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达菲干预肾阳虚外感小鼠的血清代谢组学研究
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作者 付业佩 孙启慧 +4 位作者 李灿 丁富娟 巩丽丽 杨勇 容蓉 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期821-829,共9页
目的:通过血清代谢组学的方法,采用LC-MS技术,在正负离子模式下,研究达菲对肾阳虚外感小鼠的干预作用,初步探索达菲在流感治疗过程中调控的代谢通路。方法:36只昆明小鼠随机分为正常组、模型组、达菲组,腹腔注射苯甲酸雌二醇方法复制肾... 目的:通过血清代谢组学的方法,采用LC-MS技术,在正负离子模式下,研究达菲对肾阳虚外感小鼠的干预作用,初步探索达菲在流感治疗过程中调控的代谢通路。方法:36只昆明小鼠随机分为正常组、模型组、达菲组,腹腔注射苯甲酸雌二醇方法复制肾阳虚小鼠模型,然后通过滴鼻感染方法建立病证结合的肾阳虚小鼠外感模型,达菲组以9.75 mg·kg^-1·d^-1剂量给药干预,每天1次,连续6 d,其他组给予等量的生理盐水;末次给药24 h后取小鼠血清,并进行原始数据采集和相关统计学分析。结果:达菲组小鼠体质量、肛温相对于模型组均有回升趋势;血清样品经过数据分析,最终鉴定了22个存在显著性差异的生物标志物,正离子模式下8个,负离子模式下14个,包括氨基酸类、甘油磷脂类、激素类以及花生四烯酸等物质,以上物质经达菲干预后均出现不同程度的回调。结论:达菲对肾阳虚外感小鼠具有一定干预作用,在干预过程中对甘油磷脂代谢、视黄醇代谢、能量代谢等途径具有一定的调控作用。 展开更多
关键词 液相色谱-质谱 代谢组学 达菲 肾阳虚外感
基于代谢组的厌氧氨氧化菌群对温度的响应机制
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作者 霍唐燃 潘珏君 刘思彤 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1936-1945,共10页
【背景】在环境工程领域中,大多数耐冷菌从活性污泥中分离得到。了解活性污泥菌群对低温的响应有助于耐冷菌的驯化培养。【目的】以厌氧氨氧化污泥菌群作为研究对象,研究温度对厌氧氨氧化菌群代谢通路与代谢产物的影响,以期初步阐释厌... 【背景】在环境工程领域中,大多数耐冷菌从活性污泥中分离得到。了解活性污泥菌群对低温的响应有助于耐冷菌的驯化培养。【目的】以厌氧氨氧化污泥菌群作为研究对象,研究温度对厌氧氨氧化菌群代谢通路与代谢产物的影响,以期初步阐释厌氧氨氧化菌群低温响应机理。【方法】在25℃与35℃条件下驯化培养厌氧氨氧化污泥,研究温度对反应器脱氮效能、菌群活性与生长以及群落结构的影响,通过代谢组学比较两个温度下厌氧氨氧化菌群代谢物丰度以及代谢通路活性。【结果】虽然低温导致厌氧氨氧化菌群CO2固定、TCA循环与丙酮酸代谢的下调,进而导致氮去除活性以及增长速率显著下降,但菌群RNA合成水平、腐胺与信号分子合成上调,从而通过转录调控、调控膜脂组成与改变膜结构的方式,调控菌群代谢以适应低温环境。【结论】从分子机理的角度探究了厌氧氨氧化污泥菌群适应低温环境的生理机制,首次阐释了腐胺与信号分子在污泥菌群适应低温过程中的重要作用。 展开更多
关键词 厌氧氨氧化菌群 降温 响应机制 代谢组学
基于肝脏代谢组分析研究低聚硒化氨基多糖对黑鲷的免疫调节作用 预览
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作者 周秀锦 杨会成 +3 位作者 张静 邵宏宏 冷向阳 韩超 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期939-945,共7页
采用基于液相色谱-飞行时间质谱联用(LC-TOF-MS)技术的代谢组学方法,分析黑鲷肝脏内源性代谢物的变化,研究硒化氨基多糖增强黑鲷的免疫调节机制。采用XCMS plus 软件非靶向分析质谱采集数据,筛选潜在生物标志物,并通过MetaboAnalyst3.0... 采用基于液相色谱-飞行时间质谱联用(LC-TOF-MS)技术的代谢组学方法,分析黑鲷肝脏内源性代谢物的变化,研究硒化氨基多糖增强黑鲷的免疫调节机制。采用XCMS plus 软件非靶向分析质谱采集数据,筛选潜在生物标志物,并通过MetaboAnalyst3.0网站分析相关代谢通路。结果表明,饲喂硒化氨基多糖组中的代谢物明显区分于空白组,发现并鉴定了32个有差异的生物标志物。代谢通路分析结果表明,硒化氨基多糖可通过氨基酰基-转运脱氧核糖核苷酸(tRNA)生物合成、氨基酸代谢、核苷酸代谢、氮代谢等代谢通路增强黑鲷自身的免疫机能。该研究为阐明硒化氨基多糖的免疫增强机制提供了科学依据。 展开更多
关键词 高分辨质谱 代谢组学 低聚硒化氨基多糖 黑鲷 免疫调节
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Effect of Tong Xie Yao Fang on endogenous metabolites in urine of irritable bowel syndrome model rats 预览
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作者 Xue-Ying Zhao Jian-Wei Wang +3 位作者 Yue Yin Kai Li Miao Zhang Fu-Ping Yan 《世界胃肠病学杂志:英文版》 SCIE CAS 2019年第34期5134-5151,共18页
BACKGROUND Tong Xie Yao Fang is a representative traditional Chinese prescription for the treatment of liver and spleen deficiency,abdominal pain and diarrhea.It has a unique function in the treatment of gastrointesti... BACKGROUND Tong Xie Yao Fang is a representative traditional Chinese prescription for the treatment of liver and spleen deficiency,abdominal pain and diarrhea.It has a unique function in the treatment of gastrointestinal dysfunction including irritable bowel syndrome(IBS),is a common functional bowel disease.Its main symptoms are recurrent abdominal pain,diarrhea,constipation or alternations between diarrhea and constipation.There are obvious differences in metabolites between TCM syndromes.By comparing the body fluid metabolism maps of model animals,metabolomics can discover disease biomarkers,analyze the differences in metabolic pathways and understand the pathological process and the metabolic pathways of substances in the body.Thus,the evaluation of animal models tends to be comprehensive and objective.This may provide further understanding between the interaction between Tong Xie Yao Fang and the IBS model.AIM To evaluate the effect of Tong Xie Yao Fang on IBS rats by using metabolomics method.METHODS Wistar rats were used to establish IBS models,and then randomly divided into four groups:A model control group and three Tong Xie Yao Fang treatment groups(high,medium and low doses).A normal,non-IBS group was established.The rats were treated for 2 wk.On days 0 and 14 of the experimental model,urine was collected for 12 h and was analyzed by ultra-performance liquid chromatography quadrupole time-of-flight mass spectrometry.Nine potential biomarkers were identified,and six major metabolic pathways were found to be related to IBS.RESULTS In the study of metabonomics,nine potential biomarkers including L-serine,4-methylgallic acid,L-threonine,succinylacetone,prolyl-hydroxyproline,valylserine,acetyl citrate,marmesin rutinoside and 5-hydroxy-L-tryptophan were identified in urine,which were assigned to amino acids,organic acids,succinyl and glycosides.Furthermore,the metabolic pathway of L-serine,L-threonine and 5-hydroxy-L-tryptophan was found in the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,which mainly involved th 展开更多
关键词 Tong Xie YAO Fang IRRITABLE BOWEL syndrome Liver-spleen disharmony ENDOGENOUS METABOLITES Metabolomics
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Metabolomic Fingerprint of the Model Ciliate, Tetrahymena thermophila Determined by Untargeted Profiling Using Gas Chromatography-Mass Spectrometry 预览
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作者 XU Jing BO Tao +1 位作者 SONG Weibo WANG Wei 《中国海洋大学学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第3期654-662,共9页
The ciliate Tetrahymena is a valuable model organism in the studies of ecotoxicology. Changes in intracellular metabolism are caused by exogenous chemicals in the environment. Intracellular metabolite changes signify ... The ciliate Tetrahymena is a valuable model organism in the studies of ecotoxicology. Changes in intracellular metabolism are caused by exogenous chemicals in the environment. Intracellular metabolite changes signify toxic effects and can be monitored by metabolomics analysis. In this work, a protocol for the GC-MS-based metabolomic analysis of Tetrahymena was established. Different extraction solvents showed divergent effects on the metabolomic analysis of Tetrahymena thermophila. The peak intensity of metabolites detected in the samples of extraction solvent Formula 1(F1) was the strongest and stable, while 61 metabolites were identified. Formula 1 showed an excellent extraction performance for carbohydrates. In the samples of extraction solvent Formula 2(F2), 66 metabolites were characterized, and fatty acid metabolites were extracted. Meanwhile, 57 and 58 metabolites were characterized in the extraction with Formula 3(F3) and Formula 4(F4), respectively. However, the peak intensity of the metabolites was low, and the metabolites were unstable. These results indicated that different extraction solvents substantially affected the detected coverage and peak intensity of intracellular metabolites. A total of 74 metabolites(19 amino acids, 11 organic acids, 2 inorganic acids, 11 fatty acids, 11 carbohydrates, 3 glycosides, 4 alcohols, 6 amines, and 7 other compounds) were identified in all experimental groups. Among these metabolites, amino acids, glycerol, myoinositol, and unsaturated fatty acids may become potential biomarkers of metabolite set enrichment analysis for detecting the ability of T. thermophila against environmental stresses. 展开更多
关键词 TETRAHYMENA THERMOPHILA metabolomics ECOTOXICOLOGY gas chromatography-mass spectrometry
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NADPH氧化酶相关基因对盾壳霉代谢的影响 预览
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作者 孙池 蒋静 +2 位作者 胡先文 付艳苹 姜道宏 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期79-84,共6页
基于液质联用(LC-MS)的代谢组学分析手段,通过突变株Qnox1-6与野生株zs-1的代谢比较,研究NADPH氧化酶相关基因对盾壳霉代谢的影响。筛选得到14个重要的代谢差异物质,主要是羧酸类和苷类物质。特别是7个仅在突变株中出现的物质为:苯二酚... 基于液质联用(LC-MS)的代谢组学分析手段,通过突变株Qnox1-6与野生株zs-1的代谢比较,研究NADPH氧化酶相关基因对盾壳霉代谢的影响。筛选得到14个重要的代谢差异物质,主要是羧酸类和苷类物质。特别是7个仅在突变株中出现的物质为:苯二酚、松柏苷、甾体皂苷类物质、3个羧酸类物质及其他物质,这些代谢物与盾壳霉寄生核盘菌紧密相关。 展开更多
关键词 盾壳霉 NOX 突变株 寄生能力 LC-MS 差异代谢物 代谢组学
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A novel approach based on metabolomics coupled with network pharmacology to explain the effect mechanisms of Danggui Buxue Tang in anaemia
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作者 HUA Yong-Li MA Qi +5 位作者 YUAN Zi-Wen ZHANG Xiao-Song YAO Wan-Ling JI Peng HU Jun-Jie WEI Yan-Ming 《中国天然药物:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第4期275-290,共16页
Danggui Buxue Tang(DBT) is a famous Chinese medicinal decoction. Mechanism of DBT action is wide ranging and unclear. Exploring new ways of treatment with DBT is useful. Sprague–Dawley(SD) rats were randomly divided ... Danggui Buxue Tang(DBT) is a famous Chinese medicinal decoction. Mechanism of DBT action is wide ranging and unclear. Exploring new ways of treatment with DBT is useful. Sprague–Dawley(SD) rats were randomly divided into 3 groups including control(NC, Saline), the DBT(at a dose of 8.10 g·kg^–1), and blood deficiency(BD)(Cyclophosphamide(APH)-and Cyclophosphamide(CTX)-induced anaemia). A metabolomics approach using Liquid Chromatography-Quadrupole-Time-of-Flight/Mass Spectrometry(LC/Q-TOFMS) was developed to perform the plasma metabolic profiling analysis and differential metabolites were screened according to the multivariate statistical analysis comparing the NC and BD groups, and the hub metabolites were outliers with high scores of the centrality indices. Anaemia disease-related protein target and compound of DBT databases were constructed. The TCMSP, Chem Mapper and STITCH databases were used to predict the protein targets of DBT. Using the Cytoscape 3.2.1 to establish a phytochemical component–target protein interaction network and establish a component, protein and hub metabolite protein–protein interaction(PPI) network and merging the three PPI networks basing on BisoGenet. The gene enrichment analysis was used to analyse the relationship between proteins based on the relevant genetic similarity by ClueGO. The results shown DBT effectively treated anaemia in vivo. 11 metabolic pathways are involved in the therapeutic effect of DBT in vivo;S-adenosyl-L-methionine, glycine, L-cysteine, arachidonic acid(AA) and phosphatidylcholine(PC) were screened as hub metabolites in APH-and CTX-induced anaemia. A total of 288 targets were identified as major candidates for anaemia progression. The gene-set enrichment analysis revealed that the targets are involved in iron ion binding, haemopoiesis, reactive oxygen species production, inflammation and apoptosis. The results also showed that these targets were associated with iron ion binding, haemopoiesis, ROS production, apoptosis, inflammation and related signal 展开更多
关键词 Danggui Buxue TANG Metabolomics NETWORK PHARMACOLOGY ANAEMIA
电离辐射对小鼠肾脏影响的代谢组学研究 预览
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作者 肖雄杰 HU Mary +1 位作者 张许 HU Jian-zhi 《波谱学杂志》 CAS 北大核心 2019年第2期172-181,共10页
电离辐射对生物体影响是目前生物医学领域研究的热点之一.本文利用基于核磁共振氢谱(1H NMR)的代谢组学技术研究来自暴露于不同的电离辐射的C57BL/6J小鼠的肾脏的水溶性萃取物,并试图寻找电离辐射对小鼠肾脏影响的特异性生物标志物.分... 电离辐射对生物体影响是目前生物医学领域研究的热点之一.本文利用基于核磁共振氢谱(1H NMR)的代谢组学技术研究来自暴露于不同的电离辐射的C57BL/6J小鼠的肾脏的水溶性萃取物,并试图寻找电离辐射对小鼠肾脏影响的特异性生物标志物.分析结果表明,辐射组可与相应的对照组明显区分.在所发现的75个代谢物中,有6种代谢物的浓度发生显著性变化,分别为2-氨基丁酸、3-羟基丁酸、高丝氨酸、1,3-丙二胺、β-丙氨酸和抗坏血酸.这些代谢物可能成为高剂量电离辐射对生物体肾脏代谢影响的标志物. 展开更多
关键词 核磁共振氢谱(1H NMR) 代谢组学 电离辐射 肾脏 多变量数据分析
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何首乌的入血成分、药动学及肝毒性代谢组学研究进展
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作者 蒙钟经 丁选胜 《药学进展》 CAS 2019年第5期379-383,共5页
中药何首乌为蓼科植物何首乌Polygonum multiflorum Thunb.的干燥块根,是一种常用的补益中药,并兼有药食同源的应用基础。但近年来,何首乌及其制剂导致药源性肝损伤的报道日益增多,其安全性问题已成为人们关注的焦点。基于此,对近年来... 中药何首乌为蓼科植物何首乌Polygonum multiflorum Thunb.的干燥块根,是一种常用的补益中药,并兼有药食同源的应用基础。但近年来,何首乌及其制剂导致药源性肝损伤的报道日益增多,其安全性问题已成为人们关注的焦点。基于此,对近年来何首乌入血成分、药动学及肝毒性代谢组学的研究进展进行综述,以期为何首乌在临床上安全、合理应用提供参考。 展开更多
关键词 何首乌 肝毒性 入血成分 药动学 代谢组学
基于洛杉矶–北京迁徙人群的大气污染暴露相关急性健康效应标志物的代谢组学研究 预览
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作者 谢天宁 林岩 邱兴华 《北京大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期501-508,共8页
采用定组设计,以14名洛杉矶加州大学–北京大学交换学生为受试者,建立基于气相色谱–质谱联用的尿液非靶向代谢组学方法,采用包括(正交)偏最小二乘回归判别分析在内的多种统计方法识别差异物质,并基于色谱–质谱信息进行结构鉴定。通过... 采用定组设计,以14名洛杉矶加州大学–北京大学交换学生为受试者,建立基于气相色谱–质谱联用的尿液非靶向代谢组学方法,采用包括(正交)偏最小二乘回归判别分析在内的多种统计方法识别差异物质,并基于色谱–质谱信息进行结构鉴定。通过固定站点监测数据评价研究期间两地的大气污染物暴露,采用混合效应线性模型探索污染物与指征氧化损伤的生物标志物间的关联。结果表明,两地的暴露变化与人体能量代谢、氧化损伤、肠胃菌群、蛋白质与RNA代谢(可能涉及细胞凋亡)等通路变化之间可能存在关联,受试者尿液中的尿囊素、胱氨酸和假尿嘧啶水平在北京显著上升。当以尿囊素作为指征机体急性氧化损伤的标志物时,其变化与0~96小时的PM2.5、0~24小时的CO、24~48小时的NO2、48~72小时的O3以及24~72小时的SO2暴露有较强的相关性。结果表明北京与洛杉矶间大气污染物暴露的差异可能导致受试者体内氧化损伤负担发生变化,同时体内可能产生抗氧化损伤的生理活动,例如通过调动能量代谢通路抵御氧化还原失衡造成的氧化损伤负担。 展开更多
关键词 代谢组学 生物标志物 氧化损伤 大气污染物 混合效应模型
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心脏外科术后急性肾损伤的代谢组学研究进展 预览
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作者 石宁 张松 +1 位作者 马高祥 马世平 《医药前沿》 2019年第18期5-7,共3页
急性肾损伤是表现为肾功能急剧下降的成人心脏外科术后的严重并发症之一.代谢组学是通过对生物体液或组织中所有内源性小分子代谢物进行高通量检测,分析代谢物与机体病理生理关系的一门学科.近年来,将代谢组学技术应用于心脏术后急性肾... 急性肾损伤是表现为肾功能急剧下降的成人心脏外科术后的严重并发症之一.代谢组学是通过对生物体液或组织中所有内源性小分子代谢物进行高通量检测,分析代谢物与机体病理生理关系的一门学科.近年来,将代谢组学技术应用于心脏术后急性肾损伤的研究,对明确其发病机制、寻找简单无创的预后标志物等具有重要价值.本文拟对代谢组学在心脏外科术后急性肾损伤的预警作用做简要综述. 展开更多
关键词 心脏外科 急性肾损伤 代谢组学
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代谢组学在白血病中的研究进展 预览
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作者 宋志强 朱臻宇 +1 位作者 刘悦 柴逸峰 《药学实践杂志》 CAS 2019年第5期385-389,399共6页
代谢组学是对生物系统(细胞、组织、器官、生命体)中所有内源性小分子代谢物进行定性和定量分析的一门新学科,通过研究代谢物和代谢通路改变与生理病理变化之间的规律,揭示疾病的代谢本质。白血病是一种常见的血液系统恶性肿瘤,它的发... 代谢组学是对生物系统(细胞、组织、器官、生命体)中所有内源性小分子代谢物进行定性和定量分析的一门新学科,通过研究代谢物和代谢通路改变与生理病理变化之间的规律,揭示疾病的代谢本质。白血病是一种常见的血液系统恶性肿瘤,它的发生发展与代谢密切相关,代谢组学发现的内源性小分子代谢物已经广泛应用于白血病的发病机制、诊断和药效机制研究并取得了显著进展。综述近年来代谢组学在白血病发病机制、诊断和药效机制方面的研究进展,以期为进一步研究提供参考。 展开更多
关键词 代谢组学 白血病 内源性小分子代谢物 发病机制 诊断 药效机制
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Effects of the ambient fine particulate matter(PM2.5) exposure on urinary metabolic profiles in rats using UPLC-Q-TOF-MS
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作者 Lin Zhang Tengfei Xu +3 位作者 Zifeng Pi Meizhu Zheng Fengrui Song Zhiqiang Liu 《中国化学快报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第1期90-94,共5页
In order to study the damage of ambient fine particulate matter(PM2.5) to organism in the environment,the method of urinary metabolomics was used to detect the potential endogenous metabolites and their related metabo... In order to study the damage of ambient fine particulate matter(PM2.5) to organism in the environment,the method of urinary metabolomics was used to detect the potential endogenous metabolites and their related metabolic pathways to clarify the toxicity mechanisms. Particles of PM2.5 collected from the fibrous membrane were extracted ultrasonically and dissolved in physiological saline to prepare PM2.5 suspension. The solution of saline and fine particular matter was injected into the trachea of rats respectively. The rats were injected two times a week for four weeks. Samples of 24-h urine were collected at the 14 th day after the end of exposure, and the ultra performance liquid chromatography coupled with quadrupole time-of-flight mass spectrometry(UPLC-Q-TOF-MS) was used for the metabolomics detection. Principal component analysis(PCA) was used to investigate the global metabolomic alterations and a clear separation in the scatter diagram were observed. 17 potential endogenous metablites were identified from urinary samples in rats by UPLC-Q-TOF-MS. The primary metabolism pathways involved pentose and glucuronate interconversions, starch and sucrose metabolism, tryptophan metabolism, tyrosine metabolism, phenylalanine metabolism, purine metabolism, acetaminophen metabolism pathway, retinol metabolism and valproic acid metabolism pathway.The results are helpful to understand the toxicological mechanisms of PM2.5 and screened out potential biomarkers of rats which exposure to PM2.5. 展开更多
关键词 AMBIENT fine PARTICULATE MATTER UPLC -Q-TOF-MS Metabolomics URINE
基于代谢组学方法研究中段小肠切除大鼠模型发生术后疲劳的机制 预览
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作者 黄烈城 陈红燕 +1 位作者 庞凤舜 秦有 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2019年第10期1545-1549,共5页
目的运用代谢组学方法研究中段小肠切除大鼠模型发生术后疲劳的机制。方法雄性SD大鼠20只随机分为模型组与正常组,利用LC MS(液相色谱-质谱联用)获取大鼠血浆代谢图谱,并采用主成分分析(PCA)、偏最小二乘法-判别分析(PLS DA)进行多变量... 目的运用代谢组学方法研究中段小肠切除大鼠模型发生术后疲劳的机制。方法雄性SD大鼠20只随机分为模型组与正常组,利用LC MS(液相色谱-质谱联用)获取大鼠血浆代谢图谱,并采用主成分分析(PCA)、偏最小二乘法-判别分析(PLS DA)进行多变量统计分析,筛选出区分术后疲劳大鼠与正常大鼠的重要差异代谢物及相关代谢途径。结果术后疲劳大鼠与正常大鼠相比,得到差异性代谢离子5680个,两组大鼠血浆代谢谱存在明显差异,同时色氨酸代谢,戊糖和葡萄糖醛酸的相互转化,精氨酸和脯氨酸代谢,细胞色素P450对外源化合物代谢的影响,卟啉和叶绿素、叶酸合成、维生素B6、亚油酸代谢等代谢通路存在明显差异。结论中段小肠切除大鼠模型发生术后疲劳与色氨酸、精氨酸、戊糖和葡萄糖醛酸的相互转化等代谢途径变化引起的脑内5 HT合成增多、血液循环功能减弱、能量供给障碍相关。由于目前非靶向代谢物的鉴定仍有不足,具体各种代谢物定性及定量分析仍需进一步实验研究。 展开更多
关键词 代谢组学 液相色谱-质谱联用 术后疲劳 主成分分析 偏最小二乘法-判别分析
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甜菜组学技术研究进展 预览
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作者 耿贵 吕春华 +2 位作者 於丽华 李任任 王宇光 《中国农学通报》 2019年第12期124-129,共6页
转录组学、蛋白组学、基因组学和代谢组学等组学技术具有高通量、高灵敏度和系统性等优点,已成为在分子水平研究植物应对生物胁迫和非生物胁迫的强有力工具。本研究综述了近年来国内外在甜菜组学技术方面的相关研究,包括甜菜在生物和非... 转录组学、蛋白组学、基因组学和代谢组学等组学技术具有高通量、高灵敏度和系统性等优点,已成为在分子水平研究植物应对生物胁迫和非生物胁迫的强有力工具。本研究综述了近年来国内外在甜菜组学技术方面的相关研究,包括甜菜在生物和非生物胁迫下的抗逆分子机理研究、细胞质雄性不育(CMS)结构基因和基因辅助甜菜育种功能研究,这些研究对于培育优良甜菜品种具有重要的理论价值。下一步应加强多种组学结合的研究策略,并结合基因功能鉴定发掘更多的甜菜优质基因资源。 展开更多
关键词 甜菜 转录组学 蛋白质组学 基因组学 代谢组学
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半根交替干旱胁迫对大豆农艺性状及籽粒代谢物的影响 预览
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作者 谢丛薇 张潇文 +6 位作者 杨才琼 胡宝予 杨峰 王小春 刘江 杨文钰 张静 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2019年第3期288-295,共8页
【目的】探讨半根交替干旱胁迫对大豆农艺性状及籽粒代谢物的影响,为研究大豆品质提升及抗旱代谢调控机理奠定基础。【方法】以两个耐旱性差异显著的大豆品种(耐旱型ND12、敏感型C103)为研究材料,开展室内盆栽试验,考察了不同水分胁迫... 【目的】探讨半根交替干旱胁迫对大豆农艺性状及籽粒代谢物的影响,为研究大豆品质提升及抗旱代谢调控机理奠定基础。【方法】以两个耐旱性差异显著的大豆品种(耐旱型ND12、敏感型C103)为研究材料,开展室内盆栽试验,考察了不同水分胁迫下大豆的株高、单株荚数、百粒重等农艺性状,并采用高效液相色谱法分析籽粒代谢群体的变化规律。【结果】在半根交替干旱胁迫下,两个大豆品种的外观性状变化存在差异,但并不显著(P>0.05),抗性品种ND12的株高、茎粗、分枝数、主茎节数等指标呈下降趋势,敏感型品种C103却出现了小幅增长;胁迫对大豆产量性状的影响较大,两个品种的百粒重均极显著降低,单株产量显著降低,ND12的降幅低于C103;干旱敏感型大豆籽粒化学成分对胁迫的响应更剧烈,皂苷合成通路及丙酮醛降解通路上调,大豆皂苷和谷胱甘肽含量显著上升;木质素糖苷合成通路及苯丙氨酸合成通路显著上调,松柏醇、芥子醛等含量显著上升。【结论】有望通过适度的半根干旱栽培,在维持大豆正常生长的前提下,提升皂苷、谷胱甘肽等品质性状;通过籽粒代谢群体的变化情况,能够为抗旱性大豆种质资源的筛选提供参考;胁迫环境下大豆籽粒木质化程度的加剧,可能对大豆代际间应对非生物胁迫有重要作用。 展开更多
关键词 大豆 分根 干旱胁迫 代谢组 农艺性状
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代谢组学法研究转录因子SlNAC4对番茄果实代谢产物的影响 预览
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作者 郑海英 张冬青 赵晓丹 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第10期36-42,共7页
以SlNAC4基因沉默番茄和野生型番茄为研究对象,采用高效液相色谱-串联高分辨率质谱仪对破色期番茄果实代谢产物进行代谢组学分析,探究转录因子SlNAC4对果实成熟中代谢产物的影响。利用XCMS软件和inhouse标准品、HMDB、KEGG等数据库对化... 以SlNAC4基因沉默番茄和野生型番茄为研究对象,采用高效液相色谱-串联高分辨率质谱仪对破色期番茄果实代谢产物进行代谢组学分析,探究转录因子SlNAC4对果实成熟中代谢产物的影响。利用XCMS软件和inhouse标准品、HMDB、KEGG等数据库对化合物进行定性分析,用metaX软件进行定量及差异代谢产物的筛选。对两组番茄代谢组学分析结果显示,既能与数据库物质的一级离子m/z匹配也能与数据库物质的碎片离子(二级)m/z匹配到的差异代谢物质共有67种,包括氨基酸衍生物及二肽类(19种)、维生素类(7种)、糖类及其衍生物(4种)、核酸及其衍生物(11种)、生物碱类(4种)、香精香料(4种)及有机酸(9种)等。其中有29种化合物含量上调,38种含量显著下降,表明番茄转录因子SlNAC4影响了番茄果实成熟过程中的代谢。 展开更多
关键词 番茄 转录因子SlNAC4 代谢组学 代谢产物
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基于高分辨质谱的非靶向代谢组学在食品造假鉴定中的研究进展 预览
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作者 赖博文 刘玢 梁永康 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期192-197,共6页
食品造假属于以经济利益为驱动的食品欺诈(Economically motivated adulteration,EMA),是目前影响及破坏食品安全秩序的重要因素之一。而随着人们生活水平的迅速提高,对食品品质提出了更高的要求,当下食品造假现象是公众极为关注的问题... 食品造假属于以经济利益为驱动的食品欺诈(Economically motivated adulteration,EMA),是目前影响及破坏食品安全秩序的重要因素之一。而随着人们生活水平的迅速提高,对食品品质提出了更高的要求,当下食品造假现象是公众极为关注的问题。以往,针对已知的目标物质进行定量检测的靶向代谢组学技术在食品检测中广泛应用,代谢组学技术已经成为食品科学研究中不可或缺的工具。近年来,针对食品造假现象,代谢组学的另一个分支,基于高分辨质谱(High-resolution mass spectrometry,HRMS)的非靶向代谢组学(Non-targeted metabolomics,NTM)开始运用到食品造假的鉴定中,并已取得快速的发展。对基于HRMS的非靶向代谢组学的食品造假鉴定工作流程进行了介绍,对其数据处理方式进行了概括,并就其在食品物种(品种)、产地和品质等造假鉴定相关应用分别进行了总结,最后还对基于高分辨质谱的非靶向代谢组学应用于食品检测中优点和缺点进行了概括,并对其在其他研究方向进行了展望,旨在对食品检测中代谢组学的最新研究进展进行总结和归纳。 展开更多
关键词 高分辨质谱 代谢组学 食品造假
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慢性肾脏疾病晚期患者的尿代谢组学特征分析 预览
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作者 冯琴 尚小玲 +1 位作者 李智 胡芳 《现代检验医学杂志》 CAS 2019年第1期93-96,共4页
目的研究尿代谢物在慢性肾脏疾病(CKD)晚期患者中的变化及与肾脏疾病发展的相关性。方法通过NMR分析15例患者和15例健康人的尿代谢组分,进行主成分分析(PCA)检验,并进一步运用液相色谱-三重四极杆质谱法分析另外16例CKD患者和15例对照... 目的研究尿代谢物在慢性肾脏疾病(CKD)晚期患者中的变化及与肾脏疾病发展的相关性。方法通过NMR分析15例患者和15例健康人的尿代谢组分,进行主成分分析(PCA)检验,并进一步运用液相色谱-三重四极杆质谱法分析另外16例CKD患者和15例对照的尿液样本进行验证,并鉴定CKD和非CKD尿样之间的尿代谢物。结果发现CKD和非CKD尿样之间有七种尿代谢物显著不同(P<0.05),其中枸橼酸盐、牛磺酸、5-羟脯氨酸在CKD患者中显著降低(P<0.05),而谷氨酸、鸟苷酸乙酸酯、α-苯乙酰谷氨酰胺和N-氧化三甲胺显著上升(P<0.05)。根据这些代谢物的变化趋势,5例CKD患者中有4例被鉴定为CKD患者(80%准确性),7例健康人中有6例被划分到对照区(86%准确性)。结论该方法特异度高,可以用来预测CKD,其临床引用前景良好。 展开更多
关键词 慢性肾病 质谱 代谢组学
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代谢组学在新生儿临床中的应用 预览
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作者 刘秋彤(综述) 钟晓云(审校) 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期942-948,共7页
代谢组学是后基因组时代新兴的热门学科,国内外在人体的健康评估、生长发育、疾病诊断及疗效评估等方面均有大量研究。新生儿期作为生命的特殊时期,其细胞迅速更新、大量能量及物质被消耗、代谢途径的更改,均会对代谢物水平产生影响。... 代谢组学是后基因组时代新兴的热门学科,国内外在人体的健康评估、生长发育、疾病诊断及疗效评估等方面均有大量研究。新生儿期作为生命的特殊时期,其细胞迅速更新、大量能量及物质被消耗、代谢途径的更改,均会对代谢物水平产生影响。然而新生儿的代谢水平和代谢轮廓目前尚无参考标准。该文综述了目前国内外新生儿生长发育和常见疾病的代谢研究状况及其临床应用现状,从代谢角度重新认识新生儿生长发育过程、常见病和多发病,将会为新生儿营养指导和评估、疾病治疗方案的选择、新的药物研究提供思路。 展开更多
关键词 代谢组学 临床应用 新生儿
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