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头颈部鳞癌中FOXP3基因相关的竞争性内源性RNA网络分析 预览
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作者 孙娟 王薇 +3 位作者 胡文良 孙学威 李玲香 崔晓波 《局解手术学杂志》 2017年第2期82-85,共4页
目的探索FOXP3基因在头颈部鳞癌中的作用机制。方法选取TCGA数据库中的279例头颈部鳞癌二代测序样本,利用cbioportal筛选样本中FOXP3的共表达基因;利用String数据库,建立FOXP3的共表达网络;利用DAVID数据库分析共表达网络功能;利用... 目的探索FOXP3基因在头颈部鳞癌中的作用机制。方法选取TCGA数据库中的279例头颈部鳞癌二代测序样本,利用cbioportal筛选样本中FOXP3的共表达基因;利用String数据库,建立FOXP3的共表达网络;利用DAVID数据库分析共表达网络功能;利用miRTarBase和StarBase数据库,筛选能够调控FOXP3的短链非编码RNA(microRNA)、长链非编码RNA(in-cRNA)和环状非编码RNA(circRNA);最后,利用Cytoscape软件建立FOXP3的竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。结果在TCGA数据库的头颈部鳞癌样本中共筛选出FOXP3的共表达基因950个。(Spearman分数大于0.5)功能分析结果显示这些共表达基因的功能主要为免疫应答,T细胞、淋巴细胞和粒细胞激活等免疫相关功能。ceRNA网络揭示miR-31-5p和miR-210-3p能够靶向调控FOXP3基因。此外,XIST、TUGl、JRK和LINC00473等42个lncRNA和ZNF223-hsa-circ000898和ISYl-hsa-circ001090等31个circRNA能够通过ceRNA作用调控FOXP3。结论成功建立FOXP3基因相关的ceRNA网络,并挖掘出42个lncRNA和31个cir-cRNA可能通过ceRNA作用调控FOXP3,可为头颈部鳞状细胞癌的分子机制研究和分子靶向治疗提供新的切入点。 展开更多
关键词 喉鳞状细胞癌 FOXP3 编码RNA 环状编码RNA 竞争性内源性RNA 编码RNA 靶向治疗
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非编码RNA对脑功能的影响 被引量:1
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作者 菅敏钰 韩如泉 《国际麻醉学与复苏杂志》 CAS 2014年第10期952-956,共5页
背景 非编码RNA(noncoding RNAs,ncRNAs)包括短链非编码RNA(microRNAs,miRNAs)和长链非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNAs),二者均参与基因表达的调控,从而影响脑功能。目的 探讨ncRNAs对脑功能的影响。内容 阐述ncRNAs对中枢... 背景 非编码RNA(noncoding RNAs,ncRNAs)包括短链非编码RNA(microRNAs,miRNAs)和长链非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNAs),二者均参与基因表达的调控,从而影响脑功能。目的 探讨ncRNAs对脑功能的影响。内容 阐述ncRNAs对中枢神经系统发育及中枢神经系统疾病的影响。 趋向 随着新的ncRNAs被发现,其对脑功能影响的研究也将更加深入。 展开更多
关键词 编码RNA 编码RNA 编码RNA 脑功能
短链非编码RNA的研究进展 预览 被引量:5
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作者 沈君炜(综述) 康九红(审校) 《同济大学学报:医学版》 CAS 2011年第1期 105-110,共6页
非编码RNA,即不参与蛋白质编码的RNA,在细胞内外发挥着广泛和重要的作用。广义上讲,转运RNA(tRNA),核糖体RNA(rRNA),核内小分子RNA(snRNA)及核酶等都属于非编码RNA。对于这些非编码RNA的结构和功能,人们已经有了较为深入的认识。
关键词 编码RNA MIRNA PIRNA SIRNA
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LncRNA与miRNA的交互作用及调控机制对肿瘤发生与发展过程的影响 预览 被引量:1
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作者 芮强 何震宇 《医学综述》 2015年第9期1594-1596,共3页
长链非编码RNA(LncRNA)被作为人类基因组中重要的调控分子之一,通过多种方式发挥其生物学调控功能。研究表明,LncRNA也可作为一种竞争性的内源性RNA与非编码微RNA(miRNA)交互作用,共同参与靶向基因的调控,对肿瘤发生与发展过程产生... 长链非编码RNA(LncRNA)被作为人类基因组中重要的调控分子之一,通过多种方式发挥其生物学调控功能。研究表明,LncRNA也可作为一种竞争性的内源性RNA与非编码微RNA(miRNA)交互作用,共同参与靶向基因的调控,对肿瘤发生与发展过程产生重要影响。同时,miRNA通过大量蛋白质编码基因靶向调控LncRNA的表达,miRNA和LncRNA在调节细胞过程均有重要作用。该文在分别介绍miRNA与LncRNA功能的基础上,总结miRNA与LncRNA交互作用及调控机制对肿瘤发生与发展过程的影响。 展开更多
关键词 编码RNA 编码RNA 交互作用 调控机制
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