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引起青海省马铃薯根腐类病害的镰刀菌种类鉴定
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作者 杨波 王喜刚 +1 位作者 郭成瑾 沈瑞清 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期420-423,共4页
马铃薯是继水稻、小麦和玉米之后的第四大粮食作物[1],也是我国青海省主要的经济作物。马铃薯干腐病是镰刀菌根腐类病害中最重要的一种病害,其窖藏期发病率最高可达60%[2],根腐类病害已成为限制青海省马铃薯产业发展的重要因素。
关键词 POTATO FUSARIUM root ROT diseases MORPHOLOGICAL characteristics molecular identification
鱼卵和仔稚鱼鉴定技术研究进展 预览
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作者 金雨婷 蒋日进 +2 位作者 赵进 刘志坚 管峰 《安徽农业科学》 CAS 2019年第15期18-20,39共4页
鱼卵和仔稚鱼是鱼类繁殖的早期幼体形态,其分布、数量和种类对于渔业资源的可持续发展和生物学研究具有重要意义,鱼卵和仔稚鱼鉴定是这一研究的重要环节。鱼卵和仔稚鱼的鉴定先后历经了形态学鉴定和分子鉴定两个技术发展阶段。简述鱼卵... 鱼卵和仔稚鱼是鱼类繁殖的早期幼体形态,其分布、数量和种类对于渔业资源的可持续发展和生物学研究具有重要意义,鱼卵和仔稚鱼鉴定是这一研究的重要环节。鱼卵和仔稚鱼的鉴定先后历经了形态学鉴定和分子鉴定两个技术发展阶段。简述鱼卵和仔稚鱼鉴定在渔业资源普查和科学研究中的重要意义以及2种主要鉴定技术的研究进展,为鱼卵和仔稚鱼鉴定研究提供基础知识。 展开更多
关键词 鱼卵和仔稚鱼 物种鉴定 形态学 分子鉴定 DNA条形码
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2017年江苏省急性驰缓性麻痹患者感染非脊髓灰质炎肠道病毒的鉴定分析
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作者 戚宇华 冷红英 +2 位作者 陈强 吴昀 郭宏雄 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第4期417-419,425共4页
目的对2017年江苏省急性驰缓性麻痹(AFP)患者粪便中分离的非脊髓灰质炎肠道病毒(NPEV)进行分型鉴定。方法收集249例AFP患者粪便,分离NPEV病毒,采用多对引物RT-PCR扩增VP1区基因序列并测序,进行Blast比对和基因进化树分析。结果共分离出N... 目的对2017年江苏省急性驰缓性麻痹(AFP)患者粪便中分离的非脊髓灰质炎肠道病毒(NPEV)进行分型鉴定。方法收集249例AFP患者粪便,分离NPEV病毒,采用多对引物RT-PCR扩增VP1区基因序列并测序,进行Blast比对和基因进化树分析。结果共分离出NPEV13株,RT-PCR扩增VP1区基因后进行测序分型,其中3株为肠道病毒A群(CVA2 2株,CVA10 1株);8株为肠道病毒B群(E6 2株,E11 2株,CVB5、E3、E5、E25各1株);2株为混合感染(A群中的CVA8+B群的E11和B群的CVB5+E6);未分离到C群和D群毒株。结论2017年江苏省AFP患者肠道中的NPEV以HEV-B群为优势群,其次为HEV-A群,可为本地NPEV的病原谱研究提供依据。 展开更多
关键词 非脊髓灰质炎肠道病毒 急性驰缓性麻痹病例 分子分型 鉴定
林木根际细菌JYZ-SD5的促生抗逆性能及种类鉴定 预览
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作者 徐秀倩 吴小芹 +1 位作者 吴天宇 曾梦嫚 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期31-38,共8页
旨在探究林木根际细菌JYZ-SD5促生抗逆性能,以期揭示该菌在野外应用的价值。采用特定培养基定性检测该菌的固氮解磷解钾特性,测定该菌产IAA能力;平板对峙法检测菌株拮抗病原真菌活性;检测该菌重金属耐受性;将根际细菌JYZSD5施用于水杉... 旨在探究林木根际细菌JYZ-SD5促生抗逆性能,以期揭示该菌在野外应用的价值。采用特定培养基定性检测该菌的固氮解磷解钾特性,测定该菌产IAA能力;平板对峙法检测菌株拮抗病原真菌活性;检测该菌重金属耐受性;将根际细菌JYZSD5施用于水杉盆栽幼苗,观测对水杉生长的影响;采用形态、生理生化测试及16S rRNA基因序列分析,对菌株JYZ-SD5进行种类鉴定。结果显示,菌株JYZ-SD5具有固氮、解磷、解钾的能力;不加色氨酸前提下产IAA量可达6.818 6μg/mL;对链格孢(Alternaria sp.)、异色状拟盘多毛孢(Pestalotiopsis vesicolor)有一定拮抗活性,可产生蛋白酶和纤维素酶;对重金属Mn7+、Cr6+耐受性强,最高均可达400 mg/L;温室盆栽试验表明,根际细菌JYZ-SD5可提高水杉苗木叶绿素相对含量,对水杉株高和地径增长具有促进作用。结合形态学、生理生化和分子鉴定的方法初步确定该菌为拟蕈状芽孢杆菌(Bacillus paramycoides)。根际细菌JYZ-SD5具有良好的促生抗逆特性,具有成为新型生物菌肥的开发潜力和野外应用价值。 展开更多
关键词 根际细菌 促生特性 抗逆特性 种类鉴定
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矮化核桃枝枯病病原菌的形态与分子鉴定 预览
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作者 程相瑞 李丙雪 +2 位作者 卢靖天 陈倩倩 康业斌 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期78-82,133共6页
为了明确河南省洛阳地区核桃枝条一种新病害的病原种类,对采自田间的典型症状枝条进行了常规组织分离,对单孢菌株进行了形态鉴定、rDNA ITS序列分析及致病性测定。结果表明,病原菌在PDA培养基上菌落初为白色,随着色素的积累,由中心向边... 为了明确河南省洛阳地区核桃枝条一种新病害的病原种类,对采自田间的典型症状枝条进行了常规组织分离,对单孢菌株进行了形态鉴定、rDNA ITS序列分析及致病性测定。结果表明,病原菌在PDA培养基上菌落初为白色,随着色素的积累,由中心向边缘变为灰绿色,再变成墨绿色,最终全部变成黑色;气生菌丝棉絮毛状,菌落边缘不整齐,近圆形或不规则形。分生孢子器散生或聚生,呈黑色小粒状,分生孢子器球形或近球形,深褐色,具孔口;分生孢子梗短缺,无色,杆状,末端产生分生孢子;分生孢子梭形、纺锤形,无色,无隔,基部钝圆,顶部稍尖,单孢(24.5~ 29.0)μm×(4.8~7.5)μm。离体枝条接种结果表明,该菌能侵染核桃枝条引起与田间相同的症状。据此将分离物鉴定为葡萄座腔菌 Botryosphaeria dothidea 。 展开更多
关键词 核桃 枝枯病 葡萄座腔菌 形态鉴定 分子鉴定
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寄生醉马草的孢囊线虫种类鉴定 预览
6
作者 张译文 李惠霞 +3 位作者 陈秀菊 徐鹏刚 郭静 张淑玲 《草业科学》 CAS CSCD 2019年第5期1283-1291,共9页
为了解孢囊线虫在禾本科牧草上的寄生情况,2017年8月中旬采集甘肃省天祝高寒草原禾本科牧草根及根际土样,通过简易漂浮法分离孢囊线虫。结果发现,在醉马草(Achnathernm inebrians)根部观察到白色孢囊线虫,并从根际土样中分离到褐色孢囊... 为了解孢囊线虫在禾本科牧草上的寄生情况,2017年8月中旬采集甘肃省天祝高寒草原禾本科牧草根及根际土样,通过简易漂浮法分离孢囊线虫。结果发现,在醉马草(Achnathernm inebrians)根部观察到白色孢囊线虫,并从根际土样中分离到褐色孢囊。通过对该线虫群体阴门膜孔、阴门裂、阴门下桥、泡状突等形态特征进行观察和测量,初步将其鉴定为禾谷孢囊线虫(Heterodera avenae Wollenweber)。用最大似然法对该群体的ITS1-rDNA和28SrDNA序列在软件MEGA6.0构建系统发育树,结果显示:其ITS1序列与中国的H.avenae群体聚为一支,其相似性为99%;28S序列与捷克的H.avenae群体聚为一支,其相似性为99%。通过形态学和系统发育学综合分析,将醉马草上寄生的线虫群体鉴定为禾谷孢囊线虫,这是首次发现醉马草可被禾谷孢囊线虫寄生。该研究结果为醉马草的防治提供了理论依据。 展开更多
关键词 醉马草 禾谷孢囊线虫 形态鉴定 分子鉴定
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Identification of Microplankton in South China Sea with Image-Matching Individual PCR 预览
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作者 LI Si YANG Guanpin +1 位作者 ZHU Baohua PAN Kehou 《中国海洋大学学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第1期219-226,共8页
In this study,marine microplankton were identified by combining standard light microscopy with Sanger 18S rRNA gene sequencing.The image-matching individual PCR technique was applied to identify the image collectable ... In this study,marine microplankton were identified by combining standard light microscopy with Sanger 18S rRNA gene sequencing.The image-matching individual PCR technique was applied to identify the image collectable unicellular microplankton to genera.Instead of pure strain culture and morphological identification,microplankton individual cells were isolated and fixed with glutaraldehyde,frozen and stored for months.Finally,they were imaged under a microscope and molecularly identified via phylogenetic analysis of their 18S ribosomal RNA gene(18S rDNA).Microplankton cells were collected at 30 locations in South China Sea,and were assigned to 21 known and 4 unidentified genera(2 uncultured fungi and 2 uncultured stramenopiles)with phylogenetic analysis in parallel to the morphological identification. 展开更多
关键词 image-matching INDIVIDUAL PCR MICROPLANKTON 18S ribosomal RNA gene morphological IDENTIFICATION molecular IDENTIFICATION South China Sea
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洛阳烟区烟株根围抗烟草疫霉放线菌的筛选与鉴定 预览
8
作者 陈奇园 丁钥琪 +2 位作者 赵世民 李淑君 康业斌 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期22-28,共7页
为筛选对烟草疫霉具有拮抗作用的放线菌菌株,有效防治烟草黑胫病,对洛阳烟区烟株根围土壤中分离的放线菌采用改良平板对峙法与菌丝生长速率法测定了供试菌株及其发酵液对烟草疫霉的拮抗作用,并通过形态学观察、生理生化测定及16S rDNA... 为筛选对烟草疫霉具有拮抗作用的放线菌菌株,有效防治烟草黑胫病,对洛阳烟区烟株根围土壤中分离的放线菌采用改良平板对峙法与菌丝生长速率法测定了供试菌株及其发酵液对烟草疫霉的拮抗作用,并通过形态学观察、生理生化测定及16S rDNA序列分析鉴定了优势拮抗放线菌的种类。结果表明:在获得的227个放线菌单菌落中,8个菌株的发酵液对烟草疫霉菌丝生长的抑制率达100%,被确定为优势拮抗放线菌。根据这些菌株的形态学观察、生理生化反应与16S rDNA序列分析结果,将菌株YY75鉴定为鲁萨链霉菌(Streptomyces lucensis),菌株YY124、YY135鉴定为高贵链霉菌(S. nobilis),菌株LN204、LN221、LN247鉴定为娄彻链霉菌(S. rochei),菌株SX92鉴定为珊瑚链霉菌(S. coralus),菌株SX59鉴定为金黄回旋链霉(S. aureoverticillatus),均属于放线菌门、放线菌纲、链霉菌目、链霉菌科、链霉菌属。 展开更多
关键词 洛阳烟区 烟草 烟草疫霉 拮抗放线菌 形态鉴定 分子鉴定
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HRM技术在梅花鹿茸及其混伪品药材鉴定中的应用
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作者 郭鑫 张旭 +5 位作者 任晓航 周红潮 时坤 李建明 宗颖 杜锐 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1140-1143,共4页
目的采用高分辨率熔解曲线技术(HRM),基于SRY序列对梅花鹿茸及相关混伪品药材进行快速鉴别,为规范市场药材管理提供一个新的分子检测手段。方法购买梅花鹿茸及相关鹿茸药材进行DNA提取,选择SRY序列为鉴别序列,在退火温度为57℃,40个循... 目的采用高分辨率熔解曲线技术(HRM),基于SRY序列对梅花鹿茸及相关混伪品药材进行快速鉴别,为规范市场药材管理提供一个新的分子检测手段。方法购买梅花鹿茸及相关鹿茸药材进行DNA提取,选择SRY序列为鉴别序列,在退火温度为57℃,40个循环数的条件下,建立正品梅花鹿茸的熔解曲线模型,并对其DNA模板浓度、引物浓度进行筛选得到适宜范围。结果在DNA质量浓度为10~100 ng·μL-1、引物浓度为10μmol·L-1的条件下,正品梅花鹿茸药材的熔解曲线Tm值为(82.77±0. 03)℃。应用该方法检测市场随机收集的10份鹿茸产品,通过比较分析7份为正品梅花鹿茸,3份为驯鹿茸。进而将其PCR产物进行测序,加以验证。结论 HRM方法稳定、灵敏、重现性好,可以实现简单、快速、高通量、可视化的鹿茸药材鉴定。 展开更多
关键词 高分辨率熔解曲线 SRY 梅花鹿茸 分子鉴定
牦牛肺炎病原多杀性巴氏杆菌和殊异支原体的分子鉴定与分析 预览
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作者 张学勇 郭志宏 +6 位作者 简莹娜 朵红 沈秀英 马怡隽 付永 宋永武 才让周在 《青海畜牧兽医杂志》 2019年第2期39-42,55共5页
青海省刚察县某牦牛产业基地牦牛发生咳嗽,鼻孔有分泌物流出,呼吸困难等症状的疾病。为快速确诊发病牛的致病原因,及时防控和治疗,从发病和病死的牦牛中,采集鼻腔拭子和肺脏、胸腔积液,利用PCR方法进行分子鉴定与分析。结果显示:此牛场... 青海省刚察县某牦牛产业基地牦牛发生咳嗽,鼻孔有分泌物流出,呼吸困难等症状的疾病。为快速确诊发病牛的致病原因,及时防控和治疗,从发病和病死的牦牛中,采集鼻腔拭子和肺脏、胸腔积液,利用PCR方法进行分子鉴定与分析。结果显示:此牛场中引发肺炎的病原是A型多杀性巴氏杆菌和殊异支原体两种病原体混合感染,测序结果显示5个有效样品中鉴定的为完全相同的病原,P.multocida-GC1的Kmt基因与参考序列中国株CP031554/3/2/1同源性在99%以上,M.dispar-GC1与参考序列的16SrRNA基因同源性在97%以上。同时在遗传进化角度再次分析确认了鉴定的P.multocida与中国和俄罗斯的A型多杀性巴氏杆菌聚成一大支;鉴定的M.dispar与殊异支原体聚为一支。结果表明,青海刚察地区牦牛存在感染多杀性巴氏杆菌和殊异支原体的潜在风险,该研究为牦牛呼吸道疾病与肺炎的病原学调查和病原的流行病学调查提供了参考数据。 展开更多
关键词 牦牛 多杀性巴氏杆菌 殊异支原体 分子鉴定
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大叶黄杨灰斑病病原菌鉴定、生物学特性及五种杀菌剂对其抑制作用
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作者 侯囡嵩 陈雅丽 +1 位作者 于得水 陈名君 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期670-678,共9页
为明确大叶黄杨灰斑病病原菌种类、生物学特性和对杀菌剂的敏感性,采用组织分离法获得大叶黄杨灰斑病病原菌,利用形态特征和分子生物学对其进行鉴定,系统研究该病原菌的生物学特性,并用生长速率法测定了80%代森锰锌、80%代森锌、70%百... 为明确大叶黄杨灰斑病病原菌种类、生物学特性和对杀菌剂的敏感性,采用组织分离法获得大叶黄杨灰斑病病原菌,利用形态特征和分子生物学对其进行鉴定,系统研究该病原菌的生物学特性,并用生长速率法测定了80%代森锰锌、80%代森锌、70%百菌清、50%多菌灵和430 g/L戊唑醇5种杀菌剂对该病原菌生长的抑制效果。致病性测定结果表明,从感病植株分离所得菌株能在大叶黄杨叶片上成功定殖并扩展,且从发病部位分离得到的菌株与原接种菌株相同。通过病原菌的宏观形态、显微结构和ITS序列分析,确定该病原菌为斑污拟盘多毛孢Pestalotiopsis maculans;当葡萄糖为碳源、蛋白胨为氮源时,菌丝日生长速度最快,分别为4.08、4.90 mm/d;当温度为21~28℃、pH为7时,菌丝日生长速度最快,分别为5.07~5.16 mm/d和5.21 mm/d;50%多菌灵对该菌的抑制效果最好,抑制中浓度EC50最小,为0.06 μg/mL。 展开更多
关键词 斑污拟盘多毛孢 分子鉴定 生物学特性 抑制作用
基于便携式和CFX96实时荧光PCR仪的冬虫夏草及其混伪品鉴定研究
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作者 贠凯祎 向丽 +3 位作者 王晓玥 刘杨 姚辉 宋经元 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期746-752,共7页
采用TaqMan探针实时荧光PCR方法对冬虫夏草及其混伪品进行分子鉴定研究。从100份冬虫夏草及其混伪品中提取总DNA,依据核糖体(rDNA)内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列,利用MEGA 7.0软件进行比较分析,找出冬虫夏草及... 采用TaqMan探针实时荧光PCR方法对冬虫夏草及其混伪品进行分子鉴定研究。从100份冬虫夏草及其混伪品中提取总DNA,依据核糖体(rDNA)内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列,利用MEGA 7.0软件进行比较分析,找出冬虫夏草及其混伪品的变异位点,通过Primer Premier 6.0软件设计一对特异性引物和TaqMan探针,分别在两种实时荧光PCR仪(Genesig q16和Bio-Rad CFX96)上进行灵敏度和特异性鉴定研究。灵敏度研究表明,在Bio-Rad CFX96系统中,该方法对冬虫夏草DNA模版的检测下限为0.016 ng·μL^-1;在Genesig q16系统中,该方法对冬虫夏草DNA模版的检测下限为15.527 ng·μL^-1。特异性鉴定研究表明,在Genesig q16和Bio-Rad CFX96系统上,该方法对冬虫夏草均具有良好的特异性,能与混伪品下垂虫草、古尼虫草、蛹虫草、蝉花、凉山虫草、新疆虫草明显区分。TaqMan探针实时荧光PCR方法可实现对冬虫夏草及其混伪品的准确鉴定,为药材市场的管理提供技术支撑,对名贵中药材的鉴别具有较好应用前景。 展开更多
关键词 冬虫夏草 TAQMAN探针 实时荧光PCR 分子鉴定
人造板表面微生物采集及真菌分子鉴定 预览
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作者 马星霞 张斌 +1 位作者 张景朋 蒋明亮 《中国人造板》 2019年第1期14-16,共3页
采取Petrifilm测试片法采集和培养微生物以及分子鉴定手段,快速鉴定人造板表面的微生物种类和数量,为人造板表面抗菌和防霉评价提供新方法。
关键词 表面微生物 霉菌 细菌 微生物采集 分子鉴定
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ITS2序列鉴定甘草混淆伪品的研究
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作者 白东东 李新圃 +3 位作者 杨峰 罗金印 张行 李宏胜 《中兽医医药杂志》 2019年第3期14-16,共3页
为了对中药材甘草及其混伪品进行分子鉴定,以区分正品甘草与混伪品。从兰州市不同商家收集9种甘草,提取DNA,扩增ITS2序列并进行双向测序,在GenBank数据库收集甘草混伪品苦豆子、苦参、黄芪和山豆根的序列,应用MEGA7.0进行序列变异分析,... 为了对中药材甘草及其混伪品进行分子鉴定,以区分正品甘草与混伪品。从兰州市不同商家收集9种甘草,提取DNA,扩增ITS2序列并进行双向测序,在GenBank数据库收集甘草混伪品苦豆子、苦参、黄芪和山豆根的序列,应用MEGA7.0进行序列变异分析,以Kimura 2-Parameter(K2P)模型计算遗传距离,并构建邻近(NJ)树。基于ITS2序列的序列变异、最近距离法和系统邻近树分析结果表明,该方法可将2015版《中华人民共和国药典》中规定的正品甘草与其混伪品进行区分。说明ITS2序列可有效区分5种甘草混伪品,为中兽医和中医临床应用提供保障依据。 展开更多
关键词 甘草 ITS2序列 分子鉴定 混伪品
疣状毛癣菌致母女共患体癣分析 预览
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作者 尚盼盼 周亚斌 +3 位作者 汪旸 陈伟 万喆 王爱平 《中国麻风皮肤病杂志》 2019年第4期225-228,共4页
母亲上肢出现皮损1年,女儿面部皮损4个月,皮损表现为大小不一的环形红斑,表面覆有鳞屑及少许痂皮,境界清楚,边缘稍隆起。患者家中养牛。两例皮损真菌镜检均可见菌丝,真菌培养均阳性,分离菌株经表型及分子鉴定,两株菌均为疣状毛癣菌,体... 母亲上肢出现皮损1年,女儿面部皮损4个月,皮损表现为大小不一的环形红斑,表面覆有鳞屑及少许痂皮,境界清楚,边缘稍隆起。患者家中养牛。两例皮损真菌镜检均可见菌丝,真菌培养均阳性,分离菌株经表型及分子鉴定,两株菌均为疣状毛癣菌,体外药敏试验显示对伊曲康唑及特比萘芬均敏感。2例患者经口服和外用抗真菌药物联合治疗获痊愈。 展开更多
关键词 疣状毛癣菌 体癣 分子鉴定 药敏试验
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互助藏羊梭菌病病原体的分离鉴定与分析 预览
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作者 雷有菊 王文勇 张学勇 《青海畜牧兽医杂志》 2019年第4期6-12,31共8页
青海省互助县某羊场藏系绵羊患病死亡,伴有腹泻、神经症状,为快速确诊发病原因,及时防控和治疗,采集病羊样品5份,通过镜检、细菌分离培养、分子生物学试验及致病性试验进行病原鉴定分析。结果证明此次病原菌为羊致病性D型魏氏梭菌,毒素... 青海省互助县某羊场藏系绵羊患病死亡,伴有腹泻、神经症状,为快速确诊发病原因,及时防控和治疗,采集病羊样品5份,通过镜检、细菌分离培养、分子生物学试验及致病性试验进行病原鉴定分析。结果证明此次病原菌为羊致病性D型魏氏梭菌,毒素基因分析显示该菌同时含有α和ε两种毒素基因,动物致病性试验结果表明该菌对昆明系小鼠具有较强的致病性,并从试验致死的小鼠中分离到与藏羊病原相一致的细菌。三种基因的遗传进化树显示,该菌具有较强的多样性。研究确定了本次藏羊致死的主要病原为D型魏氏梭菌,结果可为该羊场梭菌病的治疗和预防提供科学依据。 展开更多
关键词 藏羊 魏氏梭菌 腹泻 分离培养 分子鉴定
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互助藏羊肺炎病原绵羊肺炎支原体的PCR检测与分析 预览
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作者 王世贵 马成军 张学勇 《青海畜牧兽医杂志》 2019年第4期27-31,共5页
青海省互助某羊场藏系绵羊发生肺炎疾病,为了快速准确诊断藏羊肺炎发病的致病病原微生物,及时防控和治疗,采集病死绵羊肺样品,利用PCR分子生物学方法进行鉴定与生物信息学分析。经过分子鉴定,此羊场引发肺病的病原是绵羊肺炎支原体(Myco... 青海省互助某羊场藏系绵羊发生肺炎疾病,为了快速准确诊断藏羊肺炎发病的致病病原微生物,及时防控和治疗,采集病死绵羊肺样品,利用PCR分子生物学方法进行鉴定与生物信息学分析。经过分子鉴定,此羊场引发肺病的病原是绵羊肺炎支原体(Mycoplasma ovipneumoniae, MO);测序结果显示样品中鉴定的为同一株病原,鉴定的菌株的16S rRNA基因与参考序列EU265779的同源性达到99.86%。同时遗传进化树显示,鉴定的菌株与GenBank中的绵羊肺炎支原体聚成一大支,其关系最近,在进化角度证实此次鉴定的确实为绵羊肺炎支原体。结果表明,此羊场引发肺炎疾病的病原是绵羊肺炎支原体,提示要对羊群进行相关的病原学研究和流行病学调查,为针对性地对细菌性病原进行对症治疗提供参考。 展开更多
关键词 藏羊 肺炎 绵羊肺炎支原体 分子鉴定
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广东省番茄黄化曲叶病毒的分子鉴定及序列分析 预览
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作者 汤亚飞 佘小漫 +4 位作者 李正刚 于琳 蓝国兵 邓铭光 何自福 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期143-148,共6页
番茄黄化曲叶病毒病是世界番茄生产上一种毁灭性病害,番茄黄化曲叶病毒Tomato yellow leaf curl virus(TYLCV)是引起该病害的主要病原病毒之一。本文采用滚环扩增及基因克隆方法,获得了侵染广东佛山和肇庆番茄的TYLCV 4个分离物全基因组... 番茄黄化曲叶病毒病是世界番茄生产上一种毁灭性病害,番茄黄化曲叶病毒Tomato yellow leaf curl virus(TYLCV)是引起该病害的主要病原病毒之一。本文采用滚环扩增及基因克隆方法,获得了侵染广东佛山和肇庆番茄的TYLCV 4个分离物全基因组;它们均为2 781 nt,编码6个ORF,其中病毒链上编码AV1和AV2,互补链上编码AC1、AC2、AC3和AC4。同源性比较结果表明,4个广东分离物基因组序列两两间同源性为99%以上;与已报道的TYLCV各分离物同源性在90%以上,而与来自中国不同地区的TYLCV分离物的同源率均在98%以上。系统进化分析显示,广东分离物与来自中国不同地区的TYLCV分离物亲缘关系较近,并聚类在一个分支。因此,侵染引起广东佛山和肇庆番茄黄化曲叶病的病毒应来自国内其他地区。本研究是对TYLCV广东分离物分子特征的首次报道。 展开更多
关键词 番茄黄化曲叶病毒 分子鉴定 序列分析
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花楸烂皮病病原菌鉴定 预览
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作者 程德昊 贾含琪 +1 位作者 刘雪峰 董爱荣 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期83-87,共5页
为了鉴定花楸(Sorbus pohuashanensis(Hance)Hedl)烂皮病的病原,在东北林业大学校园采集到带病植物标本,进行了病原菌的分离和纯化;通过孢子悬浮液对花楸树健康枝条刺伤接种,完成了病害柯赫氏法则的验证。通过观察菌株菌落的宏观和微观... 为了鉴定花楸(Sorbus pohuashanensis(Hance)Hedl)烂皮病的病原,在东北林业大学校园采集到带病植物标本,进行了病原菌的分离和纯化;通过孢子悬浮液对花楸树健康枝条刺伤接种,完成了病害柯赫氏法则的验证。通过观察菌株菌落的宏观和微观形态,对比相关参考文献对病原菌进行了形态学鉴定;提取供试菌株DNA,进行rDNA-ITS序列的PCR扩增与测序,对比NCBI数据库对病菌进行分子鉴定。结果表明:孢子悬浮液接种在花楸枝条上发病的病症与自然条件下病症相同;与NCBI数据库比对,病原菌与普尔松白孔座壳菌(Leucostoma persoonii(Nitschke)Hhn.)在覆盖度为96%的范围内相似度为99%。因此,鉴定引起花楸烂皮病的病原菌为普尔松白孔座壳菌,其无性型为核果壳囊孢(Cytospora leucostoma(Speg.)Sacc.)。该病害为花楸上的国内新病害。 展开更多
关键词 花楸烂皮病 普尔松白孔座壳菌 核果壳囊孢 分子鉴定 新病害
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基于线粒体COI基因的印度新曲厉螨的分子鉴定 预览 被引量:1
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作者 邓洁 郭浩杰 +3 位作者 黄少康 林焱 黄伟峰 段辛乐 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2019年第2期380-386,共7页
本研究利用线粒体 COI 基因对印度新曲厉螨进行分子鉴定,以期为研究该螨的生物学习性及对蜜蜂的危害提供技术支持。分别从中华蜜蜂、意大利蜜蜂工蜂体上,以及桉树花序上采集试螨,扩增印度新曲厉螨的 COI 基因,并将获得的 COI 基因序列在... 本研究利用线粒体 COI 基因对印度新曲厉螨进行分子鉴定,以期为研究该螨的生物学习性及对蜜蜂的危害提供技术支持。分别从中华蜜蜂、意大利蜜蜂工蜂体上,以及桉树花序上采集试螨,扩增印度新曲厉螨的 COI 基因,并将获得的 COI 基因序列在Genbank中Blast对比;利用Genedoc软件分析基因序列的相似性;利用MEGA 7.0计算厉螨科不同种螨之间的遗传距离,构建 COI 基因的系统发育树。结果表明:采自中华蜜蜂、意大利蜜蜂及桉树花序上的印度新曲厉螨样本 COI 基因序列完全一致,均表现出明显的A/T碱基偏向性,与同属 Neocypholaelaps apicola 的 COI 基因序列的相似性为88%。基于 COI 基因的印度新曲厉螨的种内的遗传距离(0.00)显著小于与厉螨科6种螨的遗传距离(0.203~0.403)且不存在重叠区域。构建的 COI 基因的系统发育树显示,采自印度新曲厉螨样本 COI 与同属的 Neocypholaelaps apicola 聚同一进化枝,其它不同属螨则按照属的不同聚集在不同的进化枝。本研究所用的线粒体 COI 基因序列的差异可应用于印度新曲厉螨的分子鉴定。 展开更多
关键词 印度新曲厉螨 COI基因 分子鉴定
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