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中国南部和西南地区HCV感染的基因型分布特征 预览 被引量:9
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作者 刘丽君 张瑞 +3 位作者 李俊强 田园 杜绍财 魏来 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第19期 2337-2340,共4页
目的了解中国南部和西南地区HCV感染基因型分布特点。方法用丙型肝炎病毒(HCV)5’非编码区ABC复合酶切分型的方法,对49例广州和重庆HCV感染者进行基因分型,并对检出的6a型产物进行测序。将所得序列与GenBank参考序列比对,并作同源... 目的了解中国南部和西南地区HCV感染基因型分布特点。方法用丙型肝炎病毒(HCV)5’非编码区ABC复合酶切分型的方法,对49例广州和重庆HCV感染者进行基因分型,并对检出的6a型产物进行测序。将所得序列与GenBank参考序列比对,并作同源性分析。结果49例样品中共检出4例6a型,序列分析表明这4例样品都具有6a型特征性,即第-145位的CA插入,并与6a型参考序列同源性最高。分型结果表明,34例广州样品中,1b型25例(72.53%)、2a型5例(14.71%)、3b型1例(2.94%)、6a型2例(5.88%)、1b和2a混合型1例(2.94%);15例重庆样品中1b型8例(53.33%)、2a型1例(6.67%)、3a型1例(6.67%)、3b型3例(20.00%)、6a型2例(13.33%)。结论广州和重庆两个城市的基因型分布都以1b型为主,并首次在广州检出6a型感染,但感染率低于2a型;而重庆则为2a、3a、3b和6a型等多种基因型分布的特点,说明我国南部和西南地区HCV基因型分布与中国大陆其他地区的流行模式存在差异,这可能与其地理位置及静脉药瘾者的迅速增多有关。 展开更多
关键词 肝炎病毒 基因型 5编码区
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肠道病毒71型非编码区结构与功能研究进展
2
作者 董祯 温红玲 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2018年第5期553-556,共4页
肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)是婴幼儿手足口病的重要病原体之一,也是继脊髓灰质炎病毒之后的又一种非常重要且常见的嗜神经病毒。EV71非编码区(untranslated regions,UTRs)的某些位点突变或空间结构改变会影响病毒翻译和... 肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)是婴幼儿手足口病的重要病原体之一,也是继脊髓灰质炎病毒之后的又一种非常重要且常见的嗜神经病毒。EV71非编码区(untranslated regions,UTRs)的某些位点突变或空间结构改变会影响病毒翻译和复制能力以及病毒对细胞组织的亲和力,甚至导致毒力发生变化。目前,EV71的致病机制尚不明确,非编码区的研究是必不可少的一部分,本文综述了近几年来关于EV71非编码区基本结构以及功能研究的最新进展。 展开更多
关键词 肠道病毒71型 5编码区 3’编码区
中国口服脊髓灰质炎减毒活疫苗安全性评估 被引量:4
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作者 赵蓉 张勇 +2 位作者 王东艳 祝双利 许文波 《中国计划免疫》 2006年第6期445-453,共9页
目的研究北京生物制品研究所(北京所)和中国医学科学院医学生物学研究所(昆明所)生产的口服脊髓灰质炎(脊灰)减毒活疫苗(OPV)减毒位点的基因特征,对比Sabin标准株,从基因序列的基础上研究OPV是否安全有效,从而为中国维持无... 目的研究北京生物制品研究所(北京所)和中国医学科学院医学生物学研究所(昆明所)生产的口服脊髓灰质炎(脊灰)减毒活疫苗(OPV)减毒位点的基因特征,对比Sabin标准株,从基因序列的基础上研究OPV是否安全有效,从而为中国维持无脊灰状态OPV的使用和免疫策略提供科学依据。方法随机选取生产的不同批次OPV,先进行病毒分离和扩增,用中和试验定型,分出Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型脊灰疫苗病毒,然后用聚合酶链反应(PCR)得到各型脊灰疫苗病毒的5'非编码区(5'NTR区)和VP1蛋白编码区基因核苷酸片段,测序后,与各型脊灰Sabin标准株进行比较分析。结果两个所生产的OPV各型疫苗病毒的5'NTR区核苷酸序列与标准Sabin株各型别5'NTR区无差别,同源性为100%;VP1区核苷酸序列比较,北京所与昆明所OPVⅠ型VP1区与SabinⅠ型VP1区核苷酸序列同源性为100%;北京所OPVⅡ型VP1区与SabinⅡ型VP1区比较,有5个碱基变化,同源性为99.45%,昆明所OPVⅡ型VP1区与SabinⅡ型VP1区比较,有6个碱基变化,同源性为99.34%;北京所与昆明所OPVⅢ型VP,区与SabinⅢ型VP,区比较,都有2个碱基变化,同源性为99.78%。北京所与昆明所生产的OPV,3个型别的5'NTR区和VP1蛋白编码区基因核苷酸序列与标准Sabin株比较,所有神经毒力位点未发生变化,未发生毒力回复突变。结论中国北京所和昆明所生产的OPV是安全有效的,应对如何停止使用OPV,如何用脊灰灭活疫苗取代OPV进行前期研究工作。 展开更多
关键词 口服脊髓灰质炎减毒活疫苗 Ⅲ型脊髓灰质炎疫苗病毒 Sabin标准株 5'编码区 VP1蛋白编码区
BamH Ⅰ酶切位点变异区域性分布在HCV 1b型5'非编码区的研究 预览 被引量:3
4
作者 张瑞 杜绍财 +2 位作者 田园 韩建德 魏来 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第20期 3082-3084,共3页
目的研究丙型肝炎病毒(HCV)1b型5'非编码区BamHⅠ酶切位点变异的区域性分布.方法对来自中国4个不同地区的64例HCV 1b基因型血清样品进行5'-NCR扩增后,分别用Mbo Ⅰ、BamH Ⅰ限制性内切酶酶切分析,比较不同地区变异株分布的差异... 目的研究丙型肝炎病毒(HCV)1b型5'非编码区BamHⅠ酶切位点变异的区域性分布.方法对来自中国4个不同地区的64例HCV 1b基因型血清样品进行5'-NCR扩增后,分别用Mbo Ⅰ、BamH Ⅰ限制性内切酶酶切分析,比较不同地区变异株分布的差异.结果测序证实中国HCV 1b基因型在117位有BamH Ⅰ酶切位点.64例血清样品中,BamH Ⅰ单切点变异株,华南7例(28%),东北1例(10%),华北1例(11.1%),西南0例;Mbo Ⅰ及BamHⅠ切点均无的变异株,西南8例(40%),华南2例(4%),东北1例(10%),华北0例.结论证实HCV 1b型BamH Ⅰ变异具有区域性分布特点,华南地区和西南地区变异较多,华北和东北变异较少.而这一变异是否与干扰素治疗耐药有关,尚有待于进一步研究. 展开更多
关键词 酶切位点 HCV 5编码区 遗传变异
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猪乳糖酶基因5’非编码区多态性分析 被引量:4
5
作者 杜海廷 赵薇 +2 位作者 巴彩凤 田玉民 苏玉虹 《畜牧与兽医》 北大核心 2013年第8期45-49,共5页
研究检测国内外猪种乳糖酶基因5’非编码区多态性位点。采用PCR、TA克隆和直接测序的方法,分析大白猪、长白猪、杜洛克、荷包猪、民猪乳糖酶基因5’非编码区多态性。结果表明,在猪乳糖酶基因5’非编码区-630 bp处及增强子区-797 bp处出... 研究检测国内外猪种乳糖酶基因5’非编码区多态性位点。采用PCR、TA克隆和直接测序的方法,分析大白猪、长白猪、杜洛克、荷包猪、民猪乳糖酶基因5’非编码区多态性。结果表明,在猪乳糖酶基因5’非编码区-630 bp处及增强子区-797 bp处出现G/A两种不同的等位基因,在-539 bp处出现C/T两种不同的等位基因,在-442 bp处出现C/A两种不同的等位基因。 展开更多
关键词 乳糖酶基因 5编码区 多态性
中国兰州地区丙型肝炎病毒感染的基因型分布特征 预览 被引量:3
6
作者 张文杰 刘丽君 +3 位作者 杜绍财 李朝霞 卢青云 杨少华 《临床肝胆病杂志》 CAS 2010年第3期290-291,294共3页
目的了解中国兰州地区丙型肝炎病毒(HCV)感染基因型分布特点。方法筛选41例来自兰州的HCVRNA阳性患者血清样品,扩增HCV5′非编码区(5’NCR),得到257bp的聚合酶链反应(PCR)产物,并对这些产物进行测序。然后将所得序列与GenBank参... 目的了解中国兰州地区丙型肝炎病毒(HCV)感染基因型分布特点。方法筛选41例来自兰州的HCVRNA阳性患者血清样品,扩增HCV5′非编码区(5’NCR),得到257bp的聚合酶链反应(PCR)产物,并对这些产物进行测序。然后将所得序列与GenBank参考序列比对,并作同源性分析和进化分析。结果 41例样品中共检出1b型感染25例(61.0%),1c型感染8例(19.5%),2a型4例(9.8%),1a型3例(7.3%),3b型感染1例(2.4%)。结论兰州地区的基因型分布以1b型为主,并首次在中国检出1c型感染,且感染率仅低于1b型;此外还检出2a、1a和3b;未检出4、5和6型等基因型。 展开更多
关键词 肝炎病毒 肝炎 丙型 基因型 5编码区
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Ⅰ型鸭肝炎病毒内部核糖体进入位点的结构与功能研究 预览 被引量:2
7
作者 赵伟 李传峰 +1 位作者 陈宗艳 刘光清 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期 1-5,共5页
为验证Ⅰ型鸭肝炎病毒(DHV-Ⅰ)基因组5'非编码区(UTR)是否含有内部核糖体进入位点元件,本研究利用体外翻译系统,结合细胞转染试验对DHV-Ⅰ5'UTR的结构和功能进行分析。结果表明:DHV-Ⅰ的5'UTR具有典型的内部核糖体结合元件(IRE... 为验证Ⅰ型鸭肝炎病毒(DHV-Ⅰ)基因组5'非编码区(UTR)是否含有内部核糖体进入位点元件,本研究利用体外翻译系统,结合细胞转染试验对DHV-Ⅰ5'UTR的结构和功能进行分析。结果表明:DHV-Ⅰ的5'UTR具有典型的内部核糖体结合元件(IRES)功能,能够内部起始下游蛋白的翻译,IRES元件位于360 nt~620 nt,共260个碱基。对IRES的二级结构进行预测和分析显示,DHV-ⅠIRES的结构与丙型肝炎病毒相似。利用定点突变方法,破坏IRES的颈环结构(SL)1、2以及IIIe区的关键性核苷酸,检测该突变对IRES功能的影响。研究结果显示,SL1、SL2和IIIe结构的破坏使得DHV-ⅠIRES的功能消失,表明SL1、SL2和IIIe区是维持IRES启动内部翻译起始功能的关键性结构域。 展开更多
关键词 Ⅰ型鸭肝炎病毒 5'编码区 内部核糖体进入位点
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HCV特异性M1GS核酶的构建及体外切割活性研究 预览 被引量:2
8
作者 张文军 宁容 +1 位作者 张欣 李红枝 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期 99-103,共5页
针对HCV基因组中较为保守的区域-5’UTR,设计一段GS引导序列,并与大肠杆菌RNaseP的催化亚基-M1RNA的3’末端共价结合,构建序列特异性M1GS核酶-M1GS—HCV/C20。体外实验证实,所构建的人工核酶对HCV5’UTR具有明显的靶向切割活性,... 针对HCV基因组中较为保守的区域-5’UTR,设计一段GS引导序列,并与大肠杆菌RNaseP的催化亚基-M1RNA的3’末端共价结合,构建序列特异性M1GS核酶-M1GS—HCV/C20。体外实验证实,所构建的人工核酶对HCV5’UTR具有明显的靶向切割活性,且这种切割发生于靶序列的特定位点。研究将为进一步阐明该核酶在胞内的活性、乃至动物模型内评价其抗病毒效果提供实验材料,从而为新型抗HCV药物及反义基因治疗的研究奠定基础。 展开更多
关键词 核酶P 引导序列 丙型肝炎病毒 5编码区
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丙型肝炎5’非编码区末端快速基因扩增方法的建立及应用 预览 被引量:1
9
作者 秦兆习 丛旭 +3 位作者 蒋栋 哈明昊 陈红松 魏来 《实用肝脏病杂志》 2005年第6期 321-323,共3页
目的建立快速获得丙型肝炎(HCV)基因组5'非编码区(5'UTR)真末端序列的分子生物学方法.方法逆转录后利用末端聚合酶(TDT)进行加尾反应,再利用套式聚合酶链反应(PCR)扩增出目的末端基因的cDNA片段,A-T克隆,用限制性内切酶片段长... 目的建立快速获得丙型肝炎(HCV)基因组5'非编码区(5'UTR)真末端序列的分子生物学方法.方法逆转录后利用末端聚合酶(TDT)进行加尾反应,再利用套式聚合酶链反应(PCR)扩增出目的末端基因的cDNA片段,A-T克隆,用限制性内切酶片段长度多态性分析(RFLP)与PCR鉴定重组子,全自动序列分析仪测定插入子序列.结果 cDNA末端快速扩增技术(RACE)获得5株HCV5'UTR克隆,包括3株全长克隆和2株缺失克隆.2株缺失克隆,一条在5'末端缺失53个碱基,另一条缺失144个碱基.结论 RACE技术快速、有效、实用,可有效获得丙型肝炎病毒基因组的5'非编码区末端序列. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 5编码区 序列分析 CDNA末端快速扩增
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线粒体融合基因2新变异位点A-35G与原发性高血压的相关性研究 预览 被引量:1
10
作者 王佐广 靳飞 +7 位作者 李笑 刘雅 刘洁琳 孙东东 李闯 文杰 温绍君 魏永祥 《心肺血管病杂志》 2017年第3期165-169,共5页
目的:线粒体融合基因2(Mfn2)是一个与原发性高血压(EH)易感性相关的基因。本研究的目的是探讨该基因上游未编码区的单核苷酸位点变异与EH的相关性。方法:筛选健康正常血压(NT组)者342人和EH组患者366例。进行常规体检和血压、... 目的:线粒体融合基因2(Mfn2)是一个与原发性高血压(EH)易感性相关的基因。本研究的目的是探讨该基因上游未编码区的单核苷酸位点变异与EH的相关性。方法:筛选健康正常血压(NT组)者342人和EH组患者366例。进行常规体检和血压、血脂及血糖等检查。提取静脉血DNA,设计引物进行PCR扩增后,进行测序。然后计算相关变异位点的等位基因和基因型在二组人群中分布的频率,并进一步分析其与EH的相关性。结果:SNPdb数据库检索表明A-35G是一个新的Mfn2启动子区的变异位点。该位点在NT组和EH组中基因型频率和基因频率均存在着明显的差别,即AA、AG、GG的频率分别为290(79.3%)/245(71.5%)、8(2.2%)/9(2.7%)、68(18.5%)/88(25.8%),A、G分别为588(80.1%)/499(73.0%)、144(19.7%)/185(27.0%)。进一步按性别分组后显示:在男性NT组和EH组中基因型频率和基因频率也存在着明显的差别,即AA、AG、GG的频率分别为157(79.3%)/143(73.2%)、4(1.9%)/3(1.7%)、40(20.0%)/49(25.1%),A、G分别为588(80.1%)/499(73.0%)、144(19.7%)/185(27.0%)。在女性NT组和EH组中基因型频率和基因频率不存在着明显的差别(P〉0.05)。在经过年龄和性别调整后进行相关性分析发现A-35G、体质指数、身高和体重与EH发病明显相关。结论:A-35G是一个新的Mfn2启动子区的变异位点,基因频率和基因型频率在EH和男性EH组中明显高于正常对照组。相关性分析表明该变异也与EH的发病存在明显相关。因此,A-35G可能是EH发病的独立危险因素。 展开更多
关键词 线粒体融合基因2 位点变异 原发性高血压 5编码区 转录因子
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HCV5'非编码区基因分型与病毒复制水平的分析 被引量:1
11
作者 王越 雷金娥 +6 位作者 段巍 江啸 穆丽君 惠凌云 史雯欣 周聪雅 杜忆华 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2017年第5期414-418,共5页
目的 研究丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV)的基因分型与各基因型的病毒复制水平,为判断病情及抗病毒治疗提供参考.方法 收集未经抗病毒药物治疗的抗-HCV阳性血清标本60份,经逆转录聚合酶链反应(Reverse Transcription Polymeras... 目的 研究丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV)的基因分型与各基因型的病毒复制水平,为判断病情及抗病毒治疗提供参考.方法 收集未经抗病毒药物治疗的抗-HCV阳性血清标本60份,经逆转录聚合酶链反应(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)及核苷酸序列分析HCV的5'非编码区,对标本进行基因分型,并采用定量-PCR检测患者的血清HCV-RNA含量.统计学数据用Graphpad Prism 5.0和SPSS21.0软件进行分析.多组间的比较采用方差分析,两独立样本比较的t检验.结果 本研究人群中HCV各基因亚型的检出率依次为1b型48.3%(29/60)、3 a型23.3% (14/60)、1a型16.7% (10/60)和2a型10%(6/60),并检出一例2c亚型.HCV各基因亚型的血清平均病毒RNA含量的对数值log10(IU/ml)和标准差分别是:1a型5.46±1.19、1b型6.22±0.78、2a型5.47±0.65、3a型5.38±0.98 log10 (IU/ml).结论 本研究人群中1型HCV感染率显著高于2型和3型的感染率(P<0.01).1b亚型组血清HCV-RNA含量显著高于1a、2a和3a亚型感染人群的血清HCV-RNA含量(P<0.05).研究HCV准确的基因分型与血清HCV-RNA含量,有助于对各基因型丙型肝炎患者抗病毒治疗方案的制定. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 5'编码区 HCV基因分型 血清HCV-RNA含量
猪水泡病病毒5’和3’非编码区一级和二级结构分析 预览
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作者 冶贵生 张彦明 +4 位作者 刘湘涛 洪海霞 张永国 张淼涛 胡建和 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期 343-346,共4页
应用RT-PCR技术,用特异性引物扩增出SVDV HK'70 5'和3'非编码区,并将目的片段连接于pMD18-T载体,转化JM109感受态细胞.重组质粒经双酶切、PCR鉴定后测序.核苷酸序列比较结果表明,SVDV HK'70 5'非编码区与参考毒株SV... 应用RT-PCR技术,用特异性引物扩增出SVDV HK'70 5'和3'非编码区,并将目的片段连接于pMD18-T载体,转化JM109感受态细胞.重组质粒经双酶切、PCR鉴定后测序.核苷酸序列比较结果表明,SVDV HK'70 5'非编码区与参考毒株SVDV J1'73、SVDV H/3'76核苷酸的差异率分别为1.6%、1.9%SVDV HK'70 3'-NCR与参考毒株SVDV J1'73、SVDV H/3'76核苷酸的差异率分别为1.0%、1.0%.应用计算机软件对3个SVDV毒株非编码区的二级结构进行预测,结果表明,SVDV HK'70 5'非编码区二级结构中存在13个结构域,SVDV J1'73 5'非编码区二级结构中存在9个结构域,SVDV H/3'76 5'非编码区二级结构中存在10个结构域;SVDV HK'70 3'非编码区二级结构中存在3个结构域,且与其他的两个毒株SVDV J1'73、SVDV H/3'76基本相同. 展开更多
关键词 SVDV HK’70 5编码区 3’编码区 同源性 二级结构
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肠道病毒71型基因组5'非编码区序列分析 被引量:2
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作者 袁晓晶 温红玲 +6 位作者 高峰 许洪芝 司鲁莹 王东旭 宋艳艳 赵丽 王志玉 《山东大学学报:医学版》 CAS 北大核心 2012年第9期127-132,共6页
目的了解2009年山东省临沂市分离的肠道病毒71型(EV71)基因组5'非编码区(5'UTR)序列特征,探讨基因组中引起神经毒性作用的候选位点。方法从手足口病患者的粪便标本中分离EV71,运用一步法逆转录聚合酶链反应扩增8个病毒株的5'UTR... 目的了解2009年山东省临沂市分离的肠道病毒71型(EV71)基因组5'非编码区(5'UTR)序列特征,探讨基因组中引起神经毒性作用的候选位点。方法从手足口病患者的粪便标本中分离EV71,运用一步法逆转录聚合酶链反应扩增8个病毒株的5'UTR区,运用DNAstar和MEGA 4软件进行序列分析。结果 8个病毒株5'UTR区核苷酸为741~745 nt,核苷酸序列同源性介于97.0%~99.9%,8个病毒株的5'UTR区与C4亚型的同源性最高。序列比对发现,在5'UTR区第265 nt及703 nt处出现了核苷酸的突变(G265A,G703T)。遗传进化分析显示,8个病毒株序列与C4亚型的亲缘关系最为密切。结论此8个病毒株为C4亚型,核苷酸突变(G265A,G703T)可能与EV71的致神经毒性作用有关。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒71型 5'编码区 遗传进化分析 神经毒性
内部核糖体进入位点(IRES)调控多种癌细胞系中尾型同源盒转录因子2的翻译
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作者 高文青 李琪 +2 位作者 陈蕴 朱瑞宇 金坚 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期260-268,共9页
尾型同源盒转录因子2(caudal type homeobox transcription factor 2,CDX2)促进肠癌细胞增殖,并具有致瘤的潜能。然而,对于CDX2翻译水平的调控机制研究甚少。本研究基于转染及报告酶活性分析结果,首次证明CDX2 5'非翻译区(5'untran... 尾型同源盒转录因子2(caudal type homeobox transcription factor 2,CDX2)促进肠癌细胞增殖,并具有致瘤的潜能。然而,对于CDX2翻译水平的调控机制研究甚少。本研究基于转染及报告酶活性分析结果,首次证明CDX2 5'非翻译区(5'untranslated region,5'-UTR)存在内部核糖体进入位点(internal ribosome entry site,IRES),并通过IRES在HEK293细胞以及肝癌、肠癌和卵巢癌等肿瘤细胞株中介导翻译起始。IRES介导的翻译机制与经典的帽依赖翻译途径(cap-dependent translation)不同,在一些IRES反式作用因子(IRES trans-acting factors,ITAFs)的作用下,不需要帽状结构,IRES可以直接招募核糖体小亚基,起始翻译。同时,肿瘤细胞内IRES介导的翻译方式可能是引起蛋白质异常表达的原因之一。通过Western印迹检测CDX2在4种肿瘤细胞系中的表达,发现CDX2的IRES活性与其在肿瘤细胞中蛋白质表达量正相关,其活性在耐药型卵巢肿瘤细胞株中最高。此外,CDX2 IRES元件的5'端截短及报告酶活性分析证明,CDX2 5'-UTR的活性中心位于68-147碱基之间,而位于5'末端的67个碱基形成一个远端茎环,抑制全长IRES的活性。定点突变68-147活性区域的实验结果揭示,3个茎环结构域(68GCCGGC73,88GCCAG92和114CUCUG118)是IRES元件中不可或缺的部分。上述结果证明,CDX2 5'-UTR具有IRES活性,其活性依赖于二级茎环结构。因此,可以针对特殊的茎环结构域进行研究,使之成为肿瘤药物作用靶点。 展开更多
关键词 尾型同源盒转录因子2 5'编码区 内部核糖体进入位点
Analysis of hypermutation of the 5’ noncoding region in the BCL-6 gene 预览
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作者 王林 刘建湘 +9 位作者 黄薇 王辉东 王建民 顾柏炜 陈竺 陈赛娟 许良中 杨文涛 金晓龙 柳红 《中华医学杂志:英文版》 SCIE CAS CSCD 2001年第3期62-66,107共6页
目的 研究BCL 6基因突变在B细胞非Hodgkin’s淋巴瘤 (B NHL)发病中的作用。方法 联合应用聚合酶链反应 变性梯度凝胶电泳 (PCR DGGE)和DNA测序等技术 ,对 4 0例B NHL的两个特殊亚型 :弥漫性大细胞性淋巴瘤 (DLCL)和滤泡性淋巴瘤 (FL... 目的 研究BCL 6基因突变在B细胞非Hodgkin’s淋巴瘤 (B NHL)发病中的作用。方法 联合应用聚合酶链反应 变性梯度凝胶电泳 (PCR DGGE)和DNA测序等技术 ,对 4 0例B NHL的两个特殊亚型 :弥漫性大细胞性淋巴瘤 (DLCL)和滤泡性淋巴瘤 (FL)患者BCL 6基因 5’非编码区的突变进行检测。结果 在DLCL中BCL 6基因突变率为 2 5 7% ,9例阳性病例的突变类型均为碱基替换 ,其单碱基改变率为 (0 56- 1 10 )× 10 2 /bp。结论 BCL 6基因 5’调控区的改变为高频率、多位点的体细胞突变 ;本研究为分析中国人DLCL的发病机制和淋巴瘤的辅助诊断提供了一个分子标志 展开更多
关键词 CL6基因 5编码区 超高频突变(超突变) 弥漫性大细胞性淋巴瘤滤泡性淋巴瘤
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新型肝炎病毒 预览 被引量:1
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作者 骆成榆 《上海预防医学》 CAS 1997年第4期187-189,共3页
关键词 肝炎病毒 肝炎病人 暴发性肝炎 黄病毒 HGV-RNA 献血员 PCR检测 重组蛋白 猴血清 5编码区
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丙型肝炎病毒5’utr分型和C区基因分型结果的比较 预览 被引量:1
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作者 丁伟良 许可 +5 位作者 邓小昭 喻荣彬 杨志贤 邵建伟 谈永飞 张云 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期 206-208,共3页
目的比较丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)不同基因分型方法的一致性。方法采用5’非编码区(NCR)型特异性引物分型法和核心区型特异性引物分型法分别对95例和其中的31例HCV RNA阳性患者的血清样本进行基因分型,分析不同分型... 目的比较丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)不同基因分型方法的一致性。方法采用5’非编码区(NCR)型特异性引物分型法和核心区型特异性引物分型法分别对95例和其中的31例HCV RNA阳性患者的血清样本进行基因分型,分析不同分型方法的灵敏度和稳定性异同。结果两种分型方法的一致性达到93.5%,对于混合感染的发现能力C区分型较强.稳定性无差异。结论C区分型方法更加精确。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 5编码区 核心 基因分型
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2a型丙型肝炎病毒5’非编码区的RACE护增及二级结构的分析 预览
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作者 秦兆习 丛旭 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期 333-336,共4页
目的:获得真全长中国大陆2a型丙型肝炎病毒(HCV)5’非编码区(5’UTR)cDNA,并分析其一级结构和二级结构,为进一步研究其在HCR复制、翻译中的调控机制、开发新的抗HCV药物奠定基础。方法:利用逆转录套式聚合酶链反应(RT-PCR)... 目的:获得真全长中国大陆2a型丙型肝炎病毒(HCV)5’非编码区(5’UTR)cDNA,并分析其一级结构和二级结构,为进一步研究其在HCR复制、翻译中的调控机制、开发新的抗HCV药物奠定基础。方法:利用逆转录套式聚合酶链反应(RT-PCR)联合限制性内切酶长度多态性分析(RFLP)初步筛选出1例2a型HCV感染者,采用cDNA末端快速扩增技术(RACE)扩增出一条约800bp的cDNA片段,A-T克隆,用RFLP与PCR鉴定重组子,全自动序列分析仪测定插入子序列,RNAdraw预测二级结构。结果:RACE法获得真全长2a型HCV 5’端序列。5个克隆中,3个克隆含全长5’UTR序列,与HCV-1,HC-C2,HC-J6,HC-J8相比,同源性分别为93.6%-94.4%,92.1%-93.0%,98.8%-99.7%,96.2%-96.5%,与2a型标准株HC-J6相比,21,170,222,247,339位不同,分别为G,A,C,C,T,但这些突变不影响其二级结构。另外2个克隆为5’端缺失突变株,分别缺失54bp和144bp。结论:RACE技术快速、有效、实用,可用效获得病毒基因组的末端序列;依此获得中国大陆2a型HCV的5’UTR cDNA;在感染者血液中存在5’端部分缺失的HCV基因片段。 展开更多
关键词 2a型丙型肝炎病毒 二级结构 丙型肝炎 5'编码区 序列分析 CDNA末端快速扩增技术 一级结构
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丙型肝炎病毒基因组5‘非编码区结构与功能研究进展 被引量:1
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作者 徐东刚 《国外医学:分子生物学分册》 CSCD 1995年第4期 180-184,共5页
丙型肝炎病毒是经血源传播的一类肝炎病毒,其基因组为单股正链RNA,全长约为 9.5kb,结构组成与黄热病毒和瘟病毒相似,它的5、非编码区相对较长,一般为324-341个碱基。内含有数个小的开放阅读框。不同分离株在此区... 丙型肝炎病毒是经血源传播的一类肝炎病毒,其基因组为单股正链RNA,全长约为 9.5kb,结构组成与黄热病毒和瘟病毒相似,它的5、非编码区相对较长,一般为324-341个碱基。内含有数个小的开放阅读框。不同分离株在此区的同源性可高达98%,其一级结构高度保守,并可形成特定的二级结构,在病毒基因的表达和复制中起重要的调节作用。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 5'编码区
猪繁殖与呼吸综合征病毒5’非编码区前导转录调控序列及其侧翼序列的结构与功能解析
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作者 陆嘉琦 高飞 +2 位作者 刘萍 蔺涛 袁世山 《畜牧与兽医》 北大核心 2011年第11期 1-6,共6页
为解析猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)5’非翻译区(5’UTR)的高级结构与功能,以北美株PRRSV感染性克隆为平台,通过定点突变PCR技术将其5’UTR中一特殊高级调控元件的一级序列进行突变,以改变其二级茎环结构,从而解析该结构的基... 为解析猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)5’非翻译区(5’UTR)的高级结构与功能,以北美株PRRSV感染性克隆为平台,通过定点突变PCR技术将其5’UTR中一特殊高级调控元件的一级序列进行突变,以改变其二级茎环结构,从而解析该结构的基因调控水平。将突变DNA克隆转染入BHK-21细胞后利用免疫荧光及RT—PCR试验:来研究拯救后突变病毒的转录、翻译特性,及通过空斑形态学及病毒生长曲线分析突变病毒的生长特性。结果表明,PRRSV 5’UTR中该高级调控元件的顶端环结构为病毒复制所必需,其只可耐受2个核苷酸的突变;同时发现该调控元件中一保守的茎结构为病毒复制非必需。由此证实了PRRSV 5’UTR中调控病毒复制过程的必需高级结构,为进一步解析PRRSV复制调控元件奠定基础。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 5编码区 前导转录调控序列 病毒复制 基因表达调控
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