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禾本科植物NBS-LRR类抗病基因结构、功能和进化研究进展 预览
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作者 兰冬雪 汤丽影 +3 位作者 李佳 谢鹏远 吕玉光 戚晓利 《中国农学通报》 2019年第15期124-127,共4页
禾本科植物是粮食的主要来源,NBS-LRR类抗病基因作为抗病基因数目最多的家族,在植物抵御病虫害中起着关键作用。为了深入研究NBS-LRR抗病基因,本研究介绍了禾本科植物NBS-LRR类抗病基因的结构与功能、分类和数量,抗病基因的分布及进化... 禾本科植物是粮食的主要来源,NBS-LRR类抗病基因作为抗病基因数目最多的家族,在植物抵御病虫害中起着关键作用。为了深入研究NBS-LRR抗病基因,本研究介绍了禾本科植物NBS-LRR类抗病基因的结构与功能、分类和数量,抗病基因的分布及进化模式。同时对该类基因的研究前景进行了展望,提出需要深入研究的问题。 展开更多
关键词 抗病基因 NBS-LRR 分子进化 禾本科
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美国农业部黄瓜分子育种研究简介 预览
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作者 翁益群 《天津农业科学》 CAS 2019年第6期6-18,共13页
美国农业部黄瓜研究实验室隶属于美国农业部农业研究署(USDA-ARS)蔬菜作物研究室(VCRU),挂靠于威斯康星大学园艺系。该实验室黄瓜育种项目始于1968年。过去50年中,该实验室在黄瓜遗传育种方面取得了丰硕的成果,并对美国及世界黄瓜育种... 美国农业部黄瓜研究实验室隶属于美国农业部农业研究署(USDA-ARS)蔬菜作物研究室(VCRU),挂靠于威斯康星大学园艺系。该实验室黄瓜育种项目始于1968年。过去50年中,该实验室在黄瓜遗传育种方面取得了丰硕的成果,并对美国及世界黄瓜育种起到了重要的推动作用。本文简要介绍了实验室的历史及研究成果,着重概括了2008—2018年本实验室在以下方面所做的研究及取得的成绩:(1)黄瓜应用基因组学工具的开发;(2)黄瓜重要经济性状分子标记的开发,基因及主效QTL的克隆与功能研究;(3)黄瓜染色体的起源与进化分析,以及栽培黄瓜的驯化与种质资源的遗传多样性研究。同时,对所取得的各项成果在黄瓜育种中的潜力进行了评价。最后对今后实验室的工作进行了展望。 展开更多
关键词 黄瓜 分子育种 QTL 基因克隆 染色体进化 驯化
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2013-2018年中国H7N9流感病毒HA与NA进化研究
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作者 安淑一 孙英伟 姚文清 《公共卫生与预防医学》 2019年第3期10-15,共6页
目的研究2013-2018年中国H7N9流感病毒HA与NA进化研究。方法通过收集NCBI网站HA与NA序列数据,对各年份筛选出序列进行进化分析、关键位点分析,糖基化位点分析。结果H7N9流感病毒HA与NA序列中韩与美国形成两大分支。韩国与中国形成并列... 目的研究2013-2018年中国H7N9流感病毒HA与NA进化研究。方法通过收集NCBI网站HA与NA序列数据,对各年份筛选出序列进行进化分析、关键位点分析,糖基化位点分析。结果H7N9流感病毒HA与NA序列中韩与美国形成两大分支。韩国与中国形成并列分支。2013-2018年间遗传距离增加,同源性递减。所有中国株缺失69~73位缺失“QISNT”。NA糖基化位点42~45位,关键位点193有突变。HA抗原决定簇148位点,182和183位点有变异,关键位点186和134有突变。结论中国H7N9流感病毒HA与NA序列正在变迁,部分关键位点已经发生突变,可能会改变病毒的致病特征。 展开更多
关键词 H7N9 血凝素(HA) 神经氨酸酶(NA) 分子进化 突变
CYP116B家族单加氧酶的发现、表征及分子改造研究进展 预览
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作者 李仁结 张龑 +1 位作者 许建和 郁惠蕾 《生物加工过程》 CAS 2019年第1期29-35,43共8页
CYP116B家族单加氧酶属于细胞色素P450单加氧酶的第IV家族,能够催化包括羟化、硫醚氧化、O脱烷基、N脱烷基和环氧化等在内的多种类型反应,具有广阔的应用前景。近年来,多个CYP116B家族成员酶的发现、分子改造及底物谱拓展使人们对它的... CYP116B家族单加氧酶属于细胞色素P450单加氧酶的第IV家族,能够催化包括羟化、硫醚氧化、O脱烷基、N脱烷基和环氧化等在内的多种类型反应,具有广阔的应用前景。近年来,多个CYP116B家族成员酶的发现、分子改造及底物谱拓展使人们对它的酶学性质有了更为深入的理解,为开发新型具有工业应用潜力的CYP116B家族成员酶提供了研究基础。本文中,笔者主要从CYP116B家族单加氧酶的发现、表征、分子改造及结构功能关系等方面综述CYP116B在生物催化领域的研究进展。 展开更多
关键词 CYP116B家族单加氧酶 表征 分子改造 结构功能关系
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The Genome of Cucurbita argyrosperma (Silver- Seed Gourd) Reveals Faster Rates of Protein- Coding Gene and Long Noncoding RNA Turnover and Neofunctionalization within Cucurbita
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作者 Josue Barrera-Red on do Enrique Ibarra-Laclette +6 位作者 Alejandra Vazquez-Lobo Yocelyn T. Gutierrez-Guerrero Guillermo Sanchez de la Vega Daniel Pinero Salvador Montes-Hernandez Rafael Lira-Saade Luis E. Eguiarte 《分子植物:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第4期506-520,共15页
Whole-genome duplications are an important source of evolutionary novelties that change the mode and tempo at which genetic elements evolve within a genome. The Cucurbita genus experienced a wholegenome duplication ar... Whole-genome duplications are an important source of evolutionary novelties that change the mode and tempo at which genetic elements evolve within a genome. The Cucurbita genus experienced a wholegenome duplication around 30 million years ago, although the evolutionary dynamics of the coding and noncoding genes in this genus have not yet been scrutinized. Here, we analyzed the genomes of four Cucurbita species, in eluding a newly assembled genome of Cucurbita argyrosperma, and compared the gene con tents of these species with those of five other members of the Cucurbitaceae family to assess the evolutionary dynamics of protein-coding and long intergenic noncoding RNA (lincRNA) genes after the genome duplication. We report that Cucurbita genomes have a higher protein-coding gene birth-death rate compared with the genomes of the other members of the Cucurbitaceae family. C. argyrosperma gene families associated with pollination and transmembrane transport had significantly faster evolutionary rates. lincRNA families showed high levels of gene turnover throughout the phylogeny, and 67.7% of the lincRNA families in Cucurbita showed evidence of birth from the neofunctionalization of previously existing protein-coding genes. Collectively, our results suggest that the whole-genome duplication in Cucurbita resulted in faster rates of gene family evolution through the neofunctionalization of duplicated genes. 展开更多
关键词 CUCURBITA argyrosperma comparative GENOMICS molecular evolution neofunctionalization LONG noncoding RNA WHOLE-GENOME DUPLICATION
基于分子动力学模拟的纳米铝板力学性能与缺陷演化过程的尺寸效应研究
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作者 王路生 丁军 +2 位作者 宋鹍 刘泊 黄霞 《机械强度》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期333-339,共7页
采用分子动力学方法模拟了不同分子动力学模型尺寸对含初始裂纹缺陷纳米单晶铝板在拉伸载荷作用下的裂纹缺陷演化过程的影响。结果表明:随着模型尺寸增大,材料的屈服应力减小,屈服点提前,断裂韧性提高。在弹性阶段,材料变形与体系内部... 采用分子动力学方法模拟了不同分子动力学模型尺寸对含初始裂纹缺陷纳米单晶铝板在拉伸载荷作用下的裂纹缺陷演化过程的影响。结果表明:随着模型尺寸增大,材料的屈服应力减小,屈服点提前,断裂韧性提高。在弹性阶段,材料变形与体系内部原子的点缺陷和面缺陷相关;在塑性变形阶段,材料变形与位错增殖和滑移相关。裂纹尖端处应力集中是裂尖附近晶体结构发生相变的原因,能量在相变后释放导致应力松弛所致。 展开更多
关键词 分子动力学 尺寸效应 力学性能 缺陷演化
陕西杨凌地区番茄斑萎病毒外壳蛋白基因的克隆与分析 预览
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作者 默宁 石岩 +2 位作者 秦蕾 李云洲 梁燕 《中国蔬菜》 北大核心 2019年第3期36-40,共5页
番茄斑萎病毒(Tomatospottedwiltvirus,TSWV)是世界上危害最大的十大病毒之一,为了确定陕西杨凌地区的番茄感染TSWV情况,采集该地区4份疑似感染TSWV的番茄样品,通过表型观察以及PCR分子鉴定进行分析。结果显示,2份材料扩增出234bp的特... 番茄斑萎病毒(Tomatospottedwiltvirus,TSWV)是世界上危害最大的十大病毒之一,为了确定陕西杨凌地区的番茄感染TSWV情况,采集该地区4份疑似感染TSWV的番茄样品,通过表型观察以及PCR分子鉴定进行分析。结果显示,2份材料扩增出234bp的特异性条带,表明样品感染了TSWV。采用同源克隆方法获得了杨凌地区757bpTSWV的外壳蛋白基因(CP),其与西班牙TSWV分离物同源性最高,为99%,而与昆明的TSWV分离物亲缘关系较远。 展开更多
关键词 番茄斑萎病毒 分子鉴定 系统进化
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无脊椎动物乙酰胆碱酯酶研究进展 预览
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作者 孟祥坤 缪丽君 +1 位作者 董帆 王建军 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2019年第3期508-519,共12页
乙酰胆碱酯酶(AChE)是生物体中一种十分重要的神经递质水解酶,也是有机磷和氨基甲酸酯类杀虫剂的作用靶标。AChE在不同生物中的性质显著不同,如编码基因个数、序列保守性、表达分布及生理功能等。作为杀虫剂的主要作用靶标之一,AChE不... 乙酰胆碱酯酶(AChE)是生物体中一种十分重要的神经递质水解酶,也是有机磷和氨基甲酸酯类杀虫剂的作用靶标。AChE在不同生物中的性质显著不同,如编码基因个数、序列保守性、表达分布及生理功能等。作为杀虫剂的主要作用靶标之一,AChE不但可以通过单个点突变引起昆虫抗药性,还能够通过多个点突变联合作用、靶标表达量变化及基因复制等方式引起抗药性并且改变昆虫的适合度代价。本文主要从AChE的基因类型、分子进化、蛋白结构、生理功能、与昆虫的抗药性关系、同一物种中不同AChE的性质等6个方面对昆虫纲、蛛形纲和线虫等无脊椎动物AChE的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 乙酰胆碱酯酶 基因类型 分子进化 蛋白结构 生理功能 昆虫抗药性
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S1基因结构解析与分子进化分析
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作者 马生健 刘耀光 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期458-465,共8页
S1是水稻(Oryza sativa L.)亚非栽培稻种间杂种不育一个最重要的基因座,对杂种的雌雄配子都有选择性杀灭作用。前期我们通过图位克隆获得S1基因座的候选基因后,NCBI查找发现‘日本晴’的S1等位基因序列全长7 kb,局倍区域有高GC分布。为... S1是水稻(Oryza sativa L.)亚非栽培稻种间杂种不育一个最重要的基因座,对杂种的雌雄配子都有选择性杀灭作用。前期我们通过图位克隆获得S1基因座的候选基因后,NCBI查找发现‘日本晴’的S1等位基因序列全长7 kb,局倍区域有高GC分布。为此本研究通过分多段运用有针对性的PCR方法,对所用的材料IRAT216与IRAT216S1进行了扩增并测序,获得了各自的S1全长序列,并进行了比对,发现IRAT216与‘日本晴’的序列完全相同,但IRAT216与IRAT216S1之间存在多处变异。同时针对有效变异区对S1基因进行了分子进化调查,建立了水稻的分子进化树,确定了S1在物种进化中的意义。本研究的S1基因序列测定,将为水稻分子标记辅助育种中分子标记的开发提供序列参照,同时也将为S1基因RNA的表达分析与蛋白功能研究、在各物种中的分化变异和水稻在进化中地位划分提供理论依据,并能为水稻的起源研究提供参考。 展开更多
关键词 栽培稻 杂种不育 分子进化 S1基因
漆树科植物漆酚的多样性及演化关系研究 预览
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作者 蒋颖 高敏 +1 位作者 孟盈 聂泽龙 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期552-562,共11页
漆酚是漆树科植物独有的化学成分,具有良好的抗氧化、抗肿瘤、抗病毒等生物活性,极具药物和工业生产开发价值。该研究通过对国内外有关漆树科各类群有关漆酚数据的搜集和整理,开展漆树科漆酚的多样性与分布情况的综合统计;同时在利用核... 漆酚是漆树科植物独有的化学成分,具有良好的抗氧化、抗肿瘤、抗病毒等生物活性,极具药物和工业生产开发价值。该研究通过对国内外有关漆树科各类群有关漆酚数据的搜集和整理,开展漆树科漆酚的多样性与分布情况的综合统计;同时在利用核基因ETS和叶绿体基因rps16和trnL-F重建漆树科系统发育树的基础上,探讨漆酚在漆树科及各属间的起源和演化关系。结果表明:(1)漆树科漆酚具有较高的多样性,在其苯环和-R链上都有很大的变异。(2)发现漆酚仅存在于Anacardioideae亚科中,是该亚科的一个重要界定特征。(3)基于漆酚苯环结构和-R链特征的祖先性状重建分析表明,漆树科的漆酚是由邻苯二酚向间苯二酚演化,而漆酚-R链的十五烃(烯)基则是向十七烃(烯)基平行演化。 展开更多
关键词 漆树科 漆酚 分子进化 系统发育
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唾液酸苷酶的催化机理及水解与合成寡糖进展
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作者 郭龙成 马忠轩 +1 位作者 卢丽丽 肖敏 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2019年第2期181-192,共12页
唾液酸苷酶(EC.3.2.1.18)是一类重要的糖苷水解酶,在动物和微生物中广泛存在.该类酶催化寡糖或糖缀合物上非还原末端唾液酸水解,具有重要的生物学功能,如参与溶酶体降解代谢物、癌症发生、微生物致病等多种生理和病理过程.除了水解活性... 唾液酸苷酶(EC.3.2.1.18)是一类重要的糖苷水解酶,在动物和微生物中广泛存在.该类酶催化寡糖或糖缀合物上非还原末端唾液酸水解,具有重要的生物学功能,如参与溶酶体降解代谢物、癌症发生、微生物致病等多种生理和病理过程.除了水解活性外,有的唾液酸苷酶还具有转糖基活性,能够以唾液酸单糖或糖苷为糖基供体,催化唾液酸转移到受体分子上,一步合成寡糖和糖苷化合物.这种合成活性对于唾液酸相关糖链的大量获得具有重要意义,有利于推动该类寡糖的基础研究及其在食品和医药中的应用.本文综述了唾液酸苷酶的结构和催化机理、生理功能、转糖基作用及其在寡糖合成中的应用. 展开更多
关键词 唾液酸 唾液酸苷酶 结构及催化机理 转糖基作用 分子改造
褐斜鲽(Plagiopsettaglossa)线粒体基因组特征及重排机制研究 预览
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作者 董江星 时伟 +1 位作者 孔晓瑜 陈世喜 《热带海洋学报》 CSCD 北大核心 2018年第1期1-11,共11页
冠鲽科(Samaridae) 隶属于鲽形目(Pleuronectiformes), 包含冠鲽属(Samaris) 、沙鲽属(Samariscus) 和斜鲽属(Plagiopsetta).目前研究表明, 冠鲽(Samaris cristatus)和满月沙鲽(Samariscus latus)的线粒体基因组结构都有... 冠鲽科(Samaridae) 隶属于鲽形目(Pleuronectiformes), 包含冠鲽属(Samaris) 、沙鲽属(Samariscus) 和斜鲽属(Plagiopsetta).目前研究表明, 冠鲽(Samaris cristatus)和满月沙鲽(Samariscus latus)的线粒体基因组结构都有重排, 并且两者的基因数量也有差别.为检测斜鲽属鱼类中是否也有不同的特征结构, 我们选用褐斜鲽(Plagiopsetta glossa)作为代表种进行斜鲽属鱼类线粒体基因组特征分析, 同时与冠鲽属及沙鲽属鱼类的线粒体基因组特征进行对比.分析显示, 褐斜鲽的线粒体基因组全长为18723bp, 包括39 个基因: 13 个蛋白基因、24 个tRNA 基因、2 个rRNA 基因、2 个控制区、1 个轻链复制起点和比典型基因组多的13 个间隔子.和经典鱼类的线粒体基因组相比, 褐斜鲽和满月沙鲽都多了tRNA-Cys 和tRNA-Tyr 两个tRNA, 冠鲽只多了tRNA-Cys, 且3 个种类都多了-个控制区, 但褐斜鲽与满月沙鲽的基因排列顺序相同.褐斜鲽线粒体基因的重排导致不同位置的6 个tRNA 形成了六连体基因簇“tRNA-Cys1-Tyr1-Ser1-Lys-Arg-Ser2”, “ND5-ND6-Glu-Cytb-Thr”则位于六连体之后, 但这11 个基因相对的排序没有发生变化.采用双复制随机丢失模型(double replications and random loss, DRRL)对褐斜鲽基因的重排现象进行分析, 认为该鱼类基因数量、排列顺序以及比典型基因组多13 个间隔子等特征为该模型提供了新的依据. 展开更多
关键词 鲽形目 冠鲽科 线粒体基因组 基因重排 分子进化
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青藏高原东南部山丹nrDNA ITS和cpDNA petB/petD 序列的分子进化特点 预览
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作者 蒋福娟 唐楠 +2 位作者 唐道城 巨秀婷 孙静清 《植物研究》 CSCD 北大核心 2018年第1期117-124,共8页
采用改良CTAB法提取青藏高原东南部山丹25个居群所有个体的基因组DNA,选取核基因ITS和叶绿体petB/petD区域进行PCR扩增、纯化和测序。对所有序列对位排列,其中ITS序列总长696bp,变异位点有4处,共产生7种单倍型,变异位点百分率为0.... 采用改良CTAB法提取青藏高原东南部山丹25个居群所有个体的基因组DNA,选取核基因ITS和叶绿体petB/petD区域进行PCR扩增、纯化和测序。对所有序列对位排列,其中ITS序列总长696bp,变异位点有4处,共产生7种单倍型,变异位点百分率为0.72%,(G+C)含量60.4%;petB/petD序列总长616bp,仅1处变异位点和2种单倍型,变异位点百分率为0.16%,(G+C)含量34.6%。表明山丹中,petB/petD区域较ITS序列保守,变异速率较慢。对ITS序列单倍型进行失配分布和中性检验分析发现,山丹现有分布范围可能经历了近期居群小范围扩张,AMOVA分析发现山丹居群的遗传变异主要存在于居群内,NST 〉GST(P〉0.01),表明山丹的遗传变异有着不显著的谱系地理结构。因此,山丹ITS序列适合该种的谱系地理学研究。 展开更多
关键词 青藏高原东南部 山丹 ITS petB/petD 分子进化
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GⅡ.17型诺如病毒流行概况及分子进化特征研究进展
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作者 曹孟婵 李贤相 何军 《中国公共卫生》 CSCD 北大核心 2018年第10期1446-1448,共3页
GⅡ.P17_GⅡ.17诺如病毒株是2014-2015年亚洲出现的变异株,其导致的疾病,在发病规模、感染人数、发病程度等方面,均盛于诺如病毒流行株GⅡ.4。虽是新毒株,但近年来,利用自组装病毒样颗粒蛋白(VLPs)系统对诺如病毒GⅡ.P17_GⅡ.17的研... GⅡ.P17_GⅡ.17诺如病毒株是2014-2015年亚洲出现的变异株,其导致的疾病,在发病规模、感染人数、发病程度等方面,均盛于诺如病毒流行株GⅡ.4。虽是新毒株,但近年来,利用自组装病毒样颗粒蛋白(VLPs)系统对诺如病毒GⅡ.P17_GⅡ.17的研究比较多,包括病毒衣壳蛋白结构、受体结构、进化机制等方面。这些研究为诺如病毒引起的急性腹泻等相关疾病的预防控制和疫苗研制奠定了良好的理论基础。 展开更多
关键词 诺如病毒 GⅡ.17型 流行概况 分子进化
2016年南京市乙型流感流行病学及病毒NA基因序列分析
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作者 王炜翔 吴小清 +2 位作者 苏晶晶 李伟 邓斐 《中国预防医学杂志》 CAS CSCD 2018年第12期886-890,共5页
目的分析2016年南京市乙型流感流行病学特征及病毒NA基因分子进化特征。方法从中国疾病预防控制中心国家流感监测信息系统导出2016年南京市流感监测数据,应用生物信息学软件进行分析。结果2016年南京市流感监测网络实验室共检测流感样... 目的分析2016年南京市乙型流感流行病学特征及病毒NA基因分子进化特征。方法从中国疾病预防控制中心国家流感监测信息系统导出2016年南京市流感监测数据,应用生物信息学软件进行分析。结果2016年南京市流感监测网络实验室共检测流感样病例咽拭子样本5 626份,检测阳性病例771例,占13.70%。乙型流感282例,占流感病毒分离总数的36.58%。乙型流感病毒感染中,主要以Victoria谱系为主(93.62%);发病年龄以≤15岁人群居多,占58.87%(166/282);发病时间主要集中在3-4月,占71.63%(202/282);9株南京株NA全部分布进化树的Group2分支的两个小分支A/B,同B/Brisbane/60/08NA相比,共发生45I→T、73L→I、120I→V等10处氨基酸位点的替换,重要的酶活性位点及耐药位点均未发生变化。结论乙型流感为南京市2016年流感流行主要的优势毒株之一,春季为高发季节,NA氨基酸位点无特异性位点突变。 展开更多
关键词 乙型流感病毒 神经氨酸酶 分子特征 氨基酸位点 基因进化
加强对小儿骨髓增生异常综合征的认识
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作者 李娟娟 刘嵘 师晓东 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2018年第3期165-170,共6页
骨髓增生异常综合征是一组来源于造血干细胞的异质性的髓系恶性肿瘤,主要好发于老年人,儿童发病率很低,且与遗传性疾病高度相关。对于其发病机制的认识,近年来不断深入、细化,不仅发掘出多种与之相关的细胞遗传学及分子生物学改变... 骨髓增生异常综合征是一组来源于造血干细胞的异质性的髓系恶性肿瘤,主要好发于老年人,儿童发病率很低,且与遗传性疾病高度相关。对于其发病机制的认识,近年来不断深入、细化,不仅发掘出多种与之相关的细胞遗传学及分子生物学改变,还针对其克隆演化的特点与疾病发生发展的关系,及协助预后判定方面有较系统的研究。现主要对以上机制加以总结,并结合儿童病例的特点进行阐述。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 分子学机制 克隆演化 儿童
食肉目核糖核酸酶10分子进化研究 预览
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作者 郎大田 柯曾杰 刘松菊 《云南师范大学学报:自然科学版》 2018年第4期61-66,共6页
基于食肉目14个物种开展核糖核酸酶10RNase10分子进化研究,获得14条(RNase10)序列,氨基酸序列具有8个结构半光氨酸,但CKXXNTF功能区及催化活性氨基酸发生了改变,等电点明显低于核糖核酸酶基因(RNASE A)超家族典型成员RNase1-8,揭示... 基于食肉目14个物种开展核糖核酸酶10RNase10分子进化研究,获得14条(RNase10)序列,氨基酸序列具有8个结构半光氨酸,但CKXXNTF功能区及催化活性氨基酸发生了改变,等电点明显低于核糖核酸酶基因(RNASE A)超家族典型成员RNase1-8,揭示食肉目RNase10可能失去了RNASE A超家族原有的宿主防御功能,而具有其他新功能.另外,基于RNase10构建的系统发育树为食肉目亲缘关系提供了一种可能性参考.总之,基于食肉目RNase10开展的分子进化研究,增加了该基因研究的多样性,为后续深入研究奠定了基础. 展开更多
关键词 食肉目 RNase10 等电点 系统发育 分子进化
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大豆固氮相关的硫酸盐转运基因进化分析
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作者 陈磊 邵志伟 +2 位作者 高兴 郑宇轩 朱新宇 《大豆科学》 CSCD 北大核心 2018年第5期697-703,共7页
在植物进化过程中,不同亚家族的硫酸盐转运基因在功能上发生了广泛的分化,因而有必要理解其背后的分子进化机制。为研究与大豆固氮相关的硫酸盐转运基因的分子进化机制,本研究从基因结构和选择压力两个方面对涉及根瘤固氮功能分化的大... 在植物进化过程中,不同亚家族的硫酸盐转运基因在功能上发生了广泛的分化,因而有必要理解其背后的分子进化机制。为研究与大豆固氮相关的硫酸盐转运基因的分子进化机制,本研究从基因结构和选择压力两个方面对涉及根瘤固氮功能分化的大豆硫酸盐转运基因进行进化分析。基因结构分析鉴别了保守和可变的基因结构,并与固氮相关的大豆硫酸盐转运基因的表达歧异建立关联。选择压力分析发现了大豆固氮相关的GmSULTR2; 3序列存在两段正选择区域,可能与它的固氮根瘤分化有关。本研究结果提供了大豆固氮相关的硫酸盐转运基因分子进化的新认识,有助于对其功能的进一步研究。 展开更多
关键词 大豆 硫酸盐转运体 功能分化 分子进化
血管生长素基因在食肉目中的分子进化研究 预览
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作者 郎大田 刘娜 刘松菊 《昭通学院学报》 2018年第5期44-48,共5页
血管生长素(Angiogenin, ANG)主要与宿主防御功能相关,是核糖核酸酶基因(Ribonuclease A,RNASE A)超家族重要成员之一。基于基因组水平对食肉目2个超科7科14个物种开展ANG分子进化研究,采用Blast N与TBlast N的方法,共获得9条功能... 血管生长素(Angiogenin, ANG)主要与宿主防御功能相关,是核糖核酸酶基因(Ribonuclease A,RNASE A)超家族重要成员之一。基于基因组水平对食肉目2个超科7科14个物种开展ANG分子进化研究,采用Blast N与TBlast N的方法,共获得9条功能基因和5条假基因。功能基因平均等电点为9.52,其值明显高于RNASE A超家族其它成员,典型的RNASE A超家族序列特征在ANG中未发生改变,揭示食肉目ANG拥有原有的宿主防御功能。系统发育树显示猫型超科4个物种聚为一簇,犬型超科的海豹科与海象科形成姐妹群。 展开更多
关键词 食肉目 血管生长素 假基因 等电点 系统发育 分子进化
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基于体外分子进化技术提高弯曲芽孢杆菌CCTCC 2015368 β-淀粉酶的热稳定性
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作者 陈磊 陈晟 +1 位作者 吴敬 吴丹 《生物工程学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期255-263,共9页
运用体外分子进化技术易错PCR方法,高通量筛选热稳定性提高的弯曲芽孢杆菌Bacillus flexus CCTCC2015368β-淀粉酶突变体。利用LB琼脂淀粉板显色、96-孔板DNS法测酶活和酶标仪检测等,最终筛选到了一株热稳定性显著提高的突变体D476N。... 运用体外分子进化技术易错PCR方法,高通量筛选热稳定性提高的弯曲芽孢杆菌Bacillus flexus CCTCC2015368β-淀粉酶突变体。利用LB琼脂淀粉板显色、96-孔板DNS法测酶活和酶标仪检测等,最终筛选到了一株热稳定性显著提高的突变体D476N。野生型和突变体D476N分别纯化后,酶学性质测定表明:突变体D476N的最适pH为6.5,与野生型相比降低了0.5。突变体D476N和野生型的最适温度均为55℃,突变体D476N在55℃下的半衰期为35 min,比野生型提高了95%。突变体D476N的T_(50)值比野生型提高4℃。突变体D476N的K_m值为97.98μmol/L,是野生型(85.86μmol/L)1.14倍;突变体稳定性提高的同时,催化活力相对于野生型有略微下降。通过SWISS-MODEL同源模拟野生型和突变体D476N的三维结构,并通过PyMol软件分析,发现突变后的氨基酸残基Asn476位于蛋白质表面的loop环上,通过MOE软件计算,D476N的分子自由能(ΔG)为106.01kcal/mol,比野生酶降低10.3%,这一结果与蛋白质分子自由能和热稳定性呈负相关的理论相符。 展开更多
关键词 分子进化 易错PCR Β-淀粉酶 热稳定性
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