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基于网络药理学探讨加味四君子汤治疗胃癌的作用机制研究 认领
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作者 陈伟霞 李佳 +3 位作者 牛垚飞 康妍 马纯政 赵爱光 《中医肿瘤学杂志》 2021年第2期48-55,共8页
目的探讨加味四君子汤治疗胃癌的物质基础和作用机制。方法本研究采用中药系统药理学技术平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP),筛选加味四君子汤的潜在活性化学物质,借助基... 目的探讨加味四君子汤治疗胃癌的物质基础和作用机制。方法本研究采用中药系统药理学技术平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP),筛选加味四君子汤的潜在活性化学物质,借助基因注释(Genecards)数据库平台,预测和筛选胃癌的作用靶点,采用Cytoscape软件,构建"药物-活性化学物质-疾病-作用靶点-信号通路网络"相互作用网络,通过对相互作用网络的分析,获取加味四君汤作用于胃癌的潜在活性成分、相应靶点及信号通路,预测该方剂治疗胃癌的作用机制。结果共筛选出55个潜在活性成分,太子参潜在活性成分8个,白术潜在活性成分7个,茯苓潜在活性成分15个,半夏潜在活性成分13个,藤梨根潜在活性成分4个,壁虎潜在活性成分8个,共涉及与胃癌相关作用靶点121个。加味四君子汤中木犀草素、熊果酸、β-谷甾醇、黄芩素、刺槐素为作用于胃癌的主要活性成分,PTGS2为6味中药共同作用的靶点。拓扑结构分析主要靶基因为33个,连接度较高的分别为PTGS2、PTGS1、ADRB2、PGR和CHRM3。主要靶基因不仅参与调控类固醇激素反应、细胞程序性死亡、氧化应激等过程,还介导癌症通路、细胞凋亡(Apoptosis)、白介素-17信号通路(IL-17 signaling pathway)、5-羟色胺能突触(Serotonergic synapse)、甲状腺激素信号通路、血管内皮生长因子信号通路、NF-kappa B信号通路等。结论加味四君子汤中活性成分作用于PTGS2、PTGS1、ADRB2、PGR和CHRM3等靶点,通过调节细胞凋亡、白介素-17信号通路等多条信号通路,协同治疗胃癌。通过挖掘中药复方作用于胃癌的潜在靶点和有关通路,推测加味四君子汤可能具有防治胃癌的效用。 展开更多
关键词 加味四君子汤 网络药理学 有效成分 靶点
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Surface Temperature Changes Projected by FGOALS Models under Low Warming Scenarios in CMIP5 and CMIP6 认领
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作者 Shang-Min LONG Kai-Ming HU +2 位作者 Gen LI Gang HUANG Xia QU 《大气科学进展:英文版》 SCIE CAS 2021年第2期203-220,共18页
To meet the low warming targets proposed in the 2015 Paris Agreement,substantial reduction in carbon emissions is needed in the future.It is important to know how surface climates respond under low warming targets.The... To meet the low warming targets proposed in the 2015 Paris Agreement,substantial reduction in carbon emissions is needed in the future.It is important to know how surface climates respond under low warming targets.The present study investigates the surface temperature changes under the low-forcing scenario of Representative Concentration Pathways(RCP2.6)and its updated version(Shared Socioeconomic Pathways,SSP1-2.6)by the Flexible Global Ocean-Atmosphere-Land System(FGOALS)models participating in phases 5 and 6 of the Coupled Model Intercomparison Project(CMIP5 and CMIP6,respectively).In both scenarios,radiative forcing(RF)first increases to a peak of 3 W m^−2 around 2045 and then decreases to 2.6 W m^−2 by 2100.Global mean surface air temperature rises in all FGOALS models when RF increases(RF increasing stage)and declines or holds nearly constant when RF decreases(RF decreasing stage).The surface temperature change is distinct in its sign and magnitude between the RF increasing and decreasing stages over the land,Arctic,North Atlantic subpolar region,and Southern Ocean.Besides,the regional surface temperature change pattern displays pronounced model-to-model spread during both the RF increasing and decreasing stages,mainly due to large intermodel differences in climatological surface temperature,ice-albedo feedback,natural variability,and Atlantic Meridional Overturning Circulation change.The pattern of tropical precipitation change is generally anchored by the spatial variations of relative surface temperature change(deviations from the tropical mean value)in the FGOALS models.Moreover,the projected changes in the updated FGOALS models are closer to the multi-model ensemble mean results than their predecessors,suggesting that there are noticeable improvements in the future projections of FGOALS models from CMIP5 to CMIP6. 展开更多
关键词 surface temperature low warming targets Arctic amplification AMOC Southern Ocean
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基于生信分析筛选胆囊癌关键基因及相关通路的研究 认领
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作者 殷晓晓 薛小峰 赵华 《中国肿瘤外科杂志》 CAS 2021年第1期12-19,共8页
目的通过生信分析筛选胆囊癌治疗的关键基因及癌症相关通路,挖掘胆囊癌患者的差异基因,预测胆囊癌的潜在治疗靶点。方法对GEO数据库中获得的芯片数据进行差异基因(DEGs)分析。选取NCBI-基因表达综合数据库(GEO)中的基因表达芯片“GSE76... 目的通过生信分析筛选胆囊癌治疗的关键基因及癌症相关通路,挖掘胆囊癌患者的差异基因,预测胆囊癌的潜在治疗靶点。方法对GEO数据库中获得的芯片数据进行差异基因(DEGs)分析。选取NCBI-基因表达综合数据库(GEO)中的基因表达芯片“GSE76633”和“GSE74048”,利用GEO2R在线分析工具对胆囊癌样本和正常胆囊样本中的差异基因进行筛选。在DAVID和KOBAS上对差异基因进行生物过程(GO)分析和通路富集(KEGG)分析。使用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析数据库STRING构建靶点互作(PPI)网络模型。结果该研究共筛选了197个差异基因(P<0.05,|Log2FC|>2),其中有33个上调基因,164个下调基因。这些基因主要参与了代谢过程的调节,脂肪酸β-氧化、氧化-还原过程等GO生物过程。主要调控代谢途径,甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,缬氨酸亮氨酸和异亮氨酸降解,抗生素的生物合成等。结论该研究利用生物信息学筛选出胆囊癌中的差异基因及相关通路,帮助理解其分子机制及在胆囊癌发病机制和发生、发展过程中的作用,为寻找胆囊癌新的治疗靶点提供思路。 展开更多
关键词 胆囊癌 生物信息学分析 差异基因 靶点
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基于网络药理学和生物信息学模式预测白花蛇舌草抗非小细胞肺癌关键靶点和分子机制 认领
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作者 叶松山 刘云鹤 +3 位作者 李文涛 夏颖 赵芷洁若 于建春 《肿瘤药学》 CAS 2021年第1期58-65,112,共9页
目的应用网络药理学和生物信息学方法预测白花蛇舌草抗非小细胞肺癌(NSCLC)的关键靶点,并探讨其可能的分子机制。方法通过TCMSP数据库检索白花蛇舌草活性成分和靶点,利用GeneCards、DigSee和DisGeNET数据库获取NSCLC靶点并与药物靶点映... 目的应用网络药理学和生物信息学方法预测白花蛇舌草抗非小细胞肺癌(NSCLC)的关键靶点,并探讨其可能的分子机制。方法通过TCMSP数据库检索白花蛇舌草活性成分和靶点,利用GeneCards、DigSee和DisGeNET数据库获取NSCLC靶点并与药物靶点映射,使用Cytoscape软件构建"白花蛇舌草-活性成分-靶点-非小细胞肺癌"网络;采用String数据库和Cytoscape构建靶标蛋白互作(PPI)网络,筛选关键靶点,运用R软件对靶标基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,利用ClueGO+CluePedia插件分析关键靶点和信号通路的关联。结果获取到白花蛇舌草中槲皮素和β-谷甾醇等4个抗NSCLC活性成分、63个潜在靶标和5个关键靶点MYC、AKT1、EGFR、CASP3及CCND1;GO富集主要涉及细胞增殖与凋亡调节、抑制肿瘤转移和侵袭、物质代谢和基因表达等多个生物学过程与功能;KEGG通路富集主要涉及多种癌症通路、蛋白多糖、AGE-RAGE信号通路、microRNAs、人巨细胞病毒(HCMV)感染、PI3K-AKT信号通路和MAPK信号通路等。关键靶点与APAF1、CDK4/6、AKT2和TRIB3等在相关信号通路存在关联。结论本研究初步预测和揭示了白花蛇舌草抗NSCLC的关键靶点和可能的作用机制,体现了中药多组分、多靶点、多途径交互协作的特点,为白花蛇舌草抗肿瘤研究及临床应用奠定了基础。 展开更多
关键词 白花蛇舌草 非小细胞肺癌 网络药理学 靶点 分子机制
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Nine-long non-coding ribonucleic acid signature can improve the survival prediction of colorectal cancer 认领
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作者 Zhen Zong Ce-Gui Hu +5 位作者 Tai-Cheng Zhou Zhuo-Min Yu Fu-Xin Tang Hua-Kai Tian Hui Li He Wang 《世界胃肠外科杂志:英文版(电子版)》 SCIE CAS 2021年第2期210-221,共12页
BACKGROUND Investigating molecular biomarkers that accurately predict prognosis is of considerable clinical significance.Accumulating evidence suggests that long noncoding ribonucleic acids(lncRNAs)are frequently aber... BACKGROUND Investigating molecular biomarkers that accurately predict prognosis is of considerable clinical significance.Accumulating evidence suggests that long noncoding ribonucleic acids(lncRNAs)are frequently aberrantly expressed in colorectal cancer(CRC).AIM To elucidate the prognostic function of multiple lncRNAs serving as biomarkers in CRC.METHODS We performed lncRNA expression profiling using the lncRNA mining approach in large CRC cohorts from The Cancer Genome Atlas(TCGA)database.Receiver operating characteristic analysis was performed to identify the optimal cutoff point at which patients could be classified into the high-risk or low-risk groups.Based on the Cox coefficient of the individual lncRNAs,we identified a ninelncRNA signature that was associated with the survival of CRC patients in the training set(n=175).The prognostic value of this nine-lncRNA signature was validated in the testing set(n=174)and TCGA set(n=349).The prognostic models,consisting of these nine CRC-specific lncRNAs,performed well for risk stratification in the testing set and TCGA set.Time-dependent receiver operating characteristic analysis indicated that this predictive model had good performance.RESULTS Multivariate Cox regression and stratification analysis demonstrated that this nine-lncRNA signature was independent of other clinical features in predicting overall survival.Functional enrichment analysis of Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathways and Gene Ontology terms further indicated that these nine prognostic lncRNAs were closely associated with carcinogenesis-associated pathways and biological functions in CRC.CONCLUSION A nine-lncRNA expression signature was identified and validated that could improve the prognosis prediction of CRC,thereby providing potential prognostic biomarkers and efficient therapeutic targets for patients with CRC. 展开更多
关键词 Colorectal cancer Long non-coding ribonucleic acid Biomarkers Survival prediction The Cancer Genome Atlas Therapeutic targets
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香连片抗细菌性痢疾相关疾病的网络药理学研究 认领
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作者 黄先菊 董悦 +3 位作者 王晶 李竣 杨光忠 石召华 《中南民族大学学报:自然科学版》 CAS 2021年第1期39-42,共4页
通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选香连片的主要活性成分;通过TCMSP及Swiss Target Prediction数据库查找筛选其活性成分的对应靶点.收集有关细菌性痢疾相关疾病的靶点,映射至香连片活性成分靶点基因,构建活性成分-靶点网络及共同... 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选香连片的主要活性成分;通过TCMSP及Swiss Target Prediction数据库查找筛选其活性成分的对应靶点.收集有关细菌性痢疾相关疾病的靶点,映射至香连片活性成分靶点基因,构建活性成分-靶点网络及共同靶点蛋白相互作用网络(PPI).将共同靶基因进行GO功能富集与KEGG通路富集分析.从香连片中筛选出42个活性成分,19个与细菌性痢疾相关疾病的作用靶点;GO功能富集筛选得到生物学过程相关条目12条、分子功能相关条目5条及细胞组分相关条目6条;KEGG通路富集筛选得到8条相关通路,涉及钙信号通路、癌症通路、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路等.这表明香连片可能通过钙信号通路、癌症通路、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号等,对细胞增殖、凋亡、炎症反应等过程产生影响从而拥有抗细菌性痢疾相关疾病功能,此外预测中表明其作用还涉及多条癌症通路,可为其预防癌症研究提供一定依据. 展开更多
关键词 香连片 网络药理学 细菌性痢疾 靶点 通路
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基于网络药理学的芪参益气滴丸治疗心肌梗死机制研究 认领
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作者 魏欣 周仁鹏 +2 位作者 刘清武 胡伟 鲁超 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2021年第2期194-201,共8页
目的采用网络药理学的方法探究芪参益气滴丸治疗心肌梗死(MI)的药理作用机制。方法使用中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)检索芪参益气滴丸中药复方中四味草药的所有活性化合物成分和作用靶点;通过OMIM、TTD、PharmG KB、DisG inN... 目的采用网络药理学的方法探究芪参益气滴丸治疗心肌梗死(MI)的药理作用机制。方法使用中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)检索芪参益气滴丸中药复方中四味草药的所有活性化合物成分和作用靶点;通过OMIM、TTD、PharmG KB、DisG inN ET及DrugB ank数据库对MI的相关疾病靶点进行检索,并与药物的治疗靶点进行映射,获得药物作用于疾病的靶点。用Cytoscape软件构建药物成分-疾病靶点网络,筛选药物治疗心肌梗死的核心靶点。利用DAVID数据库进行KEGG富集分析,Omicshare数据库进行GO二级分类富集并对KEGG富集的结果进行可视化处理。结果选择口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18,肠上皮细胞膜渗透性(Caco-2)≥-0.4及半衰期(HL)≥4 h作为活性化合物的ADME筛选条件,共获得82个活性成分和610个成分靶点。五个疾病数据库共检索MI相关靶点1 713个,药物靶点映射到疾病中共获得103个靶点。对大于平均度值的27个核心靶点进行DAVID富集分析,发现ADRB2、CHRM3、CHRM2、NOS3、NOS2、ADRA1D、CALM1、PIK3CG、DRD1、PDE3A、F2、GSK3B、COX2、ESR2、ACHE、SCN5A、COX1、PTGS2等18个芪参益气滴丸治疗MI的核心靶点富集到钙信号通路、cA MP信号通路、cG MP-PKG信号通路等19条与MI相关的通路。结论通过使用系统药理学的理论和方法证实了芪参益气滴丸多成分、多靶点、多途径的治疗特点,预测了其治疗MI的可能机制,为其基础研究提供了参考和理论依据。 展开更多
关键词 芪参益气滴丸 心肌梗死 网络药理学 靶点 信号通路
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MicroRNAs in laser-induced choroidal neovascularization in mice and rats:their expression and potential therapeutic targets 认领
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作者 Bridget Martinez Philip V.Peplow 《中国神经再生研究:英文版》 SCIE CAS 2021年第4期621-627,共7页
Choroidal neovascularization characterizes wet age-related macular degeneration.Choroidal neovascularization formation involves a primarily angiogenic process that is combined with both inflammation and proteolysis.A ... Choroidal neovascularization characterizes wet age-related macular degeneration.Choroidal neovascularization formation involves a primarily angiogenic process that is combined with both inflammation and proteolysis.A primary cause of choroidal neovascularization pathogenesis is alterations in pro-and anti-angiogenic factors derived from the retinal pigment epithelium,with vascular endothelium growth factor being mainly responsible for both clinical and experimental choroidal neovascularization.MicroRNAs(miRNAs)which are short,non-coding,endogenous RNA molecules have a major role in regulating various pathological processes,including inflammation and angiogenesis.A review of recent studies with the mouse laser-induced choroidal neovascularization model has shown alterations in miRNA expression in choroidal neovascularization tissues and could be potential therapeutic targets for wet age-related macular degeneration.Upregulation of miR-505(days 1 and 3 post-laser),miR-155(day 14)occurred in retina;miR-342-5p(days 3 and 7),miR-126-3p(day 14)in choroid;miR-23a,miR-24,miR-27a(day 7)in retina/choroid;miR-505(days 1 and 3)in retinal pigment epithelium/choroid;downregulation of miR-155(days 1 and 3),miR-29a,miR-29b,miR-29c(day 5),miR-93(day 14),miR-126(day 14)occurred in retinal pigment epithelium/choroid.Therapies using miRNA mimics or inhibitors were found to decrease choroidal neovascularization lesions.Choroidal neovascularization development was reduced by overexpression of miR-155,miR-188-5p,miR-(5,B,7),miR-126-3p,miR-342-5p,miR-93,miR-126,miR-195a-3p,miR-24,miR-21,miR-31,miR-150,and miR-184,or suppression of miR-505,miR-126-3p,miR-155,and miR-23/27.Further studies are warranted to determine miRNA expression in mouse laser-induced choroidal neovascularization models in order to validate and extend the reported findings.Important experimental variables need to be standardized;these include the strain and age of animals,gender,number and position of laser burns to the eye,laser parameters to induce choroidal neovascu 展开更多
关键词 age-related macular degeneration angiogenesis animal model blood plasma CHOROID laser MICRORNAS NEOVASCULARIZATION RETINA retinal pigment epithelium therapeutic targets vascular endothelial growth factor
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Hippo signaling:bridging the gap between cancer and neurodegenerative disorders 认领
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作者 Neha Gogia Anuradha Venkatakrishnan Chimata +2 位作者 Prajakta Deshpande Aditi Singh Amit Singh 《中国神经再生研究:英文版》 SCIE CAS 2021年第4期643-652,共10页
During development,regulation of organ size requires a balance between cell proliferation,growth and cell death.Dysregulation of these fundamental processes can cause a variety of diseases.Excessive cell proliferation... During development,regulation of organ size requires a balance between cell proliferation,growth and cell death.Dysregulation of these fundamental processes can cause a variety of diseases.Excessive cell proliferation results in cancer whereas excessive cell death results in neurodegenerative disorders.Many signaling pathways known-to-date have a role in growth regulation.Among them,evolutionarily conserved Hippo signaling pathway is unique as it controls both cell proliferation and cell death by a variety of mechanisms during organ sculpture and development.Neurodegeneration,a complex process of progressive death of neuronal population,results in fatal disorders with no available cure to date.During normal development,cell death is required for sculpting of an organ.However,aberrant cell death in neuronal cell population can result in neurodegenerative disorders.Hippo pathway has gathered major attention for its role in growth regulation and cancer,however,other functions like its role in neurodegeneration are also emerging rapidly.This review highlights the role of Hippo signaling in cell death and neurodegenerative diseases and provide the information on the chemical inhibitors employed to block Hippo pathway.Understanding Hippo mediated cell death mechanisms will aid in development of reliable and effective therapeutic strategies in future. 展开更多
关键词 animal models cell death mechanisms cell-signaling chemical inhibitors Drosophila eye Hippo pathway NEURODEGENERATION neurological diseases therapeutic targets
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基于网络药理学探讨益肾健脾核心药对治疗少弱精症的作用机制 认领
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作者 于旭东 商建伟 +5 位作者 邓省 王继升 刘蕊嘉 司红梅 刘晓訸 张耀圣 《海南医学院学报》 CAS 2021年第5期382-387,共6页
目的:在系统生物学理论的指导下,应用网络药理学的研究方法探讨益肾健脾法治疗少弱精症的物质基础及作用机制。方法:通过检索中药系统药理学平台(TCMSP)选取益肾健脾核心药对中的有效元素和作用靶点;通过检索人类基因信息数据库选取少... 目的:在系统生物学理论的指导下,应用网络药理学的研究方法探讨益肾健脾法治疗少弱精症的物质基础及作用机制。方法:通过检索中药系统药理学平台(TCMSP)选取益肾健脾核心药对中的有效元素和作用靶点;通过检索人类基因信息数据库选取少弱精症的疾病靶点;应用R语言软件遴选药物与疾病共同靶点,应用Cytoscape软件构建药物-疾病-靶点互作网络;通过STRING平台构建共同靶点蛋白互作网络(PPI);应用R语言对益肾健脾核心药物与少弱精症的共同靶点进行GO和KEGG富集分析。结果:从益肾健脾中药中共获得97个有效活性成分,得到46个益肾健脾中药治疗少弱精症的可能靶点,结合KEGG富集分析结果可以推测益肾健脾中药改善男性少弱精症的作用机制可能与调控人内源性激素有关。结论:通过网络药理学的研究方法预测了益肾健脾中药治疗男性少弱精症的可能效应靶点和通路。 展开更多
关键词 网络药理学 少弱精症 益肾健脾法 靶点 信号通路
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基于网络药理学研究黄芪-白术治疗新冠肺炎的作用机制 认领
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作者 涂文玲 朱景茹 +3 位作者 李墨辞 陈梅妹 杨朝阳 甘慧娟 《福建中医药》 2021年第2期1-5,20,共6页
目的采用网络药理学的方法探讨黄芪-白术治疗新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)的作用机制。方法利用TCMSP数据库对黄芪-白术活性成分和作用靶点进行查找与筛选,获得黄芪-白术的有效活性成分和作用靶点,用Cytoscape 3.7.2软件绘制黄芪-白术的... 目的采用网络药理学的方法探讨黄芪-白术治疗新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)的作用机制。方法利用TCMSP数据库对黄芪-白术活性成分和作用靶点进行查找与筛选,获得黄芪-白术的有效活性成分和作用靶点,用Cytoscape 3.7.2软件绘制黄芪-白术的有效活性成分-作用靶点网络;利用GeneCards数据库获取新冠肺炎作用靶点,利用Venny 2.1.0在线工具,获得黄芪-白术与新冠肺炎共同作用靶点(即是黄芪-白术治疗新冠肺炎的作用靶点);利用String数据库构建和分析共同作用靶点互作网络;最后利用R软件对共同作用靶点进行GO和KEGG富集分析。结果通过对黄芪-白术活性成分、作用靶点查找与筛选,获得黄芪-白术有槲皮素、山奈酚、蛇床子素、毛蕊异黄酮等19个有效活性成分,作用靶点189个,并绘制出黄芪-白术的有效活性成分-作用靶点网络图;用GeneCards数据库获取新冠肺炎作用靶点259个,经过Venny 2.1.0在线工具分析,获取41个黄芪-白术与新冠肺炎共同作用靶点;GO和KEGG富集分析提示:黄芪-白术参与细胞因子受体结合、细胞因子活性、受体配体活性、磷酸酶结合等生物学过程,可能通过调控IL-17、P53、HIF-1、B细胞、T细胞等信号通路而起到治疗新冠肺炎的作用。结论黄芪-白术主要是通过抗炎、抗氧化及调节免疫而达到治疗新冠肺炎目的。 展开更多
关键词 黄芪-白术 新冠肺炎 网络药理 作用机制 靶点 信号通路
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基于网络药理学探讨威灵仙-天花粉药对抗癌的作用机制 认领
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作者 司红梅 于旭东 +3 位作者 商建伟 宋连英 孟繁超 张耀圣 《中国实验方剂学杂志》 CAS 北大核心 2021年第5期182-190,共9页
目的:基于网络药理学探讨"威灵仙-天花粉"抗癌症的潜在靶点和作用机制。方法:应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)根据口服生物利用度(OB)和类药性(DL)对威灵仙和天花粉的活性成分和相应靶蛋白进行筛选;应用GeneCards,OMIM数... 目的:基于网络药理学探讨"威灵仙-天花粉"抗癌症的潜在靶点和作用机制。方法:应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)根据口服生物利用度(OB)和类药性(DL)对威灵仙和天花粉的活性成分和相应靶蛋白进行筛选;应用GeneCards,OMIM数据库筛选癌症疾病的靶点,应用R语言软件筛选威灵仙、天花粉与癌症疾病共同靶点;应用Cytoscape3.7.2软件构建"药物-活性成分-疾病-靶点"网络图;应用STRING数据库绘制共同靶点蛋白互作网络(PPI);应用R语言软件对有效作用靶点进行基因本体(GO)功能,京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:从威灵仙-天花粉药对中共获得9个有效活性成分,共检索出31个靶点基因,从癌症疾病中检索出的相关靶基因为814个,两者相关靶基因进行匹配,得到共同靶基因9个,这些靶点主要涉及内肽酶、半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡过程以及癌症坏死因子受体超家族结合等生物学过程,并通过调节细胞凋亡,麻疹,乙型肝炎,卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染,p53,白细胞介素(IL)-17,肿瘤坏死因子(TNF)等多条通路从而发挥治疗癌症的作用。结论:初步研究了威灵仙-天花粉治疗癌症的作用机制,威灵仙-天花粉药对具有多个活性成分,能通过多个靶点、多个通路来发挥治疗癌症的作用。 展开更多
关键词 网络药理学 威灵仙 天花粉 抗癌症 作用机制 靶点
渤海油田侧钻井槽口优选设计方法 认领
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作者 王占领 陈立强 《海洋石油》 CAS 2021年第1期83-86,96,共5页
低效井侧钻是渤海油田稳产增产的主要手段之一,合理匹配低效井槽口与侧钻井位是降本增效的首要之举。此文以渤海某油田三口低效井为例,通过分析低效井槽口与侧钻井位的位置关系,将其进行合理匹配,从全角变化率变化、井斜角变化、方位角... 低效井侧钻是渤海油田稳产增产的主要手段之一,合理匹配低效井槽口与侧钻井位是降本增效的首要之举。此文以渤海某油田三口低效井为例,通过分析低效井槽口与侧钻井位的位置关系,将其进行合理匹配,从全角变化率变化、井斜角变化、方位角变化、造斜段长度、井深、进尺等方面展开研究,形成一种槽口优选设计方法。现场实施结果表明,应用该方法选择难度较小的方案,节约成本两百余万元,该油田三口低效井槽口优选方案合理,作业难度及作业成本均有所降低。形成了一套渤海油田侧钻井槽口优选设计方法,可有效降低作业难度及成本,为渤海油田侧钻井槽口优选提供借鉴。 展开更多
关键词 渤海油田 侧钻 靶点 槽口优选 设计优化
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野菊花抗菌活性的网络药理学研究 认领
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作者 代书景 刘洋 +4 位作者 桂金秋 李福娟 王小花 唐小云 石学魁 《牡丹江医学院学报》 2021年第1期4-8,共5页
目的基于网络药理学方法研究野菊花主要抗菌活性成分、靶点,初步探讨其作用机制。方法通过中药系统药理学数据库(TCMSP)、GeneCards数据库筛选出野菊花主要抗菌活性成分、靶点,采用Cytoscape 3.7.2软件构建可视化的“药物-成分-靶点-疾... 目的基于网络药理学方法研究野菊花主要抗菌活性成分、靶点,初步探讨其作用机制。方法通过中药系统药理学数据库(TCMSP)、GeneCards数据库筛选出野菊花主要抗菌活性成分、靶点,采用Cytoscape 3.7.2软件构建可视化的“药物-成分-靶点-疾病”网络,依据在线STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI),应用R软件对关键靶点进行GO及KEGG通路分析。结果野菊花抗菌的潜在靶点有19个,蛋白互作网络提示IL-1β、CXCL8、IL-10、ICAM1、IFNγ、CASP3等可能是野菊花抗菌的核心靶点。GO分析结果显示,野菊花抗菌潜在基因的生物功能主要涉及细胞因子受体结合、细胞因子活性、受体配体活性、受体调节活性等;KEGG结果显示,野菊花抗菌潜在基因的通路主要涉及甲型流感病毒(Influenza A)、IL-17信号通路(IL-17 signaling pathway)、南美锥虫病(Chagas disease)、Toll样受体信号通路(Toll like receptor signaling pathway)、TNF信号通路(TNF signaling pathway)、弓形虫病(Toxoplasmosis)等信号通路。结论该研究通过网络药理学筛选,解释了野菊花抗菌活性的作用机制,为后续深入开展其抗菌作用研究奠定了基础。 展开更多
关键词 野菊花 活性成分 网络药理学 抗菌活性 靶点 信号通路
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基于网络药理学预测人参皂苷F2减肥作用的靶标及通路 认领
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作者 周静 何洋 +2 位作者 胡卫成 张迹 杨晓君 《现代食品科技》 EI CAS 北大核心 2021年第1期24-30,307,共8页
人参皂苷F2具有抗癌、护肝、抗炎、降脂等多种生理功能,但是其关于减肥的作用机制尚不明确。本研究利用网络药理学方法预测人参皂苷F2减肥作用的潜在靶点和作用通路,借助PubChem、GeneCards数据库收集人参皂苷F2、肥胖靶点信息,通过共... 人参皂苷F2具有抗癌、护肝、抗炎、降脂等多种生理功能,但是其关于减肥的作用机制尚不明确。本研究利用网络药理学方法预测人参皂苷F2减肥作用的潜在靶点和作用通路,借助PubChem、GeneCards数据库收集人参皂苷F2、肥胖靶点信息,通过共享靶点,利用Cytoscape等平台构建并分析人参皂苷F2-靶点-肥胖网络。结果表明,人参皂苷F2减肥作用共涉及35个潜在靶点,其中关键靶点包括MAPK1、VEGFA、CASP3等,GO富集提示潜在靶点主要参与代谢、结合、组成细胞组分等生物学过程,通过EGFR抗酪氨酸激酶抑制剂信号通路、P13K-Akt信号通路、神经活性配体-受体相互作用信号通路等方式发挥减肥作用。网络药理学成功预测了人参皂苷F2减肥作用的多靶点、多通路模式,为后续深入探讨其作用机制提供理论依据和研究方向。 展开更多
关键词 人参皂苷F2 肥胖 网络药理学 靶点 信号通路
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复方苁蓉益智胶囊治疗阿尔茨海默病作用机制的网络药理学研究 认领
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作者 王旭 姚璇 +1 位作者 马素亚 时晶 《中药新药与临床药理》 CAS 北大核心 2021年第2期172-181,共10页
目的利用网络药理学技术研究复方苁蓉益智胶囊(CCYC)治疗阿尔茨海默病(AD)的潜在作用机制。方法利用TCMSP、BATMAN-TCM数据库、TCMID数据库、化学专业数据库查找复方苁蓉益智胶囊中5味中药的化学成分并进行活性成分筛选;利用SwissTarget... 目的利用网络药理学技术研究复方苁蓉益智胶囊(CCYC)治疗阿尔茨海默病(AD)的潜在作用机制。方法利用TCMSP、BATMAN-TCM数据库、TCMID数据库、化学专业数据库查找复方苁蓉益智胶囊中5味中药的化学成分并进行活性成分筛选;利用SwissTargetPrediction数据库获取活性成分的作用靶点,搜索GeneCards数据库、OMIM数据库、TTD数据库结合文献查找获取阿尔茨海默病的疾病靶点。取活性成分靶点和阿尔茨海默病疾病靶点的交集,得到复方苁蓉益智胶囊治疗阿尔茨海默病的潜在靶点。利用String数据库构建蛋白质-蛋白质互作网络。采用Metascape平台进行靶点GO富集分析和KEGG富集分析,通过Cytoscape3.7.1软件构建"单味药-关键成分-靶点-通路"网络并进行分析。结果肉苁蓉含有最多的关键成分,荷叶有最多的潜在靶点。APP、MAPK1、MAPK3、ESR2、ESR1、EGFR、DRD2、ACHE可能是复方苁蓉益智胶囊治疗阿尔茨海默病的重要靶点,涉及的主要通路和过程主要包括神经递质受体活性、神经递质水平调控、多巴胺能突触、胆碱能突触等。结论肉苁蓉和荷叶在复方苁蓉益智胶囊复方中占主要地位,复方苁蓉益智胶囊治疗阿尔茨海默病的机制可能是减少Aβ的产生及tau蛋白形成、调节雌激素受体及表皮生长因子受体、调控多巴胺能及胆碱能系统。 展开更多
关键词 复方苁蓉益智胶囊 阿尔茨海默病 网络药理学 靶点 作用机制
基于网络药理学的苦参-苍术药对治疗痔疮作用机制研究 认领
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作者 马转霞 顾志荣 +4 位作者 孙岚萍 张锐 吕鑫 许爱霞 葛斌 《中国野生植物资源》 2021年第2期15-20,共6页
目的:探讨苦参-苍术药对治疗痔疮的作用机制。方法:通过中药系统药理学(TCMSP)分析平台筛选苦参、苍术的活性成分,整理并校正其对应的作用靶点。通过GeneCards、OMIM、Drugbank数据库收集痔疮相关的基因靶点,运用Venny 2.1.0筛选出苦参... 目的:探讨苦参-苍术药对治疗痔疮的作用机制。方法:通过中药系统药理学(TCMSP)分析平台筛选苦参、苍术的活性成分,整理并校正其对应的作用靶点。通过GeneCards、OMIM、Drugbank数据库收集痔疮相关的基因靶点,运用Venny 2.1.0筛选出苦参、苍术治疗痔疮的关键靶点,将关键靶点上传至STRING数据库及DAVID数据库进行PPI网络分析及GO富集分析和KEGG通路分析;采用Cytoscape 3.7.1构建疾病-药对-活性成分-关键靶点及成分-靶点-通路网络模型。结果:筛选得到苦参-苍术药对活性成分44个,作用靶点233个,痔疮靶点基因170个,两者匹配映射得到关键靶点42个。通过疾病-药对-活性成分-关键靶点网络和PPI网络分析筛选出与痔疮关联程度较大的化合物为槲皮素(Quercetin)、木犀草素(Luteolin)、芹菜素(Apigenin)、汉黄芩素(Wogonin)等,核心靶点为白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、肿瘤抑制蛋白(TP53)、趋化因子配体2(CCL2)、趋化因子(CXCL8)等。KEGG通路分析显示,苦参-苍术药对治疗痔疮的主要通路有Pathways in cancer、Proteoglycans in cancer、PI3K-Akt signaling pathway等。结论:本研究初步探讨了苦参-苍术药对治疗痔疮活性成分、作用靶点及信号通路,为进一步深入揭示其作用机制奠定了良好基础。 展开更多
关键词 苦参 苍术 药对 痔疮 网络药理学 靶点
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文章速递常见活血化瘀药对血小板的影响作用 认领
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作者 王佐梅 肖洪彬 +2 位作者 牛雯颖 李凤金 张玉昆 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2021年第2期78-81,共4页
活血化瘀的中药不仅可调节血脂及血液流变性来改善瘀血的状态,还可通过对血小板调节作用来缓解血液黏、凝、聚的变化。血小板作为血液中的重要有形成分,在活血化瘀法治疗血液循环系统疾病的研究中地位举足轻重。大量文献研究显示,具有... 活血化瘀的中药不仅可调节血脂及血液流变性来改善瘀血的状态,还可通过对血小板调节作用来缓解血液黏、凝、聚的变化。血小板作为血液中的重要有形成分,在活血化瘀法治疗血液循环系统疾病的研究中地位举足轻重。大量文献研究显示,具有活血化瘀功效的中药(三七、当归、川芎、桃仁、红花、芍药、水蛭、蒲黄、延胡索等)可通过作用于血小板上的多个靶点、以多个途径使血小板形态结构、黏附聚集功能、血管内皮完整性等均趋于好转,其机制主要是通过多种途径抑制血小板的生物学改变,故以活血化瘀药对血小板的生物学改变为侧重点,分析活血化瘀药对血小板的影响作用及其作用靶点,以期为临床治疗提供借鉴。 展开更多
关键词 活血化瘀 中药 血小板生物学改变 影响作用 作用靶点
文章速递新型冠状病毒治疗靶点及药物研究进展 认领
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作者 白佳坤 马晓阳 +1 位作者 李霄鹤 周红刚 《今日药学》 CAS 2021年第1期69-72,共4页
目的探索SARS-CoV-2的治疗靶点,治疗药物和疫苗研发的近况,为其后期的研究提供思路。方法通过检索国内外的专业数据库,对SARS-CoV-2的最新文献进行解读,获取相关数据。结果目前研究出2个抗病毒药物靶点,一个抗体和疫苗的靶点及一个开发... 目的探索SARS-CoV-2的治疗靶点,治疗药物和疫苗研发的近况,为其后期的研究提供思路。方法通过检索国内外的专业数据库,对SARS-CoV-2的最新文献进行解读,获取相关数据。结果目前研究出2个抗病毒药物靶点,一个抗体和疫苗的靶点及一个开发检测试剂的靶点,可能的有效药物和疫苗也已经开始临床研究。结论目前SARS-CoV-2的针对性靶点已清楚,候选药物和疫苗的疗效尚待确认。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 靶点 治疗药物 疫苗
文章速递基于网络药理学的金荞麦治疗糖尿病肺病的作用机制 认领
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作者 刘小敏 刘靖 +3 位作者 刘晓蝶 刘园园 邹亮 宋雨 《成都大学学报:自然科学版》 2021年第1期8-14,共7页
基于网络药理学研究金荞麦治疗糖尿病肺病的主要化学成分,作用靶点和相关信号通路.利用TCMSP数据库检索金荞麦主要的活性成分及作用靶点;基于OMIM和Gene Cards数据库找出与糖尿病肺病相关的作用靶点,求金荞麦主要成分的作用靶点与糖尿... 基于网络药理学研究金荞麦治疗糖尿病肺病的主要化学成分,作用靶点和相关信号通路.利用TCMSP数据库检索金荞麦主要的活性成分及作用靶点;基于OMIM和Gene Cards数据库找出与糖尿病肺病相关的作用靶点,求金荞麦主要成分的作用靶点与糖尿病肺病的相关靶点交集,将交集靶点导入STRING数据库构建PPI网络,对该网络进行拓扑分析找出关键靶点;把关键靶点导入DAVID 6.8.0数据库,找出金荞麦治疗糖尿病肺病关键靶点参与的生物学过程、分子功能、细胞组分和KEGG通路.结果显示,通过TCMSP数据库的口服利用度(OB)和类药性(DL)条件筛选出15个金荞麦主要化合物,相应作用靶点85个;与糖尿病肺病发病机制有关的作用靶点18个,经PPI网络分析得到9个关键靶点;GO分析富集得到生物过程72个,分子功能14个,细胞组分8个,65条KEGG信号通路.表明金荞麦治疗糖尿病肺病发挥药效的有效成分可能是没食子酸酯、(+)-儿茶素、β-谷甾醇、异鼠李素和原花青素B1等化合物,作用机制可能跟MAPK1、AKT1、EGFR、EGF、JUN等靶点,以及Erb B信号通路、Ras信号通路、癌症中的胆碱代谢、MAPK信号通路、局灶性粘连及TNF信号通路有关. 展开更多
关键词 金荞麦 糖尿病肺病 靶点 信号通路 网络药理学
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