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西瓜高密度遗传图谱的构建及基因组Scaffolds定位 预览
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作者 丁双玉 许勇 +9 位作者 任毅(编译) 赵泓 寇青禾 江姣 张海英 侯文菊 邹小花 孙宏贺 宫国义 Amnon Levi 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2019年第8期191-192,共2页
目的与意义:现代西瓜品种的遗传基础较窄,然而西瓜中有几个亚种具有广泛遗传多样性,它们可以成为改良西瓜品种的有用种质资源.当前西瓜基因组资源和遗传图谱有限,并需要开发一种可用于鉴定西瓜染色体的细胞遗传学图谱,其能够划定栽培西... 目的与意义:现代西瓜品种的遗传基础较窄,然而西瓜中有几个亚种具有广泛遗传多样性,它们可以成为改良西瓜品种的有用种质资源.当前西瓜基因组资源和遗传图谱有限,并需要开发一种可用于鉴定西瓜染色体的细胞遗传学图谱,其能够划定栽培西瓜与其它相关的西瓜属植物之间存在的结构差异.现如今,还没有任何关于西瓜基因组序列的高密度遗传连锁图谱的报道,致使西瓜在不同品种之间遗传多样性较低.所以,构建高密度的西瓜遗传连锁图谱成为当下之需. 展开更多
关键词 基因组序列 遗传图谱 高密度 西瓜 遗传连锁 遗传多样性 定位 种质资源
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基于RIL群体鉴定棉花抗黄萎病相关QTLs 预览
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作者 鲁宁宁 赵云雷 +6 位作者 王红梅 陈伟 赵佩 龚海燕 崔艳利 桑晓慧 张凯 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2019年第3期254-262,共9页
【目的】鉴定出能够稳定表达的棉花抗黄萎病相关数量性状位点(Quantitative trait loci,QTLs)。【方法】以抗落叶型黄萎病棉花品种常抗棉和感黄萎病品种TM-1为亲本配制的111个重组自交系家系为作图群体,筛选出多态性简单序列重复(Simple... 【目的】鉴定出能够稳定表达的棉花抗黄萎病相关数量性状位点(Quantitative trait loci,QTLs)。【方法】以抗落叶型黄萎病棉花品种常抗棉和感黄萎病品种TM-1为亲本配制的111个重组自交系家系为作图群体,筛选出多态性简单序列重复(Simple sequence repeat,SSR)标记,并用于构建遗传图谱。用完备复合区间作图法对该群体在安阳大田、新疆重病地及病圃等多个环境下的黄萎病病情指数进行QTLs检测。【结果】构建了1张含有12个连锁群、40个标记、总长212.5 cM(厘摩)的遗传图谱。获得了6个与抗黄萎病基因相关的QTLs,对数优势比(Logarithm of the odd score,LOD)分布在2.51~5.55,贡献率最大为20.34%,最小为6.93%。其中,qVR-D05-1能够在安阳大田2015年7月15日和新疆南疆重病地2016年7月9日2个环境中检测到,贡献率分别为12.96%和20.34%。【结论】本研究得到的qVR-D05-1能够为定位出稳定的棉花抗黄萎病相关QTLs提供参考。 展开更多
关键词 棉花 SSR 黄萎病 遗传图谱 数量性状位点
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基于重测序的超密遗传图谱揭示甜瓜蔓枯病抗性相关基因 预览
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作者 胡仲远 杨景华 +4 位作者 张明方(编译) 邓冠聪 牟海鹏 徐宇辉 李晨 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2019年第8期251-252,共2页
目的与意义:蔓枯病(Gsb)是甜瓜的重要病害,在南方多雨地区设施环境下高发,严重影响产量和品质.选育抗病品种是防治蔓枯病最常用、也是最经济有效的方法之一.本研究希望阐明甜瓜抗蔓枯病遗传特性,构建基于单核苷酸多态性(SNPs)的甜瓜高... 目的与意义:蔓枯病(Gsb)是甜瓜的重要病害,在南方多雨地区设施环境下高发,严重影响产量和品质.选育抗病品种是防治蔓枯病最常用、也是最经济有效的方法之一.本研究希望阐明甜瓜抗蔓枯病遗传特性,构建基于单核苷酸多态性(SNPs)的甜瓜高密度遗传图谱,对抗蔓枯病基因进行定位,以获得控制甜瓜蔓枯病抗性的候选基因. 展开更多
关键词 甜瓜蔓枯病 抗性相关基因 遗传图谱 单核苷酸多态性 超密 测序 多雨地区 抗病品种
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饲用型小黑麦遗传图谱构建及草产量相关性状QTLs初步定位 预览
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作者 刘晶 赵方媛 +3 位作者 李冬梅 李雪 田新会 杜文华 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期219-226,共8页
本研究以饲用型小黑麦杂交F2代为作图群体,利用ISSR分子标记构建了遗传连锁图谱,并对小黑麦草产量相关性状(株高,分蘖数,单株生物量)进行了QTLs定位,可为小黑麦草产量相关主效QTL挖掘、功能基因定位以及分子标记辅助育种奠定基础。结果... 本研究以饲用型小黑麦杂交F2代为作图群体,利用ISSR分子标记构建了遗传连锁图谱,并对小黑麦草产量相关性状(株高,分蘖数,单株生物量)进行了QTLs定位,可为小黑麦草产量相关主效QTL挖掘、功能基因定位以及分子标记辅助育种奠定基础。结果表明:521个F2代单株草产量相关性状的田间表型数据呈连续变异,分布频率大致接近正态分布,可用于QTLs定位。该遗传图谱包含7个连锁群,图谱总长度为542.9cM,标记间平均距离为5.90cM,共有92个位点。对草产量相关性状基因进行QTL定位分析,共检测到17个QTLs,分布在6个连锁群上,控制株高的QTLs有5个,贡献率为6.7%~13.2%;控制分蘖数的QTLs有7个,贡献率为5.4%~15.4%;控制单株生物量的QTLs有5个,贡献率为7.4%~12.4%。其中QPH7-2,QNT2-2和QBS2分别对小黑麦株高、分蘖数和单株生物量的贡献率最大,为主效QTLs,可对其进行进一步克隆、转化及利用。 展开更多
关键词 小黑麦 ISSR标记 遗传图谱 草产量相关性状 QTLS定位
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基于DArT-Seq SNP的高密度遗传图谱的构建及野生型和栽培型西瓜杂交遗传群体偏分离基因组区域的鉴定 预览
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作者 任润生 羊杏平(编译) +6 位作者 Rumiana Ray 李苹芳 徐锦华 张曼 刘广 姚协丰 Andrzej Kilian 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2019年第8期172-173,共2页
目的与意义:西瓜[Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum.et Nakai]是重要的蔬菜作物,在全世界范围内都广泛种植.构建高密度的西瓜遗传图谱和不断利用新开发的标记构建饱和遗传图谱仍然是目前西瓜基因组学研究的重要内容之一.本项研究主要... 目的与意义:西瓜[Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum.et Nakai]是重要的蔬菜作物,在全世界范围内都广泛种植.构建高密度的西瓜遗传图谱和不断利用新开发的标记构建饱和遗传图谱仍然是目前西瓜基因组学研究的重要内容之一.本项研究主要以西瓜自交系‘K3’和野生西瓜种‘PI189225’为亲本构建F2分离群体,利用以DArTseq为基础的SNP标记构建西瓜高密度遗传连锁图谱. 展开更多
关键词 SNP标记 遗传图谱 基因组学 西瓜种 高密度 野生型 遗传群体 偏分离
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基于DArTSeq的SNP标记的西瓜核心种质遗传多样性和群体结构分析 预览
6
作者 任润生 羊杏平(编译) +6 位作者 Ray 徐锦华 李苹芳 张曼 刘广 姚协丰 Andrzej Kilian 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2019年第8期174-175,共2页
目的与意义:亲本材料是进行育种工作的基础,遗传基础狭窄导致难以培育出突破性品种,因此亟需加强遗传资源的引进及其农艺性状特征和遗传基础的了解与掌握,对现有优良西瓜品种和育种亲本材料进行遗传多样性研究,可有效减少相似遗传背景... 目的与意义:亲本材料是进行育种工作的基础,遗传基础狭窄导致难以培育出突破性品种,因此亟需加强遗传资源的引进及其农艺性状特征和遗传基础的了解与掌握,对现有优良西瓜品种和育种亲本材料进行遗传多样性研究,可有效减少相似遗传背景的组合,减少育种的工作量。同时,随着分子生物学技术的发展,分子标记种类及检测手段日趋完善,利用分子标记技术对植物进行聚类分析,可以快速了解植物的遗传多样性、亲缘关系和品种鉴定等。本研究对37份核心西瓜种质进行遗传多样性分析,确定这些西瓜核心种质材料间的遗传背景差异,为后期育种工作中的亲本组配、等位基因发掘和标记辅助选择等提供参考。 展开更多
关键词 SNP标记 遗传图谱 基因组学 西瓜种 高密度 野生型 遗传群体 偏分离
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甜瓜侧枝相关性状的QTL定位
7
作者 张肖静 张凯歌 +6 位作者 朱华玉 张宇 胡倩梅 程思源 张敏娟 胡建斌 杨路明 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期519-528,共10页
以甜瓜长侧枝自交系‘TopMark’和短侧枝自交系‘PI353814’为亲本,构建了F2群体和F2:3家系。利用92个F2单株构建了一张包含12个连锁群,353个SSR标记的遗传连锁图谱,覆盖基因组长度为1 565.88 cM,连锁群长度在86.98~186.68 cM,标记间的... 以甜瓜长侧枝自交系‘TopMark’和短侧枝自交系‘PI353814’为亲本,构建了F2群体和F2:3家系。利用92个F2单株构建了一张包含12个连锁群,353个SSR标记的遗传连锁图谱,覆盖基因组长度为1 565.88 cM,连锁群长度在86.98~186.68 cM,标记间的平均距离为4.44 cM。利用该连锁图谱结合F2:3家系表型鉴定数据,对甜瓜侧枝相关性状进行定位,共检测到6个QTL,分布在连锁群LGⅠ、LGⅢ和LGⅦ上,LOD值介于2.5067~12.5524之间,可解释9.9242%~48.2348%的表型变异率。其中侧枝总长主效QTLlbtl7.1和侧枝均长主效QTLlbal7.1均位于连锁群LGVⅡ的SSR标记CmSSR17145和CmSSR17293之间,贡献率分别为38.5923%和48.2348%。进一步利用186个F2:3家系和新开发标记对主效QTL进行了验证,发现侧枝总长主效QTL lbtl7.1定位在SSR标记CmSSR17251和CmSSR17253之间,与两标记的遗传距离分别为2.5和0.5 cM,可解释41.2742%的表型变异,侧枝均长主效QTL lbal7.1被定位在SSR标记CmSSR17238和CmSSR17251之间,距离两标记分别为1.5和0.5cM,可解释55.1739%的表型变异。 展开更多
关键词 甜瓜 侧枝 F2:3 遗传图谱 QTL定位
西瓜遗传图谱构建和基因定位研究进展 预览
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作者 李兵兵 刘文革 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2019年第2期1-6,共6页
西瓜是一种在世界范围内广泛种植的园艺作物,中国是世界上最大的西瓜生产国和消费国,对西瓜遗传育种的研究具有重要意义。遗传图谱是进行基因定位、图位克隆、分子标记辅助育种的重要工具,并为分子生物学的深入研究提供了基础。近年来,... 西瓜是一种在世界范围内广泛种植的园艺作物,中国是世界上最大的西瓜生产国和消费国,对西瓜遗传育种的研究具有重要意义。遗传图谱是进行基因定位、图位克隆、分子标记辅助育种的重要工具,并为分子生物学的深入研究提供了基础。近年来,随着高通量测序技术和分子标记的发展,西瓜遗传图谱研究取得了很大进展,基于不同遗传背景的西瓜遗传图谱陆续发表,极大地促进了西瓜基因组学和分子遗传育种的发展。笔者总结了近年来国内外西瓜遗传图谱构建和基因定位的研究进展及应用,并探讨了目前西瓜遗传图谱构建方面存在的主要问题及今后的研究趋势。 展开更多
关键词 西瓜 遗传图谱 基因定位
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基于SRAP分子标记的冰草遗传连锁图谱构建 预览
9
作者 李佳奇 于卓 +3 位作者 杨东升 于肖夏 吴国芳 牛亚青青 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期76-83,共8页
构建高密度遗传连锁图谱是冰草抗性、品质、产量等重要性状QTL精细定位及标记辅助育种研究的基础。该试验以四倍体杂交冰草F2群体的202个分离单株及其亲本为材料,利用SRAP分子标记技术和Join Map 4.0作图软件对冰草的遗传连锁图谱进行... 构建高密度遗传连锁图谱是冰草抗性、品质、产量等重要性状QTL精细定位及标记辅助育种研究的基础。该试验以四倍体杂交冰草F2群体的202个分离单株及其亲本为材料,利用SRAP分子标记技术和Join Map 4.0作图软件对冰草的遗传连锁图谱进行了构建。结果表明:(1)共筛选出22对多态性好、标记位点清晰稳定的SRAP适宜引物,对冰草杂种F2分离单株的基因组DNA进行PCR扩增,共获得510个SRAP多态性标记位点,其比率占88.2%。(2)偏分离分析表明,偏分离标记比率仅为14.12%,符合遗传作图的要求。(3)成功构建了冰草的SRAP分子标记遗传连锁图谱,该图谱有14个连锁群、510个标记,连锁群间长度范围86.4~179.0cM,覆盖基因组总长度1912.9cM,标记间平均间距3.75cM,为高密度遗传图谱。 展开更多
关键词 冰草 SRAP标记 遗传图谱
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基于SNP和SSR标记的小麦品质性状的QTL定位
10
作者 黄梦豪 刘天相 +2 位作者 强琴琴 李春莲 王中华 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期3966-3973,共8页
为给小麦品质性状的标记辅助选择提供备选分子标记,并进一步定位和克隆小麦部分品质相关性状的QTL,本研究利用普通小麦Heyne×Lakin杂交F2代单粒传获得的145个F8代重组自交系(Recombinantinbred line, RIL)群体,构建了含有2 082对标... 为给小麦品质性状的标记辅助选择提供备选分子标记,并进一步定位和克隆小麦部分品质相关性状的QTL,本研究利用普通小麦Heyne×Lakin杂交F2代单粒传获得的145个F8代重组自交系(Recombinantinbred line, RIL)群体,构建了含有2 082对标记(1 980对SNP标记和102对SSR标记)、总长度为2 120.13 cM的遗传连锁图谱,并利用该图谱对小麦连续两年的品质性状(蛋白质含量,湿面筋含量,淀粉含量和Zeleny沉降值)进行了 QTL分析。结果表明,共检测出11个QTL,其中,蛋白质含量有2个QTL,位于2A和5A染色体上,可解释的表型变异率6.94% 12.55%;湿面筋含量QTL有1个,位于5A染色体上,可解释的表型变异率8.40%~ 12.96%;淀粉含量QTL有3个,位于2A和5A染色体上,可解释的表型变异率9.78%~11.23%;Zeleny沉降值QTL有5个,位于2A、5A和7D染色体上,可解释的表型变异率4.75% 20.15%。其中5A染色体上存在这些品质性状QTL富集区,同时具有“一因多效”QTL位点。这个区段的发现,为小麦品质育种提供了参考依据。 展开更多
关键词 小麦(Triticum AESTIVUM L.) RIL群体 遗传图谱 品质性状 QTL
西瓜果实长圆的遗传及候选基因定位 预览
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作者 豆峻岭 刘文革(编译) +5 位作者 赵胜杰 路绪强 何楠 张磊 Aslam Ali 匡汉晖 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2019年第8期158-159,共2页
目的与意义:果实形状作为一个非常重要的农艺性状,在许多作物中已经有了非常深入的研究,同时也获得了许多控制果实形状的候选基因.随着2012年西瓜全基因组测序的完成,西瓜分子生物学的研究得到了快速发展,目前关于西瓜遗传图谱的报道有... 目的与意义:果实形状作为一个非常重要的农艺性状,在许多作物中已经有了非常深入的研究,同时也获得了许多控制果实形状的候选基因.随着2012年西瓜全基因组测序的完成,西瓜分子生物学的研究得到了快速发展,目前关于西瓜遗传图谱的报道有很多,根据遗传图谱也得到了许多性状的QTLs,尤其是西瓜果实的长度、宽度、果形指数等.然而目前还没有关于西瓜果实形状候选基因定位的报道.因此笔者通过配制杂交组合,解析西瓜果实形状的遗传模式,同时利用现代分子生物学手段,希望能够获得控制西瓜果实形状的候选基因. 展开更多
关键词 遗传图谱 基因定位 现代分子生物学 果实形状 实长 瓜果 全基因组测序 候选基因
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枣遗传图谱构建研究进展 预览
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作者 王中堂 张钟 +2 位作者 周广芳 李新岗 张琼 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1340-1348,共9页
枣遗传图谱是枣树分子辅助育种的重要工具之一。高质量的枣遗传图谱在遗传演化分析、QTLs基因定位等研究中发挥了重要作用。为开展图位克隆重要农艺性状基因、加快枣育种进程,本文简要概述了目前国内外枣遗传图谱的研究进展,包括设计亲... 枣遗传图谱是枣树分子辅助育种的重要工具之一。高质量的枣遗传图谱在遗传演化分析、QTLs基因定位等研究中发挥了重要作用。为开展图位克隆重要农艺性状基因、加快枣育种进程,本文简要概述了目前国内外枣遗传图谱的研究进展,包括设计亲本组合、真实子代鉴定、构建作图群体、遗传图谱构建和相关QTL定位研究等方面,进一步探讨前人研究存在的问题并提出相关解决措施,为开展筛选农艺状候选基因和枣分子辅助育种研究奠定了理论基础。 展开更多
关键词 遗传图谱 数量性状定位(QTL)
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泡桐高密度分子遗传图谱的构建 预览
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作者 李文杨 王娟 +1 位作者 赵振利 范国强 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期80-85,共6页
以毛泡桐Paulownia tomentosa为母本、白花泡桐Paulownia fortunei为父本进行正反交,以杂交获得的子一代(F1)构建泡桐连锁图谱的作图群体,选取限制性内切酶EcoRI对185个样品的基因组进行酶切,利用Illumina Hiseq2000测序平台进行RAD测... 以毛泡桐Paulownia tomentosa为母本、白花泡桐Paulownia fortunei为父本进行正反交,以杂交获得的子一代(F1)构建泡桐连锁图谱的作图群体,选取限制性内切酶EcoRI对185个样品的基因组进行酶切,利用Illumina Hiseq2000测序平台进行RAD测序建库,以白花泡桐基因组为参考,采用SOAP2软件进行序列比对,利用筛选到的单核苷酸多态性SNP(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)位点对该群体进行基因型分析,使用Joinmap version 4.0软件构建泡桐连锁遗传图谱。结果表明:利用RAD测序技术共获得551894个SNP标记,构建了含20个连锁群的泡桐遗传连锁图谱,该图谱的总图距为2050.77cM,标记间平均图距为0.58cM,图谱预期长度为2064.29cM,图谱基因覆盖度为99.35%。本研究构建的泡桐连锁遗传图谱具有高精度和覆盖泡桐基因组完整(构建连锁群数目等于泡桐单倍体基因组染色体的数目)的优点,为泡桐分子育种学研究奠定了基础。 展开更多
关键词 泡桐 遗传图谱 限制性酶切位点相关DNA测序 单核苷酸多态性
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盐胁迫下水稻幼苗存活率的QTL定位
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作者 段敏 谢留杰 +3 位作者 朱亚军 黄善军 潘晓飚 徐建龙 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期25-35,共11页
盐胁迫是制约水稻产量的重要非生物胁迫因素。随着土壤盐碱化日益加重,培育适宜于盐碱地种植的水稻耐盐新品种是提高水稻产量的有效方法。相较于传统杂交育种,分子标记辅助育种能够提高选育的效率和精确度。选择高度耐盐籼型恢复系ST105... 盐胁迫是制约水稻产量的重要非生物胁迫因素。随着土壤盐碱化日益加重,培育适宜于盐碱地种植的水稻耐盐新品种是提高水稻产量的有效方法。相较于传统杂交育种,分子标记辅助育种能够提高选育的效率和精确度。选择高度耐盐籼型恢复系ST1050和盐敏感优质粳稻品种越光作为研究材料,用含有150 mmol/L Na Cl的营养液处理三叶期幼苗1周,再用普通营养液恢复处理1周后,以幼苗的存活率作为苗期耐盐指标,选取均匀分布于水稻染色体的463个SSR标记对亲本进行多态性分析,鉴定ST1050与越光杂交产生的F2代群体基因型,构建遗传图谱并进行QTL定位。结果显示,籼型恢复系ST1050、粳稻品种越光的存活率分别为60%和18.75%,差异显著。463个SSR标记中有121个在ST1050和越光之间表现出较好的共显性差异,多态性达26.13%。利用软件Ici Mapping 4.1分析ST1050×越光138个F2个体的基因型,最终获得了一张覆盖总遗传距离为1 160.09 c M,标记间平均距离9.59 c M的遗传图谱。结合F3代群体在盐胁迫后的存活率验证,在水稻8号、12号染色体上分别检测到1个苗期耐盐QTL,命名为q SR-8和q SR-12,贡献率分别为13.57%和6.91%。研究表明,籼型恢复系ST1050存在2个苗期耐盐QTL,对提高水稻的耐盐性发挥重要的作用,可以作为苗期耐盐供体用于标记辅助选择耐盐育种。 展开更多
关键词 耐盐 存活率 SSR分子标记 数量性状位点 遗传图谱
基于黄褐棉导入系的棉花衣分QTL定位研究 预览
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作者 陈奇 周水娟 +7 位作者 孙康泰 刘静 袁宝童 王议萍 王为 王有武 汪保华 庄智敏 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第8期1735-1739,共5页
[目的]利用黄褐棉导入系(Introgression Lines,ILs),在构建分子遗传图谱的基础上,检测与衣分相关的数量性状位点(Quantitative Trait Locus,QTLs),以期发现黄褐棉中用于改良陆地棉的衣分QTL,服务于棉花产量的分子育种。[方法]以陆地棉PD... [目的]利用黄褐棉导入系(Introgression Lines,ILs),在构建分子遗传图谱的基础上,检测与衣分相关的数量性状位点(Quantitative Trait Locus,QTLs),以期发现黄褐棉中用于改良陆地棉的衣分QTL,服务于棉花产量的分子育种。[方法]以陆地棉PD94042为受体亲本,黄褐棉(Gossypium mustelinum)为供体亲本,两者杂交后代与陆地棉亲本回交,进而建立高世代回交群体并选择构建CSILs,通过种植黄褐棉CSILs,提取DNA展开微卫星标记(SSR)实验,构建遗传连锁图谱;并将所得基因型数据和表型数据相结合,用Win QTL Cart2.5软件开展导入系群体的衣分QTL定位。[结果]利用基于黄褐棉导入系的遗传图谱检测衣分QTL,成功检测到21个衣分相关QTLs,解释表型变异范围为19.3%~42%。其中,主效QTL qLP-3在2个环境中均被检测到,其增效基因均来自于黄褐棉,因此可能对标记辅助选择有重要意义。[结论]利用黄褐棉导入系群体成功鉴定出21个衣分相关的QTLs,该结果为棉花衣分分子标记辅助育种工作提供了借鉴及依据,也为后续进一步开展QTL精细定位奠定了基础。 展开更多
关键词 黄褐棉导入系 衣分 遗传图谱 QTL定位
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一个大豆矮秆性状基因的分子标记定位 预览
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作者 袁鹰 王程 +4 位作者 韩俊 张鑫 仝潇 冯凡育 谢皓 《北京农学院学报》 2019年第3期25-29,共5页
【目的】对大豆品种北农103中的矮秆性状进行遗传分析和初步基因定位,为该基因的精细定位和育种利用奠定基础。【方法】以高秆大豆品种海系13和矮秆品种北农103为研究材料,通过对(海系13×北农103)F4的剩余杂合体(RHL)F2分离群体的... 【目的】对大豆品种北农103中的矮秆性状进行遗传分析和初步基因定位,为该基因的精细定位和育种利用奠定基础。【方法】以高秆大豆品种海系13和矮秆品种北农103为研究材料,通过对(海系13×北农103)F4的剩余杂合体(RHL)F2分离群体的遗传分析,解析控制北农103矮秆性状基因的遗传规律,同时以(海系13×北农103)的(RHL)F2∶3为作图群体,利用BSA法结合SSR分子标记,对北农103中的矮秆基因进行分子标记和遗传定位。【结果】北农103中携带1对控制矮秆性状的隐性基因GmD1;经分子标记连锁分析,该基因与9个SSR标记连锁,分别是Satt527、Satt166、Sat_340、Satt481、Sat_150、Sat_245、Satt076、Satt229和Satt664。【结论】根据大豆遗传图谱推断,该基因位于大豆L连锁群(19染色体)上,在satt527和satt166标记之间,遗传距离分别是3.7cM和4.2cM,推测为一个新的控制大豆矮秆的基因GmD1,这些发现和分子标记定位对于该基因的精细定位将起到重要作用。 展开更多
关键词 大豆 遗传分析 基因定位 遗传图谱 SSR标记
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芥菜型油菜A9染色体物理图谱构建和结构变异分析 预览
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作者 李乐 刘芳瑛 +1 位作者 陆赢 刘忠松 《湖南农业大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期30-36,共7页
以四川黄籽自交系和紫叶芥自交系多次杂交形成的F6代重组自交系(RIL)群体为材料,运用基因分析技术,构建芥菜型油菜遗传图谱。采用锚定BAC的方法,构建重叠群,最终构建了由16个重叠群共计538个BAC组成的芥菜型油菜A9染色体物理图谱,参考... 以四川黄籽自交系和紫叶芥自交系多次杂交形成的F6代重组自交系(RIL)群体为材料,运用基因分析技术,构建芥菜型油菜遗传图谱。采用锚定BAC的方法,构建重叠群,最终构建了由16个重叠群共计538个BAC组成的芥菜型油菜A9染色体物理图谱,参考芥菜基因组,估计该物理图谱长度为46.26Mb,与已发表的白菜、甘蓝型油菜和芥菜参考基因组进行比较,发现芥菜型油菜A9染色体均发生了倒位和缺失等结构变异。 展开更多
关键词 芥菜型油菜 A9染色体 GBS标记 遗传图谱 物理 结构变异
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花生籽仁大小相关性状QTL定位 预览
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作者 曾新颖 郭建斌 +7 位作者 赵姣姣 陈伟刚 邱西克 黄莉 罗怀勇 周晓静 姜慧芳 黄家权 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1200-1207,共8页
花生籽仁大小相关性状是决定花生产量的直接因素。为发掘与花生籽仁大小相关的QTL,本研究以中花16×J11构建的RIL群体为材料,得到了一张包含289个SSR标记、21个连锁群、覆盖长度为947.3cM的遗传连锁图谱。连续2年对籽仁大小相关性... 花生籽仁大小相关性状是决定花生产量的直接因素。为发掘与花生籽仁大小相关的QTL,本研究以中花16×J11构建的RIL群体为材料,得到了一张包含289个SSR标记、21个连锁群、覆盖长度为947.3cM的遗传连锁图谱。连续2年对籽仁大小相关性状鉴定表明,各性状在群体中变异广泛,呈典型正态分布,且大部分性状间显著相关。结合本研究构建的遗传图谱,利用WinCart2.5进行QTL定位分析,2年共检测到66个QTL,贡献率为3.23%~33.01%。与籽仁长(SL)、籽仁宽(SW)、籽仁长宽比(LWR)和百仁重(HSW)相关的QTL分别有18、16、18和14个。在这些QTL中,A05染色体上的区间A05A1500?A05A1530同时存在控制籽仁长(qSLA05.1和qSLA05.2)和百仁重的相关的QTL(qHSWA05.1);B06染色体上的区间A06B135?A06B113同时存在控制籽仁宽(qSWB06.2和qSWB06.4)和百仁重相关的QTL(qHSWB06.4),这些稳定存在的主效QTL将为花生产量相关性状的精细定位和分子育种奠定基础。 展开更多
关键词 花生 遗传图谱 籽仁大小 QTL
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统计基因组学中的作图函数和重组率(Ⅱ)
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作者 梅步俊 《河套学院论坛》 2019年第1期64-74,共11页
重组率的估计是遗传图谱中的关键步骤。对于连锁图谱的构建,必须将非加性重组分数转换为加性图谱距离。两种最常用的转换是Kosambi和Haldane的映射函数。通过报告与估算重组率,Kosambi距离和Haldane距离相关的计算细节。可以作为研究者... 重组率的估计是遗传图谱中的关键步骤。对于连锁图谱的构建,必须将非加性重组分数转换为加性图谱距离。两种最常用的转换是Kosambi和Haldane的映射函数。通过报告与估算重组率,Kosambi距离和Haldane距离相关的计算细节。可以作为研究者学习统计基因组学中的作图函数和重组率的基础。 展开更多
关键词 遗传图谱 Haldane距离 Kosambi距离 重组率
单核苷酸多态性(SNP)分子标记在小麦遗传育种中的研究进展 预览
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作者 吴澎 刘娟 田纪春 《农学学报》 2019年第1期54-58,共5页
为了了解单核苷酸多态性(SNP)标记在小麦遗传育种中的研究进展并为下一步在面粉制品中的应用奠定基础,本研究归纳了SNP分子标记所具有的特点以及应用比较普遍的检测方法,包括DNA构象法、高分辨溶解曲线法及直接测序法等检测方法;总结了... 为了了解单核苷酸多态性(SNP)标记在小麦遗传育种中的研究进展并为下一步在面粉制品中的应用奠定基础,本研究归纳了SNP分子标记所具有的特点以及应用比较普遍的检测方法,包括DNA构象法、高分辨溶解曲线法及直接测序法等检测方法;总结了近几年SNP标记在小麦遗传图谱的构建、作物育种、全基因组关联分析、遗传多样性和物种进化等方面的研究进展;最后提出可开发不同作物的高通量SNP芯片使SNP的研究向高通量化、全基因组发展,以及培育具有良好面制品感官特性的小麦新品种。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性标记 遗传图谱 全基因组关联分析 作物育种 小麦
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