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一个毛囊角化症家系的ATP2A2基因突变分析
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作者 陈熙慧 刘清波 +2 位作者 孙茂 袁利娟 吴元明 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2019年第8期794-797,共4页
目的探讨1例毛囊角化症家系的分子发病机制。方法提取该家系3例患者、1名正常成员以及80名正常对照的基因组DNA,结合目标序列捕获和高通量测序从皮肤病相关的基因中筛选出候选突变,应用Sanger测序和家系共分离分析进行验证。通过保守性... 目的探讨1例毛囊角化症家系的分子发病机制。方法提取该家系3例患者、1名正常成员以及80名正常对照的基因组DNA,结合目标序列捕获和高通量测序从皮肤病相关的基因中筛选出候选突变,应用Sanger测序和家系共分离分析进行验证。通过保守性分析、蛋白质结构及功能预测分析其致病性。结果3例患者ATP2A2基因的第15外显子均存在c.2246G>T(p.G749V)杂合突变,在1名正常成员以及80名正常对照中未发现上述突变。该位点的氨基酸在进化中高度保守,其突变将改变蛋白质的结构和功能。结论ATP2A2 c.2246G>T为该毛囊角化症家系的致病突变,可能通过破坏肌浆/内质网钙离子ATP酶2原有的结构和功能而致病。 展开更多
关键词 目标序列捕获 高通量测序 毛囊角化症 ATP2A2基因 肌浆/内质网钙离子ATP酶2
范可尼贫血FANCA基因双重杂合突变1例报告并基因突变分析 预览
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作者 杨娅平 李栋梁 +1 位作者 曹玮 赵田华 《山东医药》 2018年第38期75-77,共3页
目的报告1例疑似范可尼贫血(FA)患儿,并对其家系进行致病基因突变及表型分析以明确诊断,探讨其分子发病机制。方法采用目标序列捕获和高通量测序方法对1例拟诊FA患儿的FANCA基因外显子及其侧翼序列进行测序,在确定患儿致病基因型后,应用... 目的报告1例疑似范可尼贫血(FA)患儿,并对其家系进行致病基因突变及表型分析以明确诊断,探讨其分子发病机制。方法采用目标序列捕获和高通量测序方法对1例拟诊FA患儿的FANCA基因外显子及其侧翼序列进行测序,在确定患儿致病基因型后,应用Sanger测序法进行验证,同时检测患儿父母及姐姐基因型,并用Mutation Taster与PolyPhen-2软件预测突变对蛋白功能的影响。结果先证者FANCA基因存在第14外显子c.1303C>T(p.R435C)和第31外显子c.3031C>T(p.R1011C)双重杂合突变,导致该基因的第435位和1 011位氨基酸均由精氨酸变成为半胱氨酸,Sanger测序验证了该双重突变的存在。患儿父亲检出第31外显子c.3031C>T突变,其母亲与姐姐均检出第14外显子c.1303C>T突变;应用上述软件预测2个突变对蛋白功能的影响均为有害。结论报告了1例FA患儿及其家系,FANCA基因c.1303C>T与c.3031C>T复合突变是该FA家系的分子发病机制。 展开更多
关键词 范可尼贫血 FANCA基因 基因突变 目标序列捕获 高通量测序
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分子倒置探针技术的研究进展及应用 预览
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作者 罗志梅 张永彪 +3 位作者 鄢纯 韩圆圆 呼锐 刘继强 《生物技术通报》 CSCD 北大核心 2018年第10期49-57,共9页
分子倒置探针技术是一项新发展起来的用于目标序列捕获的分子生物学技术,该技术通过设计特异的探针对已知的特定目的基因组序列进行捕获,将目标序列DNA富集后再利用芯片杂交或测序进行检测。此技术有助于研究人员对大样本中的基因组重... 分子倒置探针技术是一项新发展起来的用于目标序列捕获的分子生物学技术,该技术通过设计特异的探针对已知的特定目的基因组序列进行捕获,将目标序列DNA富集后再利用芯片杂交或测序进行检测。此技术有助于研究人员对大样本中的基因组重要区域进行研究,避免了全基因组研究费用高、分析困难等问题。并且,分子倒置探针技术弥补了杂交捕获技术、PCR捕获技术等分子捕获手段的不足,为动植物及病原菌重要DNA片段的研究提供强有力的技术支持。目前,分子倒置探针技术广泛应用于单核苷酸多态性(SNP)分型、外显子测序、拷贝数变异、杂合性丢失、体细胞突变、DNA甲基化和可变剪接等方面的研究。由于其特异性强、重复性好、操作简单、费用低廉,并对DNA完整度要求不高,适用于福尔马林石蜡包埋样本分析等特点,分子倒置探针技术的应用越来越广泛。然而,分子倒置探针技术在探针设计及数据分析软件研发等方面仍存在一些不足,还需要进一步的优化完善。为促进相关领域学者全面了解该技术,综述了分子倒置探针技术的基本原理、发展历程、技术特点及在疾病研究领域的应用,讨论了分子倒置探针技术的价值及存在的问题。 展开更多
关键词 分子倒置探针技术 目标序列捕获 疾病研究
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一个Ⅱ型先天性红细胞生成异常性贫血家系的僦3B基因型及表型分析 被引量:1
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作者 李栋梁 李博伦 +4 位作者 瞿姗姗 曹玮 杨娅平 马印图 侯天文 《中华医学遗传学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第6期874-878,共5页
目的对1个Ⅱ型先天性红细胞生成异常性贫血(congenital dyserythropojetic anemia,CDA)家系进行致病基因的突变及表型分析。方法应用目标序列捕获高通量二代测序技术对1例CDAⅡ型患者SEC23B基因的外显子及侧翼区进行测序,在确定先... 目的对1个Ⅱ型先天性红细胞生成异常性贫血(congenital dyserythropojetic anemia,CDA)家系进行致病基因的突变及表型分析。方法应用目标序列捕获高通量二代测序技术对1例CDAⅡ型患者SEC23B基因的外显子及侧翼区进行测序,在确定先证者的致病基因型后,应用Sanger测序法进行验证,同时检测患者直系亲属的基因型,并用Mutation Taster与PolyPhen-2软件预测突变对蛋白功能的影响,用SWISS-MODEL软件对蛋白结构进行模拟分析。结果先证者SEC23B基因存在罕见的复合杂合错义突变C.1727T〉C(P.F576S)和C.1831C〉T(P.R611W),导致该基因的第576位氨基酸由苯丙氨酸变为丝氨酸,第611位由精氨酸变为色氨酸。Sanger测序证实了上述双重突变。先证者之姐检出C.1727T〉C杂合突变,父亲及儿子均检出C.1831C〉T杂合突变。此外,在先证者中检出一血色病相关基因HFE的杂合突变c.211C〉T(p.R71X),导致71位的精氨酸变为终止密码子,其父亲未检出此突变。上述3种突变的蛋白功能预测均为有害,分子模拟显示其改变了SEC23B蛋白的三维构象。先证者在脾脏切除后贫血有所好转,在祛铁治疗后铁蛋白有所下降。结论SEC23B基因c.1727T〉C与c.1831C〉T复合杂合突变很可能是该cDAⅡ型家系的分子发病原因,此基因型与临床表型密切相关。 展开更多
关键词 SEC23B基因 突变 贫血 先天性红细胞生成异常性 目标序列捕获 二代测序
一个丙酮酸激酶缺乏症家系PKLR基因的突变分析及产前诊断 被引量:3
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作者 李栋梁 张静 +8 位作者 焦保全 刘艳丽 王友君 王志伟 李文静 侯兰芬 孙宇 郭宏谋 郭晓 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期53-56,共4页
目的对一个丙酮酸激酶缺乏症(pyruvatekinasedeficiency,PKD)家系进行致病基因突变分析及产前诊断。方法应用目标序列捕获和高通量测序技术对临床拟诊为PKD的患儿的PKLR基因外显子及其侧翼序列进行测序,采用SIFT及PolyPhen-2数据库... 目的对一个丙酮酸激酶缺乏症(pyruvatekinasedeficiency,PKD)家系进行致病基因突变分析及产前诊断。方法应用目标序列捕获和高通量测序技术对临床拟诊为PKD的患儿的PKLR基因外显子及其侧翼序列进行测序,采用SIFT及PolyPhen-2数据库对突变进行蛋白功能预测,在确定先证者致病基因型后,应用Sanger测序技术进行验证,同时检测其父母基因型,并对孕16周的高危胎儿抽取羊水进行产前诊断。结果患儿PKLR基因存在罕见的双重杂合突变C.661G〉A(Asp221Asn)以及C.1528C〉T(Arg510Ter),导致该基因的第221位氨基酸由天冬氨酸变化为天冬酰胺,第510位由精氨酸改变为终止密码子。Sanger测序验证了该双重突变的存在,先证者父母分别检出c.661G〉A(Asp221Asn)与c.1528C〉T(Arg5lOTer)突变。胎儿检出与先证者相同的致病突变。在终止妊娠后,对流产物进行突变位点分析,结果与产前诊断一致。结论PKLR基因c.661G〉A与C.1528C〉T复合突变是该PKD家系的分子发病机制。通过产前诊断可以有效阻止致病基因的传递,降低生育患儿的风险。 展开更多
关键词 PKLR基因 突变 丙酮酸激酶 目标序列捕获 高通量测序
应用新一代测序技术进行Meckel-Gruber综合征家系突变分析研究 被引量:1
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作者 严恺 金帆 《生殖与避孕》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期767-771,共5页
目的:寻找一个两次临床拟诊为Meckel—Gruber妊娠家系的致病基因突变。方法:采用目标序列捕获芯片结合高通量测序技术寻找可疑的致病基因突变位点,利用经典的Sanger测序技术进行验证。结果:发现了全世界未见报道的CEP290基因的2种... 目的:寻找一个两次临床拟诊为Meckel—Gruber妊娠家系的致病基因突变。方法:采用目标序列捕获芯片结合高通量测序技术寻找可疑的致病基因突变位点,利用经典的Sanger测序技术进行验证。结果:发现了全世界未见报道的CEP290基因的2种新发突变。结论:新一代测序技术适用于寻找遗传异质性较强的单基因遗传病的致病基因突变位点,从而对某些表型相似的疾病进行鉴别诊断。 展开更多
关键词 Meckel-Gruber综合征 目标序列捕获 新一代测序技术
目标序列捕获测序检出红细胞丙酮酸激酶缺乏症PKLR基因新的复合突变 预览 被引量:1
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作者 李栋梁 张静 +8 位作者 刘艳丽 焦保全 王志伟 王友君 李文静 侯兰芬 郭宏谋 孙宇 郭晓 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1464-1468,共5页
目的:探讨红细胞丙酮酸激酶缺乏症(pyruvate kinase deficiency,PKD)的分子发病机制。方法:应用目标序列捕获和高通量二代测序技术(next-generation sequencing,NGS)对临床拟诊PKD患儿的PKLR基因12个外显子及其侧翼序列进行测序,采用SIF... 目的:探讨红细胞丙酮酸激酶缺乏症(pyruvate kinase deficiency,PKD)的分子发病机制。方法:应用目标序列捕获和高通量二代测序技术(next-generation sequencing,NGS)对临床拟诊PKD患儿的PKLR基因12个外显子及其侧翼序列进行测序,采用SIFT及PolyPhen-2数据库预测突变对蛋白质功能的影响,在确定患者致病基因型后,应用Sanger测序技术对此基因型进行验证。结果:NGS结果显示,患儿PKLR基因存在罕见的双重杂合突变:第5外显子661G>A(Asp221Asn)和第10外显子1528C>T(Arg510Ter),导致该基因的第221位氨基酸由天冬氨酸突变为天冬酰胺,第510位氨基酸由精氨酸突变为终止密码子,使PKLR基因氨基酸链编码提前终止;Sanger测序技术进一步验证了该双重突变的存在。检索相关文献及数据库显示,这两种突变在人群中的发生率极低,蛋白质功能预测均显示为有害。结论:PKLR基因661 G>A与1528 C>T双重杂合突变是该PKD患儿的分子发病机制,PKD患者同时存在上述复合突变的报道在国内外尚属首次。 展开更多
关键词 基因 突变 丙酮酸激酶 目标序列捕获 二代测序
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目标序列捕获结合高通量测序在遗传性疾病的应用研究 被引量:2
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作者 谢楚杏 曾海生 +1 位作者 刘国军 徐炳燕 《中国热带医学》 CAS 2015年第7期792-794,共3页
目的研究目标序列捕获结合高通量测序在常见遗传性疾病致病基因检测中的应用价值。方法对217例经气相色谱-质谱联用分析技术(GC-MS)首次确诊为遗传性耳聋、甲基丙二酸血症、遗传性骨髓衰竭综合征的患儿,应用目标序列捕获结合高通量测... 目的研究目标序列捕获结合高通量测序在常见遗传性疾病致病基因检测中的应用价值。方法对217例经气相色谱-质谱联用分析技术(GC-MS)首次确诊为遗传性耳聋、甲基丙二酸血症、遗传性骨髓衰竭综合征的患儿,应用目标序列捕获结合高通量测序技术检测其相关疾病基因。结果检测出引发患儿遗传性耳聋的致病基因为EYA4、SLC26A4、POU3F4、MYO8A、USH1C、CDH23、DFN5、TECTA,检出率为92.11%;引发甲基丙二酸血症的致病基因主要为甲基丙二酰辅酶A变位酶(MUT)、MMACHC基因突变,检出率为100%;引发患儿遗传性骨髓衰竭综合征的致病基因为SBDS、FANCD2、RPS19、FANCG、TINF2、FANCB、ELANE,检出率为100%。结论应用目标序列捕获结合高通量测序技术对遗传性耳聋、甲基丙二酸血症、遗传性骨髓衰竭综合征的突变基因检测,结果准确,方便快捷,可在临床推广。 展开更多
关键词 高通量测序 目标序列捕获 遗传性疾病 应用研究
目标序列捕获及平行测序在临床耳聋基因诊断中的应用 预览 被引量:10
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作者 苏钰 汤文学 +6 位作者 代志瑶 高雪 王国建 黄莎莎 康东洋 林曦 戴朴 《中华耳科学杂志》 CSCD 北大核心 2014年第1期45-49,共5页
目的利用目标序列捕获(Targeted sequence capture)、生物编码(Barcode)及大规模平行测序(Massively parallel sequencing,MPS)技术,对遗传性耳聋患者进行分子病因学研究,探索低成本、多基因、多样本的耳聋基因检测在临床应用... 目的利用目标序列捕获(Targeted sequence capture)、生物编码(Barcode)及大规模平行测序(Massively parallel sequencing,MPS)技术,对遗传性耳聋患者进行分子病因学研究,探索低成本、多基因、多样本的耳聋基因检测在临床应用的可行性。方法利用Illumina测序平台对来自解放军总医院聋病分子诊断中心88例(来自61个家系)具有明确家族史且常见耳聋基因检测阴性的耳聋患者,以及8例阳性对照患者进行42种基因的目标序列捕获、Barcode和MPS,并对测序结果进行生物信息学分析。结果利用上述方法在88个个体中大于一人人组家系中发现了10个家系8个基因(TECTA、DFNA5、CDH23、USHIC、MY07A、POU3F4、SLC26A4、EYA4)14个位点的致病性突变。准确验证了8个阳性对照。大于一人人组家系的致病基因检出率明显高于单人人组家系。结论高通量测序的发展为遗传性耳聋的诊断带来了巨大的机遇。目标序列捕获、Barcode、MPS的结合进一步提高了测序的准确性、降低了测序成本,同时生物信息学的进步,将促进低成本、多基因、多样本的临床耳聋基因检测成为可能。 展开更多
关键词 遗传性耳聋 目标序列捕获 生物编码 平行测序 生物信息学
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基于单体型的杜氏肌营养不良无创产前检测研究 预览
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作者 曾艳欣 陈敏 +6 位作者 陈超 赖峥菲 袁媛 王垚燊 李世泉 阿叁 陈敦金 《实用妇产科杂志》 CSCD 北大核心 2018年第9期698-701,共4页
目的:探讨利用先证者辅助单体型分析方法(PAHP)对杜氏肌营养不良(DMD)进行无创产前检测(NIPT)的可行性。方法:招募生育过DMD先证者并再次妊娠的家系17例。对孕妇、孕妇丈夫与先证者外周血基因组DNA(g DNA)样本进行目标序列捕... 目的:探讨利用先证者辅助单体型分析方法(PAHP)对杜氏肌营养不良(DMD)进行无创产前检测(NIPT)的可行性。方法:招募生育过DMD先证者并再次妊娠的家系17例。对孕妇、孕妇丈夫与先证者外周血基因组DNA(g DNA)样本进行目标序列捕获测序,获得孕妇与致病位点连锁的单体型信息。然后在夫妻双方单体型的辅助下,通过对血浆数据中各个信息可供单核苷酸多态性(SNP)位点分析及统计,推断在DMD基因区域胎儿获得的母源单体型是否与先证者一致。携带与先证者相同单体型的男胎为患胎,女胎为携带者,其余为正常胎。将NIPT结果与DMD基因诊断金标准进行比较,验证其准确性。结果:NIPT结果提示17个家系中9例为男性胎儿,8例为女性胎儿;患胎3例,携带者4例,正常胎10例。该结果与胎儿的DMD基因诊断结果一致,无假阳性与假阴性结果。结论:基于先证者辅助单体型分析方法的NIPT取材方便,能避免宫内介入性操作,同时结果准确,应用于DMD的产前检测具有一定的可行性。 展开更多
关键词 目标序列捕获测序 单体型 杜氏肌营养不良 胎儿游离DNA 无创产前检测
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遗传性痉挛性截瘫三家系临床特点和基因突变分析
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作者 王辉 李玉生 +5 位作者 杨靖 毛澄源 宋波 赵璐 史长河 许予明 《中华神经医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期402-406,共5页
目的研究3个遗传性痉挛性截瘫(HSP)家系的临床表现特点及致病基因。方法收集自2014年1月至2015年11月就诊于郑州大学第一附属医院神经内科的3个HSP家系,分析3个家系内患者的临床表现、电生理及影像学检查结果,并采集外周静脉血提取... 目的研究3个遗传性痉挛性截瘫(HSP)家系的临床表现特点及致病基因。方法收集自2014年1月至2015年11月就诊于郑州大学第一附属医院神经内科的3个HSP家系,分析3个家系内患者的临床表现、电生理及影像学检查结果,并采集外周静脉血提取基因组DNA,应用目标序列捕获测序技术对家系成员进行HSP相关基因检测。结果家系1为家族性HSP,患者主要表现为缓慢进行性发展的双下肢无力、步态异常,但并无认知功能障碍:家系2为家族性HSP,患者主要表现为早发、逐渐进展的双下肢痉挛性截瘫、智力下降;家系3内患者无家族史,临床表现部分与家系2内患者相同,同时还出现双下肢肌肉萎缩伴有胼胝体发育不良,而无其他类型症状。基因检测结果示:家系l基因突变类型为ATL1基因第7号外显子c.715C〉T(p.R239C),该突变与该家系共分离;家系2基因突变类型为SPG11基因第17号外显子:c.30993103delGTTTG(p.1033fs)及第22号外显子:c38173818insTGA(p.12721273insMe0:家系3基因突变类型为SPG11基因第32号外显子:c.6194C〉G(p.S2056X)及第29号内含子c.5121+lC〉T剪接突变。结论应用目标序列捕获测序技术发现了与HSP相关致病基因ATLl的1个已知突变、SPGJJ基因的4个新发复合杂合突变。进一步丰富了HSP的突变数据库,为HSP的诊断提供了更多依据。 展开更多
关键词 遗传性痉挛性截瘫 目标序列捕获测序 ATL1基因 SPG11基因
中国一先天性无虹膜家系的遗传分析及PAX6基因突变位点的检测 预览 被引量:1
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作者 张陆希 杨鸽 +3 位作者 贾竞 万文萃 杨鑫 金学民 《中华实验眼科杂志》 CSCD 北大核心 2017年第8期721-725,共5页
背景先天性无虹膜是双眼发病的遗传性疾病,目前的研究表明先天性无虹膜患者配对盒转录因子6(PAX6)基因突变位点具有多样性。目的通过目标序列捕获测序结合一代测序验证技术对1个中国先天性无虹膜家系进行基因突变位点的筛查和遗传分... 背景先天性无虹膜是双眼发病的遗传性疾病,目前的研究表明先天性无虹膜患者配对盒转录因子6(PAX6)基因突变位点具有多样性。目的通过目标序列捕获测序结合一代测序验证技术对1个中国先天性无虹膜家系进行基因突变位点的筛查和遗传分析。方法采用横断面研究方法,本研究组于2016年3月纳入在郑州大学第一附属医院确诊的1个中国汉族先天性无虹膜家系,并对该家系成员进行致病突变基因检测。该家系全体成员均接受神经系统、口服葡萄糖耐量试验等全身体格检查以及眼科相关检查。采集现存家系所有成员前臂静脉血10ml以提取基因组DNA,以先证者基因组DNA为模板行前房角发育异常致病基因的目标基因定点捕获测序分析,经与各基因库比对筛选出候选致病基因位点,采用PCR法对该家系成员行致病基因位点DNA片段扩增,采用Sanger测序技术在该家系除先证者以外的2例患病者和表型正常成员中进行候选致病基因验证。结果该家系共3代9名成员,I1去世,现存8位成员,包括患病者3例(112及其子代Ⅲ1、Ⅲ2)和表型正常者5人,符合常染色体显性遗传模式。所有家系成员未发现神经系统异常,口服葡萄糖耐量试验结果均呈阴性。3例患病者视力均明显下降且不能矫正,眼压平均值为21mmHg(1mmHg=0.133kPa),患者均存在虹膜完全缺如、角膜基质层混浊、眼球水平震颤、黄斑中心凹发育不良症状。此外,Ⅱ2患者存在左眼上睑下垂、右眼先天性白内障表现,Ⅲ2同时存在双眼先天性白内障、双侧晶状体不全脱位。先证者目标序列捕获测序分析及数据库比对显示,所有患病者PAX6基因第6号外显子上碱基替换e.183C〉A,经Sanger测序验证后证实突变基因与表型共分离。结论PAX6基因c.183C〉A突变是该先天性无虹膜家系的致病突变位点。 展开更多
关键词 无虹膜/遗传性 人类第11号染色体/基因 配对盒转录因子6/基因 家系谱 中国人 目标序列捕获测序 无义突变
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一例巨轴索神经病患者中发现GAN基因两种新型致病突变
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作者 王娟 马晴雯 +3 位作者 蔡勤 刘艳娜 王伟 任兆瑞 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期292-295,共4页
目的寻找1例疑似巨轴索神经病患者的致病突变位点,为疾病诊断提供科学资料。方法应用目标序列捕获测序技术对患者进行遗传筛查,找到巨轴突蛋白基因(Gigaxonin,GAIN)的可疑致病突变位点,并提取患者父母的外周血DNA,进行Sanger测... 目的寻找1例疑似巨轴索神经病患者的致病突变位点,为疾病诊断提供科学资料。方法应用目标序列捕获测序技术对患者进行遗传筛查,找到巨轴突蛋白基因(Gigaxonin,GAIN)的可疑致病突变位点,并提取患者父母的外周血DNA,进行Sanger测序验证。同时对200名正常人的400个GAN基因进行Sanger测序。此外,应用生物信息学软件Polyphen对突变巨轴突蛋白进行了功能预测。结果在患者GAN基因中鉴定出2种新型突变:c.778G〉T(p.Glu260Ter)和c.277G〉A(p.Gly93Arg),为复合杂合突变;Sanger测序证实c.778G〉T(p.Glu260Ter)突变源于父方,c.277G〉A(P.Gly93Arg)突变则与母亲相同。在200名正常人GAN基因中未检测到同样的突变,排除其为多态性。生物信息学分析预测这两种新型GAN突变均可引发巨轴突蛋白功能异常。结论研究鉴定出了患者GAN的两种新型突变,它们均可能引起巨轴突蛋白结构和功能的异常,从而导致疾病的发生,为日后类似疾病的诊断提供了依据。 展开更多
关键词 巨轴索神经病 GAN基因突变 目标序列捕获测序
目标序列捕获测序发现视网膜色素变性的热点突变SNRNP200p.S1087L及其新临床表型 被引量:2
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作者 陈雪 高翔 +6 位作者 赵堪兴 潘鑫源 张秀梅 王秀英 袁松涛 刘庆淮 赵晨 《中华眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1104-1110,共7页
目的研究我国四代常染色体显性遗传视网膜色素变性(ADRP)一家系患者的致病基因突变及临床表型特征。方法收集南京医科大学第一附属医院眼科诊治的1个四代ADRP家系的临床资料,共有12名家庭成员参与研究。其中5例患者,6名正常同胞,1... 目的研究我国四代常染色体显性遗传视网膜色素变性(ADRP)一家系患者的致病基因突变及临床表型特征。方法收集南京医科大学第一附属医院眼科诊治的1个四代ADRP家系的临床资料,共有12名家庭成员参与研究。其中5例患者,6名正常同胞,1名配偶。完善ADRP家系内所有参与者的眼科检查,包括最佳矫正视力、视野、眼底照相及全视野视网膜电流图(ERG)检查。针对179个遗传性视网膜疾病(HRD)已知致病基因及10个高度可疑的剪切基因的目标序列设计并定制目标序列捕获芯片,借助高通量二代测序技术平台检测先证者(IV:3)和患者(Ⅲ:10)的所有遗传变异,辅以生物信息学分析技术,通过一系列验证手段对所有变异进行筛选和过滤,明确致病基因和突变,并对表型和基因型问的关系进行分析。结果通过目标序列捕获测序技术和优化的生物信息学分析技术,我们证实了SNRNP200P.$1087L为该家系的致病基因突变。该家系患者的主要临床特征为发病年龄较早(6~8岁),均以夜盲为首发症状;病情进展十分迅速,14~17岁出现外周视野缺失,21~28岁出现中心视力的下降;视功能严重受损,眼底和全视野ERG检查均呈典型视网膜色素变性改变。结论SNRNP200P.$1087L为视网膜色素变性的热点致病突变,可引起一组新的临床表型,主要包括发病年龄早、病情进展迅速及视功能严重受损等。基于目标序列测序的HRD分子诊断技术能够提高我国HRD患者致病基因的检出率,为深入探索HRD的分子遗传学病因提供重要的技术手段。 展开更多
关键词 视网膜炎 色素性 目标序列捕获测序 高通量二代测序 SNRNP200基因
一例丑角样鱼鳞病胎儿的ABCA12基因突变分析 被引量:3
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作者 潘琼 程龙飞 +4 位作者 孙宝娟 金鑫 钮慧远 沈峰 宁颖 《中华医学遗传学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第2期292-295,共4页
目的鉴定1例丑角样鱼鳞病胎儿ATP结合盒转运子A12(ATP~binding cassette transporterA12,ABCA12)基因的致病性突变。方法产前超声检查发现胎儿存在颜面畸形(包括鼻梁塌陷、眼睑外翻、唇外翻和持续性张嘴)而引产,根据临床表现、... 目的鉴定1例丑角样鱼鳞病胎儿ATP结合盒转运子A12(ATP~binding cassette transporterA12,ABCA12)基因的致病性突变。方法产前超声检查发现胎儿存在颜面畸形(包括鼻梁塌陷、眼睑外翻、唇外翻和持续性张嘴)而引产,根据临床表现、皮肤病理检查和异常家族史确诊为丑角样鱼鳞病。提取患儿脐血及其父母的外周血DNA,采用目标区域序列捕获及高通量测序技术对患儿进行测序,确定突变位点,用Sanger测序法对突变位点进行验证。结果患儿携带了ABCA12的两个复合杂合性突变:无义突变c.3673C〉T(p.R1225X)和移码突变c.6167_6168insT(P.F2056FfsX9)。结论ABCA12基因C.3673C〉T和C.6167—6168insT复合杂合性突变可能为该丑角样鱼鳞病患儿的致病性突变,本研究结果为该病的遗传咨询和分子诊断提供了依据。 展开更多
关键词 丑角样鱼鳞病 ABCA12基因 复合杂合性突变 目标区域序列捕获及高通量测序
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