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基于临床数据的胃癌筛查模型研究 预览
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作者 杨荣 +1 位作者 高红梅 先来 《中国医学物理学杂志》 CSCD 2019年第9期1095-1102,共8页
目的:利用临床数据,通过机器学习建立辅助筛选模型,以提高胃癌早期诊断水平。方法:以5585例胃癌(ICD编码为C16*,A组)患者为研究对象,并从57657例非胃部恶性肿瘤(ICD编码为C*,除C16*外)中随机选择6000例(B组),从47225例健康体检者中随机... 目的:利用临床数据,通过机器学习建立辅助筛选模型,以提高胃癌早期诊断水平。方法:以5585例胃癌(ICD编码为C16*,A组)患者为研究对象,并从57657例非胃部恶性肿瘤(ICD编码为C*,除C16*外)中随机选择6000例(B组),从47225例健康体检者中随机选择6000例非恶性肿瘤(C组),作为对照。从临床数据中抽取人口学(性别、年龄)、实验室检测(血常规检测、血脂/肝功能、肿瘤相关标志物、Hp等)等信息。利用Pearson相关性分析,对各指标与诊断之间的相关性进行分析。采用独立样本t检验,检测各指标的组间差异性。选择性别、年龄、癌胚抗原(CEA)、粪隐血(FOB)等53项指标作为决策变量,采用决策树算法C5.0,建立胃癌辅助筛查模型。结果:年龄、CEA、CA153等指标与胃癌显著相关(P<0.05)。在A组-B组、B组-C组、A组-C组中,存在组间差异性的指标不相同。通过数据挖掘,得到了包含51条规则的胃癌筛查模型。模型中重要性位于前10的指标依次为CA199、CA153、CEA等。对于训练集、测试集,模型的准确率分别为89.58%、89.14%,曲线下面积为0.809。结论:通过临床数据分析,可以确定胃癌早期诊断的重要指标。利用数据挖掘方法,基于临床数据可以建立胃癌筛查辅助模型,对于胃癌筛查具有良好的辅助价值。 展开更多
关键词 胃肿瘤 疾病筛查模型 临床数据 决策树
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基于互信息和逻辑回归的新词发现
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作者 先来 韩超鹏 +3 位作者 安莹 刘莉 李忠民 杨荣 《数据分析与知识发现》 CSSCI CSCD 北大核心 2019年第8期105-113,共9页
【目的】改进新词提取方法,将提取的新词加入现有分词模型,提高医学文本分词准确率。【方法】在传统互信息模型基础上,得到字、字串的统计量,连同字串是否成词,一起作为特征,建立逻辑回归分类模型,设计了一种新词识别算法。【结果】在... 【目的】改进新词提取方法,将提取的新词加入现有分词模型,提高医学文本分词准确率。【方法】在传统互信息模型基础上,得到字、字串的统计量,连同字串是否成词,一起作为特征,建立逻辑回归分类模型,设计了一种新词识别算法。【结果】在湘雅医院皮肤科电子病历文本数据上进行系列实验,与PMI、PMI~2和PMI~3相比,融入逻辑回归的PMI模型可以取得最高的新词提取准确率(0.803)。【局限】建立逻辑回归分类模型时,需要对训练集字串是否成词进行人工判断。【结论】融入逻辑回归的互信息分词模型可以更好地识别新词,降低词语误判,对于医学文本词的切分具有良好的应用价值。 展开更多
关键词 医学文本 分词 新词发现 逻辑回归 互信息模型
基于共词分析和可视化的高血压疾病关联性挖掘 预览
3
作者 刘莉 姚京京 +2 位作者 李俊 先来 周宇葵 《中国医学物理学杂志》 CSCD 2019年第5期614-620,共7页
目的:对高血压患者电子病历病案首页进行分析挖掘,揭示其中疾病诊断之间的关系。方法:以共词分析为基础,通过Python语言构建分析模块,采用Gephi复杂网络分析软件对结果进行展示。结果:基于3 632条电子病历记录,构建包含疾病诊断节点1 02... 目的:对高血压患者电子病历病案首页进行分析挖掘,揭示其中疾病诊断之间的关系。方法:以共词分析为基础,通过Python语言构建分析模块,采用Gephi复杂网络分析软件对结果进行展示。结果:基于3 632条电子病历记录,构建包含疾病诊断节点1 029个,共现关系边12 479条的疾病诊断共现网络,发现共现关系较强的疾病诊断集群。结论:从多角度、多层面对疾病诊断共现网络进行解读,并以可视化图谱的方式展示,揭示疾病诊断之间关系,为下一步构建更加完善的疾病图谱奠定基础。 展开更多
关键词 电子病历 病案首页 高血压 共词分析 可视化
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基于深度学习的心血管疾病风险预测模型 预览
4
作者 安莹 黄能军 +1 位作者 杨荣 先来 《中国医学物理学杂志》 CSCD 2019年第9期1103-1112,共10页
心血管疾病的准确预测对其预防工作有着重大的意义,本文提出一种基于电子病历数据挖掘的模型研究心血管疾病的风险预测。该模型利用循环神经网络等技术对患者的历史电子病历数据进行表征学习,不仅能有效捕获电子病历数据中的时序特征,... 心血管疾病的准确预测对其预防工作有着重大的意义,本文提出一种基于电子病历数据挖掘的模型研究心血管疾病的风险预测。该模型利用循环神经网络等技术对患者的历史电子病历数据进行表征学习,不仅能有效捕获电子病历数据中的时序特征,而且其特征工程无需人工干预。此外,在循环神经网络上嵌入的关注机制从每个患者的数据学到了一个上下文向量,该向量能有效增强深度模型的拟合能力和可解释性。为了进一步提高心血管疾病风险预测的准确性,该模型融合了多种类型的临床数据,包括诊断编码序列、实验室数据以及人口学统计数据。该模型利用多个子模块进行表征学习,不仅能充分考虑到数据之间的差异性,还能考虑到它们之间潜在的关联性,最终提高心血管疾病风险预测的性能。实验结果表明,在心血管疾病风险预测的性能方面,该模型相比最新的几种方法具有较高的召回率、F1值和AUC值,其分别可达0.8149、0.7378和0.8375。 展开更多
关键词 心血管疾病 风险预测 电子病历 深度学习
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元基因组学研究可视化分析 预览
5
作者 覃婷 先来 《医学信息学杂志》 CAS 2018年第1期12-17,共6页
利用可视化分析软件CiteSpace对Web of Science数据库中7 747篇元基因组学领域的研究文献,从数量、地区与机构、作者、研究基础和关键词等方面进行分析并绘制相关的可视化知识图谱,总结研究热点,梳理研究力量、重要文献及学术代表人物,... 利用可视化分析软件CiteSpace对Web of Science数据库中7 747篇元基因组学领域的研究文献,从数量、地区与机构、作者、研究基础和关键词等方面进行分析并绘制相关的可视化知识图谱,总结研究热点,梳理研究力量、重要文献及学术代表人物,以期更直观地展现元基因组学领域的科研状况。 展开更多
关键词 元基因组学 知识图谱 CITESPACE 可视化
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基于电子病历的胃癌治疗方案辅助选择 预览
6
作者 夏冬 李国垒 先来 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2018年第2期63-68,共6页
目的:通过挖掘电子病历文本中的信息,探索有效的文本挖掘方法,以期实现电子病历的决策支持价值。方法:将2500份胃癌患者电子病历随机分为训练组和测试组,利用词典结合统计的方法对训练组病历文本进行分词,根据每个切分词与从病历中抽... 目的:通过挖掘电子病历文本中的信息,探索有效的文本挖掘方法,以期实现电子病历的决策支持价值。方法:将2500份胃癌患者电子病历随机分为训练组和测试组,利用词典结合统计的方法对训练组病历文本进行分词,根据每个切分词与从病历中抽取的治疗方案的共现频次对切分词进行聚类,统计训练组病历中的文本在各个聚类中词的匹配数,并以训练组病历文本在各类中的匹配词数和治疗方案建立起Bayes判别函数作为决策支持模型,对测试组病历进行验证,对分词方法及判别模型进行评价。结果:随机抽取50份发现分词召回率为74.24%,准确率为82.30%,F-1值为78.06%。在切分词聚为五类时,所建立的判别模型对测试组病历的判定准确率为62%。结论:词典结合统计的分词方法在电子病历文本分词中的效果较好,基于聚类的电子病历文本挖掘可实现病历的决策支持价值,但建立的决策支持模型准确度不高,仍需对建模过程中病历文本分词及切分词的处理进行进一步研究。 展开更多
关键词 分词 聚类分析 Bayes判别 电子病历 临床决策支持 胃癌
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基于问卷调查的医疗数据分类分级研究 预览
7
作者 娄培 刘莉 +2 位作者 先来 安莹 李忠民 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2018年第6期22-27,80共7页
目的:针对医疗卫生机构在运营过程中产生信息众多而医疗行业尚没有明确的数据保护方案的问题,对底层数据进行分类分级,进而保护患者隐私等重要信息。方法:分类整理电子病历中涉及的数据项,对每类中包含的数据项进行抽象,设计医疗数据分... 目的:针对医疗卫生机构在运营过程中产生信息众多而医疗行业尚没有明确的数据保护方案的问题,对底层数据进行分类分级,进而保护患者隐私等重要信息。方法:分类整理电子病历中涉及的数据项,对每类中包含的数据项进行抽象,设计医疗数据分类分级的调查问卷对相关人员进行调研。结果:根据问卷结果,结合数据分析方法,确定医疗数据的分类分级,对人口学、标识、卫生机构人员、卫生费用、药物、检查等11个大类赋予0级可公开、1级数据关系个人信息安全、2级数据涉及机构信息安全3种不同级别。结论:为后续的访问控制或跨库联合识别奠定了基础。 展开更多
关键词 大数据 分类分级 数据安全 医疗数据 问卷调查
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FHIR标准研究现状 预览 被引量:1
8
作者 崔健 李俊 +1 位作者 先来 赵阳 《中国医学物理学杂志》 CSCD 2017年第9期924-928,共5页
快速医疗互操作性资源(FHIR)是由HL7(卫生信息交换标准)借鉴最新的Web技术创建的一套医疗信息规范,用于医疗数据的交换和共享。本文介绍了FHIR的产生背景、概念、特点、内容及应用场景,并对国内外有关FHIR标准的应用研究进行综述,... 快速医疗互操作性资源(FHIR)是由HL7(卫生信息交换标准)借鉴最新的Web技术创建的一套医疗信息规范,用于医疗数据的交换和共享。本文介绍了FHIR的产生背景、概念、特点、内容及应用场景,并对国内外有关FHIR标准的应用研究进行综述,以期开拓FHIR标准在国内的传播和应用。 展开更多
关键词 FHIR HL7标准 研究现状 综述
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面向临床决策的电子病历文本潜在语义分析 被引量:4
9
作者 李国垒 先来 +1 位作者 夏冬 杨荣 《现代图书情报技术》 CSSCI 2016年第3期50-57,共8页
【目的】通过对电子病历中重要文本进行语义分析,提取辅助临床治疗方案选择的决策知识,实现电子病历的临床决策支持功能。【方法】使用词典和统计相结合的分词算法,对训练样本中出院记录文本进行分词处理,从中提取临床术语及治疗方... 【目的】通过对电子病历中重要文本进行语义分析,提取辅助临床治疗方案选择的决策知识,实现电子病历的临床决策支持功能。【方法】使用词典和统计相结合的分词算法,对训练样本中出院记录文本进行分词处理,从中提取临床术语及治疗方案,并对其进行潜在语义分析,找出临床术语与治疗方案之间的潜在语义联系,建立胃癌治疗方案辅助选择的潜在语义模型。【结果】利用测试样本对语义模型进行测试,在三维语义空间内,发现1000份测试样本中有605份可以从临床症状的描述准确地推算出其所对应的治疗方案,正确率为60.5%。【局限】仅以出院记录文本为研究对象,没有对其他病历文本进行分词处理。【结论】潜在语义分析方法能够有效地处理临床文本,辅助医生的临床决策,对于电子病历的开发应用具有重要意义。 展开更多
关键词 电子病历 中文文本切分 潜在语义分析 胃癌 临床决策支持 治疗方案选择
HL7结合临床文档结构研究现状 预览 被引量:1
10
作者 王雪梅 李俊 +3 位作者 先来 刘莉 李敬东 赵燕红 《中国医学物理学杂志》 CSCD 2016年第10期1074-1076,1080共4页
自2011年HL7组织制定并发布HL7结合临床文档结构(C-CDA)标准以来,在美国电子健康记录中得到了广泛的利用并在数据共享和互操作上取得较好效果,但目前在国内尚无相关的研究应用介绍。本文就卫生信息交换标准——HL7 C-CDA进行综述,介... 自2011年HL7组织制定并发布HL7结合临床文档结构(C-CDA)标准以来,在美国电子健康记录中得到了广泛的利用并在数据共享和互操作上取得较好效果,但目前在国内尚无相关的研究应用介绍。本文就卫生信息交换标准——HL7 C-CDA进行综述,介绍其发展背景、内容及应用现状。 展开更多
关键词 HL7标准 结合临床文档结构 综述
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中文病历文本分词方法研究 预览 被引量:5
11
作者 李国垒 先来 +1 位作者 夏冬 杨荣 《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期477-481,共5页
探索适合医学文本的分词方法,为医学数据挖掘和临床决策支持的语义分析奠定基础。分别使用单纯中科院ICTCLAS分词、ICTCLAS+自定义词典、ICTCLAS+统计分词和ICTCLAS+自定义词典结合互信息统计分词4种策略,对1 500份出院记录中的病历... 探索适合医学文本的分词方法,为医学数据挖掘和临床决策支持的语义分析奠定基础。分别使用单纯中科院ICTCLAS分词、ICTCLAS+自定义词典、ICTCLAS+统计分词和ICTCLAS+自定义词典结合互信息统计分词4种策略,对1 500份出院记录中的病历文本进行分词处理,并从准确率、召回率和综合指标值等3个方面对分词结果进行评价。以人工分词的50份出院记录结果为标准依据,4种分词策略的综合指标值分别为45.77%、58.76%、64.93%和78.06%。结果证实,自定义词典结合基于互信息的统计分词方法,能够有效地对病历中出院记录文本进行分词处理,可以满足临床数据分析的需求,具有良好的推广意义。 展开更多
关键词 病历文本 中文分词 统计分词 词典分词 出院记录
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试论开设长学制医学信息学专业 预览
12
作者 先来 刘建炜 《医学信息学杂志》 CAS 2015年第1期84-88,共5页
针对目前我国医学信息学专业学历教育的现状和存在的不足,认为开设长学制医学信息学专业对医学信息学学科发展和解决社会对高层次医学信息学人才的需求具有重要价值,同时对开设长学制医学信息学专业的意义进行详细阐述。
关键词 医学信息学教育 长学制教育 培养模式 教育改革
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医学类院校的网络影响力分析 预览
13
作者 雷罗 先来 冯麟 《情报工程》 2015年第6期23-31,共9页
随着信息网络的蓬勃发展,网络的影响力日趋增强,成为了社会中不可忽视的一股重要力量。本文主要运用网络链接分析的方法,对医学类院校进行网络影响力分析,得出院校的网站的影响力情况。分析结果显示实际得出的网络影响力的排名与院校排... 随着信息网络的蓬勃发展,网络的影响力日趋增强,成为了社会中不可忽视的一股重要力量。本文主要运用网络链接分析的方法,对医学类院校进行网络影响力分析,得出院校的网站的影响力情况。分析结果显示实际得出的网络影响力的排名与院校排名有一定的联系,但并非密切相关。 展开更多
关键词 网络链接分析 网络影响力分析 医学类院校
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潜在语义分析在关键词——叙词对照系统构建中的应用 被引量:3
14
作者 李国垒 先来 《情报理论与实践》 CSSCI 北大核心 2014年第4期127-130,133共5页
文章通过构建关键词一叙词矩阵,利用潜在语义分析技术,实现了关键词与叙词的自动对照。在此系统中,当用户输入关键词后,该系统能够自动提示出与之相关的叙词,辅助标引人员和检索用户根据实际情况进行选择。实验结果表明,该方法取... 文章通过构建关键词一叙词矩阵,利用潜在语义分析技术,实现了关键词与叙词的自动对照。在此系统中,当用户输入关键词后,该系统能够自动提示出与之相关的叙词,辅助标引人员和检索用户根据实际情况进行选择。实验结果表明,该方法取得了良好的效果。 展开更多
关键词 潜在语义分析 叙词 关键词
国内医学院校情报学硕士培养现状 预览 被引量:2
15
作者 夏冬 肖晓旦 先来 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2014年第6期70-74,共5页
简要介绍了我国医学情报学专业的发展历程,分析了我国医学情报学硕士的培养现状,对比了三所高校的培养方案,并针对存在的问题提出了几点建议。
关键词 医学情报学 硕士培养 医学院校 研究方向 培养方案
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面向临床决策的电子病历系统概述 预览 被引量:11
16
作者 李国垒 先来 夏冬 《中国数字医学》 2014年第12期30-32,36共4页
电子病历系统作为医院信息化建设的核心,不仅要实现对临床信息的高效管理,还应该满足临床信息利用的需求,实现临床决策支持的功能.对国内外有关电子病历系统在临床决策支持方面的应用进行了文献综述,以求对面向临床决策的电子病历系统... 电子病历系统作为医院信息化建设的核心,不仅要实现对临床信息的高效管理,还应该满足临床信息利用的需求,实现临床决策支持的功能.对国内外有关电子病历系统在临床决策支持方面的应用进行了文献综述,以求对面向临床决策的电子病历系统相关问题有较全面的了解. 展开更多
关键词 电子病历系统 临床决策支持 自然语言处理 数据挖掘
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基于潜在语义分析的关键词-分类号对应关系研究 被引量:4
17
作者 夏冬 肖晓旦 +1 位作者 李国垒 先来 《现代图书情报技术》 CSSCI 北大核心 2014年第12期92-96,共5页
【目的】通过探索关键词—分类号的对应关系,为对照系统的建立打下基础。【应用背景】辅助不熟悉分类号的论文作者进行论文标引,同时协助用户结合关键词和分类号完成更精确的检索。【方法】对构建的关键词一分类号矩阵进行奇异值分解... 【目的】通过探索关键词—分类号的对应关系,为对照系统的建立打下基础。【应用背景】辅助不熟悉分类号的论文作者进行论文标引,同时协助用户结合关键词和分类号完成更精确的检索。【方法】对构建的关键词一分类号矩阵进行奇异值分解,得到关键词、分类号的三维语义坐标,再根据查询提问式的向量表示与分类号坐标进行相关度计算并降序排序。【结果】相比单个、三个及三个以上关键词,两个关键词与分类号的对应关系有较好效果。在100对包含两个关键词的词组中,有91对能够确定至少一个相关的分类号,准确率达到91%。【结论】两个关键词与分类号的对应关系结果较为理想,为构建对照系统打下良好基础。 展开更多
关键词 潜在语义分析 关键词 分类号 对应关系
医学信息学新分支——转化医学信息学 预览 被引量:10
18
作者 李国垒 先来 《医学信息学杂志》 CAS 2013年第1期15-18,共4页
在介绍转化医学信息学概念的基础上,详细介绍转化医学信息学研究的基本内容以及国外相关的转化医学信息平台,最后对转化医学信息学的发展前景进行初步探讨。
关键词 医学信息学 转化医学 转化医学信息学
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亚胺培南对医院内革兰阴性菌的抗菌活性分析 被引量:2
19
作者 肖幸华 先来 《国际病理科学与临床杂志》 CAS 2012年第4期281-286,共6页
目的:了解亚胺培南对院内革兰阴性菌的抗菌活性。方法:收集2007年至2011年从临床送检标本中分离出来的革兰阴性菌4264株,采用Vitek 2全自动微生物鉴定分析系统、API系统及K-B法进行培养鉴定和药敏试验。结果:发现亚胺培南总耐药率为2... 目的:了解亚胺培南对院内革兰阴性菌的抗菌活性。方法:收集2007年至2011年从临床送检标本中分离出来的革兰阴性菌4264株,采用Vitek 2全自动微生物鉴定分析系统、API系统及K-B法进行培养鉴定和药敏试验。结果:发现亚胺培南总耐药率为25.82%(1101/4264),2007年至2011年的年度耐药率分别为4.23%(8/189),9.23%(35/379),10.12%(49/484),24.12%(179/742)和33.60%(830/2470);耐药菌种分别占总菌种数的28.57%(4/14),40.00%(8/20),31.25%(5/16),36.36%(8/22)和65.71%(23/35)。分离率前10位的是大肠埃希菌、鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、阴沟肠杆菌、产气肠杆菌、洋葱伯克霍尔德菌、黏质沙雷菌、产酸克雷伯菌和甲型副伤寒沙门菌,对亚胺培南的耐药率分别为0.82%(9/1097),68.22%(631/925),4.07%(29/713),39.86%(228/572),9.64%(27/280),2.40%(3/125),90.00%(81/90),7.02%(4/57),46.43%(26/56)和0(0/45)。2007年至2011年对亚胺培南的年度耐药率,铜绿假单胞菌为6.25%(1/16),31.25%(5/16),19.57%(9/46),34.48%(40/116)和45.77%(173/378);鲍曼不动杆菌为7.14%(1/14),47.06%(8/17),29.63%(8/27),61.45%(110/179)和73.26%(504/688);阴沟肠杆菌为0(0/10),0(0/26),3.13%(1/32),9.23%(6/65)和13.61%(20/147)。大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、产气肠杆菌、黏质沙雷菌在最近1~2年检出了亚胺培南耐药菌株。结论:亚胺培南是一种有效的抗革兰氏阴性菌药物,但药敏性正在逐年下降,耐药菌种数在增多,耐药率正在逐年上升。 展开更多
关键词 亚胺培南 抗菌活性 革兰阴性菌 院内细菌
医学“云”的应用前景与思考 预览 被引量:4
20
作者 张铮 先来 《中国科技信息》 2012年第10期 110,114,共2页
在对云计算的概念、特点及其发展现状进行探讨的基础上,分析了云计算技术在医疗卫生行业建设中的应用前景,同时还讨论了医学"云"应用中存在的问题。
关键词 云计算 医疗卫生信息化 多媒体资源库 数据安全
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