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江苏省新型布尼亚病毒分离株全长S片段基因特征分析 预览
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作者 董梅 姚学君 马永法 《预防医学》 2019年第1期65-67,共3页
目的分析江苏省新型布尼亚病毒(SFTSV)分离株全长S片段基因的特征,为SFTSV监测和防控提供依据。方法通过GenBank获取江苏省上传的SFTSV毒株全长S片段基因序列信息,通过构建系统进化树鉴定基因型,分析各毒株间核苷酸和氨基酸序列的同源... 目的分析江苏省新型布尼亚病毒(SFTSV)分离株全长S片段基因的特征,为SFTSV监测和防控提供依据。方法通过GenBank获取江苏省上传的SFTSV毒株全长S片段基因序列信息,通过构建系统进化树鉴定基因型,分析各毒株间核苷酸和氨基酸序列的同源性。结果获取江苏省上传的35株SFTSV毒株基因信息,毒株分离年份为2010—2014年,主要为人源毒株,有28株,占80.00%。基因亚型主要为C4和C2,分别有16和14株,分别占45.71%和40.00%。35株SFTSV毒株全长S片段基因核苷酸序列同源性百分比为94.38%~100.00%,氨基酸序列同源性百分比为89.42%~100.00%;35株毒株与各亚型参考毒株间核苷酸序列同源性百分比为94.11%~100.00%,氨基酸序列同源性百分比为89.18%~100.00%;人源毒株与宿主动物分离株间核苷酸和氨基酸同源性为94.74%~99.91%和91.42%~99.80%。结论江苏省SFTSV分离株序列间亲缘性较近,其核苷酸和氨基酸高度同源。 展开更多
关键词 新型布尼亚 全长S片段基因 分子流行病学 同源性
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利用MALDI-TOF MS特异质量峰对耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌同源性的快速分型 预览
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作者 余佳佳 刘婧娴 +1 位作者 李媛睿 刘瑛 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期206-212,共7页
目的利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)筛选耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的特异质量峰,并根据特异质量峰对CRKP进行快速同源性分析。方法选取某院微生物实验室已进行多位点序列分型(MLST)的CRKP76株,52株用于方法... 目的利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)筛选耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的特异质量峰,并根据特异质量峰对CRKP进行快速同源性分析。方法选取某院微生物实验室已进行多位点序列分型(MLST)的CRKP76株,52株用于方法的建立,24株用于方法的验证。设置5个不同的特异峰挑选标准,按照不同的标准筛选各ST型特异质量峰,依据筛选的特异质量峰对CRKP进行分型,将与MLST结果符合率最高的标准确定为最佳标准。依据最佳标准筛选出的特异峰对24株CRKP进行分型,验证特异峰质量分型方法的准确性,并与质谱仪软件中的主成分分析(PCA)和核心图谱(MSP)聚类分析进行比较。结果按照标准2[(1)信噪比(S/N)≥4,(2)S/N比值≥1.5,(3)变异系数(CV)≤40%],52株CRKP中共筛选出45个特异质量峰,利用特异质量峰对29株CRKP进行分型,与MLST符合率最高,达82.8%,确定为最佳标准。按照此标准筛选出的特异质量峰对另外24株CRKP进行分型,与MLST符合率达83.3%。而PCA聚类分析与MLST的符合率仅为66.7%,MSP聚类分析与MLST一致性较差,没有明显符合ST型的分组趋势。结论利用MALDI-TOFMS筛选出不同ST型别CRKP的特异质量峰,可用于CRKP的快速同源性分析,为暴发流行的监测和医院感染的控制提供依据。 展开更多
关键词 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌 特异质量峰 多位点序列分型 分子流行病学
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2017年南京市部分沙门菌感染特征及菌株脉冲场电泳鉴定 预览
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作者 葛藤 程婷婷 +4 位作者 张韶华 江晓 叶艳华 史小超 张洪英 《江苏预防医学》 CAS 2019年第1期19-22,86共5页
目的 了解2017年南京市沙门菌感染及分子流行病学特征。方法2017年4—10月收集南京市各哨点医院送检疑似细菌性感染的分离菌株,以常规方法鉴定,挑取单克隆菌落,进行脉冲场电泳分析,采用PulseNetChina系统聚类分析软件进行图谱分析;并结... 目的 了解2017年南京市沙门菌感染及分子流行病学特征。方法2017年4—10月收集南京市各哨点医院送检疑似细菌性感染的分离菌株,以常规方法鉴定,挑取单克隆菌落,进行脉冲场电泳分析,采用PulseNetChina系统聚类分析软件进行图谱分析;并结合临床指标进行描述性分析。结果分离、鉴定84株沙门菌,共计32种血清型,主要为鼠伤寒沙门菌(23株,占27.38%)。94.0%菌株分离自粪便标本,病例年龄1个月~95岁,主要为≤1岁(29.76%)、≥60岁组(17.86%);7月为感染高峰(占25.00%);临床诊断主要为感染性腹泻/急性胃肠炎(占72.62%)。不同年龄感染谱不同:鼠伤寒沙门菌感染者多为≤10岁组(95.65%),肠炎沙门菌感染者多为50~60岁组(62.50%),乙型副伤寒沙门菌感染以及斯坦利沙门菌感染者均≤1组岁,都柏林沙门菌感染者均为40~50岁组。经XbaⅠ酶切、电泳片段为30~700kD,PFGE指纹图谱带型相似度为0.35%~100.00%,同血清型相同菌株的PFGE指纹图谱带型均不同,鼠伤寒沙门菌S1相似群相似度最高为92.59%,其余种属相似群相似度均<80%。结论南京市2017年沙门菌感染多以鼠伤寒沙门菌为主,婴幼儿和老年人为高危人群,夏季为感染高峰。沙门菌血清型与PFGE指纹图谱未发现直接关联,应进一步加强监测及PFGE数据库建设。 展开更多
关键词 沙门菌 鼠伤寒沙门菌 脉冲场电泳 分子流行病学
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胃癌分子流行病学研究进展
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作者 黄莎 戴瑨 +3 位作者 高娟娟 游伟程 潘凯枫 李文庆 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期16-21,共6页
胃癌是发病率和死亡率较高的恶性肿瘤。近年来,随着分子生物学技术的发展和各种新兴组学检测技术的涌现,胃癌分子流行病学工作者广泛探讨人群危险因素暴露、癌前病变、胃癌形成等过程中的相关遗传和宿主因素以及环境-遗传交互作用,探索... 胃癌是发病率和死亡率较高的恶性肿瘤。近年来,随着分子生物学技术的发展和各种新兴组学检测技术的涌现,胃癌分子流行病学工作者广泛探讨人群危险因素暴露、癌前病变、胃癌形成等过程中的相关遗传和宿主因素以及环境-遗传交互作用,探索相关的生物学标志物,为胃癌的预防和控制提供了重要证据。本文综述了近年来胃癌分子流行病学最新研究进展,分别阐述基于候选策略下的血清和血浆标志物研究、全基因组关联研究、全外显子组测序研究、基于组织芯片技术的研究以及代谢组学和微生物组学等方面的现有研究证据,为未来胃癌分子流行病学研究工作提供借鉴和参考,促进胃癌的病因学研究和精准防控。 展开更多
关键词 胃癌 生物标志物 分子流行病学
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中国不同地区群体遗传结构差异及调整策略研究
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作者 朱猛 吕筠 +9 位作者 余灿清 靳光付 郭彧 卞铮 Robin Walters Iona Millwood 陈铮鸣 沈洪兵 胡志斌 李立明 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期20-25,共6页
目的描述中国不同地区群体遗传结构特征,探索并评价不同分析方案控制队列样本群体遗传结构混杂因素的效果。方法通过中国慢性病前瞻性研究(CKB)队列10个地区4500例样本的全基因组关联研究数据,通过主成分分析提取样本第一、二主成分,绘... 目的描述中国不同地区群体遗传结构特征,探索并评价不同分析方案控制队列样本群体遗传结构混杂因素的效果。方法通过中国慢性病前瞻性研究(CKB)队列10个地区4500例样本的全基因组关联研究数据,通过主成分分析提取样本第一、二主成分,绘制主成分二维图,并与样本地区来源相比较,分析我国不同地区样本的遗传结构特征。以CKB队列数据为基础,生成存在遗传结构差异、亲缘关系等队列样本特征的模拟数据集,探索并评价不同分析策略对膨胀因子(λ)的控制效果。结果我国不同地区人群存在显著的群体遗传结构差异,人群遗传结构主成分分布与项目地区的地理分布基本一致,第一主成分对应不同地区的纬度,第二主成分对应不同地区的经度。生成的模拟数据集,直接进行关联分析假阳性率较高(λ=1.16),即使调整遗传结构主成分或根据地区进行亚组分析仍无法有效控制λ(λ>1.05);使用混合线性模型引入亲属关系矩阵作为随机效应量后,无论是否进一步调整遗传结构主成分,λ均得到有效控制(λ=0.99).结论我国不同地区人群遗传结构存在较大差异,在分子流行病学研究中需要谨慎处理群体遗传结构造成的研究偏倚;针对大队列数据遗传结构复杂、亲缘关系广泛等特征,需要使用混合线性模型进行关联分析。 展开更多
关键词 分子流行病学 群体遗传结构 地区差异 混合线性模型
学校感染性腹泻疫情中诺如病毒的分子流行病学分析
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作者 陈波 翁正军 +3 位作者 陈莫娇 陈步青 陈文先 陈劲华 《中国卫生检验杂志》 CAS 2019年第2期174-175,182共3页
目的研究学校感染性腹泻疫情中诺如病毒的分子流行病学特征。方法对2017年义乌地区的学校感染性腹泻疫情中的粪便标本进行诺如病毒核酸检测,选取部分阳性标本对衣壳蛋白区基因片段进行扩增和测序,通过序列比对和进化分析确定诺如病毒的... 目的研究学校感染性腹泻疫情中诺如病毒的分子流行病学特征。方法对2017年义乌地区的学校感染性腹泻疫情中的粪便标本进行诺如病毒核酸检测,选取部分阳性标本对衣壳蛋白区基因片段进行扩增和测序,通过序列比对和进化分析确定诺如病毒的基因型别。结果120份感染腹泻标本中检测到诺如病毒阳性45份,阳性率为37.5%,选取的部分阳性菌株序列分析结果显示均为GⅡ.2型。结论诺如病毒是引起学校感染性腹泻暴发疫情的重要病原菌之一,流行时间集中在2017年1月-3月,流行型别为GⅡ.2型。 展开更多
关键词 诺如 分子流行病学 腹泻
2013年-2017年陕西省猪伪狂犬病病毒分子流行病学调查与gE基因序列变异分析 预览
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作者 朱小甫 吴旭锦 《动物医学进展》 北大核心 2019年第2期22-27,共6页
调查2013年-2017年间陕西省猪伪狂犬病流行情况,并对流行毒株gE基因进行测序分析,为猪伪狂犬病防控提供参考。采用套式PCR,检测了陕西9个地市、556个存在繁殖障碍现象猪场的1 390份样品中PRV感染情况,通过Vero细胞传代分离到11个PRV地... 调查2013年-2017年间陕西省猪伪狂犬病流行情况,并对流行毒株gE基因进行测序分析,为猪伪狂犬病防控提供参考。采用套式PCR,检测了陕西9个地市、556个存在繁殖障碍现象猪场的1 390份样品中PRV感染情况,通过Vero细胞传代分离到11个PRV地方流行毒株,并进行了gE基因片段克隆与序列分析。2013年-2017年间陕西存在繁殖障碍的猪场中PRV感染阳性率38.1%~83.3%,样品阳性率46.5%~85.3%。11株PRV核苷酸同源性为99.2%~100%,氨基酸同源性为98.3%~100%,提示这11个PRV流行毒株高度同源。在测定的118个氨基酸位点中,有6个位点与参考序列存在一定差异,分别是T/I31→S31、Q33→L33、Q52→R52、L/R67→A67、A68→D68和T115→R/P/S115。基因进化树分析显示,11株PRV亲缘关系很近,集中分布在一个小的分支上,与我国福建流行毒株Min-A关系密切,与欧美毒株亲缘关系较远。陕西省采样猪场表现出PRV感染率高、感染强度大的特点,gE基因出现多个点突变,且变异趋势相同,形成了一个独立的进化分支。 展开更多
关键词 猪伪狂犬 分子流行病学 GE基因 变异 毒分离
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武昌区域单中心人乳头瘤病毒感染及不同基因型的分布特征
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作者 郭思洁 田黎黎 +2 位作者 孔琪 张滢寅 张雄 《中国实用妇科与产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期123-126,共4页
目的探讨人乳头瘤病毒(HPV)在武昌地区的感染情况及分布特点,以期获得感染HPV在该地区的流行病学概况和特点。方法随机选取2013年7月至2018年6月就诊于武汉市武昌医院的有性生活史女性患者宫颈脱落细胞并进行HPV感染检测和基因分型。计... 目的探讨人乳头瘤病毒(HPV)在武昌地区的感染情况及分布特点,以期获得感染HPV在该地区的流行病学概况和特点。方法随机选取2013年7月至2018年6月就诊于武汉市武昌医院的有性生活史女性患者宫颈脱落细胞并进行HPV感染检测和基因分型。计算比较HPV在不同年龄组中的感染特点。结果 HPV感染率为18.8%。其中高危型占74.9%,低危型占15.2%。各年龄组高危型感染率均明显高于低危型感染率,高危型和低危型感染率最高的年龄段均为30岁以下年轻女性,分别为25.8%和21.0%。高危型中,感染率最高前3种基因型为HPV16(20.0%),HPV18(18.0%),HPV52(14.0%)。低危型中,感染率最高的前3种基因型为HPV11(33.0%),HPV6(32.0%)和HPV CP8304(26.0%)。HPV阳性患者中,单基因型和二重基因型HPV感染率分别为76.2%和18.0%,部分患者为五重感染。除了HPV43,其他基因型均可在多重感染的样本中检测到。结论武昌地区女性HPV的感染率为18.8%,且以高危型感染为主,主要基因型为HPV16、HPV18和HPV52。30岁以下年轻女性为高发人群。加强HPV的筛查和增强女性的自检意识具有非常重要的临床意义。 展开更多
关键词 人乳头瘤 感染 基因型 分子流行病学
重症监护室患者血与痰标本中鲍曼不动杆菌分子流行病学与耐药特征分析 预览
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作者 任亚文 张甲龙 邢方 《临床医学研究与实践》 2019年第4期96-98,119共4页
目的分析本院重症监护室(ICU)患者血和痰标本内鲍曼不动杆菌(ABA)分子流行病学和耐药特征,为防治ABA感染提供思路。方法选取2016年2月至2018年2月在本院ICU治疗患者的血与痰标本,分离出非重复ABA46株,联合多位点序列分型(MLST)技术与脉... 目的分析本院重症监护室(ICU)患者血和痰标本内鲍曼不动杆菌(ABA)分子流行病学和耐药特征,为防治ABA感染提供思路。方法选取2016年2月至2018年2月在本院ICU治疗患者的血与痰标本,分离出非重复ABA46株,联合多位点序列分型(MLST)技术与脉冲场凝胶电泳(PFGE)对46株ABA行同源性分析,观察46株ABA不同基因分型及耐药谱情况。结果MLST结果显示46株ABA分属为9个ST型,其中主要为ST195、ST457及STn1,分别有13、13及11株;PFGE结果显示46株ABA可分成3个克隆型,A型为18株,B型为17株,C型共4株,散发非克隆7株。PFGE分型与MLST分型一致性较高,MLST中主要ST457、ST195分型对应PFGE中的A、B型;不同MLST及PFGE分型在耐药谱方面差别不大,都表征是多重耐药,同时PFGE或者MLST相同分型的菌株其耐药谱并不完全一致。结论本院ICU患者血与痰标本中ABA主要克隆分型是ST195与ST457,且不同分型ABA均表征为多重耐药,临床需加强对ICU患者感染控制,降低其传播率。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 重症监护室 耐药谱 分子流行病学
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广州市腹泻患者Aichi病毒的检测及基因型
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作者 文羽祺 陈雪姣 +4 位作者 肖刚 何文巧 叶育华 李泳枝 陈清 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2019年第1期152-155,共4页
目的了解广州市腹泻患者粪便中Aichi病毒的携带情况,并对其进行基因分析。方法在2015年至2018年,采集南方医科大学某附属医院门诊腹泻患者的粪便样本,利用PCR技术检测粪便中Aichi病毒。采用基因测序与序列比对的方法确认阳性样本,并且... 目的了解广州市腹泻患者粪便中Aichi病毒的携带情况,并对其进行基因分析。方法在2015年至2018年,采集南方医科大学某附属医院门诊腹泻患者的粪便样本,利用PCR技术检测粪便中Aichi病毒。采用基因测序与序列比对的方法确认阳性样本,并且对阳性样本病毒序列进行基因进化分析,构建系统进化树。结果在1 002份腹泻患者粪便样本中,检测到2例Aichi病毒阳性标本,经基因分析一株病毒株为B基因型,另一株为A基因型。结论本研究首次在广东地区发现Aichi病毒,并首次在我国大陆地区检测到A基因型的Aichi病毒,但Aichi病毒总体检出率很低。 展开更多
关键词 Aichi 腹泻 分子流行病学
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志贺菌属耐药性及机制的研究进展 预览
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作者 魏亚璇 周也琪 +3 位作者 刘佳琳 段思琪 丑莉莉 李明成 《国际医药卫生导报》 2019年第2期178-180,共3页
志贺菌属易引起细菌性痢疾,可出现爆发和流行,不同国家和地区有所差异。对菌痢的抗生素治疗可减少感染的持续时间和严重程度,但随着抗生素的滥用,导致志贺菌不断变异,且由于志贺菌耐药是快速的、广泛的,继而衍生出多种多重耐药菌株。本... 志贺菌属易引起细菌性痢疾,可出现爆发和流行,不同国家和地区有所差异。对菌痢的抗生素治疗可减少感染的持续时间和严重程度,但随着抗生素的滥用,导致志贺菌不断变异,且由于志贺菌耐药是快速的、广泛的,继而衍生出多种多重耐药菌株。本文基于志贺菌耐药基因的研究,对临床上应用过的以及正在应用的抗生素进行分析,旨在进一步明确志贺菌的耐药情况,并且将重点讨论志贺菌的耐药特性以及分子流行病学特征。 展开更多
关键词 志贺菌 耐药基因 分子流行病学
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肝癌分子病理流行病学
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作者 高春 《世界华人消化杂志》 CAS 2018年第9期557-563,共7页
分子病理流行病学是在分子病理学和流行病学的基础上发展起来的一门新兴学科,由美国哈佛大学医学院Shuji Ogino教授等在2010年正式提出.肝癌分子病理流行病学研究的是肝癌危险因素、分子标志物和肝癌发生发展及预后三者之间的关系,... 分子病理流行病学是在分子病理学和流行病学的基础上发展起来的一门新兴学科,由美国哈佛大学医学院Shuji Ogino教授等在2010年正式提出.肝癌分子病理流行病学研究的是肝癌危险因素、分子标志物和肝癌发生发展及预后三者之间的关系,探索危险因素对肝癌发生发展影响的分子机制,实现对高危人群的分子分型.2型糖尿病已被确认为肝癌的危险因素之一,肝癌分子病理流行病学有助于阐明2型糖尿病对肝癌发生发展影响的分子机制.2017-12-20首届“中日肝癌分子病理流行病学专题研讨会”在北京成功举办.肝癌分子病理流行病学为我们解决肝癌的部分问题提供了机遇和挑战.有助于提升未来肝癌领域的早期预防、分子分型、早期诊断、个体化治疗、预后研究等方面的水平. 展开更多
关键词 肝癌 分子流行病学 分子 分子流行病学 2型糖尿
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非洲猪瘟分子病原学及分子流行病学研究进展 被引量:5
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作者 欧云文 马小元 +2 位作者 王俊 张永光 张杰 《中国兽医学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期416-420,共5页
非洲猪瘟是由非洲猪瘟病毒引起的一种烈性传染病,具有急性、高热、高病死率等特征。主要暴发于非洲、东欧国家、俄罗斯及高加索地区,给受灾国家的养猪业造成严重的影响。现主要从分子病原学和分子流行病学对非洲猪瘟研究情况进行综述... 非洲猪瘟是由非洲猪瘟病毒引起的一种烈性传染病,具有急性、高热、高病死率等特征。主要暴发于非洲、东欧国家、俄罗斯及高加索地区,给受灾国家的养猪业造成严重的影响。现主要从分子病原学和分子流行病学对非洲猪瘟研究情况进行综述,为非洲猪瘟的防控提供理论依据。 展开更多
关键词 非洲猪瘟 分子 分子流行病学 流行现状
山东省济南市脑膜炎奈瑟菌多位点序列分型研究
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作者 单晓英 白爱英 刘尊玉 《疾病监测》 CAS 2018年第12期1004-1008,共5页
目的分析2005-2018年山东省济南市分离的脑膜炎奈瑟菌(Nm)分子流行病学特征。方法采用多位点序列分型(MLST)方法,对Nm的分子分型进行研究,并使用BioNumerics软件进行分子分型分析。结果 2005-2018年,共分离到130株Nm,涵盖A、B、C、W135... 目的分析2005-2018年山东省济南市分离的脑膜炎奈瑟菌(Nm)分子流行病学特征。方法采用多位点序列分型(MLST)方法,对Nm的分子分型进行研究,并使用BioNumerics软件进行分子分型分析。结果 2005-2018年,共分离到130株Nm,涵盖A、B、C、W135、Y 5种血清群及不可分群(NG)。130株Nm分为37种序列型(ST):2株A群分为2种ST,分别属于已知克隆群(cc)5和未知克隆群(UA);24株B群分为17种ST,分别属于cc4821、cc162及UA;39株C群分为8种ST,分别属于cc4821、cc32及UA;54株W135群分为3种ST,分别属于cc11和cc4821;1株Y群为ST-92型,属于cc92;10株NG分为8种ST,分别属于cc4821、cc198及UA。108株已知cc菌株中,cc11占48.15%(52/108),cc4821占45.37%(49/108);22株UA菌株包括18种ST,其中,15株B群具有10种ST。结论济南市2005-2018年分离的Nm ST型别分布呈现多态性,在NG和B群中尤为明显。cc4821和cc11为两大优势克隆群,B群Nm呈现多克隆化趋势。 展开更多
关键词 脑膜炎奈瑟菌 流行性脑脊髓膜炎 多位点序列分型 分子分型 分子流行病学
云南省2016年急性乙型肝炎病例的分子流行病学研究
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作者 许盛楠 康文玉 +1 位作者 许琳 李琼芬 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2018年第4期387-392,共6页
目的了解云南省急性乙型肝炎(乙肝)病例的乙肝病毒(HBV)基因型、血清型分布特征。方法通过传染病网络直报系统收集云南省2016年报告的急性乙肝病例,采集血液标本进行相关指标检测和流行病学调查以核实诊断;对确诊的急性乙肝病例进行... 目的了解云南省急性乙型肝炎(乙肝)病例的乙肝病毒(HBV)基因型、血清型分布特征。方法通过传染病网络直报系统收集云南省2016年报告的急性乙肝病例,采集血液标本进行相关指标检测和流行病学调查以核实诊断;对确诊的急性乙肝病例进行HBV基因型、血清型检测。结果 58例急性乙肝病例的血标本HBV基因型分型成功,其中C、B、I基因型分别为51例(87.93%)、6例(10.34%)、1例(1.72%);adw2、adrq+、ayr、ayw2血清型分别为44例(75.86%)、10例(17.24%)、3例(5.17%)、1例(1.72%);有家庭乙肝史、手术史、共用剃须刀或牙刷及修脚史、医学诊疗史分别占5.17%、5.17%、27.59%、8.62%。结论云南省急性乙肝病例的HBV优势基因型为C型,优势血清型为adw2型和adrq+型,主要传播方式为经血传播。 展开更多
关键词 急性乙肝 分子流行病学
微小隐孢子虫分子流行病学 预览
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作者 陈苗 李慧 +3 位作者 唐莉 阚珍珍 李文超 顾有方 《畜牧兽医科技信息》 2018年第9期24-26,共3页
隐孢子虫是最重要的人畜共患原生动物寄生虫,其引起的人畜共患寄生虫病是导致人类和动物腹泻的主要原因之一,大多数为急性暂时性腹泻,但是,持续感染可能导致慢性病,进而威胁生命,尤其是对营养不良或免疫缺陷的人更为严重。然而,... 隐孢子虫是最重要的人畜共患原生动物寄生虫,其引起的人畜共患寄生虫病是导致人类和动物腹泻的主要原因之一,大多数为急性暂时性腹泻,但是,持续感染可能导致慢性病,进而威胁生命,尤其是对营养不良或免疫缺陷的人更为严重。然而,目前尚没有特效药物治疗。随着分子生物学的进展,PCR技术被广泛的用于隐孢子虫的检测,其特异性与灵敏性都比传统的方法较高,改善了传统方法的不足,为临床应用提供重要的参考价值。本文主要对微小隐孢子虫的基因型、基因亚型及诊断检测和预防治疗方面进行综述。 展开更多
关键词 隐孢子虫 隐孢子虫 分子流行病学
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某医院黏质沙雷菌碳青霉烯耐药机制及流行病学研究 预览
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作者 饶碧华 储新民 《安徽医科大学学报》 北大核心 2018年第5期745-749,共5页
目的研究院内黏质沙雷菌碳青霉烯类药物的耐药机制,并探索其院内分子流行病学特征,以期为临床合理运用抗生素和预防、控制其感染提供依据。方法收集2017年某三甲医院临床分离物中无重复患者的黏质沙雷菌株标本,以Vitek 2 Compact检测药... 目的研究院内黏质沙雷菌碳青霉烯类药物的耐药机制,并探索其院内分子流行病学特征,以期为临床合理运用抗生素和预防、控制其感染提供依据。方法收集2017年某三甲医院临床分离物中无重复患者的黏质沙雷菌株标本,以Vitek 2 Compact检测药敏结果,改良Hodge试验(MHT)检测碳青霉烯酶,PCR检测碳青霉烯酶类基因,ERIC-PCR分析菌株克隆型。结果筛选获得17株耐碳青霉烯黏质沙雷菌株,主要来自于重症医学科和干部病房,对阿米卡星、复方新诺明100%敏感,对环丙沙星、庆大霉素、氨曲南、头孢曲松呈现高度耐药。14株为碳青霉烯酶表型阳性,10株细菌含有CTX-M-14,5株含有KPC-2,2株含有TEM,1株含有NDM-1,1株含有SHV基因,并出现了一株细菌携带多种耐药基因的情况。结论院内黏质沙雷碳青霉烯耐药严重,耐药基因以CTX-M-14和KPC-2为主。17株细菌中11株为同一型别,可能由院内感染引起,需要院感、检验科等相关部门通力合作、加强防范,预防和控制其感染。 展开更多
关键词 黏质沙雷菌 碳青霉烯酶 耐药机制 分子流行病学
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吉林省2001-2014年麻疹分子流行病学分析 被引量:1
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作者 单元春 周剑惠 +7 位作者 王爽 程涛 吴东林 田鑫 刘磊 杨尧 付思美 黄彪 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2018年第4期417-421,共5页
目的研究2001-2014年吉林省麻疹分子流行病学特征。方法选取54株2001-2014年吉林省麻疹病毒株作为代表株,用Vero/Slam细胞进行病毒分离,用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)对麻疹病毒核蛋白羧基端450个核苷酸片段进行扩增,并对扩增产物进... 目的研究2001-2014年吉林省麻疹分子流行病学特征。方法选取54株2001-2014年吉林省麻疹病毒株作为代表株,用Vero/Slam细胞进行病毒分离,用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)对麻疹病毒核蛋白羧基端450个核苷酸片段进行扩增,并对扩增产物进行序列测定和分析。结果在2001-2014年54株麻疹流行株中,1株属于A基因型(疫苗株),其他53株均为H1基因型H1a亚型。53株麻疹病毒流行株之间相比、流行株分别与Chin9322/H1a、Shanghai-191/China-vaccine毒株相比,其核苷酸和氨基酸同源性均随年代推移逐渐减小;其中A传播链基因保守,自2001年一直稳定流行;B传播链逐步形成独立分支,且传播范围不断扩大。结论吉林省麻疹病毒流行株在14年中逐渐分化为两个进化支,两个传播链不断蔓延扩散。建议持续监测麻疹病毒基因特征和传播情况。 展开更多
关键词 麻疹 分子流行病学
上海市浦东新区HIV-1感染者基因亚型分析
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作者 张鹏 郁晓磊 +5 位作者 王绪琴 吴健 陶静 郑敏 薛以乐 康来仪 《中国艾滋病性病》 CSCD 北大核心 2018年第8期765-767,776共4页
目的了解浦东新区艾滋病病毒1型(HIV-1)感染者的病毒亚型分布特征,为该区制定针对性的艾滋病防治策略和措施提供科学依据。方法采用分层抽样的方法选取浦东新区242例HIV-1感染者的血浆标本,应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,将... 目的了解浦东新区艾滋病病毒1型(HIV-1)感染者的病毒亚型分布特征,为该区制定针对性的艾滋病防治策略和措施提供科学依据。方法采用分层抽样的方法选取浦东新区242例HIV-1感染者的血浆标本,应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,将PCR产物测序分析,确定基因亚型,并结合现场流行病学调查资料进行分析。结果获得186份pol区基因片段,HIV-1亚型分布显示,CRF01AE比例最大,为52.69%,其次为CRF07BC,31.72%,B,5.91%。CRF08BC未在同性性传播者中发现,在异性性传播者中占5.36%。CRF01AE与B亚型重组体在25岁以下年龄组和外地户籍感染者中相对较高,分别为12.20%和6.25%。在同性性传播者中发现2例CRF01AE和CRF07BC的重组体。结论浦东新区HIV感染者HIV-1型流行株呈现多样化的特点,且分布与年龄、户籍、文化程度以及传播途径相关。 展开更多
关键词 艾滋毒-1型 基因亚型 分子流行病学
2018年成都周边部队感染55型腺病毒分子流行病学溯源
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作者 王文博 古良琪 +8 位作者 刘媛 杨洋 赵秀华 周奕帆 张雪莲 陈锚锚 邱薇 范泉水 胡小兵 《第三军医大学学报》 CSCD 北大核心 2018年第24期2211-2216,共6页
目的对成都地区驻地部队暴发55型腺病毒进行病原分离、全基因序列及和遗传进化特点等分子流行病学分析,为揭示55型腺病毒的进化起源及制订疾病防控策略提供参考数据。方法采集55型腺病毒感染者咽拭子标本,采用人喉癌上皮细胞HEp-2分离... 目的对成都地区驻地部队暴发55型腺病毒进行病原分离、全基因序列及和遗传进化特点等分子流行病学分析,为揭示55型腺病毒的进化起源及制订疾病防控策略提供参考数据。方法采集55型腺病毒感染者咽拭子标本,采用人喉癌上皮细胞HEp-2分离病毒株。利用分片段PCR和测序获取毒株的全基因序列,检索并下载GenBank数据库中55型腺病毒全基因序列,采用生物信息学分析软件-MEGA6.06进行序列比对和系统发育进化树构建。结果从成都周边驻地部队3起感染疫情中分离出55型腺病毒5株,分别为24-1株、24-2株、1804001株、1806003株、DYN株。采用12片段分段PCR和测序获得了5株病毒全基因序列,GenBank登录号分别为MH256653-MH256657,5株病毒之间序列差异较小,仅有16处碱基变异。与我国报道的第一株55型腺病毒QS-DLL株和重庆株(CQ-2903)序列相比,有30处碱基变异。根据系统发育进化树分析结果,新分离的5株HAdV-55毒株均与QS-DLL株相近,与我们之前分离的西藏株(LS89/Tibet/2016)、云南株(KM03/YN/2016)等进化距离相对较远。结论本研究分析发现2018年成都周边驻地部队流行的55型腺病毒为QS-DLL类似株或重庆分离株CQ-2903株的突变株。 展开更多
关键词 55型腺 原分离 全基因测序 系统发育进化树 分子流行病学
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