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老年患者多药耐药鲍氏不动杆菌分子流行病学和耐药性研究
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作者 周娇娇 朱惠莉 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1786-1790,共5页
目的 分析多药耐药鲍氏不动杆菌(MDRAB)的分子流行病学特征和耐药机制。方法 收集2011-2017年老年患者痰标本43株MDRAB。应用多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对MDRAB进行分子分型。PCR和测序方法检测MDRAB的耐药基因。结果 ... 目的 分析多药耐药鲍氏不动杆菌(MDRAB)的分子流行病学特征和耐药机制。方法 收集2011-2017年老年患者痰标本43株MDRAB。应用多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对MDRAB进行分子分型。PCR和测序方法检测MDRAB的耐药基因。结果 MLST将43株MDRAB分为ST208、ST191和ST195、STn1(1-3-G1-2-2-94-3)。PFGE将43株MDRAB分为四个克隆型。ST208、ST191、ST195、STn1组成了克隆复合体92(CC92)。痰标本MDRAB中携带blaOXA-23-like基因阳性率为95.3%,ISAba1-blaOXA-23基因81.4%,blaOXA-66 100%,aac(6’)-Ib基因51.2%,aph(3’)-Ia基因83.7%,aac(3)-Ia基因65.1%,所有MDRAB的gyrA基因83位丝氨酸均突变为亮氨酸。结论 ST208和ST191是医院痰标本MDRAB主要的ST分型,克隆复合体CC92为医院最主要的MDRAB流行克隆,blaOXA-23、blaOXA-66是鲍氏不动杆菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药的主要机制,AAC(6’)-Ib、APH(3’)-I磷酸转移酶、AAC(3)-II氨基糖苷乙酰转移酶的产生为多药耐药鲍氏不动杆菌对氨基糖苷类抗菌药物耐药的主要机制。喹诺酮耐药决定区域的'热点'突变为鲍氏不动杆菌介导喹诺酮类抗菌药物的关键机制。 展开更多
关键词 鲍氏不动杆菌 多位点序列分析 脉冲场凝胶电泳 分子流行病 克隆复合体92
耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌感染聚集性病例分子流行病学调查及控制
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作者 赵艳春 袁翠 +3 位作者 李双玲 孙立颖 胡美华 李六亿 《中国护理管理》 CSCD 北大核心 2019年第8期1142-1145,共4页
目的:对某ICU耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)感染聚集性病例进行调查与控制,为临床多重耐药菌感染防控提供参考。方法:对2018年2月1日至3月31日期间发生的4例CRKP感染聚集性病例进行分子流行病学调查,对环境微生物进行检测,查找环境中... 目的:对某ICU耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)感染聚集性病例进行调查与控制,为临床多重耐药菌感染防控提供参考。方法:对2018年2月1日至3月31日期间发生的4例CRKP感染聚集性病例进行分子流行病学调查,对环境微生物进行检测,查找环境中的CRKP;应用PCR(Rep-PCR)分型技术分析患者与环境分离菌株的同源性;采取综合控制措施,分析控制效果。结果:发生的4例CRKP感染中医院感染2例,千住院日医院感染率为4.07‰,高于2017年同期,虽差异无统计学意义(P=0.232),但CRKP医院感染率达历年最高值,存在聚集性发生趋势。患者A、B、C及患者B床档分离的CRKP为同一基因型,患者D为其他基因型。患者A为社区获得性感染,患者B和C为医院获得性感染,说明CRKP在ICU内发生了传播。采取综合控制措施后,未发生续发CRKP感染病例,与控制前相比差异有统计学意义(P=0.021)。结论:分子流行病学调查有助于查明感染源和感染高风险因素,深入现场的临床调查与观察有助于发现感染风险,措施的有效落实是预防感染聚集发生的关键。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌 医院感染 分子流行病 调查
镇江地区诺如病毒分子流行病学特点及基因型分析 预览 被引量:1
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作者 许金凤 徐虹 +3 位作者 宋寅生 薛渊 邵世和 申红星 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2017年第11期857-861,共5页
目的分析2015-2016年镇江地区诺如病毒(No V)的分子流行病学特点及基因型分布。方法收集镇江地区腹泻患者粪便标本,逆转录PCR(RT-PCR)检测No V衣壳蛋白基因的表达水平,并对PCR产物行基因测序验证;Mega软件构建系统进化树,并进行序... 目的分析2015-2016年镇江地区诺如病毒(No V)的分子流行病学特点及基因型分布。方法收集镇江地区腹泻患者粪便标本,逆转录PCR(RT-PCR)检测No V衣壳蛋白基因的表达水平,并对PCR产物行基因测序验证;Mega软件构建系统进化树,并进行序列进化和基因型分析。结果 No V总阳性率为5.30%(85/1 605),GⅠ组检出率为0.87%(14/1 605),GⅡ组检出率为4.55%(73/1 605),其中2份样本同时检出感染GⅠ/GⅡ。GⅡ组在10-20岁组中的阳性率最高(17.80%)。2015年No V的检出率以1月最高,11月、2月次之;2016年以12月最高,3月、4月次之。2015年No V的基因型以新GII.17型变异株为主(63.89%),2016年以GII.4 Sydney_2012株为主(35%)。结论镇江地区的No V以GII组为主,青少年患者阳性率高,主要流行季节为11月至次年4月,主要流行基因型为GII.17型变异株和GII.4 Sydney_2012株。 展开更多
关键词 诺如 分子流行病 基因型
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寨卡病毒的分子流行病学进展及流行风险预测 被引量:2
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作者 刘荣飞 肖琴 +1 位作者 郭中敏 陆家海 《热带医学杂志》 CAS 2017年第8期1117-1119,共3页
寨卡作为新发传染病在2015年引起了广泛重视,了解其分子结构、系统发生以及流行历史,有助于理解寨卡病毒(ZIKV)暴发的原因。寨卡病毒和登革病毒(DENV)在流行病学上有诸多的相似性,登革热疫情对预测寨卡病毒的流行风险具有重要的... 寨卡作为新发传染病在2015年引起了广泛重视,了解其分子结构、系统发生以及流行历史,有助于理解寨卡病毒(ZIKV)暴发的原因。寨卡病毒和登革病毒(DENV)在流行病学上有诸多的相似性,登革热疫情对预测寨卡病毒的流行风险具有重要的参考价值。因此,本文对寨卡病毒的分子流行病学研究进展和风险预测做一综述。 展开更多
关键词 寨卡 分子流行病 登革 风险预测
宁夏地区丙型肝炎基因型别研究 被引量:3
5
作者 吴忠兰 赵伟明 +3 位作者 曹敏 杨东智 陈慧 尹婷 《中国卫生检验杂志》 CAS 2016年第11期1625-1627,共3页
目的了解宁夏地区丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)的毒株亚型和病毒在人群中的分布情况。方法采用ELISA方法对艾滋病哨点监测人群进行HCV抗体检测,抗体阳性样本进行实时荧光定量PCR检测,HCV RNA阳性样本采用反向点杂交法进行基... 目的了解宁夏地区丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)的毒株亚型和病毒在人群中的分布情况。方法采用ELISA方法对艾滋病哨点监测人群进行HCV抗体检测,抗体阳性样本进行实时荧光定量PCR检测,HCV RNA阳性样本采用反向点杂交法进行基因型别检测。结果检测各类人群13 200人次,HCV抗体阳性率为2.9%,HCV RNA阳性率为1.2%(159/13 200)。113例基因亚型检测,97例有基因分型结果,亚型检出率为85.8%。其中1b型24例(24.7%)、2a型9例(9.3%)、3a型29例(29.9%)、3b型6例(6.2%)、6a型18例(18.6%)、1b/2a混合型11例(11.3%),主要分布在吸毒和性乱人群中。采用点杂交法检测HCV分型与HCV RNA载量结果差异无统计学意义(P〉0.05)。结论推广在医院检测HCV基因型别及亚型,控制吸毒人群及桥梁人群仍然是宁夏HCV防治工作的重点。 展开更多
关键词 丙型肝炎 分子流行病 基因型 基因亚型
深圳市528例HIV-1感染者的分子流行病学特征 被引量:1
6
作者 孔东锋 王晓辉 秦彦珉 《中国热带医学》 CAS 2015年第5期562-564,共3页
目的研究深圳市HIV-1病毒亚型、传播途径的分布特征,为艾滋病的整体防控工作提供帮助。方法采集528例HIV-1病毒感染阳性病例的流行病学信息及标本,运用逆转录巢式聚合酶链反应方法对病毒基因进行扩增、测序,确定基因亚型,并进行统计分... 目的研究深圳市HIV-1病毒亚型、传播途径的分布特征,为艾滋病的整体防控工作提供帮助。方法采集528例HIV-1病毒感染阳性病例的流行病学信息及标本,运用逆转录巢式聚合酶链反应方法对病毒基因进行扩增、测序,确定基因亚型,并进行统计分析。结果 528例HIV-1感染者中86.6%为性传播途径感染。528份样本中共发现CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、CRF02_AG等4种毒株及B、B’、C、A1等4种亚型,其中以CRF01_AE、CRF07_BC、B为主要流行毒株或亚型,其构成情况为54.5%(288/528)、25.0%(132/528)、9.3%(49/528)。CRF01_AE在男男同性恋感染者、异性性途径感染者、吸毒感染者的构成比分别为51.2%、59.3%、66.0%。结论深圳市HIV-1感染者以性传播途径为主。病毒型别呈现多样性特征,性传播、吸毒感染人群中以CRF01_AE为主要流行毒株,血液途径感染人群以B亚型为主要流行毒株。 展开更多
关键词 人免疫缺陷毒-1型 分子流行病 艾滋
重症急性呼吸道感染儿童中人腺病毒感染的型别分布及其流行病学特征 被引量:8
7
作者 李亚敏 周为民 +4 位作者 赵彦杰 张晨 王延群 谢正德 谭文杰 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期571-573,共3页
腺病毒是Rowe等于1953年在人的腺样组织中被发现,并因此而得名。人腺病毒感染在全球范围广泛流行,可引起多种疾病。其分型检测主要方法是PCR结合测序。国内外关于婴幼儿急性呼吸道感染中腺病毒的检测及临床特征的分析已有不少报道,... 腺病毒是Rowe等于1953年在人的腺样组织中被发现,并因此而得名。人腺病毒感染在全球范围广泛流行,可引起多种疾病。其分型检测主要方法是PCR结合测序。国内外关于婴幼儿急性呼吸道感染中腺病毒的检测及临床特征的分析已有不少报道,但多数研究不进行具体分型分析,且对于近年来我国严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection, SARI)住院儿童中人腺病毒的分型分布及相关流行病学特点的研究较少。为此,本研究对来自北京某儿童医院内SARI住院儿童鼻咽抽吸物进行人腺病毒的分型检测与分析。 展开更多
关键词 呼吸道感染 分子流行病 分型检测
ICU多重耐药铜绿假单胞菌外排泵基因表达分子流行趋势及其危险因素 被引量:1
8
作者 苏美玲 《中国卫生检验杂志》 2015年第5期702-704,共3页
目的 探讨ICU患者中多重耐药铜绿假单胞菌(MDRPA)多药物外排泵基因MexAB-OprM、MexCD-OprJ、MexEF-Opr N表达的分子流行趋势及其危险因素。方法 收集2012年4月-2014年2月本院ICU病房收治的56例确诊感染MDRPA患者的痰、血或创面分泌物... 目的 探讨ICU患者中多重耐药铜绿假单胞菌(MDRPA)多药物外排泵基因MexAB-OprM、MexCD-OprJ、MexEF-Opr N表达的分子流行趋势及其危险因素。方法 收集2012年4月-2014年2月本院ICU病房收治的56例确诊感染MDRPA患者的痰、血或创面分泌物标本,分离培养MDRPA菌共56株,应用聚合酶链式反应(PCR)及实时荧光定量PCR(real-time PCR)等方法分析上述标本中3种外排泵基因表达的情况。结果 56株MDRPA菌中,MexABOprM、MexCD-OprJ及Mex EF-Opr N阳性菌株数分别为55(98.2%)、10(17.9%)和23(41.1%);MexAB-OprM、MexCD-OprJ及Mex EF-Opr N阳性菌株中高表达者分别为23例(23/55)、4例(4/10)和14例(14/23);Logistic回归分析显示,碳青酶烯类抗生素应用、留置深静脉导管及糖皮质激素应用超过1周是MexAB-OprM、MexCD-OprJ发及Mex EFOpr N高表达的独立危险因素。结论 多重耐药铜绿假单胞菌多药物外排泵基因MexAB-OprM阳性率较高,其高表达与碳青酶烯类抗生素应用、留置深静脉导管及激素应用超过1周有关。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 多重耐药 外排泵基因 分子流行病 逻辑回归
快速导流杂交分型技术检测宁夏地区人乳头瘤病毒(HPV)感染基因型分布特点
9
作者 段秀方 芦晓红 张喜龙 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2014年第16期2388-2390,共3页
目的分析宁夏地区人乳头瘤病毒(HPV)21种基因型在宫颈疾病中的感染状况及其分布特点。方法采用核酸分子快速导流杂交分型技术(Flow—through Hybridization)对2010年12月-2013年9月宁夏第五人民医院就诊的943例妇女进行HPV分型检测... 目的分析宁夏地区人乳头瘤病毒(HPV)21种基因型在宫颈疾病中的感染状况及其分布特点。方法采用核酸分子快速导流杂交分型技术(Flow—through Hybridization)对2010年12月-2013年9月宁夏第五人民医院就诊的943例妇女进行HPV分型检测,分析该地区HPV亚型的分子流行病趋势及分布特点。结果934例筛查人群总HPV感染率为34.4%(324/943),高危型为29.9%(282/943),低危型为4.5%(42/943),高危型的感染率显著高于低危型的感染率(r=214.7,P〈0.05)。单一型感染267例,感染率为28.3%,混合感染57例,感染率为6.0%,单一感染率显著高于混合感染率(z2=178.6,P〈0.05)。在被检测的21个HPV亚型中检出20种,HPV16感染率最高,为8.0%,其次为HPV58,感染率为4.2%,HPV35感染率最低为0.2%,HPV43型未检出。HPV感染高峰年龄在20岁-50岁,50岁以后感染率开始下降。结论宁夏地区宫颈病变中HPV感染常见基因型为16、58、52、31、6、33和53型,年龄分布主要集中于(20.50)周岁。 展开更多
关键词 人乳头瘤 基因亚型 分子流行病 宁夏地区
贵州省铜仁地区猪链球菌2型的分子流行病学分析
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作者 朱锋钊 杜秀园 +1 位作者 高俊波 李秀富 《北京农业:下旬刊》 2014年第A09期123-124,共2页
目的:调查分析贵州省铜仁地区的猪群中猪链球菌2型的带菌情况和毒力因子的分布情况。方法:研究采用从贵州省铜仁地区各屠宰场收集的150份猪扁桃体样本,对分离菌株进行培养,通过生化鉴定确定当地的猪群带菌情况,并使用PCR方法对猪链球菌... 目的:调查分析贵州省铜仁地区的猪群中猪链球菌2型的带菌情况和毒力因子的分布情况。方法:研究采用从贵州省铜仁地区各屠宰场收集的150份猪扁桃体样本,对分离菌株进行培养,通过生化鉴定确定当地的猪群带菌情况,并使用PCR方法对猪链球菌2型的主要致病毒力因子进行检测。结果:检测显示,150例样本中2型猪链球菌带菌率达到41.3%,其中屠宰场3的检出率较高,mrp、epf片段与阳性对照相关基因的同源性达到100%,屠宰场3的所有样本mrp、epf毒力因子均表现为阳性。结论:该地区猪群猪链球菌2型携带率较高,mrp、epf毒性因子阳性表现型与疫病的流行可能存在一定的关联性。 展开更多
关键词 多重PCR 猪链球菌 分子流行病
中国流行的狂犬病病毒时空进化分析
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作者 孟胜利 徐葛林 +3 位作者 雷永良 吴杰 严家新 杨晓明 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期231-237,共7页
本研究对1931~2009年间分离于中国20个省区的167株狂犬病病毒的N基因序列进行进化分析,以探讨中国狂犬病病毒株的基因分型和分组情况、时间和空间的动态进化。结果显示:从中国分离的毒株都属于基因1型狂犬病病毒,可以分为2个进化分支共... 本研究对1931~2009年间分离于中国20个省区的167株狂犬病病毒的N基因序列进行进化分析,以探讨中国狂犬病病毒株的基因分型和分组情况、时间和空间的动态进化。结果显示:从中国分离的毒株都属于基因1型狂犬病病毒,可以分为2个进化分支共计8个组,分支Ⅰ包括1~4组,分支Ⅱ包括5~8组;选择压力分析表明中国狂犬病病毒处于较强的净化选择约束下,狂犬病病毒N基因中的核苷酸突变主要是同义突变;运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法估计中国狂犬病病毒N基因核苷酸的平均碱基替代率为4×10-4替代/位点/年,共同祖先出现的时间不超过2000年前;迁移分析表明中国狂犬病病毒株存在跨地域传播。 展开更多
关键词 狂犬 分子流行病 N基因 地理 中国 生物信息学
中国狂犬病病毒遗传多样性分析 被引量:4
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作者 孟胜利 徐葛林 +9 位作者 程满荣 舒祥 雷勇良 朱风才 周敦金 王定明 明贺田 吴杰 严家新 杨晓明 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2010年第5期449-454,共6页
目的分析中国狂犬病病毒(RV)的遗传多样性,为我国狂犬病的预防提供理论依据。方法采用RT-PCR技术扩增26株RVN基因,并进行测序,与GenBank登录的序列进行比对,构建进化树,分析RV的基因分型和分组情况以及时间和空间的动态进化。结果中... 目的分析中国狂犬病病毒(RV)的遗传多样性,为我国狂犬病的预防提供理论依据。方法采用RT-PCR技术扩增26株RVN基因,并进行测序,与GenBank登录的序列进行比对,构建进化树,分析RV的基因分型和分组情况以及时间和空间的动态进化。结果中国RV分为2个大的进化分支(8组),分支Ⅰ包括1~4组,分支Ⅱ包括5~8组,组内核苷酸同源性≥93.2%,氨基酸同源性≥94.3%;组间核苷酸差异性≥8.0%,氨基酸差异性≥1.7%;运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法,估计中国RVN基因核苷酸的平均碱基替代率为1.4089×10-4取代/位点·年,共同祖先出现在公元968年。结论中国狂犬病病毒株均属于基因1型狂犬病病毒,存在跨地域、跨宿主传播;我国分支Ⅰ狂犬病病毒株与泰国、越南、菲律宾、印度尼西亚、马来西亚等东南亚国家分离的狂犬病病毒株起源相同;分支Ⅱ的毒株在全球分布。 展开更多
关键词 狂犬 遗传多样性 分子流行病 N基因
中国12株狂犬病街毒株G基因序列测定与分析 预览 被引量:7
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作者 孟胜利 徐葛林 +3 位作者 吴杰 王定明 严家新 杨晓明 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期 497-501,共5页
目的了解中国狂犬病毒的流行情况以及街毒株与中国人用、兽用狂犬病疫苗株在G基因核苷酸和氨基酸水平的差异,为有效控制狂犬病疫情提供初步科学依据。方法对12株街毒株G基因进行了全基因测序,与其它36株中国狂犬病街毒株,以及中国的... 目的了解中国狂犬病毒的流行情况以及街毒株与中国人用、兽用狂犬病疫苗株在G基因核苷酸和氨基酸水平的差异,为有效控制狂犬病疫情提供初步科学依据。方法对12株街毒株G基因进行了全基因测序,与其它36株中国狂犬病街毒株,以及中国的疫苗株和其它国家毒株的G基因序列进行了综合分析。结果序列分析表明来源于中国的50株狂犬病毒均为基因I型狂犬病毒;其中具有代表性的6株病毒与我国现在使用的各种疫苗株在G基因的核苷酸和氨基酸水平上均存在不同程度的差异,与我国人用疫苗株CTN同源性较高;进化分析表明,我国主要流行狂犬病毒与泰国、印度尼西亚、马来西亚等东南亚狂大病毒株处于同一分支。中国毒株之间G基因核苷酸同源性分别≥82.3%;氨基酸同源性分别≥92.1%;中国街毒株与疫苗株相比较核苷酸的同源性为79.3%~94.2%,氨基酸的同源性为87.8%~97.9%。结论我国的狂犬病毒为基因I型狂犬病毒,可以明确分为6个进化群。无论在核苷酸还是氨基酸水平上,中国多数街毒株与疫苗株CTN之间的同源性要高于与其它疫苗株。 展开更多
关键词 狂犬 分子流行病 G基因 测序分析 中国
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昆明地区吸毒人群和异性性传播HIV-1的分子流行病学 预览 被引量:4
14
作者 李晓杰 夏雪山 +1 位作者 武部豊 草川茂 《中国皮肤性病学杂志》 CAS 北大核心 2009年第5期294-295,共2页
目的探讨昆明地区吸毒人群和异性性传播感染者HIV-1的分子流行病学特点。方法收集1994~2002年26例昆明地区吸毒人群和异性性传播HIV-1阳性者的血浆,采用BigDye链终止反应试剂盒测定2.6-kb gag-RT区的核苷酸序列,确定HIV-1的基因型... 目的探讨昆明地区吸毒人群和异性性传播感染者HIV-1的分子流行病学特点。方法收集1994~2002年26例昆明地区吸毒人群和异性性传播HIV-1阳性者的血浆,采用BigDye链终止反应试剂盒测定2.6-kb gag-RT区的核苷酸序列,确定HIV-1的基因型分布。结果CRF07_BC和CRF08_BC是吸毒人群中HIV-1的主要基因型;1例吸毒者感染了亚型B’。同样,大多数异性性传播HIV-1感染者的基因型也以CRF07_BC,CRF08_BC和亚型B为主。结论昆明地区异性性传播HIV-1感染者中流行的病毒基因型来自当地吸毒人群。 展开更多
关键词 HIV-1 分子流行病 吸毒人群 异性性传播
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新疆猪瘟病毒分子流行病的研究 预览
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作者 陈创夫 余兴龙 +5 位作者 乔军 孟庆龄 田晶华 王金富 柳建新 张高轩 《石河子大学学报:自然科学版》 CAS 2004年第1期 56-59,共4页
采用RT-PCR方法从新疆临床发病猪场采集的病料中扩增了CSFV流行株E2基因的主要抗原位点编码区,测定了15株CSFV的核苷酸序列.应用DNAstar计算机软件对6个地区6个代表株CSFV的核苷酸序列和推导的氨基酸序列进行了比较分析,结果表明:新疆6... 采用RT-PCR方法从新疆临床发病猪场采集的病料中扩增了CSFV流行株E2基因的主要抗原位点编码区,测定了15株CSFV的核苷酸序列.应用DNAstar计算机软件对6个地区6个代表株CSFV的核苷酸序列和推导的氨基酸序列进行了比较分析,结果表明:新疆6株CSFV流行株与猪瘟兔化弱毒株(C株)核苷酸序列的同源性为80.9%~82.8%,氨基酸的同源性为86.2%~88.3%,说明新疆CSFV流行株E2基因发生了部分变异,与疫苗株相比抗原性产生一定的差异. 展开更多
关键词 新疆 猪瘟 分子流行病 抗原性 疫苗株
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西安和林州市食管癌比较分子流行病学研究 预览 被引量:5
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作者 李良寿 杨文献 《解放军预防医学杂志》 CAS 北大核心 1999年第4期 255-259,共5页
目的:通过西安市和林州市食管癌p53基因高表达率、危险因素及其第五外显子突变昨突变模式的比较研究,初步探讨两地食管癌分子病因的异同。方法:分别在西安市和林州市收集食管癌病例137例,67例及相应对照,调查其相关既往史... 目的:通过西安市和林州市食管癌p53基因高表达率、危险因素及其第五外显子突变昨突变模式的比较研究,初步探讨两地食管癌分子病因的异同。方法:分别在西安市和林州市收集食管癌病例137例,67例及相应对照,调查其相关既往史,对癌组织以免疫组化和PCR直接测序方法检测P53蛋白和p53基因第五外显子突变情况;危险因素分析以单因素分析和多因素Logistic回归模型进行。结果:西安市食管癌发病及P53高表达 展开更多
关键词 食管肿瘤 分子流行病 P53蛋白 比较性研究
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诺如病毒重组株GII.P16-GII.2在广州地区引起暴发的分子流行病学调查
17
作者 苏文哲 耿进妹 +7 位作者 赖赛麟 刘静雯 汪慧 陈纯 王大虎 狄飚 张周斌 谢华萍 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2019年第4期362-368,共7页
目的揭示2016年7月至2017年6月广州市诺如病毒暴发流行的源头及其规律。方法通过哨点医院和各级疾控中心收集病例信息和粪便标本,用荧光定量PCR方法对标本中的诺如病毒核酸进行检测,并对阳性标本核酸进行扩增和测序,通过BLAST比对寻找... 目的揭示2016年7月至2017年6月广州市诺如病毒暴发流行的源头及其规律。方法通过哨点医院和各级疾控中心收集病例信息和粪便标本,用荧光定量PCR方法对标本中的诺如病毒核酸进行检测,并对阳性标本核酸进行扩增和测序,通过BLAST比对寻找同源性最接近的参考序列并构建系统发生树。结果通过广州市感染性腹泻监测网络共收集标本854人份,患者男女性别比为1∶0.67,78.33%的病例为7岁以下学龄前儿童,共检出诺如病毒GII组核酸阳性220份(25.76%,合并GI组核酸阳性5份);2016年下半年流行的主要型别是GII.Pe-GII.4.Sydney_2012型(94.64%),2017年上半年流行的主要型别是GII.P16-GII.2型(67.65%)。2016年9月份开始广州市诺如病毒感染性腹泻疫情的报告数逐渐增多,至2017年2~3月份迎来发病高峰,4月份疫情报告数开始下降,5~6月份之后腹泻疫情报告数下降至2~3起/月。2016年9~11月份的暴发疫情均由GII.Pe-GII.4.Sydney_2012型引起;2016年12月至2017年4月的暴发疫情由GII.P16-GII.2型引起;部分疫点的厨工和保育员标本中有检出诺如病毒GII组阳性,且与病例标本的型别一致。结论2016至2017年冬春季节在广州地区暴发的诺如病毒疫情是诺如病毒重组株GII.P16-GII.2型在本地的首次暴发,各疫点间病毒基因序列同源性较高,提示可能是同一来源;部分疫点的厨工和保育员可能在部分疫情的扩散中扮演了重要的角色。 展开更多
关键词 诺如 感染性腹泻 分子分型 分子流行病
HIV分子流行病学研究和实践进展 预览
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作者 钟平 《新发传染病电子杂志》 2019年第3期137-144,共8页
本文系统地综述了近年来国内外艾滋病分子流行病学研究和实践方面的进展,主要从三个方面阐述了全球和中国HIV-1基因亚型和新型重组型病毒演变的现状、特点和趋势,以及正在发展的可助力于精准干预艾滋病流行的分子传播网络的最新研究进展... 本文系统地综述了近年来国内外艾滋病分子流行病学研究和实践方面的进展,主要从三个方面阐述了全球和中国HIV-1基因亚型和新型重组型病毒演变的现状、特点和趋势,以及正在发展的可助力于精准干预艾滋病流行的分子传播网络的最新研究进展,包括全球HIV-1亚型多样性和分布地域性、我国HIV-1亚型此消彼长、新型重组病毒频繁发生和HIV分子传播网络研究进入实践阶段。本文明确指出了HIV-1亚型和重组病毒多样性是阻碍遏制HIV流行的关键因素,并强调了基于分子簇的精准干预在助力控制艾滋病流行中的重要意义。本文将为从事艾滋病防治事业的公共卫生专业人员、医生以及实验室工作人员提供较新的信息,供读者进一步学习和参考。 展开更多
关键词 HIV/AIDS 分子流行病 基因亚型 重组 分子传播网络
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2017-2018年天津地区腹泻住院患儿腺病毒感染的分子流行病学及基因型分析
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作者 李璇 范超萌 +4 位作者 林书祥 王维 王萍 方玉莲 崔华雷 《国际生物医学工程杂志》 CAS 2019年第2期109-114,共6页
目的了解天津地区腹泻患儿腺病毒的感染状况、流行病学特点和基因遗传进化特征。方法收集2017年7月至2018年7月天津市儿童医院腹泻住院患儿的粪便标本1609例,提取腺病毒核酸,进行六邻体hexon基因片段的扩增。对腺病毒阳性标本进行核酸... 目的了解天津地区腹泻患儿腺病毒的感染状况、流行病学特点和基因遗传进化特征。方法收集2017年7月至2018年7月天津市儿童医院腹泻住院患儿的粪便标本1609例,提取腺病毒核酸,进行六邻体hexon基因片段的扩增。对腺病毒阳性标本进行核酸序列测定,并与GenBank中的已知序列进行序列比对和系统进化树分析。同时采用金标法检测粪便标本中的轮状病毒,乳胶凝集法检测弯曲杆菌,PCR和实时荧光定量PCR检测博卡病毒、诺如病毒和艰难梭菌。结果1609例标本中共检出腺病毒69例,阳性率为4.3%。其中82.6%的腺病毒阳性腹泻患儿年龄在7~48月龄;不同季节腺病毒阳性率差异具有统计学意义(χ^2=11.467,P=0.009),夏秋两季为腺病毒阳性率高峰;腺病毒混合感染率为26.1%(18/69),与诺如病毒或轮状病毒混合感染各7例,艰难梭菌混合感染4例。随机选取39份腺病毒阳性标本PCR产物进行基因序列检测,共检测到7种腺病毒基因型,以肠道腺病毒的腺病毒41型为主(46.1%,18/39),其次为非肠道腺病毒的腺病毒31、3和7型,而1、5和6型较为少见。结论天津地区腹泻患儿的腺病毒基因型多样,各个季节散在流行,夏秋两季高发,以婴幼儿期感染常见。 展开更多
关键词 腹泻 毒感染 分子流行病 基因分型 婴幼儿
2017年江西部分地区PEDV分子流行病学调查 预览
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作者 蒋新华 周荷田 +4 位作者 罗锋 杨丹凤 张志庆 陈松昌 邓舜洲 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第5期1474-1482,共9页
为了解江西地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行和变异情况,本研究利用RT-PCR方法对2017年采自江西省部分地区规模化猪场182份腹泻仔猪小肠组织和粪便样品进行检测,并设计了2对引物对37份阳性病料的S基因进行扩增、克隆及序列测定,以及与G... 为了解江西地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行和变异情况,本研究利用RT-PCR方法对2017年采自江西省部分地区规模化猪场182份腹泻仔猪小肠组织和粪便样品进行检测,并设计了2对引物对37份阳性病料的S基因进行扩增、克隆及序列测定,以及与GenBank中登录的22株PEDVS基因参考序列进行遗传进化分析。结果显示,37株PEDV江西流行株的S基因序列长为4158或4161bp,编码1385或1386个氨基酸,全部为Group1型,与美国流行毒株较为接近,而与欧洲毒株(Br1/87)及疫苗株(CV777)亲缘关系较远;37株PEDV中有36株为G1-1亚群,1株为G1-2亚群;37株PEDV江西毒株间的S基因核苷酸序列同源性为96.9%~100.0%,氨基酸序列同源性为96.1%~100.0%,与22株参考毒株的核苷酸、氨基酸序列同源性分别为92.7%~100.0%和91.5%~100.0%;相较于CV777疫苗株,PEDV江西流行毒株的S基因存在碱基缺失、插入和位点突变现象。本研究从分子流行病学角度证实了2017年江西部分地区PEDV的流行与变异情况,为指导江西省PEDV的科学防控提供了参考依据。 展开更多
关键词 流行性腹泻毒(PEDV) 分子流行病 S基因 遗传变异
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