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植物响应低温胁迫转录组测序研究进展
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作者 张健 唐露 +1 位作者 冉启凡 黄德均 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1849-1866,共18页
低温胁迫是限制植物生长发育和地理分布最主要的环境因子之一,影响植物细胞膜系统、抗氧化系统、光合作用、次生代谢等诸多方面,对农业生产和发展有严重影响。因此,揭示作物在冷胁迫下的生理及分子机制是十分必要的,这有助于培育耐寒作... 低温胁迫是限制植物生长发育和地理分布最主要的环境因子之一,影响植物细胞膜系统、抗氧化系统、光合作用、次生代谢等诸多方面,对农业生产和发展有严重影响。因此,揭示作物在冷胁迫下的生理及分子机制是十分必要的,这有助于培育耐寒作物品种,从而减少生产损失,扩大作物种植面积,具有重要的生产价值和经济效益。目前,基于RNA-seq技术进行植物低温胁迫分子机制深度解析在拟南芥、水稻、油菜、茶树、小麦、烟草、高粱等重要作物上得到了发展应用。本研究综述了近年来植物在低温胁迫或低温适应过程中的转录组学研究现状,以期为高通量测序技术在植物抗性研究方面提供方法借鉴和理论基础。 展开更多
关键词 低温胁迫 转录组测序 差异表达基因 代谢途径 RNA
miR-301b-3p通过靶向SATB2抑制肝癌细胞增殖 预览
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作者 林辉 周懿 +3 位作者 周燚 李慧芬 杨远 侯克柱 《贵州医药》 CAS 2020年第2期171-174,共4页
目的研究miR-301b-3p在肝细胞癌中的表达情况及其对肝癌细胞增殖的影响。方法采用qRT-PCR检测miR-301b-3p在肝癌组织和细胞系中的表达情况。采用免疫印迹法和荧光素酶报告子法研究miR-301b-3p与SATB2蛋白的相互作用关系。采用CCK8实验... 目的研究miR-301b-3p在肝细胞癌中的表达情况及其对肝癌细胞增殖的影响。方法采用qRT-PCR检测miR-301b-3p在肝癌组织和细胞系中的表达情况。采用免疫印迹法和荧光素酶报告子法研究miR-301b-3p与SATB2蛋白的相互作用关系。采用CCK8实验评估细胞的增殖能力。结果在本研究中,qRT-PCR结果证实miR-301b-3p在HCC组织和肝癌细胞系中下调表达。将miR-301b-3p mimic转染至HepG2细胞后,HepG2细胞的增殖能力显著被抑制。结合生物信息学分析、荧光素酶报告实验、qRT-PCR以及免疫印迹实验中证实,SATB2是miR-301b-3p在肝癌细胞中的直接作用靶点。在HepG2细胞中,miR-301b-3p抑制SATB2的mRNA和蛋白表达水平。结论本研究结果表明,miR-301b-3p通过抑制SATB2调控肝癌细胞增殖,提示miR-301b-3p可能是肝癌治疗的一个潜在的靶点。 展开更多
关键词 肝细胞癌 增殖 SATB2 RNA
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核酸农药——极具潜力的新型植物保护产品
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作者 王治文 高翔 +3 位作者 马德君 钟珊 刘西莉 席真 《农药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期681-691,共11页
核酸农药是一类可以特异性地结合靶标生物中特定基因转录的信使RNA的多核苷酸,通过靶标生物体内天然存在的RNA干扰系统沉默相应基因的表达,从而干扰靶标生物的正常生长及其对寄主植物的危害,最终达到保护植物的目的。相对于传统农药而言... 核酸农药是一类可以特异性地结合靶标生物中特定基因转录的信使RNA的多核苷酸,通过靶标生物体内天然存在的RNA干扰系统沉默相应基因的表达,从而干扰靶标生物的正常生长及其对寄主植物的危害,最终达到保护植物的目的。相对于传统农药而言,核酸农药因其具有特异性较强、开发成本较低、安全绿色等优点正受到越来越多的关注。本文将围绕核酸农药的防治原理、优势特点及应用现状等方面进行综述,详细介绍以靶标基因为导向研制核酸农药的高效筛选方法及其研究进展,总结分析核酸农药未来发展方向和趋势,以期为核酸农药的进一步研发创制和推广应用提供参考。 展开更多
关键词 核酸农药 绿色农药 RNA 双链RNA 干扰RNA 靶标基因
女性躯体形式障碍患者外周血中miR16、miR182表达与临床特征关系 预览
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作者 宋晋 马子龙 +1 位作者 陈绘景 王强 《中国计划生育学杂志》 2019年第11期1477-1481,共5页
目的:探究女性躯体形式障碍(SFD)患者外周血浆中miR 16、miR 182表达及与临床特征关系。方法:选取2017年3月-2018年12月本院诊治的女性SFD患者115例(病例组),同期女性健康体检者118例为对照组。实时荧光定量聚合酶链反应法检测两组血浆m... 目的:探究女性躯体形式障碍(SFD)患者外周血浆中miR 16、miR 182表达及与临床特征关系。方法:选取2017年3月-2018年12月本院诊治的女性SFD患者115例(病例组),同期女性健康体检者118例为对照组。实时荧光定量聚合酶链反应法检测两组血浆miR 16、miR 182表达水平;分析病例组miR 16、miR 182表达与临床特征关系;利用症状自评量表(SCL 90)均分检测病例组,分析发病危险因素。结果:病例组外周血浆miR 16(1.57±0.38)、miR 182(1.70±0.41)表达水平均高于对照组(1.02±0.30、1.09±0.33),且表达水平与抑郁、焦虑因子有关(均P<0.05);SCL 90均分病例组(2.84±0.65分)高于对照组(1.72±0.39分),miR 16、miR 182表达水平与SCL 90均分呈正相关(P<0.05);miR 16、miR 182、SCL 90均分均是影响女性发生SFD的危险因素(P<0.05)。结论:miR 16、miR 182在女性SFD患者外周血浆中均表达上调,有望成为诊断女性SFD的临床指标。 展开更多
关键词 躯体形式障碍 RNA 16 RNA 182 临床特征
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NaIO4氧化–深度测序技术的优化用于检测微量RNA样品中小RNA 3′末端甲基化修饰
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作者 薛皖强 侯丽 +1 位作者 李荣红 吴立刚 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2019年第9期1779-1786,共8页
2′-O-甲基化是存在于多种小RNA 3′末端的修饰,具有重要的生物学功能。目前高通量研究小RNA 3′末端2′-O-甲基化的方法主要是NaIO4氧化处理结合小RNA深度测序,但该方法需要3μg总RNA,难以用于研究少量细胞中小RNA的3′末端甲基化修饰... 2′-O-甲基化是存在于多种小RNA 3′末端的修饰,具有重要的生物学功能。目前高通量研究小RNA 3′末端2′-O-甲基化的方法主要是NaIO4氧化处理结合小RNA深度测序,但该方法需要3μg总RNA,难以用于研究少量细胞中小RNA的3′末端甲基化修饰。该研究通过调整NaIO4氧化处理的条件以及测试有无甘油终止氧化反应对小RNA文库构建的影响,优化了适用于微量RNA的氧化条件,实现对10 ng小鼠睾丸样本总RNA中的小RNA 3′末端甲基化修饰的深度测序检测,建立了用于检测微量RNA样品中小RNA 3′末端甲基化修饰的方法,为检测少量细胞中小RNA的3′末端甲基化修饰提供了有效方法。 展开更多
关键词 RNA PIRNA 3′末端2′-O-甲基化 RNA修饰 深度测序
寄主与病原物互作中小RNA转运机制及应用 预览
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作者 乔露露 赵弘巍 牛冬冬 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期1-5,共5页
灰霉病菌与拟南芥互作中会分泌小RNA进入植物细胞,通过与拟南芥Argonaute 1(AGO1)蛋白相结合,利用寄主的RNA干扰(RNA interference,RNAi)机制沉默寄主的免疫相关基因,从而抑制拟南芥的免疫反应。相反,寄主也会将小RNA转移到病原菌中,从... 灰霉病菌与拟南芥互作中会分泌小RNA进入植物细胞,通过与拟南芥Argonaute 1(AGO1)蛋白相结合,利用寄主的RNA干扰(RNA interference,RNAi)机制沉默寄主的免疫相关基因,从而抑制拟南芥的免疫反应。相反,寄主也会将小RNA转移到病原菌中,从而抑制病原菌的致病力。最近研究发现拟南芥可以通过类似于外泌体的胞外囊泡(extracellular vesicles,EV)将小RNA分泌到真菌细胞中。这些含有寄主小RNA的胞外囊泡在侵染部位积累并被真菌细胞吸收,并转运寄主小RNA诱导沉默真菌关键的致病因子,降低灰霉病菌的致病力。因此,在与病原菌的相互进化中,拟南芥通过外泌体介导的跨界RNA干扰抑制病原菌的侵染。本综述回顾了在多种植物-病原物互作体系中开展的小RNA穿梭转运研究,总结了可能的转运机制,讨论了以跨界RNA干扰技术为基础研发的新型环境友好型“RNA杀菌剂”的可靠性和局限性,对于读者了解新型作物病害防治技术具有重要意义。 展开更多
关键词 灰霉病菌 拟南芥 免疫反应 胞外囊泡 RNA 寄主诱导基因沉默
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基于转录组测序探索创伤弧菌MO6-24/O小RNA 预览
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作者 周亚男 李宗城 +3 位作者 张晓彤 胡成进 应晓敏 曹源 《生物技术通讯》 CAS 2019年第3期354-359,共6页
目的:基于转录组测序注释,探索创伤弧菌MO6-24/O小RNA(sRNA)。方法:在海洋培养基2216E中培养创伤弧菌MO6-24/O,收集从对数生长期到静止期不同时间点的细菌,提取细菌RNA,通过富集sRNA以及去除核糖体RNA进行建库和测序,然后将读段匹配到... 目的:基于转录组测序注释,探索创伤弧菌MO6-24/O小RNA(sRNA)。方法:在海洋培养基2216E中培养创伤弧菌MO6-24/O,收集从对数生长期到静止期不同时间点的细菌,提取细菌RNA,通过富集sRNA以及去除核糖体RNA进行建库和测序,然后将读段匹配到创伤弧菌MO6-24/O基因组并进行注释,最后进行验证。结果:发现59个顺式编码sRNA、102个反式编码sRNA,并进行了部分验证。结论:鉴定出创伤弧菌MO6-24/OsRNA。 展开更多
关键词 创伤弧菌 RNA 转录组测序
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奶牛子宫炎性腔液外泌体小RNA分布和组成分析 预览
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作者 田凤 常震宇 +9 位作者 丁进 李成忠 冯妍 封紫嫣 倪和民 盛熙晖 齐晓龙 邢凯 郭勇 王相国 《北京农学院学报》 2019年第4期95-99,共5页
【目的】筛选奶牛子宫内膜炎诊断新型标志。【方法】采用贝博试剂盒分别从健康奶牛、患子宫内膜炎奶牛的子宫腔液中分离外泌体,透射电子显微镜检测外泌体形态和粒径大小,蛋白免疫印迹法检测外泌体蛋白标记CD9的表达,Trizol提取外泌体内R... 【目的】筛选奶牛子宫内膜炎诊断新型标志。【方法】采用贝博试剂盒分别从健康奶牛、患子宫内膜炎奶牛的子宫腔液中分离外泌体,透射电子显微镜检测外泌体形态和粒径大小,蛋白免疫印迹法检测外泌体蛋白标记CD9的表达,Trizol提取外泌体内RNA,Agilent 4200生物分析仪检测RNA的分布与组成。【结果】透射电子显微镜下奶牛子宫腔液外泌体呈囊泡形,有完整的膜结构,粒径大小为50~150nm之间;蛋白免疫印迹法检测到外泌体内均有CD9表达;生物分析仪检测显示子宫内膜炎症改变了子宫腔液内小RNA长度分布和组成。【结论】子宫腔液中小RNA变化可以作为奶牛子宫内膜炎症诊断的新型标志。 展开更多
关键词 奶牛 子宫内膜炎 外泌体 RNA
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肥胖导致男性不育的表观遗传机制研究进展
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作者 王翠艳(综述) 刘红英(审校) 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1036-1039,共4页
肥胖引发表观遗传改变可导致男性出现不育表型。关于肥胖与男性不育的关系问题,早期研究多集中于内分泌方面。近年研究发现肥胖还可以引发机体表观遗传改变,如DNA甲基化,残余组蛋白修饰,小RNA等,影响精子成熟发育。DNA甲基化是胞嘧啶-磷... 肥胖引发表观遗传改变可导致男性出现不育表型。关于肥胖与男性不育的关系问题,早期研究多集中于内分泌方面。近年研究发现肥胖还可以引发机体表观遗传改变,如DNA甲基化,残余组蛋白修饰,小RNA等,影响精子成熟发育。DNA甲基化是胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤二核苷酸的胞嘧啶残基上的调节标记,肥胖导致DNA甲基化异常,并改变mRNA表达丰度,还可以影响印记基因表达出现印记基因病。残余组蛋白修饰方式包括甲基化、乙酰化等,它们可以相互作用或协同作用,以保证精子正常生长发育。肥胖可以改变甲基化酶及乙酰化酶活性,直接影响残余组蛋白的甲基化和乙酰化;还可以影响精子小RNA的表达,导致精子缺陷。本文就肥胖引起的表观遗传学改变及导致男性不育的作用机制做逐一综述。 展开更多
关键词 肥胖 男性不育 表观遗传 DNA甲基化 组蛋白修饰 RNA
溶藻弧菌ZJ-T小RNA srvg23535基因突变株的构建及其功能初探
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作者 邓益琴 陈偿 +4 位作者 苏友禄 程长洪 马红玲 刘松林 冯娟 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期829-841,共13页
【背景】小RNA被证实对细菌遗传变异、生长繁殖、致病性等具有重要的调控作用,但是在机会致病菌——溶藻弧菌(Vibrioalginolyticus)中研究较少。本实验室前期通过转录组测序和Northern Blot鉴定得到溶藻弧菌ZJ-T中小RNA srvg23535。【... 【背景】小RNA被证实对细菌遗传变异、生长繁殖、致病性等具有重要的调控作用,但是在机会致病菌——溶藻弧菌(Vibrioalginolyticus)中研究较少。本实验室前期通过转录组测序和Northern Blot鉴定得到溶藻弧菌ZJ-T中小RNA srvg23535。【目的】初探小RNA srvg23535对溶藻弧菌生物学特性的影响。【方法】利用同源重组技术构建小RNA srvg23535的缺失突变株,并对野生株和srvg23535突变株的菌落形态、运动性、胞外蛋白酶分泌、H2O2和Cu2+的压力感应、铁吸收利用、抗生素抗性以及生长代谢等生物学特性进行比较研究。【结果】通过对溶藻弧菌小RNA srvg23535基因缺失突变株的生物学特性分析表明,小RNA srvg23535缺失后,对溶藻弧菌菌落形态、运动性、胞外蛋白酶分泌、H2O2和Cu2+的压力感应、铁吸收利用、抗生素抗性以及多数测定的碳源、氮源代谢的影响不显著;但突变株对D-海藻糖(D-trehalose)的代谢减弱,对果胶(Pectin)、丙氨酸-谷氨酰胺(Ala-Gln)的代谢增强,并可利用丙氨酸-天冬氨酸(Ala-Asp)为氮源。【结论】小RNA srvg23535参与调控溶藻弧菌对D-海藻糖(D-trehalose)、果胶(Pectin)、丙氨酸-谷氨酰胺(Ala-Gln)和丙氨酸-天冬氨酸(Ala-Asp)的代谢,这将为获取srvg23535调控靶标基因,进而阐明其与靶标基因的相互作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 溶藻弧菌 RNA srvg23535 缺失突变株 生物学特性
植物花粉败育的研究进展 预览
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作者 张鹏飞 张道荣 +5 位作者 凌冬 刘先斌 周芳菊 汤清益 孙华卫 唐清 《湖北农业科学》 2019年第23期10-15,共6页
雄蕊心皮化、雄蕊受损和花粉发育异常等多种因素都可以导致植物雄性不育,形成败育的花粉粒。综述了在雄性不育中植物花粉败育与呼吸作用、膜脂过氧化、物质代谢和小RNA等的关系。
关键词 花粉败育 呼吸作用 膜脂过氧化 物质代谢 RNA
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无先兆偏头痛患者血小板miRNA表达谱分析 预览
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作者 潘建青 张玲玲 +3 位作者 吴军 孙武平 杨少敏 杨春水 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期374-377,共4页
目的分析无先兆偏头痛患者的血小板microRNA(miRNA)表达特征,寻找与偏头痛发作相关的差异表达miRNA。方法收集5例无先兆偏头痛患者和5例健康对照的抗凝全血10 mL,提取血小板RNA后通过BGISEW-500 sequencing技术进行测序。将clean reads... 目的分析无先兆偏头痛患者的血小板microRNA(miRNA)表达特征,寻找与偏头痛发作相关的差异表达miRNA。方法收集5例无先兆偏头痛患者和5例健康对照的抗凝全血10 mL,提取血小板RNA后通过BGISEW-500 sequencing技术进行测序。将clean reads比对到参考基组和miRNA数据库,定量各样品miRNA的表达情况。使用DEGseq对差异miRNA进行筛选,得到差异表达miRNA后对差异表达miRNA的靶基因进行GO功能分析以及KEGG信号通路富集分析。结果通过比较样品之间的表达量,总共筛选到821个差异表达的miRNA,这些差异表达miRNA的靶基因主要涉及到:轴突发育等细胞组成;突触前等神经元相关的生物学过程;细胞黏附分子结合等分子功能。结论与健康组相比,无先兆偏头痛患者血小板miRNA表达模式发生明显改变,这些miRNA主要参与轴突发育以及一些细胞信号传导途径。 展开更多
关键词 偏头痛 RNA
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基于TNFα处理的小鼠原代血管内皮细胞鉴定心血管疾病相关的NF-κB调控的基因和microRNA
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作者 Hui ZHU Yun LI +3 位作者 Mao-xian WANG Ju-hong WANG Wen-xin DU Fei ZHOU 《浙江大学学报:B卷英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第10期803-817,共15页
目的:鉴定与心血管疾病相关的核因子κB(NF-κB)调控的基因和小RNA(micro RNA),探讨疾病发生发展的机制。创新点:构建心血管疾病相关的NF-κB调控网络。方法:基于NF-κB转录活性差异的小鼠原代血管内皮细胞模型,采用基因芯片(Genechip)... 目的:鉴定与心血管疾病相关的核因子κB(NF-κB)调控的基因和小RNA(micro RNA),探讨疾病发生发展的机制。创新点:构建心血管疾病相关的NF-κB调控网络。方法:基于NF-κB转录活性差异的小鼠原代血管内皮细胞模型,采用基因芯片(Genechip)检测NF-κB调控的基因和microRNA。再通过实时荧光定量聚合酶链反应(q RT-PCR)和生物信息学方法进行差异基因和microRNA的筛选、验证、功能注释,从而发现与心血管疾病相关的NF-κB调控的基因和microRNA。结论:在肿瘤坏死因子α(TNFα)处理的小鼠原代血管内皮细胞中:NF-κB调控77个基因,其中45个基因上调,32个基因下调。NF-κB还在TNFα处理的He La细胞中调控其中10个基因。通过q RT-PCR验证了NF-κB上调Egr1、Tnf和Btg2的表达。基因功能注释表明,许多NF-κB调节的基因聚类到经典的NF-κB参与的生物学过程。在TNFα处理的小鼠原代血管内皮细胞中还发现:NF-κB调控26个microRNA,其中21个上调,5个下调。进一步研究发现,7个NF-κB调控的microRNA还可能调控9个NF-κB调控的基因。最后通过检索数据库发现,5个NF-κB调控的基因和12个NF-κB调控的microRNA与心血管疾病相关。因此,本研究提升了对心血管疾病进展分子机制的理解。 展开更多
关键词 心血管疾病 核因子ΚB RNA 内皮细胞
国际生物多样性中心专家组到中国热科院访问交流 预览
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作者 彭军 《世界热带农业信息》 2019年第5期25-26,共2页
近期,受中国热科院环植所邀请,国际生物多样性中心Guy Blomme,Inge Van den Bergh,Nicolas Roux和SijunZheng博士4位专家来中国热科院开展为期一周的学术交流研讨。来访期间,双方对联合主持的国家自然科学基金国际(地区)合作研究项目“... 近期,受中国热科院环植所邀请,国际生物多样性中心Guy Blomme,Inge Van den Bergh,Nicolas Roux和SijunZheng博士4位专家来中国热科院开展为期一周的学术交流研讨。来访期间,双方对联合主持的国家自然科学基金国际(地区)合作研究项目“小RNA调控香蕉-枯萎菌互作的分子机制研究及抗枯育种分子设计”进行了中期总结。 展开更多
关键词 生物多样性中心 专家组 中国 合作研究项目 学术交流 分子设计 分子机制 RNA
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基于高通量测序发掘番木瓜果实成熟相关miRNA 预览
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作者 申艳红 姜涛 +3 位作者 刘璐琪 石天磊 赵湾湾 陈晓静 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1473-1482,共10页
【目的】番木瓜是典型的呼吸跃变型果实,外源乙烯处理使番木瓜呼吸跃变提前,促进果实成熟。分离番木瓜果实成熟相关miRNA,为深入了解呼吸跃变型果实的成熟分子机制奠定基础。【方法】利用高通量测序技术对乙烯(ETH)、1-MCP和清水对照(CG... 【目的】番木瓜是典型的呼吸跃变型果实,外源乙烯处理使番木瓜呼吸跃变提前,促进果实成熟。分离番木瓜果实成熟相关miRNA,为深入了解呼吸跃变型果实的成熟分子机制奠定基础。【方法】利用高通量测序技术对乙烯(ETH)、1-MCP和清水对照(CG)处理的番木瓜果实进行miRNA和转录组高通量测序,然后对测序获得数据进行生物信息学分析,进行miRNA鉴定和靶基因预测,并与转录组测序结果进行关联分析。【结果】乙烯、1-MCP和对照处理分别获得10734196、16486803和16067290条纯净序列,共鉴定出523个miRNA。其中,已知miRNA个数为1-MCP(303)、CG(214)和ETH(239),新miRNA个数为1-MCP(184)、CG(188)和ETH(114)。与对照相比,在乙烯处理中上调和下调表达的miRNA分别是123和72条。靶基因预测共获得5053个靶基因,KEGG功能富集分析显示它们参与了戊糖、葡萄糖醛酸转换、淀粉和蔗糖代谢、卟啉和叶绿素代谢、类胡萝卜素合成等代谢途径。筛选出的番木瓜果实成熟衰老相关候选miRNA,包含4个果实软化调控相关miRNA(miR167-y、miR4993-x、miR3946-x和miR5059-x)、3个果实颜色调控相关miRNA(miR4993-x、miR815-y和miR7810-x)、3个激素调控相关miRNA(miR4993-x、miR8004-x和miR9722-x)和4个转录因子调控相关miRNA(miR5641-y、miR9722-x、miR838-y和miR319-y)。【结论】筛选的番木瓜果实成熟衰老相关miRNA为今后果实成熟衰老调控网络研究提供了可能的线索。 展开更多
关键词 番木瓜 乙烯 RNA 高通量测序 果实
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番茄斑驳花叶病毒海南分离物全基因组序列分析 预览
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作者 刘晓璇 李威霖 +1 位作者 张彤 周国辉 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2019年第1期139-144,共6页
本研究采用小RNA 深度测序及RT-PCR 检测技术鉴定海南省陵水县冬种番茄(圣女果)病株受到烟草花叶病毒属的番茄斑驳花叶病毒(Tomato mottle mosaic virus,ToMMV)侵染。通过机械摩擦接种,将该病原病毒保存于本生烟植株上,命名为番茄斑驳... 本研究采用小RNA 深度测序及RT-PCR 检测技术鉴定海南省陵水县冬种番茄(圣女果)病株受到烟草花叶病毒属的番茄斑驳花叶病毒(Tomato mottle mosaic virus,ToMMV)侵染。通过机械摩擦接种,将该病原病毒保存于本生烟植株上,命名为番茄斑驳花叶病毒海南分离物(ToMMV-HN)。采用RT-PCR 分段扩增获得了该病毒分离物的全基因组序列。测序结果表明,该病毒分离物基因组全长6399 nt,含有4 个开放阅读框,编码4 种蛋白,与已报道的ToMMV9 个分离物核苷酸和编码产物氨基酸序列相似性分别为98.0%~100%和99.2%~100%;与同属的番茄花叶病毒(Tomatomosaic virus,ToMV)、番茄棕色皱果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,TBRFV)和烟草花叶病毒(Tobacco mosaicvirus,TMV)代表分离物核苷酸序列相似性分别为84.7%、80.7%和79.0%。系统进化分析结果表明,ToMMV-HN 与该病毒中国西藏和云南辣椒分离物亲缘关系最近,与美国加州和南卡州番茄分离物次之,与西班牙和巴西番茄分离物亲缘关系相对较远。本研究为我国番茄病毒病诊断和防控,尤其是抗病品种选育提供了基础资料。 展开更多
关键词 番茄斑驳花叶病毒 RNA 深度测序 病毒基因组序列
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吉林省塞内卡病毒流行情况监测预警分析 预览
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作者 穆国冬 卢松岩 +1 位作者 张忠湛 林翰 《吉林畜牧兽医》 2019年第12期73-74,共2页
塞内卡病毒病是由A 型塞内卡病毒(SVA)引起的一种主要感染猪的病毒性传染病。A 型塞内卡病毒又被称为塞内卡山谷病毒(SVV),是小RNA 病毒科塞内卡病毒属的唯一成员。2002 年SVA 原型毒株由美国遗传治疗公司科研人员从人胚胎视网膜细胞中... 塞内卡病毒病是由A 型塞内卡病毒(SVA)引起的一种主要感染猪的病毒性传染病。A 型塞内卡病毒又被称为塞内卡山谷病毒(SVV),是小RNA 病毒科塞内卡病毒属的唯一成员。2002 年SVA 原型毒株由美国遗传治疗公司科研人员从人胚胎视网膜细胞中首次分离[1],2015 年我国首次在广东地区爆发猪原发性水疱病(PIVD)猪场的样品中检测到SVA,母猪表现为水疱病临床症状,感染仔猪急性死亡[2]。另据研究表明,不同年龄的猪只均可感染该病毒,可导致猪的口鼻、蹄冠等部位出现类似水泡样病变[3]。 展开更多
关键词 病毒性传染病 水疱病 病毒属 蹄冠 科研人员 RNA 监测预警 水泡样
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HBV相关肝细胞癌患者的血清外泌体miRNA表达谱分析
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作者 叶春艳 申红玉 +3 位作者 钱梅云 朱冬梅 薛源 鱼国盛 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1005-1008,共4页
对HBV相关肝癌患者、乙型肝炎肝硬化患者、健康体检者(每组3例)血清外泌体进行深度测序,获取肝细胞癌特性性表达的miRNA基因共25个。其中上调的有17个,下调的基因有5个,选取5个基因进行qPCR验证,结果与筛选结果一致。
关键词 肝细胞癌 外泌体 乙型肝炎病毒 RNA
植物免疫研究与抗病虫绿色防控:进展、机遇与挑战
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作者 张杰 董莎萌 +12 位作者 王伟 赵建华 陈学伟 郭惠珊 何光存 何祖华 康振生 李毅 彭友良 王国梁 周雪平 王源超 周俭民 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2019年第11期1479-1507,共29页
植物免疫学是研究植物与病原生物互作的学科.同动物一样,植物也具有强大的先天免疫系统,其本质是通过对病毒、细菌、真菌、卵菌、线虫、昆虫、寄生植物等病原生物的识别激活防卫反应,拒阻病原生物的侵害;而病原生物则能够逃避或抑制宿... 植物免疫学是研究植物与病原生物互作的学科.同动物一样,植物也具有强大的先天免疫系统,其本质是通过对病毒、细菌、真菌、卵菌、线虫、昆虫、寄生植物等病原生物的识别激活防卫反应,拒阻病原生物的侵害;而病原生物则能够逃避或抑制宿主植物的识别和防卫反应,在植物上引起病虫害.20年来,我国植物免疫研究取得巨大进步,与国际同行相比,在多个研究方向实现了并跑,在少数方向实现了领跑,为农作物病虫害绿色防控提供了理论支撑和新的技术手段. 展开更多
关键词 抗病基因 抗虫基因 感病基因 免疫受体 激发子 效应蛋白 信号转导 RNA
肉兔胚胎期肌肉中miRNA的生物信息学分析 预览
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作者 张翔宇 杨超 +10 位作者 邝良德 李丛艳 张翠霞 郑洁 任永军 郭志强 唐丽 邓晓东 雷岷 黄邓萍 谢晓红 《畜禽业》 2019年第2期1-3,共3页
兔肉是一种高蛋白、低脂肪、低胆固醇的健康肉源。miRNA在家兔肌肉的生长发育中起了重要的调控作用。研究利用Solexa测序技术对3只妊娠27d的新西兰白兔的背最长肌进行了miRNA测序,旨在评估高通量测序在发掘肉兔miRNA中的数据质量,以及... 兔肉是一种高蛋白、低脂肪、低胆固醇的健康肉源。miRNA在家兔肌肉的生长发育中起了重要的调控作用。研究利用Solexa测序技术对3只妊娠27d的新西兰白兔的背最长肌进行了miRNA测序,旨在评估高通量测序在发掘肉兔miRNA中的数据质量,以及解析肉兔胚胎期肌肉组织中miRNA的生物学特征。结果表明,仅前5位碱基的错误率略接近0.5%,其他位置的碱基错误率均远远低于0.5%,说明总体测序质量高,获得的序列可用于后续miRNA的鉴定分析。90%以上的miRNA序列长度在20~24nt。其中约60%长度为22nt的miRNA,占到了纯净序列的一半以上。其次为23nt,再次为21nt。miRNA长度分布的不平衡可能与miRNA的作用机理和具体生物学功能有关。 展开更多
关键词 家兔 肌肉 高通量测序 RNA
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