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白花泡桐茎和叶差异表达的cDNA-SRAP分析 认领
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作者 茹广欣 周霜晴 +2 位作者 朱秀红 刘小囡 王鋆瑞 《河南农业大学学报》 CSCD 北大核心 2017年第4期481-486,共6页
以白花泡桐茎和叶为材料,利用cDNA-SRAP分子标记技术,对其进行基因表达的差异分析。从64对引物中筛选出25对扩增效果较好的引物对进行扩增,检测得到36个差异片段,2次PCR扩增重复率为66.8%。经挑选回收、克隆和测序,最终测得23条差异片... 以白花泡桐茎和叶为材料,利用cDNA-SRAP分子标记技术,对其进行基因表达的差异分析。从64对引物中筛选出25对扩增效果较好的引物对进行扩增,检测得到36个差异片段,2次PCR扩增重复率为66.8%。经挑选回收、克隆和测序,最终测得23条差异片段序列,长度主要在400~1 700bp之间。经BLASTX进行比对和功能分析,16条与已知功能基因有较高同源性,包含能量与代谢(34.78%)、蛋白质合成(8.70%)、细胞壁相关(4.35%)、信号传导与胁迫响应(8.70%)及复合影响(13.04%)等多个方面;7条与未知功能基因序列有较高同源性。 展开更多
关键词 cDNA-SRAP 白花泡桐 差异片段 功能分析
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从江香猪基因组甲基化修饰与体重之间的相关性研究 认领 被引量:2
2
作者 林如涛 冉雪琴 王嘉福 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第4期973-979,共7页
为了探索从江香猪生长慢的表观遗传学机理,本试验应用甲基化敏感扩增多态性(methylation—sensitive amplifying polymorphism,MSAP)技术,将60头20d从江香猪分为高体重组和低体重组,研究血液和肝脏基因组DNA中胞嘧啶的甲基化程度... 为了探索从江香猪生长慢的表观遗传学机理,本试验应用甲基化敏感扩增多态性(methylation—sensitive amplifying polymorphism,MSAP)技术,将60头20d从江香猪分为高体重组和低体重组,研究血液和肝脏基因组DNA中胞嘧啶的甲基化程度,并测定差异的甲基化片段核苷酸序列。结果发现,MSAP分析得到5977条带;与低体重组相比,高体重组的血液和肝脏总甲基化水平较低,两组的血液半甲基化水平均较肝脏中的高,全/总甲基化水平较低。提示香猪血液和肝脏基因组的总甲基化程度随体重的增加而下降。经克隆测序得到5条有差异的甲基化条带A1—A5,其中A1和A2源自血液,A3-A5来自肝脏;A1和A4片段为高体重组特有,其余3条片段为低体重组特有;A3片段未找到相关基因,其他4个片段处于代谢或免疫相关的基因内部或5’侧翼区。提示从江香猪基因组的甲基化水平存在个体差异,并与20d体重相关;得到的4条甲基化片段,将有助于香猪甲基化调控机制的研究。 展开更多
关键词 从江香猪 基因组甲基化 差异片段 体重
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云南省鼠疫菌株差异片段基因分型及其流行病学特征 认领 被引量:7
3
作者 朱俊洁 王鹏 +1 位作者 李伟 宋志忠 《中华地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期599-601,共3页
目的对云南省鼠疫菌株进行基因分型,探究云南各型菌株之间的内在联系。方法选取云南家鼠、野鼠及玉龙鼠疫菌共171株进行试验,采用鼠疫菌基因组23个差异片段(DFR)进行分型,并运用BioNumerics5.0进行聚类分析。结果23个差异片段将17... 目的对云南省鼠疫菌株进行基因分型,探究云南各型菌株之间的内在联系。方法选取云南家鼠、野鼠及玉龙鼠疫菌共171株进行试验,采用鼠疫菌基因组23个差异片段(DFR)进行分型,并运用BioNumerics5.0进行聚类分析。结果23个差异片段将171株鼠疫菌分为7个基因组型:Genomovar5、Genomovar7、Genomovar9型及4个新发现的基因型。7株玉龙型菌株都为Genomovar5基因型;16株野鼠型(滇西纵谷型)鼠疫菌株被分为3个基因型,其中13株为Genomovar7基因型,2株为Genomovar9基因型,1株为新发现的Genomovar—ynl基因型;148株云南家鼠型(滇闽居民型)鼠疫菌株被分为4个基因型,其中145株为Genomovar9基因型.3株为3个新发现的基因型,分别为Genomovar-yn2、一yn3、一yn4基因型。生态型聚类分析显示,玉龙型鼠疫菌株与滇西纵古型(野鼠型)菌株的基因型较为相似(87.20%),与滇闽居民型(家鼠型)相似度较小(73.75%)。2株滇西纵谷型菌株与滇闽居民型的主基因型同为Genomovar9基因型。滇西纵谷型Genomovar-ynl基因型与Genomovar7基因型相似,但缺失DFR11。滇闽居民型Genomovar-yn2、-yn3、-yn4基因型与Genomovar9基因型相似,但分别缺失了DFRIO、DFR9、DFR11。结论在野鼠型鼠疫菌株中新发现了1种基因型,在家鼠型鼠疫菌株中新发现了3种基因型,在野鼠型鼠疫菌株中发现了家鼠型鼠疫菌株。玉龙鼠疫菌株的基因型与滇西纵谷型(野鼠型)菌株的基因型相似较高,与滇闽居民型(家鼠型)菌株的基因型相似度较小。 展开更多
关键词 耶尔森菌 鼠疫 差异片段 基因分型
NBS profiling技术在小麦抗叶锈病研究中的应用初探 认领
4
作者 梁丽然 王珅 +2 位作者 高琳 王海燕 刘大群 《中国农学通报》 CSCD 2013年第12期194-200,共7页
为了研究NBS profiling技术在小麦(Triticum aestivumL.)抗叶锈病基因中应用的可行性,本研究选用15个小麦抗叶锈病近等基因系和感病亲本Thatcher为材料,建立NBS profiling体系,并进行多态性分析;同时选取含有成株抗叶锈病基因Lr35的... 为了研究NBS profiling技术在小麦(Triticum aestivumL.)抗叶锈病基因中应用的可行性,本研究选用15个小麦抗叶锈病近等基因系和感病亲本Thatcher为材料,建立NBS profiling体系,并进行多态性分析;同时选取含有成株抗叶锈病基因Lr35的近等基因系TcLr35和Thatcher为材料,进行cDNA NBS profiling,从转录水平上寻找与目的基因Lr35相关的RGA片段。研究结果表明:基因组NBS profiling中所选的16对酶/引物组合中MseⅠ/NBS2、MseⅠ/NBS5和MseⅠ/NBS7均得到了较好扩增结果,多态性高,多态性检出率分别为26.4%、26.4%和23.5%;cDNA NBS profiling中共筛选了52对酶/引物组合进行差异片段的扩增,有多对组合能成功揭示抗感间差异。NBS profiling技术可应用于小麦叶锈病抗病基因的研究中,为该技术在小麦抗叶锈病基因筛选及分子标记研究中的应用奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦 NBS PROFILING 分子标记 多态性 差异片段
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食管癌中特异表达的人类omega蛋白(Igll3)基因的序列分析及意义 认领
5
作者 李峰 蒋志华 +1 位作者 闻燕 吕欢 《中国慢性病预防与控制》 CAS 2012年第1期 48-50,共3页
目的筛选食管癌中差异表达的基因,进一步了解食管癌发生的分子机制。方法利用荧光差异显示技术(DD—PCR)从食管癌组织相对癌旁组织中获得差异表达片段,对这些片段进行克隆和序列分析。通过在GenBank中同源性检索,查找差异片段相对... 目的筛选食管癌中差异表达的基因,进一步了解食管癌发生的分子机制。方法利用荧光差异显示技术(DD—PCR)从食管癌组织相对癌旁组织中获得差异表达片段,对这些片段进行克隆和序列分析。通过在GenBank中同源性检索,查找差异片段相对应的同源基因。利用定量PCR检测验证该基因表达的差异性。设计引物获得该基因全长。结果通过DD—PCR得到3个差异片段,分别为人类10号常染色体上的开放阅读框99;人类信号转导和激活转录因子2及人类omega蛋白(纠13)。定量PCR验证的结果表明,纠旧在食管癌组织中的表达量高于癌旁组织。设计引物得到该基因全长,测序表明该基因长为711bp,编码236aa。结论igU3在食管癌组织中异常表达,可能在食管癌发生过程中起着重要的作用。 展开更多
关键词 食管癌 Igll3基因 差异片段
斑节对虾性腺差异表达基因的筛选 认领
6
作者 陈亮 黄建华 +2 位作者 张殿昌 苏天凤 江世贵 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期47-55,共9页
以池塘养殖250日龄的斑节对虾性腺组织为材料,利用mRNA差异显示(differential display,DD)筛选性腺差异表达基因,获得173条雌、雄性腺差异表达片段。随机选取44条差异片段进行回收、克隆、测序及Real—timeRT—PCR验证,最终获得1... 以池塘养殖250日龄的斑节对虾性腺组织为材料,利用mRNA差异显示(differential display,DD)筛选性腺差异表达基因,获得173条雌、雄性腺差异表达片段。随机选取44条差异片段进行回收、克隆、测序及Real—timeRT—PCR验证,最终获得10条阳性差异表达片段,其中OA7-1、OA7—2、OG8一1、OG8—2、OCl—3、OC4—2、OC8在卵巢中表达量极显著(P〈0.01)高于精巢,TG6—3、TG8在精巢中表达量极显著(P〈0.01)高于卵巢,TC1为精巢特异表达片段。序列分析表明OA7—2为脱氧尿嘧啶三磷酸核苷酸水解酶(dUTPase)(E值6e-54);OG8-1为真核细胞翻译起始因子3亚单位4(elF-3 delta)(E值9e-58);OCl-3为未命名蛋白产物(unnamed protein product)(E值2e-17);OC4—2为60S核糖体蛋白L7(RPL7)(E值6e-40):OC8为60S核糖体蛋白L3(RPL3)(E值5e-36);OA7-1、OG8-2和TCI与BLASTx比对同源性较低(10^-4〈E值〈10);TG6-3和TG8未检索到同源序列(E值〉10),为新的EST序列。对TCl转录水平分析表明其在精巢中表达,在卵巢及雌、雄性个体的眼柄神经节、大脑组织、肝胰腺、肌肉中均不表达,雌、雄个体基因组DNA均能扩增出TCl片段,推测TCl可能为一条由转录水平调控参与精子发生及繁殖相关的重要基因。对精巢表达量远高于卵巢的差异片段TG6-3进行雌、雄个体不同组织转录水平的对比分析发现,其在眼柄神经节组织中不表达,在雌性脑组织中不表达而在雄性脑组织中表达且在性腺组织中表达水平最高,表明TG6-3有可能为一条参与斑节对虾性腺发育调控的基因,为进一步阐明对虾性腺发育的分子调控机制提供了有价值的信息。 展开更多
关键词 斑节对虾 性腺 差异显示 差异片段
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牛布鲁菌强毒株544与猪型疫苗株S2基因组差异筛选与鉴定 认领 被引量:2
7
作者 张俊敏 韩文瑜 +5 位作者 雷连成 孙长江 冯新 赵伟栋 杜涛峰 刘珊珊 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1490-1494,共5页
应用代表性差异分析技术(Representational difference analysis,RDA)对流产布鲁菌强毒株544和疫苗株S2进行基因组差异分析。经过3轮差减杂交,对差异片段进行Southern-blot验证,BLAST分析和PCR鉴定,最终获得疫苗株S2特有的3条差异片... 应用代表性差异分析技术(Representational difference analysis,RDA)对流产布鲁菌强毒株544和疫苗株S2进行基因组差异分析。经过3轮差减杂交,对差异片段进行Southern-blot验证,BLAST分析和PCR鉴定,最终获得疫苗株S2特有的3条差异片段与已测序的所有猪布鲁菌(Brucella suis)同源性均为100%,只在弱毒株S2基因组中检测出,而在强毒株544中不存在,为建立布鲁菌自然感染菌与疫苗株的基因鉴别诊断方法奠定了基础。 展开更多
关键词 布鲁菌 代表性差异分析 差异片段 诊断 鉴定
不同方法鉴定差异显示技术RAP-PCR得到差异基因的比较 认领
8
作者 李升康 王玉桥 《汕头大学医学院学报》 2009年第2期 80-82,共3页
目的:评价用RAP-PCR法从测序胶上得到深海细菌(Shewanella piezotolerance WP3)差异片段验证的最佳方法。方法:用RT-PCR,RNA点杂交,荧光实时定量PCR对不同盐浓度的差异片段进行对比实验。结果:3种方法均能检测到片段的差异表达:RT... 目的:评价用RAP-PCR法从测序胶上得到深海细菌(Shewanella piezotolerance WP3)差异片段验证的最佳方法。方法:用RT-PCR,RNA点杂交,荧光实时定量PCR对不同盐浓度的差异片段进行对比实验。结果:3种方法均能检测到片段的差异表达:RT-PCR灵敏性最强,RNA点杂交需要的RNA量最大,荧光实时定量PCR精确性最高。结论:在实验条件允许下,用荧光实时定量PCR对较少片段的验证较好。 展开更多
关键词 SHEWANELLA piezotolerance WP3 差异显示 RAP-PCR方法 差异片段 验证
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布鲁氏菌强毒株与弱毒株基因组DNA差异基因筛选与鉴定 认领 被引量:1
9
作者 张俊敏 韩文瑜 +5 位作者 雷连成 孙长江 赵瑞利 冯新 赵伟栋 杜涛峰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期 513-518,共6页
本研究应用代表性差异分析技术(RDA)对流产布鲁氏菌强毒株544A和弱毒株104M进行基因组差减分析。经过3轮差减杂交,获得强毒株特有的9条差异片段和弱毒株特异的17条差异片段。经BLAST分析和PCR鉴定,最终证实3条差异片段,与流产布鲁... 本研究应用代表性差异分析技术(RDA)对流产布鲁氏菌强毒株544A和弱毒株104M进行基因组差减分析。经过3轮差减杂交,获得强毒株特有的9条差异片段和弱毒株特异的17条差异片段。经BLAST分析和PCR鉴定,最终证实3条差异片段,与流产布鲁氏菌经典弱毒株S19同源性在98%~99%之间,只在弱毒株104M基因组中检测出,而在强毒株544A中不存在。该实验为建立布鲁氏菌自然感染菌与疫苗株的基因鉴别诊断方法奠定了基础。 展开更多
关键词 流产布鲁氏菌 代表性差异分析 差异片段 鉴定
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大足黑山羊地方类群多胎性AFLP标记研究 认领
10
作者 杨国锋 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2009年第15期 1-4,共4页
利用分子标记技术AFLP标记,从15对引物中选取扩增效果较好的11对引物,对11只极端多胎个体和6只极端非多胎个体DNA进行扩增,共扩增出766个条带,平均多态率5.36%,其中引物E42/T48中1条294bp的条带在极端非多胎个体中均出现,而在... 利用分子标记技术AFLP标记,从15对引物中选取扩增效果较好的11对引物,对11只极端多胎个体和6只极端非多胎个体DNA进行扩增,共扩增出766个条带,平均多态率5.36%,其中引物E42/T48中1条294bp的条带在极端非多胎个体中均出现,而在极端多胎个体中只在1个个体中扩增出来,表现出极显著的差异。对差异片段回收、克隆、测序,设计4对引物,对基因组扩增后发现,产生差异片段的原因是片段内部有较长序列的插入或丢失,产生310bp和265bp2个等位基因,其中310bp纯合等位基因的初产羔羊数显著高于310bp和265bp杂合等位基因的初产羔羊数,在大足黑山羊地方类群内可能作为多胎性状分子标记。 展开更多
关键词 多胎 AFLP 差异片段 大足黑山羊
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小麦矮腥黑穗菌差异片段筛选与分子检测体系的建立 认领 被引量:7
11
作者 年四季 殷幼平 +2 位作者 袁青 夏玉先 王中康 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期 725-728,共4页
采取随机扩增DNA多态性(Random amplified polymorphic DNA,RAPD)引物介导的半特异PCR技术(RAPD primer mediated hemi-specific PCR,RM-PCR),在从不同地域征集的18个小麦矮腥黑穗菌(Tilletia controversa Kühn,TCK)菌株和2... 采取随机扩增DNA多态性(Random amplified polymorphic DNA,RAPD)引物介导的半特异PCR技术(RAPD primer mediated hemi-specific PCR,RM-PCR),在从不同地域征集的18个小麦矮腥黑穗菌(Tilletia controversa Kühn,TCK)菌株和29个小麦网腥黑穗病菌(Tilletia caries(DC)Tul,TCT)菌株的总基因组DNA中筛选鉴定出TCK独有的大小为1322bp差异基因组片段。根据该片段序列设计筛选出2对特异性引物CQUTCK2/CQUTCK3和CQUTCK4/CQUTCK5,均可以从18个TCK菌株的菌丝体和冬孢子DNA中稳定地扩增出747bp和200bp的单一靶带DNA,而在29个TCT菌株的菌丝体或冬孢子DNA均无任何扩增产物。以腥黑穗菌属通用引物对CQUK6/CQUK7为内置对照,可以确定被检样品是否含PCR抑制物质进而判断检测体系是否正确,同时有效地排除样品检测结果的假阳性和假阴性。采用建立的TCK特异PCR检测技术体系,实现简单而快速地鉴定小麦矮腥黑穗菌冬孢子或罹病小麦组织中侵染菌丝体的目的。 展开更多
关键词 TCK TCT 差异片段 内置对照
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胃癌DNA甲基化差异片段的筛选与分析 认领
12
作者 王珣 廖爱军 苏琦 《现代肿瘤医学》 CAS 2006年第5期 581-584,共4页
目的:筛选和分析胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段。方法:通过甲基化敏感性代表性差异分析法(methylation—sensitive—represemational difference analysis,MS—RDA),筛选胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段,经克隆、测... 目的:筛选和分析胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段。方法:通过甲基化敏感性代表性差异分析法(methylation—sensitive—represemational difference analysis,MS—RDA),筛选胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段,经克隆、测序后进行生物信息学分析。结果:获得3个甲基化差异片段CRS1308、CRS1309、CRS1310序列。其中CRS1309和CRS1310已被GenBank收录,登陆号分别为AY887106和AY887107。CRS1309序列与LOC440683基因、LOC440887基因的3端、DRD5基因均有很高的相似性;CRS1310序列与1999年Minoru Toyota在人类结肠癌中分离出的核糖体RNA上的甲基化差异性CpG岛有很高的相似性。结论:胃癌和正常胃组织间DNA甲基化存在差异,LOC440683、LOCA40887、DRD5基因的异常甲基化可能与胃癌的发生相关,胃癌中CRS1310序列所在核糖体RNA上的CpG岛易发生甲基化。 展开更多
关键词 胃癌 DNA甲基化 差异片段 筛选 分析
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应用MS-RDA筛选胃癌甲基化差异片段 认领
13
作者 廖爱军 苏琦 +2 位作者 王珣 曾斌 石巍 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2006年第4期365-369,共5页
目的:应用甲基化敏感性代表性差异分析法(methylation-sensitive representational difference analysis,MS-RDA)筛选胃癌和正常胃组织间甲基化差异DNA片段.方法:通过MS-RDA筛选胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段,经克隆、测... 目的:应用甲基化敏感性代表性差异分析法(methylation-sensitive representational difference analysis,MS-RDA)筛选胃癌和正常胃组织间甲基化差异DNA片段.方法:通过MS-RDA筛选胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段,经克隆、测序后进行生物信息学分析.结果:获得3个甲基化差异片段,分别为CRS1308,CRS1309,CRS1310序列,其中CRS1309和CRS1310已被GenBank收录,登陆号分别为AY887106和AY887107,CRS1309序列与LOC440683基因第11外显子、LOC440887基因的3′端,DRD5基因启动子和外显子区域均有很高的相似性(分别为98%,99%,94%),CRS1310序列与1999年Minoru Toyota在人类结肠癌中分离出的核糖体RNA上的甲基化差异性CpG岛有很高的相似性(98%).结论:胃癌和正常胃组织间DNA甲基化存在差异,MS-RDA可有效分析这两种不同组织间甲基化的差异,筛选出有意义的甲基化差异片段. 展开更多
关键词 胃癌 DNA甲基化 差异片段 MS-RDA
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子宫内膜异位症 认领
14
《中国计划生育和妇产科》 2004年第5期374-376,共3页
关键词 子宫内膜 异位症 内异症 抗转铁蛋白抗体 联合药物治疗 差异表达基因 子宫腺肌症 异位内膜 差异片段 间接ELISA法
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反向Northern筛查冠心病血瘀证差异片段 认领 被引量:8
15
作者 杨保林 王阶 姜燕 《中国中医基础医学杂志》 CAS CSCD 2004年第9期 29-30,34,共3页
目的:降低mRNA差异显示假阳性.方法:采用反向Northern杂交方法进行筛查差异片段的真实性.结果:差异片段再扩增后经检测符合杂交条件的有96条,反向杂交后,有10条DNA片段属于真实的差异片段.结论:反向Northern杂交是降低mRNA差异显示假阳... 目的:降低mRNA差异显示假阳性.方法:采用反向Northern杂交方法进行筛查差异片段的真实性.结果:差异片段再扩增后经检测符合杂交条件的有96条,反向杂交后,有10条DNA片段属于真实的差异片段.结论:反向Northern杂交是降低mRNA差异显示假阳性的有效方法. 展开更多
关键词 反向Northern 冠心病血瘀证 差异片段
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平消胶囊合并三苯氧胺治疗老年乳腺癌8例体会 认领 被引量:1
16
作者 肖昌蔚 《现代肿瘤医学》 CAS 2006年第5期 532,共1页
自2002年1月至2004年8月,我科治疗60岁以上因各种原因未行手术及放化疗,而单纯13服平消胶囊加三苯氧胺的老年乳腺癌患者8例,取得了较好的临床疗效,现报告如下。
关键词 乳腺癌 DNA甲基化 差异片段 老年
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外源酚酸诱导枳菌根共生相关基因筛选 认领
17
作者 王明元 李建福 +3 位作者 刘建福 徐志周 林萍 李雨晴 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1383-1394,共12页
【目的】基于丛枝菌根(AM)真菌改变柑橘酚类现象,筛选外源酚酸诱导菌根共生差异基因,分析酚相关基因功能。【方法】以枳(Poncirus trifoliate L.)接种AM真菌,并施加外源酚酸,采用随机引物扩增,获得差异表达片段;继而克隆酚相关基因并进... 【目的】基于丛枝菌根(AM)真菌改变柑橘酚类现象,筛选外源酚酸诱导菌根共生差异基因,分析酚相关基因功能。【方法】以枳(Poncirus trifoliate L.)接种AM真菌,并施加外源酚酸,采用随机引物扩增,获得差异表达片段;继而克隆酚相关基因并进行生物信息学分析。【结果】试验采用20条随机引物和3条锚定引物扩增cDNA,共获得了154条差异显示的表达片段;对其中16条Northern杂交显示阳性的片段测序与比对,发现9条有相关功能注释,参与环境因子及内源信号的识别,调节共生体的形成;DD-11基因只有在外源酚酸添加和接种AM真菌的根系中表达,该片段cDNA全长序列长度为1382 bp,编码454个氨基酸,分子式为C2210H3427N603O657S31,其理论等电点和相对分子量分别为7.81和49950.03;磷酸化分析发现,该蛋白有22个丝氨酸残基、14个苏氨酸残基及7个酪氨酸残基可能成为蛋白激酶磷酸化位点。通过PredictProtein服务器对DD-11蛋白质的二级结构进行分析,该蛋白含有α螺旋22%、无规则卷曲58%、延伸链20%,不含有β折叠结构。【结论】本试验获得菌根共生过程酚相关基因,其功能与植物内源信号识别密切相关,为探讨酚类在菌根共生过程中的分子机制提供了新的视角。 展开更多
关键词 丛枝菌根真菌 酚酸 差异片段筛选 蛋白结构
生物信息学在克隆去势SD大鼠cDNA消减差异片段SCn4的全长cDNA及其序列分析中的应用 认领
18
作者 王松 沈霖 +1 位作者 陈国庆 金丽 《武汉体育学院学报》 CSSCI 北大核心 2006年第4期 82-84,共3页
从去势SD大鼠cDNA消减文库中抽取消减差异未知基因的cDNA部分序列,利用生物信息学的方法延伸表达序列标签(Expression Sequence Tag,EST)序列,以获得基因的部分乃至全长cDNA序列,避免或部分避免构建与筛选cDNA文库等烦琐的实验室... 从去势SD大鼠cDNA消减文库中抽取消减差异未知基因的cDNA部分序列,利用生物信息学的方法延伸表达序列标签(Expression Sequence Tag,EST)序列,以获得基因的部分乃至全长cDNA序列,避免或部分避免构建与筛选cDNA文库等烦琐的实验室工作。该策略体现了后基因组生物信息学的重要性,它在克隆确定致病新基因方面提供了新思路、新方法。本研究利用生物信息学“电子”克隆了去势SD大鼠cDNA消减文库中的差异片段SCn4的全长cDNA并对其可能的全基因序列作了预测。 展开更多
关键词 运动生理 生物信息学 表达序列标签 生物学 克隆 去势 SD大鼠 CDNA 消减差异片段
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双孢蘑菇丛生变异的RAPD分析及差异片段的克隆 认领 被引量:6
19
作者 陈美元 王泽生 +1 位作者 廖剑华 宋思扬 《厦门大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期 657-660,共4页
通过双孢蘑菇正常菌株及其丛生变异菌株基因组DNA的RAPD研究,找到一个与双孢蘑菇丛生变异可能相关的DNA片段,将其克隆并测序.GenBank查询结果表明该片段可能的部分开放读框(ORF)与多种生物的二氢硫辛酰胺脱氢酶(DLDH)的部分氨基酸序列... 通过双孢蘑菇正常菌株及其丛生变异菌株基因组DNA的RAPD研究,找到一个与双孢蘑菇丛生变异可能相关的DNA片段,将其克隆并测序.GenBank查询结果表明该片段可能的部分开放读框(ORF)与多种生物的二氢硫辛酰胺脱氢酶(DLDH)的部分氨基酸序列有较高的同源性,由此提出了一个双孢蘑菇丛生变异的分子机理假设. 展开更多
关键词 食用菌 双孢蘑菇 丛生变异 RAPD分析 DNA差异片段 基因变异 基因克隆 分子机理
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抑制差减杂交克隆E1 Tor霍乱弧菌流行株与非流行株基因组差异片段及其分析 认领 被引量:3
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作者 张丽娟 杨帆 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期 573-577,共5页
为了克隆与分析霍乱弧菌O1 E1 Tor流行株与非流行株两类菌株基因组差异片段,采用抑制差减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)分别以国内保留的流行株Wujiang-2及非流行株Js-32一株作为被检菌,另一株作为参考菌... 为了克隆与分析霍乱弧菌O1 E1 Tor流行株与非流行株两类菌株基因组差异片段,采用抑制差减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)分别以国内保留的流行株Wujiang-2及非流行株Js-32一株作为被检菌,另一株作为参考菌进行基因组差异研究。在进行的差减杂交实验中,流行株Wujiang-2共检出34个特异差异片段,经同源检索共代表35个基因片段,其中包括许多重要的霍乱弧菌毒力相关基因如CTXφ遗传单元,TLC因子及可移动外来成分如霍乱弧菌整合子RVC序列及Tn10转位酶,非流行酶Js-32共检出14个特异差异片段,经同源检索未能检出同源片段,可能代表新基因序列。研究表明,霍乱弧菌流行株与非流行株基因组存在较多差异基因,表现在毒力,毒力相关基因,代谢以及其它噬菌体等可转移的基因成分。 展开更多
关键词 抑制差减杂交 EL Tor霍乱弧菌流行株 非流行株 基因组差异片段 序列分析 基因克隆
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