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白花泡桐和毛泡桐丛枝病发生与蛋白质表达谱变化 预览
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作者 张雯宇 翟晓巧 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2019年第2期161-169,共9页
为深入了解泡桐丛枝病发生与蛋白质变化的关系,以白花泡桐和毛泡桐健康、患丛枝病组培幼苗以及经15mg·L-1和75mg·L-1硫酸二甲酯(DMS)处理的患病组培幼苗为材料,采用iTRAQ技术研究这2个品种、8种材料的蛋白质表达谱变化。结果... 为深入了解泡桐丛枝病发生与蛋白质变化的关系,以白花泡桐和毛泡桐健康、患丛枝病组培幼苗以及经15mg·L-1和75mg·L-1硫酸二甲酯(DMS)处理的患病组培幼苗为材料,采用iTRAQ技术研究这2个品种、8种材料的蛋白质表达谱变化。结果表明,12种蛋白质与泡桐丛枝病发生密切相关,其主要定位于叶绿体(7个,58.33%)和线粒体(3个,25%),功能与光合作用、蛋白质翻译、抗逆性相关。实时荧光定量PCR验证结果显示部分蛋白质的基因在mRNA的表达水平与iTRAQ测试的蛋白质翻译水平结果一致。研究结果为深入揭示泡桐丛枝病发生机理奠定基础。 展开更多
关键词 白花泡桐 毛泡桐 丛枝病 iTRAQ 蛋白质表达谱
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电离辐照损伤对小鼠脾脏组织核糖体信号通路的影响 预览
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作者 何清 李敏 +3 位作者 唐文诚 易辉燕 王蕾 王继生 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1244-1250,共7页
目的从比较蛋白质组学的角度,分析电离辐照损伤组小鼠与正常组小鼠脾脏组织差异蛋白质的表达情况,对差异蛋白所涉及的信号通路进行分析,从而阐明电离辐照对小鼠脾脏组织的损伤机制。方法采用5 Gy 60 Coγ射线照射小鼠,构建小鼠电离辐照... 目的从比较蛋白质组学的角度,分析电离辐照损伤组小鼠与正常组小鼠脾脏组织差异蛋白质的表达情况,对差异蛋白所涉及的信号通路进行分析,从而阐明电离辐照对小鼠脾脏组织的损伤机制。方法采用5 Gy 60 Coγ射线照射小鼠,构建小鼠电离辐照损伤模型,提取电离辐照组小鼠和正常组小鼠的脾脏组织,利用ITRAQ联合LC-MS/MS技术,筛选出两组小鼠脾脏组织的差异蛋白质。结果KEGG Pathway富集分析共鉴定到17条生物信号通路(P<0.05),其中富集在核糖体信号通路的差异蛋白质有37个,其中有36个差异蛋白质表达下调,1个差异蛋白质表达上调。这些通路涉及核糖体蛋白、60S核糖体蛋白、40S核糖体蛋白等的多个亚基蛋白,这些蛋白主要参与蛋白质的翻译及核糖体的结构组成等生物过程。结论电离辐照导致小鼠脾脏组织核糖体信号通路所涉及的37个差异蛋白中,有36个差异蛋白表达下调,1个差异蛋白表达上调,导致脾脏组织蛋白质合成障碍是电离辐照损伤的重要机制。 展开更多
关键词 电离辐照 脾脏组织 比较蛋白质组学 ITRAQ 核糖体 KEGG
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应用iTRAQ结合2D LC-MS/MS技术分析哈蟆油与伪品蛙油的差异蛋白质组
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作者 魏星华 王铭 +5 位作者 张玉尧 潘黛安 苏航 齐滨 张鹤 赵大庆 《辽宁中医杂志》 CAS 2019年第3期472-475,I0002共5页
采用iT RAQ结合2D LC-MS/MS技术对哈蟆油、青蛙油、蟾蜍油、牛蛙油的蛋白质组进行研究。采用Q Exactive质谱鉴定并经MASCOT软件搜库,对所鉴定的蛋白质进行理化性质分析、层次聚类分析、Gene ontology(GO)功能注释和生物信息学分析。结... 采用iT RAQ结合2D LC-MS/MS技术对哈蟆油、青蛙油、蟾蜍油、牛蛙油的蛋白质组进行研究。采用Q Exactive质谱鉴定并经MASCOT软件搜库,对所鉴定的蛋白质进行理化性质分析、层次聚类分析、Gene ontology(GO)功能注释和生物信息学分析。结果共获得2286个肽段,鉴定到1220个蛋白质,其中1212个蛋白质具有定量信息。鉴定得到的蛋白质分子量主要分布在4. 1~36. 9 kD a,占82. 79%,等电点主要分布在4. 41~9. 89,占94. 84%。对比青蛙油、蟾蜍油和牛蛙油与哈蟆油蛋白质数据库,筛选得到8个差异蛋白(比值> 1. 2或比值<0. 83,且P <0. 05),其中显著上调的蛋白质3个,显著下调的蛋白质5个。本结果在蛋白质组成上显示了哈蟆油与伪品蛙油的差异性,为进一步分析哈蟆油中蛋白质成分特点、功能奠定基础。 展开更多
关键词 哈蟆油 青蛙油 蟾蜍油 牛蛙油 ITRAQ 蛋白质组
电离辐照损伤对小鼠睾丸组织氧化磷酸化信号通路的影响 预览
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作者 罗芳芳 李敏 +3 位作者 易辉燕 吴莎莎 唐莉 王继生 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期483-488,共6页
目的 比较电离辐照损伤小鼠与正常小鼠的睾丸组织差异表达蛋白质,分析所得差异蛋白涉及的信号通路,以期从蛋白质组学角度阐述电离辐照对睾丸组织损伤的作用机制。方法 采用^60Coγ射线辐照建立小鼠电离辐照损伤模型。运用比较蛋白质组... 目的 比较电离辐照损伤小鼠与正常小鼠的睾丸组织差异表达蛋白质,分析所得差异蛋白涉及的信号通路,以期从蛋白质组学角度阐述电离辐照对睾丸组织损伤的作用机制。方法 采用^60Coγ射线辐照建立小鼠电离辐照损伤模型。运用比较蛋白质组学方法、iTRAQ联合LC-MS/MS检测技术,提取出小鼠辐照组与正常组睾丸组织比较后的差异表达蛋白质,进一步利用David6.8、String10.5和Cytoscape3.6.1数据库,对差异蛋白进行KEGG富集分析和相互作用分析。结果 KEGG富集分析鉴定出21条生物信号通路(P<0.05),其中富集于氧化磷酸化信号通路的差异蛋白有13个,均为表达下调。该通路涉及ATP合成酶、细胞色素、NADH脱氢酶这3类蛋白的多个亚基,它们主要参与线粒体电子传递、线粒体呼吸链复合物I装配、ATP生物合成等过程。结论 电离辐照引起小鼠睾丸组织氧化磷酸化信号通路所涉及的13个差异蛋白均出现低表达,导致细胞机体ATP的合成障碍是辐射损伤的重要机制。 展开更多
关键词 电离辐照 睾丸 蛋白质组学 ITRAQ KEGG 氧化磷酸化
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丹莪妇康煎膏对子宫腺肌病异位子宫内膜间质细胞Y14增殖、迁移及侵袭的影响
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作者 刘发英 邹阳 +3 位作者 杨必成 罗勇 张子宇 黄欧平 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2019年第11期822-825,共4页
目的:研究丹莪妇康煎膏含药血清对子宫腺肌病间质细胞Y14的细胞生物学功能的影响。方法:制备丹莪妇康煎膏含药血清,作用于间质细胞Y14,CCK-8、Transwell及流式细胞术检测细胞增殖、迁移、侵袭及凋亡情况;同位素相对标记与绝对定量技术... 目的:研究丹莪妇康煎膏含药血清对子宫腺肌病间质细胞Y14的细胞生物学功能的影响。方法:制备丹莪妇康煎膏含药血清,作用于间质细胞Y14,CCK-8、Transwell及流式细胞术检测细胞增殖、迁移、侵袭及凋亡情况;同位素相对标记与绝对定量技术检测差异表达蛋白情况。结果:与对照组相比,丹莪妇康煎膏含药血清高剂量组作用96h,抑制细胞增殖差异显著(P<0.05);中、高剂量组细胞迁移数及侵袭数均显著下降(P<0.05);同位素相对标记与绝对定量技术检测并筛选到差异表达蛋白质共188个,其中表达上调的蛋白质81个,表达下调的蛋白质107个。结论:丹莪妇康煎膏能抑制Y14细胞的增殖、迁移及侵袭;同位素相对标记与绝对定量技术筛选出的差异表达蛋白质为进一步研究其作用机制提供了基础。 展开更多
关键词 丹莪妇康煎膏 子宫腺肌病 子宫内膜间质细胞 ITRAQ
不同发育时期油桐种仁油体蛋白质组分析 预览
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作者 张启燕 高暝 +2 位作者 吴立文 汪阳东 陈益存 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2019年第1期47-57,共11页
[目的]对油桐种仁不同生长时期的油体蛋白进行定量蛋白质组研究,鉴定油桐种仁油体蛋白质的组成,探讨不同生长时期种仁油体蛋白质组的表达差异。[方法]采用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术提取3个不同生长时期的油桐种仁油体蛋白质... [目的]对油桐种仁不同生长时期的油体蛋白进行定量蛋白质组研究,鉴定油桐种仁油体蛋白质的组成,探讨不同生长时期种仁油体蛋白质组的表达差异。[方法]采用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术提取3个不同生长时期的油桐种仁油体蛋白质组,质检合格的蛋白经酶解、iTRAQ标记后进行高效液相、质谱检测。利用Mascot软件对转换的二级质谱数据进行蛋白质鉴定,通过iTRAQ定量寻找差异表达蛋白,并对差异蛋白进行GO功能注释、KEGG代谢通路和聚类分析。[结果]在3个生长时期成熟油桐种仁油体亚细胞器中共鉴定出5 632个蛋白,其中,2 639个具有催化活性,401个蛋白质参与脂肪酸及油脂的合成与代谢。在种仁成熟的3个生长时期中,共有3 430个油体蛋白的表达量发生了显著变化。油体差异蛋白的富集分析发现,具有催化活性这一分子功能的差异蛋白主要在油脂积累初期发生富集。在桐油和桐酸积累时期,参与脂肪酸代谢和油脂贮藏的酰基辅酶A氧化酶、DGA蛋白和油质蛋白(Oleosin)表达量显著上升,表明这些蛋白在调控桐油和桐酸的积累中可能发挥着关键作用。[结论]获得油桐种仁成熟过程中动态特异的油体蛋白质组表达谱,揭示油体蛋白质组的组成、主要调控桐油合成的关键酶和结构蛋白,为进一步研究油脂的合成与油体的装配等相关机制奠定了基础。 展开更多
关键词 油桐 油体蛋白质组 iTRAQ 比较蛋白质组
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iTRAQ技术筛选急性心肌梗死动物血清早期潜在标记物的试验研究 预览
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作者 娄江杰 翁莹政 +6 位作者 曾广忠 刘小伟 金红峰 王亚利 杜常青 徐晨凯 唐礼江 《浙江医学》 CAS 2019年第4期310-313,384共5页
目的利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技术筛选急性心肌梗死(AMI)后表达的差异蛋白,寻找可早期诊断AMI的潜在血清标记物。方法32条成年比格犬分为假手术组和AMI组(采用冠状... 目的利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技术筛选急性心肌梗死(AMI)后表达的差异蛋白,寻找可早期诊断AMI的潜在血清标记物。方法32条成年比格犬分为假手术组和AMI组(采用冠状动脉注射聚乙烯微球悬浮制剂和凝血酶粉剂制作动物模型),分别收集造模前和造模后1、2、3、6h血清。利用8标iTRAQ技术分析两组血清中蛋白质的表达情况,将表达差异倍数>1.2倍(上下调)且P<0.05的蛋白视为差异蛋白,并对差异蛋白进行基因本体(Gene ontology,GO)功能注释和富集分析。结果AMI后1h出现的差异蛋白有51种,上调28种,下调23种。AMI后2h出现的差异蛋白有54种,上调28种,下调26种。AMI后3h出现的差异蛋白有43种,上调24种,下调19种。AMI后6h出现的差异蛋白有54种,上调29种,下调25种。综合分析前6h差异蛋白,查阅文献资料排除未命名蛋白和犬特有蛋白后,共发现15种差异蛋白在AMI后6h内稳定表达,上调7种,下调8种。结论利用iTRAQ技术筛选出15种与早期AMI相关蛋白,对筛选出的差异蛋白进行功能分析并查阅相关文献,其中肌球蛋白作为早期诊断AMI的新型血清标记物可能有较大潜力。 展开更多
关键词 急性心肌梗死 生物标记物 iTRAQ技术 肌球蛋白
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针刺阳明经穴调控FALS患者NAD(P)转氢酶表达的研究
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作者 李玲 黄银兰 +3 位作者 马腾 万明雨 曹丽翠 姚辉洁 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期1184-1188,共5页
目的:观察针刺阳明经穴后,家族性肌萎缩侧索硬化症(FALS)患者骨间肌中NAD(P)转氢酶的差异表达,揭示针刺阳明经穴治疗FALS的分子机制。方法:同一个家系患病组(4例)与正常组(5人),针刺穴位:双侧肩髃、曲池、合谷、伏兔、足三里、解溪,每... 目的:观察针刺阳明经穴后,家族性肌萎缩侧索硬化症(FALS)患者骨间肌中NAD(P)转氢酶的差异表达,揭示针刺阳明经穴治疗FALS的分子机制。方法:同一个家系患病组(4例)与正常组(5人),针刺穴位:双侧肩髃、曲池、合谷、伏兔、足三里、解溪,每日针刺1次,留针30min,每10min行针1次,留针期间共行针2次,10次为1个疗程,1个疗程后休息2d继续下1个疗程,共针刺3个疗程。治疗前后分别提取两组(9人)的骨间肌组织,运用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术,运用Gene Ontology(GO)分析细胞成分,生物过程功能注释对NAD(P)转氢酶分析。结果:NAD(P)转氢酶表达在患病组治疗前后有显著性差异(P<0.01),并且表达呈上调。正常组治疗前后表达无差异。两组治疗前后比较表达均无显著差异。结论:针刺阳明经穴对FALS患者效应机制可能是通过对NAD(P)转氢酶的调控影响线粒体功能,抑制细胞凋亡,起到治疗作用。 展开更多
关键词 NAD(P)转氢酶 治痿独取阳明 经穴效应 家族性肌萎缩侧索硬化症 iTRAQ
基于iTRAQ技术的不同耐热性水稻花药差异蛋白分析 预览
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作者 张桂莲 赵瑞 +1 位作者 刘逸童 唐文帮 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期671-679,共9页
为从蛋白质水平揭示耐热与热敏感水稻花药响应高温胁迫的分子机制,本研究以耐热水稻品系996和热敏感水稻品系4628为材料,采用iTRAQ技术对高温和适温条件下水稻花药进行差异蛋白质组学分析。结果表明,在996高温-996适温、4628高温-4628... 为从蛋白质水平揭示耐热与热敏感水稻花药响应高温胁迫的分子机制,本研究以耐热水稻品系996和热敏感水稻品系4628为材料,采用iTRAQ技术对高温和适温条件下水稻花药进行差异蛋白质组学分析。结果表明,在996高温-996适温、4628高温-4628适温、996高温-4628高温和996适温-4628适温4个比较组中,共筛选到957个差异表达蛋白,其中上调表达蛋白398个,覆盖率达20%以上的蛋白占鉴定总蛋白的50. 96%。GO分析显示,抽穗开花期花药差异蛋白主要集中于代谢过程和细胞过程,在细胞组成方面主要分布于胞内部分、细胞器和细胞,分子功能主要涉及催化活性、绑定等。花药差异蛋白通路分析显示,来源于bZIP和DOF家族的2个转录因子差异表达,DOF家族基因上调,b ZIP家族基因下调;18个HSPs基因中大部分表达上调;与植物激素和信号传导相关基因大部分表达下调;10个活性氧(ROS)相关基因中5个表现为上调;与次生代谢相关基因大部分下调。本研究结果为揭示水稻花药高温胁迫的应答分子调控机制提供了一定的理论基础。 展开更多
关键词 水稻 高温 花药 差异蛋白 ITRAQ
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应用iTRAQ技术对支原体肺炎患儿血清差异蛋白的定量分析 预览
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作者 彭珊璐 李凤艳 +2 位作者 李博 戴勇 王凯 《西部医学》 2019年第1期136-142,共7页
目的应用同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ)分析支原体肺炎患儿血清蛋白,筛选出差异蛋白并行其功能分析。方法采用强阳离子交换色谱分析法对8种不同同位素标记的iTRAQ和液相色谱法以及串联质谱分析支原体肺炎组(MPP组)和健康对照组... 目的应用同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ)分析支原体肺炎患儿血清蛋白,筛选出差异蛋白并行其功能分析。方法采用强阳离子交换色谱分析法对8种不同同位素标记的iTRAQ和液相色谱法以及串联质谱分析支原体肺炎组(MPP组)和健康对照组血清蛋白并通过Mascot软件分析和GO分析表达差异的蛋白。结果与对照组相比,MPP组中共鉴定出有定量信息的蛋白质66个,包括52个上调蛋白和14个下调蛋白。生物信息学分析显示差异表达的蛋白主要参与急性期反应、急性炎症反应、氧气输送、空气运输、过氧化氢分解过程、细胞氧化解毒、凝血、及细胞解毒等过程,这些表达差异的蛋白中选择6个显著表达差异作为候选蛋白,分别是上调蛋白SAA、CRP、HBB、APOM和下调蛋白APOC3、GPX3。结论本研究发现这6种蛋白在小儿支原体肺炎过程中发挥重要作用,可能作为该病潜在的临床筛查生物标志物。 展开更多
关键词 ITRAQ 支原体肺炎 差异蛋白 生物标志物
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基于iTRAQ技术的甘蔗受黑穗病菌侵染蛋白组分析 预览
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作者 宋奇琦 Pratiksha SINGH +5 位作者 Rajesh Kumar SINGH 宋修鹏 李海碧 农友业 杨丽涛 李杨瑞 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期55-69,共15页
黑穗病已成为影响甘蔗产量和含糖量的重要病害。为从蛋白质水平探讨甘蔗应答黑穗病菌的分子机制, 本实验选用抗黑穗病品种桂糖29号和感黑穗病品种崖城71-374, 处理组用浸渍法接种黑穗病菌, 对照组用无菌水模拟接菌, 在接种180 d 后采取... 黑穗病已成为影响甘蔗产量和含糖量的重要病害。为从蛋白质水平探讨甘蔗应答黑穗病菌的分子机制, 本实验选用抗黑穗病品种桂糖29号和感黑穗病品种崖城71-374, 处理组用浸渍法接种黑穗病菌, 对照组用无菌水模拟接菌, 在接种180 d 后采取甘蔗叶片, 使用iTRAQ技术对蛋白质组进行研究。结果显示, 桂糖29号中有定量信息蛋白1429个, 差异表达蛋白290个, 其中上调表达蛋白153个, 下调表达蛋白137个; 崖城71-374中有定量信息蛋白1576个, 差异表达蛋白125个, 其中上调表达蛋白55个, 下调表达蛋白70 个。抗病品种桂糖29 号中差异表达蛋白数多于感病品种崖城71-374, 且桂糖29号在KEGG 富集到的代谢通路也更多, 可能被侵染后抗病品种的免疫调节机制更为复杂, 涉及的调控通路网更广。经对光合作用、抗氧化系统、钙信号、苯丙烷类代谢、激素相关差异表达蛋白及共有差异表达蛋白分析, 发现光合作用通路、ROS、ABA、钙信号通路相关蛋白在2个品种中多为上调表达, 且桂糖29号的上调表达蛋白数多于崖城71-374, 可能参与甘蔗后期对黑穗病的应答。植物抗病是一个复杂的过程, 需要多种功能与途径参与调控。在本实验中没有发现苯丙烷类代谢途径及一些酶(谷胱甘肽过氧化物酶、抗坏血酸过氧化物酶、超氧化物歧化酶、谷胱甘肽硫转移酶、过氧化氢酶)、激素(生长素、乙烯、赤霉素)参与甘蔗的抗病过程, 可能与采样时间有关。 展开更多
关键词 甘蔗 黑穗病 ITRAQ 蛋白质组
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基于iTRAQ技术探讨水蛭干预IgA肾病大鼠模型蛋白质组学研究 预览
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作者 谢永祥 史伟 +2 位作者 龙春莉 蓝芳 谢丽萍 《临床肾脏病杂志》 2019年第3期202-207,共6页
目的 运用iTRAQ结合质谱技术检测IgA肾病(IgAN)大鼠模型尿液蛋白指纹图谱,筛选差异表达蛋白,研究水蛭治疗血瘀证IgAN的作用机制。方法 选用6周龄的Wistar雄性大鼠140只,运用脂多糖牛血清白蛋白+脂多糖+四氯化碳方法建立实验性IgAN模型,... 目的 运用iTRAQ结合质谱技术检测IgA肾病(IgAN)大鼠模型尿液蛋白指纹图谱,筛选差异表达蛋白,研究水蛭治疗血瘀证IgAN的作用机制。方法 选用6周龄的Wistar雄性大鼠140只,运用脂多糖牛血清白蛋白+脂多糖+四氯化碳方法建立实验性IgAN模型,造模成功后,随机分为模型对照组(不给予干预)、生理盐水对照组(给予生理盐水2mL/100g灌胃)、水蛭高剂量治疗组(给予泼泥松5.5mg·kg-1·d-1+水蛭1.2g·kg-1·d-1灌胃。每日一次)、水蛭中剂量治疗组(给予泼泥松5.5mg·kg-1·d-1+水蛭0.6g·kg-1·d-1灌胃。每日一次)、水蛭低剂量治疗组(给予泼泥松5.5mg·kg-1·d-1+水蛭0.3g·kg-1·d-1灌胃。每日一次)、泼尼松治疗对照组(给予泼尼松5.5mg·kg-1·d-1),另设立空白对照组,每组20只。收集各组大鼠尿液样本,经过SDS-PAGE电泳后,进行iTRAQ标记,采用离线二维液相色谱分离与点靶以及质谱分析,运用数据库检索对各组样本进行相对定量分析,并利用生物信息学软件进行信息学分析。结果 以P值<0.05且蛋白丰度差异<0.83或蛋白丰度差异>1.2为差异蛋白筛选标准,共筛选出的16个差异蛋白,其中模型对照组和空白对照组相比上调、水蛭治疗后下调的蛋白有6个,模型对照组和空白对照组相比下调、水蛭治疗后上调的蛋白有10个。采用KEGG富集分析筛选出和IgAN发生、发展密切相关的有10条分子信号通路,主要通路为补体和凝血级联途径。结论 应用iTRAQ技术筛选出水蛭治疗后IgAN大鼠模型尿液标本中差异表达蛋白及与IgAN发生、发展密切相关的信号通路,为深入研究IgAN血瘀证的发生机制及水蛭治疗IgAN的作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 IGA肾病 水蛭 血瘀证 蛋白质组学 ITRAQ
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基于定量蛋白质组学的NT-89抗白念珠菌作用机制研究 预览
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作者 刘昱 阎澜 姜远英 《中国真菌学杂志》 CSCD 2019年第2期70-77,共8页
目的利用定量蛋白质组学iTRAQ技术,分析抗真菌化合物NT-89作用后白念珠菌蛋白质组的含量变化。方法提取NT-89作用前后的白念珠菌总蛋白与细胞壁蛋白,利用iTRAQ技术检测蛋白提取物中蛋白质的相对丰度,寻找药物作用前后的差异蛋白,并利用G... 目的利用定量蛋白质组学iTRAQ技术,分析抗真菌化合物NT-89作用后白念珠菌蛋白质组的含量变化。方法提取NT-89作用前后的白念珠菌总蛋白与细胞壁蛋白,利用iTRAQ技术检测蛋白提取物中蛋白质的相对丰度,寻找药物作用前后的差异蛋白,并利用GO数据库注释蛋白质功能分类。结果总蛋白(TP)提取物中检测出295种差异蛋白,其中的Ywp1p、Pga10p在总蛋白中含量下调最为显著。细胞壁蛋白(CWP)提取物中有6种GPI锚定蛋白含量显著降低。结论NT-89影响了白念珠菌细胞壁的结构完整与功能,iTRAQ技术能够为药物的作用机制研究提供有效参考信息。 展开更多
关键词 NT-89 白念珠菌 细胞壁 氟化氢吡啶 GPI锚定蛋白 ITRAQ
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笃斯越橘响应低温和短光周期的蛋白质组分析
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作者 乌凤章 王贺新 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期265-279,共15页
以3年生笃斯越橘苗为材料,将苗木分别置于对照(23℃,日照长度14 h),低温短日照(4℃,日照长度10 h)和低温长日照(4℃,日照长度14 h)的人工气候室中。处理21 d后,采用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)蛋白质组学技术测定枝条蛋白质表达变... 以3年生笃斯越橘苗为材料,将苗木分别置于对照(23℃,日照长度14 h),低温短日照(4℃,日照长度10 h)和低温长日照(4℃,日照长度14 h)的人工气候室中。处理21 d后,采用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)蛋白质组学技术测定枝条蛋白质表达变化情况。结果显示:通过质谱鉴定出5 972个蛋白质,600个差异表达蛋白,其中在低温短日照与对照比对组中,丰度显著上调蛋白有140个,丰度显著下调蛋白有114个;在低温长日照与对照比对组中,丰度显著上调蛋白有255个,丰度显著下调蛋白有122个;在低温短日照与低温长日照比对组中,丰度显著上调蛋白有39个,丰度显著下调蛋白有187个。这些蛋白主要参与(1)RNA代谢,(2)蛋白质翻译后修饰,(3)碳水化合物转运和代谢,(4)能量代谢和转换,(5)脂质代谢,(6)次生代谢产物合成,(7)抗氧化与胁迫防御,(8)光合作用,(9)无机离子转运和代谢。结果表明与抗冻性有关的蛋白差异表达主要受低温诱导,少数蛋白表达受低温和光周期共同影响,低温短光周期更有利于抗冻性形成。低温锻炼可显著提高RNA代谢、蛋白质翻译后修饰、抗氧化和防御反应、次生代谢产物合成以及脂质代谢过程中许多蛋白质的丰度,提示这些代谢途径和相关蛋白可能在笃斯越橘抗冻机制中起重要作用。 展开更多
关键词 笃斯越橘 低温锻炼 蛋白质组 光周期 ITRAQ 抗冻性
嗜水气单胞菌感染青鱼肝脏的蛋白质组学分析 预览
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作者 刘问 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期330-339,共10页
采用同重同位素标记相对与绝对定量(iTRAQ)结合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术,分析嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染青鱼(Mylopharyngodon piceus)后青鱼肝脏组织的差异表达蛋白。以致病性嗜水气单胞菌菌株BCK0712注射感染健... 采用同重同位素标记相对与绝对定量(iTRAQ)结合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术,分析嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染青鱼(Mylopharyngodon piceus)后青鱼肝脏组织的差异表达蛋白。以致病性嗜水气单胞菌菌株BCK0712注射感染健康青鱼,24h后采集感染组和对照组青鱼肝脏,开展蛋白质组学分析。通过数据库检索,共鉴定到4475个肝脏组织蛋白,从中筛选到188个差异表达蛋白,其中表达上调的蛋白70个,表达下调的蛋白118个。经生物信息学分析,表明这些差异表达蛋白主要参与了补体和凝血级联反应、剪接体、细胞内吞作用、氧化磷酸化、碳代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、色氨酸代谢等通路。组织病理分析表明,青鱼感染嗜水气单胞菌后肝脏出现了明显的病理变化,主要表现为肝细胞边界不分明、细胞核固缩、肝板排列紊乱、有出血现象等。研究结果为进一步深入探究嗜水气单胞菌的致病机制提供了理论基础。 展开更多
关键词 青鱼 嗜水气单胞菌 肝脏 ITRAQ
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红球菌跨膜运输荧蒽的差异膜蛋白分析 预览
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作者 孔德康 李艺 +2 位作者 王红旗 许洁 关晶晶 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期274-280,共7页
提取不同时间荧蒽诱导下红球菌BAP-1分泌的膜蛋白,利用同位素标记相对和绝对定量技术(iTRAQ技术)结合液相二级质谱对差异膜蛋白进行聚类以及生物信息学分析.旨在从蛋白质层面上研究红球菌BAP-1跨膜运输荧蒽过程中起关键作用的膜蛋白种... 提取不同时间荧蒽诱导下红球菌BAP-1分泌的膜蛋白,利用同位素标记相对和绝对定量技术(iTRAQ技术)结合液相二级质谱对差异膜蛋白进行聚类以及生物信息学分析.旨在从蛋白质层面上研究红球菌BAP-1跨膜运输荧蒽过程中起关键作用的膜蛋白种类及其作用机制.结果共鉴定到172个差异膜蛋白.通过差异膜蛋白的COG和GO功能分析,发现荧蒽的加入主要影响了红球菌BAP-1细胞膜上与能量、转运相关的膜蛋白.ABC转运蛋白和TonB依赖转运蛋白作为微生物主要的载体蛋白对BAP-1跨膜运输荧蒽起到了重要作用.过氧化氢酶和超氧化物歧化酶在第6d有一个显著上调,作为抗氧化防御机制来保护微生物.各种膜蛋白在不同阶段发挥着各自作用,这些蛋白共同组成蛋白互作网络调控红球菌BAP-1的跨膜运输过程. 展开更多
关键词 红球菌BAP-1 荧蒽 膜蛋白 跨膜运输 ITRAQ
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脂肪酸合成酶与信号传导及转录激活因子3相互作用促进肝癌细胞的迁移和侵袭
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作者 黄娟 邹小芹 +5 位作者 佘莎 舒凤 拓焕 任红 胡怀东 杨轶轩 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期681-686,共6页
目的肝细胞癌(HCC)是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一。转移是肝癌患者恶化的标志和死亡的主要原因。为了制定有效的治疗策略,迫切需要研究肝癌转移的分子基础。方法免疫组织化学检测脂肪酸合成酶(FASN)在肝癌中的表达。划痕试验和细胞... 目的肝细胞癌(HCC)是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一。转移是肝癌患者恶化的标志和死亡的主要原因。为了制定有效的治疗策略,迫切需要研究肝癌转移的分子基础。方法免疫组织化学检测脂肪酸合成酶(FASN)在肝癌中的表达。划痕试验和细胞侵袭试验验证FASN在肝癌迁移和侵袭中的作用。采用ITRAQ(同位素标记的相对与绝对定量)鉴定与FASN相互作用的蛋白质。免疫共沉淀(Co-IP)和细胞免疫荧光分析用于评估FASN和信号传导及转录激活因子3(STAT3)之间的相互作用。采用蛋白质印迹法检测FASN敲低后STAT3、P-STAT3、基质金属蛋白酶(MMP)-2和MMP-9的表达。采用t检验进行统计学分析。结果免疫组织化学检测结果显示FASN在肝癌组织中的表达高于癌旁组织。ITRAQ、Co-IP和免疫荧光分析发现FASN与STAT3存在相互作用。蛋白质印迹法检测结果表明FASN敲低后,P-STAT3、MMP-2和MMP-9的表达降低。结论FASN可能通过与STAT3相互作用和影响MMP-2/MMP-9的表达从而促进肝癌的转移。 展开更多
关键词 肝细胞 脂肪酸合成酶 信号传导及转录激活因子3 ITRAQ 转移
斑马鱼早期胚胎发育囊胚sphere时期的蛋白组学研究 预览
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作者 陈漪 胡瑞芹 +1 位作者 冉皓宇 陈良标 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2019年第1期53-64,共12页
斑马鱼(Danio rerio)早期胚胎发育囊胚时期是胚胎发育过程的关键时期,利用iTRAQ蛋白质质谱分析技术,检测斑马鱼早期胚胎发育过程中囊胚sphere时期的蛋白质表达情况,并分析该时期表达的蛋白质的相应功能和参与调控的生物过程。以野生型... 斑马鱼(Danio rerio)早期胚胎发育囊胚时期是胚胎发育过程的关键时期,利用iTRAQ蛋白质质谱分析技术,检测斑马鱼早期胚胎发育过程中囊胚sphere时期的蛋白质表达情况,并分析该时期表达的蛋白质的相应功能和参与调控的生物过程。以野生型斑马鱼发育至sphere时期即4 hpf的胚胎为样本,利用iTRAQ标记与LC-MS/MS串联质谱技术,结合数据库比对,对该时期表达的蛋白质进行定性和定量的鉴定分析。检测结果共鉴定到的总蛋白数为1 178个,利用生物信息学进行功能分析,发现这些蛋白广泛参与了细胞信号传递、细胞运动和细胞骨架构建、细胞增殖、细胞分化、物质合成与代谢等各项重要的生命活动过程。研究表明,利用iTRAQ标记的方法可以对4hpf时期的斑马鱼胚胎中的蛋白质进行有效的分离和鉴定,并初步建立了斑马鱼早期发育关键阶段sphere时期的蛋白质组表达图谱,以期为斑马鱼胚胎发育过程中蛋白质组学和调控机制的研究提供参考。 展开更多
关键词 斑马鱼 早期胚胎发育 蛋白质组 ITRAQ
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光合作用信号途径调控陆地棉矮化的机理研究 预览
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作者 屠小菊 汪启明 +3 位作者 谢陈灵 李咏宇 李瑞莲 刘爱玉 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2019年第3期201-209,共9页
【目的】了解光合作用信号途径基因调控陆地棉矮化的机理。【方法】以现蕾期陆地棉矮化突变体LA-1及其近等基因系LH-1茎尖为材料,通过同位素标记相对和绝对定量(Isobaric tags for relative and absolute quantitation, i TRAQ)结合液... 【目的】了解光合作用信号途径基因调控陆地棉矮化的机理。【方法】以现蕾期陆地棉矮化突变体LA-1及其近等基因系LH-1茎尖为材料,通过同位素标记相对和绝对定量(Isobaric tags for relative and absolute quantitation, i TRAQ)结合液相质谱串联(LC-MS/MS)的定量蛋白质组学技术及定量反转录-聚合酶链式反应(Quantitative reverse-polymerase chain reaction, qRT-PCR)技术,分析两种材料中蛋白水平及m RNA水平基因表达情况,并通过生理生化方法检测两种材料光合能力差异。【结果】光合作用信号途径差异表达蛋白PsbO、PsaE、PsaH、PetF-1、PetF-2在LA-1中表达量下调,PetC和delta表达量上调。m RNA水平,除delta基因在两种材料中表达量无显著差别外,其它基因与蛋白水平具有同样的表达趋势。现蕾后,LA-1的净光合速率(Pn)、气孔导度(Cond)显著小于LH-1,蒸腾速率(Tr)极显著小于LH-1,而胞间CO2浓度(Ci)无显著差异。与LH-1相比,LA-1的实际光化学效率(YⅡ)、光系统Ⅱ(PS Ⅱ)的潜在活性(Fv/F0)显著减少,叶绿素荧光非光化学猝灭(NPQ)显著增大。【结论】陆地棉矮化突变体LA-1的矮化与光合作用信号途径存在相关性,为进一步研究LA-1矮化的分子机理及棉花的矮化育种提供基础。 展开更多
关键词 陆地棉 矮化 光合作用 ITRAQ 差异表达蛋白
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大黄蒽醌联合荔枝核黄酮干预SIV/CEMx174细胞的蛋白组学研究
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作者 张夏 罗伟生 +4 位作者 张扬武 王仕衍 禤传凤 康毅 陈姗 《辽宁中医杂志》 CAS 2019年第1期111-115,I0003-I0004共6页
目的:观察大黄蒽醌联合荔枝核黄酮类化合物体外抗猴艾滋病病毒(SIV)与模型组差异蛋白质的表达。方法:建立艾滋病病毒模型,利用大黄及荔枝核提取大黄蒽醌及荔枝核黄酮类化合物共同作用于猴CEMx174细胞48h后,提取两组细胞的总蛋白,利用iT... 目的:观察大黄蒽醌联合荔枝核黄酮类化合物体外抗猴艾滋病病毒(SIV)与模型组差异蛋白质的表达。方法:建立艾滋病病毒模型,利用大黄及荔枝核提取大黄蒽醌及荔枝核黄酮类化合物共同作用于猴CEMx174细胞48h后,提取两组细胞的总蛋白,利用iTRAQ技术筛选出表达的差异蛋白,并且利用GO数据库对差异蛋白进行富集度分析和注释以及对KEGG数据库进行信号转导通路的分析。结果:大黄蒽醌联合荔枝核黄酮组鉴定出116个特异蛋白,模型组鉴定出121个特异蛋白,两组的差异蛋白20个,其中5个蛋白表达上调,15个蛋白表达下调。GO数据库分析显示差异蛋白主要参与了蛋白、RNA、DNA等结合的分子功能,主要参与了免疫反应、信号转导、病毒感染、细胞凋亡的生物过程,细胞组件主要存在于细胞质、细胞膜、细胞核、胞外体上。KEGG分析显示差异蛋白主要参与了癌症通路、病毒致癌作用、肺结核、EB病毒感染、梅毒感染、补体途径、炎症介质的调节、调控细胞自噬通路等相关信号通路。结论:iTRAQ技术能够快速地筛选出差异蛋白,结合GO、KEGG分析能够以整体观阐释大黄蒽醌类联合荔枝核黄酮类化合物体外抗SIV的作用机制。 展开更多
关键词 大黄蒽醌类 荔枝核黄酮类化合物 蛋白质组学 ITRAQ SIV
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