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小麦ILs群体SSR分子标记遗传连锁图谱构建 预览
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作者 吕百川 苏其红 +4 位作者 辛筱筱 孙娟 刘小雪 刘媛 杨德龙 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期35-42,共8页
【目的】为小麦回交导入系(introgression lines,ILs)群体(‘晋麦47’ב西峰20’)构建简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)标记遗传连锁图谱.【方法】通过小麦ILs群体160个株系对2 306对均匀分布在21条染色体上的SSR标记... 【目的】为小麦回交导入系(introgression lines,ILs)群体(‘晋麦47’ב西峰20’)构建简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)标记遗传连锁图谱.【方法】通过小麦ILs群体160个株系对2 306对均匀分布在21条染色体上的SSR标记进行多态性筛选,利用筛选出的多态性SSR标记对该群体进行遗传多样性分析和遗传连锁图谱构建.【结果】该群体共筛选出442个多态性SSR标记,每个SSR位点平均遗传多样性指数(H′)为0.31,多态性信息量(PIC)为0.25.其中,B基因组和第Ⅲ同源群H′与PIC较高,而D基因组和第Ⅰ同源群较低.通过聚类分析,该群体160个株系可分为5大类群.利用多态性SSR标记构建了1套涵盖小麦21条染色体的遗传图谱,总长度5 857.39 cm,每条染色体的平均长度为277.27 cm,标记间的平均距离为13.25 cm.【结论】构建了1条可用于小麦复杂数量性状精细定位和分子标记辅助选择育种的遗传连锁图谱. 展开更多
关键词 小麦 ILs群体 SSR标记 遗传多样性 遗传连锁图谱
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紫花苜蓿开花性状的遗传特性分析与QTL定位 预览
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作者 何飞 张帆 +4 位作者 张铁军 康俊梅 龙瑞才 杨青川 马春晖 《草业学报》 CSCD 北大核心 2019年第2期112-120,共9页
通过构建紫花苜蓿杂交F1代遗传分离群体,研究紫花苜蓿早熟性状的遗传特性,确定始花期性状的最适遗传模型,同时定位始花期相关的QTL位点。以低产早熟紫花苜蓿(父本)和高产晚熟紫花苜蓿(母本)为亲本构建杂交群体,以亲本和二者杂交产生的15... 通过构建紫花苜蓿杂交F1代遗传分离群体,研究紫花苜蓿早熟性状的遗传特性,确定始花期性状的最适遗传模型,同时定位始花期相关的QTL位点。以低产早熟紫花苜蓿(父本)和高产晚熟紫花苜蓿(母本)为亲本构建杂交群体,以亲本和二者杂交产生的152个F1代单株为研究对象。于2015和2016年调查始花期性状,运用主多基因遗传模型分析始花期性状的最适遗传模型。通过GBS测序技术对154个单株进行基因分型,利用测序产生的SNP标记构建连锁图谱,同时结合表型数据进行QTL定位。结果表明:2MG-A为始花期性状的最适遗传模型,2015年的主基因遗传率为99%,2016年的主基因遗传率为98.5%。父本连锁图覆盖图距为1386cM,平均标记密度3.2cM;母本连锁图覆盖图距为798.73cM,平均标记密度8.07cM。对两年的数据进行QTL定位分析得到2个主效QTL位点,表型贡献率分别为12.1334%和11.0157%。表明始花期主要受两对主效基因控制,同时具有加性作用。始花期性状主要由2个QTL位点控制。 展开更多
关键词 开花性状 始花期 遗传分析 连锁图谱 QTL定位
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基于RIL群体鉴定棉花抗黄萎病相关QTLs 预览
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作者 鲁宁宁 赵云雷 +6 位作者 王红梅 陈伟 赵佩 龚海燕 崔艳利 桑晓慧 张凯 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2019年第3期254-262,共9页
【目的】鉴定出能够稳定表达的棉花抗黄萎病相关数量性状位点(Quantitative trait loci,QTLs)。【方法】以抗落叶型黄萎病棉花品种常抗棉和感黄萎病品种TM-1为亲本配制的111个重组自交系家系为作图群体,筛选出多态性简单序列重复(Simple... 【目的】鉴定出能够稳定表达的棉花抗黄萎病相关数量性状位点(Quantitative trait loci,QTLs)。【方法】以抗落叶型黄萎病棉花品种常抗棉和感黄萎病品种TM-1为亲本配制的111个重组自交系家系为作图群体,筛选出多态性简单序列重复(Simple sequence repeat,SSR)标记,并用于构建遗传图谱。用完备复合区间作图法对该群体在安阳大田、新疆重病地及病圃等多个环境下的黄萎病病情指数进行QTLs检测。【结果】构建了1张含有12个连锁群、40个标记、总长212.5 cM(厘摩)的遗传图谱。获得了6个与抗黄萎病基因相关的QTLs,对数优势比(Logarithm of the odd score,LOD)分布在2.51~5.55,贡献率最大为20.34%,最小为6.93%。其中,qVR-D05-1能够在安阳大田2015年7月15日和新疆南疆重病地2016年7月9日2个环境中检测到,贡献率分别为12.96%和20.34%。【结论】本研究得到的qVR-D05-1能够为定位出稳定的棉花抗黄萎病相关QTLs提供参考。 展开更多
关键词 棉花 SSR 黄萎病 遗传图谱 数量性状位点
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四倍体马铃薯SRAP分子遗传连锁图谱的构建 预览
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作者 张明飞 于卓 +4 位作者 于肖夏 李景伟 马艳红 吴国芳 王颖 《草业学报》 CSCD 北大核心 2019年第8期190-199,共10页
为了给后期马铃薯块茎高淀粉、高干物质及产量等重要数量性状基因座(QTL)定位和分子标记辅助育种奠定基础,以四倍体马铃薯YSP-4×MIN-021杂种F1的182个分离单株为作图群体,利用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记进行了遗传图谱构建... 为了给后期马铃薯块茎高淀粉、高干物质及产量等重要数量性状基因座(QTL)定位和分子标记辅助育种奠定基础,以四倍体马铃薯YSP-4×MIN-021杂种F1的182个分离单株为作图群体,利用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记进行了遗传图谱构建研究。试验从357对SRAP引物中筛选出适宜引物36对。用这些引物对马铃薯杂种F1的182个分离单株及其亲本的基因组DNA进行PCR扩增得到598个SRAP标记。卡方检验显示偏分离标记数为127个,其中母本连锁群59个,父本连锁群68个,偏分离比率均小于30%,符合遗传作图的要求。用软件JoinMap4.0建立了2张四倍体马铃薯双亲的SRAP遗传图谱。母本YSP-4的连锁群总长度为1572.2cM,标记数目为274个,平均间距为5.74cM,12个连锁群的长度范围为14.03~214.44cM;父本MIN-021的连锁群总长度为1932.23cM,标记数目为324个,平均间距为5.96cM,各连锁群的长度范围为93.65~242.06cM。 展开更多
关键词 四倍体马铃薯 SRAP标记 遗传连锁图谱
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秀水134为背景的染色体片段代换系的构建 预览
5
作者 孟卓玲 曹玉洁 +9 位作者 单丹丹 方春 缪小菲 费月新 方柄杰 王越 赵文佳 侯璐燕 吴敏 吴洪恺 《中国稻米》 2019年第2期29-34,共6页
染色体片段代换系作为发掘和鉴定有利基因的有力工具得到了广泛的应用。本研究以秀水134为背景亲本,以扬稻6号为供体亲本,构建了一套染色体片段代换系。该代换系包含53个株系,其代换片段长度在7.4~182.15 cM之间,占水稻全基因组的0.49%~... 染色体片段代换系作为发掘和鉴定有利基因的有力工具得到了广泛的应用。本研究以秀水134为背景亲本,以扬稻6号为供体亲本,构建了一套染色体片段代换系。该代换系包含53个株系,其代换片段长度在7.4~182.15 cM之间,占水稻全基因组的0.49%~12.15%,平均占水稻全基因组的5.0%。这套代换系的代换片段总长度为1 995 cM,覆盖水稻基因组的1.33倍。本文还对染色体片段代换系的构建策略和应用进行了讨论。 展开更多
关键词 水稻 分子标记 遗传连锁图谱 染色体片段代换系
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甘蓝型油菜遗传图谱构建及产量相关性状QTL定位研究进展 预览
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作者 星晓蓉 柳海东 《青海大学学报》 2019年第5期1-8,共8页
油菜是世界上重要的油料作物,甘蓝型油菜在油菜生产中占据着主导地位。本文主要综述了甘蓝型油菜遗传连锁图谱构建从最初的RFLP发展到SNP标记及产量性状相关的千粒重、主花序有效角果数和每角粒数等数量性状位点(QTL)定位的研究进展,并... 油菜是世界上重要的油料作物,甘蓝型油菜在油菜生产中占据着主导地位。本文主要综述了甘蓝型油菜遗传连锁图谱构建从最初的RFLP发展到SNP标记及产量性状相关的千粒重、主花序有效角果数和每角粒数等数量性状位点(QTL)定位的研究进展,并指出了目前存在的问题和对甘蓝型油菜图谱构建进行展望,以期为甘蓝型油菜的遗传育种提供理论依据。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 遗传连锁图谱 产量性状 数量性状遗传位点
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基于CAPS标记的甜瓜单果重相关性状QTL分析 预览
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作者 刘相玉 张裕舒 +4 位作者 刘柳 刘识 高鹏 王迪 王学征 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1601-1613,共13页
[目的]基于甜瓜全基因组重测序技术,挖掘SNP位点并开发CAPS标记,构建遗传连锁图谱。初步为甜瓜单果重相关性状进行QTL定位,为甜瓜单果重相关基因挖掘奠定理论基础。[方法]选取栽培甜瓜品系M4-130为母本,野生甜瓜品系X207为父本,构建F2:... [目的]基于甜瓜全基因组重测序技术,挖掘SNP位点并开发CAPS标记,构建遗传连锁图谱。初步为甜瓜单果重相关性状进行QTL定位,为甜瓜单果重相关基因挖掘奠定理论基础。[方法]选取栽培甜瓜品系M4-130为母本,野生甜瓜品系X207为父本,构建F2:3群体材料。对甜瓜果实单果重、果实长宽、果肉厚度、果形指数及可溶性固形物含量等性状进行相关性分析。对亲本材料进行20×深度重测序,利用BWA、SAMTools、VCFTools等软件在全基因组范围内挖掘双亲SNP位点,利用SNP2CAPS软件结合甜瓜基因组上的限制性内切酶酶切位点开发CAPS标记,建立遗传连锁图谱。最后采用复合区间作图法对甜瓜果实单果重、果实长宽、果肉厚度、果形指数及可溶性固形物含量进行QTL分析。[结果]单果重与果实长度、果实宽度及果肉厚度呈显著相关。开发得到可利用CAPS标记185个,构建一张包含12个连锁群的遗传连锁图谱,覆盖总长度为1600.45cM,标记间的平均遗传距离8.65cM。定位发现与单果重相关QTL位点7个(FW3.1、FW4.1、FW5.1、FW6.1、FW8.1、FW8.2、FW11.1),与果实长度相关QTL位点7个(FL2.1、FL3.1、FL4.1、FL5.1、FL6.1、FL8.1、FL11.1),与果实宽度相关QTL位点5个(FWID3.1、FWID4.1、FWID8.1、FWID10.1、FWID11.1),与果肉厚度相关QTL位点2个(FT6.1、FT11.1),与果形指数相关QTL位点1个(FS2.1),与可溶性固形含量相关QTL位点2个(SS6.1、SS12.1)。[结论]获得了24个QTL位点。确定了一个主效QTL位点FW8.1,贡献率高达25.8774%,LOD值为16.8746。发现单果重与果实长度、果实宽度及果肉厚度密切相关,定位区间相同或相邻,紧密集中在3、4、5、6、8、11染色体上。 展开更多
关键词 甜瓜 单果重 遗传连锁图谱 QTL
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基于RAD-seq技术的鹅掌楸基因组SNP标记开发
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作者 陆叶 龙晓飞 +2 位作者 王鹏凯 陈金慧 施季森 《南京林业大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期1-7,共7页
【目的】开发大量可靠的SNP标记,为鹅掌楸高密度遗传连锁图谱的构建和基于基因组的林木选择育种提供分子基础。【方法】从北美鹅掌楸NK基因型为母本、鹅掌楸LS基因型为父本的F1代杂交群体中,选取198株个体为作图群体。用限制性内切酶Eco... 【目的】开发大量可靠的SNP标记,为鹅掌楸高密度遗传连锁图谱的构建和基于基因组的林木选择育种提供分子基础。【方法】从北美鹅掌楸NK基因型为母本、鹅掌楸LS基因型为父本的F1代杂交群体中,选取198株个体为作图群体。用限制性内切酶EcoR I对包括2个亲本和198个子代在内的200个单株的基因组DNA进行酶切,构建RAD(restriction-site associated DNA)文库并进行RAD-seq测序。采用读长为91 bp的双末端测序。2个亲本的平均测序深度为2×,198个子代的平均测序深度为0.8×,平均产量为1.94 Gb,共获得约387.21 Gb数据。用Stacks软件将每个样品的RAD-reads作生物信息学分析,对候选位点进行卡方检验和缺失率检验,再将符合孟德尔遗传的标记及与之相对应的RAD-tag序列和鹅掌楸参考基因组序列进行比对。最后,从本研究开发的SNP标记中选取27个候选SNP位点,设计引物,对随机挑选的16个F1代进行PCR扩增并将结果进行测序,同时验证SNP的有效性。【结果】从候选群体中共鉴定到22 019个SNP位点,符合孟德尔遗传规律的标记为4 233个,最终获得3 501个候选SNP标记。SNP验证中,共有293个SNP标记完成测序并能判读结果,所有位点都为SNP位点,共有194(66.2%)个SNP变异类型得到了验证。【结论】基于RAD-seq技术和鹅掌楸参考基因组序列为基础的策略,能够作为一种快速有效的手段,实现大规模的分子标记开发,可用于鹅掌楸等林木的高密度遗传图谱的构建。 展开更多
关键词 北美鹅掌楸 鹅掌楸 限制性位点关联DNA测序(RAD-seq)技术 SNP标记 遗传连锁图谱
柑橘遗传连锁图谱构建及重要性状QTL的研究进展
9
作者 韩国辉 罗友进 +3 位作者 向素琼 杨海健 李勋兰 程昌凤 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1739-1751,共13页
对柑橘遗传连锁图谱的构建以及抗病、抗虫、抗非生物胁迫、果实与种胚发育、品质等重要性状相关的QTL定位研究进展进行了综述,对其未来研究趋势和前景提出了展望。
关键词 柑橘 遗传连锁图谱 性状相关基因 QTL定位
基于SSR对火炬松×加勒比松杂种形质性状的QLT定位分析
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作者 蒋开彬 何紫迪 +3 位作者 孔凡启 郝静 周晓煦 黄少伟 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2019年第3期448-453,共6页
对火炬松×加勒比松杂种部分形质性状的QTL进行定位分析,为杂种育种和株型培育提供借鉴。以火炬松1.5代种子园优良单株T1为母本,加勒比松第一代种子园优良单株C1为父本,杂交产生F1代113个单株。使用Join Map■ 3.0作图软件构建火炬... 对火炬松×加勒比松杂种部分形质性状的QTL进行定位分析,为杂种育种和株型培育提供借鉴。以火炬松1.5代种子园优良单株T1为母本,加勒比松第一代种子园优良单株C1为父本,杂交产生F1代113个单株。使用Join Map■ 3.0作图软件构建火炬松母本和加勒比松父本的SSR标记遗传图谱,并用MapQTL4.0 作图软件对形质性状的QTL进行定位。火炬松母本图谱总长度293.9 cM,标记间距范围为3.7~47.9 cM,标记平均间距15.5 cM。加勒比松父本图谱总长度245.5 cM,标记间距范围为6.8~49.8 cM,标记平均间距13.6 cM。检测到4个与形质性状有关的QTL位点,其中有2个QTL定位于火炬松染色体LG4上。4个形质性状的QTLs解释方差为8.6%~13.6%,可以利用这些QTLs进行特定株型的培育,如分枝角度的控制培育。 展开更多
关键词 火炬松 加勒比松 形质性状 遗传连锁图谱 QTL定位
盐胁迫下水稻幼苗存活率的QTL定位
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作者 段敏 谢留杰 +3 位作者 朱亚军 黄善军 潘晓飚 徐建龙 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期25-35,共11页
盐胁迫是制约水稻产量的重要非生物胁迫因素。随着土壤盐碱化日益加重,培育适宜于盐碱地种植的水稻耐盐新品种是提高水稻产量的有效方法。相较于传统杂交育种,分子标记辅助育种能够提高选育的效率和精确度。选择高度耐盐籼型恢复系ST105... 盐胁迫是制约水稻产量的重要非生物胁迫因素。随着土壤盐碱化日益加重,培育适宜于盐碱地种植的水稻耐盐新品种是提高水稻产量的有效方法。相较于传统杂交育种,分子标记辅助育种能够提高选育的效率和精确度。选择高度耐盐籼型恢复系ST1050和盐敏感优质粳稻品种越光作为研究材料,用含有150 mmol/L Na Cl的营养液处理三叶期幼苗1周,再用普通营养液恢复处理1周后,以幼苗的存活率作为苗期耐盐指标,选取均匀分布于水稻染色体的463个SSR标记对亲本进行多态性分析,鉴定ST1050与越光杂交产生的F2代群体基因型,构建遗传图谱并进行QTL定位。结果显示,籼型恢复系ST1050、粳稻品种越光的存活率分别为60%和18.75%,差异显著。463个SSR标记中有121个在ST1050和越光之间表现出较好的共显性差异,多态性达26.13%。利用软件Ici Mapping 4.1分析ST1050×越光138个F2个体的基因型,最终获得了一张覆盖总遗传距离为1 160.09 c M,标记间平均距离9.59 c M的遗传图谱。结合F3代群体在盐胁迫后的存活率验证,在水稻8号、12号染色体上分别检测到1个苗期耐盐QTL,命名为q SR-8和q SR-12,贡献率分别为13.57%和6.91%。研究表明,籼型恢复系ST1050存在2个苗期耐盐QTL,对提高水稻的耐盐性发挥重要的作用,可以作为苗期耐盐供体用于标记辅助选择耐盐育种。 展开更多
关键词 耐盐 存活率 SSR分子标记 数量性状位点 遗传图谱
雪茄烟品种Beinhart1000-1赤星病抗性基因的QTL定位 预览
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作者 童治军 张谊寒 +3 位作者 陈学军 曾建敏 方敦煌 肖炳光 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期477-482,共6页
由链格孢菌(Alternaria alternata)引起的赤星病是最具破坏性的烟草叶斑病害之一,在中国严重地影响烟草(Nicotiana tabacum L.)的产量和质量。选育抗烟草赤星病的优良品种虽是预防该病最经济、有效的途径,但因其抗性受数量性状基因控制... 由链格孢菌(Alternaria alternata)引起的赤星病是最具破坏性的烟草叶斑病害之一,在中国严重地影响烟草(Nicotiana tabacum L.)的产量和质量。选育抗烟草赤星病的优良品种虽是预防该病最经济、有效的途径,但因其抗性受数量性状基因控制而很难通过常规育种手段实现。为了便于开展烟草抗赤星病分子标记辅助选择育种,本研究利用抗赤星病雪茄烟品种Beinhart1000-1 和感病烤烟品种红花大金元经杂交、自交产生的362 个F2 单株构建了一张包含670 个SSR标记的烟草遗传连锁图谱,并结合组培快繁形成的F2株系的田间赤星病病情指数(DI),在全基因组范围内检测获得2 个与烟草赤星病抗性相关的QTL,分别位于第20 和23 连锁群上的SSR 标记TMs05179 和TMs04022,以及TM61049和TM62212 之间。这2 个QTL 等位基因均来自抗病亲本Beinhart1000-1,它们一起解释了两亲本间81%的病情指数(DI)差异及64%的加性效应。为下一步开展烟草抗赤星病的分子标记辅助育种奠定了基础。 展开更多
关键词 烟草赤星病 简单重复序列 遗传连锁图谱 数量性状基因座
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谷子SSR标记的开发与应用研究进展 预览
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作者 付楠 刘金荣 +3 位作者 王素英 刘海萍 闫宏山 宋中强 《安徽农业科学》 CAS 2018年第25期26-28,35共4页
对SSR标记技术在谷子遗传多样性、遗传连锁图谱构建、基因定位和分子育种方面的研究进行综述,以期为SSR标记技术在谷子上的应用提供参考。
关键词 谷子 SSR 遗传多样性 遗传连锁图 基因定位 分子育种
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基于SSR分子标记的高丹草遗传图谱构建及相关性状QTL定位
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作者 于肖夏 南志标 +4 位作者 于卓 杨东升 谢锐 石悦 吴国芳 《分子植物育种》 CSCD 北大核心 2018年第16期5347-5358,共12页
本试验以散穗高粱和红壳苏丹草为亲本,以其杂种F2代的170个分离单株为作图群体,利用SSR分子标记技术和Join Map 3.0作图软件构建高丹草遗传连锁图谱,并在此基础上对分蘖数、株高、氢氰酸含量等8个相关性状进行QTL定位。结果表明:从120... 本试验以散穗高粱和红壳苏丹草为亲本,以其杂种F2代的170个分离单株为作图群体,利用SSR分子标记技术和Join Map 3.0作图软件构建高丹草遗传连锁图谱,并在此基础上对分蘖数、株高、氢氰酸含量等8个相关性状进行QTL定位。结果表明:从120对SSR引物中共筛选出50对多态性引物,利用这些引物对作图群体各单株进行PCR扩增,共获得226个多态性标记,平均扩增标记为4.5个/引物。构建出一张由10个连锁群组成的高丹草SSR分子遗传图谱,含181个SSR标记,图谱总长803.13 cM。各连锁群长度在5.8~152.3 cM之间,标记间平均距离4.38 cM,图谱密度较高。在构建图谱的基础上,对高丹草8个相关性状进行QTL定位,共获得17个QTLs,其中控制茎粗的QTL 4个,控制叶宽的QTL 3个,控制叶片数、叶长、分蘖数和穗长的QTL各2个;控制株高和氢氰酸含量的QTL各1个。这些QTL位点分布于高丹草SSR遗传连锁图谱的其中8个连锁群上,其遗传贡献率的范围为12.5%~25.6%。本研究可为进一步开展高丹草重要性状基因的精细定位、图位克隆、功能分析,以及分子标记辅助育种提供理论指导。 展开更多
关键词 高丹草 SSR标记 遗传连锁图谱 农艺性状 QTL定位
基于SSR标记的四倍体鸭茅遗传图谱加密 预览 被引量:2
15
作者 唐露 金梦雅 +3 位作者 黄琳凯 张旭 赵欣欣 张新全 《中国农业科学》 CSCD 北大核心 2018年第5期991-998,共8页
【目的】利用转录组测序开发的EST-SSR标记和鸭茅基因组调研测序开发的基因组SSR(genomic-SSR)标记,对已构建的四倍体鸭茅遗传图谱加密,为定位控制鸭茅重要农艺性状的QTL位点奠定基础。【方法】基于拟测交策略,以"楷模"(高杆、多... 【目的】利用转录组测序开发的EST-SSR标记和鸭茅基因组调研测序开发的基因组SSR(genomic-SSR)标记,对已构建的四倍体鸭茅遗传图谱加密,为定位控制鸭茅重要农艺性状的QTL位点奠定基础。【方法】基于拟测交策略,以"楷模"(高杆、多分蘖、宽叶、早熟)和"01436"(矮秆、少分蘖、细叶、晚熟)作为亲本材料进行杂交,得到一个含有214株鸭茅材料的作图群体,利用亲本和随机选取的5个单株对574对EST-SSR标记和150对Genomic-SSR进行引物筛选,PCR产物经8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测后,将扩增条带清晰、在亲本之间存在差异且子代间存在分离的多态性引物用于亲本及群体扩增。将扩增结果按标记类型统计分析,对于亲本间存在差异的条带,按条带有无(有带计1,无带记0)对DNA扩增产物按进行统计,经卡方检验,将分离比例符合1﹕1(亲本基因型为Aaaa×aaaa或aaaa×Aaaa)和3﹕1(亲本基因型为Aaaa×Aaaa)的标记,用于遗传连锁图谱构建。符合作图要求的标记采用High Map软件进行遗传图谱构建。【结果】最终筛选出符合要求的EST-SSR引物31对和Genomic-SSR引物17对,引物多态性分别为5.4%和11.3%,总的多态性为6.6%。对鸭茅214个作图群体单株及亲本DNA进行扩增,共得到169个多态性位点,其中EST-SSR101个,Genomic-SSR68个位点。169个标记位点经卡方检验分析表明,有89个标记符合孟德尔分离规律,标记可用率为52.7%,其中呈Aaaa×aaaa或aaaa×Aaaa分离类型的标记有79个,呈Aaaa×Aaaa的有10个,其余80个为偏分离标记。将SSR标记整合以前的标记信息,重新构建了一张包含2 551个标记,覆盖7个连锁群,总长度为758.4 cM的鸭茅高密度遗传图谱。加密后的图谱包含SNP标记4 187个,SSR标记84个,各连锁群标记数在166—709个,每个连锁群的平均标记数为364个,LG1包含最多标记数有709个,LG7标记数最少166个,各连锁群长度在 展开更多
关键词 鸭茅 SSR 遗传图谱加密
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高丹草SRAP和SSR分子遗传连锁图谱的构建 预览 被引量:3
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作者 石悦 于肖夏 +4 位作者 南志标 于卓 吴国芳 杨东升 张明飞 《中国草地学报》 CSCD 北大核心 2018年第5期11-17,共7页
为了定位高丹草低氢氰酸含量、产草量及抗逆性等重要性状的QTLs,以高丹草杂种F2为作图群体,利用SRAP和SSR两种分子标记技术对305个F_2分离单株及其亲本基因组DNA进行PCR扩增得到427个多态性分子标记位点(253个SRAP、174个SSR),采用Joi... 为了定位高丹草低氢氰酸含量、产草量及抗逆性等重要性状的QTLs,以高丹草杂种F2为作图群体,利用SRAP和SSR两种分子标记技术对305个F_2分离单株及其亲本基因组DNA进行PCR扩增得到427个多态性分子标记位点(253个SRAP、174个SSR),采用Joinmap4.0作图软件构建了一张含SRAP和SSR两种标记的高丹草分子遗传连锁图谱。图谱有10个连锁群,各连锁群的长度变幅72.9cM~168.2cM,覆盖基因组总长度1273.4cM,含427分子标记,标记间的平均距离2.98cM。 展开更多
关键词 高丹草 SRAP和SSR标记 遗传连锁图谱
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中国南瓜(Cucurbita moschata D.)遗传图谱构建及果实黄酮QTL定位 预览
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作者 刘泽发 谢波 +1 位作者 孙波 孙小武 《中国瓜菜》 北大核心 2018年第12期5-10,18共7页
我国利用的南瓜栽培种主要有中国南瓜(Cucurbita moschata D.)、印度南瓜(C.maxima L.)和美洲南瓜(C.pepo L.).试验利用中国南瓜中皮色、果形及黄酮含量等性状互补的2份亲本材料构建了基于F2代分离群体的分子遗传图谱,包含87个分... 我国利用的南瓜栽培种主要有中国南瓜(Cucurbita moschata D.)、印度南瓜(C.maxima L.)和美洲南瓜(C.pepo L.).试验利用中国南瓜中皮色、果形及黄酮含量等性状互补的2份亲本材料构建了基于F2代分离群体的分子遗传图谱,包含87个分子标记、2个形态标记、18个连锁群,覆盖基因组1038.9cM,平均遗传距离为11.67cM;并对南瓜果实长棒形(longstick,ls)、全黄性状(yellowfull,yf)及果实黄酮含量(flavonoids,fl)进行了遗传定位. 展开更多
关键词 中国南瓜 黄酮 遗传连锁图 QTL定位
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基于SRAP和SSR标记构建的杏扁遗传连锁图谱 预览 被引量:1
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作者 王晓燚 孔德晶 艾鹏飞 《生物技术通报》 CSCD 北大核心 2018年第11期103-110,共8页
以杏扁品种‘龙王帽’授粉‘优一’获得98个F1代单株为作图群体,采用SRAP和SSR标记进行连锁图谱的构建。采用Join Map4.0软件进行连锁分析,分别构建了‘龙王帽’和‘优一’的分子连锁框架图,共获得132个SRAP标记和17个SSR标记。其中父... 以杏扁品种‘龙王帽’授粉‘优一’获得98个F1代单株为作图群体,采用SRAP和SSR标记进行连锁图谱的构建。采用Join Map4.0软件进行连锁分析,分别构建了‘龙王帽’和‘优一’的分子连锁框架图,共获得132个SRAP标记和17个SSR标记。其中父本遗传图谱涉及8个连锁群,包含53个SRAP标记和9个SSR标记,图谱总长为694.8cM,标记间平均图距为11.21cM,平均每个连锁群上有7.75个标记位点,连锁群平均长度为86.85cM;母本遗传图谱涉及8个连锁群,包含79个SRAP标记和8个SSR标记,图谱总长为924.8cM,标记间平均图距为10.63cM,平均每个连锁群上有10.87个标记位点,连锁群平均长度为115.6cM。 展开更多
关键词 杏扁 分子标记 遗传图谱 SRAP SSR
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西瓜种子大小相关性状分子标记与验证
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作者 陈欣 孙宇蛟 +3 位作者 刘明坤 刘识 王学征 栾非时 《分子植物育种》 CSCD 北大核心 2018年第1期163-169,共7页
以种子大小差异显著的黏籽西瓜(Citrullus lanatus ssp.mucosospermus)品系PI186490和普通栽培西瓜品系(Citrullus lanatus ssp.vulgaris)W1-1为亲本材料,通过杂交及自交获得的F2群体,对西瓜种子大小相关性状进行精细定位,并构建遗... 以种子大小差异显著的黏籽西瓜(Citrullus lanatus ssp.mucosospermus)品系PI186490和普通栽培西瓜品系(Citrullus lanatus ssp.vulgaris)W1-1为亲本材料,通过杂交及自交获得的F2群体,对西瓜种子大小相关性状进行精细定位,并构建遗传连锁图谱。结果表明:(1)获得与种子长度及宽度相关的QTL位点各一个,贡献率分别为24.57%和24.79%。(2)利用与种子长度及宽度紧密连锁的CAPS标记(CAPS13,CAPS14)对72份不同种子大小的自然群体材料上进行标记与表型的符合度的验证:标记CAPS13在大粒种子中检出率为36.11%,小粒检出率为80.56%;标记CAPS14在大粒中检出率为30.56%,小粒检出率为83.33%。 展开更多
关键词 西瓜 种子性状 CAPS 遗传连锁图谱
红三叶遗传图谱构建及抗白粉病基因QTL定位 预览
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作者 蒲小剑 田久胜 +1 位作者 田新会 杜文华 《草业学报》 CSCD 北大核心 2018年第4期79-88,共10页
本研究以感(岷山红三叶)、抗(澳大利亚红三叶品种♀Sensation×Renegade♂杂交新品系“甘农PR1”)白粉病红三叶材料为父母本杂交并种植成苗经人工接菌后筛选出抗、感白粉病的F 1群体为作图群体,利用AFLP标记构建红三叶高密度遗传图... 本研究以感(岷山红三叶)、抗(澳大利亚红三叶品种♀Sensation×Renegade♂杂交新品系“甘农PR1”)白粉病红三叶材料为父母本杂交并种植成苗经人工接菌后筛选出抗、感白粉病的F 1群体为作图群体,利用AFLP标记构建红三叶高密度遗传图谱,并利用区间作图法对抗白粉病QTL进行了定位分析,可以为红三叶抗白粉病基因克隆和转基因等分子辅助育种奠定基础。结果表明,149个AFLP标记构建得到的遗传图谱包含7个连锁群(LG1,LG2,LG3,LG4,LG5,LG6和LG7),遗传图谱的总距离为640.5 cM。其中,LG1连锁群的遗传距离(140.6 cM)和标记间平均距离(9.4 cM)均最大;LG4连锁群的遗传距离(55.2 cM)和标记间平均距离(1.8 cM)最小。应用区间作图法对红三叶抗白粉病基因进行QTL分析定位,共检测到5个抗白粉病相关QTL位点(qrp-1,qrp-2,qrp-3,qrp-4和qrp-5),其中qrp-1、qrp-2、qrp-3和qrp-4位于LG4连锁群上,qrp-5位于LG5连锁群上。5个QTL位点对抗白粉病的贡献率为29%~90%,qrp-1对红三叶白粉病抗性的贡献率最大(90%),为主效QTL。 展开更多
关键词 红三叶 AFLP分子标记 遗传连锁图谱 抗白粉病 QTL分析
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