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DNA-Lipid探针用于细胞膜外pH值的原位成像 预览
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作者 周文玉 汤娉婷 +1 位作者 杨荣华 郑晶 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期154-158,共5页
将二酰基脂质体自动偶联到两端标有Cy3和Cy5的具有i-motif结构的DNA链上,形成二酰基脂质体-DNA共轭物(DNA-lipid)探针。二酰基脂质体与细胞膜之间强烈的疏水作用可使该探针直接插入细胞膜表面,实现缺氧和常氧条件下细胞外pH值的比率型... 将二酰基脂质体自动偶联到两端标有Cy3和Cy5的具有i-motif结构的DNA链上,形成二酰基脂质体-DNA共轭物(DNA-lipid)探针。二酰基脂质体与细胞膜之间强烈的疏水作用可使该探针直接插入细胞膜表面,实现缺氧和常氧条件下细胞外pH值的比率型检测。在高pH值条件下,具有i-motif结构的DNA链两端的荧光基团处于分离状态,无FRET效应;在低pH值条件下,具有i-motif结构的DNA链在细胞膜表面形成四聚体结构,两端的荧光基团相互靠近,产生强的FRET效应。通过测定两种荧光基团的荧光强度比值实现了pH值的定量检测。利用此探针对pH值的灵敏响应实现了对缺氧环境中细胞外pH值的精确测量,在生理病理学上具有重大意义。 展开更多
关键词 缺氧环境 细胞外pH值 i-motif结构 二酰基脂质体 荧光共振能量转移 成像分析
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单根DNA短链构筑pH响应超分子水凝胶 被引量:1
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作者 史杰中 贾昊旸 刘冬生 《高分子学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2017年第1期135-142,共8页
设计合成了一条包含两段自互补序列和一段富含胞嘧啶(C)序列的DNA单链.在碱性条件下,两段自互补序列可通过分子间自组装形成一维DNA纳米线,调节pH至酸性条件后,胞嘧啶序列通过形成双分子i-motif结构将纳米线交联,从而形成DNA水... 设计合成了一条包含两段自互补序列和一段富含胞嘧啶(C)序列的DNA单链.在碱性条件下,两段自互补序列可通过分子间自组装形成一维DNA纳米线,调节pH至酸性条件后,胞嘧啶序列通过形成双分子i-motif结构将纳米线交联,从而形成DNA水凝胶.当加入酸或碱调节体系的pH时,水凝胶的力学强度会发生变化.在pH为5.3时,水凝胶力学强度达到最大,增大或减小pH都会使水凝胶强度降低.同时,改变DNA单链浓度也能够调节水凝胶的力学强度.此凝胶制备过程原料合成简便,无需涉及不同DNA链定量配比的问题,大大简化了实验操作;另外i-motif结构在形成与解离两态之间的转换非常迅速,在几秒钟之内便可完成,也赋予该凝胶快速pH响应的特性. 展开更多
关键词 DNA水凝胶 自互补 i-motif结构 PH响应
Mechano-chemical selections of two competitive unfolding pathways of a single DNA i-motif
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作者 徐悦 陈虎 +5 位作者 璩玉杰 Artem K.Efremov 黎明 欧阳钟灿 刘冬生 严洁 《中国物理B:英文版》 SCIE EI CAS CSCD 2014年第6期621-628,共8页
The DNA i-motif is a quadruplex structure formed in tandem cytosine-rich sequences in slightly acidic conditions.Besides being considered as a building block of DNA nano-devices, it may also play potential roles in re... The DNA i-motif is a quadruplex structure formed in tandem cytosine-rich sequences in slightly acidic conditions.Besides being considered as a building block of DNA nano-devices, it may also play potential roles in regulating chromosome stability and gene transcriptions. The stability of i-motif is crucial for these functions. In this work, we investigated the mechanical stability of a single i-motif formed in the human telomeric sequence 5-(CCCTAA)3CCC, which revealed a novel pH and loading rate-dependent bimodal unfolding force distribution. Although the cause of the bimodal unfolding force species is not clear, we proposed a phenomenological model involving a direct unfolding favored at lower loading rate or higher pH value, which is subject to competition with another unfolding pathway through a mechanically stable intermediate state whose nature is yet to be determined. Overall, the unique mechano–chemical responses of i-motif-provide a new perspective to its stability, which may be useful to guide designing new i-motif-based DNA mechanical nano-devices. 展开更多
关键词 机械化学反应 DNA 竞争 机械稳定性 路径 纳米器件 端粒序列 酸性条件
基于核酸i-motif结构的pH响应荧光传感器 预览
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作者 吕岩 贾美琪 +3 位作者 周会鹏 廖冬丽 艾永兴 于聪 《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期31-35,共5页
利用核酸i-motif结构对质子的超敏感特性,选择富含胞嘧啶C的核酸链及其互补链,以及染料SYBR Green Ⅰ对单双链DNA的不同荧光响应特性,研制了一种灵敏的新型pH响应荧光传感器。当pH值从5.0变为7.5时,SYBR Green Ⅰ的荧光强度增大了4倍以... 利用核酸i-motif结构对质子的超敏感特性,选择富含胞嘧啶C的核酸链及其互补链,以及染料SYBR Green Ⅰ对单双链DNA的不同荧光响应特性,研制了一种灵敏的新型pH响应荧光传感器。当pH值从5.0变为7.5时,SYBR Green Ⅰ的荧光强度增大了4倍以上,pH传感范围是5.0~7.5,并显示出很高的pH分辨率(0.1个pH单元)。该pH传感器具有简单、快速、成本低等优点,有望用于相关生物过程中微小pH值变化的传感分析。 展开更多
关键词 核酸i-motif结构 SYBR Green pH响应传感器 荧光
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d(TCn)序列形成i-Motif四聚体的电喷雾质谱分析 预览
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作者 秦玉娇 魏士刚 +2 位作者 刘振爽 汪兵 国新华 《分析化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第6期 932-935,共4页
富含胞嘧啶(C)的DNA序列d(TCn)能通过C和质子化CH+氢键之间的相互作用形成平行的双链结构,两条质子化双链从头到尾插入,进一步形成反平行i-Motif四链结构。利用电喷雾质谱在乙酸-乙酸铵缓冲溶液中研究了样品浓度、缓冲液的浓度、... 富含胞嘧啶(C)的DNA序列d(TCn)能通过C和质子化CH+氢键之间的相互作用形成平行的双链结构,两条质子化双链从头到尾插入,进一步形成反平行i-Motif四链结构。利用电喷雾质谱在乙酸-乙酸铵缓冲溶液中研究了样品浓度、缓冲液的浓度、溶液的pH值及d(TCn)序列中C的长度(n=3,4,5,6)对d(TCn)形成四分子i-Motif结构影响。结果显示:d(TC5)序列在pH 4.0~5.0,甲醇含量为30%,浓度为20mmol/L醋酸-醋酸铵缓冲溶液中形成四聚体准分子离子强度最高。对于所研究的d(TCn)序列,序列长度(n)越大,形成四分子i-Motif离子的相对强度越高。 展开更多
关键词 电喷雾离子阱质谱 四聚体i-Motif结构 d(TCn)序列 C.CH+碱基对
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d(C4)相关序列形成四分子i-Motif结构的电喷雾质谱研究 预览 被引量:1
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作者 秦玉娇 魏士刚 +3 位作者 王晓录 杨帆 汪兵 国新华 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2011年第12期 2748-2751,共4页
设计了与富含胞嘧啶(C)的DNA序列d(C4)相关的DNA序列d(C4),d(TC4),d(AC4),d(T2C4),d(A2C4),d(C4T),d(C4A)和d(TC4T);采用电喷雾质谱测定发现这些序列形成四分子非共价复合物离子,根据离子的相对丰度可确定形成四链i... 设计了与富含胞嘧啶(C)的DNA序列d(C4)相关的DNA序列d(C4),d(TC4),d(AC4),d(T2C4),d(A2C4),d(C4T),d(C4A)和d(TC4T);采用电喷雾质谱测定发现这些序列形成四分子非共价复合物离子,根据离子的相对丰度可确定形成四链i-motif结构的数量和可能性;同时考察了腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)在d(C4)序列的5'和3'端对其形成四分子i-motif结构的影响.结果表明,在d(C4)的5'端增加A碱基或T碱基更易形成四分子复合物;5'端含T碱基比含A碱基更利于形成四分子复合物;而在d(C4)序列中增加2个A碱基或T碱基比增加相应的单个碱基形成了更高丰度的四分子离子峰. 展开更多
关键词 DNAi-motif结构 电喷雾质谱 d(C4)相关序列 非共价相互作用
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