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Species-specific COI primers for rapid identification of a globally significant invasive pest, the cassava mealybug Phenacoccus manihoti Matile-Ferrero 预览
1
作者 WANG Yu-sheng TIAN Hu +1 位作者 WAN Fang-hao ZHANG Gui-fen 《农业科学学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第5期1042-1049,共8页
The globally invasive cassava mealybug Phenacoccus manihoti Matile-Ferrero is a pernicious pest of cassava,and its recent introduction into Asia has raised considerable alarm.To slow or prevent further invasion,an acc... The globally invasive cassava mealybug Phenacoccus manihoti Matile-Ferrero is a pernicious pest of cassava,and its recent introduction into Asia has raised considerable alarm.To slow or prevent further invasion,an accurate,simple,and developmental-stage-independent detection method for P.manihoti is required.In the present study,a PCR method based on a species-specific mitochondrial DNA cytochrome oxidase I(SS-COI)marker was developed for rapid identification of P.manihoti.One pair of SS-COI primers(PMSSZW-1F and PMSSZW-1R)was designed based on sequence variations in the COI gene among P.manihoti and related mealybug species.Specificity of the primer pair was validated on 21 closely related species.Sensitivity tests were performed on four immature developmental stages and female adults.Efficacy tests demonstrated that at the relatively low concentration of(135.2±14.7)pgresuspended DNA,the specific fragment was detected in all replicates.Furthermore,the SS-COI primer pair was assayed on three populations of P.manihoti from major exporting countries of cassava.The PCR assay was proved to be a rapid,simple,and reliable molecular measure for the identification of P.manihoti.This tool will be useful for quarantine,monitoring,and management of this invasive pest. 展开更多
关键词 Phenacoccus manihoti CASSAVA MEALYBUG invasive pest molecular identification SPECIES-SPECIFIC COI PRIMERS
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桑树桑黄与杨树桑黄的分子辨别 预览
2
作者 宋吉玲 陆娜 +5 位作者 王伟科 袁卫东 李海波 程俊文 亢学平 闫静 《四川大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期765-770,共6页
为准确鉴别桑黄(Sanghuangporus)近缘种桑树桑黄(S.sanghuang)与杨树桑黄(S.vaninii)、暴马桑黄(S.baumii),本研究基于核糖体基因rDNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列分析技术,对桑黄真菌进行了系统发育分析与近缘... 为准确鉴别桑黄(Sanghuangporus)近缘种桑树桑黄(S.sanghuang)与杨树桑黄(S.vaninii)、暴马桑黄(S.baumii),本研究基于核糖体基因rDNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列分析技术,对桑黄真菌进行了系统发育分析与近缘种的分子辨别研究.结果表明,在NJ系统发育树上,23个桑树桑黄、11个杨树桑黄和6个暴马桑黄菌株各自以很高的Bootstrap支持率聚为了三个独立的分支,种间差异明显.依据桑树桑黄和杨树桑黄的rDNA ITS序列差异,设计两对引物Sv_U1/Sv_L和Sv_U2/Sv_L,均可特异性地扩增杨树桑黄478 bp和651 bp的ITS片段,而不扩增桑树桑黄的ITS片段,因而可用于两个桑黄近缘种的快速分子辨别.本研究为探讨桑黄孔菌属真菌的系统发育关系提供了参考,并为桑黄种间的准确辨别提供了一种有效的分子辅助手段. 展开更多
关键词 桑黄 鉴别 分类 内转录间隔区 特异性引物
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耐酸乳酸杆菌物种特异性引物设计及其在古井贡酒窖泥酒醅质量评价中的初步应用 预览
3
作者 刘倩倩 李俊薇 +4 位作者 曹润洁 张会敏 何宏魁 李安军 张治洲 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期16-22,共7页
古井贡酒的酿造过程中,窖泥和酒醅中发现大量耐酵乳杆菌(Lactobacillus acetotolerans),对该菌快速特异性检测非常重要。该文利用L. acetotolerans菌及大量Lactobacillus类似菌种的全基因组序列与PRIMERBLAST方法,设计了几对L. acetotol... 古井贡酒的酿造过程中,窖泥和酒醅中发现大量耐酵乳杆菌(Lactobacillus acetotolerans),对该菌快速特异性检测非常重要。该文利用L. acetotolerans菌及大量Lactobacillus类似菌种的全基因组序列与PRIMERBLAST方法,设计了几对L. acetotolerans特异性引物,其中2对经过系列验证具有较好的特异性,可结合QPCR技术对不同质量和不同发酵阶段的窖泥进行L. acetotolerans含量的快速检测。结果表明,古井贡酒窖泥中L. acetotolerans含量总体明显低于酒醅,老窖泥中L. acetotolerans含量总体明显低于新窖池窖泥;而酒醅中老厂区和新厂区L. acetotolerans含量平均来看都很高,但样本之间存在明显波动。所用L. acetotolerans特异性引物可对浓香型白酒发酵样本中L. acetotolerans的相对含量测定并辅助评估窖泥酒醅质量。 展开更多
关键词 LACTOBACILLUS acetotolerans 古井贡酒 特异性引物 窖泥 酒醅
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基于实时荧光定量PCR技术监测四川工业泡菜发酵过程中主要细菌的变化 预览 被引量：2
4
作者 张亚豪 梁会朋 +2 位作者 常聪 尹礼国 张文学 《中国调味品》 北大核心 2018年第1期35-38,47共5页
采用实时荧光定量PCR（qPCR）技术对四川工业泡菜发酵过程中变形菌门、厚壁茼门、乳杆菌属、盐单胞菌属、假单胞菌属和孤菌属的数量变化进行了检测。结果表明：变形菌门是泡菜发酵前期的优势菌门，而发酵中期和后期的优势菌门为厚壁菌... 采用实时荧光定量PCR（qPCR）技术对四川工业泡菜发酵过程中变形菌门、厚壁茼门、乳杆菌属、盐单胞菌属、假单胞菌属和孤菌属的数量变化进行了检测。结果表明：变形菌门是泡菜发酵前期的优势菌门，而发酵中期和后期的优势菌门为厚壁菌门；在整个发酵过程中，乳杆菌属的含量呈现出明显的增加，假单胞菌属的含量有所降低，盐单胞菌属和弧菌属的含量均基本保持不变。该结果为四川泡菜工业化生产提供了一定的理论基础。 展开更多
关键词 四川工业泡菜 细菌 特异性引物 实时荧光定量PCR 数量变化
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烟草野火病菌特异性检测引物筛选及应用 预览
5
作者 陈瑞朋 卢凯 +5 位作者 张敏 刘元德 宗浩 牛纪军 刘文涛 徐后娟 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2018年第1期72-76,共5页
烟草野火病是山东烟区主要的细菌性病害之一，为了能够对该病害进行精确、快速的分子鉴定，本研究从NCBI基因组数据库中下载了假单胞菌属25个不同菌种和127个丁香假单胞菌属不同致病变种的全基因组数据，利用Mauve 2.3.1进行全基因组比... 烟草野火病是山东烟区主要的细菌性病害之一，为了能够对该病害进行精确、快速的分子鉴定，本研究从NCBI基因组数据库中下载了假单胞菌属25个不同菌种和127个丁香假单胞菌属不同致病变种的全基因组数据，利用Mauve 2.3.1进行全基因组比对，获得丁香假单胞菌烟草致病变种特异性区段。在此基础上利用Primer Premier 6.0进行引物设计，筛选出了一对丁香假单胞菌烟草致病变种的特异性检测引物40429。利用7株山东不同烟区的烟草野火病菌和4株分别来自于贵州、湖北、福建及云南的烟草野火病菌进行了该引物的适用性验证，结果表明该引物均可扩增得到大小为203 bp的单一目的条带。说明该引物对于烟草野火病菌的检测具有良好的适用性，可以用于野火病菌的分子鉴定。 展开更多
关键词 烟草野火病 丁香假单胞菌烟草致病变种 特异性引物 分子鉴定
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基于PCR的冬虫夏草检测方法研究
6
作者 梁恒兴 王巍 +3 位作者 段庆梓 张彪 尚柯 张玉 《中药材》 北大核心 2018年第3期546-550,共5页
目的:建立基于PCR的冬虫夏草真伪检测方法。方法:对冬虫夏草及其伪品的序列进行比对分析,在ITS区设计了冬虫夏草的特异性引物,并通过对PCR反应条件的优化,建立了冬虫夏草与常见伪品的PCR检测方法。结果:建立了冬虫夏草真伪鉴别的PCR检... 目的:建立基于PCR的冬虫夏草真伪检测方法。方法:对冬虫夏草及其伪品的序列进行比对分析,在ITS区设计了冬虫夏草的特异性引物,并通过对PCR反应条件的优化,建立了冬虫夏草与常见伪品的PCR检测方法。结果:建立了冬虫夏草真伪鉴别的PCR检测方法,并利用该方法对采集的虫草样品进行检测,实现了冬虫夏草与伪品的准确鉴别。结论:该方法操作简单、特异性强、重复性好。 展开更多
关键词 冬虫夏草 伪品 ITS 特异性引物 PCR
柑橘黑斑病菌的分子检测技术研究 预览
7
作者 王兴红 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第5期130-135,共6页
为了快速区分柑橘黑斑病菌、亚洲柑橘叶点霉菌、首都叶点霉菌和中国柑橘叶点霉菌,在ITS1和18S区域设计了针对柑橘黑斑病菌、首都叶点霉菌和中国柑橘叶点霉菌的上游引物,以ITS4作为下游引物,并对所设计引物的特异性和退火温度进行了筛选... 为了快速区分柑橘黑斑病菌、亚洲柑橘叶点霉菌、首都叶点霉菌和中国柑橘叶点霉菌,在ITS1和18S区域设计了针对柑橘黑斑病菌、首都叶点霉菌和中国柑橘叶点霉菌的上游引物,以ITS4作为下游引物,并对所设计引物的特异性和退火温度进行了筛选,对引物的灵敏度进行了验证,并进行了果园疑似病斑的检测。结果表明,在退火温度为60℃时,引物Pc1/ITS4仅能从柑橘黑斑病菌中扩增出593 bp的特异性条带,引物Pct4/ITS4仅能从首都叶点霉菌中扩增出551 bp的条带,引物Pcc1/ITS4仅能从中国柑橘叶点霉菌中扩增出706 bp的条带,不能从柑橘常见病害病原菌中扩增出任何条带。特异性引物的灵敏度检测结果表明,引物Pc1/ITS4和Pct4/ITS4的检测灵敏度为200 pg,引物Pcc1/ITS4的检测灵敏度为20 pg。筛选的特异性引物Pc1/ITS4可以对果园疑似柑橘黑斑病病斑进行检测。因此,利用设计的特异性引物Pc1/ITS4、Pct4/ITS4和Pcc1/ITS4,结合简单的病原菌基因组DNA提取方法,可以在短时间内完成对病原菌的分子检测。 展开更多
关键词 柑橘黑斑病 柑橘黑斑病菌 中国柑橘叶点霉菌 首都叶点霉菌 特异性引物
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5种仓储豆象的分子鉴定和检测 预览 被引量：1
8
作者 刘昌燕 李莉 +1 位作者 焦春海 万正煌 《植物保护》 CSCD 北大核心 2017年第4期120-124,共5页
本研究以在检疫中经常被截获的5种豆象为研究对象,通过对GenBank中5种豆象mtDNA COⅠ序列的查询,并进行序列比对,共设计了30对引物,通过筛选获得5对能分别鉴定5种豆象的特异引物,并用50、25、10、5、1、0.5、0.1、0.05ng/μL 8个不同浓... 本研究以在检疫中经常被截获的5种豆象为研究对象,通过对GenBank中5种豆象mtDNA COⅠ序列的查询,并进行序列比对,共设计了30对引物,通过筛选获得5对能分别鉴定5种豆象的特异引物,并用50、25、10、5、1、0.5、0.1、0.05ng/μL 8个不同浓度系列的豆象DNA模板来检测灵敏度,结果表明,豌豆象和四纹豆象特异引物对的灵敏度为0.1ng/μL,蚕豆象、菜豆象和绿豆象特异引物对的灵敏度为0.5ng/μL。该方法可用于快速准确地鉴定5种豆象,对于豆象类害虫的检测监测具有重要意义。 展开更多
关键词 豆象科 MTDNA COⅠ基因 特异引物 分子鉴定
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利用多重PCR诊断水稻白叶枯病和细菌性条斑病的复合发生 被引量：3
9
作者 李云飞 陈雪娇 +5 位作者 杨雪 张爱芳 谷春艳 高同春 陈雨 姚剑 《植物检疫》 北大核心 2016年第1期48-52,共5页
为准确检测水稻白叶枯病菌、细菌性条斑病菌及这两种病菌的复合发生,利用软件DNAStar分析比较这两种菌的部分核酸序列,设计了检测这两种病菌的特异性引物。引物Xoo F-Xoo R能特异性扩增出水稻白叶枯病菌中一条大小162 bp的条带;引物Xooc... 为准确检测水稻白叶枯病菌、细菌性条斑病菌及这两种病菌的复合发生,利用软件DNAStar分析比较这两种菌的部分核酸序列,设计了检测这两种病菌的特异性引物。引物Xoo F-Xoo R能特异性扩增出水稻白叶枯病菌中一条大小162 bp的条带;引物Xooc F1-Xooc R1和Xooc F2-Xooc R2能够分别特异性扩增出水稻细菌性条斑病菌中690 bp和945 bp的条带。通过优化PCR反应条件,成功建立了多重PCR技术,可以对不同国家的水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌进行准确检测,对由这两种病菌引起的复合侵染实现了准确诊断。 展开更多
关键词 水稻白叶枯病菌 水稻细菌性条斑病菌 特异性引物 多重PCR 复合侵染
阿胶的半巢式-多重PCR鉴别方法研究 预览 被引量：2
10
作者 张慧 孙海新 +2 位作者 许娜 黄金发 孙丕春 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2016年第17期103-106,共4页
采用半巢式-多重PCR(聚合酶链式反应)法鉴别阿胶中是否掺杂有马、猪和牛源性成分。首先采用液氮研磨法从阿胶中提取高质量的DNA(脱氧核糖核酸),以通用引物P1和P2进行第一轮扩增,并将扩增产物作为第二轮PCR的模板;再以包含通用引物P1和4... 采用半巢式-多重PCR(聚合酶链式反应)法鉴别阿胶中是否掺杂有马、猪和牛源性成分。首先采用液氮研磨法从阿胶中提取高质量的DNA(脱氧核糖核酸),以通用引物P1和P2进行第一轮扩增,并将扩增产物作为第二轮PCR的模板;再以包含通用引物P1和4种物种(驴、马、猪和牛)特异性引物A、B、C和D的混合引物进行第二轮多重PCR扩增;最后电泳检测第二轮扩增产物,根据电泳条带的分子量大小,判断阿胶产品的动物原材料是否掺假。结果表明,采用本方法可观察到不同动物DNA分子量之间的明显差异,通过DNA电泳结果直接判断阿胶产品中是否掺假。 展开更多
关键词 半巢式-多重PCR法 阿胶 鉴别 通用引物 特异性引物
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实时荧光定量PCR定潜伏侵染目目检测山核桃干腐病病菌方法的建立 预览 被引量：1
11
作者 朱致翔 时浩杰 +1 位作者 雷飞斌 张传清 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期364-368,共5页
由茶麋子葡萄座腔菌Botryosphaeria dothidea引起的山核桃Carya cathayensis干腐病是山核桃栽培过程中的主要病害，该病菌表现明显的“潜伏侵染＂特性。研究山核桃树体中干腐病菌的定量检测技术对山核桃干腐病的预测预报及科学防治具有... 由茶麋子葡萄座腔菌Botryosphaeria dothidea引起的山核桃Carya cathayensis干腐病是山核桃栽培过程中的主要病害，该病菌表现明显的“潜伏侵染＂特性。研究山核桃树体中干腐病菌的定量检测技术对山核桃干腐病的预测预报及科学防治具有重要的指导意义。根据茶麋子葡萄座腔菌的EF／α基因设计特异性引物，通过普通聚合酶链式反应（PCR）和实时荧光定量PCR（real-timePCR）扩增发现引物EFRT-F1／R1对山核桃干腐病病菌的特异性及扩增效率较高，可稳定扩增出230bp的目标条带。应用此特异性引物建立的实时荧光定量PCR干腐病病菌检测方法能够定量检测出山核桃植株样品中的病菌含量，灵敏度要比普通PCR高100倍。 展开更多
关键词 森林保护学 山核桃干腐病 实时荧光定量PCR 特异性引物 基因组DNA
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贝西滑刃线虫双重PCR检测方法研究 预览 被引量：1
12
作者 林宇 王金成 +3 位作者 张宇含 董立 顾建锋 李志勇 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期80-83,93共5页
为实现贝西滑刃线虫的高效、准确鉴定，根据贝西滑刃线虫核糖体28S rRNA—D2／D3片段的保守区域设计了特异性引物，并结合植物寄生线虫通用引物作为内标，构建了贝西滑刃线虫的一步双重PCR检测体系。结果表明：特异性引物GU—F／GU—R... 为实现贝西滑刃线虫的高效、准确鉴定，根据贝西滑刃线虫核糖体28S rRNA—D2／D3片段的保守区域设计了特异性引物，并结合植物寄生线虫通用引物作为内标，构建了贝西滑刃线虫的一步双重PCR检测体系。结果表明：特异性引物GU—F／GU—R对贝西滑刃线虫具有高度的特异性，扩增出245bp的特异性目标片段，有效检测灵敏度可达0．125ng／μL线虫DNA模板量。该方法特异性好、灵敏度高、稳定性强，适用于贝西滑刃线虫的快速检测。 展开更多
关键词 贝西滑刃线虫 双重PCR 特异性引物 分子鉴定
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基于特异性聚合酶链式反应的西红花快速分子鉴别研究 被引量：3
13
作者 郑琪 蒋超 +2 位作者 袁媛 曹亮 金艳 《中国药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期23-28,共6页
目的建立一种基于特异性聚合酶链式反应（PCR）及荧光染料检测快速鉴别西红花真伪品的方法。方法通过对叶绿体基因片段测序和比对分析,找出西红花与其常见掺伪品序列差异,针对差异碱基设计特异性引物,构建并优化聚合酶链式反应扩增反应... 目的建立一种基于特异性聚合酶链式反应（PCR）及荧光染料检测快速鉴别西红花真伪品的方法。方法通过对叶绿体基因片段测序和比对分析,找出西红花与其常见掺伪品序列差异,针对差异碱基设计特异性引物,构建并优化聚合酶链式反应扩增反应体系,使用荧光染料法检测聚合酶链式反应产物,实现西红花的快速鉴别。结果建立了基于psb A-trn H序列的西红花鉴别体系,优化后的聚合酶链式反应反应条件为90℃预变性1 min,90℃变性5 s,58℃延伸5 s,26个循环。在聚合酶链式反应反应产物中加入染料SYBR Green I,西红花正品出现强烈绿色荧光,而伪品无荧光。结论位点特异性聚合酶链式反应方法可以简单快速鉴别西红花及其掺伪品。 展开更多
关键词 西红花 间隔区片段 叶绿体编码基因 聚合酶链式反应 特异性引物 SYBR Green I
适用于不同产地半夏药材的特异性引物PCR鉴定分析方法 预览
14
作者 陈蓉 吴成丽 +1 位作者 邓赟 卞金辉 《中药与临床》 2015年第6期14-15,共2页
目的：通过特异性引物PCR技术,建立不同产地半夏药材通用的聚合酶链式反应（PCR）鉴别法。方法：提取不同产地半夏药材的基因组DNA,利用特异性引物对基因组DNA进行扩增,通过琼脂糖凝胶电泳对扩增结果进行分析。结果：所设计的引物能够... 目的：通过特异性引物PCR技术,建立不同产地半夏药材通用的聚合酶链式反应（PCR）鉴别法。方法：提取不同产地半夏药材的基因组DNA,利用特异性引物对基因组DNA进行扩增,通过琼脂糖凝胶电泳对扩增结果进行分析。结果：所设计的引物能够特异性地扩增出半夏的目的DNA,并适用于全国9个主要不同产地半夏药材的检测。结论：该方法具有较强的特异性和普适性,适用于半夏药材的真伪性鉴别。 展开更多
关键词 半夏 特异性引物 PCR
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基于COI序列的光肩星天牛快速分子鉴定 被引量：3
15
作者 邬颖 王德朋 +2 位作者 和东旭 陈芳 石娟 《植物检疫》 北大核心 2014年第4期46-49,共4页
光肩星天牛是危害非常严重的林业蛀干害虫之一，光肩星天牛幼虫鉴定相对困难，而在进出口木质包装中截获的虫态大多为幼虫或蛹，因此对其快速而准确的鉴定十分重要。本文通过对包括光肩星天牛在内的天牛科6种常见危险性林业有害生物线粒... 光肩星天牛是危害非常严重的林业蛀干害虫之一，光肩星天牛幼虫鉴定相对困难，而在进出口木质包装中截获的虫态大多为幼虫或蛹，因此对其快速而准确的鉴定十分重要。本文通过对包括光肩星天牛在内的天牛科6种常见危险性林业有害生物线粒体DNA的COI基因序列比对分析，设计并筛选出一对特异性引物，该引物的PCR检测方法可直接应用于光肩星天牛幼虫的鉴定，这为我国进出境检验检疫工作提供了技术支持。 展开更多
关键词 光肩星天牛 线粒体DNA细胞色素c氧化酶亚基 I基因(COI) 特异性引物 鉴定
药材天麻ITS2特异性引物的筛选 预览 被引量：2
16
作者 马孝熙 孙伟 +4 位作者 钱齐妮 任伟超 邬兰 张雅琴 宋明 《世界科学技术：中医药现代化》 北大核心 2014年第2期325-328,共4页
目的：药材天麻由于隶属于单子叶植物兰科天麻属，天麻中含有大量多糖、蛋白质以及大量次生代谢物质，使其提取的DNA质量不高，影响后续的PCR扩增。且ITS2通用引物在单子叶植物部分物种通用性很差。本研究通过对DNA提取过程、PCR扩增过... 目的：药材天麻由于隶属于单子叶植物兰科天麻属，天麻中含有大量多糖、蛋白质以及大量次生代谢物质，使其提取的DNA质量不高，影响后续的PCR扩增。且ITS2通用引物在单子叶植物部分物种通用性很差。本研究通过对DNA提取过程、PCR扩增过程进行优化，设计出一对用于鉴别天麻药材的ITS2引物，为中药材天麻的鉴定提供一种新方法。方法：以通用ITS2引物扩增出的两条序列为研究对象，经Primer Premier 5.0设计出3对特异性引物，通过对22份样品进行研究，筛选出一条高特异性的ITS2引物。结果：在54益的退火温度下，TM2F-2R对天麻的鉴定效率高达90.9%。结论：TM2F-2R可作为天麻ITS2序列的特异性引物，为天麻的分子鉴定提供了一套准确、稳定的鉴定方法。 展开更多
关键词 天麻 ITS2 特异性引物 TM2F-2R 鉴定
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陕西设施蔬菜根结线虫特异性分子检测 预览 被引量：2
17
作者 张锋 杨苗苗 +2 位作者 孙娟 洪波 张淑莲 《中国农学通报》 CSCD 2014年第31期136-140,共5页
为明确陕西设施蔬菜根结线虫的主要种类,利用已报道的花生根结线虫[Meloidogyne arenaria（Neal.）Chitwood]、南方根结线虫[Meloidogyne incognita（Kofold＆White）Chitwood]、北方根结线虫（Meloidogyne hapla Chitwood）和爪哇根结... 为明确陕西设施蔬菜根结线虫的主要种类,利用已报道的花生根结线虫[Meloidogyne arenaria（Neal.）Chitwood]、南方根结线虫[Meloidogyne incognita（Kofold＆White）Chitwood]、北方根结线虫（Meloidogyne hapla Chitwood）和爪哇根结线虫[Meloidogyne javanica（Treub）]的特异性引物,对陕西省20个县市区的24个样区的根结线虫进行PCR检测。样品中检测到了南方根结线虫、北方根结线虫、花生根结线虫和爪哇根结线虫,其中南方根结线虫为优势种群,大部分样区为单一种群为害,但个别样区存在2种种群。 展开更多
关键词 根结线虫 PCR检测 特异性引物 分子鉴定
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大白菜-结球甘蓝2号单体异附加系的FLOWERING LOCUS C（FLC）基因鉴定 预览 被引量：1
18
作者 顾爱侠 刘立平 +3 位作者 赵建军 许愿超 王彦华 申书兴 《农业生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期846-852,共7页
开花时间是芸薹属蔬菜的重要性状,FLOWERING LOCUS C（FLC）是影响植物开花的关键基因.本研究利用FLCs基因外显子4的多态性区段设计正向引物,外显子7的保守区设计反向引物,建立了能够区分大白菜（Brassica rapa ssp.pekinensis,AA）BrF... 开花时间是芸薹属蔬菜的重要性状,FLOWERING LOCUS C（FLC）是影响植物开花的关键基因.本研究利用FLCs基因外显子4的多态性区段设计正向引物,外显子7的保守区设计反向引物,建立了能够区分大白菜（Brassica rapa ssp.pekinensis,AA）BrFLC1、BrFLC2、BrFLC3和BrFLC5,与结球甘蓝（B.oleracea var.capitata,CC） BoFLC1、BoFLC2、BoFLC3和BoFLC5,共计8个基因的4对特异引物.利用该特异引物对添加结球甘蓝2号染色体的大白菜单体异附加系的FLCs基因进行鉴定,结果表明,该单体异附加系除具有大白菜的4个BrFLCs基因,同时添加了结球甘蓝的BoFLC3基因.实现了大白菜染色体组背景下结球甘蓝FLCs基因的跟踪鉴定,同时为大白菜遗传背景下添加结球甘蓝BoFLC3基因易位系的获得提供了特色材料. 展开更多
关键词 大白菜 结球甘蓝 单体异附加系 FLOWERING LOCUS C(FLC) 特异引物 基因分型
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3对引物快速鉴定烟草黑胫病菌的比较研究 预览 被引量：1
19
作者 张丽芳 方敦煌 +2 位作者 陈海如 赵兴能 徐伟伟 《云南农业大学学报：自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期161-166,共6页
为了对不同来源的烟草黑胫病菌（Phytophora nicotianae）进行快速鉴定,设计并合成了一对特异性引物ITS8-1/ITS8-2,并与已经报道的特异性引物Pn1/Pn2和SP/AP对来自22个不同采样点烟草黑胫病菌DNA进行PCR扩增对比.结果发现特异性引物Pn1/... 为了对不同来源的烟草黑胫病菌（Phytophora nicotianae）进行快速鉴定,设计并合成了一对特异性引物ITS8-1/ITS8-2,并与已经报道的特异性引物Pn1/Pn2和SP/AP对来自22个不同采样点烟草黑胫病菌DNA进行PCR扩增对比.结果发现特异性引物Pn1/Pn2和SP/AP对部分菌株不能扩增或扩增的条带较弱,而特异性引ITS8-1/ITS8-2则能扩增所有的供试菌株且扩增条带清晰,这表明该引物的特异性强于其他2对.用其他根茎病害病菌基因组DNA、烟草黑胫病组织和病土验证发现,引物ITS8-1/ITS8-2只能对烟草黑胫病菌、病组织、病土扩增出1条364 bp的特异性条带,与报道的P.nicotianae序列同源性为100％.证明该引物可适用于不同来源烟草黑胫病菌的鉴定、不同地点烟草黑胫病害的诊断. 展开更多
关键词 烟草黑胫病菌 特异性引物 PCR 鉴定
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旱稻孢囊线虫的快速分子检测 预览 被引量：2
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作者 王水南 彭德良 +1 位作者 黄文坤 丁中 《湖南农业大学学报：自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期178-182,共5页
根据旱稻孢囊线虫（Heterodera elachista）和常见孢囊线虫的ITS序列比对分析，设计1对早稻孢囊线虫特异性引物He-F／He-R，特异性片段长度为281bp。运用该特异性引物及建立的DNA提取方法和PCR体系，可特异性检测早稻孢囊线虫单条2龄幼... 根据旱稻孢囊线虫（Heterodera elachista）和常见孢囊线虫的ITS序列比对分析，设计1对早稻孢囊线虫特异性引物He-F／He-R，特异性片段长度为281bp。运用该特异性引物及建立的DNA提取方法和PCR体系，可特异性检测早稻孢囊线虫单条2龄幼虫，可以从混合有1条旱稻孢囊线虫的0．1g水稻根组织中特异性检测出目的DNA片段。特异性引物He-F／He-R与通用引物D2A／D3B结合，运用一步双重PCR检测方法可快速鉴定单孢囊，也可从初始分离的田间土壤总线虫样品中直接检测出旱稻孢囊线虫。 展开更多
关键词 旱稻孢囊线虫 PCR检测 特异性引物
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