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TACC1亚型的研究进展
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作者 徐盼 蒋伟文(审校) 《临床口腔医学杂志》 2019年第2期115-118,共4页
转化酸性卷曲螺旋基因1(transforming acidic coiled-coil gene 1,TACC1),是TACC基因的一个亚群,该基因进化上比较保守,有一个大的卷曲螺旋结构域(TACC域)位于羧基末端。TACC1广泛参与转录、翻译以及中心体动力学等过程,在机体的正常发... 转化酸性卷曲螺旋基因1(transforming acidic coiled-coil gene 1,TACC1),是TACC基因的一个亚群,该基因进化上比较保守,有一个大的卷曲螺旋结构域(TACC域)位于羧基末端。TACC1广泛参与转录、翻译以及中心体动力学等过程,在机体的正常发育和肿瘤的发生发展中具有重要意义。TACC1调节异常也在多种恶性肿瘤中发挥重要作用。TACC1 mRNA选择性剪接产生多个变体,在癌症生物学中意义重大。随着近年来对TACC1研究的不断深入,有关其亚型的论述也越来越多,本文将对近年来有关TACC1基因亚型结构、在组织中的分布及其功能等方面的研究进行综述。 展开更多
关键词 TACC1 选择性剪接 肿瘤发生发展
RNA结合蛋白QKI在恶性肿瘤中的研究进展 预览
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作者 刘钊 武爱文 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期195-199,共5页
Quaking基因编码的QKI蛋白为具有信号转导特性和RNA激活功能的RNA面发挥着至关重要的作用。近年来有研究发现QKI转移及预后相关。QKI蛋白可通过选择性剪接、细胞周期调控、上皮间质转化等机制参与肿瘤发生发展。而QKI蛋白的表达和功能受... Quaking基因编码的QKI蛋白为具有信号转导特性和RNA激活功能的RNA面发挥着至关重要的作用。近年来有研究发现QKI转移及预后相关。QKI蛋白可通过选择性剪接、细胞周期调控、上皮间质转化等机制参与肿瘤发生发展。而QKI蛋白的表达和功能受DNA重要的生物标志物。本文就QKI蛋白在恶性肿瘤发生发展中相关的功能研究及上下游调控机制进行综述。 展开更多
关键词 QKI蛋白 肿瘤 MIRNAS 选择性剪接 上皮间质转化
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lncRNA选择性剪接调控的研究进展
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作者 季慧慧 赵永杰 +1 位作者 郑中华 段世伟 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2019年第2期144-151,共8页
长链非编码RNA (lncRNA)选择性剪接是指剪除未成熟lncRNA中的内含子,并将外显子连接起来生成成熟lncRNA的过程.在各类疾病发生和发展过程中,异常的选择性剪接起着重要作用. lncRNA选择性剪接直接参与膀胱癌、结直肠癌、肝癌、神经母细... 长链非编码RNA (lncRNA)选择性剪接是指剪除未成熟lncRNA中的内含子,并将外显子连接起来生成成熟lncRNA的过程.在各类疾病发生和发展过程中,异常的选择性剪接起着重要作用. lncRNA选择性剪接直接参与膀胱癌、结直肠癌、肝癌、神经母细胞瘤等多种肿瘤的发病机制,且与胚胎发育、软骨毛发发育、多系统萎缩症等紧密相关.在此,我们对lncRNA选择性剪接的起因、调控机制以及对疾病影响的研究进展进行综述.此外,本文还介绍了两个与lncRNA选择性剪接相关的数据库(SpliceMap和LNCediting). 展开更多
关键词 lncRNA 选择性剪接 疾病发生 异构体
例谈基因表达过程中多种肽链的合成 预览
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作者 张勇 王健 《中学生物学》 2019年第2期4-5,共2页
阐述了生物体在基因的表达过程中,可以通过mRNA前体的选择性剪接、一个RNA编码多个基因、肽链的合成后加工等方式合成多种肽链。
关键词 基因 选择性剪接 肽链
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靶向调控血管内皮生长因子选择性剪接对肾细胞癌的作用研究
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作者 陶丹 蒋国松 黄超 《临床泌尿外科杂志》 2019年第8期591-597,601共8页
目的:靶向干预血管内皮生长因子(VEGF)mRNA前体(pre-mRNA)第8外显子选择性剪接,重建抗血管生成因子的优势表达,高效抑制肾细胞癌血管生成。方法:针对VEGF pre-mRNA的剪接特点,分别在第7内含子和8a外显子交接附近、交接点和下游设计了与... 目的:靶向干预血管内皮生长因子(VEGF)mRNA前体(pre-mRNA)第8外显子选择性剪接,重建抗血管生成因子的优势表达,高效抑制肾细胞癌血管生成。方法:针对VEGF pre-mRNA的剪接特点,分别在第7内含子和8a外显子交接附近、交接点和下游设计了与之特异性结合的3条小干扰RNA(siRNA),探讨靶向不同区域的siRNA对VEGF pre-mRNA选择性剪接的影响,并进一步观察其调控肾癌细胞增殖、迁移、克隆形成及血管生成等功能的作用。结果:促血管生成的VEGF剪接体(VEGF165a)在肾细胞癌中表达明显上调,而抗血管生成的VEGF165b在肾细胞癌中表达明显下调;针对剪接位点设计的靶向siRNA能够有效干预VEGF选择性剪接,使VEGF165a表达下降,VEGF165b表达显著上升;与此同时,肾癌细胞增殖、迁移、促血管生成能力显著下降。结论:本研究为进一步利用siRNA调控基因选择性剪接奠定理论基础,并为肾细胞癌的靶向治疗提供了更具针对性的新策略。 展开更多
关键词 肾细胞癌 血管内皮生长因子 选择性剪接 小干扰RNA
环状RNA的产生、研究方法及功能 预览
6
作者 刘旭庆 高宇帮 +5 位作者 赵良真 蔡宇晨 王汇源 苗苗 顾连峰 张航晓 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期469-485,共17页
随着高通量测序技术的发展,环状RNA(circular RNAs,circRNAs)逐渐成为非编码RNA研究领域的热点。本文系统综述了环状RNA侧翼内含子自身互补配对驱动、RNA结合蛋白驱动以及套索驱动这3种环状RNA形成模型,并从高通量文库构建、生物信息学... 随着高通量测序技术的发展,环状RNA(circular RNAs,circRNAs)逐渐成为非编码RNA研究领域的热点。本文系统综述了环状RNA侧翼内含子自身互补配对驱动、RNA结合蛋白驱动以及套索驱动这3种环状RNA形成模型,并从高通量文库构建、生物信息学鉴别和常用的实验验证等3个方面对环状RNA的研究方法进行了介绍。同时,本文详细归纳了环状RNA作为microRNA(miRNA)或蛋白的海绵体、调控宿主基因的选择性剪接和表达、翻译成多肽等多种功能。最后通过系统综述植物环状RNA的特征及最新研究进展,为环状RNA在植物学中的进一步研究提供了新的视野。 展开更多
关键词 环状RNA 反向剪接 选择性剪接 海绵体
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Tra2β蛋白在肿瘤中的研究进展 预览
7
作者 郝福 郭建华 孙睿 《中国药物与临床》 CAS 2019年第5期732-734,共3页
转化因子(Transformer)2β蛋白(Tra2β)的编码基因Tra2b在人体中的表达具有组织特异性,其在心脏、骨骼肌和胰腺中表达较高,而在肾脏和肝脏中则相对较低,此外,有文献报道,Tra2b基因在部分肿瘤中会发生明显扩增,如乳腺癌、胃癌、肺癌、宫... 转化因子(Transformer)2β蛋白(Tra2β)的编码基因Tra2b在人体中的表达具有组织特异性,其在心脏、骨骼肌和胰腺中表达较高,而在肾脏和肝脏中则相对较低,此外,有文献报道,Tra2b基因在部分肿瘤中会发生明显扩增,如乳腺癌、胃癌、肺癌、宫颈癌以及头颈癌等[1,2]。Tra2β和Tra2α是Tra2的2个亚族,它们具有相似的氨基酸序列和RNA特异性结合能力,Tra2β是这2种同源基因中的'显性'基因. 展开更多
关键词 Β蛋白 细胞增殖 选择性剪接 研究进展
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奶牛CD4基因选择性剪接的鉴定 预览
8
作者 许金根 蔡治华 王立克 《安徽科技学院学报》 2018年第3期17-20,共4页
目的:通过检测奶牛CD4基因选择性剪接,为研究CD4基因的结构和功能打下基础。方法:采集奶牛尾静脉血,提取血液总RNA后反转录成cDNA。通过反转录PCR扩增和测序,以鉴定CD4基因剪接体和单核苷酸多态性。结果:通过序列比对分析,发现奶牛CD... 目的:通过检测奶牛CD4基因选择性剪接,为研究CD4基因的结构和功能打下基础。方法:采集奶牛尾静脉血,提取血液总RNA后反转录成cDNA。通过反转录PCR扩增和测序,以鉴定CD4基因剪接体和单核苷酸多态性。结果:通过序列比对分析,发现奶牛CD4基因外显子8处存在缺失,扩增的两种CD4mRNA序列长度相差122bp(整个外显子8缺失)。另外,在牛CD4基因外显子8处检测到1个碱基突变(C/A)。结论:奶牛CD4基因发现两种相差外显子8的剪接体,并检测到1个SNP。 展开更多
关键词 CD4基因 奶牛 选择性剪接 单核苷酸多态
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受胆固醇调节的变异剪接体及其意义 预览
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作者 庞亚娜 赵晋枫 +1 位作者 董元坤 张策 《中国医学创新》 CAS 2018年第8期18-22,共5页
目的:检测人肝癌细胞中LDLR的变异剪接体LDLR-ΔExon4、LDLR-ΔExon12,HMGCS1的变异剪接体HMGCS1-ΔExon2和HMGCR的变异剪接体HMGCR-ExonΔ13是否受胆固醇的调节。方法:建立高胆固醇模型组、低胆固醇模型组及正常组,提取不同模型组... 目的:检测人肝癌细胞中LDLR的变异剪接体LDLR-ΔExon4、LDLR-ΔExon12,HMGCS1的变异剪接体HMGCS1-ΔExon2和HMGCR的变异剪接体HMGCR-ExonΔ13是否受胆固醇的调节。方法:建立高胆固醇模型组、低胆固醇模型组及正常组,提取不同模型组的RNA并进行反转录,采用Realtime PCR(RT-PCR)技术检测LDLR-ΔExon4,LDLR-ΔExon12,HMGCS1-ΔExon2和HMGCR-ExonΔ13的mRNA的表达。结果:在高胆固醇模型组中,与正常组相比,LDLR-ΔExon4、LDLR-ΔExon12、HMGCS1-ΔExon2及HMGCR-ExonΔ13的mRNA的表达量与各基因全长相比均明显升高(P<0.05);而在低胆固醇模型组中,与正常组相比,上述的变异剪接体mRNA的表达量与各基因全长相比均明显下降(P<0.05)。结论:LDLR-ΔExon4、LDLR-ΔExon12、HMGCS1-ΔExon2及HMGCR-ExonΔ13等变异剪接体受胆固醇的调节,并可能参与并调控胆固醇的代谢。 展开更多
关键词 选择性剪接 胆固醇 变异剪接
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剪接因子SRSF7新的mRNA剪接异构体及在顺铂处理的细胞中的变化 预览
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作者 马春霞 陈香玲 +4 位作者 李明阳 杨渊 刘淑媛 史荔 俞建昆 《贵州医科大学学报》 CAS 2018年第2期154-159,共6页
目的:探讨不同梯度浓度顺铂(CDDP)处理不同肺癌细胞后新发现的剪接因子SRSF7mRNA异构体在同浓度CDDP处理后不同的细胞中的水平变化。方法:采用梯度浓度的CDDP处理肺癌细胞A549(8、18、24、32、40、48及56μmol/L)和H1299(12、24... 目的:探讨不同梯度浓度顺铂(CDDP)处理不同肺癌细胞后新发现的剪接因子SRSF7mRNA异构体在同浓度CDDP处理后不同的细胞中的水平变化。方法:采用梯度浓度的CDDP处理肺癌细胞A549(8、18、24、32、40、48及56μmol/L)和H1299(12、24、36、48、60、72及84μmol/L),处理24h后提取总RNA,进行RTPCR检测SRSF7mRNA剪接异构体,并选取NCBI中未确定的异构体进行TA克隆后测序并分析鉴定异构体类型;用56μmol/L的CDDP处理人胚肾细胞293FT,宫颈癌细胞CaSki、SiHa、C33A细胞24h,提取总RNA后验证新发现的SRSF7mRNA剪切异构体是否存在这些细胞中。结果:发现3种新的SRSF7mRNA剪接异构体(分别标记为New1、New2及New3),在肺癌细胞A549、H1299,人胚肾细胞293FT,宫颈癌细胞CaSki、SiHa、C33A细胞等多种肿瘤细胞中均存在,根据NCBI的预测New1,New2,New3异构体均为非编码蛋白的mRNA异构体,随着处理CDDP浓度的增加,其比例明显上升;而编码蛋白的mRNA异构体a和(或)b所占比例明显下降;同时SRSF7的总mRNA水平逐渐降低。结论:新发现的3种非编码的mRNA异构体的变化揭示细胞可能通过SRSF7自身的mRNA选择性剪接来应对DNA损伤。 展开更多
关键词 顺铂 富含精氨酸丝氨酸的剪接因子7 选择性剪接 异构体 细胞凋亡
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选择性剪接调控蛋白PTBP3与恶性肿瘤相关性的研究进展 预览
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作者 陈彬(综述) 孙珏 +2 位作者 谢曼丽 陈伟霞 赵爱光(审校) 《国际检验医学杂志》 CAS 2018年第19期2420-2422,共3页
选择性剪接调控蛋白PTBP3是一种RNA结合蛋白,存在于造血细胞、脑、肺、胃、乳腺等多种细胞中。长期以来PTBP3的功能未受到足够重视,自从人们发现PTBP3是选择性剪接调控蛋白hnRNP家族中的一员,在转录后调控中起着重要作用,其研究开... 选择性剪接调控蛋白PTBP3是一种RNA结合蛋白,存在于造血细胞、脑、肺、胃、乳腺等多种细胞中。长期以来PTBP3的功能未受到足够重视,自从人们发现PTBP3是选择性剪接调控蛋白hnRNP家族中的一员,在转录后调控中起着重要作用,其研究开始取得一定进展,发现PTBP3与多种恶性肿瘤的关系密切。PTBP3在不同肿瘤中起到不同的作用,这与选择性剪接的组织和环境依赖性密切相关。 展开更多
关键词 选择性剪接 PTBP3 肿瘤
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胶质瘤中PTB调控长非编码RNA选择性剪接的筛选 预览
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作者 卫群芳 朱丽媛 +1 位作者 韩为 彭小忠 《基础医学与临床》 CSCD 2018年第6期787-792,共6页
目的探究在神经胶质瘤发生发展过程中PTB调控选择性剪接的长非编码RNA。方法全转录组芯片分析筛选受PTB蛋白介导影响选择性剪接的长非编码RNA。提取胶质瘤和正常细胞系及临床病例组织样品和敲低PTB的神经胶质瘤细胞总RNA,实时荧光定量PC... 目的探究在神经胶质瘤发生发展过程中PTB调控选择性剪接的长非编码RNA。方法全转录组芯片分析筛选受PTB蛋白介导影响选择性剪接的长非编码RNA。提取胶质瘤和正常细胞系及临床病例组织样品和敲低PTB的神经胶质瘤细胞总RNA,实时荧光定量PCR验证候选基因不同剪接异构体的表达及比值变化。核质分离实验鉴定长非编码RNA细胞定位。结果筛选出16条受PTB蛋白介导影响选择性剪接的长非编码RNA,其中linc00882的不同剪接异构体的表达模式受PTB调控所产生的差异最明显。检测到linc00882定位于细胞质。结论神经胶质瘤中PTB蛋白参与长非编码RNA linc00882的选择性剪接。 展开更多
关键词 选择性剪接 长非编码RNA PTB 神经胶质瘤
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有氧运动影响低密度脂蛋白受体pre-mRNA的选择性剪接及组蛋白修饰机制研究 预览
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作者 赵晋枫 武宝爱 《山东体育学院学报》 CSSCI 北大核心 2018年第6期78-83,共6页
低密度脂蛋白受体(Low density lipoprotein receptor,LDLR)与脂代谢关系密切,可以清除血浆中大部分胆固醇。近来离体研究发现,高胆固醇可以改变LDLR pre-mRNA的选择性剪接导致变异剪接体LDLR-△Exon4和LDLR-△Exon12比例上升,而其生物... 低密度脂蛋白受体(Low density lipoprotein receptor,LDLR)与脂代谢关系密切,可以清除血浆中大部分胆固醇。近来离体研究发现,高胆固醇可以改变LDLR pre-mRNA的选择性剪接导致变异剪接体LDLR-△Exon4和LDLR-△Exon12比例上升,而其生物学功能与全长的LDLR有明显差别。有氧运动可以增加全长的LDLR的表达,起到降低血胆固醇的作用,但机制未明。新近研究表明,组蛋白修饰与pre-mRNA的选择性剪接(LDLR pre-mRNA)有密切的关系。对近年来有氧运动降低高胆固醇血症以及组蛋白修饰对于LDLR pre-mRNA选择性剪接的影响进行综述,为进一步阐述有氧运动降低高胆固醇血症机制研究提供新思路。 展开更多
关键词 有氧运动 高胆固醇血症 LDLR 选择性剪接 组蛋白修饰
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家蚕orcokinin基因的选择性剪接与表达分析
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作者 王平阳 赵巧玲 +2 位作者 裘智勇 沈兴家 夏定国 《蚕业科学》 CSCD 北大核心 2018年第6期849-858,共10页
Orcokinin(OK)是节肢动物门特有的一种神经肽,该神经肽自从在小龙虾中发现以来,便陆续在节肢动物门其他物种中鉴定到,然而由于其结构的复杂性和功能的多样性,对OK基因的结构与作用机制知之甚少。利用RACE克隆、qRT-PCR等方法对家蚕OK基... Orcokinin(OK)是节肢动物门特有的一种神经肽,该神经肽自从在小龙虾中发现以来,便陆续在节肢动物门其他物种中鉴定到,然而由于其结构的复杂性和功能的多样性,对OK基因的结构与作用机制知之甚少。利用RACE克隆、qRT-PCR等方法对家蚕OK基因(BmOK)的结构与表达进行分析。结果表明BmOK存在选择性剪接,形成2个转录本BmOKA和BmOKB;BmOKA由外显子exon1、exon2、exon3、exon5、exon6、exon7和exon8组成,全长BmOKB由外显子exon1、exon2、exon3和exon4组成。BmOKA由于选择性剪接又有4个亚型,分别为BmOKA1(CDS长度为534 bp)、BmOKA2(CDS长度为564 bp)、BmOKA3(CDS长度为570 bp)和BmOKA4(CDS长度为600 bp),占比为22∶13∶5∶1,4个亚型有相同的5′ UTR(62 bp)和3′ UTR(188 bp);BmOKB只有一种CDS(864 bp),5′ UTR序列与BmOKA相同(62 bp),但3′ UTR(168 bp)不同。BmOKA主要在家蚕腹神经索表达,在4龄眠后18 h表达量最低;BmOKB在头部和中肠的表达量相对较高,眠期表达量高于其他时期。BmOKA与斜纹夜蛾Orcokinin同源性最高,完整蛋白质前体的同源性为33.80%。本研究清晰地展示了家蚕BmOK基因的结构与表达模式,为后续分析BmOK基因的功能奠定了理论基础并提供实验依据。 展开更多
关键词 BmOK基因 选择性剪接 神经肽 家蚕
RBM4a基因表达与功能研究进展
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作者 雍红梅 周学义 +1 位作者 赵薇 冯振卿 《南京医科大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2018年第7期1009-1013,共5页
RNA结合基序4(RNA-binding motif 4,RBM4)是一个参与不同细胞生物学过程的RNA结合蛋白(RNA-binding protein,RBP),其结构包含两个RNA识别基序和一个CCHC型锌指结构。RBM4表达于多种组织,参与前体m RNA的选择性剪接、翻译控制和RNA... RNA结合基序4(RNA-binding motif 4,RBM4)是一个参与不同细胞生物学过程的RNA结合蛋白(RNA-binding protein,RBP),其结构包含两个RNA识别基序和一个CCHC型锌指结构。RBM4表达于多种组织,参与前体m RNA的选择性剪接、翻译控制和RNA沉默等转录后基因调控过程。RBM4具有多种生物学功能,包括维持胚胎和性腺发育、控制昼夜节律及介导细胞分化等。RBM4的表达异常可导致多种疾病的发生,特别是与肿瘤的关系密切,但具体分子机制尚需进一步研究。文章就RBM4的相关研究进展作一综述。 展开更多
关键词 RBM4 选择性剪接 翻译控制 RNA沉默 疾病
人HNRNPA1基因及蛋白质的生物信息学分析 预览
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作者 马素珍 刘丹丹 +3 位作者 张方方 潘晓丽 刘胜利 朱艳琴 《安徽大学学报:自然科学版》 北大核心 2018年第1期75-85,共11页
采用生物信息学的方法分析人HNRNPA1基因的启动子情况及蛋白质的理化性质、信号肽及NLS、亲疏水性、跨膜区域、蛋白质结构、相互作用的蛋白质及GO注释.选择合适软件对HNRNPA1相关信息进行分析.结果显示,预测的HNRNPA1因存在1个启动子... 采用生物信息学的方法分析人HNRNPA1基因的启动子情况及蛋白质的理化性质、信号肽及NLS、亲疏水性、跨膜区域、蛋白质结构、相互作用的蛋白质及GO注释.选择合适软件对HNRNPA1相关信息进行分析.结果显示,预测的HNRNPA1因存在1个启动子;HNRNPA1蛋白质是由372个氨基酸组成的具有NLS、无跨膜结构的亲水不稳定蛋白质,其等电点为9.17;哺乳动物中氨基酸序列高度保守;二级结构以无规卷曲为主,预测的三级结构经拉曼图分析可信度高;HNRNPA1多定位于细胞核,与RNA的选择性剪接及mRNA运输有关.此外,启动子的甲基化对HNRNPA1表达影响明显,其蛋白质具有NLS、无跨膜结构且不稳定,属于亲水蛋白质,分布于细胞核,对mRNA的成熟具有重要作用. 展开更多
关键词 HNRNPA1 RNA 选择性剪接 生物信息学
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神经母细胞瘤SK-N-SH细胞内DHRS4L2基因一种新选择性剪接亚型S4的克隆和亚细胞定位
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作者 龚慧 李一凡 +6 位作者 祝胜郎 杜冀晖 王磊 周蓓 廉婕 李蓉 麦丽文 《医学分子生物学杂志》 CAS 2017年第4期192-198,共7页
目的 神经母细胞瘤SK-N-SH细胞系脱氢酶/还原酶(SDR家族)成员4类2[dehydrogenase/reductase(SDR family)member 4 like 2,DHRS4L2]基因的一种新的选择性剪接亚型克隆、生物信息学分析及其亚细胞定位.方法 以SK-N-SH细胞cDNA为模板,... 目的 神经母细胞瘤SK-N-SH细胞系脱氢酶/还原酶(SDR家族)成员4类2[dehydrogenase/reductase(SDR family)member 4 like 2,DHRS4L2]基因的一种新的选择性剪接亚型克隆、生物信息学分析及其亚细胞定位.方法 以SK-N-SH细胞cDNA为模板,PCR扩增DHRS4基因簇Ea1转录本.将PCR产物A-T克隆至pGEMT-Easy质粒,对质粒进行DNA Sanger测序.将测序所得序列用NCBI ORF finder分析其编码区,用Motif Scan分析预测蛋白氨基酸序列.用Clustal Omega进行蛋白序列比对分析.将新亚型完整编码框cDNA以及删除偶核定位信号的编码框分别插入pEGFP-C1质粒,所得质粒和空质粒分别转染SK-N-SH细胞,在荧光显微镜下观察转染表达蛋白亚细胞定位.结果 用RT-PCR和Sanger测序方法发现,SK-N-SH表达DHRS4L2 Ea1转录本,未检测到其表达脱氢酶/还原酶(SDR家族)成员4类1[dehydrogenase/reductase(SDR family)member 4 like 1,DHRS4L1]的Ea2转录本.DHRS4L2 Ea1表达一个新的选择性剪接亚型DHRS4L2-S4(KU141377),由AY616183基础上在Ea1与E2外显子之间插入新外显子Ej形成,外显子Ej含有新亚型翻译起始密码子ATG.转录本KU141377预测蛋白羧基端具有偶核定位信号(bipartite nuclear localization signal,NLS),提示其可能定位于细胞核.绿色荧光蛋白融合蛋白实验显示,在SK-N-SH细胞该蛋白定位于细胞核.该蛋白还含有一个甘氨酸密集区(glycine-rich region)和阿片样生长因子受体重复(opioid growth factor receptor repeat)序列.结论 研究发现SK-N-SH细胞表达的一种DHRS4L2新选择性剪接亚型KU141377,其预测编码蛋白含有细胞偶核定位信号,融合荧光蛋白实验显示该新亚型定位于细胞核,这为后续研究DHRS4L2在神经母细胞瘤中的潜在功能奠定基础. 展开更多
关键词 DHRS4L2基因 选择性剪接 细胞核定位
测序分析转录因子网络调控阿司匹林刺激下血管内皮细胞中的可变表达
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作者 刘芳 单伟 +2 位作者 李舒 王鹤鸣 孙苑红 《实用手外科杂志》 2017年第4期469-472,共4页
目的 旨在探讨潜在的人脐静脉血管内皮细胞(HUVEC)在阿司匹林刺激下的应答机制.方法80μg/mL阿司匹林作用或不作用于人脐静脉血管内皮细胞,4 d后从人脐静脉血管内皮细胞中提取RNA.RNA测序及数据过滤(工具:NGSQC工具包),无异质的数... 目的 旨在探讨潜在的人脐静脉血管内皮细胞(HUVEC)在阿司匹林刺激下的应答机制.方法80μg/mL阿司匹林作用或不作用于人脐静脉血管内皮细胞,4 d后从人脐静脉血管内皮细胞中提取RNA.RNA测序及数据过滤(工具:NGSQC工具包),无异质的数据成图于基因组hg19(工具:tophat2).此后,147个差异表达基因(DEGS)识别于阿司匹林组和对照组之间(工具:cuffdiff),且富集在与细胞因子受体的相互作用和趋化因子信号相关的11条通路上.结果构建差异表达基因蛋白质-蛋白质相互作用网络(工具:STRING),且ISG15和MX1是关键性差异表达基因.构建差异表达基因和转录因子调控网络(TFS)(工具:TRED数据库),CCL2和FN1(枢纽性表达基因)受NFKB1和RELA共同调节(枢纽性TFS).此外,分析外显子的使用和选择性剪接(工具:dexseq),在阿司匹林刺激下ADORA2A剪接发生改变.结论阿司匹林可影响血管内皮细胞的增殖和迁移,可能通过调节ISG15,MX1,CCL2,FN1以及ADORA2A的表达来参与血管生成过程. 展开更多
关键词 选择性剪接 差异表达基因 人脐静脉血管内皮细胞 转录组测序 阿司匹林
可变剪接与肿瘤
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作者 刘源 张红河 徐恩萍 《中华病理学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第8期585-589,共5页
可变剪接,又称选择性剪接(alternative splicing),1978年Gilbert[1]在对Adenovirus hexon基因的研究中发现并提出可变剪接现象,他认为一个基因的不同编码区可以拼接在一起被剪接下来,产生功能不同的mRNA.20世纪80年代初,人们在哺乳动... 可变剪接,又称选择性剪接(alternative splicing),1978年Gilbert[1]在对Adenovirus hexon基因的研究中发现并提出可变剪接现象,他认为一个基因的不同编码区可以拼接在一起被剪接下来,产生功能不同的mRNA.20世纪80年代初,人们在哺乳动物编码荷尔蒙降血钙素的基因中发现可变剪接现象[2],在编码免疫球蛋白的基因中也发现了可变剪接[3].此后,越来越多的研究证实可变剪接广泛存在于真核生物中[4].在哺乳动物中,可变剪接与mRNA的加工紧密相关,是增加mRNA复杂性和蛋白质多样性的原因之一.最新的mRNA测序技术和表达序列标签技术检测到大约95%的人类基因与多个外显子进行可变剪接,异常可变剪接可能导致肿瘤的发生[5-6]. 展开更多
关键词 可变剪接 肿瘤 mRNA 表达序列标签 哺乳动物 选择性剪接 免疫球蛋白 N基因
Characterization of the voltage-gated sodium channel of the Asian citrus psyllid, Diaphorina citri
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作者 Bin Liu Monique R. Coy +1 位作者 Jin-Jun Wang Lukasz L. Stelinski 《昆虫科学:英文版》 SCIE CAS CSCD 2017年第1期47-59,共13页
亚洲柠檬 psyllid, Diaphorina citri Kuwayama (半翅类:Liviidae ) ,是柠檬的一个重要昆虫害虫。它是 &lsquo;Candidatus&rsquo; 的向量Liberibacter asiaticus,感染柠檬的一个韧皮部有限细菌,导致疾病 Huanglongbing (HL... 亚洲柠檬 psyllid, Diaphorina citri Kuwayama (半翅类:Liviidae ) ,是柠檬的一个重要昆虫害虫。它是 &lsquo;Candidatus&rsquo; 的向量Liberibacter asiaticus,感染柠檬的一个韧皮部有限细菌,导致疾病 Huanglongbing (HLB ) 。疾病管理重重地依靠 D 的抑制。有杀虫药剂的 citri 人口,包括 pyrethroids。在到监视器杀虫药剂抵抗的最近的年度调查,把危险性归结为 fenpropathrin 在 D 的几张地人口被识别。citri。pyrethroids 的主要目标是电压门钠隧道(VGSC ) 。因为减少有约束力的 pyrethroid 或改变 gating 动力学的变化, VGSC 对目标地点 insensitivity 敏感。这些变化,已知的同样击倒的抵抗或 kdr,在节肢动物种类的宽差异被报导了。在有 kdr 变化的联合,拼接的选择也与减少的 pyrethroid 功效被联系了。这里,我们在 D 报导 VGSC 的分子的描述。与越过这种的发展阶段的其他的拼接的调查一起的 citri。以前的研究表明了那 D。citri 有一个优美酶的军火库除去杀虫药剂导致减少的功效。从当前的调查的结果证明目标地点 insensitivity 也是到在 D 的 pyrethroids 的杀虫药剂电阻的一个潜在的基础。citri。VGSC 顺序和它的分子的描述应该便于电阻的一个确定的案例的内在的原因的早说明到 pyrethroids。这是从 hemipteran 的 VGSC 的第一描述到详细的这水平,与 dipterans 和 lepidopterans 上的以前的研究的多数。 展开更多
关键词 电压门控钠通道 柑橘木虱 拟除虫菊酯杀虫剂 拟除虫菊酯类杀虫剂 表征 选择性剪接 亚洲 击倒抗
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