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环形RNA研究现状及展望
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作者 曹培华 武丹彤 +3 位作者 栾静 王新蕾 刘伯男 马宁 《医学分子生物学杂志》 CAS 2019年第4期395-400,共6页
环形RNA(circular RNA,circRNA)属于迄今发现的非编码RNA的当中的一种,是通过反向剪接(back spacing)形成的并以共价键形成环形结构的一类单链闭环分子。不同于经传统剪接(canonical splicing)形成的mRNA,经反向剪接形成的环形RNA不具... 环形RNA(circular RNA,circRNA)属于迄今发现的非编码RNA的当中的一种,是通过反向剪接(back spacing)形成的并以共价键形成环形结构的一类单链闭环分子。不同于经传统剪接(canonical splicing)形成的mRNA,经反向剪接形成的环形RNA不具有亍加帽结构和3'poly(A)尾结构,可抵抗RNaseR酶的降解。环形RNA可在多物种间广泛、稳定存在。随着高通量测序技术的发展,环形RNA相继被发现,在调控基因表达中发挥着重要功能,可参与多种疾病的发生发展过程。环形RNA以多种形式在转录水平发挥着重要的调控作用,具有巨大的研究前景。 展开更多
关键词 环形RNA 转录调控 非编码RNA
非编码RNA与卒中研究进展 预览
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作者 马蓉 徐弘扬 +1 位作者 杨锡彤 王光明 《广东医学》 CAS 2019年第4期602-605,共4页
脑卒中是一种多因素引起的疾病,是全球范围内致残和致死的第2位原因。近年来,在完善和改进卒中诊断标准和治疗策略方面进行了许多尝试并取得了较大的进步,但因为其狭窄的治疗时间窗,许多临床试验都以失败告终。迄今为止临床上最有效的... 脑卒中是一种多因素引起的疾病,是全球范围内致残和致死的第2位原因。近年来,在完善和改进卒中诊断标准和治疗策略方面进行了许多尝试并取得了较大的进步,但因为其狭窄的治疗时间窗,许多临床试验都以失败告终。迄今为止临床上最有效的卒中治疗方法是溶栓治疗,但是由于溶栓治疗存在很大的风险,同时适应的治疗时间窗较短,卒中触发的各种病理生理级联信号的激活严重威胁患者健康。非编码RNA(noncoding RNAs,ncRNAs)具有相对稳定性、特异性和可重复性,在缺血性卒中病理学过程中作为转录后基因表达的重要调控介质,因此认为在疾病早期诊断方面,ncRNAs是比蛋白质和基因更好的生物标志物及候选物,ncRNAs可能是治疗卒中的一种新的方法。 展开更多
关键词 卒中 非编码RNA 环形RNA 长非编码RNA 微小RNA
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家蚕环形RNA的预测与鉴定
3
作者 周怀香 斯洪强 +3 位作者 朱兵 吕正兵 盛清 聂作明 《蚕业科学》 CSCD 北大核心 2018年第2期233-241,共9页
环形RNA(circRNA)是具有闭合环状结构的单链RNA,其功能涉及对亲本基因转录的调控、miRNA的吸附和作为某些疾病的生物标志物。以家蚕幼虫、蛹和蛾3个发育时期蚕体的混合样本提取总RNA,利用高通量测序共获得112 271 320个测序read。采... 环形RNA(circRNA)是具有闭合环状结构的单链RNA,其功能涉及对亲本基因转录的调控、miRNA的吸附和作为某些疾病的生物标志物。以家蚕幼虫、蛹和蛾3个发育时期蚕体的混合样本提取总RNA,利用高通量测序共获得112 271 320个测序read。采用软件Map Splice和Find_circ从获得的测序read中预测家蚕的circRNAs,其中用Map Splice预测到的circRNA共1 659条,用Find_circ预测到的circRNA共9 777条,2个软件共同预测到的circRNA有1 598条。利用circRNA预测程序CircRNApredictor.pl从家蚕转录组read(SRR315361)和家蚕基因组序列中预测到12 955条circRNA,进一步将高通量测序read匹配预测的circRNA序列,结果显示序列首尾重叠,为环状分子。通过软件miRanda预测了部分家蚕circRNA的靶miRNA。设计特异性的正、反向PCR引物对,选取其中11条SRPBM(spliced reads per billion mapping)值最高的circRNA进行PCR,产物测序鉴定为家蚕潜在的circRNA分子,其中BmcircR_3621、BmcircR_8955、BmcircR_8926、BmcircR_6123、BmcircR_8349、BmcircR_1198、BmcircR_9535、BmcircR_6215、BmcircR_7937在家蚕酪氨酸蛋白激酶Abl(tyrosine-protein kinase Abl)和异常细胞迁移蛋白10(abnormal cell migration protein 10)等的基因序列中以环的形式存在,并且主要成环位点与生物信息学预测结果一致,而BmcircR_2196和BmcircR_6226的成环位点与预测存在差异。研究结果可供家蚕乃至昆虫新型RNA分子的鉴定和研究参考。 展开更多
关键词 家蚕 环形RNA 高通量测序 生物信息学分析 基序
环形RNA在癌症中的研究进展 被引量:1
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作者 汪赛 陈晨 +2 位作者 熊莹喆 肖玲慧 李招发 《药学学报》 CSCD 北大核心 2018年第6期903-909,共7页
环形RNA(circRNA)是一种缺乏5'末端帽和3'末端poly(A)尾的非编码闭环单链RNA分子。环状RNA比线性mRNA更丰富和稳定,其表达更具保守性和特异性。circRNA通过多种机制调节癌症发展,包括miRNA海绵,调节基因转录,调节RNA结合蛋白质和... 环形RNA(circRNA)是一种缺乏5'末端帽和3'末端poly(A)尾的非编码闭环单链RNA分子。环状RNA比线性mRNA更丰富和稳定,其表达更具保守性和特异性。circRNA通过多种机制调节癌症发展,包括miRNA海绵,调节基因转录,调节RNA结合蛋白质和蛋白质翻译。本文综述探讨circRNA在癌症中的作用,有助于开发新的临床诊断技术和治疗方法。 展开更多
关键词 环形RNA miRNA海绵 转录 癌症
竞争性内源RNA与消化系恶性肿瘤关联的研究进展 预览
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作者 史燕妹 牛义淳 +3 位作者 路明亮 黄华 常江 和海玉 《世界华人消化杂志》 CAS 2017年第7期596-601,共6页
竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ce RNA)是一种相互作用的R N A转录本,通过竞争性结合并降低靶标微小RNA(micro RNA,miRNA)的水平,解除信使RNA(messenger RNA,m RNA)的抑制作用.miRNA、mRNA、长链非编码RNA、假基因、环... 竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ce RNA)是一种相互作用的R N A转录本,通过竞争性结合并降低靶标微小RNA(micro RNA,miRNA)的水平,解除信使RNA(messenger RNA,m RNA)的抑制作用.miRNA、mRNA、长链非编码RNA、假基因、环形RNA之间形成了密不可分的网络,通过这种复杂的网络互相调节各自的表达水平,从而参与一系列的生物学行为,包括肿瘤的发生.肿瘤相关性ce RNA在消化系肿瘤的形成过程中发挥关键作用,我们对消化系肿瘤相关性ce RNA做简要综述,并简单分析其与靶标mi RNA的相互作用,为进一步理解ce RNA介导的肿瘤生成分子机制提供新思路. 展开更多
关键词 竞争性内源RNA 微小RNA 假基因 长链非编码RNA 环形RNA 胃癌 结肠癌 肝癌
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不同种类RNA与脑出血关系的研究 预览
6
作者 范亚男 张敬军 《中华脑科疾病与康复杂志(电子版)》 2017年第2期99-102,共4页
脑出血发病机制复杂,不同种类的RNA与脑出血的关系是国内外研究的热点之一.本文综述不同种类RNA与脑出血的关系,探讨不同种类RNA可能作用的靶向基因、信号转导通路和代谢途径,为脑出血早期防治提供新的理论依据.
关键词 脑出血 MRNA 微小RNA 长链非编码RNA 环形RNA
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环形RNA在疾病中的研究进展 被引量:1
7
作者 王绪宁 黄亮 +4 位作者 张悦 贾宝庆 刘洪一 栗世铀 郑伟 《现代生物医学进展》 CAS 2017年第6期1194-1197,共4页
环形RNA(circular RNA circRNA)是由前体RNA的3’末端和5’末端首尾相连形成的环状非编码RNA,可竞争内源性RNA,调节基因的表达。环形RNA在发现之初,被认为是由于错误剪接产生的,未引起重视,随着RNA测序和生物信息等技术的发展大量的环... 环形RNA(circular RNA circRNA)是由前体RNA的3’末端和5’末端首尾相连形成的环状非编码RNA,可竞争内源性RNA,调节基因的表达。环形RNA在发现之初,被认为是由于错误剪接产生的,未引起重视,随着RNA测序和生物信息等技术的发展大量的环形RNA被发现,并逐渐成为非编码RNA的研究热点。虽然目前对其功能了解甚少,但已有的研究表明环形RNA可以对基因转录后进行调控。本文将从环形RNA的发现过程、形成机制、生物学功能、与疾病的关系以及研究中存在的问题进行综述,有助于进一步研究中心法则,同时为疾病诊治提供新的方向。 展开更多
关键词 环形RNA 非编码RNA MIRNA 肿瘤
结直肠癌中hsa_circ_0006156 RNA的低表达及其临床意义 预览
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作者 黄亮 王绪宁 +4 位作者 贾宝庆 刘洪一 郭少华 张加金 郑伟 《解放军医学院学报》 CAS 2017年第10期922-926,共5页
目的探讨hsa_circ_0006156基因在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中的表达水平与临床意义。方法利用荧光定量PCR技术检测2014年12月-2015年12月于本院行手术治疗的31例结直肠癌病人的肿瘤组织和癌旁组织中hsa_circ_0006156的表达水平... 目的探讨hsa_circ_0006156基因在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中的表达水平与临床意义。方法利用荧光定量PCR技术检测2014年12月-2015年12月于本院行手术治疗的31例结直肠癌病人的肿瘤组织和癌旁组织中hsa_circ_0006156的表达水平,并结合临床病理资料分析其临床意义。利用Blast、Bedtool等软件预测分析hsa_circ_0006156与micro RNA的相互作用。结果 hsa_circ_0006156在结直肠癌组织中表达水平显著低于癌旁正常组织(P=0.004)。相较于癌旁正常组织,hsa_circ_0006156在24例病人癌组织中(77.4%)表达下调,7例(22.6%)表达上调,hsa_circ_0006156表达水平与肿瘤大小相关(P=0.042)。hsa_circ_0006156表达诊断癌组织与癌旁组织的受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)的曲线下面积(area under curve,AUC)为72.3%(95%CI:0.592~0.853),灵敏度和特异度分别为71%和77.4%。hsa_circ_0006156序列上含有分别针对hsa-mi R-5011(n=24)、hsa-mi R-4775(n=22)、hsa-mi R-4445(n=20)、hsa-mi R-627(n=12)等mi RNA的结合位点(binding sites)。结论 hsa_circ_0006156在结直肠癌组织中表达水平下调,可作为结直肠癌的诊断分子标记物。其可能作为"mi RNA海绵"(mi RNA sponge)发挥转录后调控作用。 展开更多
关键词 环形RNA 结直肠癌 hsa_circ_0006156 RNA 分子标记物
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环形RNAs形成机制的多样性 预览
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作者 张小跎 《价值工程》 2017年第22期176-177,共2页
环形RNAs是一种结构与常见线性RNA不同的一种环形转录物。生命的各个领域环形RNAs广泛存在,包括真核生物、细菌、古生菌和病毒,而且在神经细胞中高度表达,说明它们可能具有一定的生物功能。多年来,我们对于它们的形成机制和功能并不清... 环形RNAs是一种结构与常见线性RNA不同的一种环形转录物。生命的各个领域环形RNAs广泛存在,包括真核生物、细菌、古生菌和病毒,而且在神经细胞中高度表达,说明它们可能具有一定的生物功能。多年来,我们对于它们的形成机制和功能并不清楚。最近的研究表明环形RNAs的形成机制和功能具有多样性,例如有外显子环化、内含子环化、细菌基因组环化等。 展开更多
关键词 环形RNA 形成机制 多样性
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环形RNA在肿瘤中的研究现状 预览
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作者 黄亮 王绪宁 郑伟 《世界最新医学信息文摘(电子版)》 2017年第44期35-36,38共3页
环形RNA(circular RNA/circRNA)广泛地存在于真核细胞胞质中,被认为是一类具有重要的转录后调控功能的非编码RNA分子,其表达具有明显的组织及疾病特异性。目前研究认为,环形RNA的主要生物学功能是作为miRNA海绵负性调控miRNA的表达,同... 环形RNA(circular RNA/circRNA)广泛地存在于真核细胞胞质中,被认为是一类具有重要的转录后调控功能的非编码RNA分子,其表达具有明显的组织及疾病特异性。目前研究认为,环形RNA的主要生物学功能是作为miRNA海绵负性调控miRNA的表达,同时部分研究发现环形RNA还可以翻译蛋白质和多肽以及调控转录过程等。大量的研究发现环形RNA在人类疾病尤其是恶性肿瘤的发病过程中具有重要的作用。深入研究环形RNA的产生机制、结构特性和生物学功能有助于我们深入了解肿瘤的发生机制,同时为肿瘤的预防、诊断和治疗提供新的方向和思路。 展开更多
关键词 环形RNA 肿瘤 MIRNA 研究
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非编码RNA与心肌重构 预览 被引量:3
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作者 王建勋 高金宁 丁巍 《上海大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期310-317,共8页
非编码RNA(non-coding RNAs,nc RNAs)是一类不编码蛋白质的RNA分子.相关研究表明,nc RNAs不仅参与细胞的增殖、凋亡、分化、代谢等生理过程,还参与疾病的病理过程.心肌重构(myocardial remodeling)是多种心血管疾病最主要的病理基础... 非编码RNA(non-coding RNAs,nc RNAs)是一类不编码蛋白质的RNA分子.相关研究表明,nc RNAs不仅参与细胞的增殖、凋亡、分化、代谢等生理过程,还参与疾病的病理过程.心肌重构(myocardial remodeling)是多种心血管疾病最主要的病理基础.已有多项研究表明,心肌重构的发生发展与nc RNAs的调控息息相关,近年来针对nc RNAs在心脏疾病方面的研究也得到了迅猛发展.对nc RNAs包括微小RNA(micro RNAs,mi RNAs)、长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lnc RNAs)和环形RNA(circular RNAs,circ RNAs)与心肌重构的最新研究进展以及作用机制进行介绍,旨在寻找新的心脏疾病治疗靶点. 展开更多
关键词 非编码RNA 微小RNA 长链非编码RNA 环形RNA 心肌重构
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circRNA的研究进展及其法医学意义 预览 被引量:4
12
作者 张雅琪 邵诚臣 +2 位作者 李成涛 赵子琴 谢建辉 《法医学杂志》 CAS CSCD 2016年第2期131-133,共3页
RNA在法医学领域中越来越受到重视,发展以RNA为基础的新生物标记在复杂案例分析中具有重要的意义。环形RNA(circular RNA,circRNA)是最近被广泛报道的一类非编码RNA,虽然其生成和表达调节机制目前尚未完全清楚,但现有的研究表明ci... RNA在法医学领域中越来越受到重视,发展以RNA为基础的新生物标记在复杂案例分析中具有重要的意义。环形RNA(circular RNA,circRNA)是最近被广泛报道的一类非编码RNA,虽然其生成和表达调节机制目前尚未完全清楚,但现有的研究表明circRNA具有重要的生物学功能。circRNA具有细胞表达特异性,稳定性好且表达丰富等特点,使其在法医学应用中具有潜在意义。本文对circRNA的研究历程及生成调节机制、生物学属性及其生物学功能进行总结,希望能为相关研究和法医学应用提供参考。 展开更多
关键词 法医遗传学 环形RNA 综述[文献类型]
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环形RNA研究进展 被引量:2
13
作者 陈学英 许萍萍 +1 位作者 代娟娟 田聆 《生命科学》 CSCD 2015年第9期1125-1132,共8页
环形RNA(circular RNA,circ RNA)广泛存在于各种生物细胞中,并且具有结构稳定、表达量丰富以及在不同组织及其不同发育阶段具有表达特异性等特征。目前认为,circ RNA可以在转录后水平调控基因表达,但是circ RNA的产生机制及其代谢途... 环形RNA(circular RNA,circ RNA)广泛存在于各种生物细胞中,并且具有结构稳定、表达量丰富以及在不同组织及其不同发育阶段具有表达特异性等特征。目前认为,circ RNA可以在转录后水平调控基因表达,但是circ RNA的产生机制及其代谢途径仍然不是很清楚。迄今研究认为,circ RNA的主要生物学作用是作为微小RNA(micro RNA,miRNA)海绵体调控miRNA的表达。此外,circ RNA在肿瘤、动脉粥样硬化、糖尿病、帕金森病等多种疾病的发生发展中发挥了一定的作用。深入了解circ RNA的作用机制及其功能,有助于深入了解疾病的发生、发展机理,设计更好的预防、诊断和治疗疾病新策略。 展开更多
关键词 环形RNA 微小RNA 微小RNA海绵体 肿瘤
环形RNA在天然免疫过程中的重要功能
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作者 刘楚霄 李响 +1 位作者 南芳 陈玲玲 《生命的化学》 CAS CSCD 2019年第3期424-429,共6页
一类环形RNA来自外显子反向剪接,以共价键形成闭环结构。至今,科学家在真核生物中发现了多达几十万条环形RNA,但大部分环形RNA的功能至今不详。中国科学院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组与合作者的最新研究成果阐述了环形RNA... 一类环形RNA来自外显子反向剪接,以共价键形成闭环结构。至今,科学家在真核生物中发现了多达几十万条环形RNA,但大部分环形RNA的功能至今不详。中国科学院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组与合作者的最新研究成果阐述了环形RNA在细胞受病毒感染时的降解机制及其通过形成分子内双链结构结合天然免疫因子参与天然免疫应答调控的重要新功能,并揭示环形RNA低表达与炎症性自身免疫性病——系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus, SLE)密切相关。该研究为环形RNA在天然免疫中的重要功能研究奠定基础,并为炎症性自身免疫病的发病机制及未来的干预治疗提出了新的思路与潜在靶点。 展开更多
关键词 环形RNAs 环形RNA的降解 环形RNA的二级结构 PKR 系统性红斑狼疮(SLE)
非肌层浸润性膀胱癌环形RNA位点差异性表达
15
作者 潘建刚 秦轶 +3 位作者 黄中华 王忠康 林甫俊 周兴 《中华生物医学工程杂志》 CAS 2018年第3期203-208,共6页
目的 初步探讨非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)中环形RNA(circRNA)的异常表达.方法 2014年10月至2015年6月收集在广州医科大学附属第二医院泌尿外科经病理确诊的NMIBC患者标本,通过基因芯片对3例人NMIBC组织较癌旁正常组织差异表达的circRNA... 目的 初步探讨非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)中环形RNA(circRNA)的异常表达.方法 2014年10月至2015年6月收集在广州医科大学附属第二医院泌尿外科经病理确诊的NMIBC患者标本,通过基因芯片对3例人NMIBC组织较癌旁正常组织差异表达的circRNA进行初筛,随机选取2个表达异常的circRNAs,在10对NMIBC及其配对正常组织采用实时荧光定量PCR检测.结果 与癌旁正常组织比较,在NMIBC组织中,表达上调的有3个,分别是:hsa_circ_102339、hsa_circ_103730、hsa_circ_104160,表达下调有4个,分别是:hsa_circ_100617、hsa_circ_104738、hsa_circ_103093、hsa_circ_105038.基因芯片提示hsa_circ_104738在NMIBC组织中表达明显低于癌旁正常组织.实时定量PCR测定hsa_circ_104738的表达水平与基因芯片结果一致.结论 NMIBC组织中存在circRNA表达异常,hsa_circ_104738尤为明显,有待进一步分析其可能机制. 展开更多
关键词 环形RNA(circRNA) 非肌层浸润性膀胱癌 实时荧光定量PCR
环形RNA分子揭秘 被引量:7
16
作者 张杨 王海滨 陈玲玲 《生命的化学》 CAS CSCD 2014年第4期428-433,共6页
环形RNA分子是一类不具有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。利用针对环形结构RNA分子的实验和计算方法,并结合新一代高通量测序,现已在多种细胞内发现了大量环形RNA分子的稳定存在。目前,尽... 环形RNA分子是一类不具有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。利用针对环形结构RNA分子的实验和计算方法,并结合新一代高通量测序,现已在多种细胞内发现了大量环形RNA分子的稳定存在。目前,尽管环形RNA分子的产生机制及其代谢仍然不清楚,但是已有的研究表明环形RNA分子具有调控基因表达的功能。对环形RNA分子的产生机制和功能等的进一步研究,将为人们深入理解生命活动在转录水平的复杂性调控提供重要的分子基础和研究依据。 展开更多
关键词 非编码RNA 环形RNA分子 外显子来源的环形RNA分子 内含子来源的环形RNA分子
隐秘的未知宇宙:心血管环形RNA研究 预览
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作者 刘芝彤 《中西医结合心血管病杂志(电子版)》 2018年第7期27-27,共1页
人类的基因有DNA和少量的RNA构成,RNA分子在人类的身体中存在着不可忽视的作用。生物学中对RNA的研究结果表明,所有的RNA分子结构都是成线性分布的,但是随着科学实验的一步步进行,发现了RNA的另一种形态结构环形RNA分子,并且环形RNA分... 人类的基因有DNA和少量的RNA构成,RNA分子在人类的身体中存在着不可忽视的作用。生物学中对RNA的研究结果表明,所有的RNA分子结构都是成线性分布的,但是随着科学实验的一步步进行,发现了RNA的另一种形态结构环形RNA分子,并且环形RNA分子在人类的人体中广泛的存在,本篇文章的重点在于进行心血管环形RNA分子的研究,希望可以在进行心血管疾病的治疗中,使用环形RNA分子作为靶点分子,开拓心血管治疗的新的方向。 展开更多
关键词 环形RNA分子 靶点分子 心血管研究
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