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急性酒精中毒患者儿茶酚氧位甲基化转移酶基因多态性分析 预览
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作者 冯锴 姜树朋 +1 位作者 汪明 李艳 《微循环学杂志》 2018年第3期39-42,共4页
目的:分析急性酒精中毒患者儿茶酚氧位甲基化转移酶COMT rs4680基因多态性。方法:针对COMT rs4680位点设计内外两对引物,建立两对交叉引物-聚合酶链反应(PCR-CTPP)检测体系,经过PCR扩增,通过琼脂糖凝胶电泳鉴别基因型,最后将该结果... 目的:分析急性酒精中毒患者儿茶酚氧位甲基化转移酶COMT rs4680基因多态性。方法:针对COMT rs4680位点设计内外两对引物,建立两对交叉引物-聚合酶链反应(PCR-CTPP)检测体系,经过PCR扩增,通过琼脂糖凝胶电泳鉴别基因型,最后将该结果与基因测序结果比较,验证其准确性,并通过该方法检测288例急性酒精中毒患者(急性酒精中毒组)和348例健康对照人群(健康对照组)COMT基因型,分析COMT rs4680基因多态性与急性酒精中毒的关系。结果:COMT rs4680有GG型、AG型、AA型三种基因型,且PCR-CTPP方法可以准确检测COMT rs4680基因多态性;与健康对照组比较,急性酒精中毒组AA型检出率明显升高(P〈0.05),但两组G、A两种等位基因频率差异无统计学意义(P〉0.05)。结论:PCR-CTPP可成功鉴别COMT rs4680三种基因型,AA型可能是急性酒精中毒发生的高危因素之一。 展开更多
关键词 交叉引物-聚合酶链反应 COMT rs4680 单核苷酸多态性 酒精中毒
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水稻稻瘟病抗性基因Pi25功能性SNP分子标记开发及应用 被引量:3
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作者 周雷 蔡海亚 +10 位作者 戴凤美 徐华山 刘凯 闸雯俊 李三和 杨国才 陈志军 李培德 国成 焦春海 游艾青 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期2680-2685,共6页
为了使稻瘟病抗性基因Pi25在水稻分子育种中得到高效和快速利用,本研究通过将Pi25不同等位基因测序及序列比对鉴定到一个Pi25基因内特异SNP位点。使用PCR-CTPP(PCR with confrontingtwo-pair primers)的方法加以改进开发了一套鉴定该SN... 为了使稻瘟病抗性基因Pi25在水稻分子育种中得到高效和快速利用,本研究通过将Pi25不同等位基因测序及序列比对鉴定到一个Pi25基因内特异SNP位点。使用PCR-CTPP(PCR with confrontingtwo-pair primers)的方法加以改进开发了一套鉴定该SNP的功能性分子标记,利用该标记及待检测水稻品种基因组DNA进行PCR扩增,通过不同PCR产物条带大小将Pi25与其它等位基因区分开,可快速判断待测水稻Pi25的基因型。本方法快速简单、成本低廉,可广泛应用于水稻种质资源Pi25基因型鉴定和分子标记辅助选择育种。 展开更多
关键词 稻瘟病抗性 Pi25 PCR-CTPP 功能分子标记 MAS
p73基因多态性与非小细胞肺癌遗传易感性分析 预览 被引量:2
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作者 王霜霜 董林利 +1 位作者 汤建新 李文 《湖南工业大学学报》 2014年第6期13-16,共4页
采用两对引物-聚合酶链反应(PCR-CTPP)方法分别对100例非小细胞肺癌患者和120例健康对照者进行p73基因多态性检测,DNA测序验证基因分型结果,对p73基因多态性与非小细胞肺癌的相关性进行分析,探讨湖南省地区人群中p73基因多态性与非小... 采用两对引物-聚合酶链反应(PCR-CTPP)方法分别对100例非小细胞肺癌患者和120例健康对照者进行p73基因多态性检测,DNA测序验证基因分型结果,对p73基因多态性与非小细胞肺癌的相关性进行分析,探讨湖南省地区人群中p73基因多态性与非小细胞肺癌遗传易感性的关系。试验结果表明,PCRCTPP法和测序得到的基因分型结果完全吻合,100例肺癌患者的p73基因型分布如下:GC/GC型60例(60%)、GC/AT型36例(36%)、AT/AT型4例(4%),与携带p73 GC/GC基因型者比较,携带AT/AT基因型者的肺癌患病风险增加3.4倍(OR=3.387,95%CI=1.055-10.875,P=0.032),而携带GC/AT基因型者肺癌风险也呈增加趋势,但是无显著性差异(OR=1.183,95%CI=0.672-2.082,P=0.561)。p73基因多态性可能与湖南省地区人群非小细胞肺癌遗传易感性相关。 展开更多
关键词 NSCLC p73基因多态性 PCR-CTPP
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PCR-CTPP:一种基于错配技术的SNP分型方法的改良 预览 被引量:14
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作者 王柯 章金涛 +6 位作者 运玉霞 吴晓冰 陈阿群 王鹏 王凯娟 张建营 代丽萍 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期 182-188,共7页
为探讨两对交叉引物PCR(PCR—CTPP)技术的原理并提高SNP分型的准确性,以人类MTHFR基因1298位点突变为例,通过设计合理的引物、优化引物终浓度及复性温度等重建PCR—CTPP检测系统,对比常规PCR—CTPP和改良的PCR-CTPP检测系统的可靠... 为探讨两对交叉引物PCR(PCR—CTPP)技术的原理并提高SNP分型的准确性,以人类MTHFR基因1298位点突变为例,通过设计合理的引物、优化引物终浓度及复性温度等重建PCR—CTPP检测系统,对比常规PCR—CTPP和改良的PCR-CTPP检测系统的可靠性。结果表明,改良的PCR-CTPP检测系统更加准确,支持了常规方法存在理论缺陷的观点;批量鉴定结果进一步验证了改良方法的可靠性。该技术有望在医学和分子生物学等领域广泛应用。 展开更多
关键词 两对交叉引物PCR 四引物扩增受阻突变体系PCR SNP分型 人为错配 亚甲基四氢叶酸还原酶
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p73G4A多态性与新疆维吾尔族人乳头状瘤病毒相关性宫颈癌的研究 预览 被引量:1
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作者 郑莉莉 潘晓琳 +4 位作者 杨安强 郑兴征 王晓凌 周秋媛 李新敏 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第16期2302-2306,2311共6页
目的p73G4A多态性与新疆维族HPV相关宫颈癌发生的相关性;探讨PCR-CTPP在SNP检测及分析中的应用。方法应用PCR、PCR-RFLP以及PCR-CTPP技术对101例维族宫颈癌和100例维族正常宫颈组织的p73G4A多态性分布及HPV16的感染情况进行检测。结果p... 目的p73G4A多态性与新疆维族HPV相关宫颈癌发生的相关性;探讨PCR-CTPP在SNP检测及分析中的应用。方法应用PCR、PCR-RFLP以及PCR-CTPP技术对101例维族宫颈癌和100例维族正常宫颈组织的p73G4A多态性分布及HPV16的感染情况进行检测。结果p73G4A多态性3种基因型GC/GC、AT/AT和GC/AT在维吾尔族宫颈癌中所占比例差异无显著性(χ^2=2.268,P〉0.05);HPV16DNA检测显示,HPV16感染在宫颈癌及对照组中分布经统计学分析差异有显著性(χ^2=116.837,P〈0.05);p73G4A多态性3种基因型在HPV16阳性组和阴性组中分布,经统计学分析差异无显著性(χ^2=1.820,P〉0.05);采用PCR-CTPP技术检测分析维族宫颈癌p73G4A多态性,与PCR-RFLP技术检测结果一致。结论p73G4A多态性可能与维族宫颈癌无相关性;PCR-CTPP技术经济、省时、操作简单,结果稳定可靠,对于SNP以及基因点突变研究具有较高的应用价值。 展开更多
关键词 p73多态性 HPV PCR-CTPP 宫颈癌 维吾尔族
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采用PCR-CTPP检测白细胞介素2基因多态性 预览 被引量:1
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作者 杨丽红 陈必成 +2 位作者 潘晓东 李澄棣 昌盛 《中国实验诊断学》 2007年第5期 569-571,共3页
目的采用PCR-CTPP技术,检测中国浙南地区白细胞介素-2(IL-2)基因.330位的多态性,并分析其可能的临床应用。方法针对IL-2基因.330(T/G)多态性设计两条序列特异性引物,结合两侧引物,在同一反应管中进行PCR。对PCR条件进行优化... 目的采用PCR-CTPP技术,检测中国浙南地区白细胞介素-2(IL-2)基因.330位的多态性,并分析其可能的临床应用。方法针对IL-2基因.330(T/G)多态性设计两条序列特异性引物,结合两侧引物,在同一反应管中进行PCR。对PCR条件进行优化,并与测序结果进行对比。在此优化条件对101名体检个体的DNA进行IL-2基因多态性分析。结果通过条件优化,PCR-CIPP(polyrnerase chain reaction with confronting two-pair primers)可以区分IL-2—330位T或G的单核苷酸的多态性,并与测序结果相符合。101位体检个体中TT纯合子为43例(42.6%),GG纯合子为11例(10.9%),T/G杂合子为47例(46.5%),结果按HardyWeinberg分布(P〉0.05)。结论PCR-CTPP可区分IL-2-330(T/G)多态性,且简单、方便,具有临床应用价值。 展开更多
关键词 IL-2 多态性 PCR-CIPP
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PCR-CTPP技术在宫颈癌P73基因多态性研究中应用 预览
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作者 郑莉莉 杨安强 +4 位作者 潘晓琳 郑兴征 李洪安 梁伟华 郑玉琴 《石河子大学学报:自然科学版》 CAS 2006年第1期 41-44,共4页
采用PCR-CTPP技术检测分析新疆维吾尔族宫颈癌P73基因第二外显子G4C14-to-A4T14多态性, 并与PCR-RFLP技术检测结果对比,探讨PCR-CTPP在SNP检测及分析中的应用.结果显示:经PCR-CTPP扩增出P73基因第二外显子G4C14-to-A4T14三种基因型相应... 采用PCR-CTPP技术检测分析新疆维吾尔族宫颈癌P73基因第二外显子G4C14-to-A4T14多态性, 并与PCR-RFLP技术检测结果对比,探讨PCR-CTPP在SNP检测及分析中的应用.结果显示:经PCR-CTPP扩增出P73基因第二外显子G4C14-to-A4T14三种基因型相应的DNA片段,与DNA测序结果符合.说明PCR-CTPP技术成本较低、省时、操作简便,结果稳定可靠,对于SNP研究具有较高的应用价值. 展开更多
关键词 PCR-CTPP P73基因多态性 宫颈癌
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PCR-CTPP简单快速检测乙醇脱氢酶-1B基因多态性
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作者 姜树朋 童永清 李艳 《实用预防医学》 CAS 2017年第9期1061-1063,共3页
目的 建立两对交叉引物-聚合酶链反应(PCR-CTPP)检测体系鉴别乙醇脱氢酶-1B基因多态性。方法 针对ADH1B rs1229984位点设计两对内外引物,经过聚合酶链反应、电泳鉴别基因型,将该方法与DNA测序法比较,验证其检测准确性,并通过该方法检... 目的 建立两对交叉引物-聚合酶链反应(PCR-CTPP)检测体系鉴别乙醇脱氢酶-1B基因多态性。方法 针对ADH1B rs1229984位点设计两对内外引物,经过聚合酶链反应、电泳鉴别基因型,将该方法与DNA测序法比较,验证其检测准确性,并通过该方法检测58例健康人ADH1B基因多态性分布情况。结果 PCR-CTPP方法可用于准确检测ADH1B基因多态性,与DNA测序结果相符;在58例健康人中,ADH1B A等位基因频率71.6%,为优势等位基因。结论 PCR-CTPP技术检测ADH1B基因多态性简单快速、经济省力,可用于疾病易感基因的快速筛查和分子流行病学研究,适合在一般实验室推广应用。 展开更多
关键词 乙醇 乙醇脱氢酶-1B 单核苷酸多态性 PCR-CTPP
PCR-CTPP技术在MDR1基因SNP分型中的应用 预览
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作者 凌烈锋 董斌 聂刘旺 《皖南医学院学报》 CAS 2010年第6期 405-408,共4页
目的:建立两对引物-聚合酶链反应(PCR-CTPP)技术改进体系-两步法PCR-CTPP,研究其在MDR1基因SNP的快速分型中的应用价值。方法:采用两步法PCR-CTPP技术对158例的癫痫患者MDR1基因rs3789243和rs2235046进行检测分型,并以DNA测序验证... 目的:建立两对引物-聚合酶链反应(PCR-CTPP)技术改进体系-两步法PCR-CTPP,研究其在MDR1基因SNP的快速分型中的应用价值。方法:采用两步法PCR-CTPP技术对158例的癫痫患者MDR1基因rs3789243和rs2235046进行检测分型,并以DNA测序验证基因分型结果。结果:通过两步法PCR-CTPP得到的基因分型结果与DNA测序得到的基因分型结果完全一致。结论:改进的两步法PCR-CTPP技术是一种可靠、快速的对基因SNP分型检测方法,能在普通实验室广泛应用,有助于基因SNP的分型研究。 展开更多
关键词 PCR-CTPP MDR1基因 SNP
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MUTYH基因与结直肠癌发病的关系 预览 被引量:3
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作者 佟静 王炳元 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2008年第31期3576-3581,共6页
目的:检测家族性腺瘤性息肉病(familial adenomatous polyposis,FAP)家族成员MUTYH基因SNP4A点,为结直肠癌易感人群的筛检提供依据. 方法:应用PCR-SSCP及基因测序方法检测三个疑似FAP家系患者MUTYH基因SNP位点,PCR-CTPP方法检... 目的:检测家族性腺瘤性息肉病(familial adenomatous polyposis,FAP)家族成员MUTYH基因SNP4A点,为结直肠癌易感人群的筛检提供依据. 方法:应用PCR-SSCP及基因测序方法检测三个疑似FAP家系患者MUTYH基因SNP位点,PCR-CTPP方法检测中国医科大学附属第一医院结直肠癌组患者283例与对照组307患者血液DNA中MUTYHIVS1-5A〉CSNP突变位点的情况,分析其多态性与结直肠癌易感性的关系.结果:发现MUTYH基因3个SNP位点,分别为IVS1-5A〉C(A/C):IVS6+35A〉G(A/G,G/G)及C-G972C(Q335H)(G/C).结直肠癌患者中发生MUTYHIVS1-5A/C与MUTYHIVS1-5C/C突变的患者分别为11和2例,对照组中发生MUTYHIVS1-5A/C突变的患者为4例,但未发现MUTYHIVS1-5C/C纯合性突变.对照组中MUTYHIVS1-5A/C等位基因频率与结直肠癌组相比,有显著性差异(χ^2=7.43,P=0.006).MUTYHIVS1-5A〉C态性与结直肠癌易感性有相关性. 结论:MUTYHIVS1-5A〉C位点基因多态性在结直肠癌发生中起着作用,其对了解结直肠癌的发病机制及对高危人群的筛检具有重大意义. 展开更多
关键词 家族性腺瘤性息肉病 结直肠癌 MUTYH 基因 PCR-CTPP
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