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猪胆粉及其中成药的特异性PCR鉴别方法
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作者 王丽 金艳 +1 位作者 蒋超 袁媛 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第17期136-141,共6页
目的:建立一种适用于猪胆粉及其中成药的特异性聚合酶链式反应(PCR)鉴别方法,为复杂组分中动物源性成分的鉴定提供示范。方法:根据猪源性鉴别引物,建立PCR鉴别方法,优化反应体系,并对此方法进行考察和验证。利用建立的PCR鉴别方法,对20... 目的:建立一种适用于猪胆粉及其中成药的特异性聚合酶链式反应(PCR)鉴别方法,为复杂组分中动物源性成分的鉴定提供示范。方法:根据猪源性鉴别引物,建立PCR鉴别方法,优化反应体系,并对此方法进行考察和验证。利用建立的PCR鉴别方法,对20批自制猪胆粉药材,19批市售猪胆粉药材和22批含猪胆粉中成药的猪源性成分进行鉴别,将市售的猪胆粉药材和含猪胆粉中成药PCR扩增的阳性产物进行酶切验证和序列测定验证。结果:20批自制猪胆粉药材、猪胆粉对照药材均能扩出约212 bp的特异性鉴别条带,牛和羊参考品均无条带;19批市售猪胆粉药材中仅5批扩出特异性鉴别条带;22批含猪胆粉中成药中有10批检出猪源性成分;猪胆粉对照药材及市售猪胆粉药材PCR扩增的阳性产物经Mnl I酶切后均能产生约200 bp的条带;猪胆粉及其中成药中扩增产物序列与Gen Bank数据库中相似性最高的物种为Sus scrofa,一致性为99%,与猪的序列高度一致。结论:该文建立的特异性PCR鉴别方法可准确鉴别猪胆粉及其中成药中的猪源性成分。 展开更多
关键词 猪胆粉 中成药 特异性聚合酶链式反应 分子鉴别
3个石榴良种的ISSR分子鉴别 预览
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作者 王庆军 罗华 +2 位作者 毕润霞 赵丽娜 郝兆祥 《贵州农业科学》 CAS 2019年第1期94-100,共7页
为石榴良种的推广栽植和分子标记辅助选择育种奠定理论基础,采用ISSR分子技术方法,从ISSR随机引物中筛选出8条多态性好、谱带清晰、扩增稳定的引物(UBC834、UBC841、UBC811、UBC835、UBC827、UBC861、UBC840、UBC810)对秋艳、青丽和桔艳... 为石榴良种的推广栽植和分子标记辅助选择育种奠定理论基础,采用ISSR分子技术方法,从ISSR随机引物中筛选出8条多态性好、谱带清晰、扩增稳定的引物(UBC834、UBC841、UBC811、UBC835、UBC827、UBC861、UBC840、UBC810)对秋艳、青丽和桔艳3个石榴良种进行ISSR-PCR扩增分析鉴别。结果表明:秋艳良种获得的2条特异性分子标记引物为UBC811和UBC834;青丽、桔艳良种获得的2条特异性分子标记引物为UBC835和UBC840,同时获得了3个石榴良种各自的特征图谱,初步建立了分子鉴别体系。 展开更多
关键词 石榴 良种 ISSR 分子鉴别
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基于ITS2序列的“藏茵陈”分子鉴别和遗传多样性研究 预览
3
作者 吴波 朱小芬 +1 位作者 李风琴 葛菲 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期347-355,共9页
通过实验测定和GenBank数据库检索印度獐牙菜、川西獐牙菜、大籽獐牙菜、獐牙菜、抱茎獐牙菜、湿生萹蕾、椭圆叶花锚、喉毛花、宿根胁助花、篦齿虎耳草、唐古特虎耳草、山地虎耳草、优越虎耳草等ITS2序列,使用CodonCode Aligner V5.1和M... 通过实验测定和GenBank数据库检索印度獐牙菜、川西獐牙菜、大籽獐牙菜、獐牙菜、抱茎獐牙菜、湿生萹蕾、椭圆叶花锚、喉毛花、宿根胁助花、篦齿虎耳草、唐古特虎耳草、山地虎耳草、优越虎耳草等ITS2序列,使用CodonCode Aligner V5.1和MEGA5.5软件处理ITS2序列,对“藏茵陈”各基原物种变异进行了分析并以Neighbor-Join法构建了“藏茵陈”类各基原物种遗传多样性聚类分析图。结果表明,ITS2序列可以作为“藏茵陈”基原植物的分子鉴别和遗传多样性分析的可靠方法。 展开更多
关键词 藏茵陈 ITS2 分子鉴别
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地龙的多重位点特异性PCR鉴别
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作者 田娜 魏艺聪 +4 位作者 袁媛 金艳 杨全 赵玉洋 蒋超 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第17期124-129,共6页
目的:近年来,中药材地龙的商品价格不断上涨,市场的混伪品随之增加。其主要鉴别特征在药材中大部分丢失,难以区分。因此,急需建立一种准确、稳定的中药材地龙基原鉴别方法。方法:根据地龙及其混伪品的COI基因序列差异找到变异位点,从而... 目的:近年来,中药材地龙的商品价格不断上涨,市场的混伪品随之增加。其主要鉴别特征在药材中大部分丢失,难以区分。因此,急需建立一种准确、稳定的中药材地龙基原鉴别方法。方法:根据地龙及其混伪品的COI基因序列差异找到变异位点,从而设计参环毛蚓、通俗环毛蚓、威廉环毛蚓及栉盲环毛蚓的特异性鉴别引物,优化反应体系并进行耐受性和适用性的考察和验证。在此基础上将特异性引物组合,构建多重聚合酶链式反应(PCR)体系,从而建立了一种高效准确、操作简便、专属性强、重复性好的中药材地龙及其常见混伪品的多重位点PCR鉴别方法。结果:在该方法下广地龙基原参环毛蚓可得到366 bp片段,沪地龙基原通俗环毛蚓和威廉环毛蚓可得到487 bp片段,栉盲环毛蚓可得到475 bp片段,其他混伪品均无条带。将之组合形成的多重PCR可在一次鉴定操作中根据条带位置同时鉴别沪地龙和广地龙。结论:该文所建立的多重位点特异性PCR鉴别方法可准确鉴别中药材地龙真伪。 展开更多
关键词 地龙 多重位点特异性聚合酶链式反应 分子鉴别 混伪品 参环毛蚓 通俗环毛蚓 威廉环毛蚓 栉盲环毛蚓
汾远2号远志的rDNA ITS等位基因特异性PCR鉴别研究 预览
5
作者 李娟 王丹丹 +4 位作者 孔冉冉 田洪岭 张福生 秦雪梅 马存根 《山西医科大学学报》 CAS 2019年第8期1143-1148,共6页
目的设计出鉴别汾远2号远志的特异性PCR引物,建立快速鉴别汾远2号远志的方法。方法利用植物核糖体DNA(rDNA)的内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)通用型引物扩增远志样品,并对所有样品进行双向测定,采用DNAMAN软件对远志... 目的设计出鉴别汾远2号远志的特异性PCR引物,建立快速鉴别汾远2号远志的方法。方法利用植物核糖体DNA(rDNA)的内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)通用型引物扩增远志样品,并对所有样品进行双向测定,采用DNAMAN软件对远志样品rDNA ITS序列进行比对,找到汾远2号远志(Polygala tenuifolia,简称FY2)的等位基因差异位点,并利用NCBI网上已有的远志序列以及作者测序得到的卵叶远志(P.sibirica)序列和FY2序列比对,进行等位基因差异位点的验证。最后根据FY2的碱基差异位点,采用Primer 5.0软件设计特异性PCR引物,用于FY2的特异性PCR鉴别。结果测序所得的序列与NCBI中远志的相似度高达99.36%。找到了两个FY2的等位基因差异位点,第123位点为T,其余样品均为A,第553位点为T,其余样品均为C。设计了4对特异性PCR引物对FY2进行特异性PCR扩增,在约463 bp处出现单一的扩增条带,而其他远志及卵叶远志则无相应的扩增条带。结论等位基因特异性PCR能有效地从远志和卵叶远志药材中鉴别出汾远2号远志,具有准确、高效、灵敏、简便的特点。 展开更多
关键词 远志 汾远2号 ITS 等位基因特异性引物 分子鉴别
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岩陀ITS2片段PCR扩增条件优化及物种鉴别研究 预览
6
作者 方强强 王燕 《现代园艺》 2019年第5期31-34,共4页
以岩陀植物叶片为材料,利用试剂盒提取方法提取植物叶片中的DNA,对ITS2序列进行PCR扩增条件优化并对ITS2序列鉴别物种能力进行考察;通过单因素实验分别研究退火温度、DNA模板量、循环次数等因素对岩陀DNA条形码鉴别中所选的ITS2序列扩... 以岩陀植物叶片为材料,利用试剂盒提取方法提取植物叶片中的DNA,对ITS2序列进行PCR扩增条件优化并对ITS2序列鉴别物种能力进行考察;通过单因素实验分别研究退火温度、DNA模板量、循环次数等因素对岩陀DNA条形码鉴别中所选的ITS2序列扩增反应的影响,并对扩增体系进行优化,采用Seqman7.1软件对测序峰图进行校对拼接,应用MEGA计算种内种间遗传距离,采用邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统发育树;结果表明:优化后的PCR扩增反应体系总体积为25μL,含Taq PCR Master Mix 12.5μL、DNA模板量5ng、上下游引物(10mol/L)各1μL、ddH2O9.5μL,ITS2序列在退火温度设置为60℃,循环次数为30次的条件下进行PCR扩增,获得清晰单一的电泳条带,ITS2测序成功率100%,比对后的序列长度475bp,GC含量约50%,种内种间变异存在重叠,没有明显的Barcoding gap;结论:通过试剂盒提取岩陀植物叶片DNA,在优化后的PCR扩增反应体系对ITS2序列进行扩增,可以满足后续对鬼灯檠属多基原植物岩陀的亲缘关系、物种鉴别和遗传多样性等领域的研究,但ITS2序列不适合岩陀种DNA条形码鉴别。 展开更多
关键词 岩陀 DNA提取 核糖体ITS2 PCR扩增条件 测序 分子鉴别
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我国外来入侵生物福寿螺种类的多重PCR鉴别方法
7
作者 贺超 杨倩倩 +2 位作者 刘苏汶 刘光富 俞晓平 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期97-105,共9页
为研发能快速、准确地鉴别在我国为害严重的3种福寿螺——小管福寿螺Pomacea canaliculata、斑点福寿螺P.maculata和新发现入侵种Pomacea sp.的PCR技术,基于其线粒体全基因组序列,通过比对分析找到种间差异区段,分别设计并筛选了上述3... 为研发能快速、准确地鉴别在我国为害严重的3种福寿螺——小管福寿螺Pomacea canaliculata、斑点福寿螺P.maculata和新发现入侵种Pomacea sp.的PCR技术,基于其线粒体全基因组序列,通过比对分析找到种间差异区段,分别设计并筛选了上述3种福寿螺的特异性引物对,建立了多重PCR检测方法,对其特异性和灵敏度进行评价。结果表明,所设计的引物特异性强,能从不同地理种群的小管福寿螺、斑点福寿螺和Pomacea sp.中分别扩增出1 238、901和571 bp的特异性条带,阴性对照无条带;退火温度为60℃时,32个扩增循环的检测灵敏度可达1 ng样品DNA量。所构建的多重PCR体系可应用于福寿螺不同部位组织碎片、不同性别及不同发育阶段样品的鉴别,具有准确快速、灵敏高效的特点,可用于植保检疫及食品安全部门福寿螺种类的检测。 展开更多
关键词 福寿螺 特异性引物 分子鉴别 线粒体基因 多重PCR
高大鬼针草的形态与显微鉴定 预览
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作者 郑晓文 邴帅 +3 位作者 刘政 陈文华 谭会颖 徐凌川 《山东科学》 CAS 2018年第1期30-35,共6页
运用分子、植物形态以及显微鉴别的方法对高大鬼针草进行研究。通过测定DNA的ITS序列确定高大鬼针草为鬼针草属,并对其形态学以及茎、叶的显微鉴别特征进行详细描述和记录。该研究建立的方法为高大鬼针草的鉴定以及开发利用提供了参考... 运用分子、植物形态以及显微鉴别的方法对高大鬼针草进行研究。通过测定DNA的ITS序列确定高大鬼针草为鬼针草属,并对其形态学以及茎、叶的显微鉴别特征进行详细描述和记录。该研究建立的方法为高大鬼针草的鉴定以及开发利用提供了参考依据。 展开更多
关键词 高大鬼针草 分子鉴别 形态鉴别 显微鉴别
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基于形态和DNA序列分析的海龙类药材商品的基原调查 预览 被引量:2
9
作者 刘富艳 金艳 +4 位作者 袁媛 秦雯 蒋超 赵玉洋 黄璐琦 《世界中医药》 CAS 2018年第2期241-247,共7页
目的:为市售海龙药材的鉴别以及建立质量控制标准提供科学依据。方法:对我国主要药材市场的海龙类商品进行收集,并通过形态鉴别和DNA分子鉴别确定海龙商品基原。结果:共有刁海龙Solenognathus hardwickii(Gray,1830)、拟海龙Syngna... 目的:为市售海龙药材的鉴别以及建立质量控制标准提供科学依据。方法:对我国主要药材市场的海龙类商品进行收集,并通过形态鉴别和DNA分子鉴别确定海龙商品基原。结果:共有刁海龙Solenognathus hardwickii(Gray,1830)、拟海龙Syngnathoides biaculeatus(Bloch,1785)、舒氏海龙Syngnathus schlegeli Kaup,1856、宝珈枪吻海龙Doryichthys boaja(Bleeker,1850)、黑斑刁海龙Solegnathus lettiensis Bleeker,1860、斗氏刁海龙Solegnathus dunckeri Whitley,1927、多棘刁海龙Solegnathus spinosissimus Günther,1870、粗吻海龙Trachyrhamphus serratus(Temminck et Schlegel,1847)、光粗吻海龙Trachyrhamphus bicoarctatus(Bleeker,1857)、长吻粗吻海龙Trachyrhamphus longirostris Kaup,1856、葛氏海蠋鱼Halicampus grayi Kaup,1856等11种基原,其中黑斑刁海龙、斗氏刁海龙、光粗吻海龙、长吻粗吻海龙为首次在中药市场中发现。结论:本文所进行的DNA序列分析结合形态鉴别方法也对其他中药材的市场调查和商品基原鉴别研究提供了模式。 展开更多
关键词 海龙药材 市场调查 分子鉴别
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多重位点特异性PCR鉴别海龙及其混伪品 被引量:2
10
作者 刘富艳 金艳 +3 位作者 袁媛 秦雯 赵玉洋 蒋超 《中国实验方剂学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第15期57-64,共8页
目的:建立一种高效、准确的中药材海龙及其常见混伪品的特异性聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)鉴别方法。方法:通过比较海龙及其混伪品的细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因(cytochrome C oxidase subunitⅠ,COⅠ)基因序... 目的:建立一种高效、准确的中药材海龙及其常见混伪品的特异性聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)鉴别方法。方法:通过比较海龙及其混伪品的细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因(cytochrome C oxidase subunitⅠ,COⅠ)基因序列差异,根据变异位点设计刁海龙、尖海龙及拟海龙的特异性鉴别引物,优化反应体系,并对此方法进行耐受性和适用性的考察和验证。在此基础上,将3对特异性引物组合,构建多重PCR体系。结果:在多重PCR体系中,刁海龙能扩增出485 bp片段,尖海龙可扩增出120 bp片段,拟海龙可以扩增出240 bp片段,其他混伪品均无条带。所设计的特异性鉴别引物具有高度的特异性。结论:该文所建立的位点特异性PCR鉴别方法可实现海龙的准确鉴别。 展开更多
关键词 海龙 特异性PCR 分子鉴别 混伪品
基于ITS2序列的獐牙菜属六种药材的分子鉴定 预览 被引量:2
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作者 侯典云 杨萌萌 +3 位作者 周爽 赵杏利 张红晓 胥华伟 《天然产物研究与开发》 CSCD 北大核心 2018年第7期1126-1131,共6页
本文以獐牙菜属的六种药材为研究对象,采用MEGA 6.0软件确定ITS2序列的GC含量,基于K2P模型计算遗传距离,构建NJ树,ITS2 database在线分析二级结构等方法,研究ITS2条形码序列对六种药材的鉴别效果。结果表明,六种药材的ITS2序列长度范围... 本文以獐牙菜属的六种药材为研究对象,采用MEGA 6.0软件确定ITS2序列的GC含量,基于K2P模型计算遗传距离,构建NJ树,ITS2 database在线分析二级结构等方法,研究ITS2条形码序列对六种药材的鉴别效果。结果表明,六种药材的ITS2序列长度范围为230-232 bp,平均GC含量为61.2%-64.0%。六种药材的种内变异均较小,其种间平均遗传距离为0.03-0.09。ITS2二级结构的茎环结构和四个臂均不同,NJ树结果显示,六种药材可分别聚为一支,呈现出明显的单系性。因此,ITS2序列可准确、有效地鉴别本研究的獐牙菜属六种药材,为这些药材的后续相关深入研究奠定了基础,也为獐牙菜属其他物种鉴定提供了参考。 展开更多
关键词 獐牙菜属 药材 ITS2 分子鉴别
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石斛夜光丸中主要中药成分的分子鉴别 被引量:1
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作者 鲍方名 沈海英 《时珍国医国药》 CSCD 北大核心 2018年第7期1650-1652,共3页
目的建立石斛夜光丸中主要成分石斛、人参及水牛角的分子鉴别方法,并在市售的不同厂家的石斛夜光丸中进行验证。方法使用植物基因组试剂盒提取石斛夜光丸中的石斛、人参及水牛角基因组,根据石斛属的通用ITS基因序列、人参属的mat K基因... 目的建立石斛夜光丸中主要成分石斛、人参及水牛角的分子鉴别方法,并在市售的不同厂家的石斛夜光丸中进行验证。方法使用植物基因组试剂盒提取石斛夜光丸中的石斛、人参及水牛角基因组,根据石斛属的通用ITS基因序列、人参属的mat K基因序列、水牛线粒体细胞色素b基因设计引物,并建立相应的PCR体系。结果在三组PCR体系中,均获得与阳性对照一致的特异性序列。结论使用设计的引物和优化的PCR体系,可以有效的进行石斛夜光丸中石斛、人参及水牛角的分子鉴别。 展开更多
关键词 石斛夜光丸 石斛 人参 水牛角 分子鉴别
滇池沉积物中反硝化细菌及产甲烷菌的分子鉴别研究 预览
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作者 尹利方 陈泽斌 +5 位作者 夏体渊 王定康 姚丽媛 华金珠 徐胜光 王家银 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第1期154-159,共6页
【目的】为了解滇池沉积物中反硝化细菌及产甲烷菌的种类组成。【方法】采用引物NirS1F/NirS6R和Me1/Me2分别对沉积物总DNA进行PCR扩增,得到1000 bp的反硝化细菌和760 bp的产甲烷菌特异性片段。【结果】证实了滇池沉积物中存在反硝化细... 【目的】为了解滇池沉积物中反硝化细菌及产甲烷菌的种类组成。【方法】采用引物NirS1F/NirS6R和Me1/Me2分别对沉积物总DNA进行PCR扩增,得到1000 bp的反硝化细菌和760 bp的产甲烷菌特异性片段。【结果】证实了滇池沉积物中存在反硝化细菌和产甲烷菌,且推测产甲烷菌的丰度高于反硝化细菌。2个克隆文库分别获得阳性克隆子55和99个,利用Mothur软件将序列分别划分为10和5个OUT,说明尽管反硝化细菌的丰度低于产甲烷菌,但物种多样性高于产甲烷菌。运用BLASTN程序在GenBank数据库中进行序列比对,发现55个反硝化细菌阳性克隆子可分为10个种类,OTU10类序列与细菌Dechloromonas aromatica的相似性达86%,是反硝化细菌中的优势类群;99个产甲烷菌阳性克隆子可分为5个种类,OTU5类序列与甲酸甲烷规则菌(Methanoregula formicicum)相似性达86%,该类群是反硝化细菌中的优势类群。【结论】滇池沉积物中的反硝化细菌与产甲烷菌多为潜在的未被培养的新种。 展开更多
关键词 滇池 沉积物 反硝化细菌 产甲烷菌 分子鉴别
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常用蛇类药材鉴别研究进展 被引量:3
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作者 张乐 陶明宝 +1 位作者 陈鸿平 刘友平 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期222-227,共6页
蛇是人类宝贵的野生动物资源,也是我国重要的蛇类药材来源。它具有祛风、通络、定惊止痉等功效,在风湿痹证方面具有良好的治疗效果。近年来,在经济利益驱使下,加上我国蛇种类繁多,现有蛇类多达241种,且各自形态特征差异不明显,使得准确... 蛇是人类宝贵的野生动物资源,也是我国重要的蛇类药材来源。它具有祛风、通络、定惊止痉等功效,在风湿痹证方面具有良好的治疗效果。近年来,在经济利益驱使下,加上我国蛇种类繁多,现有蛇类多达241种,且各自形态特征差异不明显,使得准确鉴定药材困难,容易导致市场用药品种混乱。文章就近10年来用于常用蛇类药材(主要以《中国药典》收载品种乌梢蛇、金钱白花蛇、蕲蛇为例)及其混伪品的鉴别方法进行了整理研究,综述了各类鉴别方法在蛇类药材中的研究进展,包括传统的性状鉴别、显微鉴别、理化鉴别及近年来发展的微性状鉴别、色谱质谱技术和一些现代的分子鉴别方法如DNA条形码技术,并阐述了各种鉴别方法的适用对象及其优缺点,以期为蛇类药材或者动物类药材的鉴别研究提供思路和参考。发现目前药用蛇在现场快检、中成药的鉴别和优劣鉴别方面仍然面临着一些困难,提示对药用蛇品质进行客观评价时,还需将传统与现代鉴别方法相结合、真伪与优劣鉴别技术相联系。 展开更多
关键词 蛇类药材 混伪品 鉴别方法 分子鉴别
肉及肉制品中牦牛源性成分的PCR鉴别 预览 被引量:3
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作者 段庆梓 尚柯 +3 位作者 张彪 张玉 王巍 梁恒兴 《食品研究与开发》 北大核心 2017年第9期共4页
通过牦牛与其他常见物种的细胞色素b基因序列进行比对,设计牦牛的特异性引物,并进行聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)体系中不同条件、参数的考察,建立肉及肉制品中牦牛源性检测的PCR方法.该方法具有较好的专属性,建立的... 通过牦牛与其他常见物种的细胞色素b基因序列进行比对,设计牦牛的特异性引物,并进行聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)体系中不同条件、参数的考察,建立肉及肉制品中牦牛源性检测的PCR方法.该方法具有较好的专属性,建立的PCR体系仅对牦牛源性有扩增现象,而对其他物种无扩增,且对牦牛源性的检出限可达到1%.能够满足检验机构或生产企业对肉及肉制品中牦牛源性的检测需求. 展开更多
关键词 肉制品 牦牛 聚合酶链式反应 分子鉴别
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DNA条形码在主要滇产石斛鉴别中的应用 预览 被引量:3
16
作者 张爱丽 高亚芳 +2 位作者 黎太米 谭文红 钱子刚 《中国民族民间医药杂志》 2017年第2期11-16,共6页
目的:选择云南境内应用面较广、市场流通量较大的14个石斛品种,建立其 DNA条形码鉴定方法。方法:结合Genbank数据库序列,选择ITS、psbA-trnH、matK、rbcL等4条常用序列对石斛DNA样品进行扩增和测序,利用MEGA5.0计算种间种内 K2P... 目的:选择云南境内应用面较广、市场流通量较大的14个石斛品种,建立其 DNA条形码鉴定方法。方法:结合Genbank数据库序列,选择ITS、psbA-trnH、matK、rbcL等4条常用序列对石斛DNA样品进行扩增和测序,利用MEGA5.0计算种间种内 K2P遗传距离并构建NJ树,同时采用Taxon DNA软件计算Barcoding gap (条形码种内种间遗传差异)。结果:ITS序列的K2P种内遗传距离小于种间遗传距离,NJ树可以很好地将不同品种的石斛分开,且有较明显的Barcoding gap。结论:ITS序列可以作为鉴别这14种滇产主要石斛的优选序列。 展开更多
关键词 滇产石斛 DNA条形码 分子鉴别
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山姜属物种的ITS序列分析和分子鉴别
17
作者 黄琼林 马新业 +1 位作者 詹若挺 陈蔚文 《时珍国医国药》 CSCD 北大核心 2017年第6期1367-1369,共3页
目的 采用ITS序列对山姜属物种进行分子鉴别。方法 通过PCR扩增测序或Genbank下载获取山姜属物种的ITS序列,采用DNAMAN软件对所有序列进行序列校正,使用Clustal X软件进行序列多重比对,运用MEGA 4.0软件计算遗传距离和构建系统发育树。... 目的 采用ITS序列对山姜属物种进行分子鉴别。方法 通过PCR扩增测序或Genbank下载获取山姜属物种的ITS序列,采用DNAMAN软件对所有序列进行序列校正,使用Clustal X软件进行序列多重比对,运用MEGA 4.0软件计算遗传距离和构建系统发育树。结果 山姜属24个物种43条序列比对后序列为509 bp,变异位点共122个。高良姜等19个物种的种间遗传距离大于其种内遗传距离,具有明显的条形码间距,可与其他物种区别;疏花山姜等5个物种种间遗传距离小于或等于种内距离,不能完全被鉴别开来。系统聚类树显示,大多数山姜属物种各自聚成一分支,单系性较好。结论 ITS序列对24个山姜属物种具有良好的鉴别能力,为该属物种鉴定研究提供了分子依据。 展开更多
关键词 山姜属 ITS 序列分析 分子鉴别
基于ITS条形码的维药克孜力乔古鲁克药材的分子鉴定研究 预览 被引量:2
18
作者 马双双 王学勇 +7 位作者 刘春生 肖瑶 赵保胜 张驰 李妍芃 王娟 田思敏 冯琼 《环球中医药》 CAS 2017年第6期687-691,共5页
目的对维药克孜力乔古鲁克药材(Paeoniae radix hybridae,PRH)的品种进行精准鉴别,同时将其原植物块根芍药Paeonia hybrida Pall.与窄叶芍药P.anomala L.和新疆芍药P.sinjiangensis K.Y.Pan进行区分,为保证药材来源的准确性提供科学... 目的对维药克孜力乔古鲁克药材(Paeoniae radix hybridae,PRH)的品种进行精准鉴别,同时将其原植物块根芍药Paeonia hybrida Pall.与窄叶芍药P.anomala L.和新疆芍药P.sinjiangensis K.Y.Pan进行区分,为保证药材来源的准确性提供科学依据。方法提取块根芍药的DNA,基于内部转录间隔区的核糖体DNA序列(ITS)进行PCR引物扩增并测序,并从Gen Bank数据库下载块根芍药和其原变种窄叶芍药和近缘种新疆芍药的ITS序列,采用DNAMAN、Editseq、Me GA5等软件,计算块根芍药种间、种内的Kimura 2-parameter(K 2-P)遗传距离,寻找块根芍药的特异位点,并构建Neighbor-joining(N-J)系统聚类树。结果块根芍药G+C含量范围为55.82%~56.45%,与另外两个种G+C含量未重叠;所有样本ITS序列的K 2-P遗传距离范围为0~0.026,其中种间遗传距离分布为0.014~0.026,大于块根芍药种内遗传距离0.000~0.012;通过序列比对分析,发现块根芍药与另外2个种有6个特异位点;N-J系统聚类树也将19个样品聚为两个大支系,所有块根芍药聚为一支,有84%支持率,其中中国地区分布的块根芍药聚为一小支,俄罗斯地区分布的块根芍药亲缘关系较远。结论经过遗传距离、系统聚类、特异位点分析等系统研究发现ITS序列能区分块根芍药与其原变种窄叶芍药和近缘种新疆芍药,可以应用于维药PRH的精准鉴别,并且在变种与原变种的区分方面有很大潜力。 展开更多
关键词 克孜力乔古鲁克 块根芍药 内转录间隔区 遗传多样性 分子鉴别
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基于DNA条形码技术鉴别5种列当属药用植物 预览 被引量:1
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作者 韩奇亨 汤健 +1 位作者 王晓琴 李旻辉 《中国现代中药》 CAS 2017年第7期917-923,959共8页
目的:建立一种快速、准确、标准化的5种列当属药用植物的DNA条形码鉴别方法。方法:采集5种列当属药用植物,所有样品进行总DNA提取,PCR扩增,并对扩增产物进行测序得到相应的序列,测序结果使用CONTIG、BioEdit、MEGA6.0软件进行分... 目的:建立一种快速、准确、标准化的5种列当属药用植物的DNA条形码鉴别方法。方法:采集5种列当属药用植物,所有样品进行总DNA提取,PCR扩增,并对扩增产物进行测序得到相应的序列,测序结果使用CONTIG、BioEdit、MEGA6.0软件进行分析,构建系统发育树。结果:测得5种列当属植物的ITS、rbcL、tmL-F和matK全长序列共200条,4种序列长度范围在364—1240bp,其中ITS、tmLiF和matK可将其鉴别出来。结论:rbcL序列无法有效鉴别5种列当属药用植物,trnL—F与ITS序列能够成功鉴别,可作为列当属植物的分子鉴别方法。 展开更多
关键词 分子鉴别 DNA条形码 列当属
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冬虫夏草的分子鉴定方法 被引量:1
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作者 段庆梓 尚柯 +1 位作者 张良 郑萍 《华西药学杂志》 CAS CSCD 2017年第2期205-207,共3页
目的 建立专属性强的冬虫夏草分子鉴定方法。方法 通过在ITS1区设计冬虫夏草的特异性引物,并进行不同条件的优化试验,建立冬虫夏草的酶联免疫吸附法(PCR)鉴别体系。结果 建立的酶联免疫吸附法(PCR)体系对冬虫夏草有164bp条带的扩增... 目的 建立专属性强的冬虫夏草分子鉴定方法。方法 通过在ITS1区设计冬虫夏草的特异性引物,并进行不同条件的优化试验,建立冬虫夏草的酶联免疫吸附法(PCR)鉴别体系。结果 建立的酶联免疫吸附法(PCR)体系对冬虫夏草有164bp条带的扩增,而伪品无扩增现象。结论 所建立的PCR体系能够准确、快速的鉴别冬虫夏草及其伪品。 展开更多
关键词 中药材 冬虫夏草 伪品 酶联免疫吸附法 分子鉴别
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