期刊文献+
共找到9,139篇文章
< 1 2 250 >
每页显示 20 50 100
茉莉生殖发育与分子生物学特性研究分析 预览
1
作者 邓衍明 齐香玉 苏家乐 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期270-277,共8页
茉莉花的观赏、茶用和药用价值均较高,是重要的花茶和香精原料,目前生产上使用的主要为双瓣茉莉,但双瓣茉莉经过多年的无性繁殖和长期使用会出现品种性退化,导致其抗性和产花量均降低。为全面了解茉莉生殖发育特性和分子生物学特性研究... 茉莉花的观赏、茶用和药用价值均较高,是重要的花茶和香精原料,目前生产上使用的主要为双瓣茉莉,但双瓣茉莉经过多年的无性繁殖和长期使用会出现品种性退化,导致其抗性和产花量均降低。为全面了解茉莉生殖发育特性和分子生物学特性研究现状,本文综述了国内外关于茉莉雌、雄性生殖器官的发育,分子标记开发,遗传多样性分析及功能基因克隆等基础研究方面的进展,并对今后茉莉生殖发育和分子生物学特性方面的主要研究方向和研究重点进行了展望,以期为克服茉莉结实障碍,实现品种改良、种质创新和重要性状的分子解析及分子设计育种等提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 茉莉花 生殖发育 分子标记 遗传多样性 次生代谢
在线阅读 免费下载
泥东风螺线粒体基因组及其遗传多样性分析 预览
2
作者 熊钢 周先文 +4 位作者 王晓清 巫旗生 康骊 秦溱 曾志南 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期26-33,共8页
为研究泥东风螺线粒体基因组遗传进化和遗传多样性,采用PCR扩增和直接测序技术,对泥东风螺线粒体基因组全序列及3个野生群体线粒体基因测序,并用生物软件进行分析。研究结果表明,泥东风螺线粒体基因组上的tRNA-Met、tRNA-Tyr、tRNA-Cys... 为研究泥东风螺线粒体基因组遗传进化和遗传多样性,采用PCR扩增和直接测序技术,对泥东风螺线粒体基因组全序列及3个野生群体线粒体基因测序,并用生物软件进行分析。研究结果表明,泥东风螺线粒体基因组上的tRNA-Met、tRNA-Tyr、tRNA-Cys、tRNA-Trp、tRNA-GLn、tRNA-Gly、tRNA-Glu和tRNA-Thr位于环形线粒体L链上;18种腹足纲动物线粒体全长基因相似性为70.1%~92.9%,种间的12S RNA和16S RNA相似性与线粒体基因组全长相似性相当;12S RNA的391~491 bp区域和16S RNA的1~106 bp和361~481 bp区域为高度变异区,而16S RNA的1191~1317 bp区域为高度保守区;以F5引物扩增测序3个野生群体,共检测到由40个多态位点组成的26个单倍型,野生群体单倍型多样性为(0.406±0.112)~(0.532±0.113),野生群体核苷酸多样性为(0.00094±0.00124)~(0.00111±0.00123);北海野生群体与连江和长乐野生群体之间的遗距离分别为0.00094和0.00099。其结果可以为泥东风螺遗传进化、人工增殖和种质资源保护评估提供参考。 展开更多
关键词 泥东风螺 线粒体基因组 环形结构 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
咖啡种质资源遗传多样性的ISSR分析 预览
3
作者 闫林 黄丽芳 +4 位作者 王晓阳 孙燕 林兴军 董云萍 龙宇宙 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期491-499,共9页
【目的】对我国收集保存的咖啡种质资源进行遗传多样性分析,为咖啡种质资源的收集、保存、鉴定、创新及有效利用提供理论参考。【方法】从哥伦比亚大学(UBC Primer Set#9)公布的100个ISSR引物序列中筛选出多态性好、扩增条带清晰且重复... 【目的】对我国收集保存的咖啡种质资源进行遗传多样性分析,为咖啡种质资源的收集、保存、鉴定、创新及有效利用提供理论参考。【方法】从哥伦比亚大学(UBC Primer Set#9)公布的100个ISSR引物序列中筛选出多态性好、扩增条带清晰且重复性好的引物,利用其对72份咖啡种质材料进行扩增,对电泳图谱进行统计分析,并利用NTSYSpc2.1计算遗传相似系数和遗传距离。根据非加权算术平均法(UPGMA)进行聚类分析,并进行主坐标分析。【结果】筛选出的19条引物共扩增出153条条带,其中多态性条带数为128条,占总条带数的83.7%;72份咖啡种质材料间的遗传相似系数为0.4531~0.9609,平均为0.6567;遗传距离为0.0351~1.0951,平均为0.4081。其中,大粒种种内遗传相似系数最大(0.9297~0.9531),遗传距离最小(0.0445~0.0669);中粒种种内遗传相似系数最小(0.5781~0.8750),遗传距离最大(0.1210~0.5363)。主坐标分析与聚类分析结果一致,均显示72份咖啡种质材料可分为三大类,其中3份大粒种、3份查理种及1份中粒种巴布亚新几内亚-2聚为Ⅰ类群;32份小粒种聚为聚为Ⅱ类群;除巴布亚新几内亚-2外的其他31份中粒种及1份中小粒杂交种Arabusta和1份福建咖啡共33份聚为Ⅲ类群。聚类分析结果与种质地理来源无明显相关性。【结论】咖啡种质资源各种间存在较大的遗传差异,以中粒种种内遗传多样性较丰富,以大粒种种内遗传多样性较低。利用ISSR分子标记可准确分析咖啡资源遗传多样性。 展开更多
关键词 咖啡 ISSR 遗传多样性 聚类分析 主坐标分析
在线阅读 免费下载
南沙群岛密斑马面鲀群体遗传多样性分析 预览
4
作者 高天翔 王志杨 +1 位作者 宋娜 宋林 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期159-165,共7页
密斑马面鲀Thamnaconustessellatus是在我国南海海域较为常见的一种马面鲀属鱼类。本研究基于线粒体DNA控制区序列对南沙群岛密斑马面鲀3个群体的遗传结构及其遗传多样性进行了分析。研究结果显示,密斑马面鲀的控制区序列变异程度较大,8... 密斑马面鲀Thamnaconustessellatus是在我国南海海域较为常见的一种马面鲀属鱼类。本研究基于线粒体DNA控制区序列对南沙群岛密斑马面鲀3个群体的遗传结构及其遗传多样性进行了分析。研究结果显示,密斑马面鲀的控制区序列变异程度较大,86尾个体序列的变异位点数为38个,共定义了28个单倍型;3个密斑马面鲀群体的单倍型多样度和核苷酸多样度均较高,且相差不大;密斑马面鲀群体间未检测到显著的群体遗传结构,分子方差分析表明,99.67%的遗传差异来自于群体内,群体间遗传差异仅为0.33%。贝叶斯树和最大似然树均显示出密斑马面鲀单倍型间松散的分布,未检测到显著的谱系结构。群体历史动态分析结果表明密斑马面鲀的群体经历了更新世的群体扩张事件。 展开更多
关键词 密斑马面鲀 南沙群岛 控制区 遗传多样性 群体遗传结构
在线阅读 下载PDF
白花蛇舌草的简单重复序列区间(ISSR)遗传多样性分析 预览
5
作者 周敏 高慧新 +2 位作者 封毅 曾昭清 田慧 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期200-205,共6页
采用简单重复序列区间(ISSR)分子标记对不同产地白花蛇舌草的遗传多样性进行分析。分别在广西壮族自治区、广东省、湖南省、浙江省、福建省、江西省和安徽省共采集23份白花蛇舌草样品,选用150条ISSR引物进行PCR扩增,运用POPGENE1.32、NT... 采用简单重复序列区间(ISSR)分子标记对不同产地白花蛇舌草的遗传多样性进行分析。分别在广西壮族自治区、广东省、湖南省、浙江省、福建省、江西省和安徽省共采集23份白花蛇舌草样品,选用150条ISSR引物进行PCR扩增,运用POPGENE1.32、NTSYS2.10软件进行遗传多样性分析。筛选出11条引物,扩增出115条多态性条带,多态性比率为85.22%,等位基因数(Na)为1.852 2,有效等位基因(Ne)为1.543 4,Neis基因多样性指数(H)为0.316 5,Shannon′s信息指数(I)为0.470 0。聚类分析结果表明白花蛇舌草可分成3类,实验结果表明ISSR分子标记可以为白花蛇舌草的系统分类和鉴定提供分子水平的科学依据。 展开更多
关键词 白花蛇舌草 ISSR 遗传多样性 遗传距离
在线阅读 下载PDF
基于SRAP标记的哈尼梯田红米遗传多样性及群体结构分析
6
作者 马孟莉 周晓梅 +3 位作者 郑云 张婷婷 张晓倩 卢丙越 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期2231-2237,共7页
著名的哈尼梯田核心区位于云南省元阳县,至今仍以种植水稻地方品种为主,梯田红米是其中的主要类型。本研究利用筛选的20对SRAP标记分析60份哈尼梯田红米品种的遗传多样性和群体结构。20对SRAP标记共扩增出182个条带,其中165个具有多态性... 著名的哈尼梯田核心区位于云南省元阳县,至今仍以种植水稻地方品种为主,梯田红米是其中的主要类型。本研究利用筛选的20对SRAP标记分析60份哈尼梯田红米品种的遗传多样性和群体结构。20对SRAP标记共扩增出182个条带,其中165个具有多态性,多态性比率达90.66%,平均每对引物可扩增9.10个条带;观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样度(H)和Shannon信息指数(I)分别为1.907、1.404、0.239和0.366,表明云南哈尼梯田水稻红米品种具有较丰富的遗传多样性。聚类分析和主成分分析均将60份红米品种分为两大类,即57个籼稻品种聚为第一类,3个粳稻品种聚为第二类,表明哈尼梯田红米以籼稻为主,在籼稻亚群中有部分品种存在遗传分化现象,这一结果与STRUCTURE软件分析的群体结构类型一致。本研究为哈尼梯田红米资源的保护和利用提供了科学依据。 展开更多
关键词 哈尼梯田 红米 遗传多样性 群体结构
基于转录组测序的葛根SSR标记研究与利用 预览
7
作者 肖亮 尚小红 +3 位作者 曹升 谢向誉 曾文丹 严华兵 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期59-67,共9页
该研究以‘桂粉葛1号’为材料,通过转录组测序的方法测得8.9Gb clean reads,组装成137629个转录本,最终得到83811个Unigene序列。进化树分析表明,葛根和苜蓿、花生聚为一支。用MISA软件在83811个序列中检测到25452个简单重复序列(SSR)位... 该研究以‘桂粉葛1号’为材料,通过转录组测序的方法测得8.9Gb clean reads,组装成137629个转录本,最终得到83811个Unigene序列。进化树分析表明,葛根和苜蓿、花生聚为一支。用MISA软件在83811个序列中检测到25452个简单重复序列(SSR)位点,三核苷酸重复的SSR数量最多,其次是二核苷酸重复。三核苷酸重复中,(AAG)n是最普遍的重复单元(27.87%)。共设计了229对SSR引物,其中28对引物可以产生清晰的条带和丰富的多态性,被用于检测44份葛根资源的遗传多样性。在44个葛根资源的基因组DNA中共扩增出90个片段,其中89个条带有多态性,平均等位基因数为3.1786。多态性信息量范围为0.0830~0.7742(平均数为0.4557)。聚类分析显示遗传相似性系数范围为0.2667~1.0000。这些结果提示所检测的葛根资源在DNA分子水平存在着丰富的遗传多样性。当阈值为0.58时,44个资源可以划分为2个类群,且44份资源的类群划分与地理来源之间没有直接关系,但这些标记将是葛根遗传多样性研究可用的基因组资源。 展开更多
关键词 SSR标记 资源收集 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
基于SRAP标记的甜瓜耐盐种质资源遗传多样性分析 预览
8
作者 高宁宁 常高正 +4 位作者 康利允 李晓慧 梁慎 李海伦 赵卫星 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期68-75,共8页
研究不同耐盐程度甜瓜种质资源的亲缘关系和遗传多样性,为甜瓜种质资源有效利用提供理论依据。该试验以不同耐盐程度的27个甜瓜品种为材料,利用SRAP标记分析甜瓜种质资源的遗传多样性,从364对引物组合中筛选出24对扩增清楚且多态性丰富... 研究不同耐盐程度甜瓜种质资源的亲缘关系和遗传多样性,为甜瓜种质资源有效利用提供理论依据。该试验以不同耐盐程度的27个甜瓜品种为材料,利用SRAP标记分析甜瓜种质资源的遗传多样性,从364对引物组合中筛选出24对扩增清楚且多态性丰富的引物,共扩增出415个清晰的位点,其中多态性位点241个,多态比率达58%。平均观测等位基因数(Na)为1.5880,平均有效等位基因数(Ne)为1.3470,平均Neis基因多样性指数(H)为0.2013,平均Shannons信息指数(I)为0.3010,表明供试甜瓜具有丰富的遗传多样性。UPGMA聚类结果显示:遗传相似系数在0.36~1.00之间,遗传相似性系数在0.72时,可将27个甜瓜品种划分为4个类群,耐盐型甜瓜在其中3个类群有分布,中等耐盐型甜瓜在4大类群中均有分布,盐敏感型均集中在第Ⅰ类群,表明耐盐型和中等耐盐型甜瓜种质的遗传多样性比盐敏感型种质丰富。遗传相似系数与UPGMA聚类结果的Cophentic矩阵相关系数为0.749,说明聚类分析结果较准确。研究认为,耐盐型甜瓜的遗传多样性较丰富,要得到耐盐的杂种优势品种,需要融入更多遗传关系较远的新种质。 展开更多
关键词 甜瓜 SRAP 遗传多样性 耐盐
在线阅读 下载PDF
基于重测序的陆地棉InDel标记开发与评价 预览
9
作者 吴迷 汪念 +3 位作者 沈超 黄聪 温天旺 林忠旭 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期196-203,共8页
碱基插入/缺失(InDel)是基因组中丰富的遗传变异形式。InDel以其密度高、易于基因型分型等优点成为分子标记开发的理想来源。本研究利用262份陆地棉品系重测序数据鉴定的InDel位点,在全基因组范围内设计了3206个InDel标记并挑选均匀分布... 碱基插入/缺失(InDel)是基因组中丰富的遗传变异形式。InDel以其密度高、易于基因型分型等优点成为分子标记开发的理想来源。本研究利用262份陆地棉品系重测序数据鉴定的InDel位点,在全基因组范围内设计了3206个InDel标记并挑选均匀分布的320个标记进行验证。320个标记筛选出87个多态性标记,多态性率为26.88%。利用多态性标记对不同地理来源的262份陆地棉种质资源进行基因分型,共检测到160个等位位点;多态性信息含量(PIC)为0.0836~0.3750,平均值为0.3073;基因多样性指数变异范围为0.0874~0.5000,平均值为0.3876,表明我国陆地棉遗传基础相对狭窄。群体结构分析将262份陆地棉品系大致划分为2个亚群,聚类分析和主成分分析的结果与之基本一致。采用混合线性模型(Mixed linear model)对6个纤维品质性状的关联分析检测到65个关联位点(P<0.01),各位点对表型变异贡献率为2.57%~8.12%。本研究旨在利用重测序数据开发全基因组范围的可用于凝胶检测的InDel标记,为棉花种质资源研究和分子标记辅助选择育种提供便捷工具。 展开更多
关键词 陆地棉 INDEL标记 遗传多样性 群体结构 关联分析
在线阅读 免费下载
糯玉米自交系SSR标记遗传多样性及群体遗传结构分析 预览
10
作者 卢媛 艾为大 +5 位作者 韩晴 王义发 李宏杨 瞿玉玑 施标 沈雪芳 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期214-224,共11页
为了解糯玉米种质的遗传基础,利用29对SSR标记对87份糯玉米自交系进行遗传多样性分析,共检测出180个等位变异,平均每个位点6个等位变异,多态性信息含量变幅为0.308~0.915,平均为0.572。材料间遗传相似系数为0.49~0.93,平均为0.66。通过... 为了解糯玉米种质的遗传基础,利用29对SSR标记对87份糯玉米自交系进行遗传多样性分析,共检测出180个等位变异,平均每个位点6个等位变异,多态性信息含量变幅为0.308~0.915,平均为0.572。材料间遗传相似系数为0.49~0.93,平均为0.66。通过聚类分析UPGMA(unweighted pair-group method with arithmetic means)方法在遗传相似系数0.64处将87份糯玉米自交系划分为4个类群,分别包含9、66、10和2份材料。此外,利用Structure群体遗传结构分析也将87份糯玉米自交系分为4个类群,分别包含24、25、19和19份材料;进一步分析表明,供试群体中大部分糯玉米自交系的遗传变异较单一。本研究为糯玉米新品种选育和遗传进化分析提供了种质基础和理论依据。 展开更多
关键词 糯玉米 遗传多样性 群体遗传结构
在线阅读 免费下载
中华绒螯蟹长江、黄河和辽河水系野生和养殖群体的遗传多样性 预览
11
作者 苏雨 张成 +3 位作者 李清清 郑海地 成永旭 吴旭干 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期436-444,共9页
中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)是中国最重要的淡水养殖蟹类,广泛分布于东亚地区,养殖区域主要集中在长江、黄河和辽河流域。本研究基于线粒体 DNA D-loop 区评估辽河野生群体(LW)和养殖群体(LC)、黄河野生群体(HW)和养殖群体(HC)及长... 中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)是中国最重要的淡水养殖蟹类,广泛分布于东亚地区,养殖区域主要集中在长江、黄河和辽河流域。本研究基于线粒体 DNA D-loop 区评估辽河野生群体(LW)和养殖群体(LC)、黄河野生群体(HW)和养殖群体(HC)及长江野生群体(YW)和养殖群体(YC)的遗传多样性和种群结构。结果显示:(1)用于本研究的 D-loop基因片段长度为 477 bp,共包含 234个变异位点和 131个简约信息位点, 6个群体的 262个个体中共有 110个单倍型,包括 90个独有单倍型和 20个共享单倍型;(2)6个种群的单倍型多样性指数(Hd)范围为 0.88889~0.96522,核苷酸多样性指数(π)范围为 0.00887~0.01602,养殖和野生群体遗传多样性水平依次为: HC>YC>LC 及HW>LW>YW;(3)6 个群体的遗传距离(Da)范围为 0.0119~0.0173,不论是养殖群体还是野生群体,辽河群体和长江群体之间的遗传距离均最小,且 6个群体间遗传分化指数 FST为 0.12938。对 6个群体进行中性检验显示 Tajima’s D和 Fu’s Fs的值均为负值。综上,基于线粒体 D-loop基因的研究结果表明,三水系养殖和野生群体均具有较高的遗传多样性,且辽河和长江水系中华绒螯蟹的亲缘关系相对较近,该研究为中华绒螯蟹的种质资源评估、保护和开发提供了参考。 展开更多
关键词 中华绒螯蟹 D-LOOP 地理种群 遗传多样性 遗传结构
在线阅读 下载PDF
藏系绵羊mtDNA和Y染色体遗传多样性的检测与系统进化关系的分析
12
作者 董泽生 高雪 +4 位作者 吴燕华 李蕾蕾 付弘赟 张瑞娜 贾功雪 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第4期45-47,51,179共5页
为了评估青海地区藏系绵羊各类群的遗传结构与分子进化关系,试验选择青海地区四个典型的地理生态类群(山谷型、欧拉型、高原型和扎什加型)藏羊,提取血液基因组DNA后,分别对线粒体D-loop区序列和Y染色体Sry基因序列进行特异性扩增并测序... 为了评估青海地区藏系绵羊各类群的遗传结构与分子进化关系,试验选择青海地区四个典型的地理生态类群(山谷型、欧拉型、高原型和扎什加型)藏羊,提取血液基因组DNA后,分别对线粒体D-loop区序列和Y染色体Sry基因序列进行特异性扩增并测序。结果表明:D-loop序列的核苷酸多样性为0.031±0.004,单倍型多样性为0.994±0.006;而Sry序列的核苷酸多样性为0.046±0.005,单倍体多样性为0.861±0.044。说明高原型藏羊在母系遗传上更接近扎什加型藏羊,而在父系遗传上扎什加型藏羊与其他三个类群间的隔离较为明显,三个类群在父系遗传上的基因交流更为频繁。 展开更多
关键词 藏系绵羊 线粒体DNA Y染色体 系统发育 遗传多样性 遗传距离
红花EST-SSR分子标记开发与初步验证 预览
13
作者 覃瑞 陈贤军 +6 位作者 湛蔚 向妮艳 刘虹 严兴初 黄稳 覃尔岱 李刚 《西南民族大学学报:自然科学版》 CAS 2019年第2期146-154,共9页
旨在开发红花EST-SSR标记,为红花分子辅助育种和种质资源评价提供有力工具.先对红花转录组进行测序,选用MISA软件筛选鉴定SSR位点.在云南红花(YH)转录组中,共获得46 016个SSR位点,分布频率为32.09%,平均每3.11 kb有一个SSR.云南红花SSR... 旨在开发红花EST-SSR标记,为红花分子辅助育种和种质资源评价提供有力工具.先对红花转录组进行测序,选用MISA软件筛选鉴定SSR位点.在云南红花(YH)转录组中,共获得46 016个SSR位点,分布频率为32.09%,平均每3.11 kb有一个SSR.云南红花SSR位点以二,三核苷酸重复基序为主,其优势重复基序分别为AG/CT(44%)和AAG/CTT(24%).SSR位点重复次数相差较大,其中重复为5次比率最高,SSR位点数为9 369(26.63%),其次为6次(8 148, 23.16%).同时,利用Primer3.0进行引物设计,随机筛选27对引物,在60份不同来源红花种质中进行多态性验证,获得12对具有多态性稳定的引物,多态性引物比率为44.4%.结果表明,基于红花转录组序列开发SSR标记是可行的,开发的标记具有稳定扩增性,丰富多态性等优点,开发的SSR标记将有助于红花功能基因挖掘,遗传连锁图谱构建和遗传多样性分析. 展开更多
关键词 红花 转录组 EST-SSR 多态性 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
基于脂肪酸生物标记法探讨中国沿海六群体绒螯蟹(Eriocheir sensu stricto)的种群遗传 预览
14
作者 张成 祖露 +2 位作者 李清清 成永旭 吴旭干 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期388-397,共10页
水产动物肌肉中的脂肪酸组成可用于评价其种群遗传。本研究通过测定和比较辽河(LH)、黄河(HH)、长江(YZ)、瓯江(OJ)、闽江(MJ)和南流江(NLJ)水系野生绒螯蟹(Eriocheir sensu stricto)肌肉中的脂肪酸组成,进一步分析了6 群体间的遗传多... 水产动物肌肉中的脂肪酸组成可用于评价其种群遗传。本研究通过测定和比较辽河(LH)、黄河(HH)、长江(YZ)、瓯江(OJ)、闽江(MJ)和南流江(NLJ)水系野生绒螯蟹(Eriocheir sensu stricto)肌肉中的脂肪酸组成,进一步分析了6 群体间的遗传多样性和亲缘关系。结果显示:(1)在6 水系群体中检测出26 种脂肪酸,其中C20:5n3、C18:1n9、C22:6n3、C16:0、C20:4n6、C18:2n6 和C18:0 为主要种类,其总和占总脂肪酸的74%以上;(2)逐步判别分析法筛选出8 种判别贡献较大的脂肪酸,分别是C17:0、C18:0、C20:0、C22:1n9、C18:3n3、C18:3n6、C20:2n6 和C22:5n3,据此分别建立判别方程,综合判别准确率为98.33%;(3)聚类分析显示: OJ 与MJ 群体的欧氏距离最小, HH与YZ群体的欧氏距离比OJ与MJ群体的要大, NLJ群体与其他5 个群体的欧氏距离相对最大;(4) 6 群体间脂肪酸含量的变异系数在2.99%—30.00%之间,遗传多样性指数变化幅度在3.2732—3.3204 之间。综上,基于脂肪酸生物标记法表明6 水系绒螯蟹群体遗传多样性指数均较高,脂肪酸可以有效鉴别6水系野生绒螯蟹种群,整体上南流江群体和其余5 群体间相距最远;本研究结果可为绒螯蟹种质资源评价和开发利用等提供基础资料。 展开更多
关键词 绒螯蟹属 地理群体 脂肪酸生物标记 遗传多样性 亲缘关系
在线阅读 下载PDF
香菇F2代群体农艺性状的SSR关联分析 预览
15
作者 章炉军 高成 +5 位作者 于海龙 宋春艳 尚晓冬 谭琦 王瑞娟 张美彦 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2019年第1期1-10,100共11页
以香菇(Lentinula edodes)'沪香F2'为亲本,构建F2代群体,测定85个F2代菌株在PDA平板上的菌丝生长速度、菌包中的菌丝生长速度、原基形成时间、出菇周期、菌盖直径、菌柄直径、菌柄长度、单包产量、单包菇数等农艺性状,利用筛选... 以香菇(Lentinula edodes)'沪香F2'为亲本,构建F2代群体,测定85个F2代菌株在PDA平板上的菌丝生长速度、菌包中的菌丝生长速度、原基形成时间、出菇周期、菌盖直径、菌柄直径、菌柄长度、单包产量、单包菇数等农艺性状,利用筛选获得的32对具多态性的SSR引物对F2代群体进行基因型检测,共扩增出93个多态性条带,将观测的9个农艺性状与这93个SSR标记进行相关性分析。结果显示,有26个标记能够与这些性状发生关联,关联事件的总数为30;其中有8个标记表现为极显著关联(P<0.01),2个标记与菌柄长度极显著关联,6个标记与单包菇数极显著关联。本研究首次探索了香菇F2代群体在表型上的分化以及与分子标记之间的关联性,为分子标记辅助育种在香菇中的应用提供参考。 展开更多
关键词 遗传多样性 连锁不平衡 群体结构 等位变异 表型变异效应
在线阅读 下载PDF
番茄种质资源主要植物学性状的遗传多样性及相关性 预览
16
作者 李云洲 闫见敏 +2 位作者 须文 王勇 梁燕 《贵州农业科学》 CAS 2019年第2期68-74,共7页
为拓宽番茄品种选育材料的遗传基础,以西北农林科技大学园艺学院番茄种质资源库中的142份番茄种质为研究材料,对植株、产量、果实和品质等方面的47个性状进行遗传多样性和相关性分析,研究番茄种质的遗传多样性及各性状间的相关性。结果... 为拓宽番茄品种选育材料的遗传基础,以西北农林科技大学园艺学院番茄种质资源库中的142份番茄种质为研究材料,对植株、产量、果实和品质等方面的47个性状进行遗传多样性和相关性分析,研究番茄种质的遗传多样性及各性状间的相关性。结果表明:47个性状的遗传多样性指数平均为2.08,其中27个质量性状的遗传多样性指数平均为0.65,果型的遗传多样性指数最高(1.44),株型遗传多样性指数最低(0.04);20个数量性状的遗传多样性指数平均为4.01,心室数的遗传多样性指数最小(2.41),果横径的遗传多样性指数最高(4.79)。数量性状的变异系数平均为45.94%,除叶片长之外,其余各性状变异系数均高于平均值。数量性状中单花序花数和单花序果数属于强变异,其余均为中等变异。142份番茄种质为自然群体,遗传变异较丰富,可用于开展番茄重要目标性状的关联分析作图。 展开更多
关键词 番茄 种质资源 遗传多样性 相关性
在线阅读 下载PDF
贵州武陵山地区19份柚资源的遗传多样性 预览
17
作者 王小柯 郑乾明 +3 位作者 罗怿 李文云 柏自琴 李金强 《贵州农业科学》 CAS 2019年第2期75-80,共6页
为保护野生和地方柚品种资源、挖掘优良性状,采集贵州武陵山地区19份柚样品,提取总DNA,利用Illumina HiSeq 4000PE150测序,构建GBS(Genotyping-by-Sequencing)文库;使用Samtools软件进行SNP(SingleNucleotidePolymorphism)检测;基于SNP... 为保护野生和地方柚品种资源、挖掘优良性状,采集贵州武陵山地区19份柚样品,提取总DNA,利用Illumina HiSeq 4000PE150测序,构建GBS(Genotyping-by-Sequencing)文库;使用Samtools软件进行SNP(SingleNucleotidePolymorphism)检测;基于SNP基因分型结果采用邻接法构建系统进化树,对19份柚资源进行遗传多样性分析。结果表明:19份柚资源测序总碱基数5.61Gbp且测序质量较高,平均测序深度10.67,与柚参考基因组的平均比对匹配率为98.47%。共获得79825个高质量的SNP位点,所有SNP位点在柚基因组9条染色体上基本均匀分布。系统进化树显示19份样品被聚为3个主要的类群且遗传差异较小。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 核苷酸多样性 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
不同来源中国李(Prunus salicina L.)的多样性与近缘种关系 预览
18
作者 魏潇 章秋平 +6 位作者 刘宁 张玉萍 徐铭 刘硕 张玉君 马小雪 刘威生 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期568-578,共11页
【目的】中国李资源丰富、分布广泛。更好地明晰不同来源中国李栽培品种的多样性、遗传结构差异以及与同域近缘种的关系,将有利于明确中国李驯化扩散历程以及近缘种在栽培驯化过程中的作用,促进中国李地方品种资源的深入挖掘和新品种的... 【目的】中国李资源丰富、分布广泛。更好地明晰不同来源中国李栽培品种的多样性、遗传结构差异以及与同域近缘种的关系,将有利于明确中国李驯化扩散历程以及近缘种在栽培驯化过程中的作用,促进中国李地方品种资源的深入挖掘和新品种的选育。【方法】利用均匀分布于基因组的22对SSR分子标记,采用荧光毛细管电泳检测技术对48份种质进行基因分型,其中包括38份不同来源的中国李种质、10份变异类型或近缘种。通过GenAlEx 6.41软件评估22对SSR引物的多态性,对参试种质按不同来源分析遗传多样性;利用NTSYS-pc 2.1软件构建48份材料的树状聚类分析图;并根据贝叶斯模型的Structure 2.2软件分析不同居群间的遗传结构差异。【结果】基于48份供试材料的数据,22对SSR引物等位变异范围为3—21个,平均每个位点检测到13.54个;总共检测到298个等位变异,其中有51.8%的等位变异属于稀有等位变异。在不同居群间进行比较,根据平均有效等位变异(Ne)、平均Shannon’s多样性指数(I)、观察杂合度(Ho)和期望杂合度(He)可以看出,南方品种群的多样性最高,其次为东北品种群;而杏李的多样性最低,且明显低于华北品种群。通过分子方差分析,认为中国李的多样性有69%的遗传变异来源于居群内,仅有31%的遗传变异来源于居群间。基于遗传分化系数和Nei’s遗传距离的数据比较,认为不同居群间存在显著的遗传分化,同时不同地理来源种质间存在适当的基因交流。树状聚类分析暗示国外育成品种与我国南方品种群具有较近的亲缘关系;而华北品种群与杏李关系密切;东北品种群与乌苏里李关系紧密。群体结构分析可以将栽培中国李种质资源划分为南方小果脆肉品种群、南方大果品种群(包括国外育成品种)、华北品种群和东北品种群。【结论】我国南方地区中国李的多样性最为丰富,� 展开更多
关键词 中国李 遗传多样性 群体结构 基因流
在线阅读 下载PDF
黄淮海地区夏玉米弯孢叶斑病菌遗传多样性分析 预览
19
作者 常佳迎 刘树森 +3 位作者 马红霞 石洁 郭宁 张海剑 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期822-836,共15页
【目的】针对黄淮海地区发生的玉米弯孢叶斑病,通过分子生物学技术,明确其致病菌新月弯孢(Curvularia lunata)在不同地区和年份间的遗传差异及亲缘关系,为研究该病害的发生和流行提供数据资料。【方法】对2013、2016和2017年采集自黄淮... 【目的】针对黄淮海地区发生的玉米弯孢叶斑病,通过分子生物学技术,明确其致病菌新月弯孢(Curvularia lunata)在不同地区和年份间的遗传差异及亲缘关系,为研究该病害的发生和流行提供数据资料。【方法】对2013、2016和2017年采集自黄淮海地区5省(河南、河北、山东、安徽、江苏)的病样进行分离,并采用形态学和分子生物学(ITS和EF-1α序列分析)对分离到的菌株进行鉴定,共获得175个新月弯孢菌株。从哥伦比亚大学开发的通用引物中筛选出13条多态性高、重复性好的引物,利用筛选出的引物对175个新月弯孢菌株进行ISSR-PCR扩增,利用Popgen32软件计算多态性比率、Shannon’s信息指数、群体间的遗传距离和遗传相似性,使用NTsys2.10e软件进行UPGMA聚类分析和基于遗传相似系数的主坐标分析,构建聚类分析图和散点图。【结果】利用筛选出的引物对175个菌株进行PCR扩增,共获得105条多态性条带,多态性比率为100%。在群体平均水平上,基因多样性水平(H)为0.3867,Shannon’s的信息指数(I)为0.5682,表明玉米弯孢叶斑病菌具有丰富的遗传多样性;不同地理种群间的遗传多样性存在一定差异,河南和安徽种群遗传多样性最高,江苏种群较低;年度间相同地理来源的菌群亲缘关系较远,相同年份不同地理来源菌群亲缘关系较近。聚类分析显示所有菌株相似系数为0.51—0.93,在相似系数为0.59水平上,175个菌株被划分为2群5个亚群,亚群间表现出年度间的差异,不同地理种群病菌间存在基因交流,遗传相关性较高;主坐标分析结果与聚类分析结果一致,同一年份的菌株明显聚集在一起。【结论】引起黄淮海地区玉米弯孢叶斑病的病原菌群体存在较高的遗传变异,地域相邻的病菌遗传关系较近;同一地区的菌株在年度间表现出一定遗传距离,而同一年份不同地理来源的菌株遗传距离较近。引起该地区� 展开更多
关键词 新月弯孢 黄淮海地区 遗传多样性 ISSR
在线阅读 下载PDF
基于线粒体COⅠ序列的中国前鳞鮻遗传多样性分析 预览
20
作者 黄镇宇 章群 +2 位作者 卢丽锋 周琪 唐楚林 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2019年第1期46-52,共7页
前鳞鮻(Liza affinis)是分布于西北太平洋的日本南部及中国台湾海域等的经济鱼类。为了解中国前鳞鮻的遗传背景,该研究分析了采自中国4省82尾样本COⅠ基因5’端712 bp序列,共发现21个单倍型,遗传多样性(H_d=0.4840±0.0700,π=0.001... 前鳞鮻(Liza affinis)是分布于西北太平洋的日本南部及中国台湾海域等的经济鱼类。为了解中国前鳞鮻的遗传背景,该研究分析了采自中国4省82尾样本COⅠ基因5’端712 bp序列,共发现21个单倍型,遗传多样性(H_d=0.4840±0.0700,π=0.0010±0.0002)较低。根据群体所属的地区、海域、海峡进行分组,通过AMOVA分析,得出组间的Fst值皆小于0.05,P值皆大于0.05,组间变异的比例极低(–0.6%~0.46%),表明中国前鳞鮻群体间无明显分化,其原因可能是:1)频繁的基因交流。前鳞鮻的洄游范围较大,且受海流影响,导致不同地区的群体间有着密切的基因交流;2)近期种群扩张事件。中国前鳞鮻整体的Fu’s F_s值为显著性负值(F_S=–20.3900,P=0),核苷酸错配峰图为明显单峰,单倍型网络图呈星状结构,均表明中国前鳞鮻群体经历过种群扩张,估算扩张大约发生在13.4199~1.4911万年前,可能是冰期和间冰期的交替中海平面的变化所致。此外,洞头群体的遗传多样性(H_d=0.8080±0.1130,π=0.0021±0.0006)明显高于其他地理群体,建议将其作为优先保护的对象。 展开更多
关键词 前鳞鮻 遗传多样性 COⅠ基因 中国沿海
在线阅读 免费下载
上一页 1 2 250 下一页 到第
使用帮助 返回顶部 意见反馈