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基于SNP遗传图谱定位玉米雄穗分枝数和主轴长QTLs 预览
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作者 王赛 王宇宇 +7 位作者 王石磊 徐梦真 邹欢 侯清桂 毛棣 田磊 陈彦惠 吴连成 《河南农业大学学报》 CSCD 北大核心 2019年第5期671-676,共6页
以玉米雄穗分枝数差异显著的自交系豫086(分枝数多)和豫M 1-7(分枝数少)杂交获得F1,通过单粒传法获得含177个株系的F7 RIL群体。以玉米10 kb SNP芯片进行RIL群体基因分型,构建高密度遗传图谱,并利用QTL Cartographer 2.5对郑州和海南2... 以玉米雄穗分枝数差异显著的自交系豫086(分枝数多)和豫M 1-7(分枝数少)杂交获得F1,通过单粒传法获得含177个株系的F7 RIL群体。以玉米10 kb SNP芯片进行RIL群体基因分型,构建高密度遗传图谱,并利用QTL Cartographer 2.5对郑州和海南2个环境下玉米雄穗分支数(Tassel branch number,TBN)和玉米雄穗主轴长(Total tassel length,TTL)进行QTL分析。结果表明,构建的高密度遗传图谱覆盖玉米10条染色体,包含1 792个簇,覆盖基因组长度为2 109.45 cM,相邻簇之间平均距离为1.18 cM。在此图谱基础上采用复合区间作图法,在2个环境下共检测到了24个雄穗相关性状QTLs。其中7个与TBN相关QTL分布于第3, 8和10条染色体上,单个QTL的表型变异范围是6.74%~13.88%;其余17个为与TTL相关QTL,位于第1,3,5,6,8和9染色体上,单个QTL位点可解释5.59%~18.66%的表型变异。在2个环境下检测到了一个相同的TTL相关QTL位点(qTTL1-2)和2个既控制TBN又控制TTL的QTL位点(qTBN8郑州,qTTL8郑州;qTBN8-3海南,qTTL8海南)。 展开更多
关键词 玉米 QTL定位 雄穗分枝数 雄穗主轴长 玉米10 K SNP芯片
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甘蓝型油菜的花期与生育期QTL定位 预览
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作者 俎峰 赵凯琴 +5 位作者 张云云 田正书 刘亚俊 奚俊玉 束正齐 符明联 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期500-505,共6页
【目的】对甘蓝型油菜花期和生育期QTL进行定位,为精细定位和克隆早花基因及开展分子标记辅助早熟油菜品种选育提供理论依据。【方法】以极早熟甘蓝型油菜G28、甘蓝型油菜H008及以二者为亲本构建的175个F1DH株系为材料,利用甘蓝型油菜60... 【目的】对甘蓝型油菜花期和生育期QTL进行定位,为精细定位和克隆早花基因及开展分子标记辅助早熟油菜品种选育提供理论依据。【方法】以极早熟甘蓝型油菜G28、甘蓝型油菜H008及以二者为亲本构建的175个F1DH株系为材料,利用甘蓝型油菜60KSNP芯片分型技术绘制高密度遗传连锁图谱,并采用完备复合区间作图法对2016─2017年度丽江和临沧2个生长环境下甘蓝型油菜的花期(FT)和生育期(MT)田间调查数据进行QTL扫描分析。【结果】F1DH株系花期与生育期具有较明显的超亲现象,表明双亲材料控制花期和生育期的位点不同。F1DH株系在丽江生长环境下花期与生育期相关系数为0.63,在临沧生长环境下二者相关系数为0.79,即花期与生育期呈较高的正相关。利用SNP芯片构建的高密度遗传连锁图谱共包含19条连锁群,7601个SNPs位点,总长3838.2cM。在丽江和临沧2个生长环境下共检测到6个花期QTL和5个生育期QTL,分布于A02、A07、C02、C03、C06、C07和C09连锁群上,可分别解释2.96%~17.40%和4.98%~11.82%的遗传变异。花期QTLqFTA02-1和qFTC03-2在2生长个环境下均可检测到,加性效应值相反,其中qFTA02-1具有最高的LOD值(20.43)、贡献率(17.40%)和加性效应值(3.27d),且与生育期QTLqMTA02-1置信区间重叠,是最主要的花期主效QTL;qFTC03-2为次要的花期主效QTL。在qFTA02-1置信区间内发现2个拟南芥花期调控关键基因FLC和FY的油菜同源基因拷贝BnaA02g00370D和BnaA02g01670D。【结论】花期主效QTLqFTA02-1和qFTC03-2可用于分子标记辅助选育早熟油菜品种。BnaA02g00370D和BnaA02g01670D可能为qFTA02-1置信区间内控制甘蓝型油菜花期性状的目标基因。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 花期 生育期 QTL定位 SNP芯片
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大麦白粉病抗性的遗传分析与QTL定位 预览
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作者 费新茹 朱娟 +4 位作者 郭晖 郭红 吕超 郭宝健 许如根 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期888-893,共6页
为探究大麦白粉病抗性遗传,定位其抗性QTL,本研究以抗病品种Gairdner和感病品种扬饲麦1号杂交F1花药培养构建的DH群体及亲本为材料,对大麦白粉病抗性进行鉴定与遗传分析,并利用91对在亲本间多态性好的SSR标记构建了群体的遗传连锁图谱,... 为探究大麦白粉病抗性遗传,定位其抗性QTL,本研究以抗病品种Gairdner和感病品种扬饲麦1号杂交F1花药培养构建的DH群体及亲本为材料,对大麦白粉病抗性进行鉴定与遗传分析,并利用91对在亲本间多态性好的SSR标记构建了群体的遗传连锁图谱,采用Windows QTL IciMapping 4. 0软件中的完备区间-加性模型对大麦白粉病抗性QTL进行定位。结果表明,DH群体各系间存在丰富的大麦白粉病抗性遗传变异。共检测到5个与大麦白粉病抗性相关的QTLs。其中3个时期均检测到qPM-2Ha位于Bmag0711-AWBMS56区间,可解释的表型变异为7. 48%~12. 50%;qPM-4Ha位于EBmac0906-HVM68区间,可解释的表型变异为23. 07%~32. 09%;2个时期均检测到qPM-2Hb位于Bmag0749-GBM1475区间,可解释的表型变异为6. 22%~8. 13%。qPM-2Ha、qPM-4Ha及qPM-2Hb白粉病抗性基因均来源于抗病亲本Gairdner,qPM-3Ha和qPM-4Hb白粉病抗性基因来源于感病亲本扬饲麦1号,qPM-2Hb和qPM-3Ha可能是2个新的大麦白粉病抗性QTLs位点。本研究结果为大麦白粉病抗性基因的发掘、精细定位、克隆及分子标记辅助选择育种奠定了基础。 展开更多
关键词 大麦 DH群体 白粉病 QTL定位
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叶绿素含量相关QTL定位研究进展 预览
4
作者 叶景秀 柳海东 《青海大学学报:自然科学版》 2019年第4期55-60,共6页
叶绿素含量属于数量性状,利用QTL定位是对其性状进行分析的重要方法之一,有利于加快作物高光效育种进程。本文综述了QTL研究的主要策略和近年来叶绿素含量初步定位和精细定位工作研究进展以及存在的问题,并对未来的研究方向提出建议,以... 叶绿素含量属于数量性状,利用QTL定位是对其性状进行分析的重要方法之一,有利于加快作物高光效育种进程。本文综述了QTL研究的主要策略和近年来叶绿素含量初步定位和精细定位工作研究进展以及存在的问题,并对未来的研究方向提出建议,以期为今后深入开展叶绿素QTL定位研究及相关基因克隆研究和利用提供参考。 展开更多
关键词 QTL定位 分子标记 叶绿素 油菜
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中国小麦周8425B/中国春RIL群体成株抗叶锈基因的QTL定位 预览
5
作者 刘源 李在峰 《河北科技师范学院学报》 CAS 2019年第2期12-18,34共8页
为确定小麦叶锈病抗病基因的QTL检测及定位,找到能与抗病基因紧密连锁的分子标记,以小麦品种周8425B,中国春及其杂交获得的244个F 2∶8 RIL群体为试验材料,分别于2014~2015年在河北保定和河南周口进行了田间叶锈病病害严重度调查,获得... 为确定小麦叶锈病抗病基因的QTL检测及定位,找到能与抗病基因紧密连锁的分子标记,以小麦品种周8425B,中国春及其杂交获得的244个F 2∶8 RIL群体为试验材料,分别于2014~2015年在河北保定和河南周口进行了田间叶锈病病害严重度调查,获得了群体的表型数据,利用SNP标记和SSR标记进行基因分型,得到了群体基因型数据,运用软件Joinmap和QTL Ici Mapping 3.1进行连锁作图和QTL定位。结果找到2个QTL位点,分别位于2B,7D染色体上。 展开更多
关键词 小麦 叶锈病抗病基因 QTL定位
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玉米株高和穗位高的QTL定位 预览
6
作者 尤诗婷 邓策 +3 位作者 李会敏 吕蒙 李志敏 刘惠芬 《河南农业科学》 北大核心 2019年第6期20-25,共6页
为了鉴定株高、穗位高QTL的主效位点,利用高密度的SNP(单核苷酸多态性)连锁图谱和包含共同亲本的2个BC2F5群体,采用完备区间作图法对2个环境下的玉米株高和穗位高QTL进行分析。结果表明,BC2F5群体株高和穗位高存在广泛的变异;株高和穗... 为了鉴定株高、穗位高QTL的主效位点,利用高密度的SNP(单核苷酸多态性)连锁图谱和包含共同亲本的2个BC2F5群体,采用完备区间作图法对2个环境下的玉米株高和穗位高QTL进行分析。结果表明,BC2F5群体株高和穗位高存在广泛的变异;株高和穗位高性状受基因控制,同时受环境、基因型×环境互作的影响。在2个BC2F5群体中共检测到6个株高QTL和7个穗位高QTL,表型贡献率为8.36%~33.28%。影响株高、穗位高的主效QTLqPH2-2、qEH2-5均位于第2染色体Bin2.03~2.04区,表型贡献率分别为29.55%、31.86%。 展开更多
关键词 玉米 株高 穗位高 QTL定位
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陆地棉低世代群体纤维品质QTL定位及候选基因功能注释 预览
7
作者 乔文青 严根土 +5 位作者 石建斌 王宁 张亚林 许庆华 周红 黄群 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2019年第4期282-296,共15页
【目的】通过对纤维品质数量性状位点(Quantitative trait loci,QTLs)定位及其基因功能注释,为分子标记辅助育种提供理论依据。【方法】以2个纤维品质有差异的陆地棉品种(系)中棉所49和396289为亲本构建F2群体,以高密度遗传图谱为基础,... 【目的】通过对纤维品质数量性状位点(Quantitative trait loci,QTLs)定位及其基因功能注释,为分子标记辅助育种提供理论依据。【方法】以2个纤维品质有差异的陆地棉品种(系)中棉所49和396289为亲本构建F2群体,以高密度遗传图谱为基础,对3个环境的F2:3家系做包括细度和成熟度等在内的7个纤维品质性状QTLs定位,利用直系同源基因簇(Clusters of orthologous groups,COG)、基因本体(Gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)等数据库对QTLs做基因功能注释。【结果】获得157个与纤维品质有关的QTLs,分布于20条染色体上,A03、A04、D02、A11和D07等有较多性状的QTLs聚集,可能是控制纤维品质性状的关键染色体。共获得13个稳定QTLs,其中qFL-A03-1和qFin-A11-4在3个环境中重复出现,另有9个QTLs则在2个环境中重复出现。通过COG、GO和KEGG对QTLs进行基因功能注释,共获得4 763个候选基因,3个数据库分别注释到2 416、4 188和2 512个基因,在稳定QTLs中共注释到429个基因,其中一些基因可能与纤维品质关系密切。【结论】利用高通量测序获得的高密度遗传图谱有助于获得较多QTLs,有利于纤维品质相关候选基因的筛选及性状的改良,提高育种效率。 展开更多
关键词 陆地棉 纤维品质 QTL定位 基因注释
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重组自交系稻米品质性状的相关性分析及QTL定位 预览
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作者 秦钢 夏秀忠 +3 位作者 粟学俊 陈彩虹 梁曼玲 阎勇 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期703-709,共7页
[目的]分析重组自交系稻米品质性状的相关性,并对其进行数量性状座位(QTL)定位,为水稻品质性状遗传改良提供理论依据。[方法]以珍汕97B、柳沙油占202及二者杂交构建的174个重组自交系群体为材料,对12个稻米品质性状进行相关性分析和QTL... [目的]分析重组自交系稻米品质性状的相关性,并对其进行数量性状座位(QTL)定位,为水稻品质性状遗传改良提供理论依据。[方法]以珍汕97B、柳沙油占202及二者杂交构建的174个重组自交系群体为材料,对12个稻米品质性状进行相关性分析和QTL定位。[结果]3个稻米碾磨品质性状(出糙率、精米率和整精米率)间均呈极显著正相关(P<0.01,下同)。6个稻米外观品质性状中,除粒长与垩白率、垩白度和透明度间无显著相关性(P>0.05)外,其他性状间均呈极显著正或负相关。3个稻米蒸煮食味品质性状中,胶稠度与直链淀粉含量和碱消值呈极显著负相关。碾磨品质性状、外观品质性状和蒸煮食味品质性状间也存在不同程度相关性,如垩白粒率和垩白度与除粒长外的其他9个性状呈显著(P<0.05,下同)或极显著相关等。在第5和第6染色体上共检测出出糙率、精米率、粒宽、长宽比、垩白率、垩白度、直链淀粉含量、胶稠度和碱消值9个性状的11个QTL,其中9个QTL的表型变异贡献率大于10%,为主效QTL,且显著或极显著相关性状的QTL定位区域存在趋同现象。[结论]重组自交系群体12个稻米品质性状存在互作效应,与QTL定位结果相互印证。鉴定所得主效QTL可用于水稻稻米品质相关性状的遗传改良。 展开更多
关键词 水稻 重组自交系 品质性状 相关性分析 QTL定位
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水稻穗发芽性状的QTL定位 预览
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作者 杨锟 尚菲 +4 位作者 陈露露 孟凯文 晁旭 张友 王建飞 《扬州大学学报:农业与生命科学版》 CAS 北大核心 2019年第3期16-21,共6页
利用极易穗发芽的粳稻品系B1923与籼稻品种9311构建F2群体,采用模拟穗发芽方法测定发芽率,检测穗发芽QTL。结果表明:在F2群体中共检测到9个穗发芽QTL,分别定位在第1、2、3、4、7、11和12染色体。其中主效QTLqPHS-12位于第12染色体标记K4... 利用极易穗发芽的粳稻品系B1923与籼稻品种9311构建F2群体,采用模拟穗发芽方法测定发芽率,检测穗发芽QTL。结果表明:在F2群体中共检测到9个穗发芽QTL,分别定位在第1、2、3、4、7、11和12染色体。其中主效QTLqPHS-12位于第12染色体标记K44~W82之间,LOD值为20.68,贡献率为24.97%,高发芽率基因型来自B1923。针对qPHS-12构建BC1F2群体,进一步将qPHS-12定位在K44~K187之间。针对第1、2、7染色体的4个QTL,构建F2:3分离群体,QTL检测发现仅qPHS-2-2能重演。这一研究提示主效QTL qPHS-12在不同年份的2个世代间重演,能稳定遗传;因受遗传背景或不同年份环境条件的影响,穗发芽微效QTL在世代间重演性较差。 展开更多
关键词 水稻 穗发芽 QTL定位
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一个高抗玉米南方锈病基因的QTL定位及遗传分析 预览
10
作者 王兵伟 覃嘉明 +3 位作者 时成俏 郑加兴 覃永嫒 黄安霞 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期2033-2041,共9页
【目的】通过对一个热带高抗玉米南方锈病材料S313与4个高感玉米南方锈病材料组配的8个F2群体进行两年三季的遗传分析,在表型鉴定的基础上,利用其中1个F2群体进行局部遗传图谱构建及抗性基因定位,并利用大群体及新开发的分子标记对抗性... 【目的】通过对一个热带高抗玉米南方锈病材料S313与4个高感玉米南方锈病材料组配的8个F2群体进行两年三季的遗传分析,在表型鉴定的基础上,利用其中1个F2群体进行局部遗传图谱构建及抗性基因定位,并利用大群体及新开发的分子标记对抗性主效QTL进行精细定位,为进一步克隆该基因奠定基础。【方法】连续三季对8个F2分离群体,分3个时期进行病原菌接种,玉米生长后期按1—9级标准等级记载各单株的抗南方锈病级数,进行抗性表型鉴定,最终确定抗、感分离比例。利用56K芯片筛选出2个亲本间多态标记,选择其中均匀分布的192个标记对S313×PHW52的F2群体中各30个高抗、高感子代进行KASP分型。利用第10染色体短臂上19个SNP标记对整个F2群体进行分型,构建局部遗传图谱;将遗传图谱与田间抗性表型鉴定结果相结合进行抗性QTL定位。开发初定位区间内10个SNP标记对次级群体进行标记分型,根据交换单株数量大小进一步缩小定位区间。根据玉米B73RefGen_V4参考基因组信息,列出对应定位区间内的所有基因,利用基因的功能注释信息,确定可能与玉米抗南方锈病相关的候选基因。【结果】8个F2群体田间抗、感分离比均符合3﹕1的分离比例,说明热带自交系S313对玉米南方锈病的抗性是由1个效应比较大的主效QTL控制。利用56K芯片筛选出2个亲本间的多态标记16426个。利用192个标记对各30个抗、感子代进行连锁分析,获得了1个抗性连锁标记Affx-90241059。利用19个SNP标记构建了总遗传距离为31.8cM,标记间平均距离1.77cM的局部遗传图谱。利用复合区间作图法把该主效QTL定位在标记Affx-91298359与标记Affx-91182449之间,区间大小约2M。进一步利用F2大群体及10个SNP标记把该区间缩小到474K的范围内。玉米参考基因组B73的对应区间内共有63个基因,其中3个基因LOC103640657、LOC100191493、LOC103640673� 展开更多
关键词 玉米 南方锈病 抗性 QTL 定位
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大豆抗花叶病毒病QTL定位及其对花叶病毒病的响应 预览
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作者 武小霞 张清秀 +3 位作者 李淑萍 潘校成 陈庆山 刘春燕 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1-7,共7页
大豆花叶病毒病是造成黑龙江省大豆减产的主要病害之一。挖掘抗病基因、培育抗病品种是抵抗病害和保证大豆产量的有效途径。研究利用全基因组导入系群体(CSSLs)接种大豆花叶病毒SMV N1株系,基于bin map采用ICIM方法分析抗病相关基因QTL... 大豆花叶病毒病是造成黑龙江省大豆减产的主要病害之一。挖掘抗病基因、培育抗病品种是抵抗病害和保证大豆产量的有效途径。研究利用全基因组导入系群体(CSSLs)接种大豆花叶病毒SMV N1株系,基于bin map采用ICIM方法分析抗病相关基因QTL定位。获得分布在4号染色体上的3个QTL,分别为q-SMV-1、q-SMV-2和q-SMV-3,基因注释得到25个候选基因,其中Glyma.04G093800属于SUMO特异蛋白酶家族,具有去SUMO化作用。 展开更多
关键词 大豆 CSSLs群体 QTL定位 大豆花叶病毒
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基于黄褐棉导入系的棉花衣分QTL定位研究 预览
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作者 陈奇 周水娟 +7 位作者 孙康泰 刘静 袁宝童 王议萍 王为 王有武 汪保华 庄智敏 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第8期1735-1739,共5页
[目的]利用黄褐棉导入系(Introgression Lines,ILs),在构建分子遗传图谱的基础上,检测与衣分相关的数量性状位点(Quantitative Trait Locus,QTLs),以期发现黄褐棉中用于改良陆地棉的衣分QTL,服务于棉花产量的分子育种。[方法]以陆地棉PD... [目的]利用黄褐棉导入系(Introgression Lines,ILs),在构建分子遗传图谱的基础上,检测与衣分相关的数量性状位点(Quantitative Trait Locus,QTLs),以期发现黄褐棉中用于改良陆地棉的衣分QTL,服务于棉花产量的分子育种。[方法]以陆地棉PD94042为受体亲本,黄褐棉(Gossypium mustelinum)为供体亲本,两者杂交后代与陆地棉亲本回交,进而建立高世代回交群体并选择构建CSILs,通过种植黄褐棉CSILs,提取DNA展开微卫星标记(SSR)实验,构建遗传连锁图谱;并将所得基因型数据和表型数据相结合,用Win QTL Cart2.5软件开展导入系群体的衣分QTL定位。[结果]利用基于黄褐棉导入系的遗传图谱检测衣分QTL,成功检测到21个衣分相关QTLs,解释表型变异范围为19.3%~42%。其中,主效QTL qLP-3在2个环境中均被检测到,其增效基因均来自于黄褐棉,因此可能对标记辅助选择有重要意义。[结论]利用黄褐棉导入系群体成功鉴定出21个衣分相关的QTLs,该结果为棉花衣分分子标记辅助育种工作提供了借鉴及依据,也为后续进一步开展QTL精细定位奠定了基础。 展开更多
关键词 黄褐棉导入系 衣分 遗传图谱 QTL定位
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小麦冬前最大分蘖期根数的QTL定位 预览
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作者 彭涛 尹国红 +5 位作者 成东梅 于金林 赵伟峰 高燕 田纪春 邓志英 《河南农业科学》 北大核心 2019年第8期27-33,共7页
为了研究小麦冬前最大分蘖期根数的分子遗传基础,以小麦加倍单倍体(DH)群体(花培3号×豫麦57)的168个株系为材料,测定3个不同生长环境下DH群体的初生根数、次生根数和总根数,利用已经构建的DH群体遗传连锁图谱,采用基于混合线性模... 为了研究小麦冬前最大分蘖期根数的分子遗传基础,以小麦加倍单倍体(DH)群体(花培3号×豫麦57)的168个株系为材料,测定3个不同生长环境下DH群体的初生根数、次生根数和总根数,利用已经构建的DH群体遗传连锁图谱,采用基于混合线性模型的复合区间作图法对冬前最大分蘖期根数进行了QTL定位分析。结果表明,共检测到控制初生根数、次生根数、总根数3个性状的7个加性效应QTL和7对上位性互作QTL,分布在1B、2B、2D、3B、4A、4D、5D、6B、6D、7D染色体上,单个QTL可以解释4.67%~16.56%的遗传变异;在1B染色体上的Xwmc406-Xbarc156区间,检测到控制次生根数、总根数的QTL,表现出一因多效或紧密连锁效应,2个主效QTLqSrn1B和qRtn1B分别解释次生根数和总根数表型变异的16.56%和12.80%,可用于小麦根系性状的分子标记辅助选择。 展开更多
关键词 小麦 冬前最大分蘖期 初生根 次生根 DH群体 QTL定位
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小麦材料CH7034中成株期抗白粉病QTL定位
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作者 李欣 张晓军 +6 位作者 乔麟轶 刘成 郭慧娟 李锐 梅超 张树伟 畅志坚 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期3960-3965,共6页
小麦生长过程中常因白粉病侵扰而造成产量和品质损失,发掘新抗源、鉴定新位点是小麦品种抗性改良的基础。CH7034是本实验室选育的一份抗白粉病材料。本研究利用芯片技术对CH7034与感病品种SY95-71的重组自交系(recombinant inbred lines... 小麦生长过程中常因白粉病侵扰而造成产量和品质损失,发掘新抗源、鉴定新位点是小麦品种抗性改良的基础。CH7034是本实验室选育的一份抗白粉病材料。本研究利用芯片技术对CH7034与感病品种SY95-71的重组自交系(recombinant inbred lines, RIL)群体进行扫描,结合3年成株抗白粉病鉴定数据,鉴定出5个QTL-Pm,之后开发SSR标记对主效位点QPm.sac-2B.1 (表型变异解释率为30.6%~33.6%)进行图谱加密,进一步将其定位在小麦2B染色体长臂683 034 934~703 889 622基因组区段内,侧翼标记为X2BL-NRM12和X2BL-NRM17。本研究结果为小麦抗病育种提供了新抗源和可用于PCR检测的常规分子标记。 展开更多
关键词 小麦(Triticum AESTIVUM L.) 白粉病 成株抗性 DArT标记 QTL定位
水稻黑条矮缩病抗性QTL定位 预览
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作者 刘江宁 王楚鑫 +5 位作者 张宏根 缪一栩 高海林 许作鹏 刘巧泉 汤述翥 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1664-1671,共8页
发掘水稻黑条矮缩病的抗性基因有助于抗病品种的选育,减少黑条矮缩病对水稻生产的危害。本研究构建了包含222个家系的L5494/IR36重组自交系群体。对该群体进行黑条矮缩病的田间诱发鉴定,抗性亲本IR36发病率为28.70%,感病亲本L5494发病率... 发掘水稻黑条矮缩病的抗性基因有助于抗病品种的选育,减少黑条矮缩病对水稻生产的危害。本研究构建了包含222个家系的L5494/IR36重组自交系群体。对该群体进行黑条矮缩病的田间诱发鉴定,抗性亲本IR36发病率为28.70%,感病亲本L5494发病率为84.26%,群体发病率范围为11.21%~89.81%。利用134对分子标记构建覆盖12条染色体的遗传连锁图谱,总遗传距离为1475.97cM,平均标记间距为11.1cM。利用QTL IciMapping 4.0对抗黑条矮缩病QTL进行分析,共检测到4个QTL,其中第1、第2、第9染色体上QTL的表型贡献率分别为12.64%、16.00%和8.43%,抗病等位基因来自抗病亲本IR36;第6染色体上QTL的表型贡献率为10.82%,抗病等位基因来自感病亲本L5494。在此基础上,利用93-11为供体、日本晴为背景的近等基因系材料,在qRBSDV-1定位区间内检测到来自93-11的抗性QTL。本研究结果为水稻黑条矮缩病抗性基因定位及分子标记辅助选择育种提供借鉴。 展开更多
关键词 水稻黑条矮缩病 重组自交系 QTL定位
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基于90K芯片SNP标记的小麦遗传图谱构建及抗纹枯病QTL定位 预览
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作者 崔德周 李永波 +3 位作者 樊庆琦 隋新霞 黄承彦 楚秀生 《山东农业科学》 2019年第2期13-17,共5页
为挖掘定位小麦抗纹枯病QTL,以莱州953×山农辐63的F2∶3为作图群体,用IlluminaWheat90K芯片检测F2单株的基因型,并用QTLIciMapping4.1软件绘制该群体的遗传连锁图谱;在自然发病条件下,鉴定分离群体的抗、感表型,利用QTLIciMapping... 为挖掘定位小麦抗纹枯病QTL,以莱州953×山农辐63的F2∶3为作图群体,用IlluminaWheat90K芯片检测F2单株的基因型,并用QTLIciMapping4.1软件绘制该群体的遗传连锁图谱;在自然发病条件下,鉴定分离群体的抗、感表型,利用QTLIciMapping4.1进行抗纹枯病QTL定位分析。结果表明,构建的小麦遗传连锁图谱包含21个连锁群,覆盖了小麦的21条染色体,图谱总长度5528.12cM,平均图距5.25cM;共检测到6个分布于小麦1A、1B、2A、3A、7A和7D染色体上的加性QTL位点,单个QTL的贡献率为3.24%~10.37%。该结果可为小麦抗纹枯病QTL精细定位与相关基因克隆奠定基础,也为小麦抗纹枯病分子标记辅助选择育种提供了理论依据。 展开更多
关键词 小麦 遗传连锁图谱构建 纹枯病 QTL定位 90K芯片SNP标记
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油菜开花期的遗传调控及QTL研究进展 预览
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作者 李新 肖麓 杜德志 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期283-291,共9页
油菜开花期影响油菜的成熟期和产量,是重要的农艺性状。目前国内外学者对油菜开花期已经展开了深入研究。本文主要从模式植物拟南芥开花期的遗传调控、油菜开花期性状QTL定位、油菜开花基因克隆等方面阐述研究进展,并指出目前存在的问... 油菜开花期影响油菜的成熟期和产量,是重要的农艺性状。目前国内外学者对油菜开花期已经展开了深入研究。本文主要从模式植物拟南芥开花期的遗传调控、油菜开花期性状QTL定位、油菜开花基因克隆等方面阐述研究进展,并指出目前存在的问题和对油菜开花期性状研究进行展望,以期对开花期QTL精细定位、基因克隆和分子标记辅助选择提供理论依据。 展开更多
关键词 油菜 开花期 QTL定位 基因克隆
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基于水稻染色体片段代换系的苗期耐低氮QTL分析 预览
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作者 贾佩陇 李彪 +3 位作者 黎明辉 刘剑镔 李容柏 罗继景 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期16-24,共9页
[目的]通过定位与水稻Oryza sativa耐低氮相关的数量性状位点(QTL),为今后相关基因的精细定位、克隆以及功能研究奠定基础,也为耐低氮水稻品种的培育提供理论参考。[方法]以Koshihikari(受体)和Nona Bokra(供体)为亲本构建的全基因组单... [目的]通过定位与水稻Oryza sativa耐低氮相关的数量性状位点(QTL),为今后相关基因的精细定位、克隆以及功能研究奠定基础,也为耐低氮水稻品种的培育提供理论参考。[方法]以Koshihikari(受体)和Nona Bokra(供体)为亲本构建的全基因组单片段代换系作为研究材料,在水稻苗期进行低氮胁迫处理,对水稻株高、根长、根鲜质量、根干质量、茎叶鲜质量、茎叶干质量、总鲜质量、总干质量共8个表型进行相对损失比分析和QTL定位。[结果]定位到2个与水稻低氮胁迫耐受相关的位点,分别是qRL1-1和qRFW2-1,这2个QTL位点分别在低氮胁迫下控制水稻根长和根鲜质量。其中,qRL1-1定位于1号染色体M1-29标记附近,LOD值为2.89,可解释的表型变异为11.23%;qRFW2-1定位于2号染色体M2-225标记附近,LOD值为2.53,可解释的表型变异为9.90%。其他6个表型未检测到相关位点。[结论]初步定位了与低氮胁迫下控制水稻根长、根鲜质量相关基因,为进一步的基因精细定位奠定基础。 展开更多
关键词 水稻 单片段代换系 苗期 耐低氮 QTL定位
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小麦株高和旗叶相关性状的QTL定位 预览
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作者 王盈 赵磊 +3 位作者 董中东 任妍 张宁 陈锋 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期761-767,共7页
合理的株型对提高小麦产量、品质、抗性以及光能利用效率具有重要作用。为了实现小麦株型相关QTLs的精细定位和定向改良,本研究以普通小麦品系Shanghai 3/Catbird和Naxos为亲本创制的F10代重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)为... 合理的株型对提高小麦产量、品质、抗性以及光能利用效率具有重要作用。为了实现小麦株型相关QTLs的精细定位和定向改良,本研究以普通小麦品系Shanghai 3/Catbird和Naxos为亲本创制的F10代重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)为材料,于2016年和2017年分别在郑州和原阳两地进行表型鉴定,对株高、旗叶长和旗叶宽等株型相关性状进行QTL定位。结合覆盖全基因组的基因型检测结果,利用基于完备区间作图法的QTL IciMapping软件进行遗传连锁图谱构建及QTL分析,共鉴定到3个在多个环境下稳定存在的株型相关性状的新QTLs,分别位于6A和2B染色体上,命名为Qph-6A、Qfll-6A和Qflw-2B,单个QTL在不同环境中可分别解释表型变异的8.33%~13.93%、8.10%~8.18%和9.14%~9.46%。 展开更多
关键词 小麦 株高 旗叶性状 重组自交系 QTL定位
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冰草蛋白质含量等4个重要性状的QTL定位研究 预览
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作者 杨东升 于卓 +3 位作者 于肖夏 李佳奇 吴国芳 牛亚青青 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期775-782,共8页
为深入开展冰草优异基因的图位克隆、精细定位及标记辅助育种,以四倍体杂交冰草246个F2群体分离单株及其亲本为材料,在前期已构建出的冰草高密度分子遗传连锁图谱基础上进行了粗蛋白质含量、粗脂肪含量、茎叶比及单株产量4个重要性状的... 为深入开展冰草优异基因的图位克隆、精细定位及标记辅助育种,以四倍体杂交冰草246个F2群体分离单株及其亲本为材料,在前期已构建出的冰草高密度分子遗传连锁图谱基础上进行了粗蛋白质含量、粗脂肪含量、茎叶比及单株产量4个重要性状的QTL定位分析。结果发现,在连锁系数LOD阈值>2.0条件下,4个被测性状共检测到37个QTLs,14个连锁群上均有分布,其遗传贡献率变化范围为6.1%~37.8%。在37个QTLs中,控制粗蛋白质含量性状的有6个,控制粗脂肪含量性状的有9个,控制茎叶比性状的有12个,控制单株产量性状的有10个。 展开更多
关键词 冰草 重要性状 分子标记 QTL定位
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