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藏绵羊PPARα基因遗传变异特征及组织表达分析
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作者 张亚强 刘秀 +4 位作者 李少斌 王继卿 胡江 郝志云 罗玉柱 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期1519-1524,共6页
PPARα(Peroxisome proliferator activated receptorsα)基因参与调控线粒体脂肪酸β氧化,在能量代谢中具有重要作用,是动物高原低氧适应的主要候选基因之一。本研究采用PCR-SSCP和测序方法检测2个品种(藏绵羊,湖羊) PPARα基因P1区核... PPARα(Peroxisome proliferator activated receptorsα)基因参与调控线粒体脂肪酸β氧化,在能量代谢中具有重要作用,是动物高原低氧适应的主要候选基因之一。本研究采用PCR-SSCP和测序方法检测2个品种(藏绵羊,湖羊) PPARα基因P1区核苷酸变异及遗传特征。采用实时荧光定量PCR (quantitative real-time PCR, qRT-PCR)检测藏羊与湖羊心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、骨骼肌6个组织的相对表达量。检测表明:在扩增区域发现2个SNPs (c.515-22A>G, c.515-10C>T)对应的等位基因A、B。基因频率在2个群体间具有统计学意义(p<0.01),藏绵羊的优势基因型为AB,湖羊优势基因型为AA。推测AB基因型个体可能更有利于藏绵羊适应高原低氧环境,可作为藏绵羊低氧适应选育的分子标记。PPARα基因在2个绵羊的6个组织中均有不同程度的表达且具有品种间差异性。PPARα基因在藏绵羊心脏的表达量极显著的低于其余5个组织(p<0.01),而2个品种间,藏绵羊各组织的表达量均低于湖羊,其中在心脏、肝脏、肺脏3个组织表达量极显著的低于湖羊(p<0.01)。本研究可丰富绵羊基因组学内容,为藏绵羊低氧适应研究提供基础数据。 展开更多
关键词 PPARα基因 遗传特征 组织表达 适应性
山羊PPARα基因克隆、分子特性及组织差异表达分析 预览 被引量:1
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作者 饶辽源 周靖宣 +3 位作者 王林杰 李利 张红平 仲涛 《中国畜牧兽医》 北大核心 2018年第3期559-570,共12页
试验旨在克隆山羊过氧化物酶体增殖物激活受体α(peroxisome proliferators-activated receptors-alpha,PPARα)基因的CDS区序列,分析其编码蛋白的结构与功能,并探讨其在山羊不同组织中的表达模式。采用RTPCR方法扩增并克隆PPARα基因... 试验旨在克隆山羊过氧化物酶体增殖物激活受体α(peroxisome proliferators-activated receptors-alpha,PPARα)基因的CDS区序列,分析其编码蛋白的结构与功能,并探讨其在山羊不同组织中的表达模式。采用RTPCR方法扩增并克隆PPARα基因CDS编码区;通过在线软件对其一级结构、二级结构和三级结构进行生物信息学分析;利用基因序列和编码蛋白构建系统发育树,进行系统发育进化分析;采用实时荧光定量PCR方法检测PPARα基因在简州大耳羊心脏、肺脏、肝脏、肾脏、脾脏和网膜6个组织中的相对表达情况。结果表明,山羊PPARα基因CDS区全长1 413bp,结构稳定,共编码470个氨基酸。生物信息学分析发现,PPARα蛋白是一种结构较为稳定的带负电的亲水性蛋白,以α-螺旋和无规则卷曲为主,无信号肽和跨膜蛋白,属于膜内蛋白。蛋白序列中总共有49个磷酸化位点,9个糖基化位点。保守结构域中含有明显的DBD区域和LBD区域,蛋白结构高度保守。三级结构预测发现其蛋白结构主要为通过长链卷曲连接的2个明显不同的结构区域,结构均以helix螺旋为主。序列比对结果表明,山羊PPARα氨基酸序列与绵羊和牛的同源性最高。实时荧光定量检测结果表明,PPARα基因在肾脏和肝脏中表达量较高,显著高于其他组织(P〈0.05);在网膜组织和心脏中中度表达,显著高于肺脏和脾脏(P〈0.05);在肺脏和脾脏中相对低表达;说明山羊PPARα基因可能与体内脂肪氧化、脂质代谢和抗氧化应激等调控功能有关。试验结果为深入研究PPARα基因在山羊中的生理功能和调控机制奠定了理论基础。 展开更多
关键词 山羊 PPARα基因 克隆 生物信息学 差异表达
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畜禽PPARα基因研究进展 预览
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作者 王朝阳 蓝立明 +2 位作者 白丁平 张福君 李昂 《生物技术通报》 CSCD 北大核心 2018年第12期32-40,共9页
过氧化物酶体增殖物激活受体(Peroxisomeproliferator-activatedreceptors,PPARs)是核激素受体家族中的配体激活受体,控制许多细胞内的代谢过程,PPARα作为过氧化物酶体增殖物激活受体家族重要成员之一,是调控机体脂质代谢的重要枢纽,... 过氧化物酶体增殖物激活受体(Peroxisomeproliferator-activatedreceptors,PPARs)是核激素受体家族中的配体激活受体,控制许多细胞内的代谢过程,PPARα作为过氧化物酶体增殖物激活受体家族重要成员之一,是调控机体脂质代谢的重要枢纽,在调控畜禽机体肝脏脂质代谢方面有重要作用。PPARα基因由四个结构域组成,多在机体肝脏和脂肪组织中表达,可作为细胞核受体被外源和内源的特异性配体结合并激活,进而结合靶基因发挥对肝脏脂质代谢的调控作用。就PPARα基因的结构特点及表达模式、PPARα基因对肝脏脂代谢的调控机制,以及现阶段PPARα在畜禽方面的研究进展进行阐述,旨在引起人们对PPARα基因调控脂质代谢的关注,并为畜禽肝脏脂质代谢过程的机理研究和相关疾病的治疗提供一些理论支持。 展开更多
关键词 PPARα基因 核受体 肝脏 脂质代谢
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中国地方黄牛PPARα exon7基因多态性与生长性状的关联研究 预览 被引量:1
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作者 李芬 李荣荣 +3 位作者 张琼琼 李暑燕 马云 卢建雄 《中国牛业科学》 2016年第1期1-5,共5页
[目的]以期为我国地方黄牛生长性状分子育种提供理论依据。[方法]本研究以南阳牛、郏县红牛、鲁西牛和秦川牛4个品种共计424头中国地方黄牛为材料,以与牛脂肪代谢相关的基因PPARα为目标基因,利用生物信息学、PCR-RFLP结合DNA池测序等技... [目的]以期为我国地方黄牛生长性状分子育种提供理论依据。[方法]本研究以南阳牛、郏县红牛、鲁西牛和秦川牛4个品种共计424头中国地方黄牛为材料,以与牛脂肪代谢相关的基因PPARα为目标基因,利用生物信息学、PCR-RFLP结合DNA池测序等技术,对其第7外显子(PPARα_exon7)进行遗传特征分析,检测SNPs,并分析该序列的多态性与试验黄牛生长性状指标的相关性。[结果]发现在PPARα基因(AC_000162.1)exon7的164bp处发现了一处SNP(C/T),检测出CC和CT两种基因型。群体遗传分析显示, 展开更多
关键词 中国地方黄牛 PPARα基因 SNPS 关联分析
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鸡PPARα基因多态性与肉质性状关联的研究 被引量:2
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作者 武子寅 温彦涛 +3 位作者 黎寿丰 王杏龙 赵振华 李春苗 《中国家禽》 北大核心 2013年第7期9-12,共4页
为探究鸡过氧化物酶体激活增殖受体(PPARα)基因与其肉质性状的关系,采用PCR-SSCP对鸡PPARα编码区进行了sNPs检测,并通过测序验证。结果显示:P朋尺0基因编码区的630bp处有一个c—T的突变,导致所编码的210位氨基酸由ATC(异亮氨... 为探究鸡过氧化物酶体激活增殖受体(PPARα)基因与其肉质性状的关系,采用PCR-SSCP对鸡PPARα编码区进行了sNPs检测,并通过测序验证。结果显示:P朋尺0基因编码区的630bp处有一个c—T的突变,导致所编码的210位氨基酸由ATC(异亮氨酸)变成了ATT(异亮氨酸),发生同义突变,形成CC,CT和TT三种基因型。最小二乘方差分析显示,PPARα不饱和脂肪酸中的十六碳二烯酸含量上,TT型基因与CT型基因差异显著(尸〈0.05);在失水率上,CC基因型显著高于TT基因型(P〈0.05);在系水力上,TT和CT基因型均显著高于CC基因型(P〈0.05);在肌内脂肪含量方面,TT型显著高于CC型(P〈0.05)。提示P黝R港因的作用可能参与鸡的糖脂代谢和能量代谢,可作为筛选影响鸡肉质性状候选基因的依据。 展开更多
关键词 PPARα基因 多态性 肉质
PPARα基因对安卡×固始鸡资源群胴体品质的遗传效应分析 预览 被引量:5
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作者 田亚东 亢娟娟 +2 位作者 孙桂荣 韩瑞丽 康相涛 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2010年第6期 14-18,共5页
由793只安卡×固始鸡F2资源群为试验材料,采用PCR-SSCP技术和DNA测序的方法对PPARα基因的编码区进行SNP检测。结果发现,外显子4存在1个多态性位点,经限制性内切酶BspHⅠ酶切后显示出EE、EF、FF 3种基因型。利用SAS8.0软件分析不同... 由793只安卡×固始鸡F2资源群为试验材料,采用PCR-SSCP技术和DNA测序的方法对PPARα基因的编码区进行SNP检测。结果发现,外显子4存在1个多态性位点,经限制性内切酶BspHⅠ酶切后显示出EE、EF、FF 3种基因型。利用SAS8.0软件分析不同基因型对胴体品质的影响,结果表明,PPARα基因NC_006088:T32311C的多态性显著影响鸡的腹脂重和腹脂率(P〈0.05),而对屠体重、皮下脂肪厚、肌间脂肪带宽、半净膛重和全净膛重等无显著影响(P〉0.05)。EE型和EF型的腹脂重和腹脂率显著高于FF型(P〈0.05),而EE型和EF型之间无显著差异(P〉0.05)。PPARα基因影响脂肪代谢,可以作为分子标记用于鸡脂肪性状的分子标记辅助选择。 展开更多
关键词 F2资源群 PPARα基因 多态性 胴体品质
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COPD骨骼肌功能障碍与PPARα基因多态性关系研究 预览 被引量:7
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作者 龙翔宇 傅炜萍 +4 位作者 何大川 刘华 张剑青 舒敬奎 戴路明 《重庆医学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第18期 2406-2408,共3页
目的探讨过氧化物酶体增殖活化受体α(PPARα)基因的5个突变位点rs45550937(C/G)、rs45552534(A/G)、rs45576140(C/G)、rs45528736(A/G)、rs45576734(A/G)与慢性阻塞性肺疾病(COPD)骨骼肌功能障碍(SMD)患者的关系。方... 目的探讨过氧化物酶体增殖活化受体α(PPARα)基因的5个突变位点rs45550937(C/G)、rs45552534(A/G)、rs45576140(C/G)、rs45528736(A/G)、rs45576734(A/G)与慢性阻塞性肺疾病(COPD)骨骼肌功能障碍(SMD)患者的关系。方法采用多聚酶链反应(PCR)测序的方法,对昆明地区128例COPD患者和64例年龄匹配正常对照者的PPARα的上述5个位点进行分析。结果在正常对照者和COPD患者中PPARα的上述5个位点未发现有突变。结论 PPARα基因上述位点多态性与昆明地区COPD患者SMD无相关性。 展开更多
关键词 过氧化物酶体增殖活化受体α基因 多态性 慢性阻塞性肺疾病 骨骼肌功能障碍
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花鲈PPARα基因实时荧光定量PCR质粒标准品的构建 预览
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作者 方雯 钱云霞 《台湾海峡》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期 488-491,共4页
利用SYBR荧光定量PCR技术,制备用于花鲈(Lateolabrax japonicus)PPARα基因实时荧光定量PCR检测的质粒标准品.通过PCR扩增出目的片断344-bp,纯化后连接至pMDI8-T载体,转化宿主菌E.coli DH5α.通过PCR鉴定、双酶切鉴定和测序分... 利用SYBR荧光定量PCR技术,制备用于花鲈(Lateolabrax japonicus)PPARα基因实时荧光定量PCR检测的质粒标准品.通过PCR扩增出目的片断344-bp,纯化后连接至pMDI8-T载体,转化宿主菌E.coli DH5α.通过PCR鉴定、双酶切鉴定和测序分析后抽提重组质粒,测定其拷贝浓度,10倍梯度稀释成标准品模板10^8~10^4 copy/mm^3,进行荧光定量PCR分析.结果显示,循环阈值(Ct)与起始模板量的对数值之间有着良好的线性关系. 展开更多
关键词 海洋生物学 花鲈 PPARα基因 实时荧光定量PCR 重组质粒 标准品
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我国特有三个小型猪品系PPARα基因的多态性分析 预览 被引量:3
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作者 赵玉琼 姚春涛 +4 位作者 刘亚千 黄丽洁 赵亚力 赵权 陈华 《中国比较医学杂志》 2008年第10期 41-44,共4页
目的分析我国特有三个小型猪品系巴马小型猪、五指山小型猪,中国农大小型猪过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因exon5-intron5这段序列的单核苷酸多态性(SNPs)分布特点,为我国小型猪在糖尿病和代谢性疾病的研究中提供基础资... 目的分析我国特有三个小型猪品系巴马小型猪、五指山小型猪,中国农大小型猪过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因exon5-intron5这段序列的单核苷酸多态性(SNPs)分布特点,为我国小型猪在糖尿病和代谢性疾病的研究中提供基础资料。方法提取三个品系小型猪血液基因组DNA,以基因组DNA为模板,应用多聚合酶链式反应(PCR)技术在合成的特异性引物引导下扩增,将PCR产物纯化,然后进行测序,再将测序结果在NCBI中进行BLAST比对分析。结果测序结果显示:在PPARα基因exon 5-intron 5中存在12个单核苷酸位点,分别为83G→A,133C→T,134G→T,141C→G,146T→G,150T→G,179C→A,196C→T,205C→T,212C→T,218T→C,219T→C,其中只有83G→A这一单核苷酸突变位点位于编码区内,密码子TCA→TCG,氨基酸为Ser163Ser。结论在三个品系小型猪中PPARα基因多态位点的分布存在差异,表明小型猪的品种不同多态情况不同。 展开更多
关键词 小型猪 PPARα基因 单核苷酸多态性
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冠心病脂代谢紊乱的PPARα基因多态性研究 预览 被引量:1
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作者 张颖 雷红 邓幼平 《武汉大学学报:医学版》 CAS 2005年第1期 5-7,24,共4页
目的:研究过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因第5外显子L162V(CTT→GTT)多态性与关冠心病血脂水平的相关关系.方法:采用多聚酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法对湖北地区105例冠心病高脂血症患者及200例正常对照者P... 目的:研究过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因第5外显子L162V(CTT→GTT)多态性与关冠心病血脂水平的相关关系.方法:采用多聚酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法对湖北地区105例冠心病高脂血症患者及200例正常对照者PPARα基因L162V多态性进行研究.结果:PPARα基因L162V变异无统计学差异.冠心病高脂血症组中V162型总胆固醇(TC)水平较L162型高(P<0.05).结论:PPARα基因L162V多态性与本研究中国人冠心病血脂异常患者TC水平有关. 展开更多
关键词 PPARα基因 多态性 冠心病 脂代谢紊乱
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2型糖尿病患者PPARα基因多态性的研究 预览 被引量:4
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作者 张颖 雷红 邓幼平 《武汉大学学报:医学版》 CAS 2004年第4期 459-461,共3页
目的:探讨过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因第5外显子L162V(CTT→GTT)多态性与2型糖尿病(T2DM)的关系.方法:采用多聚酶联反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法对湖北地区100例T2DM患者及80例正常对照者PPARα基因L162V... 目的:探讨过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因第5外显子L162V(CTT→GTT)多态性与2型糖尿病(T2DM)的关系.方法:采用多聚酶联反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法对湖北地区100例T2DM患者及80例正常对照者PPARα基因L162V多态性进行研究.结果:在T2DM患者和正常对照者中未发现PPARα基因L162V变异.结论:PPARα基因L162V多态性与湖北地区T2DM不相关. 展开更多
关键词 PPARα基因 多态性 2型糖尿病
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中国荷斯坦牛PPAR-α基因多态性研究及其与耐热性能的关联分析 预览 被引量:3
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作者 方文良 黄金明 +7 位作者 王长法 鞠志花 李建斌 李荣岭 李琳 仲跻峰 何剑斌 李秋玲 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第8期165-170,共6页
本研究采用PCR方法扩增牛过氧化物酶增殖物激活受体(peroxisome proliferator-activated receptors,PPAR-α)基因的内含子3,获得589 bp的片段,利用DNA测序技术发现1个新SNP位点,即44087(G/A);同时利用PCR-RFLP技术对这该SNP位点进... 本研究采用PCR方法扩增牛过氧化物酶增殖物激活受体(peroxisome proliferator-activated receptors,PPAR-α)基因的内含子3,获得589 bp的片段,利用DNA测序技术发现1个新SNP位点,即44087(G/A);同时利用PCR-RFLP技术对这该SNP位点进行基因型分型,分别分析了771头中国荷斯坦牛、136头鲁西黄牛和37头渤海黑牛PPAR-α基因该位点的多态性。结果表明,在这3个群体中PPAR-α基因44087(G/A)位点普遍表现为GG基因型频率最高,优势等位基因为G;χ2适合性检验结果表明,该位点在中国荷斯坦牛和鲁西黄牛群体中都未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P〈0.05),在这个基因座位上均有丰富的多态信息含量。对中国荷斯坦奶牛44087(G/A)位点不同基因型与SCS、产奶性能及耐热性能进行最小二乘均值显著性检验结果表明,在PPAR-α基因该位点GA基因型是优良基因型,其个体的SCS值显著低于GG基因型(P〈0.05),并且GA基因型乳蛋白率显著高于GG基因型(P〈0.05),在炎热环境中产奶下降率显著低于GG基因型(P〈0.05)。由此分析GA基因型可能有利于提高中国荷斯坦奶牛的产奶性能。在人工选择的过程中,选择GA基因型的个体,可以降低热应激给奶牛带来的危害,同时又能够提高牛奶品质和产量。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 SNPS PPAR-α基因 多态性 PCR-RFLP
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鸭PPARα基因结构及功能的生物信息学分析 预览 被引量:4
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作者 马云 王云云 +3 位作者 张晓婷 李芬 王启钊 王新庄 《浙江大学学报:农业与生命科学版》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期 371-379,共9页
以鸭的过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因为研究对象,运用生物信息学方法对其编码的蛋白质结构、理化性质及功能结构域进行分析.结果表明:鸭的PPARα基因cDNA全长1 430 bp,最长开放阅读框为1 407 bp,编码468个氨基酸;序列比... 以鸭的过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因为研究对象,运用生物信息学方法对其编码的蛋白质结构、理化性质及功能结构域进行分析.结果表明:鸭的PPARα基因cDNA全长1 430 bp,最长开放阅读框为1 407 bp,编码468个氨基酸;序列比对结果显示鸭的PPARα基因与鸡、胸草雀、人、牛、家马等该基因的核苷酸序列同源性分别为96%、92%、79%、77%和78%,鸭PPARα基因编码的氨基酸序列与上述其他动物的同源性高达98%、97%、89%、89%和88%;系统进化分析结果显示,在鸡、胸草雀、人、牛、马等动物中,鸭的PPARα基因与鸡的进化关系最为密切,亲缘关系最近;鸭的PPARα蛋白中α螺旋较多,该蛋白质含有1段短的核定位信号序列KKNRNKC,在引导该蛋白质进入细胞核的过程中发挥作用,同时还有由2个锌指结构组成的DNA结合域及1段配体结合域. 展开更多
关键词 过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因 生物信息学分析
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牛过氧化物酶体增殖激活受体α(PPARα)基因第5外显子多态性与胴体、肉质性状的相关性 预览 被引量:6
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作者 樊月圆 昝林森 +1 位作者 王洪宝 付常振 《农业生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期 713-718,共6页
利用PCR-SSCP结合DNA测序方法对牛(Bostaurus)6个品种(秦川牛、南阳牛、郏县红牛、鲁西牛、安格斯和夏南牛)共计717个个体的过氧化物酶体增殖激活受体α(PPARα)基因第5外显子的SNP位点进行检测,并分析了该SNP位点与秦川牛的部分... 利用PCR-SSCP结合DNA测序方法对牛(Bostaurus)6个品种(秦川牛、南阳牛、郏县红牛、鲁西牛、安格斯和夏南牛)共计717个个体的过氧化物酶体增殖激活受体α(PPARα)基因第5外显子的SNP位点进行检测,并分析了该SNP位点与秦川牛的部分胴体、肉质性状的相关性。结果显示,在PPARα基因第5外显子的138bp处发生T→C突变。卡方检验结果显示,秦川牛和南阳牛处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P〈0.05);南阳牛、郏县红牛、安格斯和鲁西牛处于Hardy-Weinberg平衡状态(P〉0.05)。多态信息含量(PIC)显示,这6个品种均属于中度多态(0.25〈PIC〈0.50)。相关分析结果显示,在背膘厚和眼肌面积指标中AA型个体对于秦川牛肉质有显著影响(P〈0.05);而在系水力指标中BB型个体显著优于AA和AB型个体(P〈0.05)。这些结果提示,该位点突变可能是影响牛肉背膘厚、眼肌面积和系水力的主效QTN或与之紧密连锁,可作为肉牛产肉性状的辅助选择标记。 展开更多
关键词 过氧化物酶体增殖激活受体α(PPARα)基因 SNPS 肉质性状 分子标记
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小鼠过氧化物酶体增殖物激活受体α下游新靶基因PTG的克隆 预览
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作者 赵剑 韩云 朱应葆 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期 737-742,共6页
为了进一步研究过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)下游靶基因,应用基因芯片技术比较经过氧化物酶体增殖物(peroxisome proliferators,PPs)处理和未处理鼠肝RNA,获得经PPs处理而上调的一个EST(expressed sequence tag),C3f.用5'-... 为了进一步研究过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)下游靶基因,应用基因芯片技术比较经过氧化物酶体增殖物(peroxisome proliferators,PPs)处理和未处理鼠肝RNA,获得经PPs处理而上调的一个EST(expressed sequence tag),C3f.用5'-RACE法获得其全长cDNA,并命名为PTG.Northern法检测PTG的组织分布.结果显示,在小鼠心脏、肝脏、肾脏、睾丸等组织,PTG有高表达.Northern印迹检测AOX敲除的小鼠发现,PTG转录水平明显升高,而在Wy-14643处理的AOX/PPARα双敲除的小鼠没有发现升高.实时监测PPs处理小鼠肝脏PTG表达水平的变化,发现处理2h后,PTG表达水平提高了2倍,这说明PTG是PPARα的早期反应基因.利用PTG-EGFP表达质粒转染NIH3T3细胞,显示PTG蛋白定位于质膜下.进一步用Rab5a-EGFP和PTG-DsRed双定位载体共转染,结果表明,PTG蛋白定位于早期内吞体. 展开更多
关键词 PPARΑ PTG 基因克隆 基因定位 小鼠 过氧化物酶体
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