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泡桐高密度分子遗传图谱的构建 预览
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作者 李文杨 王娟 +1 位作者 赵振利 范国强 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期80-85,共6页
以毛泡桐Paulownia tomentosa为母本、白花泡桐Paulownia fortunei为父本进行正反交,以杂交获得的子一代(F1)构建泡桐连锁图谱的作图群体,选取限制性内切酶EcoRI对185个样品的基因组进行酶切,利用Illumina Hiseq2000测序平台进行RAD测... 以毛泡桐Paulownia tomentosa为母本、白花泡桐Paulownia fortunei为父本进行正反交,以杂交获得的子一代(F1)构建泡桐连锁图谱的作图群体,选取限制性内切酶EcoRI对185个样品的基因组进行酶切,利用Illumina Hiseq2000测序平台进行RAD测序建库,以白花泡桐基因组为参考,采用SOAP2软件进行序列比对,利用筛选到的单核苷酸多态性SNP(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)位点对该群体进行基因型分析,使用Joinmap version 4.0软件构建泡桐连锁遗传图谱。结果表明:利用RAD测序技术共获得551894个SNP标记,构建了含20个连锁群的泡桐遗传连锁图谱,该图谱的总图距为2050.77cM,标记间平均图距为0.58cM,图谱预期长度为2064.29cM,图谱基因覆盖度为99.35%。本研究构建的泡桐连锁遗传图谱具有高精度和覆盖泡桐基因组完整(构建连锁群数目等于泡桐单倍体基因组染色体的数目)的优点,为泡桐分子育种学研究奠定了基础。 展开更多
关键词 泡桐 遗传图谱 限制性酶切位点相关DNA测序 单核苷酸多态性
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甜瓜侧枝相关性状的QTL定位
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作者 张肖静 张凯歌 +6 位作者 朱华玉 张宇 胡倩梅 程思源 张敏娟 胡建斌 杨路明 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期519-528,共10页
以甜瓜长侧枝自交系‘TopMark’和短侧枝自交系‘PI353814’为亲本,构建了F2群体和F2:3家系。利用92个F2单株构建了一张包含12个连锁群,353个SSR标记的遗传连锁图谱,覆盖基因组长度为1 565.88 cM,连锁群长度在86.98~186.68 cM,标记间的... 以甜瓜长侧枝自交系‘TopMark’和短侧枝自交系‘PI353814’为亲本,构建了F2群体和F2:3家系。利用92个F2单株构建了一张包含12个连锁群,353个SSR标记的遗传连锁图谱,覆盖基因组长度为1 565.88 cM,连锁群长度在86.98~186.68 cM,标记间的平均距离为4.44 cM。利用该连锁图谱结合F2:3家系表型鉴定数据,对甜瓜侧枝相关性状进行定位,共检测到6个QTL,分布在连锁群LGⅠ、LGⅢ和LGⅦ上,LOD值介于2.5067~12.5524之间,可解释9.9242%~48.2348%的表型变异率。其中侧枝总长主效QTLlbtl7.1和侧枝均长主效QTLlbal7.1均位于连锁群LGVⅡ的SSR标记CmSSR17145和CmSSR17293之间,贡献率分别为38.5923%和48.2348%。进一步利用186个F2:3家系和新开发标记对主效QTL进行了验证,发现侧枝总长主效QTL lbtl7.1定位在SSR标记CmSSR17251和CmSSR17253之间,与两标记的遗传距离分别为2.5和0.5 cM,可解释41.2742%的表型变异,侧枝均长主效QTL lbal7.1被定位在SSR标记CmSSR17238和CmSSR17251之间,距离两标记分别为1.5和0.5cM,可解释55.1739%的表型变异。 展开更多
关键词 甜瓜 侧枝 F2:3 遗传图谱 QTL定位
西瓜遗传图谱构建和基因定位研究进展 预览
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作者 李兵兵 刘文革 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2019年第2期1-6,共6页
西瓜是一种在世界范围内广泛种植的园艺作物,中国是世界上最大的西瓜生产国和消费国,对西瓜遗传育种的研究具有重要意义。遗传图谱是进行基因定位、图位克隆、分子标记辅助育种的重要工具,并为分子生物学的深入研究提供了基础。近年来,... 西瓜是一种在世界范围内广泛种植的园艺作物,中国是世界上最大的西瓜生产国和消费国,对西瓜遗传育种的研究具有重要意义。遗传图谱是进行基因定位、图位克隆、分子标记辅助育种的重要工具,并为分子生物学的深入研究提供了基础。近年来,随着高通量测序技术和分子标记的发展,西瓜遗传图谱研究取得了很大进展,基于不同遗传背景的西瓜遗传图谱陆续发表,极大地促进了西瓜基因组学和分子遗传育种的发展。笔者总结了近年来国内外西瓜遗传图谱构建和基因定位的研究进展及应用,并探讨了目前西瓜遗传图谱构建方面存在的主要问题及今后的研究趋势。 展开更多
关键词 西瓜 遗传图谱 基因定位
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基于SRAP分子标记的冰草遗传连锁图谱构建 预览
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作者 李佳奇 于卓 +3 位作者 杨东升 于肖夏 吴国芳 牛亚青青 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期76-83,共8页
构建高密度遗传连锁图谱是冰草抗性、品质、产量等重要性状QTL精细定位及标记辅助育种研究的基础。该试验以四倍体杂交冰草F2群体的202个分离单株及其亲本为材料,利用SRAP分子标记技术和Join Map 4.0作图软件对冰草的遗传连锁图谱进行... 构建高密度遗传连锁图谱是冰草抗性、品质、产量等重要性状QTL精细定位及标记辅助育种研究的基础。该试验以四倍体杂交冰草F2群体的202个分离单株及其亲本为材料,利用SRAP分子标记技术和Join Map 4.0作图软件对冰草的遗传连锁图谱进行了构建。结果表明:(1)共筛选出22对多态性好、标记位点清晰稳定的SRAP适宜引物,对冰草杂种F2分离单株的基因组DNA进行PCR扩增,共获得510个SRAP多态性标记位点,其比率占88.2%。(2)偏分离分析表明,偏分离标记比率仅为14.12%,符合遗传作图的要求。(3)成功构建了冰草的SRAP分子标记遗传连锁图谱,该图谱有14个连锁群、510个标记,连锁群间长度范围86.4~179.0cM,覆盖基因组总长度1912.9cM,标记间平均间距3.75cM,为高密度遗传图谱。 展开更多
关键词 冰草 SRAP标记 遗传图谱
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枣遗传图谱构建研究进展 预览
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作者 王中堂 张钟 +2 位作者 周广芳 李新岗 张琼 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1340-1348,共9页
枣遗传图谱是枣树分子辅助育种的重要工具之一。高质量的枣遗传图谱在遗传演化分析、QTLs基因定位等研究中发挥了重要作用。为开展图位克隆重要农艺性状基因、加快枣育种进程,本文简要概述了目前国内外枣遗传图谱的研究进展,包括设计亲... 枣遗传图谱是枣树分子辅助育种的重要工具之一。高质量的枣遗传图谱在遗传演化分析、QTLs基因定位等研究中发挥了重要作用。为开展图位克隆重要农艺性状基因、加快枣育种进程,本文简要概述了目前国内外枣遗传图谱的研究进展,包括设计亲本组合、真实子代鉴定、构建作图群体、遗传图谱构建和相关QTL定位研究等方面,进一步探讨前人研究存在的问题并提出相关解决措施,为开展筛选农艺状候选基因和枣分子辅助育种研究奠定了理论基础。 展开更多
关键词 遗传图谱 数量性状定位(QTL)
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饲用型小黑麦遗传图谱构建及草产量相关性状QTLs初步定位 预览
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作者 刘晶 赵方媛 +3 位作者 李冬梅 李雪 田新会 杜文华 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期219-226,共8页
本研究以饲用型小黑麦杂交F2代为作图群体,利用ISSR分子标记构建了遗传连锁图谱,并对小黑麦草产量相关性状(株高,分蘖数,单株生物量)进行了QTLs定位,可为小黑麦草产量相关主效QTL挖掘、功能基因定位以及分子标记辅助育种奠定基础。结果... 本研究以饲用型小黑麦杂交F2代为作图群体,利用ISSR分子标记构建了遗传连锁图谱,并对小黑麦草产量相关性状(株高,分蘖数,单株生物量)进行了QTLs定位,可为小黑麦草产量相关主效QTL挖掘、功能基因定位以及分子标记辅助育种奠定基础。结果表明:521个F2代单株草产量相关性状的田间表型数据呈连续变异,分布频率大致接近正态分布,可用于QTLs定位。该遗传图谱包含7个连锁群,图谱总长度为542.9cM,标记间平均距离为5.90cM,共有92个位点。对草产量相关性状基因进行QTL定位分析,共检测到17个QTLs,分布在6个连锁群上,控制株高的QTLs有5个,贡献率为6.7%~13.2%;控制分蘖数的QTLs有7个,贡献率为5.4%~15.4%;控制单株生物量的QTLs有5个,贡献率为7.4%~12.4%。其中QPH7-2,QNT2-2和QBS2分别对小黑麦株高、分蘖数和单株生物量的贡献率最大,为主效QTLs,可对其进行进一步克隆、转化及利用。 展开更多
关键词 小黑麦 ISSR标记 遗传图谱 草产量相关性状 QTLS定位
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全基因测序(WGS)在肠杆菌科细菌中的应用研究 被引量:1
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作者 周子超 何岚 丁月平 《智慧健康》 2019年第2期70-72,共3页
全基因测序(whole genome sequencing, WGS)是指通过高通量测序技术对物种个体或群体进行测序,分析获得的基因组图谱,找出其差异性,以在全基因组水平探究物种进化规律和筛选功能基因的研究技术。因其有获取信息全面、精确、高通量及高... 全基因测序(whole genome sequencing, WGS)是指通过高通量测序技术对物种个体或群体进行测序,分析获得的基因组图谱,找出其差异性,以在全基因组水平探究物种进化规律和筛选功能基因的研究技术。因其有获取信息全面、精确、高通量及高分辨率等优点,现已在细菌流行病学中广泛应用。目前有大量关于肠杆菌科细菌的WGS研究,探究细菌的致病、耐药机制等。本文主要概述和讨论了WGS在肠杆菌科细菌中的应用,并简述了其关键要点和应用前景,期望为WGS在细菌流行病学中的深入应用提供理论参考。 展开更多
关键词 全基因测序 肠杆菌科细菌 基因图谱
基于SNP和SSR标记的小麦品质性状的QTL定位
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作者 黄梦豪 刘天相 +2 位作者 强琴琴 李春莲 王中华 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期3966-3973,共8页
为给小麦品质性状的标记辅助选择提供备选分子标记,并进一步定位和克隆小麦部分品质相关性状的QTL,本研究利用普通小麦Heyne×Lakin杂交F2代单粒传获得的145个F8代重组自交系(Recombinantinbred line, RIL)群体,构建了含有2 082对标... 为给小麦品质性状的标记辅助选择提供备选分子标记,并进一步定位和克隆小麦部分品质相关性状的QTL,本研究利用普通小麦Heyne×Lakin杂交F2代单粒传获得的145个F8代重组自交系(Recombinantinbred line, RIL)群体,构建了含有2 082对标记(1 980对SNP标记和102对SSR标记)、总长度为2 120.13 cM的遗传连锁图谱,并利用该图谱对小麦连续两年的品质性状(蛋白质含量,湿面筋含量,淀粉含量和Zeleny沉降值)进行了 QTL分析。结果表明,共检测出11个QTL,其中,蛋白质含量有2个QTL,位于2A和5A染色体上,可解释的表型变异率6.94% 12.55%;湿面筋含量QTL有1个,位于5A染色体上,可解释的表型变异率8.40%~ 12.96%;淀粉含量QTL有3个,位于2A和5A染色体上,可解释的表型变异率9.78%~11.23%;Zeleny沉降值QTL有5个,位于2A、5A和7D染色体上,可解释的表型变异率4.75% 20.15%。其中5A染色体上存在这些品质性状QTL富集区,同时具有“一因多效”QTL位点。这个区段的发现,为小麦品质育种提供了参考依据。 展开更多
关键词 小麦(Triticum AESTIVUM L.) RIL群体 遗传图谱 品质性状 QTL
基于SLAF-seq技术的抗杨树叶锈病SNP位点开发
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作者 戴美丽 方乐成 +1 位作者 尹佟明 李小平 《南京林业大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期73-78,共6页
【目的】探索美洲黑杨抗叶锈病的分子机制,为杨树抗病分子育种提供理论参考。【方法】选取抗锈病差异显著的美洲黑杨‘2-2’与‘2-38’为亲本,通过控制授粉杂交获得80个F1代个体。用特异性位点扩增(specific-locus amplified fragmenl s... 【目的】探索美洲黑杨抗叶锈病的分子机制,为杨树抗病分子育种提供理论参考。【方法】选取抗锈病差异显著的美洲黑杨‘2-2’与‘2-38’为亲本,通过控制授粉杂交获得80个F1代个体。用特异性位点扩增(specific-locus amplified fragmenl sequencinq,SLAF-seq)简化基因组技术对所获F1代进行深度测序,以美洲黑杨第3代组装基因组为参照。通过序列比对筛选特异长度的DNA片段,构建SLAF-seq文库,获得特异性SNP位点。经美洲黑杨叶锈病的病原菌经形态学与分子工具鉴定,确定为落叶松-杨栅锈菌(Melampsora larici-populina Kleb.)。通过叶盘法控制条件接种并对被锈菌侵染后的杨树抗性进行评估;应用Kruskal-Wallis方法对接种结果进行检验。【结果】通过接种,获得了孢子堆数量和大小等表型数据;基于SNP标记的连锁分析,一共有8 723个SNP连锁至遗传图谱上;共识别出19个连锁群,总遗传距离为3 610.67 cM;通过Kruskal-Wallis检验可得到37个紧密连锁位点(P<0.005),标记分别位于Ⅰ、Ⅳ、Ⅵ、Ⅺ、ⅩⅤ和ⅪⅩ号连锁群上。【结论】利用SLAF-seq技术开发出了37个与杨树叶锈病抗病性状紧密关联的SNP分子标记,其中Marker42056位点连锁程度最高。 展开更多
关键词 美洲黑杨 落叶松-杨栅锈菌 连锁遗传图谱 SLAF标签 Kruskal-Wallis检验
闽南传统村落的景观基因识别与构建——以福建省泉州市土坑村为例 预览
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作者 王银霞 吴林汉昕 +2 位作者 叶凌颖 魏昱君 陈祖建 《福建建设科技》 2019年第5期8-12,共5页
福建闽南地区拥有久远的历史与优越的自然地理环境,造就了它独特的传统聚落文化。本文以福建省泉州市土坑村为例,从景观基因视角出发,分析土坑村的物质景观元素及非物质景观元素,识别并梳理土坑村的景观基因脉络,构建其景观基因图谱,为... 福建闽南地区拥有久远的历史与优越的自然地理环境,造就了它独特的传统聚落文化。本文以福建省泉州市土坑村为例,从景观基因视角出发,分析土坑村的物质景观元素及非物质景观元素,识别并梳理土坑村的景观基因脉络,构建其景观基因图谱,为今后传统村落保护与更新研究提供参考与借鉴。 展开更多
关键词 景观基因 闽南传统村落 土坑村 基因图谱
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基于黄褐棉导入系的棉花衣分QTL定位研究 预览
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作者 陈奇 周水娟 +7 位作者 孙康泰 刘静 袁宝童 王议萍 王为 王有武 汪保华 庄智敏 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第8期1735-1739,共5页
[目的]利用黄褐棉导入系(Introgression Lines,ILs),在构建分子遗传图谱的基础上,检测与衣分相关的数量性状位点(Quantitative Trait Locus,QTLs),以期发现黄褐棉中用于改良陆地棉的衣分QTL,服务于棉花产量的分子育种。[方法]以陆地棉PD... [目的]利用黄褐棉导入系(Introgression Lines,ILs),在构建分子遗传图谱的基础上,检测与衣分相关的数量性状位点(Quantitative Trait Locus,QTLs),以期发现黄褐棉中用于改良陆地棉的衣分QTL,服务于棉花产量的分子育种。[方法]以陆地棉PD94042为受体亲本,黄褐棉(Gossypium mustelinum)为供体亲本,两者杂交后代与陆地棉亲本回交,进而建立高世代回交群体并选择构建CSILs,通过种植黄褐棉CSILs,提取DNA展开微卫星标记(SSR)实验,构建遗传连锁图谱;并将所得基因型数据和表型数据相结合,用Win QTL Cart2.5软件开展导入系群体的衣分QTL定位。[结果]利用基于黄褐棉导入系的遗传图谱检测衣分QTL,成功检测到21个衣分相关QTLs,解释表型变异范围为19.3%~42%。其中,主效QTL qLP-3在2个环境中均被检测到,其增效基因均来自于黄褐棉,因此可能对标记辅助选择有重要意义。[结论]利用黄褐棉导入系群体成功鉴定出21个衣分相关的QTLs,该结果为棉花衣分分子标记辅助育种工作提供了借鉴及依据,也为后续进一步开展QTL精细定位奠定了基础。 展开更多
关键词 黄褐棉导入系 衣分 遗传图谱 QTL定位
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芥菜型油菜A9染色体物理图谱构建和结构变异分析 预览
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作者 李乐 刘芳瑛 +1 位作者 陆赢 刘忠松 《湖南农业大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期30-36,共7页
以四川黄籽自交系和紫叶芥自交系多次杂交形成的F6代重组自交系(RIL)群体为材料,运用基因分析技术,构建芥菜型油菜遗传图谱。采用锚定BAC的方法,构建重叠群,最终构建了由16个重叠群共计538个BAC组成的芥菜型油菜A9染色体物理图谱,参考... 以四川黄籽自交系和紫叶芥自交系多次杂交形成的F6代重组自交系(RIL)群体为材料,运用基因分析技术,构建芥菜型油菜遗传图谱。采用锚定BAC的方法,构建重叠群,最终构建了由16个重叠群共计538个BAC组成的芥菜型油菜A9染色体物理图谱,参考芥菜基因组,估计该物理图谱长度为46.26Mb,与已发表的白菜、甘蓝型油菜和芥菜参考基因组进行比较,发现芥菜型油菜A9染色体均发生了倒位和缺失等结构变异。 展开更多
关键词 芥菜型油菜 A9染色体 GBS标记 遗传图谱 物理图谱 结构变异
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G.41×新疆野苹果树体生长性状的QTL精细定位及候选基因预测 预览 被引量:1
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作者 董军 王京 +5 位作者 梁微 马百全 董丽娟 马锋旺 符轩畅 李翠英 《中国农业科学》 CSCD 北大核心 2018年第11期2155-2163,共9页
【目的】矮化砧木可以诱导地上部接穗品种矮化,实现苹果的丰产和稳产。因此,深入挖掘调控苹果树体生长的基因,可以改善苹果树形,加强苹果园地的管理方便性。【方法】以矮化苹果砧木‘G.41’和乔化苹果砧木新疆野苹果(Malus sieversii... 【目的】矮化砧木可以诱导地上部接穗品种矮化,实现苹果的丰产和稳产。因此,深入挖掘调控苹果树体生长的基因,可以改善苹果树形,加强苹果园地的管理方便性。【方法】以矮化苹果砧木‘G.41’和乔化苹果砧木新疆野苹果(Malus sieversii)为亲本构建的188株F1代分离群体为试材,并于每个分离群体植株上嫁接‘富士冠军’。基于SSR标记技术,采用Join Map 4.0作图软件构建苹果遗传连锁图,应用Map QTL 5.0作图软件,结合后代群体的表型数据,对接穗高度和接穗横截面积生长性状进行初步QTL定位。结合苹果基因组序列信息,利用Primer5.0软件进行新SSR标记开发,并对初步定位区域进行精细定位及候选基因预测。【结果】该研究从361对SSR引物中筛选出108对在亲本之间表现出多态的SSR引物,多态率为29.9%。其中95对引物用于遗传连锁图谱构建,并在5号连锁群上初步检测出4个与植株生长性状相关的QTL位点,与接穗高度、接穗横截面积性状紧密连锁的两个标记,为L05024和Hi09b04。根据初步定位区域的序列信息,设计了新的SSR引物24对,其中在亲本间表现出多态的有10对,利用该10对引物对5号连锁群重新分析。构建了包含21个SSR标记、总长为86.0 c M的高密度遗传图谱,其平均遗传距离为7.52 c M。通过对接穗高度与接穗横截面积生长相关性状的QTL分析,在SSR标记L05024和Hi09b04之间找到与其相关的QTL位点,其表型贡献率分别为19.2%和51.7%。将该QTL位点与基因组序列对比,发现其物理距离为543 kb,并且该QTL区间包含16个候选基因。推测其中MDP0000323212为与植株生长密切相关的基因。【结论】本研究将砧木诱导矮化基因定位于苹果第5号染色体543 kb区段内,侧翼标记分别为L05024和Hi09b04,其物理距离为4.048—4.591 Mb,并筛选到可能参与调控植株生长的候选基因MDP0000323212。 展开更多
关键词 苹果砧木 SSR 遗传图谱 QTL 候选基因
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扁豆的遗传育种及分子生物学研究现状与展望 预览 被引量:1
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作者 赵永亮 王丽洁 苑旺 《河南工业大学学报:自然科学版》 北大核心 2018年第3期121-126,共6页
扁豆是一种在世界范围内皆有广泛种植的小宗经济作物,种植历史悠久,不仅具有很好的食用价值,同时还有较高的药用价值。近年来,随着人们生活水平的提高,对扁豆等小宗特色经济作物的需求不断增加,推动扁豆的遗传育种和分子生物学研究快速... 扁豆是一种在世界范围内皆有广泛种植的小宗经济作物,种植历史悠久,不仅具有很好的食用价值,同时还有较高的药用价值。近年来,随着人们生活水平的提高,对扁豆等小宗特色经济作物的需求不断增加,推动扁豆的遗传育种和分子生物学研究快速发展。扁豆的遗传育种主要方法有传统的杂交和诱变育种,分子标记辅助育种和基因工程育种在扁豆育种方面尚未见报道。扁豆的遗传多样性有助于为扁豆的种质资源的保存及分子辅助选择提供参考依据,主要从形态标记和分子标记两方面展开了遗传多样性研究方法的介绍。分子标记技术的出现使得植物育种的间接选择成为可能,极大地提高遗传分析的准确性和育种的有效性。高密度的分子遗传连锁图谱在扁豆的定位、克隆以及分子标记辅助育种等方面有着极其重要的应用价值,是数量性状位点定位、基因定位克隆,以及分子标记辅助育种等研究的重要基础。对近年来扁豆在遗传育种、遗传多样性和遗传图谱3个方面取得的研究成果进行全面的综述,着重介绍了分子标记技术在扁豆遗传多样性和遗传图谱构建方面研究的应用情况,并对扁豆分子生物学研究的发展趋势进行展望,以期为扁豆及相关作物的研究提供参考。 展开更多
关键词 扁豆 遗传育种 遗传多样性 分子标记 遗传图谱
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分子标记在澳洲坚果研究中的应用 预览
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作者 李志强 贺熙勇 +1 位作者 吴超 耿建建 《热带农业科技》 2018年第2期46-49,共4页
澳洲坚果(Macadamiaspp.)具有很高的经济和营养价值,在国际市场上极受青睐,被誉为“坚果之王”。分子标记技术作为植物育种工作中极具效率的一种研究工具已被广泛用于澳洲坚果研究。本文论述了目前分子标记技术在澳洲坚果遗传连锁图谱... 澳洲坚果(Macadamiaspp.)具有很高的经济和营养价值,在国际市场上极受青睐,被誉为“坚果之王”。分子标记技术作为植物育种工作中极具效率的一种研究工具已被广泛用于澳洲坚果研究。本文论述了目前分子标记技术在澳洲坚果遗传连锁图谱构建、遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建等方面的研究进展,并分析了其在澳洲坚果研究中的应用前景。 展开更多
关键词 澳洲坚果 分子标记 遗传图谱 遗传多样性
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RAD-seq技术在柞蚕SNP开发及遗传图谱构建中的应用前景
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作者 钟亮 谌苗苗 +5 位作者 徐亮 孟宪民 宿桂梅 戚利 焦阳 李喜升 《蚕业科学》 CSCD 北大核心 2018年第5期770-777,共8页
柞蚕(Antheraea pernyi)是鳞翅目大蚕蛾科绢丝昆虫,具有可观的经济价值和食用价值。目前,在柞蚕基因组研究中仍没有SNP标记开发及遗传图谱构建的相关报道。以高通量测序为基础的简化基因组测序技术RAD-seq,以其流程简单,不受有无参考基... 柞蚕(Antheraea pernyi)是鳞翅目大蚕蛾科绢丝昆虫,具有可观的经济价值和食用价值。目前,在柞蚕基因组研究中仍没有SNP标记开发及遗传图谱构建的相关报道。以高通量测序为基础的简化基因组测序技术RAD-seq,以其流程简单,不受有无参考基因组的限制,费用低廉,一次测序就可获得海量SNP标记等特点,适用于柞蚕的基因组学研究。RAD-seq技术在许多物种中,已成功用于超高密度遗传图谱的构建、重要性状基因的精细定位等研究。本文主要介绍RAD-seq技术及其在基因组学研究中的应用,为促进该技术在柞蚕遗传标记开发和遗传图谱构建中的应用,推动柞蚕育种工作的快速发展奠定理论基础。 展开更多
关键词 柞蚕 RAD-seq SNP标记 遗传图谱
ISSR分子标记技术在甜菜育种中的应用 预览 被引量:4
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作者 邹奕 马龙彪 +2 位作者 江伟 李文晶 吴则东 《中国糖料》 2018年第3期75-77,80共4页
主要介绍了ISSR技术的原理及特点,对ISSR分子标记技术在甜菜上抗病育种、种质资源和品种遗传多样性分析、指纹图谱构建、SSR引物开发等应用进行综述。旨在为甜菜育种技术的发展提供参考。
关键词 甜菜 ISSR 遗传多样性 抗病育种 品种鉴定 遗传图谱
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籼稻C84和粳稻春江16B重组自交系遗传图谱构建及籽粒性状QTL定位与验证 预览 被引量:2
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作者 周梦玉 宋昕蔚 +15 位作者 徐静 付雪 李婷 朱雨晨 肖幸运 毛一剑 曾大力 胡江 朱丽 任德勇 高振宇 郭龙彪 钱前 吴明国 林建荣 张光恒 《中国水稻科学》 CSCD 北大核心 2018年第3期207-218,共12页
【目的】本研究旨在挖掘水稻粒型新基因、探索其分子机理,解析籽粒发育调控遗传网络奠定基础,并为通过分子标记聚合有利基因开展超级稻分子设计育种提供理论依据。【方法】以植株和籽粒形态差异较大的晚粳稻品种春江16B(CJ16B)和广亲... 【目的】本研究旨在挖掘水稻粒型新基因、探索其分子机理,解析籽粒发育调控遗传网络奠定基础,并为通过分子标记聚合有利基因开展超级稻分子设计育种提供理论依据。【方法】以植株和籽粒形态差异较大的晚粳稻品种春江16B(CJ16B)和广亲和中籼稻背景恢复系C84为亲本构建含有188个家系的重组自交系为作图群体,利用158对在双亲中存在多态性差异的分子标记,构建了遗传连锁图谱,总遗传距离为1428.40 cM,平均标记间距为9.04 cM。在构建遗传图谱的基础上,完成RIL188个株系籽粒的粒长、粒宽、粒厚、长宽比和千粒重等5个性状考查并进行QTL定位。【结果】在海南陵水和浙江杭州两地共检测到籽粒相关主效QTL 30个,包括籽粒QTL新座位18个,解释遗传变异3.51%-17.25%。其中粒长、粒宽、粒厚和长宽比QTL位点分别为9个、5个、5个和6个,千粒重QTL位点5个。经基因座位比对,发现有5个QTL区间与已克隆的调控籽粒形态相关基因座位相近,我们通过对双亲目标基因的测序并根据差异位点设计d CAPs分子标记进行验证。【结论】该RIL群体及其遗传图谱可用于水稻重要农艺性状主效QTL基因的定位和克隆,新定位的18个粒型QTL可以为水稻籽粒发育调控网络提供补充和资料积累。 展开更多
关键词 水稻 重组自交系 遗传图谱 籽粒性状 QTL
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分子标记技术在家畜育种中的应用 预览
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作者 詹海杰 曹亮 +3 位作者 李燕平 牛晓艳 郑建婷 冯国亮 《中国农学通报》 2018年第21期145-147,共3页
为了将分子标记技术更好的应用到家畜育种工作中,本研究详细总结了分子标记技术在家畜遗传多样性分析、亲缘关系分析、遗传图谱构建、基因定位、杂种优势预测、性别鉴定和抗病育种等诸多方面的应用研究。最后提出应将表型性状、系谱和... 为了将分子标记技术更好的应用到家畜育种工作中,本研究详细总结了分子标记技术在家畜遗传多样性分析、亲缘关系分析、遗传图谱构建、基因定位、杂种优势预测、性别鉴定和抗病育种等诸多方面的应用研究。最后提出应将表型性状、系谱和分子标记三者结合应用于家畜遗传育种等方面的工作。 展开更多
关键词 分子标记 家畜 育种 遗传图谱 基因定位
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结球甘蓝高密度遗传图谱构建及抽薹时间相关QTL定位 预览
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作者 陈登辉 李海龙 +3 位作者 田多成 孙超 颉建明 康俊根 《甘肃农业大学学报》 CSCD 北大核心 2018年第5期21-28,共8页
【目的】未熟抽薹是早春结球甘蓝产量损失的原因之一,为了进一步明确甘蓝抽薹性状的遗传基础.【方法】以易抽薹、晚熟、不结球的‘R4P1’为父本和晚抽薹、早熟、圆球的‘R2P2’为母本构建了126个重组自交系群体F7-8,从1230个分子标记中... 【目的】未熟抽薹是早春结球甘蓝产量损失的原因之一,为了进一步明确甘蓝抽薹性状的遗传基础.【方法】以易抽薹、晚熟、不结球的‘R4P1’为父本和晚抽薹、早熟、圆球的‘R2P2’为母本构建了126个重组自交系群体F7-8,从1230个分子标记中筛选出408个多态性分子标记,并对控制甘蓝抽薹性状的QTL进行标记定位.【结果】387个分子标记定位到9个连锁群中,覆盖长度838cM,标记间平均图距2.2cM;在第8染色体上定位到1个与抽薹时间相关的QTL(qbt-2-2),其贡献率为9.1%,加性效应为-1.23,分子标记为CB10139.【结论】本研究构建的遗传图谱标记数量多,平均密度大,准确性高,标记CB10139可用于晚抽薹资源的筛选及耐抽薹甘蓝品种培育. 展开更多
关键词 结球甘蓝 抽薹性状 重组自交系 遗传连锁图谱 QTL定位
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