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基于质量和数量性状混合的高粱遗传多样性分析 预览
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作者 加依娜·吾永巴衣 胡文明 +1 位作者 阿迪里·托乎尼亚孜 徐翠莲 《江苏农业科学》 2019年第2期73-76,共4页
为了解高粱种质资源的遗传多样性,以56份来自不同国家和地区的高粱种质为研究对象,分别对其叶脉色、穗型、穗形、芽鞘色、颖壳色、粒色、颖壳包被度7个质量性状和生育期、株高、穗长、穗粒质量、千粒质量5个数量性状进行鉴定,分析各性... 为了解高粱种质资源的遗传多样性,以56份来自不同国家和地区的高粱种质为研究对象,分别对其叶脉色、穗型、穗形、芽鞘色、颖壳色、粒色、颖壳包被度7个质量性状和生育期、株高、穗长、穗粒质量、千粒质量5个数量性状进行鉴定,分析各性状的多样性指数,并利用质量性状和数量性状进行混合数据系统聚类。结果表明,2类性状均具有广泛的遗传变异,数量性状遗传多样性指数高于质量性状,其多样性指数的变异范围为1.639~2.012,而质量性状的多样性指数变异范围为0.879~1.498。系统聚类结果表明,在估计节点AU=95时,所有种质聚为28类,其中38份种质聚为10类,平均每类包含3.8份种质,其余18份种质分别单独归类;在AU=90时,所有种质聚为2类,分别包含13、43份种质。说明收集的56份种质具有丰富的遗传多样性,是进行性状改良和遗传研究理想的原始材料。 展开更多
关键词 高粱 质量性状 数量性状 遗传多样性 估计节点 系统聚类
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新疆海岛棉联合试验品系表型性状遗传多样性分析 预览
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作者 李小童 白玉林 +3 位作者 杜斌 王承强 刘绍欢 刘霞 《中国棉花》 2019年第2期24-29,共6页
对63份品系进行表型性状遗传多样性发现:16个表型性状中株高的遗传多样指数最高为2.069,衣分最低为1.094。10个农艺性状中,脱落率的变异系数最大为29.2%,衣分最小为5.1%;6个纤维品质性状中断裂伸长率的变异系数最大为14.4%,长度整齐度... 对63份品系进行表型性状遗传多样性发现:16个表型性状中株高的遗传多样指数最高为2.069,衣分最低为1.094。10个农艺性状中,脱落率的变异系数最大为29.2%,衣分最小为5.1%;6个纤维品质性状中断裂伸长率的变异系数最大为14.4%,长度整齐度的最小为1.3%。不同参试品系的欧式距离变幅为1.531~45.664,平均遗传距离为5.373。参试的63个长绒棉品系可份为Ⅰ类(9份)、Ⅱ(23份)、Ⅲ类(31份)3个类群。与34份新疆长绒棉品种比较发现:参试品系铃重略高,除断裂伸长率低于审定品种外,其他主要品质性状多优于审定品种。 展开更多
关键词 长绒棉 新品系 遗传多样性 聚类分析
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基于重测序的陆地棉InDel标记开发与评价 预览
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作者 吴迷 汪念 +3 位作者 沈超 黄聪 温天旺 林忠旭 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期196-203,共8页
碱基插入/缺失(InDel)是基因组中丰富的遗传变异形式。InDel以其密度高、易于基因型分型等优点成为分子标记开发的理想来源。本研究利用262份陆地棉品系重测序数据鉴定的InDel位点,在全基因组范围内设计了3206个InDel标记并挑选均匀分布... 碱基插入/缺失(InDel)是基因组中丰富的遗传变异形式。InDel以其密度高、易于基因型分型等优点成为分子标记开发的理想来源。本研究利用262份陆地棉品系重测序数据鉴定的InDel位点,在全基因组范围内设计了3206个InDel标记并挑选均匀分布的320个标记进行验证。320个标记筛选出87个多态性标记,多态性率为26.88%。利用多态性标记对不同地理来源的262份陆地棉种质资源进行基因分型,共检测到160个等位位点;多态性信息含量(PIC)为0.0836~0.3750,平均值为0.3073;基因多样性指数变异范围为0.0874~0.5000,平均值为0.3876,表明我国陆地棉遗传基础相对狭窄。群体结构分析将262份陆地棉品系大致划分为2个亚群,聚类分析和主成分分析的结果与之基本一致。采用混合线性模型(Mixed linear model)对6个纤维品质性状的关联分析检测到65个关联位点(P<0.01),各位点对表型变异贡献率为2.57%~8.12%。本研究旨在利用重测序数据开发全基因组范围的可用于凝胶检测的InDel标记,为棉花种质资源研究和分子标记辅助选择育种提供便捷工具。 展开更多
关键词 陆地棉 INDEL标记 遗传多样性 群体结构 关联分析
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糯玉米自交系SSR标记遗传多样性及群体遗传结构分析 预览
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作者 卢媛 艾为大 +5 位作者 韩晴 王义发 李宏杨 瞿玉玑 施标 沈雪芳 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期214-224,共11页
为了解糯玉米种质的遗传基础,利用29对SSR标记对87份糯玉米自交系进行遗传多样性分析,共检测出180个等位变异,平均每个位点6个等位变异,多态性信息含量变幅为0.308~0.915,平均为0.572。材料间遗传相似系数为0.49~0.93,平均为0.66。通过... 为了解糯玉米种质的遗传基础,利用29对SSR标记对87份糯玉米自交系进行遗传多样性分析,共检测出180个等位变异,平均每个位点6个等位变异,多态性信息含量变幅为0.308~0.915,平均为0.572。材料间遗传相似系数为0.49~0.93,平均为0.66。通过聚类分析UPGMA(unweighted pair-group method with arithmetic means)方法在遗传相似系数0.64处将87份糯玉米自交系划分为4个类群,分别包含9、66、10和2份材料。此外,利用Structure群体遗传结构分析也将87份糯玉米自交系分为4个类群,分别包含24、25、19和19份材料;进一步分析表明,供试群体中大部分糯玉米自交系的遗传变异较单一。本研究为糯玉米新品种选育和遗传进化分析提供了种质基础和理论依据。 展开更多
关键词 糯玉米 遗传多样性 群体遗传结构
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冬虫夏草生物学及生态学研究中的关键科学问题研究进展 预览
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作者 徐梦 徐明 李仁强 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1853-1862,共10页
冬虫夏草是一种具有极高药用和食用价值的珍稀菌类,其生物学特性和可持续发展关键技术一直是冬虫夏草研究关注的重点。总结了冬虫夏草生物学及生态学中的几个重要科学问题,包括冬虫夏草菌侵染蝙蝠蛾幼虫的途径及机制、冬虫夏草菌子实体... 冬虫夏草是一种具有极高药用和食用价值的珍稀菌类,其生物学特性和可持续发展关键技术一直是冬虫夏草研究关注的重点。总结了冬虫夏草生物学及生态学中的几个重要科学问题,包括冬虫夏草菌侵染蝙蝠蛾幼虫的途径及机制、冬虫夏草菌子实体形成及生长过程中的关键调控因子、冬虫夏草菌遗传多样性及基因组学研究、天然冬虫夏草及其微环境中的微生物群落组成、全球变暖背景下未来青藏高原地区的气候变化对冬虫夏草资源的影响等的研究进展,并分析了现有研究中尚未明确和不足之处。未来在冬虫夏草生物学及生态学的研究中,需要利用和研发更加先进的观测设备及试验方法,以实现天然冬虫夏草发生发育的原位观测和机理研究;充分利用冬虫夏草人工培植技术,结合分子生物学研究,从基因水平上揭示冬虫夏草菌生态适应性及侵染蝙蝠蛾幼虫的机理;建立冬虫夏草科学研究基地,开展长期定位观测试验并结合生态学模型构建明确未来气候变化对冬虫夏草资源的影响,以期进一步深入冬虫夏草生物学和生态学研究、推进我国冬虫夏草资源的合理利用及可持续发展的政策制定。 展开更多
关键词 冬虫夏草菌 发生发育 遗传多样性 基因组学 微生物群落 气候变化 可持续利用
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猪非典型瘟病毒GX01-2018株全基因组分子特征的分析
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作者 尹彦文 施开创 +3 位作者 孙文超 莫胜兰 陆文俊 屈素洁 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期484-492,共9页
猪非典型瘟病毒(APPV)被证实是新生仔猪先天性震颤的致病因子。为了解广西APPV流行毒株的分子遗传特征,采用RT-PCR分段扩增APPV阳性病料,经克隆、测序、拼接,获得1株APPV的全基因序列,遂被命名为GX01-2018株。结果显示,GX01-2018株基因... 猪非典型瘟病毒(APPV)被证实是新生仔猪先天性震颤的致病因子。为了解广西APPV流行毒株的分子遗传特征,采用RT-PCR分段扩增APPV阳性病料,经克隆、测序、拼接,获得1株APPV的全基因序列,遂被命名为GX01-2018株。结果显示,GX01-2018株基因组全长11 565 bp,包括一个编码3 635个氨基酸的阅读框(ORF)。同源性分析显示,GX01-2018株与国内代表毒株广西GX-CH_2016株、江西JX-JM01-2018A01株、广东China/GD-SD/2016株、广东GD株核苷酸序列的同源性分别为98.2%、92.9%、83.4%、90.8%。GX01-2018株与国外代表毒株美国000515株、德国Bavaria_S5/9株、奥地利AUT-2016_C株、荷兰NL1株核苷酸序列的同源性分别为87.8%、90.7%、90.5%、90.7%。上述国内外代表毒株间Npro、Erns、E2基因核苷酸序列的同源性分别为79.1%~97.2%、83.0%~98.4%、83.1%~96.8%。基于APPV全基因组以及E2、Npro、Erns基因核苷酸序列绘制遗传进化树,获得相似的进化树图。来自广西的GX01-2018株与欧洲型毒株位于一个分支,而同样来自广西的GX04/2017株与美洲型毒株位于另一个分支。表明APPV流行毒株具有遗传多样性,来自同一地区的流行毒株出现较大的遗传变异。 展开更多
关键词 猪非典型瘟病毒 基因组序列 遗传变异 遗传多样性 分子特征
不同抽薹性萝卜遗传多样性的SSR分子标记分析 预览
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作者 杨峰 冉茂林 +3 位作者 李晓梅 陈琳 雍小平 冉科 《江苏农业科学》 2019年第4期123-127,共5页
为了加强对耐抽薹萝卜种质资源的研究,加快耐抽薹萝卜育种进程,从206对SSR分子标记引物中筛选出21对,用于57份不同抽薹性萝卜材料进行遗传多样性分析。结果表明,PCR共扩增出102条条带,平均4.86条,每对引物2~9条带,其中具有多态性的为95... 为了加强对耐抽薹萝卜种质资源的研究,加快耐抽薹萝卜育种进程,从206对SSR分子标记引物中筛选出21对,用于57份不同抽薹性萝卜材料进行遗传多样性分析。结果表明,PCR共扩增出102条条带,平均4.86条,每对引物2~9条带,其中具有多态性的为95条,多态性条带百分率为93.14%。POPGENE分析结果表明,平均观测等位基因数为2.9674,平均有效等位基因数为2.4191,有效等位基因比例为81.52%;平均Nei基因多样性指数为0.3555,平均Shannon多态性指数为0.5289。UPGMA法聚类结果把供试萝卜材料分为3个类群,5个亚类:第Ⅰ类为来源于德国的极耐抽薹材料,第Ⅱ类为来源于韩国和日本的耐抽薹材料,第Ⅲ类为来源于我国的材料,其中第3亚类共有45份,占材料总数的78.95%,第4亚类为5份极易抽薹材料,第5亚类仅有1份。各材料间平均遗传相似系数为0.6381,变幅范围0.3478~0.9348,>0.7的仅22.87%,遗传差异较大。不同抽薹性萝卜材料所表现出的丰富多样性,对萝卜种质资源管理和耐抽薹品种选育具有重要意义。 展开更多
关键词 萝卜 抽薹 SSR标记 遗传多样性
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华北地区中华蒙潮虫(甲壳动物亚门:等足目)种群遗传多样性研究 预览
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作者 张瑞 王明晓 安建梅 《四川动物》 北大核心 2019年第2期139-148,共10页
中华蒙潮虫Mongoloniscus sinensis(Dollfus,1901)隶属于甲壳动物亚门Crustacea等足目Isopoda潮虫亚目Oniscidea,中国特有种。为了探究中华蒙潮虫的种群遗传分化和系统进化关系,采用PCR对采自华北地区10个地理种群89只个体线粒体2个基... 中华蒙潮虫Mongoloniscus sinensis(Dollfus,1901)隶属于甲壳动物亚门Crustacea等足目Isopoda潮虫亚目Oniscidea,中国特有种。为了探究中华蒙潮虫的种群遗传分化和系统进化关系,采用PCR对采自华北地区10个地理种群89只个体线粒体2个基因COⅠ和ND5进行联合分析。结果表明:1)中华蒙潮虫COⅠ部分基因长604 bp,ND5部分基因长615 bp,拼接序列长1 219 bp,T、C、A和G含量分别为41.0%、11.2%、30.8%和17.0%,具有显著的A+T偏倚;变异位点503个(占总核苷酸序列的41.3%),序列间的转换/颠换比值为2.8。2)89只个体共45种单倍型,单倍型多样性0.964,核苷酸多样性0.005 6,整体遗传多样性水平中等;单倍型H1、H15、H16、H21、H41为2~3个种群共享单倍型。3)联合基因(COⅠ+ND5)系统发育树表明,最早出现的是华北以北地区(山西大同、河北石家庄),最晚分化出的是华北以南地区(山西临汾、陕西西安未央区、河南新乡),演化路线为从北向南,个别种群单倍型未按地理来源形成明显的簇群。4)平均遗传分化指数为0.513,基因流为0.24;分子变异分析结果表明,种群的变异与分化主要来自种群内部,错配分布呈多峰,结合中性检验(Tajima's D=-1.429;Fu's Fs=6.499),发现中华蒙潮虫近期未经历扩张,但种群内部分化显著,增长平稳。本研究首次基于线粒体多基因联合分析了中华蒙潮虫种群遗传多样性。 展开更多
关键词 中华蒙潮虫 遗传多样性 COⅠ基因 ND5基因 华北地区
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基于ISSR和SRAP标记的栀子种质遗传多样性研究
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作者 姜武 吴志刚 +1 位作者 陶正明 蔡胡敏 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期510-516,共7页
目的对栀子遗传多样性进行研究,为栀子资源保护和新品种培育提供依据。方法采用12条ISSR和9对SRAP分子标记,以3个居群21份栀子种质资源为材料,通过多态性检测水平、遗传多样性比较和聚类分析,揭示栀子种质资源遗传多样性。结果 ISSR引物... 目的对栀子遗传多样性进行研究,为栀子资源保护和新品种培育提供依据。方法采用12条ISSR和9对SRAP分子标记,以3个居群21份栀子种质资源为材料,通过多态性检测水平、遗传多样性比较和聚类分析,揭示栀子种质资源遗传多样性。结果 ISSR引物和SRAP引物分别扩增出125和80条带数,多态性条带数分别为100和74,多态性比率(PPB)分别为80.00%和92.50%,栀子居群的总体物种水平的等位基因观察数(Na)分别为1.461 3和1.579 2,有效等位基因数(Ne)分别为1.307 7和1.342 1,Nei’s基因多样性指数(H)分别为0.173 1和0.197 4,Shannon’s指数(I)分别为0.254 5和0.295 9;遗传多样性分析结果表明,ISSR和SRAP标记中3个居群之间的遗传多样性(Ht)分别为0.239 1和0.289 9,种间遗传多样性(Hs)分别为0.173 1和0.197 4,基因分化系数(Gst)分别为0.276 2和0.318 9,即72.38%和68.11%的遗传变异在种群内进行,居群间基因流(Nm)分别为1.310 3和1.068 0,证明居群间存在一定的基因流动(Nm>1);UPGMA聚类分析表明,ISSR和SRAP标记将栀子资源分为2个类群,且以SRAP分析的聚类结果更符合实际居群。结论取样栀子种质有丰富的遗传多样性,遗传分化主要发生在居群内,SRAP标记更适合用于栀子遗传多样性分析,对栀子资源的保护和育种提供了参考。 展开更多
关键词 栀子 分子标记 遗传多样性 育种 ISSR SRAP
甘草种质主要形态性状和化学成分的遗传多样性分析
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作者 李文斌 魏胜利 +5 位作者 罗琳 闫滨滨 侯俊玲 于福来 崔洁 王文全 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期517-525,共9页
目的依据国内甘草种质主要的形态性状和化学成分,对其遗传多样性进行综合分析。方法收集移植于同一地点的42份多年生甘草种质的12个地上部分性状和5种化学成分含量,计算其遗传多样性指数和变异系数,运用聚类分析和主成分分析进行统计分... 目的依据国内甘草种质主要的形态性状和化学成分,对其遗传多样性进行综合分析。方法收集移植于同一地点的42份多年生甘草种质的12个地上部分性状和5种化学成分含量,计算其遗传多样性指数和变异系数,运用聚类分析和主成分分析进行统计分析。结果 5种化学成分中,甘草苷含量的遗传多样性指数最高为2.05,异甘草苷含量的变异系数最大为99.50%,甘草苷含量与异甘草苷含量呈中度相关关系;在12个形态性状中,株高的遗传多样性指数最高为2.08,实际果序长的变异系数最大为37.09%,果型和株型性状的变异大于叶型性状;聚类分析将42份种质分为3类,第II类群种质品质较优;主成分分析将17个指标简化为6个因子,累积贡献率为72.96%,因子6为代表甘草酸、甘草苷、异甘草苷的因子。结论甘草种质主要形态性状和化学成分的遗传多样性较为丰富,筛选出V08、V10、V17、V34、V36、V38共6个品质优异的甘草种质。 展开更多
关键词 甘草 种质 形态 甘草酸 甘草苷 异甘草苷 遗传多样性
基于表型性状和CDDP分子标记延安万花山牡丹遗传多样性分析 预览
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作者 翟立娟 史倩倩 +3 位作者 李想 罗小宁 牛立新 张延龙 《江苏农业科学》 2019年第2期95-101,共7页
利用28个表型性状和CDDP分子标记对延安万花山牡丹进行遗传多样性分析。结果表明,万花山牡丹的表型性状存在较大差异。质量性状的香农多样性指数变化范围为0.28~1.21,其中花色、叶端形态、叶片颜色、花型等较高;9个数量性状在样本中差... 利用28个表型性状和CDDP分子标记对延安万花山牡丹进行遗传多样性分析。结果表明,万花山牡丹的表型性状存在较大差异。质量性状的香农多样性指数变化范围为0.28~1.21,其中花色、叶端形态、叶片颜色、花型等较高;9个数量性状在样本中差异极显著,变异系数变化范围为12.10%~69.23%,其中花瓣数、雄蕊数的变异系数较大。CDDP分子标记分析结果表明,万花山牡丹有效等位基因数为1.5994,Neis基因多样性指数和香农多样性指数分别为0.3335和0.4861,表明延安万花山牡丹具有较高的遗传多样性。2种分析方法结果具有一致性,均可将延安万花山牡丹分为三大类,根据与紫斑牡丹和矮牡丹亲缘关系可划分为3个类型,即接近矮牡丹的类型、接近紫斑牡丹的类型和中间类型。 展开更多
关键词 牡丹 遗传多样性 表型性状 CDDP分子标记
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达氏鳇亲鱼群体mtDNA Cyt b基因和D-loop区的序列特征及遗传多样性分析 预览
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作者 孔杰 周洲 +2 位作者 刘伟 赵凤 王金乐 《江苏农业科学》 2019年第3期40-42,共3页
通过对线粒体细胞色素b(Cyt b)基因和控制区(D-loop)进行序列特征和遗传多样性检测,分析达氏鳇(Huso dauricus)亲鱼群体30个个体的序列特征及遗传多样性。结果表明,Cyt b基因长1 138 bp,G+C含量为47.03%,共定义单倍型5个、多态性位点(S)... 通过对线粒体细胞色素b(Cyt b)基因和控制区(D-loop)进行序列特征和遗传多样性检测,分析达氏鳇(Huso dauricus)亲鱼群体30个个体的序列特征及遗传多样性。结果表明,Cyt b基因长1 138 bp,G+C含量为47.03%,共定义单倍型5个、多态性位点(S)2个,简约信息位点1个,单倍型多样性指数(H_d)为0.372,平均核苷酸差异数(K)为0.384,核苷酸多样性指数(π)为0.000 34;D-loop区序列全长845 bp,G+C含量为37.41%,共定义单倍型6个,多态性位点8个,简约信息位点3个,单倍型多样性指数为0.424,平均核苷酸差异数为1.069,核苷酸多样性指数为0.001 27。基于线粒体D-loop与Cyt b序列的研究结果表明,养殖达氏鳇亲鱼群体的遗传多样性偏低,在利用达氏鳇亲鱼进行繁殖育苗时要注意近交的影响。 展开更多
关键词 达氏鳇 MTDNA D-LOOP CYT b 遗传多样性
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黄淮海地区夏玉米弯孢叶斑病菌遗传多样性分析 预览
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作者 常佳迎 刘树森 +3 位作者 马红霞 石洁 郭宁 张海剑 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期822-836,共15页
【目的】针对黄淮海地区发生的玉米弯孢叶斑病,通过分子生物学技术,明确其致病菌新月弯孢(Curvularia lunata)在不同地区和年份间的遗传差异及亲缘关系,为研究该病害的发生和流行提供数据资料。【方法】对2013、2016和2017年采集自黄淮... 【目的】针对黄淮海地区发生的玉米弯孢叶斑病,通过分子生物学技术,明确其致病菌新月弯孢(Curvularia lunata)在不同地区和年份间的遗传差异及亲缘关系,为研究该病害的发生和流行提供数据资料。【方法】对2013、2016和2017年采集自黄淮海地区5省(河南、河北、山东、安徽、江苏)的病样进行分离,并采用形态学和分子生物学(ITS和EF-1α序列分析)对分离到的菌株进行鉴定,共获得175个新月弯孢菌株。从哥伦比亚大学开发的通用引物中筛选出13条多态性高、重复性好的引物,利用筛选出的引物对175个新月弯孢菌株进行ISSR-PCR扩增,利用Popgen32软件计算多态性比率、Shannon’s信息指数、群体间的遗传距离和遗传相似性,使用NTsys2.10e软件进行UPGMA聚类分析和基于遗传相似系数的主坐标分析,构建聚类分析图和散点图。【结果】利用筛选出的引物对175个菌株进行PCR扩增,共获得105条多态性条带,多态性比率为100%。在群体平均水平上,基因多样性水平(H)为0.3867,Shannon’s的信息指数(I)为0.5682,表明玉米弯孢叶斑病菌具有丰富的遗传多样性;不同地理种群间的遗传多样性存在一定差异,河南和安徽种群遗传多样性最高,江苏种群较低;年度间相同地理来源的菌群亲缘关系较远,相同年份不同地理来源菌群亲缘关系较近。聚类分析显示所有菌株相似系数为0.51—0.93,在相似系数为0.59水平上,175个菌株被划分为2群5个亚群,亚群间表现出年度间的差异,不同地理种群病菌间存在基因交流,遗传相关性较高;主坐标分析结果与聚类分析结果一致,同一年份的菌株明显聚集在一起。【结论】引起黄淮海地区玉米弯孢叶斑病的病原菌群体存在较高的遗传变异,地域相邻的病菌遗传关系较近;同一地区的菌株在年度间表现出一定遗传距离,而同一年份不同地理来源的菌株遗传距离较近。引起该地区� 展开更多
关键词 新月弯孢 黄淮海地区 遗传多样性 ISSR
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哈尼梯田传统稻种遗传多样性影响因素 预览
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作者 王红崧 毕振佳 +2 位作者 王云月 单祖朋 李享 《江苏农业科学》 2019年第1期60-66,共7页
云南元阳哈尼梯田有着优异的水稻种质资源和丰富的稻种遗传多样性,当地传统稻种蕴含了极高的生态、人文和经济价值。高度异质的生态环境、社会环境、多元的传统民族文化习俗和丰富的农耕土著知识共同作用,使得哈尼梯田高度的稻种多样性... 云南元阳哈尼梯田有着优异的水稻种质资源和丰富的稻种遗传多样性,当地传统稻种蕴含了极高的生态、人文和经济价值。高度异质的生态环境、社会环境、多元的传统民族文化习俗和丰富的农耕土著知识共同作用,使得哈尼梯田高度的稻种多样性依然存在。本研究主要分析当地传统稻种遗传多样性现状,分析传统稻种遗传多样性对抗病稳产的影响,分析农民种子系统对传统稻种遗传多样性的影响,以及它与自然、社区、文化的共生关系;从自然生态、社会环境、传统文化等方面来分析农民种子系统的保护和丧失,构建哈尼梯田传统稻种多样性影响指标体系,识别出对地方稻种多样性维持和管理有特殊解释意义的因素,对传统稻种可持续保护策略进行讨论。 展开更多
关键词 哈尼梯田 传统稻种 遗传多样性 抗病稳产 共生种子系统 生态环境
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基于线粒体COⅠ序列的中国前鳞鮻遗传多样性分析 预览
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作者 黄镇宇 章群 +2 位作者 卢丽锋 周琪 唐楚林 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2019年第1期46-52,共7页
前鳞鮻(Liza affinis)是分布于西北太平洋的日本南部及中国台湾海域等的经济鱼类。为了解中国前鳞鮻的遗传背景,该研究分析了采自中国4省82尾样本COⅠ基因5’端712 bp序列,共发现21个单倍型,遗传多样性(H_d=0.4840±0.0700,π=0.001... 前鳞鮻(Liza affinis)是分布于西北太平洋的日本南部及中国台湾海域等的经济鱼类。为了解中国前鳞鮻的遗传背景,该研究分析了采自中国4省82尾样本COⅠ基因5’端712 bp序列,共发现21个单倍型,遗传多样性(H_d=0.4840±0.0700,π=0.0010±0.0002)较低。根据群体所属的地区、海域、海峡进行分组,通过AMOVA分析,得出组间的Fst值皆小于0.05,P值皆大于0.05,组间变异的比例极低(–0.6%~0.46%),表明中国前鳞鮻群体间无明显分化,其原因可能是:1)频繁的基因交流。前鳞鮻的洄游范围较大,且受海流影响,导致不同地区的群体间有着密切的基因交流;2)近期种群扩张事件。中国前鳞鮻整体的Fu’s F_s值为显著性负值(F_S=–20.3900,P=0),核苷酸错配峰图为明显单峰,单倍型网络图呈星状结构,均表明中国前鳞鮻群体经历过种群扩张,估算扩张大约发生在13.4199~1.4911万年前,可能是冰期和间冰期的交替中海平面的变化所致。此外,洞头群体的遗传多样性(H_d=0.8080±0.1130,π=0.0021±0.0006)明显高于其他地理群体,建议将其作为优先保护的对象。 展开更多
关键词 前鳞鮻 遗传多样性 COⅠ基因 中国沿海
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茄子种质遗传多样性及群体结构的SRAP分析
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作者 谢立峰 李宁 +1 位作者 李烨 姚明华 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期58-63,共6页
采用SRAP标记法对183份茄子(Solanum melongena)种质资源的遗传关系和群体结构进行分析。结果表明, 33对多态性SRAP引物组合共扩增出215条清晰稳定的多态性条带,平均每对引物组合产生7条多态性条带。183份茄子种质的遗传相似系数介于0.... 采用SRAP标记法对183份茄子(Solanum melongena)种质资源的遗传关系和群体结构进行分析。结果表明, 33对多态性SRAP引物组合共扩增出215条清晰稳定的多态性条带,平均每对引物组合产生7条多态性条带。183份茄子种质的遗传相似系数介于0.276–0.813之间,平均值为0.623,表明茄子种质资源间遗传背景存在一定的差异。在遗传距离为0.345 6处可将183份茄子种质分为4组。通过群体结构分析可将种质划分为4个群体,不同群体间的界限十分明显,且群体间的基因渗透较高。 展开更多
关键词 茄子 遗传多样性 群体结构 SRAP分析
峨眉山地区杨叶木姜子群体遗传多样性研究
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作者 王雪 高暝 +3 位作者 吴立文 汪阳东 刘红彩 陈益存 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期359-369,共11页
杨叶木姜子在中医药、天然香精香料、趋避剂等领域具有重要应用价值,但其分布地域狭窄,仅在四川省部分地区分布,严重影响杨叶木姜子的开发和利用。本研究以四川盆地西南边缘峨眉山地带的杨叶木姜子为材料,在峨眉山全分布区内根据地理位... 杨叶木姜子在中医药、天然香精香料、趋避剂等领域具有重要应用价值,但其分布地域狭窄,仅在四川省部分地区分布,严重影响杨叶木姜子的开发和利用。本研究以四川盆地西南边缘峨眉山地带的杨叶木姜子为材料,在峨眉山全分布区内根据地理位置和海拔高度的差异选择7个不同区域采集到84个样本,利用简化基因组测序(GBS)技术对其进行遗传多样性分析。基于GBS文库,共检测获得到48795个SNP位点,主要变异来源于内含子区域(47.69%)和基因间区(30.71%)。系统进化树分析、主成分分析和群体结构分析均显示7个杨叶木姜子居群聚类到3个大群体。这3个群体分别来自不同的祖先,分别位于峨眉山以金顶为中心向外延伸的2条主要山脉和峨眉山断层向外延伸的山谷区域中,表明峨眉山区地理差异是造成遗传多样性的主要因素。3个群体平均观测杂合度(Ho)为0.27218,平均期望杂合度(He)为0.24596。群体内变异百分率达到96.28%,而群体间变异仅为3.72%。结果表明,峨眉山杨叶木姜子群体间具有较低的遗传多样性水平,但其在群体内具有较高的核苷酸多样性,变异主要来源于群体内变异。研究结果为杨叶木姜子遗传育种和物种多样性保护提供依据,在家系选择方面需注意群体内大量采样,种质资源保存应尽量选择较低海拔。 展开更多
关键词 杨叶木姜子 峨眉山 GBS 遗传结构 遗传多样性
基于SSR的8个平欧杂交榛品种指纹图谱构建 预览
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作者 王泽亮 刘青 +1 位作者 邢文曦 郑崇文 《四川林业科技》 2019年第2期5-8,共4页
平欧杂交榛是目前我国最主要的一个栽培榛子资源。本研究使用9个SSR标记分析了8个引进的平欧杂交榛品种的遗传多样性,并进而构建了指纹图谱。结果显示其群体有效等位基因数、观察杂合度、期望杂合度均值分别为4.161、0.875、0.734,说明... 平欧杂交榛是目前我国最主要的一个栽培榛子资源。本研究使用9个SSR标记分析了8个引进的平欧杂交榛品种的遗传多样性,并进而构建了指纹图谱。结果显示其群体有效等位基因数、观察杂合度、期望杂合度均值分别为4.161、0.875、0.734,说明其遗传多样性水平较高。指纹图谱分析显示通过8个两两标记组合,能有效区分引进的平欧杂交榛品种。本研究为平欧榛栽培品种的保护与推广利用奠定了基础。 展开更多
关键词 平欧杂交榛 简单序列重复 遗传多样性 指纹图谱
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基于线粒体D-loop序列的长江口中华鲟幼鱼遗传多样性分析 预览
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作者 孙丽婷 赵峰 +2 位作者 张涛 纪严 庄平 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2019年第1期9-15,共7页
采用线粒体DNA控制区(D-loop)序列对2015年和2017年长江口中华鲟(Acipenser sinensis)幼鱼样本进行了遗传多样性分析。2015年的682个样本共检测出11个单倍型,2017年的158个样本共检测出8个单倍型。2015年和2017年长江口中华鲟幼鱼的平... 采用线粒体DNA控制区(D-loop)序列对2015年和2017年长江口中华鲟(Acipenser sinensis)幼鱼样本进行了遗传多样性分析。2015年的682个样本共检测出11个单倍型,2017年的158个样本共检测出8个单倍型。2015年和2017年长江口中华鲟幼鱼的平均单倍型多样性(h)为0.857±0.006,核苷酸多样性(π)为0.010 2±0.005 5,均低于截流前数据(h=0.949±0.010;π=0.011±0.006)。分子变异方差分析(AMOVA)显示,中华鲟幼鱼的遗传变异主要来自于群体内,但其年度样本之间出现了中等程度的遗传分化。 展开更多
关键词 中华鲟 遗传多样性 线粒体控制区 长江口
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广东省鼎湖山国家级自然保护区球孢白僵菌遗传多样性研究 预览
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作者 蔡悦 聂勇 +1 位作者 吴茜茜 黄勃 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期92-100,共9页
【目的】了解广东省球孢白僵菌Beauveria bassiana的群体遗传结构、基因流、菌株分化、遗传变异和寄主类型,以及与生态环境的相关性,为筛选优良生产菌株提供后备种质资源。【方法】采用SSR分子标记对广东省鼎湖山国家级自然保护区(以下... 【目的】了解广东省球孢白僵菌Beauveria bassiana的群体遗传结构、基因流、菌株分化、遗传变异和寄主类型,以及与生态环境的相关性,为筛选优良生产菌株提供后备种质资源。【方法】采用SSR分子标记对广东省鼎湖山国家级自然保护区(以下简称“DHS”)采集的81株球孢白僵菌进行遗传结构和多样性分析。【结果】使用8对SSR引物扩增81个菌株产生多态位点数为58个,多态位点比率为100%,其中,引物Ba12多态位点数最多(10个)。通过Popgene32软件包分析发现,DHS球孢白僵菌种群Nei’s基因多样性指数(h)为0.2126,Shannon信息指数(Is)为0.3487,可见其遗传多样性水平较高,群体异质性较强。将群体分别按照寄主和土壤、不同寄主目划分为不同亚群进一步分析,发现土壤亚群遗传多样性水平(h=0.1925,Is=0.3099)略高于寄主亚群(h=0.1769,Is=0.2783),种群间遗传分化程度较弱(Nm=1.6629,Gst=0.1307);不同寄主目群体间的遗传分化较小且基因流明显。基于UPGMA聚类分析发现,各分支菌株的分布趋势与分离基质、不同寄主目均没有相关性。【结论】DHS球孢白僵菌遗传谱系与分离基质和寄主来源均无明显相关性,不同生态环境和寄主类型的影响共同维持了DHS球孢白僵菌种群内遗传变异的多样性。 展开更多
关键词 球孢白僵菌 SSR分子标记 遗传多样性 聚类分析 鼎湖山国家级自然保护区
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