试样燃烧特性与单一试样... 采用非等温热重法研究DTA-DTG曲线,对国内大庆原油精炼后的石油焦和锡盟煤矸石混合掺烧。根据不同燃烧温度区间的反应机理不同,进行动力学研究。并计算出活化能、频率因子、燃烧特征参数、燃烧特征指数,分析混合试样燃烧特性与单一试样燃烧特性的区别。研究结果表明:煤矸石与石油焦混合比例为8:2时燃烧性能最好,着火特性、着火稳定性均优于单一试样。 展开更多
关键词 煤矸石 石油焦 燃烧特性 动力学
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草鱼乙酰辅酶A羧化酶β基因全长cDNA分子克隆与表达分析 预览 被引量:2
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作者 严媛 程汉良 +4 位作者 许建和 韩振 易乐飞 申欣 丁祝进 《动物营养学报》 CSCD 北大核心 2018年第5期1827-1836,共10页
本试验采用反转录PCR(RT-PCR)和c DNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得草鱼乙酰辅酶A羧化酶β(ACC2)基因全长c DNA,并采用实时荧光定量PCR技术研究ACC2基因在肝胰脏、脾脏、大脑、前肠、中肠、后肠、肾脏、肌肉、心脏和肠系膜脂肪... 本试验采用反转录PCR(RT-PCR)和c DNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得草鱼乙酰辅酶A羧化酶β(ACC2)基因全长c DNA,并采用实时荧光定量PCR技术研究ACC2基因在肝胰脏、脾脏、大脑、前肠、中肠、后肠、肾脏、肌肉、心脏和肠系膜脂肪等组织中的表达,同时,还对饲喂不同脂肪源饲料12周后草鱼肝胰脏和肌肉中以及饥饿再次投喂后3、6、12和24 h肝胰脏中ACC2 mRNA的表达变化进行了研究。结果显示:草鱼ACC2基因c DNA全长7 533 bp,含1个7 149 bp的开放阅读框,编码2 382个氨基酸,ACC2蛋白计算分子质量为268.34 ku,等电点为6.13。草鱼ACC2基因存在可变剪接,形成另外1个同工型(isoforms),比分子质量为268.34 ku的ACC2蛋白少8个氨基酸。ACC2基因在所有检测组织中均有表达,ACC2 mRNA的相对表达量在肌肉中最高,为29.13,在肝胰脏中最低,仅为1.90。肌肉中ACC2 mRNA的相对表达量与大脑、前肠和心脏差异不显著(P〉0.05),但显著高于其他组织(P〈0.05)。投喂不同脂肪源饲料对草鱼肝胰脏及肌肉中ACC2 mRNA相对表达量无显著影响(P〉0.05);饥饿再投喂后草鱼肝胰脏中ACC2 mRNA相对表达量在12 h达到高峰值,为6.17,之后明显下降,24 h时仅为2.84。本试验成功克隆了草鱼ACC2基因全长c DNA,其主要的功能位点ATP结合位点、生物素结合位点与其他脊椎动物相比基本保守。草鱼ACC2基因主要在肌肉等脂肪分解活跃的组织中表达,投喂不同脂肪源饲料对草鱼肝胰脏中ACC2 mRNA的相对表达量无显著影响;饥饿再投喂后,肝胰脏中ACC2 mRNA的相对表达量在投喂12 h后最高。 展开更多
关键词 草鱼 乙酰辅酶A羧化酶β 分子克隆 基因表达
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不同产地广东紫珠的连翘酯苷B和金石蚕苷含量测定及指纹图谱
7
作者 郑钦方 丁野 +2 位作者 肖聪颖 申欣 汪冶 《中国医药工业杂志》 CSCD 北大核心 2018年第4期469-473,共5页
采用高效液相色谱法测定了广东紫珠药材中连翘酯苷B和金石蚕苷的含量,并建立了HPLC指纹图谱比较不同产地广东紫珠的质量差异。含量测定结果显示,不同生长环境、不同生长年限的广东紫珠中连翘酯苷B和金石蚕苷含量相差比较大。广东紫珠山... 采用高效液相色谱法测定了广东紫珠药材中连翘酯苷B和金石蚕苷的含量,并建立了HPLC指纹图谱比较不同产地广东紫珠的质量差异。含量测定结果显示,不同生长环境、不同生长年限的广东紫珠中连翘酯苷B和金石蚕苷含量相差比较大。广东紫珠山地2年生栽培品、农田3年生栽培品和野生品的连翘酯苷B和金石蚕苷含量较接近,生长半年的种苗及一年采2次的栽培品与野生品中上述2个成分含量差异较大。20批广东紫珠样品的指纹图谱相似度均大于0.9,聚类分析结果显示,生长半年的种苗与其他样品不同,单独聚为一类。本研究可为广东紫珠药材的质量评价提供参考。 展开更多
关键词 广东紫珠 连翘酯苷B 金石蚕苷 指纹图谱
改良的在体循环法用于胰岛素的鼻腔吸收研究
8
作者 高明月 霍英楠 +1 位作者 申欣 毛世瑞 《药学学报》 CSCD 北大核心 2018年第9期1551-1556,共6页
本文建立了一种适用于胰岛素鼻腔吸收研究的在体实验方法。首先,考察在体鼻循环实验方法对胰岛素的适用性,结果发现,胰岛素存在一定的管路吸附,传统方法不适用于胰岛素的研究;而在循环液中加入0.001%Labrasol可以有效解决胰岛素的管路... 本文建立了一种适用于胰岛素鼻腔吸收研究的在体实验方法。首先,考察在体鼻循环实验方法对胰岛素的适用性,结果发现,胰岛素存在一定的管路吸附,传统方法不适用于胰岛素的研究;而在循环液中加入0.001%Labrasol可以有效解决胰岛素的管路吸附问题,该改良方法可用于胰岛素鼻腔吸收研究。采用该方法考察p H和药物浓度对胰岛素鼻腔吸收的影响,结果表明,相比于p H 4.5和p H 7.4,药物在p H 6.0的条件下吸收速度最低。同时,胰岛素的鼻腔吸收机制可能是基于浓度梯度的被动扩散。 展开更多
关键词 胰岛素 鼻腔在体循环 鼻腔吸收 管路吸附 表面活性剂
原子灰起泡失效分析与控制 预览
9
作者 申欣 《汽车工艺与材料》 2018年第5期41-43,共3页
为确认原子灰起泡原因,采用EDX元素分析、红外光谱分析和显微结构分析,对不同基材、不同电泳漆的性能进行试验对比。结果表明,起泡属于基材、电泳漆及原子灰的综合配套性问题。根据实际生产情况,提高热镀锌表面锌层均匀性、改善电泳漆... 为确认原子灰起泡原因,采用EDX元素分析、红外光谱分析和显微结构分析,对不同基材、不同电泳漆的性能进行试验对比。结果表明,起泡属于基材、电泳漆及原子灰的综合配套性问题。根据实际生产情况,提高热镀锌表面锌层均匀性、改善电泳漆膜致密性或减少原子灰中苯乙烯含量可以有效改善起泡缺陷。 展开更多
关键词 原子灰 起泡 苯乙烯 致密性
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新形势下我校应用型研究生培养模式的探索与实践 预览
10
作者 许冰 申欣 +2 位作者 阎斌伦 田美 程汉良 《考试周刊》 2017年第85期7-8,共2页
我校为顺应经济建设和社会发展新形势对应用型人才的要求,积极把握地缘和资源优势,在应用型研究生培养工作实践中不断创新,对应用型研究生的课程体系、研究生实践基地建设、应用型研究生导师遴选及研究生学位论文评价等方面进行深入探索... 我校为顺应经济建设和社会发展新形势对应用型人才的要求,积极把握地缘和资源优势,在应用型研究生培养工作实践中不断创新,对应用型研究生的课程体系、研究生实践基地建设、应用型研究生导师遴选及研究生学位论文评价等方面进行深入探索,探索出符合我校现状的学校与企业合作、学校与科研院所合作、学校与知名高校合作、学校与地方政府合作等多元联合、多元互补的应用型研究生培养新模式。 展开更多
关键词 应用型研究生 实践基地 培养模式
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褐煤与煤矸石混燃特性及SO2和NOX的析出规律研究 预览
11
作者 申欣 宋长忠 +2 位作者 石欣颖 刘锟 张博文 《内蒙古工业大学学报:自然科学版》 2017年第4期278-283,共6页
为研究褐煤与煤矸石的混燃特性以及S O2 和 NOX 的析出规律, 以便控制污染物排放, 实现褐煤和煤矸石的高效洁净燃烧.试验研究采用了锡盟褐煤和煤矸石, 分别对两种煤样进行工业分析、 元素分析及发热量的测定, 通过SetsysEvo同步热分析... 为研究褐煤与煤矸石的混燃特性以及S O2 和 NOX 的析出规律, 以便控制污染物排放, 实现褐煤和煤矸石的高效洁净燃烧.试验研究采用了锡盟褐煤和煤矸石, 分别对两种煤样进行工业分析、 元素分析及发热量的测定, 通过SetsysEvo同步热分析仪对不同质量分数的褐煤和煤矸石混合试样的燃烧特性进行研究, 并在-台小型循环流化床锅炉试验台上燃烧, 测量烟气中S O2 和NOX 的含量.结果表明: 随着褐煤质量分数的增加, 烟气中S O2 和NOX 的体积分数增大, 其中褐煤质量分数由2 0%增加到4 0%过程中, 烟气中S O2 和 NOX 的体积分数增幅最大.在实验工况下, 当褐煤质量分数为6 0%时, 燃烧特性指数S最大, 最有利于燃烧. 展开更多
关键词 褐煤 煤矸石 循环流化床锅炉 SO2 NOX
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19种蔓足类线粒体基因组特征及系统发育研究 预览 被引量:1
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作者 宋隽 申欣 +5 位作者 蔡月凤 陈盼盼 周亮 田美 程汉良 阎斌伦 《淮海工学院学报》 CAS 2017年第2期88-92,共5页
综合分析了蔓足类19个物种的线粒体基因组全序列,揭示了蔓足类线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因和差异位点等.蔓足类线粒体基因组长度为14906-15955bp,基因组编码链的A+T含量为63.1%-73.1%,表现出不同程度的AT偏好性;19个物种... 综合分析了蔓足类19个物种的线粒体基因组全序列,揭示了蔓足类线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因和差异位点等.蔓足类线粒体基因组长度为14906-15955bp,基因组编码链的A+T含量为63.1%-73.1%,表现出不同程度的AT偏好性;19个物种线粒体基因组的基因总数多数为37个,包括13种蛋白质编码基因、2个rRNA和22个tRNA;除笠藤壶科的基因排列顺序较为保守外,其他科物种的基因排列顺序相差较大;在13个蛋白质编码基因中,ATP8和ND2的差异位点比例最高,COX1最为保守.系统进化分析显示,藤壶科和古藤壶科均非单系群. 展开更多
关键词 蔓足类 藤壶 线粒体基因组 系统发育
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电站锅炉尾部烟道增设低温换热器节能效果分析 预览
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作者 宋长忠 温江汇 +2 位作者 石欣颖 申欣 李玉印 《内蒙古工业大学学报:自然科学版》 2017年第1期14-19,共6页
通过对某135WM机组进行烟气余热回收装置的设计计算,将低温烟气余热回收装置布置于机组吸风机出口至脱硫增压风机入口烟道上,本装置可全年投运,具有良好的节能环保效益,经计算BMCR工况下可回收烟气余热6MW,本装置可为机组增加直接收益20... 通过对某135WM机组进行烟气余热回收装置的设计计算,将低温烟气余热回收装置布置于机组吸风机出口至脱硫增压风机入口烟道上,本装置可全年投运,具有良好的节能环保效益,经计算BMCR工况下可回收烟气余热6MW,本装置可为机组增加直接收益200.13万元每年,节水收益20.57万元每年;还间接提高脱硫除尘效率,降低了脱硫电耗。 展开更多
关键词 烟气余热 低温换热器 节能环保
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135MW循环流化床机组烟气余热三级换热技术 预览
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作者 宋长忠 申欣 +2 位作者 石欣颖 刘锟 张博文 《节能》 2017年第12期56-59,共4页
某135MW循环流化床机组,锅炉运行中发现排烟温度高,大量烟气余热未充分利用,影响了机组的整体经济效益。采用烟气余热三级换热技术对机组烟气系统进行改造,第一级在引风机出口至脱硫增压风机入口烟道上安装H型鳍片管挟热器(FGCl)... 某135MW循环流化床机组,锅炉运行中发现排烟温度高,大量烟气余热未充分利用,影响了机组的整体经济效益。采用烟气余热三级换热技术对机组烟气系统进行改造,第一级在引风机出口至脱硫增压风机入口烟道上安装H型鳍片管挟热器(FGCl),第二级在第一级的后面安装形式相同的H型鳍片管换热器(FGC2),第三级采用氟塑料换热器(FGC3),布置在脱硫塔出口烟道。烟气余热三级换热技术能够适应由于煤质和气候环境的变化,在保证机组的安全可靠运行条件下,经济效益和环保效益显著。所提出的烟气余热品质提升并逐级利用的三级换热技术是一种创新技术,符合我国节能减排的政策,对于更大型的电厂应用也有良好的示范作用,社会效益显著。 展开更多
关键词 循环流化床 烟气系统 余热利用 三级换热 节能 效益分析
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半滑舌鳎乙酰辅酶A羧化酶α基因全长cDNA分子克隆及饲料脂肪水平对其在肝脏中表达的影响 预览 被引量:2
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作者 张夏青 许建和 +7 位作者 潘茜 易乐飞 彭永兴 申欣 阎斌伦 高焕 王雯祥 程汉良 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期485-497,共13页
本试验采用反转录PCR(RT-PCR)和c DNA末端快速扩增(RACE)技术从半滑舌鳎肝脏中克隆了乙酰辅酶A羧化酶α(ACC1)基因全长c DNA,并采用实时荧光定量PCR方法对半滑舌鳎ACC1基因在肠道、肝脏、肌肉、卵巢、脾脏、全脑、肾脏、心脏、肠... 本试验采用反转录PCR(RT-PCR)和c DNA末端快速扩增(RACE)技术从半滑舌鳎肝脏中克隆了乙酰辅酶A羧化酶α(ACC1)基因全长c DNA,并采用实时荧光定量PCR方法对半滑舌鳎ACC1基因在肠道、肝脏、肌肉、卵巢、脾脏、全脑、肾脏、心脏、肠系膜脂肪等组织中的表达进行了研究;此外,还研究了饲料脂肪水平对半滑舌鳎肝脏中ACC1基因表达的影响。结果表明:1)半滑舌鳎ACC1基因c DNA全长7 811 bp,含1个7 074 bp的开放阅读框,编码2 357个氨基酸,ACC1蛋白计算分子质量为266 ku,等电点为6.42。半滑舌鳎ACC1氨基酸序列保守位点包括1个ATP结合位点(Gly^316~Gly^321)、1个生物素结合位点(Val^785)-Met^786)-Lys^787-Met^788)、1个辅酶A结合位点(Ser^1969~Val^1995)。此外,半滑舌鳎ACC1基因存在可变剪接,形成另外2个同工型(isoforms),与分子质量为266 ku的ACC1相比,分别少8和15个氨基酸。2)半滑舌鳎所有组织中均检测到ACC1基因的表达,肝脏和全脑中ACC1 mRNA相对表达量显著高于其他组织(P〈0.05),分别为2.67和2.53;肠道、肠系膜脂肪和卵巢中次之,分别为1.14、1.10和0.97;肾脏中最低,仅为0.48。3)与对照组(未添加鱼油组)相比,3.5%鱼油组肝脏中A CC1 mRNA相对表达量显著降低(P〈0.05);7.0%和10.0%鱼油组肝脏中A CC1 mRNA相对表达量进一步降低,显著低于3.5%组和对照组(P〈0.05),同时10.0%鱼油组低于7.0%鱼油组(P〉0.05)。综上,本试验克隆出了半滑舌鳎ACC1基因的全长c DNA,并得出半滑舌鳎ACC1蛋白的主要功能位点为ATP结合位点、生物素结合位点、辅酶A结合位点,与其他脊椎动物相比基本保守。半滑舌鳎ACC1基因主要在肝脏和全脑等生脂组织中表达,饲料中添加鱼油显著抑制其肝脏中ACC1基因的表达,且抑制作用与鱼油添加量呈正相关。 展开更多
关键词 半滑舌鳎 乙酰辅酶A羧化酶α 分子克隆 营养调控 组织表达
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基于新一代测序技术的A-2O与BIOLAK活性污泥宏基因组比较分析
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作者 田美 刘汉湖 申欣 《环境科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期638-646,共9页
本研究是A2O(anaerobic/anoxic/oxic,厌氧/缺氧/好氧)与百乐克(BIOLAK)活性污泥宏基因组比较分析的首份报告.在百乐克和A2O活性污泥宏基因组中,分别检测到47个和51个门类,超过了澳大利亚强化生物除磷(enhanced biological phosphor... 本研究是A2O(anaerobic/anoxic/oxic,厌氧/缺氧/好氧)与百乐克(BIOLAK)活性污泥宏基因组比较分析的首份报告.在百乐克和A2O活性污泥宏基因组中,分别检测到47个和51个门类,超过了澳大利亚强化生物除磷(enhanced biological phosphorus removal,EBPR)、美国强化生物除磷和Bibby活性污泥中所检测到的生物类群.百乐克活性污泥中所发现的门类,均在A2O活性污泥中检测到.但是,有4个门类仅在A2O活性污泥中出现.Ignavibacteriae门在A2O活性污泥宏基因组中的比例(2.044 0%)是百乐克活性污泥(0.637 6%)的3.2倍.与此同时,芽单胞菌门在百乐克活性污泥宏基因组中的比例是2.467 3%,比其在A2O活性污泥中的比例(0.140 4%)高出17倍多;衣原体门在百乐克活性污泥宏基因组中的比例是0.219 2%,比其在A2O活性污泥中的比例(0.036 0%)高出6倍多.另外,在属的层级,有167个属仅在A2O活性污泥中检出;与此同时,有50个属仅发现于百乐克活性污泥中.因此,在门和属的层级,A2O与百乐克活性污泥的生物群落均存在巨大差异.然而,在百乐克和A2O两个活性污泥中,与氮、磷、硫和芳香族化合物代谢相关的功能基因比例均是非常接近的.此外,两个活性污泥中KEGG(Kyoto Encyclopedia for Genes and Genomes,京都基因与基因组百科全书)所有6个类别的排序均相同.同时,氮代谢相关的功能基因分类和通路分析表明,高丰度酶在百乐克和A2O宏基因组中具有相同的排序.因此,A2O和百乐克活性污泥宏基因组比较分析显示,两个不同的生物群落具有相似的功能分配. 展开更多
关键词 活性污泥 宏基因组 功能分配 生物群落 新一代测序技术
基于SVM的甲壳动物线粒体基因分析方法 预览
17
作者 徐启华 耿帅 +1 位作者 肖晓 申欣 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期54-61,共8页
甲壳动物线粒体基因组蕴涵了物种进化历程中重要的遗传信息,如何有效地利用这些保留在基因组中的基因序列和基因顺序信息,是甲壳动物线粒体基因组研究的一个重点方向。为了进一步探讨甲壳动物稳定、可靠的系统发育关系,本文利用支持向... 甲壳动物线粒体基因组蕴涵了物种进化历程中重要的遗传信息,如何有效地利用这些保留在基因组中的基因序列和基因顺序信息,是甲壳动物线粒体基因组研究的一个重点方向。为了进一步探讨甲壳动物稳定、可靠的系统发育关系,本文利用支持向量机的分类功能实现了甲壳动物线粒体基因组基因区与基因间区、编码区与非编码区的准确分类和预测,同时为了提高分类学习机的泛化能力,使用了交叉验证方法和粒子群算法优化选取支持向量机相关训练参数。通过MATLAB仿真分析的方法,对10种甲壳动物线粒体基因组序列的基因区和基因间区进行分类,以及对5种甲壳动物进行线粒体基因组序列中编码区和非编码区的分类,获得了较好的分类准确率。仿真结果表明本文方法是可行的和有效的,能够出色地应用于甲壳动物线粒体基因组序列的研究分析。 展开更多
关键词 甲壳动物 线粒体 基因分析 支持向量机 交叉验证 粒子群算法
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脊尾白虾线粒体基因组应答饥饿的甲基化特征分析 预览 被引量:2
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作者 高焕 赵莲 +5 位作者 薛蓓 朱国华 赖晓芳 陈建华 申欣 阎斌伦 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期953-961,共9页
为研究脊尾白虾应答饥饿的线粒体基因组表观遗传学特征,本研究在筛选适宜脊尾白虾线粒体基因组甲基化位点分析的BSP引物基础上,对不同饥饿期该虾线粒体基因组的甲基化特征进行了分析。共设计覆盖脊尾白虾线粒体全基因组序列的BSP引物51... 为研究脊尾白虾应答饥饿的线粒体基因组表观遗传学特征,本研究在筛选适宜脊尾白虾线粒体基因组甲基化位点分析的BSP引物基础上,对不同饥饿期该虾线粒体基因组的甲基化特征进行了分析。共设计覆盖脊尾白虾线粒体全基因组序列的BSP引物51对,经验证其中10对引物可用于脊尾白虾线粒体基因组的甲基化特征分析,选用其中具有稳定扩增产物的5对引物分别对饥饿10、20和30 d的脊尾白虾线粒体基因组的甲基化特征进行了分析,结果表明,脊尾白虾耐受饥饿的平均死亡时间为19.8 d,最长耐受时间为48 d,在不同饥饿阶段线粒体基因组均可发生甲基化现象,且在第10天时甲基化比例最高,而第20和30天时甲基化比例反而降低;甲基化主要发生在ND基因位点上,据此推测这种甲基化可能用来调节能量代谢相关的电子传递链过程。本研究首次揭示了脊尾白虾线粒体基因组存在甲基化现象,为展开虾类线粒体基因组表观遗传学研究奠定了理论基础。 展开更多
关键词 脊尾白虾 线粒体基因组 甲基化 饥饿
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百乐克(BIOLAK)活性污泥宏基因组的生物多样性及功能分析 被引量:12
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作者 田美 刘汉湖 +3 位作者 申欣 赵方庆 陈帅 姚永佳 《环境科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1739-1748,共10页
百乐克(BIOLAK)是一种在全球范围内得到成功推广的多级活性污泥工艺,然而,迄今对于百乐克工艺的核心元件——活性污泥的生物群落及其功能尚鲜见报道.以连云港市大浦工业区废水处理厂为例,借助于新一代高通量测序技术,获得百乐克活性污... 百乐克(BIOLAK)是一种在全球范围内得到成功推广的多级活性污泥工艺,然而,迄今对于百乐克工艺的核心元件——活性污泥的生物群落及其功能尚鲜见报道.以连云港市大浦工业区废水处理厂为例,借助于新一代高通量测序技术,获得百乐克活性污泥中大规模的宏基因组数据(428 588条高质量DNA序列).鉴定出47个门类、872个属及1 351个物种.细菌域(289 933条序列)中包含33个门,其中变形菌门Proteobacteria是生物量最丰富的门(62.54%),其次是拟杆菌门Bacteroidetes(11.29%)、硝化螺旋菌门Nitrospirae(5.65%)和浮霉菌门Planctomycetes(4.79%),显示这些生物类群在百乐克废水处理系统中发挥着关键作用.在748个细菌属中,硝化螺菌属Nitrospira(5.60%)最为丰富,为活性污泥氮循环过程中的关键菌群.其次为芽单胞菌属Gemmatimonas(2.45%),是生物除磷过程的重要菌属.在古菌域(1 019条序列)中鉴定出3个门及39个属.在真核域(1 055序列),鉴定出10个门及60个属,其中,纤毛虫门Ciliophora是最大的门(257条序列).同时,检测到448条病毒序列,主要为噬菌体.在百乐克活性污泥中,参与氮、芳香化合物和磷代谢的功能基因比例分别为2.50%、2.28%和1.56%,均高于美国和澳大利亚两个废水处理厂活性污泥中功能基因的比例.在氮代谢的4个过程中,反硝化相关基因所占比重最高,达到80.81%,其次是氨化(12.78%)、硝化(4.38%)和固氮(2.04%).总之,在百乐克活性污泥中蕴藏着惊人的生物多样性,同时,参与氮、芳香化合物和磷代谢的功能基因非常丰富. 展开更多
关键词 百乐克(BIOLAK) 宏基因组 活性污泥 生物多样性 氮代谢 反硝化
基于nad5的西施舌漳州群体遗传分化水平分析——以蛤蜊属2个物种差异水平为参照 预览
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作者 孟学平 申欣 +4 位作者 屠海淼 朱笑琳 赵娜娜 程汉良 阎斌论 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期2635-2642,共8页
扩增了西施舌日照、连云港、北海、漳州4个野生群体、四角蛤蜊和中国蛤蜊各1个群体共73个样本的NAD5基因片段。测序获得了480bp核苷酸序列,分析核苷酸的多态性,旨在评估福建漳州西施舌与日照、连云港、北海西施舌之间的分化水平。结... 扩增了西施舌日照、连云港、北海、漳州4个野生群体、四角蛤蜊和中国蛤蜊各1个群体共73个样本的NAD5基因片段。测序获得了480bp核苷酸序列,分析核苷酸的多态性,旨在评估福建漳州西施舌与日照、连云港、北海西施舌之间的分化水平。结果:从73个序列中共检测到44种单倍型(Hap),其中西施舌4个群体有29种Haps,四角蛤蜊和中国蛤蜊分别有10种和5种Haps,漳州群体与北海、日照、连云港群体单倍型有明显差异;将西施舌分为北海、日照、连云港组(GP1)和漳州组(GP2)2个组,分析核苷酸差异,GPl与GP2间的T、A、G含量差异极显著(P〈0.01)。GP1与GP2间的遗传距离与组内(GP1、GP2)遗传距离之比为25.1—41.8,四角蛤蜊与中国蛤蜊之间的遗传距离与种内个体间遗传距离之比为24.4—36.7,GP1、GP2间的差异达到了四角蛤蜊和中国蛤蜊种间差异水平,而日照、北海群体间的遗传距离只有O.009,北海与日照群体地理位置虽远,但遗传差异则很小;AMOVA分析显示漳州西施舌发生了极显著遗传分化(F ST=0.966—0.978,P〈0.01)。 展开更多
关键词 西施舌 四角蛤蜊 中国蛤蜊 nad5 差异
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