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基因组选择方法研究进展 预览 被引量:1
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作者 王欣 孙辉 +1 位作者 胡中立 徐辰武 《扬州大学学报:农业与生命科学版》 北大核心 2018年第1期61-67,共7页
基因组选择能够在全基因组范围内同时估计出所有标记的效应,对表型未知的群体做出合理的预测,进而实现对品种更加全面、可靠的选择。该方法能够降低动植物育种的时间和人工成本,具有十分广阔的应用前景。概述GBLUP、贝叶斯和机器学习等... 基因组选择能够在全基因组范围内同时估计出所有标记的效应,对表型未知的群体做出合理的预测,进而实现对品种更加全面、可靠的选择。该方法能够降低动植物育种的时间和人工成本,具有十分广阔的应用前景。概述GBLUP、贝叶斯和机器学习等目前主流基因组选择方法的原理和特点、影响预测精度的主要因素以及基因组选择方法在动植物育种应用中的研究进展,并指出当前基因组选择方法研究所面临的问题和挑战。 展开更多
关键词 基因组选择 标记 预测 精度
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药物相关性分子靶标检测在儿童恶性实体肿瘤个体化治疗中的初步研究 预览 被引量:2
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作者 李斯文 王珊 +5 位作者 杨超 李长春 赵珍珍 孔祥如 邓晓斌 彭亮 《临床小儿外科杂志》 CAS 2017年第4期341-346,共6页
目的初步探讨药物相关性分子靶标检测在儿童恶性实体肿瘤个体化治疗中的临床意义。方法选择2014年2月至2017年3月期间于重庆医科大学附属儿童医院诊治的150例恶性实体肿瘤患儿,取其手术肿瘤组织标本150份,通过免疫组织化学(IHC)或聚合... 目的初步探讨药物相关性分子靶标检测在儿童恶性实体肿瘤个体化治疗中的临床意义。方法选择2014年2月至2017年3月期间于重庆医科大学附属儿童医院诊治的150例恶性实体肿瘤患儿,取其手术肿瘤组织标本150份,通过免疫组织化学(IHC)或聚合酶链式反应(PCR)测序的方法检测肿瘤药物相关性分子靶标的表达或突变,并根据靶标对应的药物分别比较间叶来源和非间叶来源的肿瘤,霍奇金淋巴瘤(Hodgkin lymphoma,HL)和非霍奇金淋巴瘤(non Hodgkin lymphoma,NHL),神经母细胞瘤(neuroblastoma,NB)和肝母细胞瘤(hepatoblastoma,HB)对常见化疗药物的敏感性及毒副作用有无差异。结果①共检测肿瘤标本化疗药物相关性分子靶标15个,包括:人切除修复交叉互补基因1(ERCC1),DNA拓扑异构酶 I(TOPO I),DNA拓扑异构酶Ⅱ A(TOPO Ⅱ A),DNA修复蛋白 O6- 甲基转移酶(MGMT),微管蛋白β3(tubulinβ3),胸苷酸合成酶(TS),CYP2C19*2,二氢叶酸还原酶[DHFR(C829T)],尿苷二磷酸-葡萄糖醛酸基转移酶(lUGT1A1*28),CYP2B6*6,亚甲基四氢叶酸还原酶[MTHFR(C677T)],巯嘌呤甲基转移酶[TPMT(A719G)],TPMT(G238C),二氢嘧啶脱氢酶[DPYD*2A(14+1G>A)]和DPYD*9(T85C)基因的表达或多态性。②根据靶标对应的相关药物进行分析,得出常用不同化疗药物在儿童恶性实体肿瘤中的总体敏感率及毒副反应情况:甲氨蝶呤敏感占100 0%,替莫唑胺/卡莫司汀/司莫司汀敏感占66 7%,蒽环类/依托泊苷、氟尿嘧啶敏感占52 2%,铂类敏感占52 1%,长春碱类敏感占51 6%,伊立替康/拓扑替康不敏感占81 5%,环磷酰胺不敏感占53 7%;甲氨蝶呤毒副反应弱占90 0%,巯嘌呤毒副反应弱占87 5%,环磷酰胺毒副反应弱占73 8%,氟尿嘧啶毒副反应弱占64 3%,伊立替康/依托泊苷毒副反应弱占55 6%。③不同来源、不同病理类型的儿童恶性实体肿瘤对同一化疗药物敏感性的差异比较:间叶源性肿瘤较非间叶源性肿瘤对伊立替康/拓扑替 展开更多
关键词 儿童 恶性实体肿瘤 分子靶标 个体化化疗
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Effects of marker density and minor allele frequency on genomic prediction for growth traits in Chinese Simmental beef cattle 预览
3
作者 ZHU Bo ZHANG Jing-jing +8 位作者 NIU Hong GUAN Long GUO Peng XU Ling-yang CHEN Yan ZHANG Lu-pei GAO Hui-jiang GAO Xue LI Jun-ya 《农业科学学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2017年第4期911-920,共10页
Genomic selection has been demonstrated as a powerful technology to revolutionize animal breeding. However,marker density and minor allele frequency can affect the predictive ability of genomic estimated breeding valu... Genomic selection has been demonstrated as a powerful technology to revolutionize animal breeding. However,marker density and minor allele frequency can affect the predictive ability of genomic estimated breeding values(GEBVs). To investigate the impact of marker density and minor allele frequency on predictive ability,we estimated GEBVs by constructing the different subsets of single nucleotide polymorphisms(SNPs)based on varying markers densities and minor allele frequency(MAF)for average daily gain(ADG),live weight(LW)and carcass weight(CW)in 1059 Chinese Simmental beef cattle. Two strategies were proposed for SNP selection to construct different marker densities:1)select evenly-spaced SNPs(Strategy 1),and 2)select SNPs with large effects estimated from Bayes B(Strategy 2). Furthermore,predictive ability was assessed in terms of the correlation between predicted genomic values and corrected phenotypes from 10-fold cross-validation. Predictive ability for ADG,LW and CW using autosomal SNPs were 0.13±0.002,0.21±0.003 and 0.25±0.003,respectively. In our study,the predictive ability increased dramatically as more SNPs were included in analysis until 200K for Strategy 1. Under Strategy 2,we found the predictive ability slightly increased when marker densities increased from 5K to 20K,which indicated the predictive ability of 20K(3% of 770K)SNPs with large effects was equal to the predictive ability of using all SNPs. For different MAF bins,we obtained the highest predictive ability for three traits with MAF bin 0.01–0.1. Our result suggested that designing a low-density chip by selecting low frequency markers with large SNP effects sizes should be helpful for commercial application in Chinese Simmental cattle. 展开更多
关键词 中国西门塔尔牛 等位基因频率 预测能力 标记密度 生长性状 基因组 育种值估计 SNPs
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Characterization of plant genomic SSR loci and exploration of an experiential method of developing SSR markers 预览
4
作者 Xiaodong ZHU Linhai WANG +3 位作者 Jingyin YU Xin WEI Yanxin ZHANG Xiurong ZHANG 《中国油料作物学报(英文版)》 2016年第1期21-30,共10页
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GBLUP技术在鸡品种选育中的应用效果研究 被引量:1
5
作者 郭其新 徐璐 +6 位作者 鲁伟 张康宁 袁青妍 许盛海 武玮 常国斌 陈国宏 《中国家禽》 北大核心 2016年第20期6-9,共4页
为揭示遗传力和标记密度对估计基因组育种值的影响和探讨基因组选择在家禽育种中的效果,运用QMSim软件分别模拟不同遗传力、不同标记数目的群体结构数据、基因组信息数据及相应的表型数据;运用基因组最佳线性无偏估计(GBLUP)方法估... 为揭示遗传力和标记密度对估计基因组育种值的影响和探讨基因组选择在家禽育种中的效果,运用QMSim软件分别模拟不同遗传力、不同标记数目的群体结构数据、基因组信息数据及相应的表型数据;运用基因组最佳线性无偏估计(GBLUP)方法估计基因组育种值,并计算基因组育种值的准确性;比较基因组选择与表型选择在育种成本以及遗传进展的差异。结果显示,随着遗传力和标记数目增加,估计育种值准确性明显提高,同时基因组选择在遗传进展上具有明显优势,但是在对表型选择与基因组选择进行成本分析时,基因组选择的成本并没有明显提高。因此,基因组选择育种在家禽育种过程中具有明显优势。 展开更多
关键词 基因组选择 标记数目 遗传力 准确性
苎麻Genomic-SSR与EST-SSR分子标记遗传差异性分析 预览 被引量:3
6
作者 刘晨晨 栾明宝 +3 位作者 陈建华 王晓飞 许英 孙志民 《中国麻业科学》 2015年第2期57-63,共7页
为了明确苎麻不同SSR的遗传差异性,利用Genomic-SSR与EST-SSR两种SSR标记对19个苎麻核心种质的遗传多样性进行分析。根据统计结果,Genomic-SSR平均检测到的观测等位基因数为3.4643、有效等位基因数为2.1982、Shannon多样性指数为0.8864... 为了明确苎麻不同SSR的遗传差异性,利用Genomic-SSR与EST-SSR两种SSR标记对19个苎麻核心种质的遗传多样性进行分析。根据统计结果,Genomic-SSR平均检测到的观测等位基因数为3.4643、有效等位基因数为2.1982、Shannon多样性指数为0.8864、观测杂合度为0.5254、期望杂合度为0.5172;EST-SSR平均检测到的观测等位基因数为2.3333、有效等位基因数为1.9438、Shannon多样性指数为0.7120、观测杂合度为0.5128、期望杂合度为0.4778。Genomic-SSR和EST-SSR两种引物的有效等位基因数(Ne)和观测杂合度(Ho)差异不显著,Genomic-SSR的Shannon指数显著高于EST-SSR。研究结果表明,在标记多态性及基因型鉴别等方面,Genomic-SSR与EST-SSR均具有显著的遗传差异性,但是两种标记都能有效的鉴别不同基因型个体。Genomic-SSR可优先用于分子身份证、高密度遗传连锁图谱的构建和遗传多样性分析;EST-SSR用来研究苎麻近缘种间的遗传多样性、进化分析、连锁图谱和比较基因组学更有优越性。 展开更多
关键词 苎麻 遗传差异性 分子标记 GENOMIC-SSR EST-SSR
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俄罗斯蜜蜂保种群的遗传标识码:基因组微卫星标记谱图 预览 被引量:1
7
作者 Brando rf A Ivoilova M +1 位作者 李兴安 薛运波 《中国蜂业》 2013年第Z3期17-22,共6页
俄罗斯蜜蜂是欧洲人大约在十九世纪中期向俄罗斯符拉迪沃斯托克及其周边海冰边疆(即俄罗斯远东地区)移居时带入的西方蜜蜂;欧洲黑蜂在欧洲向东方向的地理分布极限地域是位于俄罗斯西部平原(欧洲部分)与东部高原、山地(亚洲部分)之间的... 俄罗斯蜜蜂是欧洲人大约在十九世纪中期向俄罗斯符拉迪沃斯托克及其周边海冰边疆(即俄罗斯远东地区)移居时带入的西方蜜蜂;欧洲黑蜂在欧洲向东方向的地理分布极限地域是位于俄罗斯西部平原(欧洲部分)与东部高原、山地(亚洲部分)之间的乌拉尔山脉,即俄罗斯中部地区。为了初步揭示俄罗斯蜜蜂与欧洲黑蜂之间的遗传关系,本研究通过聚合酶链反应体外扩增基因组微卫星标记的方法,对俄罗斯远东地区采样点的俄罗斯蜜蜂(俄罗斯当地人称之为俄罗斯远东黑蜂)和俄罗斯中部地区采样点的欧洲黑蜂(俄罗斯当地人称之为俄罗斯中部蜜蜂)进行了比对分析。聚丙烯酰胺凝胶电泳的结果显示,绝大多数蜜蜂样本在11个基因组微卫星位点均出现等位序列条带,两种蜜蜂样本的等位序列条带数构成了各自特有的基因组微卫星DNA等位序列标记谱图。这提示,俄罗斯蜜蜂样本的基因组微卫星DNA等位序列标记谱图作为俄罗斯蜜蜂保种群的遗传标识码,很可能具有特异性(相对于欧洲黑蜂样本的基因组微卫星DNA等位序列标记谱图)。 展开更多
关键词 俄罗斯蜜蜂 保种群 遗传标识码 基因组微卫星 标记谱图
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Genetic Analysis of Genomic DNA in Shanxi Lean Meat Pigs (SD-Ⅲ Line) 预览 被引量:1
8
作者 Wenjin ZHU Yunguo ZHANG +3 位作者 Yongmei SU Jing NI Jianhua WU Chuanjia GUO 《农业科学与技术:英文版》 CAS 2012年第7期1579-1582,共4页
Abstract [Objective] This study aimed to detect the purity of Shanxi lean meat pigs. [Method] Eight primers were selected and used in the DNA fingerprinting technique amplified fragment length polymorphism (AFLP) to... Abstract [Objective] This study aimed to detect the purity of Shanxi lean meat pigs. [Method] Eight primers were selected and used in the DNA fingerprinting technique amplified fragment length polymorphism (AFLP) to detect the purity of 30 Shanxi lean meat pigs. [Result] A total of 206 AFLP markers were obtained; 3-15 bands were obtained from each primer. The similarity index of population in Shanxi local pigs was 0.931 on average. [Conclusion] AFLP is suitable for detection of genomic DNA, and the genetic purity of SD-Ⅲ line is higher. 展开更多
关键词 Key words PIGS GENOMIC DNA AFLP Molecular marker
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山西瘦肉型猪(SD-Ⅲ系)基因组DNA的AFLP检测研究 预览 被引量:2
9
作者 朱文进 苏咏梅 +5 位作者 关学敏 岳文斌 姜玉锁 张美俊 张桂贤 郭传甲 《激光生物学报》 CAS CSCD 2006年第2期 191-194,共4页
用分子标记AFLP对山西瘦肉型猪(SD-Ⅲ系)进行纯度检测,旨在为评价该猪种的遗传特性提供相关参数。实验共用8条引物,对25头猪进行了基因组DNA的分析,共获得171个AFLP标记,单引物获得的标记数在3个~15个之间,群体相似系数为0.928... 用分子标记AFLP对山西瘦肉型猪(SD-Ⅲ系)进行纯度检测,旨在为评价该猪种的遗传特性提供相关参数。实验共用8条引物,对25头猪进行了基因组DNA的分析,共获得171个AFLP标记,单引物获得的标记数在3个~15个之间,群体相似系数为0.928(0.892~0.978);遗传距离为0.072(0.022~0.108)。结果表明:AFLP适宜于基因组DNA遗传结构检测;SD-Ⅲ系猪纯度较高。 展开更多
关键词 基因组DNA 相似系数 分子标记 遗传距离
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不同性别类型黄瓜品种基因组DNA的提取及RAPD标记的初步研究 预览 被引量:4
10
作者 向太和 王利琳 +2 位作者 胡江琴 庞基良 余爱华 《杭州师范学院学报:自然科学版》 CAS 2005年第2期 121-123,141,共4页
采用改良的异丙醇沉淀法成功地提取了11个不同性别类型黄瓜品种的基因组DNA.以此作为PCR扩增反应模板进行RAPD分析,结果从22个10bp随机寡核苷酸引物中筛选出2个引物S23和S91在全雌性品种MT700和其他性别类型的品种之间稳定地扩增出多态... 采用改良的异丙醇沉淀法成功地提取了11个不同性别类型黄瓜品种的基因组DNA.以此作为PCR扩增反应模板进行RAPD分析,结果从22个10bp随机寡核苷酸引物中筛选出2个引物S23和S91在全雌性品种MT700和其他性别类型的品种之间稳定地扩增出多态性.至于该多态性标记是否与黄瓜雌性性别有关,还有待进一步分析. 展开更多
关键词 基因组DNA 黄瓜品种 RAPD标记 性别 类型 提取 RAPD分析 PCR扩增 多态性标记 醇沉淀法 寡核苷酸 全雌性 引物
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山西瘦肉型猪(SD-Ⅲ系)基因组DNA的AFLP和RAPD检测研究 预览
11
作者 朱文进 郭传甲 张桂贤 《山西农业大学学报:自然科学版》 CAS 2004年第1期 6-9,共4页
用AFLP和RAPD两种分子标记对山西瘦肉型猪(SD-Ⅲ系)进行纯度检测,旨在为评价该猪种的遗传稳定性提供相关参数,并对这两种方法应用于遗传距离、相似系数的估测进行了比较. AFLP实验用8条引物,对SD-Ⅲ系14头猪进行了基因组DNA分析,共获得... 用AFLP和RAPD两种分子标记对山西瘦肉型猪(SD-Ⅲ系)进行纯度检测,旨在为评价该猪种的遗传稳定性提供相关参数,并对这两种方法应用于遗传距离、相似系数的估测进行了比较. AFLP实验用8条引物,对SD-Ⅲ系14头猪进行了基因组DNA分析,共获得101个AFLP标记,单引物获得的标记数在3~15之间,群体相似系数为0.928(0.892~0.978);遗传距离为0.072(0.108~0.022).RAPD实验用14条随机引物,共获得124个RAPD标记,单引物获得的标记数在4~11之间,群体相似系数为0.944(0.901~0.987);遗传距离为0.056(0.099~0.013).结果表明:1 AFLP和RAPD适宜于基因组DNA检测,但AFLP优于RAPD,2 SD-Ⅲ系猪纯度较高. 展开更多
关键词 山西 瘦肉型猪 SD-Ⅲ系 基因组 DNA AFLP RAPD 相似系教 分子标记 遗传距离
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梭子蟹科六种海产蟹的RAPD标记 预览 被引量:16
12
作者 金珊 赵青松 +1 位作者 王春琳 陈寅儿 《动物学研究》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期 172-176,共5页
选取日本蟳(普陀、嵊泗两个自然群体)、锈斑蟳、锐齿蟳、三疣梭子蟹、红星梭子蟹、青蟹共6种海产蟹,用RAPD方法检测了其基因组DNA的多态性.在事先优化的反应条件下,用16个随机引物共扩增出123条多态性片段,片段大小在500~14 000 bp.在... 选取日本蟳(普陀、嵊泗两个自然群体)、锈斑蟳、锐齿蟳、三疣梭子蟹、红星梭子蟹、青蟹共6种海产蟹,用RAPD方法检测了其基因组DNA的多态性.在事先优化的反应条件下,用16个随机引物共扩增出123条多态性片段,片段大小在500~14 000 bp.在123条扩增片段中,6种蟹共享的片段有2条,3种蟳有13条,2种梭子蟹有16条;6种蟹之间随机扩增DNA片段的共享度在0.0606~0.8000,相对遗传距离指数在0.2000~0.9394.根据获得的相对遗传距离指数,用PHYLIP 3.5 软件包中的UPGMA和NJ方法进行聚类处理.UPGMA和NJ聚类图均显示三疣梭子蟹和红星梭子蟹先聚在一起,再和青蟹聚在一起.6种蟹的亲缘关系与传统的形态学分类结果基本一致. 展开更多
关键词 梭子蟹科 海产蟹 RAPD标记 基因组DNA 遗传标记 亲缘关系
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小麦叶片直接用于PCR和RAPD反应的方法 预览 被引量:9
13
作者 汪秀峰 杨剑波 +2 位作者 吴丽芳 李莉 向太和 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期 332-334,共3页
本研究以经过碱处理的小麦叶片直接作为PCR和RAPD反应的模板,并应用于小麦转基因目标性状的跟踪检测、品种多态性分析等方面.该方法具有快速、简便等特点,尤其是在受测群体较大时,此种方法更显得经济有效.
关键词 小麦叶片 PCR RAPD反应 基因组DNA 分子标记
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一种叶片直接作用PCR扩增的新方法及其应用 预览 被引量:26
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作者 汪秀峰 杨剑波 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期 67-70,共4页
以水稻为模式植物研究了利用碱处理叶片直接用作PCR扩增的模板,并应用于水稻品种种性和纯度鉴定以及分子标记辅助田间育种材料的选择中。该方法具有快速、简便、结果可信度高,重复性好,对待测植株的损伤小等特点,它无需高速冷冻离... 以水稻为模式植物研究了利用碱处理叶片直接用作PCR扩增的模板,并应用于水稻品种种性和纯度鉴定以及分子标记辅助田间育种材料的选择中。该方法具有快速、简便、结果可信度高,重复性好,对待测植株的损伤小等特点,它无需高速冷冻离心机及相应的提取DNA的试剂,故试验成本低,检测所需的时间短。尤其是群体较大时,此种方法更是显得经济有效,利用此种方法在1d内可检测300份样品。 展开更多
关键词 水稻 基因组DNA 分子标记 聚合酶链式反应 鉴定 研究方法 叶片
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菜豆基因组微卫星DNA的分离与鉴定 预览 被引量:3
15
作者 郭建春 柳原诚司 《植物学报:英文版》 CSCD 2000年第11期 1179-1183,共5页
从耐高温型菜豆(Phaseolus vulgaris L.)品种“Haibushi”基因组分离微卫星DNA,可以提供与耐热性QTL(quantitative trait locus)连锁的多态遗传标记。为此,利用la... 从耐高温型菜豆(Phaseolus vulgaris L.)品种“Haibushi”基因组分离微卫星DNA,可以提供与耐热性QTL(quantitative trait locus)连锁的多态遗传标记。为此,利用lambda ZAPⅡ载体构建了一个包含400-800bp插入片段的菜豆基因组文库。利用地高辛末端标记寡聚核苷酸(GA)10和(CA)10作为探针筛选该文库,并对部分阳性克隆进行测序分析, 展开更多
关键词 菜豆 基因组文库 微卫星DNA 分子标记 序列分析
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中间偃麦草第6同源群特异STS标记开发 预览
16
作者 刘淑娟 张晓军 +10 位作者 李欣 刘成 白建荣 任永康 郑军 李世姣 郭慧娟 梅超 张树伟 畅志坚 乔麟轶 《草业学报》 CSCD 北大核心 2019年第4期139-145,共7页
中间偃麦草(2n=6x=42,JJJ~sJ~sStSt)是小麦遗传改良的重要野生资源之一,因其基因组尚未完成测序,造成目前已报道的特异分子标记数量较少,不能满足小麦生产和研究领域内对杂交材料中外源片段或外源基因鉴定的需求。本研究利用中间偃麦草... 中间偃麦草(2n=6x=42,JJJ~sJ~sStSt)是小麦遗传改良的重要野生资源之一,因其基因组尚未完成测序,造成目前已报道的特异分子标记数量较少,不能满足小麦生产和研究领域内对杂交材料中外源片段或外源基因鉴定的需求。本研究利用中间偃麦草GBS芯片探针数据组装了5877409条Contig序列,筛选后获得5452条与小麦基因组相似性低于80%的、具有染色体位置信息的非冗余序列,据此开发2019个序列标签位点(sequence-tagged site,STS)分子标记,在中间偃麦草第1至第7同源群中的分布依次为250、215、323、253、323、253和402;利用5株中间偃麦草和5份小麦农家种的DNA从253个第6同源群(G6)标记中进一步筛选出160个中间偃麦草特异标记,其中"+/-"型特异标记共有53个,分布在G6-Chr1(32个)、G6-Chr2(13个)和G6-Chr3(8个)染色体上;接着利用拟鹅观草(2n=2x=14,StSt)、百萨偃麦草(2n=2x=14,J~bJ~b)、二倍体长穗偃麦草(2n=2x=14,J~eJ~e)以及中国春-二倍体长穗偃麦草6J~e代换系推断G6-Chr2为6St染色体;最后利用6St上开发的13个"+/-"型标记,从分子水平对小麦-偃麦草代换系F881(6St/6D)中的外源6St染色体进行了验证。研究结果将为中间偃麦草染色体或染色体片段的鉴定提供较为方便和经济的检测手段。 展开更多
关键词 中间偃麦草 基因组特异 STS分子标记
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基因组选择技术在家禽育种中的应用 被引量:1
17
作者 吴桂琴 闫奕源 +3 位作者 李花妮 李光奇 韩文朋 赵丽红 《中国家禽》 北大核心 2018年第9期1-5,共5页
基因组选择是动物育种领域的一项前沿的选种技术,在家禽育种中的研究和应用正在积极开展。文章综述了基因组选择的基本原理、鸡DNA分型的方法、目前基因组选择在国内外家禽育种企业中的应用情况,以及基因组选择在家禽育种产业化应用所... 基因组选择是动物育种领域的一项前沿的选种技术,在家禽育种中的研究和应用正在积极开展。文章综述了基因组选择的基本原理、鸡DNA分型的方法、目前基因组选择在国内外家禽育种企业中的应用情况,以及基因组选择在家禽育种产业化应用所面临的成本、算法、人才等挑战。尽管基因组选择在家禽育种中存在这些挑战,但是随着基因组选择的模型和算法完善以及基因型测定技术成本的日趋下降,基因组选择必将在家禽育种中得到广泛应用,从而加速品种培育进程。 展开更多
关键词 基因组选择 分子标记 家禽育种 应用
小麦-黑麦抗条锈病1BL/1RS易位系8-2-1的鉴定 预览
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作者 梁邦平 刁慧珊 +10 位作者 李家创 袁凤平 刘洋 白宇皓 李毛 郝冬冬 白升升 武军 赵继新 杨群慧 陈新宏 《麦类作物学报》 CSCD 北大核心 2018年第9期1045-1052,共8页
利用农艺性状优良的普通小麦品系W770B(2n=6x=42,AABBDD)与墨西哥黑麦(Secale cere-ale L.2n=2x=14,RR)杂交,秋水仙素处理染色体加倍,再经过多次与W770B回交,筛选出若干性状优良的衍生系。在大田用抖粉法人工接种条锈病混合... 利用农艺性状优良的普通小麦品系W770B(2n=6x=42,AABBDD)与墨西哥黑麦(Secale cere-ale L.2n=2x=14,RR)杂交,秋水仙素处理染色体加倍,再经过多次与W770B回交,筛选出若干性状优良的衍生系。在大田用抖粉法人工接种条锈病混合菌种(CYR31,CYR32)对衍生系进行多次鉴定,筛选出对条锈病混合菌种(CYR31,CYR32)高抗的衍生系8-2-10为了明确小麦新种质8-2-1的遗传基础,为该种质的应用提供参考,采用细胞学、原位杂交(genomic in situ hybridization,GISH)、分子标记(SCAR,SSR)、SDS-PAGE、近红外谷物分析仪和农艺性状调查对其进行鉴定分析。细胞学鉴定结果表明,8-2-1具有42条染色体(2n=42=21Ⅱ);以黑麦DNA为探针的原位杂交(GISH)鉴定结果表明,8-2-1具有黑麦染色体信号;黑麦特异SCAR标记和1RS上的SCAR标记能够同时在黑麦和8-2-1中扩增出特异条带;小麦各个基因组SSR分子标记鉴定结果表明,只有小麦1BS上的SSR标记不能在8-2-1中扩增出目的条带,表明8-2-1为小麦-黑麦1BL/1RS易位系。SDS-PAGE结果表明,8-2-1亚基组成为Null、7+8、2+12,与W770B(Null,7+16,2+12)在Glu-B1位点编码的HMW-GS存在差异。8-2-1粗蛋白含量(干基)、面筋含量(湿基)达到中筋小麦标准;Zele-ny沉降值符合弱筋小麦标准。农艺性状调查发现,8-2-1具有早熟、大穗、大粒等优点。因此,8-2-1可为培育高产、抗病和优质小麦新品种提供重要的中间材料。 展开更多
关键词 1BL/1RS 条锈病 原位杂交 分子标记 高分子量谷蛋白亚基
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紫花苜蓿QTL与全基因组选择研究进展及其应用 预览 被引量:4
19
作者 康俊梅 张铁军 +2 位作者 王梦颖 张怡 杨青川 《草业学报》 CSCD 北大核心 2014年第6期304-312,共9页
四倍体紫花苜蓿是重要的豆科牧草之一,由于其复杂的遗传背景与二倍体作物相比遗传作图与重要性状数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位研究相对滞后。然而,二倍体苜蓿的相关研究起步较早,已经建立了高密度遗传图谱和物理图... 四倍体紫花苜蓿是重要的豆科牧草之一,由于其复杂的遗传背景与二倍体作物相比遗传作图与重要性状数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位研究相对滞后。然而,二倍体苜蓿的相关研究起步较早,已经建立了高密度遗传图谱和物理图谱,这些研究为四倍体苜蓿遗传作图与QTL定位奠定了基础。随着第三代分子标记与测序技术的快速发展,极大地促进了四倍体苜蓿的高密度遗传图谱构建与QTL定位研究,并借助分子标记辅助育种技术对提高苜蓿选育效率,加速育种进程具有重要意义。本文对苜蓿遗传图谱构建与QTL定位研究及发展趋势进行了总结,并对苜蓿关联作图与全基因组选择的研究进展及应用前景加以概述,旨在为读者就相关研究领域有较全面的了解。 展开更多
关键词 苜蓿 遗传连锁图谱 QTL 全基因组选择 分子标记辅助育种
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水稻基因组DNA提取方法的研究 预览 被引量:7
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作者 马文东 《黑龙江农业科学》 2014年第1期7-11,共5页
为探索分子标记辅助选择育种中快速有效的DNA 提取方法,以水稻新鲜叶片、衰老叶片、水稻种子为材料,以CTAB法和SDS法为提取方法,利用紫外分光光度计和琼脂糖凝胶电泳进行DNA纯度检测,对水稻基因组DNA提取方法和实验体系进行了优化... 为探索分子标记辅助选择育种中快速有效的DNA 提取方法,以水稻新鲜叶片、衰老叶片、水稻种子为材料,以CTAB法和SDS法为提取方法,利用紫外分光光度计和琼脂糖凝胶电泳进行DNA纯度检测,对水稻基因组DNA提取方法和实验体系进行了优化和摸索。结果表明:新鲜叶片提取效果最好,其次是种子,再次是衰老叶片;CTAB法和SDS法差别不大;为避免酚类物质氧化污染,可在提取液中添加β-巯基乙醇。 展开更多
关键词 水稻 基因组DNA CTAB法 SDS法 分子标记辅助育种
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