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A high?throughput three?dimensional cell culture platform for drug screening 认领
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作者 Jingyu Ock Wei Li 《生物设计与制造(英文)》 CSCD 2020年第1期40-47,共8页
Traditional two-dimensional(2D)cell cultures lack the extracellular matrix(ECM)-like structure or dynamic fluidic microenvironment for cells to maintain in vivo functionality.Three-dimensional(3D)tissue scaffolds,on t... Traditional two-dimensional(2D)cell cultures lack the extracellular matrix(ECM)-like structure or dynamic fluidic microenvironment for cells to maintain in vivo functionality.Three-dimensional(3D)tissue scaffolds,on the other hand,could provide the ECM-like microenvironment for cells to reformulate into tissue or organoids that are highly useful for in vitro drug screening.In this study,a high-throughput two-chamber 3D microscale tissue model platform is developed.Porous scaffolds are selectively foamed on a commercially available compact disk using laser.Perfusion of cell culture medium is achieved with centrifugal force-driven diffusion by disk rotation.Experimental studies were conducted on the fabrication process under various gas saturation and laser power conditions.Cell cultures were performed with two types of human cell lines:M059K and C3A-sub28.It is shown that the structure of microscale porous scaffolds can be controlled with laser foaming parameters and that coating with polydopamine these scaffolds are inducive for cell attachment and aggregation,forming a 3D network.With many such two-chamber models fabricated on a single CD and perfusion driven by the centrifugal force from rotation,the proposed platform provides a simple solution to the high-cost and lengthy drug development process with a high-throughput and physiologically more relevant tissue model system. 展开更多
关键词 HIGH-THROUGHPUT SCREENING Three-dimensional tissue model Drug SCREENING CENTRIFUGAL force-driven DIFFUSION Laser FOAMING
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平行人工膜体外渗透技术在药物一致性评价中的应用 认领
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作者 关皓月 张广超 +1 位作者 牛剑钊 许鸣镝 《中国药事》 CAS 2020年第8期891-896,共6页
目的:平行人工膜体外渗透技术(PAMPA)是一种较为快速可靠的可预测药物渗透性的方法,本文梳理了平行人工膜体外渗透技术在药物一致性评价中的应用。方法:通过查阅国内外文献中关于平行人工膜体外渗透试验及评价方法,介绍平行人工膜体外... 目的:平行人工膜体外渗透技术(PAMPA)是一种较为快速可靠的可预测药物渗透性的方法,本文梳理了平行人工膜体外渗透技术在药物一致性评价中的应用。方法:通过查阅国内外文献中关于平行人工膜体外渗透试验及评价方法,介绍平行人工膜体外渗透概念及分类,总结并梳理了该方法在原辅料及制剂方面的应用。结果与结论:PAMPA在化合物筛选、制剂开发及验证等方面具有快速高通量筛选的优势,同时也为药物吸收预测方面增加了多角度全方位考察,有效的提高研发质量和研发效率。 展开更多
关键词 平行人工膜技术 体外渗透 一致性评价 仿制药 处方筛选
药物重定位候选药物筛选路径 认领
3
作者 熊阿珍 孟光兴 《中国医药工业杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期170-175,共6页
相对传统新药研发模式,药物重定位策略发现药物新用途具有显著的成本效益优势,能加快药物上市步伐,满足恶性肿瘤、罕见病、个性化医疗等特定领域药物临床用药需求,因而被各界关注。本文主要介绍了药物重定位的一般流程与候选药物筛选路... 相对传统新药研发模式,药物重定位策略发现药物新用途具有显著的成本效益优势,能加快药物上市步伐,满足恶性肿瘤、罕见病、个性化医疗等特定领域药物临床用药需求,因而被各界关注。本文主要介绍了药物重定位的一般流程与候选药物筛选路径,如从非理性设计方法向基于相似性、基于结构虚拟筛选、推理与机器学习等理性设计方法发现重定位药物的系统性转变。 展开更多
关键词 药物重定位 候选药物 基因组 相似性搜索 虚拟筛选
文章速递大肠杆菌的分离鉴定及药敏试验 认领
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作者 徐辉 王丽霞 +1 位作者 李生龙 陈砀桐 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2020年第19期84-88,共5页
为进一步确诊临床发病鸡的病原,无菌条件下取肝脏,进行细菌的分离、培养及鉴定。鉴别培养基培养结果显示,分离菌株在伊红美蓝培养基上出现带有金属光泽的菌落特征,在麦康凯培养基显示出粉红色菌落的特征。结果表明,7只患病鸡均为大肠杆... 为进一步确诊临床发病鸡的病原,无菌条件下取肝脏,进行细菌的分离、培养及鉴定。鉴别培养基培养结果显示,分离菌株在伊红美蓝培养基上出现带有金属光泽的菌落特征,在麦康凯培养基显示出粉红色菌落的特征。结果表明,7只患病鸡均为大肠杆菌感染。然后,针对分离纯化的菌株进行药敏试验。西药药敏试验结果显示,硫酸庆大霉素、阿米卡星、硫酸新霉素、安普霉素均为高敏,阿莫西林耐药,而盐酸多西环素和恩诺沙星为中敏。中药药敏试验结果显示,四黄止痢颗粒和杨树花口服液对分离菌株比较敏感。该试验结果可为大肠杆菌病的临床用药提供参考。 展开更多
关键词 病鸡 大肠杆菌 分离与鉴定 药敏试验 药物筛选
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浓度梯度微流控芯片平台的构建及其应用于抗白念珠菌药物快速筛选研究 认领 被引量:1
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作者 蔡颖 陈阳 +1 位作者 洪战英 柴逸峰 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期323-329,共7页
本文建立了用于抗白念珠菌药物快速筛选的浓度梯度微流控芯片平台,通过荧光示踪剂荧光素钠在芯片上的分布定性考察浓度梯度生成情况,采用HPLC法对芯片内模型药物氟康唑的浓度梯度分布进行定量分析,进一步比较不同流速条件对浓度梯度形... 本文建立了用于抗白念珠菌药物快速筛选的浓度梯度微流控芯片平台,通过荧光示踪剂荧光素钠在芯片上的分布定性考察浓度梯度生成情况,采用HPLC法对芯片内模型药物氟康唑的浓度梯度分布进行定量分析,进一步比较不同流速条件对浓度梯度形成的影响,最终确定两水相流速1∶1的比例用于后续药物筛选研究。以阿尔玛蓝为细胞活力指示剂,通过该平台分别进行了两性霉素B、氟康唑、伊曲康唑、伏立康唑、泊沙康唑、特比萘芬、5-氟胞嘧啶、卡泊芬净的药敏实验,快速高效地获得了药物的MIC范围,且与CLSI建议的白念珠菌敏感株的MIC值相一致,表明该平台可以通过一次实验快速筛选得到抗菌药物的MIC值范围。此外,该批次白念珠菌对特比萘芬呈现耐药,与96孔板法验证结果一致,表明该方法还可以用于耐药菌株的快速筛选。 展开更多
关键词 微流控芯片 浓度梯度生成 表征 药物筛选 白念珠菌
Bioprinting of novel 3D tumor array chip for drug screening 认领
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作者 Mingjun Xie Qing Gao +2 位作者 Jianzhong Fu Zichen Chen Yong He 《生物设计与制造(英文)》 SCIE CSCD 2020年第3期175-188,共14页
Biomedical field has been seeking a feasible standard drug screening system consisting of 3D tumor model array for drug researching due to providing sufficient samples and simulating actual in vivo tumor growth situat... Biomedical field has been seeking a feasible standard drug screening system consisting of 3D tumor model array for drug researching due to providing sufficient samples and simulating actual in vivo tumor growth situation,which is still a challenge to rapidly and uniformly establish though.Here,we propose a novel drug screening system,namely 3D tumor array chip with“layer cake”structure,for drug screening.Accurate gelatin methacryloyl hydrogel droplets(~0.1μL)containing tumor cells can be automatically deposited on demand with electrohydrodynamic 3D printing.Transparent conductive membrane is introduced as a chip basement for preventing charges accumulation during fabricating and convenient observing during screening.Culturing chambers formed by stainless steel and silicon interlayer is convenient to be assembled and recycled.As this chip is compatible with the existing 96-well culturing plate,the drug screening protocols could keep the same as convention.Important properties of this chip,namely printing stability,customizability,accuracy,microenvironment,tumor functionalization,are detailly examined.As a demonstration,it is applied for screening of epirubicin and paclitaxel with breast tumor cells to confirm the compatibility of the proposed screening system with the traditional screening methods.We believe this chip will potentially play a significant role in drug evaluation in the future. 展开更多
关键词 3D tumor array chip(3D-TAC) Gelatin methacryloyl(GelMA) Drug screening In vitro model BIOPRINTING
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2018年山东省耐多药肺结核高危人群筛查情况 认领
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作者 骆斌 程俊 +2 位作者 孙晓英 初磊 石武祥 《预防医学论坛》 2020年第4期302-304,共3页
目的了解山东省高危人群耐多药肺结核筛查情况,探索并完善耐多药肺结核患者的发现策略。方法以耐多药肺结核5类高危人群(包括初治失败患者、复发与返回患者、复制失败患者、初治涂阳治疗2/3月末痰涂片阳性患者和其他与耐多药患者接触密... 目的了解山东省高危人群耐多药肺结核筛查情况,探索并完善耐多药肺结核患者的发现策略。方法以耐多药肺结核5类高危人群(包括初治失败患者、复发与返回患者、复制失败患者、初治涂阳治疗2/3月末痰涂片阳性患者和其他与耐多药患者接触密切的涂阳患者)为主要筛查对象,进行结核菌培养和药敏试验,分析不同人群中耐多药肺结核的筛出情况。结果 2018年山东省登记高危人群肺结核可疑患者1 230例,完成耐药筛查1 138例,筛查率为92.52%。涂阳培阳率为62.21%,涂阳培阴率为26.63%,污染率为1.05%;其中复发患者涂阳培阳率最高,为65.55%,初治失败患者涂阳培阳率最低,仅为43.53%。培养阳性中有632例为结核分枝杆菌复合群,检出耐多药肺结核97例,检出率为15.35%,不同患者分类耐多药检出率差异总体上差异有统计学意义(P<0.01)。结论对重点人群优先进行筛查是非常有效的耐多药肺结核患者发现策略。 展开更多
关键词 肺结核 高危人群 耐药 筛查
The construction of in vitro tumormodels based on 3D bioprinting 认领
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作者 Liang Ma Yuting Li +4 位作者 Yutong Wu Abdellah Aazmi Bin Zhang Hongzhao Zhou Huayong Yang 《生物设计与制造(英文)》 SCIE CSCD 2020年第3期227-236,共10页
Cancer is characterized by a high fatality rate,complex molecular mechanism,and costly therapies.The microenvironment of a tumor consists of multiple biochemical cues and the interaction between tumor cells,stromal ce... Cancer is characterized by a high fatality rate,complex molecular mechanism,and costly therapies.The microenvironment of a tumor consists of multiple biochemical cues and the interaction between tumor cells,stromal cells,and extracellular matrix plays a key role in tumor initiation,development,angiogenesis,invasion and metastasis.To better understand the biological features of tumor and reveal the critical factors of therapeutic treatments against cancer,it is of great significance to build in vitro tumor models that could recapitulate the stages of tumor progression and mimic tumor behaviors in vivo for efficient and patient-specific drug screening and biological studies.Since conventional tissue engineering methods of constructing tumor models always fail to simulate the later stages of tumor development due to the lack of ability to build complex structures and angiogenesis potential,three-dimensional(3D)bioprinting techniques have gradually found its applications in tumor microenvironment modeling with accurate composition and well-organized spatial distribution of tumor-related cells and extracellular components in the past decades.The capabilities of building tumor models with a large range of scale,complex structures,multiple biomaterials and vascular network with high resolution and throughput make 3D bioprinting become a versatile platform in bio-manufacturing aswell as inmedical research.In this review,wewill focus on 3D bioprinting strategies,design of bioinks,current 3D bioprinted tumor models in vitro classified with their structures and propose future perspectives. 展开更多
关键词 Tumor model 3D bioprinting Bioink Tumor-on-a-chip Drug screening
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斑马鱼模型在中枢神经系统疾病中的研究进展 认领
9
作者 郭弘扬 唐天乐 朱晓鹏 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2020年第3期71-79,共9页
中枢神经系统(central Nervous System,CNS)疾病严重损伤人的身心健康,在全球范围内造成巨大的疾病负担,且患病人数逐年呈增长趋势。由于CNS疾病的复杂性、多因素性及多基因调控性,导致相关疾病的发病机制尚不明确,市场上也严重缺乏针... 中枢神经系统(central Nervous System,CNS)疾病严重损伤人的身心健康,在全球范围内造成巨大的疾病负担,且患病人数逐年呈增长趋势。由于CNS疾病的复杂性、多因素性及多基因调控性,导致相关疾病的发病机制尚不明确,市场上也严重缺乏针对该类疾病的有效药物。因此,探索CNS疾病的病理机制对药物的开发十分重要,急需1种模式生物来构建CNS疾病模型。斑马鱼作为1种重要的模式生物,不仅具有与人类高度保守的大脑组织区域,且具有丰富的社会学行为,成为研究CNS疾病和药物研发的重要工具。本文综述了近年来斑马鱼在CNS疾病研究中的相关研究进展,同时也介绍了一些小分子化合物在斑马鱼疾病模型中的研究应用,为今后CNS疾病的研究和相关药物的研发提供了基础。 展开更多
关键词 中枢神经系统疾病 斑马鱼 模型 药物筛选
抗疟药物筛选方法的研究进展 认领
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作者 陈浩 崔淑君 +1 位作者 肖朝江 姜北 《中南药学》 CAS 2020年第7期1210-1214,共5页
疟疾是一种危害巨大的寄生虫病,目前主要的治疗药物有青蒿素、氯喹等少数几种药物。在寻找新的抗疟药物过程中,如何建立合理的抗疟药物筛选方法,筛选出更有效的抗疟药物一直是本领域的研究重点。笔者通过收集并整理国内外相关文献,归纳... 疟疾是一种危害巨大的寄生虫病,目前主要的治疗药物有青蒿素、氯喹等少数几种药物。在寻找新的抗疟药物过程中,如何建立合理的抗疟药物筛选方法,筛选出更有效的抗疟药物一直是本领域的研究重点。笔者通过收集并整理国内外相关文献,归纳了常用的体外、体内抗疟活性筛选的实验方法,旨在为抗疟药物的研究与开发提供一些参考。 展开更多
关键词 抗疟药物 筛选方法 青蒿素 氯喹
3D细胞环在医学研究中的应用 认领
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作者 吴宏伟 许彦 +1 位作者 黄钢 刘珈 《生命科学仪器》 2020年第1期26-33,共8页
3D细胞培养比传统二维培养能更好模拟人体内环境,增加细胞间通讯,还原疾病状态,使生物医学的研究更接近人体真实情况。3D细胞环是一种无支架3D细胞培养结构,具有规则的外形、可夹取便于移植等特点,在生物医学诸多领域都有广泛应用。本... 3D细胞培养比传统二维培养能更好模拟人体内环境,增加细胞间通讯,还原疾病状态,使生物医学的研究更接近人体真实情况。3D细胞环是一种无支架3D细胞培养结构,具有规则的外形、可夹取便于移植等特点,在生物医学诸多领域都有广泛应用。本文作者结合自身目前已有的工作基础,就3D细胞环在干细胞分化、组织移植和再生、糖尿病治疗、肿瘤研究、药物检测、以及研究热放疗生物学效应、肿瘤动物建模、疾病模型构建等领域的潜在应用做一综述,旨在推动国内3D细胞培养技术的发展,以及促进医学研究由二维向3D模式的跨越。 展开更多
关键词 3D细胞培养 组织工程 糖尿病治疗 肿瘤研究 药物检测
应用于天然产物抗炎活性研究的主要细胞模型 认领
12
作者 刘燕芳 刘丹 +1 位作者 刘兰 张敉 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期874-881,共8页
细胞水平的活性筛选技术具有灵敏、快速、经济、高效的特点,已成为先导化合物研究中的重要工具。由于其所需样品量较小,更适合于天然产物的活性筛选。炎症是机体对于外界刺激的一种防御反应,与多种疾病的发生、发展相关。目前,利用相关... 细胞水平的活性筛选技术具有灵敏、快速、经济、高效的特点,已成为先导化合物研究中的重要工具。由于其所需样品量较小,更适合于天然产物的活性筛选。炎症是机体对于外界刺激的一种防御反应,与多种疾病的发生、发展相关。目前,利用相关细胞模型,天然产物在抗炎活性筛选、作用机制等研究方面均取得了很多进展。本文以天然产物的抗炎活性研究为切入点,综述了目前广泛用于该研究的单核/巨噬细胞、中性粒细胞以及其他主要细胞模型,从细胞主要特征、模型建立方法以及模型现实应用几个方面进行阐述,以期为具有抗炎活性的天然先导化合物的研究与开发提供一定参考。 展开更多
关键词 细胞模型 天然药物 抗炎作用 活性筛选
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秋葵叶斑病的药剂筛选试验 认领
13
作者 曲丹丹 高锋 《现代农业研究》 2020年第8期91-93,共3页
为了筛选出可有效防治秋葵叶斑病菌的化学药剂,该试验进行了8种不同药剂对秋葵叶斑病菌的室内毒力测定和田间药效试验。室内毒力测定结果表明秋葵叶斑病菌对8种药剂均表现敏感,其中对氟硅唑最敏感,从抑制率来看,对500mg/L的丙环唑最为敏... 为了筛选出可有效防治秋葵叶斑病菌的化学药剂,该试验进行了8种不同药剂对秋葵叶斑病菌的室内毒力测定和田间药效试验。室内毒力测定结果表明秋葵叶斑病菌对8种药剂均表现敏感,其中对氟硅唑最敏感,从抑制率来看,对500mg/L的丙环唑最为敏感;室外结果表明:8种杀菌剂对秋葵叶斑病均有不同程度的防治效果,其中25%丙环唑防治效果最好,达到70%以上。综合得出丙环唑和氟硅唑对秋葵叶斑病菌抑制效果最好。 展开更多
关键词 秋葵 链格孢菌 药剂筛选
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QuEChERS-SPE结合超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱法筛查牛奶样品中15类37种药物残留 认领
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作者 李永利 陈黎明 +2 位作者 李杰 李春华 陈鹰 《化学试剂》 CAS 北大核心 2020年第4期406-410,共5页
采用QuEChERS-SPE结合超高效液相色谱-飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)技术开发了快速测定牛奶中15类37种药物的方法。牛奶样品采用0.2%甲酸乙腈溶液和Na2EDTA-Mcllvaine缓冲溶液提取,有机相和水相分别经C18吸附剂和HLB固相萃取柱净化后合... 采用QuEChERS-SPE结合超高效液相色谱-飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)技术开发了快速测定牛奶中15类37种药物的方法。牛奶样品采用0.2%甲酸乙腈溶液和Na2EDTA-Mcllvaine缓冲溶液提取,有机相和水相分别经C18吸附剂和HLB固相萃取柱净化后合并测定。目标化合物采用BEH C18柱分离,以甲醇和0.1%甲酸水溶液为洗脱剂进行程序洗脱,正离子扫描模式检测。结果表明,牛奶样品中化合物的定量限为0.4~8.0μg/kg,3个加标浓度的平均回收率范围为70.2%~105.3%。方法具有快速、简便、高通量等特点,可以用于牛奶样品15类37种药物残留的快速测定。 展开更多
关键词 液相色谱-四级杆飞行时间质谱 QUECHERS 药物残留 筛查 牛奶
QuEChERS-超高效液相色谱串联质谱法定性筛查中药材熊胆粉中169种兽药残留 认领 被引量:1
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作者 孙健 胡青 +6 位作者 诸艳蓉 张甦 于泓 冯睿 张静娴 毛秀红 季申 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期113-122,共10页
建立了QuEChERS-超高效液相色谱串联质谱法定性筛查中药材熊胆粉中多种兽药残留,包括β-受体激动剂与拮抗剂、抗生素(青霉素类、头孢菌素类、磺胺类、喹诺酮类、氯霉素类、四环素类、硝基咪唑类、大环内酯类、聚醚类等)、抗病毒药、驱... 建立了QuEChERS-超高效液相色谱串联质谱法定性筛查中药材熊胆粉中多种兽药残留,包括β-受体激动剂与拮抗剂、抗生素(青霉素类、头孢菌素类、磺胺类、喹诺酮类、氯霉素类、四环素类、硝基咪唑类、大环内酯类、聚醚类等)、抗病毒药、驱虫药、甾体激素、非甾体抗炎药和镇静剂等169种兽药残留。样品经Na2EDTA-McIlvaine缓冲液和5%甲酸乙腈提取,经分散固相萃取法净化,以超高效液相色谱串联三重四极杆质谱法测定,通过离子丰度比定性判定。169种化合物检出限为1~1 000μg·kg-1。本方法简便快速,已应用于实际样品的测定,并可扩展至其他类似药材基质的检测。 展开更多
关键词 QUECHERS 超高效液相色谱串联质谱 兽药 熊胆粉 定性筛查
表面等离子共振技术研究进展及应用 认领
16
作者 王永智 叶华跃 +5 位作者 聂利芳 吴宏斌 邱文娜 方朝东 雷高新 曾玮乔 《中国医药科学》 2020年第6期17-21,共5页
表面等离子体共振(SPR)技术是自20世纪70年代逐步发展起来的一种光学生化检测技术.经过几十年的发展,因该技术具有样品免标记、需求量小、检测快速、灵敏度高、特异性强、选择性高等优势,已逐步发展成为分子生物学、环境污染物分析、食... 表面等离子体共振(SPR)技术是自20世纪70年代逐步发展起来的一种光学生化检测技术.经过几十年的发展,因该技术具有样品免标记、需求量小、检测快速、灵敏度高、特异性强、选择性高等优势,已逐步发展成为分子生物学、环境污染物分析、食品安全检测、药物研发等领域常用的分析工具.本文系统综述了SPR技术发展的历史及在各个领域的应用情况,并展望了SPR技术未来发展的趋势. 展开更多
关键词 表面等离子共振(SPR) 生物分子相互作用 生物传感器 环境内分泌干扰物 药物筛选
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机器学习在创新药物研发中的应用进展 认领
17
作者 周玥 张心苑 毛雪石 《医学信息学杂志》 CAS 2020年第8期25-28,47,共5页
介绍人工智能和药物设计基本概念、主要算法、技术和实际应用,探讨机器学习在创新药物研究中的应用,从分类回归、靶蛋白结构预测、活性位点识别和结合亲和力角度,详述基于机器学习策略的虚拟筛选技术在创新药物研发中的应用和挑战,对该... 介绍人工智能和药物设计基本概念、主要算法、技术和实际应用,探讨机器学习在创新药物研究中的应用,从分类回归、靶蛋白结构预测、活性位点识别和结合亲和力角度,详述基于机器学习策略的虚拟筛选技术在创新药物研发中的应用和挑战,对该技术发展进行展望。 展开更多
关键词 人工智能 机器学习 药物设计 虚拟筛选
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诱导多能干细胞与心血管精准医学 认领
18
作者 叶领群 倪萱 +3 位作者 韩兴龙 赵振奥 雷伟 胡士军 《生命的化学》 CAS CSCD 2020年第5期643-653,共11页
近年来,心血管疾病已经成为人类健康的最大威胁。然而,由于缺乏能够真实地模拟患者生理病理状态的疾病模型,心血管疾病的发生发展过程中许多重要的分子途径仍然未显现出临床转化前景。随着诱导多能干细胞技术的出现,体外可以建立具有特... 近年来,心血管疾病已经成为人类健康的最大威胁。然而,由于缺乏能够真实地模拟患者生理病理状态的疾病模型,心血管疾病的发生发展过程中许多重要的分子途径仍然未显现出临床转化前景。随着诱导多能干细胞技术的出现,体外可以建立具有特异遗传背景和表观遗传调控的疾病模型,这为心血管疾病精准医学提供了一个独特的平台。该文将重点介绍诱导多能干细胞技术在各种心血管疾病模型、药物评估及筛选方面的应用。 展开更多
关键词 诱导多能干细胞 心血管疾病 精准医学 疾病模型 药物筛选
Saccharomyces cerevisiae in neuroscience:how unicellular organism helps to better understand prion protein? 认领
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作者 Takao Ishikawa 《中国神经再生研究:英文版》 SCIE CAS 2021年第3期489-495,共7页
The baker's yeast Saccharomyces(S.)cerevisiae is a single-celled eukaryotic model organism widely used in research on life sciences.Being a unicellular organism,S.cerevisiae has some evident limitations in applica... The baker's yeast Saccharomyces(S.)cerevisiae is a single-celled eukaryotic model organism widely used in research on life sciences.Being a unicellular organism,S.cerevisiae has some evident limitations in application to neuroscience.However,yeast prions are extensively studied and they are known to share some hallmarks with mammalian prion protein or other amyloidogenic proteins found in the pathogenesis of Alzheimer's,Parkinson's,or Huntington's diseases.Therefore,the yeast S.cerevisiae has been widely used for basic research on aggregation properties of proteins in cellulo and on their propagation.Recently,a yeast-based study revealed that some regions of mammalian prion protein and amyloidβ1–42 are capable of induction and propagation of yeast prions.It is one of the examples showing that evolutionarily distant organisms share common mechanisms underlying the structural conversion of prion proteins making yeast cells a useful system for studying mammalian prion protein.S.cerevisiae has also been used to design novel screening systems for anti-prion compounds from chemical libraries.Yeastbased assays are cheap in maintenance and safe for the researcher,making them a very good choice to perform preliminary screening before further characterization in systems engaging mammalian cells infected with prions.In this review,not only classical red/white colony assay but also yeast-based screening assays developed during last year are discussed.Computational analysis and research carried out using yeast prions force us to expect that prions are widely present in nature.Indeed,the last few years brought us several examples indicating that the mammalian prion protein is no more peculiar protein–it seems that a better understanding of prion proteins nature-wide may aid us with the treatment of prion diseases and other amyloid-related medical conditions. 展开更多
关键词 amyloid artificial prion baker's yeast budding yeast drug screening fusion protein neurodegenerative diseases prion protein yeast-based assay
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基于系统的化合物-靶点相互作用预测模型的消栓通络方抗脑卒中网络药理学研究 认领
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作者 郑一夫 孔令雷 +5 位作者 贾皓 张宝月 王喆 许律捷 刘艾林 杜冠华 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期256-264,共9页
消栓通络方临床上主治脑血栓引起的精神呆滞、言语迟涩等症状,疗效显著,但其作用机制尚不明确。本文通过搜集消栓通络方中的化学成分和治疗脑卒中相关靶点,获得1251个化学成分和10个脑卒中相关靶点,采用朴素贝叶斯和递归分割等机器学习... 消栓通络方临床上主治脑血栓引起的精神呆滞、言语迟涩等症状,疗效显著,但其作用机制尚不明确。本文通过搜集消栓通络方中的化学成分和治疗脑卒中相关靶点,获得1251个化学成分和10个脑卒中相关靶点,采用朴素贝叶斯和递归分割等机器学习算法,基于分子指纹和分子描述符,结合分子对接方法,构建了脑卒中10个相关靶点的18个化合物-靶点相互作用预测模型。应用这些模型预测了消栓通络方的活性化学成分及其作用靶点,发现了153个潜在活性化学成分,其中22个可以与2个以上脑卒中药物靶点相互作用。在此基础上,利用网络构建专业软件,构建了化学成分-靶点网络,并通过Gene-Ontology(GO)富集分析,确证了靶点重要的生物过程,如凝血(blood coagulation)、血管生成正调控(positive regulation of angiogenesis)和离子转运正调控(positive regulation of ion transport)等。在此基础上,构建了靶点-通路网络。本研究利用机器学习、分子对接、虚拟筛选、数据挖掘及网络构建等技术方法,探索并部分揭示了消栓通络方抗脑卒中的活性物质基础及其化学成分-靶点-通路的网络作用机制,为消栓通络方的深入研究提供重要信息依据。 展开更多
关键词 消栓通络方 脑卒中 药物靶点 机器学习 分子对接 虚拟筛选 网络药理学
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