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基于网络药理学和生物信息学探索金匮肾气丸治疗近视的分子机制
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作者 张涛 蒋文君 +2 位作者 吴建锋 徐福如 毕宏生 《辽宁中医杂志》 CAS 2019年第5期916-919,1118共5页
目的:探讨金匮肾气丸治疗近视的分子机制。方法:运用系统药理学方法筛选金匮肾气丸活性成分及活性成分靶点预测,通过生物信息学方法,确定金匮肾气丸治疗近视的作用靶点,并进行富集分析预测可能的作用信号通路,探讨金匮肾气丸治疗近视的... 目的:探讨金匮肾气丸治疗近视的分子机制。方法:运用系统药理学方法筛选金匮肾气丸活性成分及活性成分靶点预测,通过生物信息学方法,确定金匮肾气丸治疗近视的作用靶点,并进行富集分析预测可能的作用信号通路,探讨金匮肾气丸治疗近视的分子作用机制。结果:完成了金匮肾气丸的主要活性成分筛选和靶点预测,筛选出近视的治疗靶点,完成信号通路的富集分析;金匮肾气丸能够调控甲状腺信号通路、雌激素信号通路等信号通路,影响视网膜视锥细胞的分化、视蛋白的合成以及巩膜的重塑等过程,抑制近视的发生发展。结论:金匮肾气丸主要是通过影响视锥细胞细胞分化、视蛋白的合成以及巩膜重塑等过程治疗近视。 展开更多
关键词 金匮肾气丸 近视 中药复方 系统药理学
基于系统药理模式挖掘中药寒热药性的关键靶标和疾病网络 被引量:1
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作者 戴逸飞 霍海如 +2 位作者 王朋倩 张淼 隋峰 《中华中医药杂志》 CSCD 北大核心 2018年第2期521-526,共6页
目的:通过系统药理学的方法挖掘影响中药寒热药性的关键靶标,为进一步研究寒热药性的实质提供新的思路。方法:构建寒热中药成分数据库;通过活性成分筛选及网络打靶构建有效成分-靶点网络;通过网络分析筛选出关键靶点,并以此构建靶点-... 目的:通过系统药理学的方法挖掘影响中药寒热药性的关键靶标,为进一步研究寒热药性的实质提供新的思路。方法:构建寒热中药成分数据库;通过活性成分筛选及网络打靶构建有效成分-靶点网络;通过网络分析筛选出关键靶点,并以此构建靶点-疾病网络。结果:通过网络分析得到寒性中药网络中有PTGS2、PTGS1和SCN5A关键靶点,热性中药网络中有GABRA1、PTGS2和PTGS1关键靶点;寒性中药对于前列腺癌、乳腺癌等癌症及心血管疾病具有潜在的治疗作用,而热性中药在阿兹海默症、疼痛、认知障碍、焦虑症、帕金森症等精神类疾病方面显示出一定的应用价值。结论:基于系统药理学的研究方法有助于寻找寒热药性的关键靶点和疾病网络,为深入诠释寒热药性的生物学本质提供有益的信息和数据支撑。 展开更多
关键词 中药 寒热药性 系统药理学 关键靶点 疾病网络 拓扑分析
基于系统药理学对天山雪莲活性成分的预测
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作者 闫荷露 何兰玉 +6 位作者 应雪 李霞 徐浩伦 王亚华 张华 唐辉 陈文 《中国实验方剂学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第13期166-171,共6页
目的:通过系统药理学方法预测天山雪莲的活性成分,并验证预测结果。方法:在中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)数据库收集天山雪莲中的成分,利用类药性(druglikeness,DL)筛选出活... 目的:通过系统药理学方法预测天山雪莲的活性成分,并验证预测结果。方法:在中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)数据库收集天山雪莲中的成分,利用类药性(druglikeness,DL)筛选出活性化合物;构建化合物-靶点、靶点-疾病分类、癌症-靶点关系图,预测天山雪莲治疗疾病的机制;磺酰罗丹明B(sulforhodamine B,SRB)比色法测定不同浓度天山雪莲注射液对非小细胞肺癌A549的抑制率,酶联免疫吸附测定法(enzymelinked immuno sorbent assay,ELISA)检测不同药物浓度处理的A549中前列腺素E2(prostaglandin E2,PGE2)的含量。结果:筛选出24种活性化合物;随药物浓度增加对A549的抑制率随之升高,抑制率在质量浓度为110 mg·L-1时最高为86.22%;不同质量浓度药物干预后,A549细胞中PGE2分泌量较无药物干预组均有不同程度的降低(P〈0.05)。结论:采用系统药理学方法预测了天山雪莲作用机制,通过实验验证此预测方法比较可靠,为天山雪莲药理作用的研究提供了新的研究方法。 展开更多
关键词 系统药理学 天山雪莲 肺癌 前列腺素E2
基于系统药理学的续断治疗骨质疏松作用机制研究 被引量:1
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作者 高歌 潘晓华 +2 位作者 高雪 贾芙蓉 温剑平 《中草药》 CSCD 北大核心 2018年第19期4581-4585,共5页
目的利用系统药理学的方法探讨续断治疗骨质疏松的可能作用机制。方法使用中药系统药理学数据库(TCMSP)获得续断的药物成分,筛选活性成分,预测靶蛋白。在TTD和CTD数据库查询骨质疏松对应靶蛋白,构建药物-靶蛋白-疾病相互作用网络。借... 目的利用系统药理学的方法探讨续断治疗骨质疏松的可能作用机制。方法使用中药系统药理学数据库(TCMSP)获得续断的药物成分,筛选活性成分,预测靶蛋白。在TTD和CTD数据库查询骨质疏松对应靶蛋白,构建药物-靶蛋白-疾病相互作用网络。借助DAVID数据库对核心靶蛋白作用通路进行分析。利用String数据库构建主要信号通路的蛋白质相互作用网络。结果获得7个续断活性成分及其63个靶蛋白,筛选到骨质疏松疾病靶蛋白118个,得到续断与骨质疏松交叉作用蛋白118个,进而富集到与细胞增殖分化及免疫功能等相关的24条信号通路,其中PI3K-AKT信号通路包含有最多数量的相关基因。String数据库分析表明AKT1、MAPK1、MAPK3在信号通路中出现的频率较高。结论续断可能主要通过AKT1、MAPK1、MAPK3影响PI3K-AKT信号通路治疗骨质疏松。 展开更多
关键词 续断 系统药理学 靶蛋白 信号通路 骨质疏松
系统药理学:中医药学研究新理论和新技术 预览
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作者 陈学通 粟星 +2 位作者 黄超 李燕 王永华 《世界科学技术:中医药现代化》 CSCD 北大核心 2018年第8期1393-1402,共10页
中医药作用机制研究对发现中药治疗优势和推动现代医学的发展具有重大意义。然而,传统的基于靶点高亲和力、高选择性和强生物学效应的药物研究策略与中药和靶点的弱作用、低选择性以及中药多分子的整体性作用特点存在巨大鸿沟,难以客观... 中医药作用机制研究对发现中药治疗优势和推动现代医学的发展具有重大意义。然而,传统的基于靶点高亲和力、高选择性和强生物学效应的药物研究策略与中药和靶点的弱作用、低选择性以及中药多分子的整体性作用特点存在巨大鸿沟,难以客观揭示中药的功效基础。本文将综述系统药理学研究领域的新近研究进展,同时结合研究者的实践,重点介绍如何将系统药理学的新理论和新技术应用于中药弱结合药物的开发。通过系统分析中药"药-靶-效"的潜在规律,提出了中药"弱结合-显效"理论,建立了靶点群拓扑结构及动力学分析新方法,揭示了中药弱结合显效新模式。为从系统水平研究和分析中药的功效机制,以及新药开发,老药新用,天然产物开发利用提供了新思路。 展开更多
关键词 系统药理学 多靶标弱结合 基元模块 信号通路模拟 分子动力学
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计算机辅助蒙药治疗萨病的作用机制 预览
6
作者 满达 木其尔 +4 位作者 白明慧 马十月 黄树青 金萨出茹拉 特木其乐 《世界中医药》 CAS 2018年第12期3166-3171,共6页
目的:通过计算机辅助的数据挖掘以及药理学方法,预测、探讨蒙药治疗萨病的作用机制。方法:选取文献及临床收集萨病方剂,结合数据挖掘方法、复杂网络分析方法及专家讨论意见,确定萨病核心方。借助网络药理分析平台得到核心方剂对应的萨... 目的:通过计算机辅助的数据挖掘以及药理学方法,预测、探讨蒙药治疗萨病的作用机制。方法:选取文献及临床收集萨病方剂,结合数据挖掘方法、复杂网络分析方法及专家讨论意见,确定萨病核心方。借助网络药理分析平台得到核心方剂对应的萨病相关靶点信息及通路信息。对上述信息进行进一步分析,得到蒙药干预萨病的作用机制预测结果。结果:蒙药核心方由麝香等5味药物组成,共得到与萨病有关靶点33个,涉及58个化合物。结论:蒙药核心方从神经血管单元层面治疗萨病的作用,可能是通过17β雌二醇、谷甾醇、肉桂醛、丁香酚等成分,调节神经活性配体-受体互作用通路、钙离子信号通路、多巴胺能神经突触等通路上的ESR1/2、F2、AKT1、GRIN2B、DRD2/3、HTR1A/2A等相关蛋白来实现的。 展开更多
关键词 蒙药 数据挖掘 网络药理学 萨病 药物频次 关联规则挖掘 复杂网 核心配伍
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基于系统药理学探索裸花紫珠有效成分的作用机制 被引量:1
7
作者 张力军 陈曦 +4 位作者 冯世秀 王真真 苏东兰 易博 郭曲练 《药物评价研究》 CAS 2018年第10期1759-1769,共11页
目的 通过系统药理学方法探索裸花紫珠有效成分的药理作用机制。方法 运用文献搜索和TCMSP数据库,建立裸花紫珠活性分子数据库,通过对数据库中的120个分子从口服利用度、类药性分析等几个方面进行筛选,预测出有潜在活性的分子,并通过王... 目的 通过系统药理学方法探索裸花紫珠有效成分的药理作用机制。方法 运用文献搜索和TCMSP数据库,建立裸花紫珠活性分子数据库,通过对数据库中的120个分子从口服利用度、类药性分析等几个方面进行筛选,预测出有潜在活性的分子,并通过王永华教授团队研发的SYSDT以及WES技术进行靶标预测,进而通过药物-靶标预测模型Sys TD、Drug Bank数据库等构建靶标-疾病-通路网络图,并借助基因本位论(GO)分析裸花紫珠有效成分参与的生物学过程。结果 裸花紫珠中黄酮类化合物如木犀草素及其衍生物、甲基鼠李素和芹菜素等作用于较多的靶点,在裸花紫珠的药效中起着关键作用;其对炎症、癌症、心血管疾病、神经系统以及免疫系统均有影响,其中ABCB1、NOS3、MAPK14、PPARG、GSK3β、PTGS2等同时靶向治疗多种类型疾病和多种生物学通路。GO分析表明了裸花紫珠对炎症反应、凝血、血管生成、钙离子信号传导、血压等具有调节作用。结论 裸花紫珠黄酮类化合物在的药效中起关键作用,通过ABCB1、NOS3、MAPK14等靶点对炎症反应、凝血、血管生成、钙离子信号传导、血压等发挥调节作用。 展开更多
关键词 系统药理学 裸花紫珠 作用机制 抗癌 抗炎 黄酮 丁香脂素 木犀草素 甲基鼠李素 芹菜素
基于系统药理学研究远志治疗阿尔茨海默病的作用机制 被引量:3
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作者 王昊 赵振宇 +2 位作者 沈霞 胡本祥 陈莹 《药学学报》 CSCD 北大核心 2017年第10期1554-1560,共7页
为了揭示远志治疗阿尔茨海默病的潜在活性成分群及其分子网络作用机制,本文收集了已报道的远志111个化学成分,经过口服吸收利用度、类药性和血脑屏障通透性筛选,得到远志中10个活性分子,其中口山酮类化合物3个、皂苷类化合物1个、寡糖... 为了揭示远志治疗阿尔茨海默病的潜在活性成分群及其分子网络作用机制,本文收集了已报道的远志111个化学成分,经过口服吸收利用度、类药性和血脑屏障通透性筛选,得到远志中10个活性分子,其中口山酮类化合物3个、皂苷类化合物1个、寡糖酯类化合物3个和其他类3个。继而运用反向药效团匹配的方法进行靶点预测,经验证得到与阿尔茨海默病相关靶点13个,其中核心靶点2个,即beta-secretase 1和glycogen synthase kinase-3 beta;利用KEGG数据库与GO富集分析进一步挖掘远志防治阿尔茨海默病的分子网络机制,得到映射代谢调控通路3条,主要通路为细胞凋亡通路。本文应用系统药理学的方法发现远志中的多种活性成分通过与多个靶点的相互作用,多通路调控Aβ的生成与细胞的凋亡,进而起到治疗阿尔茨海默病的作用,为远志治疗阿尔茨海默病的临床使用提供一定的科学依据。 展开更多
关键词 远志 系统药理学 阿尔茨海默病 分子机制 虚拟筛选
基于系统药理学探索莪术有效成分的药理作用机制 被引量:12
9
作者 赖艳妮 严一文 徐培平 《中国实验方剂学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第14期177-182,共6页
目的:通过一系列系统药理学方法初步探讨了莪术有效成分的药理作用机制。方法:利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库获取莪术中有效成分;从Pharm Mapper Server中获得莪术有效成分的靶蛋白;Uni Prot数据库中获取靶标的基因名称... 目的:通过一系列系统药理学方法初步探讨了莪术有效成分的药理作用机制。方法:利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库获取莪术中有效成分;从Pharm Mapper Server中获得莪术有效成分的靶蛋白;Uni Prot数据库中获取靶标的基因名称并于CTD数据库中获取基因相对应的疾病;运用网络可视化软件,构建莪术有效成分-靶点-疾病相互作用网络;借助DAVID工具进行莪术有效成分蛋白质群的基因本位论(GO)分析和靶蛋白作用通路的富集分析。结果:文本挖掘结果表明莪术主要相关疾病有肿瘤性疾病、神经系统疾病和代谢性疾病;GO分析结果表明莪术主要通过类固醇激素介导的信号通路、从RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录起始、凋亡过程的负调控、肽基络氨酸磷酸化、蛋白质自磷酸化、视黄酸受体信号通路、从RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录的正调节等作用发挥生物学功能;信号通路富集结果表明莪术主要作用蛋白与癌症途径,PPAR信号通路,癌症中的蛋白多糖,非小细胞癌,PI3K-Akt信号通路等信号通路有关。结论:莪术可能主要通过调控癌症途径,PPARP,PI3K-Akt信号通路等多途径发挥其药理作用。综合运用系统药理学的方法可以实现快速而全面地分析药物的药理作用。 展开更多
关键词 系统药理学 莪术 药理作用 基因本位论 通路富集
阿尔茨海默病治疗药物研发全面受挫及其思考 被引量:3
10
作者 殷明 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期757-763,共7页
以往30年中针对众多靶点的阿尔茨海默病(AD)治疗药物的研发,虽然全球药业公司、政府、研究机构、大学和风险投资机构等都投入了大量的人力物力资源,但2003年以来FDA没有批准一个AD药物上市。究其原因,固然与无法早期诊断、治疗策... 以往30年中针对众多靶点的阿尔茨海默病(AD)治疗药物的研发,虽然全球药业公司、政府、研究机构、大学和风险投资机构等都投入了大量的人力物力资源,但2003年以来FDA没有批准一个AD药物上市。究其原因,固然与无法早期诊断、治疗策略欠佳及患者的遗传多态性带来药物反应的多样性等因素有关,更主要的原因可能是对包括AD在内的许多复杂性疾病发病机制的了解还很肤浅。继续按照目前思路针对单个靶点的AD药物研发可能不是明智的做法。系统生物医学等发展为认知疾病网络机制及基于系统药理学的多靶点药物研发带来了希望;建立在深入的基础研究水平上的神经干细胞移植或小分子药物影响神经干细胞再生可能成为AD治疗的新途径;生物标志物的发现为研究AD发病机制及新型药物研发将带来启迪。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 Β-淀粉样蛋白 TAU 靶点 系统药理学
双光子显微镜在神经药理学活体研究中的应用 预览 被引量:1
11
作者 赵君 王晋辉 《神经药理学报》 2012年第1期45-65,共21页
得益于生物组织双光子吸收的非线性光学效应,双光子显微镜现在已经成为活体脑功能研究中重要的研究工具。双光子成像具有较深的穿透力、更为集中的空间聚焦、较小的组织损伤性等特征。因此,一方面利用双光子显微镜能够在细胞甚至是亚细... 得益于生物组织双光子吸收的非线性光学效应,双光子显微镜现在已经成为活体脑功能研究中重要的研究工具。双光子成像具有较深的穿透力、更为集中的空间聚焦、较小的组织损伤性等特征。因此,一方面利用双光子显微镜能够在细胞甚至是亚细胞水平上对活体中的神经细胞结构形态、离子浓度、细胞运动、分子相互作用等生理现象和过程进行直接的成像监测,另外还能进行光裂解、光激活、光转染和光损伤等光学操纵;另一方面,双光子活体成像单细胞分辨率的大范围成像也便于高通量的系统药理学研究。在多年使用双光子显微镜进行活体研究的基础上,我们结合最新的研究进展重点阐述双光子显微镜在神经科学、神经药理学以及疾病动物模型的活体研究中的应用,并探讨其更广阔的前景。 展开更多
关键词 双光子显微镜 系统药理学 钙成像 血液动力学 光操纵 脑成像
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丹参注射液计算机系统药理学研究 被引量:4
12
作者 朱伟 姚丽梅 《中国实验方剂学杂志》 CAS 北大核心 2011年第1期145-147,150共4页
目的:运用化学信息学和系统生物学技术对丹参注射液11种主要化学成分的生理活性进行预测。方法:从化合物的化学结构出发,采用GeneGo公司Metadrug软件预测这些化学成分的靶标与分子作用机制。结果:7种化学成分被发现有预测靶标,这... 目的:运用化学信息学和系统生物学技术对丹参注射液11种主要化学成分的生理活性进行预测。方法:从化合物的化学结构出发,采用GeneGo公司Metadrug软件预测这些化学成分的靶标与分子作用机制。结果:7种化学成分被发现有预测靶标,这些靶标作用广泛,参与机体不同的生理过程,这对探究丹参注射液的分子作用机制十分关键。另外4种化学成分没有发现有预测靶标。结论:本研究结果为丹参注射液的后续研究提供有用的线索,可促进丹参注射液的机制研究。 展开更多
关键词 丹参注射液 化学成分 靶标 系统药理学
In Silico System Pharmacology for the Potential Bioactive Ingredients Contained in Xingnaojing Injection (醒脑静注射液) and Its Material Basis for Sepsis Treatment
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作者 MA Shi-tang FENG Cheng-tao +3 位作者 XIONG You-xi ZHANG Xiao-lin MIAO Cheng-gui YU Hao 《中国结合医学杂志:英文版》 SCIE CAS CSCD 2018年第12期944-949,共6页
关键词 系统网络 注射液 药理学 成分 治疗 基础 材料
The efficacy and safety of cilostazol as an alternative to aspirin in Chinese patients with aspirin intolerance after coronary stent implantation: a combined clinical study and computational system pharmacology analysis
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作者 Ying XUE Zhi-wei FENG +9 位作者 Xiao-ye LI Zi-heng HU Qing XU Zi WANG Jia-hui CHENG Hong-tao SHI Qi-bing WANG Hong-yi WU Xiang-Qun XIE Qian-zhou LV 《中国药理学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2018年第2期205-212,共8页
有阿司匹林和 clopidogrel 的双 antiplatelet 治疗(DAT ) 是标准政体完成快速的血小板抑制并且阻止 thrombotic 事件。当前,很少信息都不关于在有过敏症或不耐的病人的其他的 antiplatelet 治疗是可得到的到阿司匹林。尽管 cilostazol... 有阿司匹林和 clopidogrel 的双 antiplatelet 治疗(DAT ) 是标准政体完成快速的血小板抑制并且阻止 thrombotic 事件。当前,很少信息都不关于在有过敏症或不耐的病人的其他的 antiplatelet 治疗是可得到的到阿司匹林。尽管 cilostazol 已经是在在中国的临床的实践的阿司匹林的一种普通选择,它的功效和安全尚待坚定。我们回顾地分析了经历了主要经皮的冠的干预(一种总线标准) 的 613 个中国病人。在他们之中, 405 个病人收到了标准 DAT (加 clopidogrel 的阿司匹林) , 205 个病人与不耐被识别到阿司匹林并且收到了其他的 DAT (加 clopidogrel 的 cilostazol ) 。在他们的基线的二个组之间没有重要差别临床的特征。学习的主要结果在 12 月后续期间包括了主要不利心脏的事件(权标) 和流血事件。权标端点在与 cilostazol (4.9%) 并且在与阿司匹林(8.3%) 对待的 408 个病人中的 34 个对待的 205 个病人中的 10 个被到达。没有统计上重要的差别在在二个组之间的权标被观察。然而,在 cilostazol 组的病人比的有更少的狭窄在阿司匹林的病人组织了(1.5% 对 4.9% , P=0.035 ) 。为事件放血的出现趋于在 cilostazol 组更低(0.49% 对 2.7% , P=0.063 ) 。这些临床的观察进一步用网络系统药理学分析被分析,并且结果与临床的观察和现出症状之前的潜的数据报告一致。我们断定在有经历冠的 stent 培植的阿司匹林不耐的中国病人,有 cilostazol 的 clopidogrel 的联合可以是标准 DAT 政体的一种有效、安全的选择。 展开更多
关键词 阿司匹林 临床 中国 安全 计算系统 功效 学分 药理
铜及其配合物在生物体系中的作用 预览 被引量:4
15
作者 Ismail,M Khan 《无机化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1998年第1期 29-39,共11页
自人类有历史记载以来,铜及其本合物即用作药物。铜是人体必需的金属元素,人体的正常代谢过程需要它们,但无法体内合成,因此,需要每天从饮食摄取和吸收。生物药学家和研究者以极大的努力和彻底地了解铜及配合物在生物体系中的作用... 自人类有历史记载以来,铜及其本合物即用作药物。铜是人体必需的金属元素,人体的正常代谢过程需要它们,但无法体内合成,因此,需要每天从饮食摄取和吸收。生物药学家和研究者以极大的努力和彻底地了解铜及配合物在生物体系中的作用,希望获得更多地信息以利于人类疾病的预防和治疗。 展开更多
关键词 铜配合物 生物体系 药疗活性 生物活性
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