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河南省临床分离的553株结核分枝杆菌基因分型研究 认领
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作者 王少华 郑丹薇 +3 位作者 朱岩昆 马晓光 石洁 李辉 《河南预防医学杂志》 2020年第1期1-3,24共4页
目的了解河南省结核分枝杆菌基因类型分布及主要流行基因群。方法对河南省各地市分离的553株结核分枝杆菌临床分离株采用间隔区寡核苷酸分型方法(spoligotyping)进行基因分型。分型结果与SITVIT数据库进行比对,并用Bionumeric 7.6软件... 目的了解河南省结核分枝杆菌基因类型分布及主要流行基因群。方法对河南省各地市分离的553株结核分枝杆菌临床分离株采用间隔区寡核苷酸分型方法(spoligotyping)进行基因分型。分型结果与SITVIT数据库进行比对,并用Bionumeric 7.6软件进行基因聚类分析。结果 553株结核分枝杆菌Spoligotyping分型后与SITVIT数据库比对后得到46种不同的基因型,其中33种型别有对应的SIT编号,剩下的13种未在数据库找到与其匹配的型别。553株菌除了14(2.53%)株菌基因型没有对应的家族用"UN"表示外,余下536株菌分别属于4个不同的家族,其中Beijing家族共481株,占总数的86.98%;其次是T家族共53株,占总数的9.58%;MANU家族2株(0.36%)(MANU2);LAM家族1株(0.18%)(T5RUS1)。结论河南省结核分枝杆菌基因型别呈现多样性,北京家族和T家族为主要的流行基因群。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 基因分型 间隔区寡核苷酸分型
ERIC-PCR及全自动核糖体分型法鉴定不同来源的解朊金黄杆菌 认领
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作者 田敏 冯震 +3 位作者 曲瑞丹 黄静 戚稼禹 曹杰 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2020年第1期105-111,118共8页
目的:为了建立一种高效分离筛选高产蛋白质谷氨酰胺酶的解朊金黄杆菌的筛选方法,采用肠道基因间重复序列扩增(ERIC-PCR)和全自动核糖体分型方法对来自不同环境的33株解朊金黄杆菌(Chryseobacterium proteolyticum)进行分子分型研究。方... 目的:为了建立一种高效分离筛选高产蛋白质谷氨酰胺酶的解朊金黄杆菌的筛选方法,采用肠道基因间重复序列扩增(ERIC-PCR)和全自动核糖体分型方法对来自不同环境的33株解朊金黄杆菌(Chryseobacterium proteolyticum)进行分子分型研究。方法:采用ERIC国际通用引物对33株解朊金黄杆菌进行PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳检测,使用NTsys软件对电泳图进行聚类分析。同时,采用全自动核糖体分型方法对33株解朊金黄杆菌进行核糖体分型,采用Bionumeric软件对菌株进行聚类分析。结果:两种方法均可得到清晰的指纹图谱,可对33株解朊金黄杆菌进行分子分型。ERIC-PCR可扩增出3~9个100~10000 bp之间的条带,将菌株分为2个族群。全自动核糖体分型方法可将菌株分为2个亚型,每种亚型间菌株仍有细微差异。结论:同种菌株之间同源性达到99%以上,但仍在遗传进化关系上存在差异。来自同一地区的分离株有聚类成一类的趋势,且与菌株的产酶能力存在密切关联。研究结果表明聚类于族群Ⅱ的菌株基本都来自于河南,且该类群菌株的产酶能力明显高于族群Ⅰ。 展开更多
关键词 解朊金黄杆菌 ERIC-PCR 全自动核糖体分型 基因分型
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全基因组SNP分型策略及基因组预测方法的研究进展 认领
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作者 王琦 朱迪 +3 位作者 王宇哲 吴杰 胡晓湘 赵毅强 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期205-216,共12页
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是遗传学研究中重要的材料。近年来,全基因组SNP标记开发方法的发展使得研究者们能够以较低成本获得丰富的基因组标记,大大推动了基因组水平的相关研究。基因组预测从已知基因型数... 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是遗传学研究中重要的材料。近年来,全基因组SNP标记开发方法的发展使得研究者们能够以较低成本获得丰富的基因组标记,大大推动了基因组水平的相关研究。基因组预测从已知基因型数据和表型数据的个体建立训练模型,对未知表型的个体进行基因型和表型预测,在育种领域具有重要意义。全基因组SNP的分型策略结合基因组预测方法,构成了动物基因组选择的前沿。本文从这两个方面进行综述,以期为从事分子遗传学,尤其是复杂性状研究的研究者们提供参考。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 基因分型 基因组预测
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3种取材法检测尖锐湿疣皮损中人乳头瘤病毒及亚型分布的对比研究 认领
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作者 胡雯 康晓静 《实用皮肤病学杂志》 2020年第1期9-11,共3页
目的分析乌鲁木齐地区尖锐湿疣患者人乳头瘤病毒(HPV)基因型分布特征以及3种取材方法检测HPV感染的对比研究。方法对乌鲁木齐地区2016年12月-2018年6月在本院皮肤科门诊就诊的277例尖锐湿疣患者采用3种不同方法对皮损随机进行取样,用实... 目的分析乌鲁木齐地区尖锐湿疣患者人乳头瘤病毒(HPV)基因型分布特征以及3种取材方法检测HPV感染的对比研究。方法对乌鲁木齐地区2016年12月-2018年6月在本院皮肤科门诊就诊的277例尖锐湿疣患者采用3种不同方法对皮损随机进行取样,用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测HPV,并对其进行统计分析。结果 277例患者的标本中HPV检测阳性者219例,阳性率为79.06%。阳性率居前4位的HPV亚型分别为HPV6、11、16、42型,维汉以及男女患者之间HPV阳性检出率差异均无统计学意义,HPV感染主要是单一感染。HPV检测结果各年龄段之间的阳性率以20~29岁组阳性率最高,其次为30~39岁、40~49岁。用刮取分泌物法、疣体涂擦法和微创取疣体新鲜组织法进行取样,微创法对HPV检出率最高,刮取法与涂擦法对HPV检出率相比差异无统计学意义。结论乌鲁木齐地区尖锐湿疣患者HPV感染以低危型6和11型为主,好发于20~29年龄段,对不同的患者人群,针对自身情况选择最优的取材方法,可更大程度的提高诊断的准确性。 展开更多
关键词 尖锐湿疣 人乳头瘤病毒 基因分型 取材方法
肛门区鳞状细胞癌和鳞状上皮内瘤变组织中HPV感染型别的研究 认领
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作者 季月霞 武晓雷 +6 位作者 耿建祥 仲玉英 吴冲 吴昆岚 张金浩 梅静 赵雪 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第6期652-655,共4页
目的探讨肛门区鳞状细胞癌及肛门区上皮内瘤变(AIN)组织中人乳头瘤病毒(HPV)感染型别分布情况及临床意义。方法采用基因扩增结合基因芯片技术对28例肛门区鳞状细胞癌、20例低级别及34例高级别AIN组织标本进行23种HPV分型检测,并对受检... 目的探讨肛门区鳞状细胞癌及肛门区上皮内瘤变(AIN)组织中人乳头瘤病毒(HPV)感染型别分布情况及临床意义。方法采用基因扩增结合基因芯片技术对28例肛门区鳞状细胞癌、20例低级别及34例高级别AIN组织标本进行23种HPV分型检测,并对受检者行相关资料分析。结果28例肛门区鳞状细胞癌总的HPV检出率为82.14%(23/28),检出的均为高危型HPV(HRHPV),占检出HPV的100.00%(23/23);20例低级别AIN中,HPV检出率为55.00%(11/20),HRHPV占检出HPV的45.46%(5/11),34例高级别AIN中,HPV检出率为79.41%(27/34),HRHPV占检出HPV的85.19%(23/27)。结论肛门区鳞状细胞癌和AIN的发生、发展与HRHPV感染密切相关,随着AIN程度的增加,HRHPV所占比例也随之增加。临床医师应对高危人群开展肛门区HPV分型检测及细胞学检查。 展开更多
关键词 肛门 人乳头瘤病毒 鳞状细胞癌 上皮内瘤变 基因分型
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河北省散发腹泻病例诺如病毒基因特征分析 认领
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作者 白雪 张淑红 申志新 《国际病毒学杂志》 2020年第1期44-47,共4页
目的了解河北省散发腹泻病例诺如病毒的分子特征。方法收集2015年9月至2016年12月,河北省6市哨点医院散发腹泻病例粪便标本,用实时荧光反转录聚合酶链式反应(real-time reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)方法检... 目的了解河北省散发腹泻病例诺如病毒的分子特征。方法收集2015年9月至2016年12月,河北省6市哨点医院散发腹泻病例粪便标本,用实时荧光反转录聚合酶链式反应(real-time reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)方法检测标本中的诺如病毒。阳性标本进行基因片段扩增,并测序进行序列比对,确定基因型。对测序所得序列与基因库中诺如病毒参考序列进行同源比对,并做进化树分析。结果共采集腹泻便样本1240份,检出诺如病毒阳性样本58份,其中GI型5份,GII型53份。对诺如病毒阳性样品RNA进行测序,得到21条主要衣壳蛋白(VP1)区序列和17条RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA-polymerase,RdRP)区序列。经过与GenBank中诺如病毒参考序列比对,得到VP1区5种基因型,GII.4型最多(10/21),其次为GII.17型(4/21),其他还有GII.2型(3/21)、GII.3型(3/21)和GII.6型(1/21)。RdRP区有2种基因型,分别为GII.P17型(4/17)和GII.Pe型(13/17)。结论河北省感染诺如病毒散发腹泻病例以GII.4型和GII.17型为主,其他型别也有检出,需要进一步加强监测,及时发现新型毒株。 展开更多
关键词 诺如病毒 腹泻病例 基因分型
空肠弯曲菌脂寡糖核心区合成相关基因簇遗传多样性研究 认领
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作者 王佳奇 顾一心 +3 位作者 周贵兰 梁昊 张建中 张茂俊 《疾病监测》 CAS 2020年第1期11-15,共5页
目的分析我国空肠弯曲菌脂寡糖(LOS)核心区合成相关基因簇的序列特征,获得LOS核心区合成相关基因簇的特异DNA序列特征。方法选择132株空肠弯曲菌的全基因组序列,采用OrthoMCL软件,进行LOS核心区合成相关基因簇DNA的同源性分析并以特异... 目的分析我国空肠弯曲菌脂寡糖(LOS)核心区合成相关基因簇的序列特征,获得LOS核心区合成相关基因簇的特异DNA序列特征。方法选择132株空肠弯曲菌的全基因组序列,采用OrthoMCL软件,进行LOS核心区合成相关基因簇DNA的同源性分析并以特异型别基因簇的特异序列为靶位点,建立PCR方法,根据特异引物序列以及扩增产物大小,识别菌株LOS核心区合成相关基因簇的主要型别。结果在132株菌中,105株菌的LOS核心区合成相关基因簇的DNA序列属于14个已确定的LOS型别,27株菌为新型LOS,根据DNA的同源性可分为10个新型别,分别命名为CDC1~10。LOS合成相关基因序列中存在大量的多聚A/T、多聚G/C结构以及碱基的插入、缺失等突变,部分突变有可能导致LOS相关合成酶及转移酶的氨基酸序列发生改变,影响其抗原性。针对A、B、C、CDC8型LOS的特异DNA序列建立的PCR鉴定方法可在50株测序菌株的基因组中得到验证。结论10种LOS新型别的发现有利于更准确地鉴定空肠弯曲菌,解释LOS的抗原多样性特征。空肠弯曲菌的LOS核心区合成相关基因簇序列多样丰富,存在大量多聚结构和DNA序列的突变,是潜在的导致LOS抗原多样性的原因。主要LOS分型的PCR法可用于快速筛查5种特异LOS型,但仍需要更多菌株的验证。 展开更多
关键词 空肠弯曲菌 脂寡糖 遗传多态性 基因分型
人乳头瘤病毒亚型感染导致宫颈病变的调查 认领
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作者 杨慧红 杨永彬 《上海预防医学》 CAS 2020年第1期67-70,77,共5页
【目的】通过调查不同亚型人乳头瘤病毒(HPV)感染与宫颈病变的关系,探讨HPV分型检测在宫颈疾病筛查中的应用价值。【方法】收集2017年1月至2018年9月在上海市第一人民医院宫颈疾病门诊就诊HPV分型检测阳性的全部患者共1851例。以病理学... 【目的】通过调查不同亚型人乳头瘤病毒(HPV)感染与宫颈病变的关系,探讨HPV分型检测在宫颈疾病筛查中的应用价值。【方法】收集2017年1月至2018年9月在上海市第一人民医院宫颈疾病门诊就诊HPV分型检测阳性的全部患者共1851例。以病理学诊断为金标准进行阴道镜检查及宫颈组织活检,分析HPV各亚型的感染分布情况及其与宫颈病变的相互关系。【结果】在1851例患者中,以高危型人乳头瘤病毒(HR-HPV)感染为主,HPV16检出率居首位,其次为HPV52、HPV58、HPV53等,其中病理组织活检结果阳性患者共234例,检出宫颈上皮内瘤变(CIN)2级以上病变者77例。HPV16型感染者CIN2级以上比例为11.8%(45/380),高于HPV52、HPV58等其他高危亚型感染者2.4%(32/1328),差异有统计学意义(χ^2=61.60,P<0.001)。在年龄因素中,>35岁组HPV高危阳性比例为96.91%(1225/1264),高于≤35岁组94.38%(554/587),差异有统计学意义(χ^2=6.898,P=0.009)。HPV分型检测检出CIN1级以上病变为12.64%(234/1851),而液基薄层细胞学检测(TCT)检出CIN1级以上病变为8.59%(159/1851),TCT作为筛查手段其检出率低于HPV检测方法(χ^2=16.01,P<0.001)。【结论】HPV亚型感染依次以HPV16、HPV52、HPV58、HPV53、HPV18递减,HR-HPV感染与宫颈病变发生密切相关,且随着高危感染的升高,其宫颈病变程度也升高。HPV分型检测较TCT筛查宫颈病变检出率更高。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 基因分型 液基薄层细胞学 宫颈病变
某三级医院甲型流感患儿肺炎链球菌耐药分布及基因分型研究 认领
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作者 诸君 孔燕 +2 位作者 史箫笛 荣强全 徐飞 《河北医学》 CAS 2020年第1期169-173,共5页
目的: 探讨某三甲医院甲型流感患儿肺炎链球菌(SPN)耐药分布情况及基因分型研究。 方法: 选取2016年1月至2019年1月在南京市高淳人民医院就诊的476例甲型流感患儿为研究对象,采集患儿咽拭子或鼻拭子标本,采用奥普托欣实验及全自动微生... 目的: 探讨某三甲医院甲型流感患儿肺炎链球菌(SPN)耐药分布情况及基因分型研究。 方法: 选取2016年1月至2019年1月在南京市高淳人民医院就诊的476例甲型流感患儿为研究对象,采集患儿咽拭子或鼻拭子标本,采用奥普托欣实验及全自动微生物鉴定仪鉴定出肺炎链球菌后,采用琼脂稀释法通过全自动细菌鉴定/药敏系统进行药敏检测确认,采用聚合酶链式反应检测肺炎链球菌耐药基因分型情况。 结果: 476例甲型流感患儿咽拭子或鼻拭子标本中共分离出肺炎链球菌36株(7.56%),其中对红霉素耐药35株(97.22%),对克林霉素耐药31株(86.11%),对青霉素耐药36株(100.00%),对万古霉素耐药3株(8.33%),对阿奇霉素耐药30株(83.33%),对头孢他啶耐药32株(88.89%),对美罗培南耐药1株(2.78%),对四环素耐药36株(100.00%),对利奈唑胺耐药11株(30.56%),对莫西沙星耐药36株(47.22%);36株肺炎链球菌含pbp2B耐药基因32株(88.89%),含ermA耐药基因17株(47.22%),含mefB耐药基因21株(58.33%),含tetM耐药基因30株(83.33%);pbp2B、ermA、mefB、tetM基因突变与其耐药表型的测定均具有较高一致性,其中对β-内酯酰胺类抗生素青霉素、头孢他啶耐药的肺炎链球菌中pbp2B基因检测出率分别为88.89%、100.00%,对大环内酯类抗生素红霉素、阿奇霉素耐药的肺炎链球菌中ermA、mefB两种基因中的任一种或二者同时存在的耐药基因检出率分别为97.14%、93.33%,对四环素耐药的肺炎链球菌中tetM基因检出率为83.33%。 结论: 肺炎链球菌对青霉素、红霉素、四环素等抗生素的耐药性较高,其耐药性与相关耐药基因(pbp2B、ermA、mefB、tetM)的表达有关,加强病原学检测,便于合理选择抗菌药物。 展开更多
关键词 甲型流感 肺炎链球菌 耐药分布 基因分型
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深圳急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒临床和流行病学特征分析 认领
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作者 祝亚楠 张海龙 +6 位作者 陈龙 姚相杰 杨洪 韩敏 关心 何雅青 胡贵方 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第3期400-405,共6页
目的研究深圳地区急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒(HPeV)的临床和流行病学特征。方法收集2017年1月到2018年12月深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便标本(常规细菌鉴定为阴性)497份,实时荧光RT PCR方法检测HPeV,通过巢式PCR扩增VP3... 目的研究深圳地区急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒(HPeV)的临床和流行病学特征。方法收集2017年1月到2018年12月深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便标本(常规细菌鉴定为阴性)497份,实时荧光RT PCR方法检测HPeV,通过巢式PCR扩增VP3/VP1连接区片段进行分型,同时对患儿的流行病学和临床资料进行统计分析。结果497例患儿中,HPeV的阳性率为8.2%;男性HPeV阳性率为7.6%,女性HPeV阳性率为9.4%(χ2=0.491,P=0.501);0~6月龄患儿HPeV阳性率最高,且92.7%的HPeV阳性患儿月龄<24个月;深圳夏季(7~9月)HPeV的阳性率最高。HPeV阳性患儿主要临床表现为中热(38.1~39℃),腹泻频率平均>6次/d,以黏液便为主,常伴有呕吐,呕吐频率平均每天5次,呕吐物以胃内容物为主。HPeV阳性患儿较阴性患儿在有无呕吐和呕吐物性状差异具有统计学意义。本研究中共检测到HPeV 1(HPeV 1A和HPeV 1B亚型)、3、4、5、6和14在内的6种基因型,其中HPeV 1B(56.1%)为优势流行株,其次是HPeV 1A(17.1%)、HPeV 3(7.3%)、HPeV 4(7.3%)、HPeV 5(4.9%)、HPeV 6(4.9%)和HPeV 14(2.4%)。系统进化分析结果显示,大部分深圳分离株与兰州和广州来源的参考株核苷酸序列一致性高。结论本研究首次在深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便中检测到HPeV,且在2017年和2018年有稳定的感染率,检测到6种HPeV基因型别可能与急性肠胃炎相关,HPeV夏季检出率最高,好发于0~6个月患儿,可能是引起急性肠胃炎住院患儿呕吐胃内容物的病因。开展HPeV监测以更充分地掌握其在深圳地区的流行和临床特征,有助于进一步明确深圳地区住院患儿病毒性急性肠胃炎病原谱构成。 展开更多
关键词 人副肠孤病毒 急性肠胃炎 儿童 基因分型 系统进化分析
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杭州地区男性人乳头瘤病毒感染特征分析 认领
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作者 许生样 《医学信息》 2020年第5期137-139,共3页
目的分析杭州地区男性人乳头瘤病毒的基因型感染情况。方法采用分子杂交技术对2019年1月~9月送检杭州迪安医学检验中心的389例男性患者生殖器脱落细胞样本进行HPV23个亚型检测并对分型结果进行分析。结果389例男性患者样本中HPV阳性样本... 目的分析杭州地区男性人乳头瘤病毒的基因型感染情况。方法采用分子杂交技术对2019年1月~9月送检杭州迪安医学检验中心的389例男性患者生殖器脱落细胞样本进行HPV23个亚型检测并对分型结果进行分析。结果389例男性患者样本中HPV阳性样本177例,阳性检出率为45.50%(177/389),前7位感染亚型依次为6、11、52、58、53、51和66型。不同年龄段中≤20岁及≥71岁男性患者HPV阳性检出率较高。119例单一亚型感染的样本中,检出HPV亚型以6型和11型为主,分别占30.25%和21.85%。58例多重感染中,主要为二重感染,占74.14%(43/58),三重感染检出7例,四重感染检出4例,五重感染检出3例,六重感染检出1例。感染亚型中共发现29例为低危型+高危型复合感染,占50.00%,7例为低危型多重感染,占12.07%,22例为高危型多重感染,占37.93%。结论在杭州地区男性患者中,HPV感染的主要亚型为6、11、52、58、53、51和66型。单一亚型感染中以6型和11型为主,多亚型复合感染中以低危型多重感染最为罕见。 展开更多
关键词 男性 人乳头瘤病毒 基因分型
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妇科门诊患者宫颈感染人乳头瘤病毒基因分型检测特征分析 认领
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作者 张丽敏 吕虹 +5 位作者 陈柯霖 刘淑静 周金 谷愉愉 康熙雄 张国军 《中国实验诊断学》 2020年第1期121-124,共4页
目的探讨妇科门诊初诊妇女宫颈感染人乳头瘤病毒的基因分型情况。方法选取2014年1月至2016年6月北京地区来北京天坛医院就诊的10252例妇科门诊妇女宫颈上皮细胞标本,采用基因扩增及导流杂交技术进行21种HPV分型检测。结果妇科门诊妇女检... 目的探讨妇科门诊初诊妇女宫颈感染人乳头瘤病毒的基因分型情况。方法选取2014年1月至2016年6月北京地区来北京天坛医院就诊的10252例妇科门诊妇女宫颈上皮细胞标本,采用基因扩增及导流杂交技术进行21种HPV分型检测。结果妇科门诊妇女检出HPV感染1930例(感染率18.83%),主要感染类型为HPV-52、16和58,以单一感染及高危感染为主。在年龄分布上以<23岁感染率最高,为35.48%,>60岁感染率最低,为12.97%。与同期我院体检妇女检出情况相比,妇科门诊妇女检出率较高,二者主要感染型别均为HPV-52、16、58、CP8304、53和39。结论妇科门诊初诊妇女HPV感染率高于体检妇女,主要感染类别相近,高感染率呈现年轻化趋势。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 基因分型 宫颈癌
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我国西部地区宫颈癌患者HPV感染现状及影响因素分析 认领
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作者 周静 玛依努尔·尼亚孜 +3 位作者 周琦 王平 陈汶 李静 《中国妇产科临床杂志》 CSCD 北大核心 2020年第1期13-16,共4页
目的了解我国西部地区宫颈鳞状细胞癌(squamous cell carcinoma,SCC)和宫颈腺癌(cervical adenocarcinoma,CADC)患者中人乳头状瘤病毒(human papillomavirus,HPV)的分布情况,为该地区宫颈癌的防治提供流行病学依据。方法收集西部地区新... 目的了解我国西部地区宫颈鳞状细胞癌(squamous cell carcinoma,SCC)和宫颈腺癌(cervical adenocarcinoma,CADC)患者中人乳头状瘤病毒(human papillomavirus,HPV)的分布情况,为该地区宫颈癌的防治提供流行病学依据。方法收集西部地区新疆维吾尔自治区、重庆市及陕西省所选中心医院经病理诊断为宫颈上皮内瘤变2级及以上(CIN2~+)的病例,包括SCC及CADC。对纳入研究的病理蜡块进行诊断及HPV基因分型。结果我国西部地区SCC及CADC患者HPV感染率分别为97.4%、73.5%,HPV单一感染率分别为95.2%、74.4%,HPV多重感染率分别为2.1%、8.5%。SCC及CADC患者中高危型HPV感染率分别为96.8%、80.3%,其中HPV16型及HPV18型感染率均为最高,HPV16型阳性检出率分别为77.8%和50.4%,HPV18型阳性检出率分别为6.9%和20.5%。SCC患者及CADC患者低危型HPV感染率均明显低于高危型HPV检出率。绝经年龄、死产数及HPV感染情况在SCC及CADC患者中的分布差异具有统计学意义。结论我国西部地区SCC及CADC患者HPV感染率均较高,HPV感染在SCC中较在CADC中更多见。SCC及CADC患者中HPV感染的型别均以HPV16型、HPV18型为主,但HPV18型与CADC的关系比SCC更密切。对宫颈癌的预防工作应在促进宫颈癌筛查、推进HPV疫苗有效接种的同时,加强行为干预工作。 展开更多
关键词 人乳头状瘤病毒 宫颈肿瘤 基因分型
兔源多杀巴斯德杆菌基因分型研究 认领
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作者 黄树武 王静 +3 位作者 潘金春 陈梅玲 张钰 闵凡贵 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第2期71-76,共6页
目的对实验动物设施普通级新西兰兔分离的多杀巴斯德杆菌分离菌株进行基因分型研究。方法2000-2018年期间,基于分离培养和生化鉴定获得兔源多杀巴斯德杆菌14株,采用荚膜多重PCR方法和多位点序列分型方法对其进行荚膜血清型和基因型鉴定... 目的对实验动物设施普通级新西兰兔分离的多杀巴斯德杆菌分离菌株进行基因分型研究。方法2000-2018年期间,基于分离培养和生化鉴定获得兔源多杀巴斯德杆菌14株,采用荚膜多重PCR方法和多位点序列分型方法对其进行荚膜血清型和基因型鉴定。结果荚膜多重PCR分型结果显示,兔源多杀巴斯德杆菌存在荚膜血清型A型,占比71.4%(10/14),B型占比28.6%(4/14);多位点序列分型分为ST12、ST35、ST72、ST73、ST76和ST77共6种ST型,且首次发现了新ST76型和ST77型。结论兔源多杀巴斯德杆菌基因分型存在复杂多样性,荚膜血清型以A型为主,与呼吸道疾病相关,在生产繁育过程中应做好质量控制。 展开更多
关键词 多杀巴斯德杆菌 基因分型
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15种高危型人乳头瘤病毒核酸检测方法验证及人群感染情况调查 认领
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作者 王萌萌 孔凡虹 +5 位作者 宗曾艳 张水兰 阚丽娟 汤花梅 张秀明 熊丹 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第1期1-5,9共6页
目的 对实时荧光定量PCR(qPCR)方法检测高危型人乳头瘤病毒(HPV)核酸进行方法学评价,同时对本院妇产科15种高危型HPV感染情况进行调查。方法 参考相关文件对性能评价的要求,验证检测方法的重复性、准确度、测定下限和抗干扰能力。对2018... 目的 对实时荧光定量PCR(qPCR)方法检测高危型人乳头瘤病毒(HPV)核酸进行方法学评价,同时对本院妇产科15种高危型HPV感染情况进行调查。方法 参考相关文件对性能评价的要求,验证检测方法的重复性、准确度、测定下限和抗干扰能力。对2018年6月至2019年4月份深圳市罗湖区医学检验中心妇产科23 276例HPV送检标本检测结果进行分析。结果 HPV高危分型试剂盒批内及批间阴阳性符合率均≥95.00%,室间质评结果符合率为100.00%,临界阳性标本重复性检测的阳性检出率为100.00%。HPV不同型别之间及与多种生殖道常见微生物之间无交叉反应,红细胞浓度达4.00%对检测结果无内源性干扰。HPV总体感染率为19.77%。高危型HPV感染年龄呈“U”形分布,≤25岁年龄段感染率最高(28.70%),其次为≥56岁年龄段(27.63%)。总体感染率排名前5位的HPV基因型别依次为56、58、16、51、68型。各年龄组以单一感染最多见。结论 qPCR方法是一种快速、便捷、准确、稳定检测HPV的方法,适用于大规模的临床HPV样本检测。深圳市罗湖区HPV感染亚型分布存在地区特异性,5个年龄组不同HPV感染状况亦有差异。流行病学调查结果为HPV感染的临床诊断和防治提供参考依据。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 基因分型 性能验证 流行病学调查
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长沙市女性HPV高危基因型及年龄分布特征分析 认领
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作者 曾召琼 李萍 +2 位作者 谭凌卉 易帆 谢小兵 《预防医学》 2020年第1期91-93,共3页
目的了解长沙市女性人乳头瘤病毒(HPV)高危基因型及其年龄分布特征,为长沙市宫颈癌的预防和诊治提供依据。方法选取2018年于湖南中医药大学第一附属医院健康体检女性为研究对象,采集宫颈脱落细胞标本,采用流式荧光杂交法检测HPV及其基... 目的了解长沙市女性人乳头瘤病毒(HPV)高危基因型及其年龄分布特征,为长沙市宫颈癌的预防和诊治提供依据。方法选取2018年于湖南中医药大学第一附属医院健康体检女性为研究对象,采集宫颈脱落细胞标本,采用流式荧光杂交法检测HPV及其基因型的感染状况,分析各类感染基因型在不同年龄组的分布特征。结果共纳入4 806人,HPV阳性803例,阳性率为16.71%。其中单一感染611例,占76.09%,阳性率为12.71%;二重感染135例,占16.81%,阳性率为2.81%;多重感染57例,占7.10%,阳性率为1.19%。检出HPV阳性基因型共27种,各类基因型阳性1 075人次。其中高危基因型17种,阳性696例,阳性率为14.48%。常见高危基因型HPV52、HPV58、HPV16、HPV53和HPV18的检出率分别为3.50%、2.33%、1.96%、1.58%和0.60%;占基因型阳性总人次的比例分别为15.63%、10.42%、8.74%、7.07%和2.70%。年龄最小18岁,最大80岁,平均(40.25±11.87)岁。各年龄组间HPV阳性率差异无统计学意义(P>0.05)。HPV52在不同年龄组阳性率均最高。结论 2018年长沙市女性HPV阳性率和高危型HPV阳性率分别为16.71%和14.48%,以单一感染为主,各年龄段均以HPV52感染为主。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 基因分型 阳性率 年龄分布
铜陵市2815例女性高危型HPV感染状况及基因型分布特征 认领
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作者 胡志军 朱娟娟 +2 位作者 潘晓龙 赵哲 唐吉斌 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2020年第3期322-324,共3页
目的了解铜陵市女性高危型人乳头瘤病毒(HPV)感染状况及基因型分布特征,为女性宫颈癌的预防和治疗提供依据。方法收集2016年8月至2018年12月在本院就诊和体检的2815例女性为研究对象,留取宫颈脱落细胞标本,用荧光PCR法对其进行HPV基因... 目的了解铜陵市女性高危型人乳头瘤病毒(HPV)感染状况及基因型分布特征,为女性宫颈癌的预防和治疗提供依据。方法收集2016年8月至2018年12月在本院就诊和体检的2815例女性为研究对象,留取宫颈脱落细胞标本,用荧光PCR法对其进行HPV基因分型检测,并分析其分布特征。结果2815例标本中共检出HPV阳性714例,总感染率25.36%;感染率前3位的分别是HPV16、HPV52和HPV58型,以单一亚型感染为主。不同年龄组患者HPV感染率比较差异有统计学意义(χ^2=23.654,P<0.001)。住院、门诊和体检组女性HPV感染率分别为55.00%、26.21%和7.56%,3组间比较差异有统计学意义(χ^2=123.451,P<0.001)。结论铜陵市女性HPV感染率较高,以HPV16、HPV52和HPV58型感染为主,≥56岁人群感染率最高。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 基因分型 分布
新疆牛源大肠杆菌O157∶H7的分离鉴定及ERIC-PCR基因分型研究 认领
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作者 苏战强 张凌 +5 位作者 刘璐瑶 王栋 马晓玉 艾柯代·吐鲁洪 张毅 佟盼盼 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第1期182-189,共8页
为了了解牛源大肠杆菌(E.coli)O157∶H7在新疆地区的污染状况以及遗传多样性,探究不同地区分离菌株的遗传关系,为控制牛源E.coli O157∶H7的传播提供试验依据。将采集的样品在EC肉汤中进行增菌(37℃、180 r/min),接着将增菌液划线接种到... 为了了解牛源大肠杆菌(E.coli)O157∶H7在新疆地区的污染状况以及遗传多样性,探究不同地区分离菌株的遗传关系,为控制牛源E.coli O157∶H7的传播提供试验依据。将采集的样品在EC肉汤中进行增菌(37℃、180 r/min),接着将增菌液划线接种到SMAC平板上,37℃培养箱中过夜培养18 h左右。挑取SMAC平板上白色或无色单菌落接种MUG培养基,37℃培养18 h左右,将无荧光样品接种到SMAC平板上,37℃培养18 h左右,隔天挑取白色或无色单菌落进行PCR鉴定,具有rfbE和fliC基因条带的即为阳性菌株。将阳性菌株进行肠杆菌基因间重复共有序列扩增(ERIC-PCR)指纹图谱聚类分析,分析菌株之间的同源性关系。ERIC-PCR结果显示,相似性100%的菌株有3组。从伊犁地区分离到的菌株差异性最大,具有6种分型;其次是乌鲁木齐,具有4种分型。菌株来源多样性最多的在D簇,由此可见通过ERIC-PCR分型,可以进行溯源观察。ERIC-PCR能够区分特定采样点或物种的分离物,它能够证明从不同来源的菌株之间,存在着某些相似的ERIC特性,并聚集在同一个簇群中。该研究中筛选出的E.coli O157∶H7菌株具有广泛的遗传多样性,该方法对于检测不同物种间的细菌差异非常敏感。由此可见ERIC-PCR可以作为E.coli O157∶H7常规监测和鉴定的一个有效的工具。 展开更多
关键词 E.COLI O157∶H7 ERIC-PCR 遗传关系 基因分型
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上海市宝山区HPV基因分型的特征分析 认领
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作者 刘灵燕 郭竹英 +3 位作者 胡传玺 耿朝晖 梅虹 钟政荣 《蚌埠医学院学报》 CAS 2020年第3期384-387,共4页
目的:了解上海市宝山区妇女人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)感染率及其与年龄的关系,以及各亚型的分布情况,为该地区宫颈癌防治提供依据。方法:采用流式荧光杂交法检测7709例女性宫颈脱落细胞27种HPV基因型,分析HPV感染的阳性... 目的:了解上海市宝山区妇女人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)感染率及其与年龄的关系,以及各亚型的分布情况,为该地区宫颈癌防治提供依据。方法:采用流式荧光杂交法检测7709例女性宫颈脱落细胞27种HPV基因型,分析HPV感染的阳性率和年龄段的关系,及HPV亚型感染的分布特点。结果:7709例标本中HPV阳性1237例,感染率为16.05%,27种HPV亚型均有检出。其中高危型833例,感染率为10.81%,前5位高危型阳性HPV依次为HPV52、16、53、58、39;低危型254例,感染率为3.29%,前5位低危型HPV依次为HPV61、43、55、81、6。HPV感染人群主要分布在41~50岁和31~40岁年龄组,各年龄组感染率差异有统计学意义(P<0.01)。在1237例HPV阳性标本中,以单基因型感染为主,双重感染次之,少数人群存在多重感染。结论:HPV以单一高危型感染为主,常见高危型为HPV52、16、53、58、39。41~50岁为感染高峰期。宫颈癌的筛查、防治以及疫苗的开发应用需同时考虑HPV基因分型和年龄因素。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 基因分型 感染率
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洛阳某猪场猪传染性胸膜肺炎放线杆菌的分离鉴定 认领
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作者 李凯明 董发明 +3 位作者 刘守川 刘杰 梁立钦 李凯强 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第4期1241-1249,共9页
为确定洛阳某猪场疑似猪传染性胸膜肺炎的病原种类及其血清型,为其临床科学防疫和合理用药提供参考方案,本试验无菌采集了病猪肺脏等病料,采用病菌培养后形态观察、革兰氏染色、生理生化特性试验、PCR诊断等技术对病原菌进行实验室分离... 为确定洛阳某猪场疑似猪传染性胸膜肺炎的病原种类及其血清型,为其临床科学防疫和合理用药提供参考方案,本试验无菌采集了病猪肺脏等病料,采用病菌培养后形态观察、革兰氏染色、生理生化特性试验、PCR诊断等技术对病原菌进行实验室分离鉴定,通过基因测序和同源性分析方法对其进行确诊,通过动物攻毒试验和药敏试验分析分离菌株的致病性和耐药性,采用5对分型引物对分离菌进行基因分型以确定病原菌血清型。结果显示,分离菌2007菌落形态为光滑、透明、边缘整齐、圆形、隆起的小菌落,革兰氏染色特征为阴性杆菌且呈多型性,具有猪传染性胸膜肺炎放线杆菌(APP)的典型培养特征,且生化结果符合猪传染性胸膜肺炎放线杆菌的生化特性。同源性分析结果显示,分离菌株2007与猪传染性胸膜肺炎放线杆菌菌株FJ848573.1同源性为99.4%,说明分离株2007是猪传染性胸膜肺炎放线杆菌。动物攻毒试验结果显示,分离菌株2007对小鼠有强致病性。药敏试验结果显示,分离株2007对泰妙菌素、氨苄西林和头孢噻呋钠等高敏,对替米考星、红霉素、氟苯尼考等20种抗菌药完全耐药,对34种抗生素的耐药率高达76.5%,具有较强的多重耐药性。分离菌2007基因分型扩增到目的基因片段与血清型5型结果相符。本试验结果为发病猪场提出了解决该病的具体防治措施,并最终获得了良好的效果,为猪传染性胸膜肺炎放线杆菌临床耐药折点的制定提供了一些参考。 展开更多
关键词 猪传染性胸膜肺炎 药敏试验 基因分型 分离鉴定
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