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四川盆周山地重楼属植物药用资源的筛选及评价
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作者 刘琴 樊小莉 +3 位作者 杨莉 徐智斌 冯波 王涛 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期526-534,共9页
目的挖掘具有药用价值的优异重楼属植物资源,缓解药用重楼资源压力,为促进重楼的可持续利用提供材料基础。方法在四川盆周山地采集21份重楼资源,根据表型筛选出大块茎资源GQ与MH,多芽资源GK。初步形态鉴定后,利用DNA条形码ITS、psbA-trn... 目的挖掘具有药用价值的优异重楼属植物资源,缓解药用重楼资源压力,为促进重楼的可持续利用提供材料基础。方法在四川盆周山地采集21份重楼资源,根据表型筛选出大块茎资源GQ与MH,多芽资源GK。初步形态鉴定后,利用DNA条形码ITS、psbA-trnH序列,采用Kimura双参数模型构建ML系统聚类树,进行系统发育分析。采用HPLC法检测其主要活性成分皂苷的含量,以预测其潜在药用价值。结果形态学结合分子鉴定结果表明,GQ、GK和MH分别依次为华重楼、滇重楼和长柱重楼。GQ、GK、MH和对照滇重楼(CK)的重楼皂苷Ⅰ、Ⅱ、Ⅵ、Ⅶ的含量及其比例表现各异,其中总含量表现为GQ>MH>CK>GK,重楼皂苷Ⅰ在GQ和MH中占比较高,分别较CK高出67.61%和73.25%,而重楼皂苷Ⅶ在GK中占比最高,表现为56.38%。结论 GQ、GK和MH分别为产于四川盆周山地特定居群的华重楼、滇重楼和长柱重楼,引种至成都平原后性状表现优良,为后续的重楼的育种研究提供了材料基础;同时3个资源均具药用潜力,其中长柱重楼MH居群资源的重楼皂苷Ⅰ及重楼皂苷总含量较高,为滇重楼、华重楼替代药材的筛选提供了新选择。 展开更多
关键词 重楼资源 华重楼 滇重楼 长柱重楼 ITS PSBA-TRNH 重楼皂苷Ⅰ 重楼皂苷Ⅱ 重楼皂苷Ⅵ 重楼皂苷Ⅶ
培养基或水凝胶球添加胰岛素铁硒转运蛋白对软骨细胞去分化的影响
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作者 刘鑫成 孟星星 +1 位作者 张煜珅 范宏斌 《中国骨与关节损伤杂志》 2019年第4期361-364,共4页
目的在负载软骨细胞的海藻酸钠水凝胶球和/或含血清的培养液中添加胰岛素铁硒转运蛋白(ITS)成分,观察其对软骨细胞去分化的影响。方法用Ⅱ型胶原酶消化法获取2周龄SD大鼠膝关节原代软骨细胞,体外培养传代至P2。实验组分为4组:(1)复合细... 目的在负载软骨细胞的海藻酸钠水凝胶球和/或含血清的培养液中添加胰岛素铁硒转运蛋白(ITS)成分,观察其对软骨细胞去分化的影响。方法用Ⅱ型胶原酶消化法获取2周龄SD大鼠膝关节原代软骨细胞,体外培养传代至P2。实验组分为4组:(1)复合细胞的2%海藻酸钠水凝胶球在常规培养液中进行3D培养,即M-B-组(M:medium,常规培养液;B:Beads,水凝胶球;+和-分别指含与不含ITS成分);(2)复合细胞的2%海藻酸钠水凝胶球在含1%ITS的培养液进行3D培养,即M+B-组;(3)复合细胞的2%海藻酸钠+1%ITS的水凝胶球在常规培养液中进行3D培养,即M-B+组;(4)复合细胞的2%海藻酸钠+1%ITS的水凝胶球在含1%ITS的培养液中进行3D培养,即M+B+组。培养14d后,各组取水凝胶球进行光镜下直接观察;活死细胞染色观察细胞存活状态;CCK-8试剂检测细胞活力;包埋切片,采用HE染色观察细胞形态;采用实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测软骨细胞Ⅱ型胶原(ColⅡ)和Sox9基因的表达情况。结果活死细胞染色的实验结果显示,4组水凝胶球负载的软骨细胞均具有良好的生长状态,只在镜下见到少量死亡细胞;CCK-8实验结果显示培养液中添加ITS比海藻酸钠水凝胶球内增加ITS更能促进软骨细胞增殖;qRT-PCR结果显示,无论在培养液还是水凝胶球内添加ITS,软骨细胞ColⅡ和Sox9的表达均无显著差异。结论ITS可以提高海藻酸钠水凝胶球3D培养的软骨细胞的增殖能力,且在培养液中添加ITS对此表现更为显著;但在3D培养体系中,ITS尚不能在特异性软骨细胞相关基因表达上表现出强有力的抑制去分化作用。 展开更多
关键词 软骨细胞 海藻酸钠 水凝胶 3D培养 胰岛素铁硒传递蛋白 ITS 组织工程
一株野生香蘑属真菌的鉴定及其生物学性质 预览
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作者 王红艳 孔维祎 +3 位作者 王竹青 孟德龙 丁强 王鸿磊 《贵州农业科学》 CAS 2019年第6期55-58,共4页
为明确野外采集到的一株香蘑属真菌的分类学地位,并为野生香蘑属真菌的人工驯化提供数据支持,利用ITS和28S rDNA的D1D2区序列测定对其进行分子生物学鉴定,研究其生物学性质。结果表明:采集的香蘑属真菌为花脸香蘑(Lepista sordida),其... 为明确野外采集到的一株香蘑属真菌的分类学地位,并为野生香蘑属真菌的人工驯化提供数据支持,利用ITS和28S rDNA的D1D2区序列测定对其进行分子生物学鉴定,研究其生物学性质。结果表明:采集的香蘑属真菌为花脸香蘑(Lepista sordida),其菌落淡紫色,菌丝多分支,直径(3.5±1.5)μm,具锁状联合,菌丝常缠绕成菌丝束和菌丝球,其最佳生长温度为25℃,最佳pH8.0,最佳碳源、氮源、无机盐分别为糖蜜、土豆浸粉和FeSO4。 展开更多
关键词 花脸香蘑 ITS 28SrDNA 鉴定 生物学性质
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西藏地区红景天属植物ITS,rbcL,trnS-G序列多态性分析
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作者 张力鹏 滕彦娇 +1 位作者 宋文芹 陈成彬 《南开大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期93-101,共9页
以西藏红景天为研究材料,利用DNA条形码(核糖体内转录间隔区ITS以及两对叶绿体DNA序列rbcL和trnS-G),对所收集的44个样品进行克隆与测序,并结合NCBI中已报道的22种红景天ITS,rbcL,trnS-G序列进行分析.利用Mega5.0软件基于DNA条形码序列... 以西藏红景天为研究材料,利用DNA条形码(核糖体内转录间隔区ITS以及两对叶绿体DNA序列rbcL和trnS-G),对所收集的44个样品进行克隆与测序,并结合NCBI中已报道的22种红景天ITS,rbcL,trnS-G序列进行分析.利用Mega5.0软件基于DNA条形码序列分析上述样本的遗传距离结果显示,ITS和trnS-G序列在红景天属植物种间的差异明显,rbcL序列的差异较小.所构建的N-J进化树结果显示ITS对红景天物种的识别能力优于rbcL和trnS-G,但任何单一的DNA条形码均无法成功辨识全部的红景天属植物.其中ITS序列可以清晰的分辨出大花红景天与圣地红景天,并且不同地理居群间的样本差异较小,rbcL+trnS-G组合DNA条形码可以清晰分辨出长鞭红景天.本研究对西藏红景天属植物进行了遗传多样性分析,为其开发与利用提供指导. 展开更多
关键词 红景天 ITS RBCL trnS-G 多态性
中国新记录Xylogone ganodermophthora的分离及鉴定
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作者 刘昆 郑巧平 +1 位作者 蒋俊 吴志鹏 《菌物研究》 CAS 2019年第2期74-78,共5页
在研究椴木灵芝连作障碍问题中,采用单菌丝分离技术获得1子囊菌纯培养物,菌株编号为WS058。经形态观察与分子鉴定,确定其为木生红曲霉属Xylogone中的灵芝腐败木生红曲霉菌Xylogone ganodermophthora。此属种均为中国新记录。文中对其进... 在研究椴木灵芝连作障碍问题中,采用单菌丝分离技术获得1子囊菌纯培养物,菌株编号为WS058。经形态观察与分子鉴定,确定其为木生红曲霉属Xylogone中的灵芝腐败木生红曲霉菌Xylogone ganodermophthora。此属种均为中国新记录。文中对其进行了详细描述,并提供了显微结构图版。 展开更多
关键词 灵芝腐败木生红曲霉 新记录属 形态学 ITS
辽宁地区野生和栽培羊肚菌ITS序列及ISSR多态性分析
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作者 曹君 王红 +2 位作者 张敏 刘俊杰 吕立涛 《中国食用菌》 北大核心 2019年第2期37-41,共5页
针对采集到的15株栽培羊肚菌样品和14株野生羊肚菌样品进行ITS序列分析和ISSR多态性分析,通过构建系统发育树和遗传聚类分析图谱,发现辽宁地区主栽品种为黑色系的六妹羊肚菌(Morchella sextelata,Mel-6)和梯棱羊肚菌(Morchella importun... 针对采集到的15株栽培羊肚菌样品和14株野生羊肚菌样品进行ITS序列分析和ISSR多态性分析,通过构建系统发育树和遗传聚类分析图谱,发现辽宁地区主栽品种为黑色系的六妹羊肚菌(Morchella sextelata,Mel-6)和梯棱羊肚菌(Morchella importuna,Mel-10),同时还有少量的七妹羊肚菌(Morchella septimelata,Mel-7);野生羊肚菌样品属于黄色系的Morchella sp.(Mes-6)和Morchella sp.(Mes-9)。结果表明辽宁地区羊肚菌栽培品种与野生羊肚菌品种具有明显的遗传差异性,为实现本地野生羊肚菌资源的合理利用和人工栽培研究提供参考。 展开更多
关键词 羊肚菌 ITS ISSR 系统发育
不同产地玄参内生真菌种群结构的比较分析
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作者 沈湛云 朱波 +2 位作者 张泉龙 张巧艳 秦路平 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期957-962,共6页
目的研究不同产地玄参内生真菌的种群结构差异。方法通过形态和分子手段相结合的方式对来自浙江磐安、陕西安康、湖北武穴、湖南邵东、四川达州和安徽亳州共6个产地的玄参进行内生真菌的分离、鉴定及种群结构分析。结果共分离得到3 052... 目的研究不同产地玄参内生真菌的种群结构差异。方法通过形态和分子手段相结合的方式对来自浙江磐安、陕西安康、湖北武穴、湖南邵东、四川达州和安徽亳州共6个产地的玄参进行内生真菌的分离、鉴定及种群结构分析。结果共分离得到3 052株内生真菌划分为153个形态型,经分子系统学分析,共划分为84个分类单元,分属于25个属,其中间座壳属、镰刀菌属、黑孢属、链格孢属、茎点霉属、棒孢属、附球菌属、枝孢属为6个产地内生真菌共有属,各产地的优势属不同。相似性分析表明,不同产地玄参内生真菌的组成结构上存在差异。Shannon-wiener多样性指数及Simpson指数分析表明浙江磐安产地玄参内生真菌多样性较高,四川达州产地的多样性稍低。结论系统研究玄参内生真菌的多样性与群落结构,阐明内生真菌在植物组织中的分布规律,可为玄参内生真菌的开发利用提供基础资料和科学依据。 展开更多
关键词 玄参 产地 内生真菌 ITS 多样性
野生毛尖蘑菌株分子鉴定及碳源与氮源筛选试验
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作者 杜萍 曹天旭 崔宝凯 《中国食用菌》 北大核心 2019年第9期16-20,共5页
毛尖蘑是生长在金矿开采后的沙滩上的一种野生珍稀食(药)用真菌.对野生毛尖蘑进行形态和分子鉴定的基础上进行了碳源、氮源筛选试验.结果 表明,由新鲜子实体分离得到的纯菌株经ITS序列鉴定为褐离褶伞(Lyophyllum fumosum);菌丝生长适宜... 毛尖蘑是生长在金矿开采后的沙滩上的一种野生珍稀食(药)用真菌.对野生毛尖蘑进行形态和分子鉴定的基础上进行了碳源、氮源筛选试验.结果 表明,由新鲜子实体分离得到的纯菌株经ITS序列鉴定为褐离褶伞(Lyophyllum fumosum);菌丝生长适宜的碳源为可溶性淀粉和麦芽糖;适宜氮源为蛋白胨、硫酸铵和酵母膏.研究结果为毛尖蘑的人工驯化栽培及其药用价值的开发奠定了基础. 展开更多
关键词 褐离褶伞 菌种分离 转录间隔区(ITS) 碳源 氮源
我国南北区域城市污水处理系统内真菌群落的差异
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作者 秦文韬 张冰 +2 位作者 孙晨翔 陈湛 文湘华 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1876-1885,共10页
【背景】微生物是污水处理系统内污染物去除的主体,真菌作为其中不可或缺的一部分,在去除有毒化合物、提高生物转化等方面发挥着重要作用,应引起人们的关注。【目的】明确我国南北区域城市污水处理系统内真菌群落的多样性、组成差异及... 【背景】微生物是污水处理系统内污染物去除的主体,真菌作为其中不可或缺的一部分,在去除有毒化合物、提高生物转化等方面发挥着重要作用,应引起人们的关注。【目的】明确我国南北区域城市污水处理系统内真菌群落的多样性、组成差异及其影响因素。【方法】采集我国北方23个污水处理厂的90份活性污泥样品和南方37个污水处理厂的121份活性污泥样品,提取上述样本的总DNA,并应用Illumina MiSeq平台进行ITS高通量测序,结合多种数量生态学分析方法对数据进行分析。【结果】我国南北区域城市污水处理系统内真菌群落结构存在显著差异,真菌群落多样性南方显著高于北方;我国南北区域真菌群落的组成差异显著,南方群落以Sordariomycetes和Glomeromycetes为优势菌纲,以Ophiocordycep和Alternaria为优势菌属,北方群落以Tremellomycetes和Saccharomycetes为优势菌纲,以Trichosporon和Saccharomyces为优势菌属,其中Tremellomycetes和Sordariomycetes是常见的病原菌,对下游生物或者人类的健康具有潜在威胁,Trichosporon属的丝状真菌若大量异常增殖会引发污泥膨胀现象,影响系统的稳定运行;地理纬度、年平均气温、进水NH4+浓度、进水总氮浓度是导致我国南北区域真菌群落存在差异的重要影响因子。【结论】我国南北区域真菌群落多样性、组成存在显著差异,地理因素、所在城市的气候因素和进水污染物浓度对真菌群落结构影响显著。针对南北区域,应合理调控相应区域内的重要功能菌群,以调控污水处理厂的高效稳定运行,同时密切关注其中的条件致病菌和易引发污泥膨胀的菌群,建立面向种群的优化控制系统以管控风险。 展开更多
关键词 真菌群落 组成 高通量测序 ITS 影响因素
基于DNA条形码的桑黄真菌分子鉴定 预览
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作者 徐鑫 边勇 +5 位作者 陈哲 孙悦 刘子璐 胡渤洋 武扬 张国庆 《北京农学院学报》 2019年第1期20-27,共8页
DNA条形码(DNA barcoding)技术是一种利用生物基因组内短遗传标签进行分类鉴定的方法.桑黄自古以来是一种名贵中药材,而市售桑黄主要依托简单的形态鉴定造成混淆众多.近年来大量研究表明,桑黄类真菌种类至少有7个种,并且其药效也不尽相... DNA条形码(DNA barcoding)技术是一种利用生物基因组内短遗传标签进行分类鉴定的方法.桑黄自古以来是一种名贵中药材,而市售桑黄主要依托简单的形态鉴定造成混淆众多.近年来大量研究表明,桑黄类真菌种类至少有7个种,并且其药效也不尽相同.【目的】为更准确、高效对桑黄类真菌进行鉴定,本研究以采集自西藏、吉林和浙江的3种桑黄子实体为材料,筛选最佳DNA条形码与相应PCR条件.【方法】利用组织分离获得3种桑黄纯培养菌株,分别编号为1713、1714和HS菌株.利用ITS、NL、rpb1、rpb2和ef1-α等7组DNA条形码分别对3种桑黄进行PCR扩增、测序、比对和发育树分析,并结合形态学特征,确定其最适DNA条形码和分类学地位.【结果】结果表明,ITS和NL条形码对3种桑黄均能够获得单一目的条带;rpb1Y、rpb2B和rpb2Y条形码特异性低,扩增后获得多个条带;而rpb1B和ef1-α条形码均无法获得条带.通过多序列比对,结合形态分析,确定1713菌株为桑黄纤孔菌(Inonotus sanghuang),而1714和HS菌株均为鲍姆纤孔菌(Inonotus baumii).【结论】本研究确定ITS和NL为桑黄分子鉴定的最佳DNA条形码,其PCR最适退火温度范围分别为58~59℃和49~50℃,为桑黄真菌快速鉴定提供参考依据. 展开更多
关键词 桑黄 分子鉴定 DNA条形码 NL ITS
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雪胆属植物DNA条形码的鉴定分析 被引量:1
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作者 张仲豪 杨程 +4 位作者 童珊珊 邓家彬 高刚 张利 杨瑞武 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期2899-2905,共7页
雪胆属(Hemsleya)植物属葫芦科(Cucurbitaceae)翅子瓜亚科(Zanonioudeae),主要分布于中国西南地区,该属多种植物的块茎具有良好的抗肿瘤,抗炎、抗菌、抗病毒等多种功效,是西南地区各民族常用的传统中药。本实验从常用的DNA条形码中筛选... 雪胆属(Hemsleya)植物属葫芦科(Cucurbitaceae)翅子瓜亚科(Zanonioudeae),主要分布于中国西南地区,该属多种植物的块茎具有良好的抗肿瘤,抗炎、抗菌、抗病毒等多种功效,是西南地区各民族常用的传统中药。本实验从常用的DNA条形码中筛选出适合鉴定雪胆属植物的核心DNA条形码,扩增并测序所需的DNA序列;分析其序列的长度、碱基组成及其变异位点;用MEGA7.0计算K-2P遗传距离,评估了各个序列的'Barcoding gap';通过构建NJ树来确定单个序列及其不同组合的物种分辨率。结果表明ITS+psb A-trn H+trn L具有最大的分辨率,为75%,推荐将ITS+psb A-trn H+trn L作为雪胆属植物鉴定的核心DNA条形码。 展开更多
关键词 雪胆属 DNA条形码 ITS PSBA-TRNH 鉴定
新绛地方发酵食品酵子中酵母菌基因序列测定和分析 预览
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作者 樊林娟 唐中伟 卫雪红 《现代食品》 2019年第14期158-161,共4页
本研究以新绛酵子为材料,通过微生物学方法分离筛选出酵母菌,观察其在PDA培养基上菌落的形态特征,并对其进行美蓝染色鉴定。采用CTAB法提取酵母细胞核中的DNA,再利用ITS引物进行PCR扩增,通过凝胶电泳分析,测定该酵母菌菌株的ITS序列。... 本研究以新绛酵子为材料,通过微生物学方法分离筛选出酵母菌,观察其在PDA培养基上菌落的形态特征,并对其进行美蓝染色鉴定。采用CTAB法提取酵母细胞核中的DNA,再利用ITS引物进行PCR扩增,通过凝胶电泳分析,测定该酵母菌菌株的ITS序列。然后利用Blast与MEGA软件得出:该菌株与酿酒酵母相似度较高,相似度为99.5%,属于酿酒酵母属。本研究为今后该菌株的特性和发酵机理研究奠定了基础。 展开更多
关键词 新绛酵子 酵母菌 ITS
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贵州福泉分布桃花水母的形态特征及分子鉴定
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作者 陶莎 姚俊杰 +2 位作者 杨梅 谭华 石让安 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期362-374,共13页
2017年10月,在贵州省福泉县发现了桃花水母(Craspedacusta)。观察其形态结构,福泉的桃花水母与索氏桃花水母(C. sowerbyi)高度相似。采用PCR和DNA测序技术扩增和测定了福泉采集桃花水母的核糖体小亚基rRNA基因(18SrRNA)、核糖体RNA基因... 2017年10月,在贵州省福泉县发现了桃花水母(Craspedacusta)。观察其形态结构,福泉的桃花水母与索氏桃花水母(C. sowerbyi)高度相似。采用PCR和DNA测序技术扩增和测定了福泉采集桃花水母的核糖体小亚基rRNA基因(18SrRNA)、核糖体RNA基因内转录间隔区(ITS)及线粒体细胞色素氧化酶亚基基因(COI),并与GenBank上已有的桃花水母18S rRNA、ITS、COI基因序列进行了比对。分子鉴定结果显示,福泉的桃花水母18SrRNA、ITS、COI基因序列与索氏桃花水母相似度分别为100%、92%、99%,确定贵州省福泉市发现的桃花水母样品在种分类水平上为索氏桃花水母。并就桃花水母的某些形态学分类指标的标准、不同伞径之间的差值是否能作为桃花水母形态分类的一个新指标这些问题做了讨论。 展开更多
关键词 桃花水母 形态学 18S RRNA ITS COI
贮藏期蒜薹表面真菌群落组成分析 预览
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作者 付丽 范昆 +3 位作者 金岩 张国福 曲健禄 吴亚玉 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期83-87,133共6页
蒜薹作为一种传统常年供应的蔬菜深受喜爱,由于贮存时间长,贮存过程中会有多种真菌产生,导致蒜薹失去经济价值。本文通过提取贮藏期蒜薹表面真菌的基因组DNA,经Illumina平台对7个样本的ITS扩增子进行测序,共获得2 418 016条raw reads,51... 蒜薹作为一种传统常年供应的蔬菜深受喜爱,由于贮存时间长,贮存过程中会有多种真菌产生,导致蒜薹失去经济价值。本文通过提取贮藏期蒜薹表面真菌的基因组DNA,经Illumina平台对7个样本的ITS扩增子进行测序,共获得2 418 016条raw reads,51个OTUs。通过OTU物种注释和物种丰度聚类,优势真菌属组成为:青霉菌属 Penicillium 81.08 %,未知子囊菌15.13%,耐冷酵母 Mrakia 1.74%,小球壳属 Mycosphaerella 1.02 %。青霉菌是贮藏蒜薹后期表面的主要真菌。 展开更多
关键词 贮藏蒜薹 真菌 扩增子测序 ITS 多样性分析
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枣属ITS及psbA-trnH序列PCR反应体系的优化与验证 预览
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作者 李学营 索相敏 +2 位作者 白瑞霞 彭建营 马宝玲 《河北农业科学》 2019年第2期64-68,共5页
为了建立和优化枣属植物核rDNA的ITS及cpDNA的psbA-trnH序列PCR反应体系,采用正交试验和单因子试验方法,对影响PCR扩增体系中的DNA模板、退火温度2个重要因子进行了比较分析。结果表明:枣属50滋L反应体系中,DNA模板量为50~200ng时,不同... 为了建立和优化枣属植物核rDNA的ITS及cpDNA的psbA-trnH序列PCR反应体系,采用正交试验和单因子试验方法,对影响PCR扩增体系中的DNA模板、退火温度2个重要因子进行了比较分析。结果表明:枣属50滋L反应体系中,DNA模板量为50~200ng时,不同的DNA模板量对PCR反应体系影响不大;退火温度对PCR反应影响较为明显,最佳退火温度为52℃,扩增时psbA-trnH片段要求的退火温度较ITS序列更为严格。 展开更多
关键词 枣属 ITS PSBA-TRNH PCR
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矮丛越橘“美登”根系共生真菌的分离与鉴定
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作者 董梅 田友文 +2 位作者 董坤 李亚东 孙海悦 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期419-425,共7页
为了研究越橘菌根真菌的多样性,从吉林农业大学浆果园采集矮丛越橘(Vaccinium angustifolium)"美登"的根系,采用酸性品红乳酸甘油染色法观察菌根类型,用根段直接培养法分离根系共生真菌,利用真菌通用引物ITS1/ITS4扩增菌株的r... 为了研究越橘菌根真菌的多样性,从吉林农业大学浆果园采集矮丛越橘(Vaccinium angustifolium)"美登"的根系,采用酸性品红乳酸甘油染色法观察菌根类型,用根段直接培养法分离根系共生真菌,利用真菌通用引物ITS1/ITS4扩增菌株的r DNA ITS序列; PCR产物测序后在Gen Bank中进行BLAST比对,然后采用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析。结果表明:"美登"菌根类型包含典型的杜鹃花类菌根;试验共分离获得49株共生真菌,依据形态特征分为13个类型; ITS序列分析获得树粉孢属、镰孢属、膜盘菌属等9个属;聚类结果将其分为锤舌菌纲、粪壳菌纲和座囊菌纲3类。矮丛越橘"美登"的根系共生真菌物种丰富,优势或典型的共生真菌为杜鹃花类菌根(ERM)真菌--树粉孢属(Oidiodendron)真菌。 展开更多
关键词 越橘 共生真菌 菌根 ITS序列 多样性
筛选金线莲种质资源的通用DNA条形码序列及鉴定其混伪品
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作者 梅瑜 邱道寿 +2 位作者 肖深根 彭淼 陈栋 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第15期5163-5170,共8页
本研究对32份金线莲(Anectochilus roxburhii)种质资源的四个DNA条形码(ITS, rbcL, psbA-trnH,matK)基因进行PCR扩增及测序,从基因库下载了金线莲及其3种主要混伪品的29条序列,分析比较各序列的差异位点、信息位点、GC含量等,并进行种... 本研究对32份金线莲(Anectochilus roxburhii)种质资源的四个DNA条形码(ITS, rbcL, psbA-trnH,matK)基因进行PCR扩增及测序,从基因库下载了金线莲及其3种主要混伪品的29条序列,分析比较各序列的差异位点、信息位点、GC含量等,并进行种内和种间的遗传距离计算,构建基于K2P模型的NJ系统发育树,综合比较不同序列的鉴定能力,最终从四个DNA条形码候选序列中筛选出可用于金线莲资源鉴定的通用序列。结果显示,ITS和psbA-trnH基因序列的种内、种间的变异位点差异和遗传距离差异较大,相比rbcL和matK序列具有显著优势,且ITS基因不仅能够快速而准确区分金线莲及其混伪品,而且能够在种内水平上区分金线莲的不同品种。因此,ITS基因序列是较适合鉴别金线莲资源的理想条形码。所得结论与前人关于金线莲的有效成分的研究结果进行了关联,发现不同品系的金线莲所含有效成分差异较大。因此,本研究可以为金线莲的功能产品研发、优良品种选育、药理药效研究等方面提供帮助,尤其在金线莲资源选择上提供了较为理想的方法,研究具有一定的应用前景和科学价值。 展开更多
关键词 金线莲(Anoectochilus roxburhii) DNA条形码 分子鉴定 ITS
猕猴桃(Actinidia)在ITS位点上的遗传多样性
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作者 何婷婷 柴军红 +2 位作者 赵楠 李雪 陈瑜欣 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第15期5171-5178,共8页
猕猴桃(Actinidia)是中国重要的经济作物之一。为了明确猕猴桃各种间的亲缘关系,本研究利用ITS基因对30个不同的猕猴桃种进行序列差异性及系统发育相关分析。结果表明:(1)获得的ITS序列在618~637 bp之间,共包含179个SNP位点,其中转换位... 猕猴桃(Actinidia)是中国重要的经济作物之一。为了明确猕猴桃各种间的亲缘关系,本研究利用ITS基因对30个不同的猕猴桃种进行序列差异性及系统发育相关分析。结果表明:(1)获得的ITS序列在618~637 bp之间,共包含179个SNP位点,其中转换位点远远多于颠换位点。(2) 30个种间的遗传距离在0.000~0.127之间。其中,大籽猕猴桃和安息香猕猴桃的距离最小,为0,在系统发育树中可见二者聚为一小支。另外,柱果猕猴桃、华南猕猴桃分别与糙叶猕猴桃、条叶猕猴桃、美丽猕猴桃、蒙自猕猴桃的距离都较小,在0.003~0.008之间,系统发育树也表明,柱果猕猴桃与糙叶猕猴桃、条叶猕猴桃和美丽猕猴桃聚为一支。(3)软枣猕猴桃、黑蕊猕猴桃、对萼猕猴桃与其它种的距离较大,在0.082~0.127之间,而系统发育树也表明,软枣猕猴桃与黑蕊猕猴桃独立成支,对萼与其它种的距离也较远。由上可见,猕猴桃的系统发育关系较为复杂。ITS可较好地将属间不同的种进行区分。本研究为后续猕猴桃种间的转录组研究提供数据基础。 展开更多
关键词 猕猴桃(Actinidia) ITS 遗传多样性
利用核糖体ITS和3个线粒体基因序列研究几种常见肿腿蜂种类 预览
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作者 姜嫄 张翌楠 +3 位作者 李志强 王福海 杨忠岐 姜冬云 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2019年第1期148-160,共13页
硬皮肿腿蜂Sclerodermus spp.(Hymenoptera:Bethylidae)寄生低龄天牛幼虫和吉丁类蛀干害虫。本研究利用核糖体ITS序列和3个线粒体基因序列区分8种常见的肿腿蜂。测出8种肿腿蜂的核糖体间隔区ITS1-5.8S-ITS2序列全长2060bp。通过对ITS序... 硬皮肿腿蜂Sclerodermus spp.(Hymenoptera:Bethylidae)寄生低龄天牛幼虫和吉丁类蛀干害虫。本研究利用核糖体ITS序列和3个线粒体基因序列区分8种常见的肿腿蜂。测出8种肿腿蜂的核糖体间隔区ITS1-5.8S-ITS2序列全长2060bp。通过对ITS序列分析,根据ITS1序列1319-1333bp位置处“CTTCT”的个数,将管氏肿腿蜂、川硬皮肿腿蜂、白蜡吉丁肿腿蜂、沙蒿吉丁肿腿蜂、苹小吉丁肿腿蜂、松脊吉丁肿腿蜂、落叶松吉丁肿腿蜂,这7种肿腿蜂分成两类,其中,管氏肿腿蜂、川硬皮肿腿蜂、白蜡吉丁肿腿蜂、沙蒿吉丁肿腿蜂为一类,有3个“CTTCT”单元,新发现的苹小吉丁肿腿蜂、松脊吉丁肿腿蜂、落叶松吉丁肿腿蜂为另一类有两个“CTTCT”单元,所以,ITS序列能够将苹小吉丁肿腿蜂、松脊吉丁肿腿蜂和落叶松吉丁肿腿蜂从已知种管氏肿腿蜂、川硬皮肿腿蜂和白蜡吉丁肿腿蜂中区分出来,也为这些新发现的肿腿蜂个体成为新物种提供理论依据;同时分析了8种肿腿蜂线粒体基因cytb,12S和16S3个基因片段,并结合线粒体基因序列数据和系统发育树。所得的结果表明落叶松吉丁肿腿蜂的所有个体聚在一起形成一个单独的姐妹群,并且在所测的3个基因中落叶松吉丁肿腿蜂都有很高的自检支持率(90%以上)。cytb和12S基因也提供了有力的证明:松脊吉丁肿腿蜂的所有个体聚集为一个单独的类群(自检支持率在90%以上)。这种多个基因综合比较分析的方法,为肿腿蜂科硬皮肿腿蜂属的个体种类鉴定及线粒体基因的进化提供一定的理论依据,但最终肿腿蜂新种的鉴定仍需对其进行形态学鉴定。 展开更多
关键词 肿腿蜂 ITS序列 线粒体基因 分子鉴定 系统发育关系
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基于多个扩增子的DNA metabarcoding技术探究黄海微型真核浮游植物多样性
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作者 张莉 张远 +1 位作者 林佳宁 王书平 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第9期4052-4060,共9页
微型真核浮游植物是海洋生态系统中能量流动和物质循环的关键环节,对维持海洋生态系统的稳定发挥着关键的作用.本研究首次应用DNA metabarcoding技术探讨黄海微型真核浮游植物的物种组成及多样性,对比分析ITS、18SrDNAV4和18SrDNAV9扩... 微型真核浮游植物是海洋生态系统中能量流动和物质循环的关键环节,对维持海洋生态系统的稳定发挥着关键的作用.本研究首次应用DNA metabarcoding技术探讨黄海微型真核浮游植物的物种组成及多样性,对比分析ITS、18SrDNAV4和18SrDNAV9扩增子条件下微型真核浮游植物的群落结构及多样性水平,并探讨了其多样性与温度、盐度的响应关系.结果表明:①基于ITS扩增子获得的微型真核浮游植物中绿藻门所占比例较高,而基于18SrDNAV4和18SrDNAV9扩增子获得的甲藻门相对丰度较高.②基于18SrDNAV9扩增子获得的微型真核浮游植物的ACE、Chao1、Shannon和Simpson指数较ITS和18SrDNAV4扩增子更高,而且其门、纲、目和科的数目较高.③黄海微型真核浮游植物的Shannon指数与温度呈现出显著正相关的关系(P<0.01),而与盐度呈现出显著负相关的关系(P<0.05).本研究通过对比不同扩增子条件下黄海微型真核浮游植物的群落结构及丰度特征,丰富了黄海微型真核浮游植物的认识,可为今后该海域微型真核浮游植物的生态学研究、生物多样性监测、生物资源动态变化及持续开发生产等方面的分析提供科学依据. 展开更多
关键词 微型真核浮游植物 DNAmetabarcoding ITS 18SrDNAV4 18SrDNAV9 多样性
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