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Let-7诱导自噬在酒精性肝病中的作用研究 预览
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作者 钱倩宇 潘然 +5 位作者 常开心 田男 钱颖 杜仲燕 李松涛 窦晓兵 《浙江中医药大学学报》 CAS 2019年第5期474-480,共7页
[目的]探讨lncRNA/let-7在酒精性肝病(alcohol liver disease, ALD)中的作用机制。[方法]通过喂食饲料含酒精的酒精喂养组(alcohol feeding group, AF),建立基于C57BL/6小鼠的ALD动物模型。制备血液和肝脏组织样品。在ALD小鼠模型和H2O... [目的]探讨lncRNA/let-7在酒精性肝病(alcohol liver disease, ALD)中的作用机制。[方法]通过喂食饲料含酒精的酒精喂养组(alcohol feeding group, AF),建立基于C57BL/6小鼠的ALD动物模型。制备血液和肝脏组织样品。在ALD小鼠模型和H2O2处理的人肝癌细胞(Human hepatocellular carcinoma, HepG2)细胞氧化应激模型中测定6种let-7 miRNA候选物的表达水平。基于Targetscan 6.2和miRanda 3.3a的生物信息学分析用于预测可能与let-7相互作用的下游靶基因和长链非编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA)候选物。然后使用qRT-PCR在小鼠肝组织中定量预测的靶miRNA和lncRNA的水平。[结果] 1) AF组肝组织中let-7表达显著低于对照饲料(pair feeding, PF)组(P<0.05),特别是let-7c、let-7d和let-7g表达水平显著降低(P<0.05)。2)与对照组(untreated, UT)相比,H2O2处理的HepG2细胞中let-7表达也下调(P<0.05)。3) AF组中发现自噬相关基因4 (autophagy related gene 4, Atg4)、自噬相关基因1 (autophagy related gene 1, Atg1)、自噬基因Beclin、自噬微管相关蛋白1轻链3B (light chain 3B, LC3B)等多种重要自噬生物标志物的表达水平均下调(P<0.05),与慢性酒精摄入可抑制细胞自噬水平的理论相一致。4)预测了3种调控let-7的潜在lncRNA候选物NONMMUT012132、NONMMUT019851和NONMMUT068425。其中,NONMMUT012132的表达在AF组中上调,而其他两个lncRNA被下调。[结论]本研究表明,由酒精消耗过量引起的肝组织氧化损伤可能导致let-7 miRNAs和细胞自噬活性的下调,lncRNA可能参与let-7活性水平的调节。 展开更多
关键词 酒精性肝病 LET-7 lncRNA MICRORNA 自噬
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长链非编码RNA Hotair通过调控巨噬细胞表型转换促进胃癌细胞增殖与侵袭 预览
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作者 李燕 周雄坤 +1 位作者 刘静 苟亚军 《中华细胞与干细胞杂志(电子版)》 2019年第1期23-28,共6页
目的探讨胃癌细胞是否通过长链非编码RNA Hotair 作用于巨噬细胞,将其转化为癌症支持细胞,进而促进胃癌的增殖与侵袭。方法实验分为对照组与AGS 细胞共培养组,转染实验分为对照组、Hotair 过表达组和RNA 干扰组胃癌细胞与巨噬细胞共培... 目的探讨胃癌细胞是否通过长链非编码RNA Hotair 作用于巨噬细胞,将其转化为癌症支持细胞,进而促进胃癌的增殖与侵袭。方法实验分为对照组与AGS 细胞共培养组,转染实验分为对照组、Hotair 过表达组和RNA 干扰组胃癌细胞与巨噬细胞共培养实验检测巨噬细胞表型转换。进行原位杂交实验对M2 型巨噬细胞与lncRNA Hotair 共定位。通过RT- PCR 实验检测并筛选出促进巨噬细胞表型转换的关键lncRNA。通过RNA 干扰技术敲低胃癌细胞lncRNA 水平并进行共培养实验。随后通过CCK-8 实验与Transwell 实验检测转型后的癌症相关巨噬细胞对胃癌细胞增殖与侵袭能力的影响。两组间均数比较采用t 检验,多组均数间比较采用单因素方差分析,组间多重比较采用SNK-q 检验。结果共培养实验结果表明,相比于对照组(5.63±1.97)个,AGS 细胞组中含有更多的CD206 阳性M2 型癌症相关巨噬细胞(32.51±5.44)个,两者比较差异有统计学意义(t =25.742,P = 0.001);ELISA实验也证明AGS 细胞组的巨噬细胞分泌更多的抑炎因子[TGF-β:(163.45±54.91)pg/ml,对照组:(87.32±19.24) pg/ml;IL-4:(156.83±69.25)pg/ml,对照组:(49.94±17.55)pg/ml;IL-10:(385.65±24.75)pg/ml,对照组:(98.82±46.26)pg/ml],两组间比较差异有统计学意义(t = 7.167,8.203,29.991,P 均< 0.05)。GEO 数据库鉴定并使用RT-PCR 筛选出Hotair 为关键lncRNA,随后的RNA 干扰实验表明,Hotair 敲低会抑制巨噬细胞的转变(CD206 阳性细胞数量由41.12±6.91 变为21.45±2.19),进而降低胃癌细胞的增殖与侵袭能力。结论胃癌细胞的lncRNA Hotair 会被巨噬细胞摄取,将其转化为癌症相关巨噬细胞,进而促进胃癌细胞的增殖与侵袭能力,这为胃癌的治疗提供了新的可能的靶点。 展开更多
关键词 lncRNA 胃癌 巨噬细胞 细胞增殖 细胞侵袭
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lncRNA-SChLAP1在肝细胞癌中的表达及临床意义 预览
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作者 孙小艳 张晓艳 《国际消化病杂志》 CAS 2019年第3期202-206,共5页
目的探究lncRNA-SChLAP1在原发性肝细胞癌(HCC)中的表达及临床意义。方法收集经手术切除的92例HCC标本及46例癌旁肝组织标本,采用RT-PCR方法检测SChLAP1的mRNA表达水平,分析其与临床病理学参数及生存期的相关性。结果SChLAP1在HCC组织... 目的探究lncRNA-SChLAP1在原发性肝细胞癌(HCC)中的表达及临床意义。方法收集经手术切除的92例HCC标本及46例癌旁肝组织标本,采用RT-PCR方法检测SChLAP1的mRNA表达水平,分析其与临床病理学参数及生存期的相关性。结果SChLAP1在HCC组织中的表达水平明显高于癌旁肝组织,差异有统计学意义(P<0.05)。SChLAP1的高表达率与肿瘤大小、临床分期、是否有门脉癌栓明显相关。门脉未侵犯组、早期组和晚期组患者行组内比较显示,SChLAP1高表达者的无病生存率和总生存率均低于低表达者。SChLAP1高表达是HCC患者预后不良的独立风险因子。结论lncRNA-SChLAP1可作为评估HCC预后不良的潜在标志物。 展开更多
关键词 lncRNA SChLAP1 肝细胞癌 预后
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猪PAANCR组织表达谱分析及其对脂质生成的影响 预览
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作者 王璟 李庆东 +9 位作者 滑留帅 陈俊峰 张家庆 任巧玲 刘付玖 张华 曹海 徐照学 邢宝松 白献晓 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第10期2834-2842,共9页
前期通过高通量测序比较去势和非去势猪皮下脂肪长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的表达差异,筛选到一个表达差异极显著的novel lncRNA——PAANCR,本试验旨在研究PAANCR在猪育肥不同阶段不同组织中的表达规律及其与脂质生成... 前期通过高通量测序比较去势和非去势猪皮下脂肪长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的表达差异,筛选到一个表达差异极显著的novel lncRNA——PAANCR,本试验旨在研究PAANCR在猪育肥不同阶段不同组织中的表达规律及其与脂质生成的关系。选用10头健康长×大二元杂交仔猪,在90和210 d各随机选取3头屠宰取样,使用实时荧光定量PCR方法检测PAANCR的表达谱,同时在3T3-L1细胞中使用siRNA干扰PAANCR的同源体lncRNA B130024G19Rik,通过油红O染色和实时荧光定量PCR分析其对脂肪沉积的作用。结果发现,PAANCR具有明显的组织特异性和发育特异性,其在肺脏、子宫、脾脏、肾脏和脂肪组织中表达量较高,而在肝脏、小肠和脑中的表达量随着年龄增长而增加,在肌肉组织中几乎不表达。同时,通过siRNA介导的干扰能够显著抑制PAANCR同源体的表达量,PAANCR同源体表达量降低后,关键成脂分化和脂质沉积调控基因表达量也随之减少。提示PAANCR可以作为调控猪脂质生成的候选因子,对于深入研究lncRNA参与调控猪脂质生成的分子机制具有重要意义。 展开更多
关键词 lncRNA 组织表达谱 RNA干扰 脂质生成
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尼罗罗非鱼雌性性腺关键LncRNA的鉴定和表达分析 预览
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作者 彭锟 宋凌云 +1 位作者 乔栖梧 林艳华 《西南师范大学学报:自然科学版》 CAS 北大核心 2019年第6期40-45,共6页
生殖细胞的分化与发育是硬骨鱼类性别分化的重要环节,并受到遗传和环境2个因素的影响.为研究LncRNA在硬骨鱼类卵母细胞发育以及性别分化中的作用,课题组通过转录组测序获得了尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)雌、雄性腺中呈现差异表达... 生殖细胞的分化与发育是硬骨鱼类性别分化的重要环节,并受到遗传和环境2个因素的影响.为研究LncRNA在硬骨鱼类卵母细胞发育以及性别分化中的作用,课题组通过转录组测序获得了尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)雌、雄性腺中呈现差异表达的LncRNA,并选取LncRNA(TCONS02477925)开展研究.发现该LncRNA具有2个外显子,属于典型的基因间LncRNA(Intergenic LncRNA),转录本全长1 537 nt,基因组定位于19号连锁群(Linkage Group 19,LG19)上,并且该基因在卵巢的表达水平显著高于精巢.荧光原位杂交结果表明,该LncRNA主要表达在I和II时相的卵母细胞的细胞质中.转录组测序结果及生物信息学分析发现,qrsl1和rtn4ip1可能是该LncRNA的cis靶基因,并且2个靶基因在卵巢中表达丰度较高.因此,本研究表明该LncRNA在罗非鱼卵母细胞发育和性别分化中可能有重要的作用. 展开更多
关键词 尼罗罗非鱼 LncRNA 卵母细胞 性别决定与分化
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鸡lncRNA-MSTRG.15568.9及其预测靶基因的表达 预览
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作者 黄子妍 孙研研 +9 位作者 李云雷 许红 刘一帆 石雷 叶建华 麻慧 倪爱心 王攀林 谢金防 陈继兰 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第7期1986-1993,共8页
试验旨在了解在鸡睾丸中高表达的1个长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)及其预测靶基因的时空表达规律,研究二者在鸡弱精子症中的调控作用。根据弱精子症和正常北京油鸡公鸡睾丸转录组测序筛选到的1个高表达的lncRNA(MSTRG.1556... 试验旨在了解在鸡睾丸中高表达的1个长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)及其预测靶基因的时空表达规律,研究二者在鸡弱精子症中的调控作用。根据弱精子症和正常北京油鸡公鸡睾丸转录组测序筛选到的1个高表达的lncRNA(MSTRG.15568.9),采用顺式(cis)作用模式预测其潜在靶基因SPAG4(sperm-associated antigen 4),进一步采用实时荧光定量PCR方法进行表达量分析。分别选择3只0、5、20、30、45、60周龄正常北京油鸡公鸡,检测MSTRG.15568.9与SPAG4基因在不同周龄公鸡睾丸中的表达量差异;选择30周龄3只正常公鸡,采集睾丸、肝脏和脾脏等8个部位组织样品,检测MSTRG.15568.9与SPAG4基因在不同组织间的表达规律;选择45周龄弱精子症公鸡和正常公鸡各3只,对比MSTRG.15568.9与SPAG4基因在睾丸的表达量差异。结果显示,MSTRG.15568.9与SPAG4存在明显的时空表达差异,且二者表达趋势基本一致。在不同周龄的鸡睾丸组织中,MSTRG.15568.9和SPAG4的表达趋势相近,MSTRG.15568.9在20周龄的表达量显著高于0、5、30、45、60周龄(P<0.05),0和5周龄表达量显著低于20、30、45和60周龄(P<0.05);SPAG4在45周龄表达量最高,其次是20周龄(P<0.05)。MSTRG.15568.9和SPAG4在睾丸和肝脏中的表达量均显著高于脾脏、肾脏等组织(P<0.05);在正常睾丸组织中的表达量均显著高于弱精子症睾丸组织(P<0.05)。综上所述,MSTRG.15568.9与SPAG4基因具有较明显的组织表达特异性,且MSTRG.15568.9可能调控SPAG4基因的表达,参与精子发生与精子活力调控;但其具体作用机制需要进一步探索。本研究可为鉴定与鸡弱精子症调节机制相关的功能基因提供参考。 展开更多
关键词 lncRNA 睾丸 精子活力 实时荧光定量PCR
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猪单核源性巨噬细胞受FSL-1刺激后lncRNAs的鉴定与特征分析 预览
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作者 赵为民 方晓敏 +5 位作者 涂枫 周李生 李碧侠 王学敏 付言峰 任守文 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第2期346-356,共11页
lncRNA是新近发现的一种具有重要功能的RNA分子,在各种生理活动中发挥着重要作用。为鉴定猪单核源性巨噬细胞受FSL-1刺激后相关的lncRNA,利用二代测序技术结合生物信息学对lncRNA进行了组装与特征分析。结果显示FSL-1刺激成功地构建了... lncRNA是新近发现的一种具有重要功能的RNA分子,在各种生理活动中发挥着重要作用。为鉴定猪单核源性巨噬细胞受FSL-1刺激后相关的lncRNA,利用二代测序技术结合生物信息学对lncRNA进行了组装与特征分析。结果显示FSL-1刺激成功地构建了细胞炎症模型,试验组与对照组共鉴定到1056个lncRNA转录本,其对应于831个基因座,这些lncRNA的平均长度为1643bp,平均外显子数为2.4个。相对于对照组,试验组有51个lncRNA上调表达,44个lncRNA下调表达。在上调lncRNA两侧相邻的蛋白质编码基因参与免疫反应、炎症反应、病毒反应等通路,而在下调lncRNA两侧相邻的蛋白质编码基因参与的通路较少,不参与上述通路。定量PCR结果显示挑选的4个lncRNA的差异倍数与RNA-Seq的结果相似,其中上调的lncRNA呈现一定的组织特异表达,而下调的lncRNA呈现多组织表达。这些结果为进一步研究lncRNA在FSL-1介导的炎症反应中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 lncRNA 单核源性巨噬细胞 FSL-1 炎症
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长链非编码RNA在甲状腺乳头状癌中的表达谱分析
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作者 郭润生 王远强 +1 位作者 史佩东 沈纳 《中华全科医学》 2019年第8期1408-1412,共5页
目的长链非编码RNA(lncRNA)在肿瘤的发生和发展中起重要作用。本研究使用基因芯片技术筛选甲状腺乳头状癌中差异表达的lncRNA,并对这些lncRNA调控的靶基因进行预测和分析。方法本研究使用微阵列来研究3例甲状腺乳头状癌(PTC)和配对的邻... 目的长链非编码RNA(lncRNA)在肿瘤的发生和发展中起重要作用。本研究使用基因芯片技术筛选甲状腺乳头状癌中差异表达的lncRNA,并对这些lncRNA调控的靶基因进行预测和分析。方法本研究使用微阵列来研究3例甲状腺乳头状癌(PTC)和配对的邻近非癌性甲状腺组织中lncRNA的表达。基因功能通过GO(Gene Ontology,GO)和通路分析进行评估,并预测lncRNA潜在的靶基因。结果与邻近的非癌性甲状腺组织相比,共有855个差异表达lncRNA,上调195个,下调660个(FC>2,P<0.05);2370个差异表达mRNA,上调801个,下调1569个(FC>2,P<0.05)。其中差异较大的lncRNA有23个,mRNA有79个(FC>4)。lncRNA-SLC34A2和它相关的mRNA GRCh38(NM001177998)差异表达最为显著(FC=23.5)。差异表达的mRNA中显著富集的GO途径显示:一些与肿瘤有关,如"焦粘连""ECM-受体相互作用""MAPK信号传导途径"和"PI3K/AKT信号传导途径"。经过通路分析,42条信号通路在差异表达的转录后显著富集,其中"焦粘连"最为显著(P=8.499×10^-7)并与47个差异表达基因有关。239个与其相关mRNA的lncRNAs可能与顺式调控有关。lncRNAs和mRNAs的位点之间的相对位置关系在基因的不同位点。结论本研究是甲状腺肿瘤相关的LNCRNA谱的补充,发现了一定数量的差异表达的LNCRNA,并预测其功能靶向基因和途径。今后,笔者将选择更多的样本,深化对lncRNA分子机制和生化功能的研究,为甲状腺癌的早期诊断和治疗提供新的准确方法。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 lncRNA 微阵列
TCGA数据库中肝癌相关差异长链非编码RNA筛选和功能预测 预览
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作者 孙金旗 马佳康 +3 位作者 任凯凯 李南 李雨濛 马军 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2019年第2期147-153,共7页
目的通过数据库挖掘寻找肝癌差异长链非编码RNA并预测其调控机制。方法从TCGA数据库中下载374例肝癌样本和50例正常样本lncRNA、miRNA、mRNA的测序数据,筛选出差异基因后构建ceRNA网络关系图,对差异基因进行生存分析。设置差异倍数(fold... 目的通过数据库挖掘寻找肝癌差异长链非编码RNA并预测其调控机制。方法从TCGA数据库中下载374例肝癌样本和50例正常样本lncRNA、miRNA、mRNA的测序数据,筛选出差异基因后构建ceRNA网络关系图,对差异基因进行生存分析。设置差异倍数(foldChange)≥2,P<0.01。结果在差异基因中发现77个lncRNA与miRNA相关,其中6个(HTR2A-AS1、AC073352.1、AL359878.1、AP002478.1、C2orf48、MYLK-AS1)与肝癌的总生存期相关;并发现了以hsa-mir-424和hsa-mir-519d为关键节点的ceRNA调控网络。结论通过对TCGA肝癌基因数据的分析,筛选了6个lncRNA与肝癌的生存期有关,hsa-mir-424和hsa-mir-519d是重要的ceRNA调控网络节点。 展开更多
关键词 肝癌 lncRNA ceRNA
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长链非编码RNA在调控抗病毒天然免疫应答中的研究进展
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作者 王琪 张玳宁 +1 位作者 冯文靖 段铭 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期693-700,共8页
天然免疫系统是机体防御病原微生物入侵的第一道防线,其生物效应依赖于复杂的信号传导和动态的基因表达调控。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类不编码蛋白质的RNA转录本。近年来,越来越多的研究表明lncRNA具有在表观遗... 天然免疫系统是机体防御病原微生物入侵的第一道防线,其生物效应依赖于复杂的信号传导和动态的基因表达调控。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类不编码蛋白质的RNA转录本。近年来,越来越多的研究表明lncRNA具有在表观遗传、转录、转录后及翻译等水平调控基因表达的能力,其功能异常与多种疾病的发生发展密切相关。本文综述了病毒和宿主编码lncRNA参与调控抗病毒天然免疫应答的研究进展,广泛深入地开展相关研究不仅有助于理解病毒与宿主间的相互作用,而且有益于发现新的抗病毒策略。 展开更多
关键词 长链非编码RNA(lncRNA) 天然免疫 病毒
长链非编码RNA的功能与人类重大疾病的相关性 预览
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作者 张晓丽 陈伟强 王烈峰 《赣南医学院学报》 2019年第4期410-416,共7页
长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)是一类转录本长度超过200 nt的RNA分子,因缺少特异性开放阅读框,所以不具有编码蛋白质的能力。曾一度被认为是转录组的噪音、垃圾序列、RNA聚合酶Ⅱ(PolⅡ)的副产物,因此被人类所忽视。高通... 长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)是一类转录本长度超过200 nt的RNA分子,因缺少特异性开放阅读框,所以不具有编码蛋白质的能力。曾一度被认为是转录组的噪音、垃圾序列、RNA聚合酶Ⅱ(PolⅡ)的副产物,因此被人类所忽视。高通量测序技术使lncRNA的研究深入到基因水平,越来越多的lncRNA被注释,其生物学功能渐渐被人类所熟知。lncRNA可以与各种生物分子(RNA、DNA以及蛋白质复合物)相互作用,参与调节转录、转录后和表观遗传水平的基因表达,调控众多人类疾病的发生发展,为临床治疗和诊断疾病提供新思路。 展开更多
关键词 lncRNA 人类疾病
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长链非编码RNA LINC00858在胃癌中的表达及其临床意义 预览
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作者 杜娟 陈亚妮 +3 位作者 史海燕 王爱红 殷松娜 赵菊梅 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2019年第7期769-773,共5页
目的检测长链非编码RNALINC00858在人胃癌及其癌旁组织中的表达情况,分析LINC00858表达量变化与人胃癌发生、发展的关系。方法利用在线统计软件分析TCGA数据库中LINC00858在人胃癌中的表达情况及其表达量变化与胃癌患者总生存期、无病... 目的检测长链非编码RNALINC00858在人胃癌及其癌旁组织中的表达情况,分析LINC00858表达量变化与人胃癌发生、发展的关系。方法利用在线统计软件分析TCGA数据库中LINC00858在人胃癌中的表达情况及其表达量变化与胃癌患者总生存期、无病生存期及患者临床分期间的关系。用实时荧光定量PCR法检测LINC00858在胃癌及其配对癌旁正常组织中的表达情况。统计学方法分析LINC00858表达量与胃癌患者年龄、性别及临床分期的关系。结果LINC00858在三种肾癌和骨髓癌组织中的表达量有所下降,在胃癌及其他类型的肿瘤组织中呈上升趋势;胃癌患者肿瘤组织中LINC00858表达量越高患者的临床分期越晚。结论LINC00858表达量的升高与胃癌的发生、发展相关,LINC00858表达量的检测及调控可能有助于临床胃癌患者病情的监测及治疗。 展开更多
关键词 LINC00858 胃癌 长链非编码RNA LncRNA
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卵巢癌铂耐药患者肿瘤组织中LINC01151的表达及诊断效能研究 预览
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作者 雷瑞霖 张萌 +2 位作者 蒋小燕 陈思琪 林荣春 《岭南现代临床外科》 2019年第5期563-566,570共5页
目的寻找和卵巢癌发生、进展以及铂类化疗耐药相关的lncRNA,从而为卵巢癌早期筛查和治疗方案的选择提供新型检测标志物。方法从顺铂耐药卵巢癌细胞株芯片筛选差异表达的lncRNA,分析TCGA和GTEx数据库中的卵巢癌测序数据,比较LINC01151在... 目的寻找和卵巢癌发生、进展以及铂类化疗耐药相关的lncRNA,从而为卵巢癌早期筛查和治疗方案的选择提供新型检测标志物。方法从顺铂耐药卵巢癌细胞株芯片筛选差异表达的lncRNA,分析TCGA和GTEx数据库中的卵巢癌测序数据,比较LINC01151在卵巢癌组织、癌旁组织、转移肿瘤组织中表达情况,及与患者整体生存周期的相关性。25对卵巢癌肿瘤组织和癌旁组织临床样本中检测LINC01151的表达水平,比较正常卵巢上皮细胞和不同卵巢癌细胞株中LINC01151的表达,以及顺铂敏感卵巢癌细胞和顺铂诱导耐药的卵巢癌细胞中LINC01151的表达,分析LINC01151与肿瘤发生、耐药的相关联。结果从顺铂耐药卵巢癌细胞株芯片中筛选差异表达的lncRNA,其中LINC01151表达差异显著。芯片中相关数据显示,LINC01151特异性在顺铂耐药的卵巢癌细胞株中高表达。通过qPCR验证发现,LINC01151在卵巢癌组织和细胞中特异性高表达,且与顺铂敏感细胞相比,顺铂诱导耐药的细胞株中LINC01151高表达。结论 LINC01151可能是卵巢癌铂类耐药的标志物,可能可以作为卵巢癌的诊断或预后的生物标志物;临床应用中利用LINC01151对患者进行筛选、分类,有利于精准化、个体化治疗,可能对改善肿瘤患者预后具有重要意义。 展开更多
关键词 卵巢癌 顺铂 铂类耐药 生物标志物 lncRNA LINC01151
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lncRNA在宫颈癌预后中的研究进展 预览
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作者 邢瑶 孟碧 刘阳晨 《现代肿瘤医学》 CAS 2019年第11期2018-2021,共4页
宫颈癌是妇科常见肿瘤,近年来体内外研究发现长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的表达水平与宫颈癌预后密切相关。本文对近年来lncRNA在宫颈癌预后中的研究成果进行简要概述。
关键词 宫颈癌 lncRNA 预后
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B3型柯萨奇病毒感染对胰岛细胞糖尿病相关LncRNA表达的影响 预览
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作者 沈雅婧 李兰娟 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2019年第10期1101-1106,共6页
目的:探讨B3型柯萨奇病毒诱发糖尿病发生的具体机制。方法:采用B3型柯萨奇病毒感染人胰岛细胞HUM-CELL-0058,病毒感染48 h后提取细胞总RNA并通过荧光定量PCR检测糖尿病相关LncRNA。对调控三种LncRNA转录的转录因子mRNA及蛋白采用实时定... 目的:探讨B3型柯萨奇病毒诱发糖尿病发生的具体机制。方法:采用B3型柯萨奇病毒感染人胰岛细胞HUM-CELL-0058,病毒感染48 h后提取细胞总RNA并通过荧光定量PCR检测糖尿病相关LncRNA。对调控三种LncRNA转录的转录因子mRNA及蛋白采用实时定量PCR及Western blot进行监测。构建了PAX6及NF-κB的过表达质粒,并转染病毒感染后的胰岛β细胞,检测柯萨奇病毒感染后异常表达LncRNA的表达水平。结果:糖尿病相关LncRNA,Lnc-P12792和MALAT1有上调表达,上升2~3倍(P<0.01),而HI-Lnc45的表达水平约为对照组的60%(P<0.01)。实时定量PCR及Western blot结果表明调控HI-Lnc45表达的转录因子PAX6表达量降低50%而调控Lnc-P12792和MALAT1的转录因子NF-κB(p65)表达升高 2.5 倍(P<0.001),这与其调控的转录因子趋势一致。表明LncRNA的表达差异是由于该基因转录因子表达异常所导致。实时定量结果表明,三种异常表达LncRNA的mRNA水平回归B3型柯萨奇病毒感染前的正常水平,证明这一趋势可被调控这两种转录因子的表达量所拯救。结论:B3型柯萨奇病毒感染人胰岛β细胞会引起转录因子NF-κB的上调表达以及PAX6的下调表达,并引起下游与糖尿病发生有关LncRNA的异常表达,这可能是B3型柯萨奇病毒诱发糖尿病发生的病理机制之一。 展开更多
关键词 B3型柯萨奇病毒 糖尿病 LncRNA 转录因子
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结直肠癌发病相关的lncRNA筛选及GAPLINC对HCT116细胞的作用 预览
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作者 罗育其 温敏杰 于海涛 《广州医药》 2019年第1期1-6,共6页
目的筛选结直肠癌(CRC)差异性表达的长链非编码RNA(lncRNA),并进行临床标本验证,研究其对结肠癌细胞HCT116功能的作用。方法利用lncRNAPCR芯片对3对CRC组织和癌旁对照组织筛选差异性表达的lncRNA,确定候选研究lncRNA GAPLINC,RT-qPCR对2... 目的筛选结直肠癌(CRC)差异性表达的长链非编码RNA(lncRNA),并进行临床标本验证,研究其对结肠癌细胞HCT116功能的作用。方法利用lncRNAPCR芯片对3对CRC组织和癌旁对照组织筛选差异性表达的lncRNA,确定候选研究lncRNA GAPLINC,RT-qPCR对21例临床样本进行验证其表达的差异性;同时构建GAPLINC表达质粒及其沉默体siRNA转染HCT116细胞,研究其对细胞凋亡、迁移及侵袭能力的影响。结果lncRNA芯片实验结果提示CRC组织中存在大量的差异性表达的lncRNA,其中GAPLINC在CRC组织表达稳定增加,21例临床样本进一步验证了其在肿瘤组织中表达增加(P<0.05);转染GAPLINC表达质粒后,HCT116细胞凋亡被抑制,同时其迁移及侵袭能力增强,转染siRNA抑制GAPLINC的表达后,则出现相反的结果。结论利用lncRNA芯片可对CRC差异性表达lncRNA进行批量筛选,GAPLINC在CRC组织中表达稳定增加,具有促癌作用,在CRC发生发展中可能起着重要作用。 展开更多
关键词 lncRNA 结直肠癌 细胞迁移及侵袭 细胞凋亡
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LncRNA CTD-3252C9.4抑制人胰腺癌Panc-1细胞体外侵袭迁移的机制 预览
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作者 尹馨 史婉月 +1 位作者 潘怡 金亮 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期230-237,共8页
研究长链非编码RNA(lncRNA)CTD-3252C9.4对人胰腺癌细胞Panc-1体外迁移和侵袭的抑制作用及其机制。采用培养胰腺癌微球体的三维半固体体系中的表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)刺激培养Panc-1细胞;采用RT-qPCR检测lncRNA CTD-... 研究长链非编码RNA(lncRNA)CTD-3252C9.4对人胰腺癌细胞Panc-1体外迁移和侵袭的抑制作用及其机制。采用培养胰腺癌微球体的三维半固体体系中的表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)刺激培养Panc-1细胞;采用RT-qPCR检测lncRNA CTD-3252C9.4在Panc-1中的表达量和载体转染效率;采用划痕-愈合法和Transwell小室法检测lncRNA CTD-3252C9.4及其靶基因骨形态发生蛋白7(bone morphogenetix protein 7,BMP7)对Panc-1细胞侵袭和迁移能力的影响;采用Western blot验证靶基因BMP7和上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)相关蛋白表达量的变化。结果表明:EGF能显著抑制Panc-1中lncRNA CTD-3252C9.4的表达,且该lncRNA能够通过抑制促癌基因BMP7的转录影响细胞侵袭和迁移能力,并且抑制肿瘤的EMT过程。 展开更多
关键词 lncRNA BMP7 胰腺癌 侵袭转移 上皮间充质转化
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CD44^+/CD44^-食管鳞癌细胞LncRNA表达谱差异分析
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作者 孙伟杰 李建成 +1 位作者 姚奇伟 戴雅青 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2019年第16期1163-1168,共6页
目的食管癌干细胞和长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA)均与食管癌放疗抵抗相关.本研究从食管癌干细胞入手,筛选出与食管癌干细胞放射敏感性相关LncRNA.方法对人食管鳞癌细胞株Eca109分别进行无血清和正常血清培养形成富集干细... 目的食管癌干细胞和长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA)均与食管癌放疗抵抗相关.本研究从食管癌干细胞入手,筛选出与食管癌干细胞放射敏感性相关LncRNA.方法对人食管鳞癌细胞株Eca109分别进行无血清和正常血清培养形成富集干细胞的悬浮细胞球(瘤球细胞组)和贴壁细胞(贴壁细胞组).通过流式细胞技术从瘤球细胞组和贴壁细胞组分选出CD44^+食管鳞癌干细胞和CD44^-食管鳞癌细胞,再利用LncRNA高通量测序分析2种细胞间Ln-cRNA差异表达谱,并应用实时荧光定量PCR方法验证前10位差异性表达最大的LncRNA.结果与CD44^-食管鳞癌细胞相比,CD44^+食管鳞癌干细胞组有2517个基因表达上调,2444个基因下调,其中mRNA有3174个(1479个上调,1695个下调),LncRNA有1832个(1038个上调,794个下调).食管鳞癌干细胞MSTRG.73085(t=9.919,P<0.001)表达下调,其相对比值平均数为1.7×10^-4,CH17-360D5.3(t=5.39,P=0.006)、CH17-360D5.2(t=9.192,P<0.001)、RP11-439E19.10(t=9.84,P<0.001)、MSTRG.424(t=4.391,P=0.012)、MSTRG.64087(t=6.591,P=0.003)和MSTRG.15903(t=11.71,P<0.001)表达上调,其相对比值平均数分别为335.3×10^-4、26.7×10^-4、8.6×10^-4、3.8×10^-4、5.1×10^-4和33.6×10^-4.结论瘤球细胞组中表达下调的MSTRG.73085,上调的CH17-360D5.2、CH17-360D5.3、RP11-439E19.10、MSTRG.424、MSTRG.64087和MSTRG.15903有可能与食管鳞癌干细胞的放射敏感性有关联. 展开更多
关键词 食管鳞癌 干细胞 放射敏感性 LncRNA 高通量测序
植物非编码RNA及其在甜菜中的应用研究 预览
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作者 李任任 吕春华 +1 位作者 於丽华 耿贵 《中国糖料》 2019年第3期63-69,共7页
非编码RNA是在真核生物中发现的具有调控功能的RNA,能够以各种方式参与植物的生长发育、信号转导以及逆境胁迫等生命过程。甜菜是我国重要的糖料作物,最近研究发现非编码RNA中的miRNA能够以多种方式参与到甜菜应对盐胁迫、干旱胁迫及养... 非编码RNA是在真核生物中发现的具有调控功能的RNA,能够以各种方式参与植物的生长发育、信号转导以及逆境胁迫等生命过程。甜菜是我国重要的糖料作物,最近研究发现非编码RNA中的miRNA能够以多种方式参与到甜菜应对盐胁迫、干旱胁迫及养分胁迫的应答中。另外,在病毒侵染甜菜过程中发现非编码RNA起到重要作用。因此研究甜菜非编码RNA对于甜菜的种植和品种改良具有重要意义。本文简要综述了目前研究较多的miRNA、lncRNA和circRNA的产生方式及调控机制,并介绍了miRNA参与甜菜逆境胁迫和lncRNA影响甜菜春化机制的一些研究,旨在对未来甜菜非编码RNA的进一步研究提供理论指导。 展开更多
关键词 非编码RNA 甜菜 MIRNA lncRNA circRNA
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基于TCGA数据库的胶质母细胞瘤LncRNA风险预测模型的建立 预览
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作者 彭慧 秦凯 +2 位作者 戴宇翃 张孟贤 郭秋云 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 2019年第5期417-420,共4页
目的利用TCGA数据库建立胶质母细胞瘤患者预后的LncRNA风险评分模型。方法下载TCGA数据库中胶质母细胞瘤及正常神经组织的基因表达谱数据、临床相关数据,筛选差异表达LncRNA,采用单因素和多因素Cox风险回归模型筛选和建立LncRNA预后模... 目的利用TCGA数据库建立胶质母细胞瘤患者预后的LncRNA风险评分模型。方法下载TCGA数据库中胶质母细胞瘤及正常神经组织的基因表达谱数据、临床相关数据,筛选差异表达LncRNA,采用单因素和多因素Cox风险回归模型筛选和建立LncRNA预后模型。结果从TCGA数据库中得到169份胶质母细胞瘤组织和5份正常神经组织的基因表达谱,使用R语言edgeR包进行差异基因分析(logFC≥2或≤-2,FDR<0.05)得到差异基因7 978个,其中差异LncRNA 1 643个。单因素Cox分析及多因素Cox回归分析得到基于4个LncRNA的多因素预后风险模型:风险评分=0.59×NDUFB2-AS1-0.41×ZEB1-AS1+0.31×AL139385.1+0.21×AGAP2-AS1。模型的ROC曲线下面积AUC=0.864。患者风险评分结果提示高评分患者预后较低评分患者差。结论 NDUFB2-AS1、ZEB1-AS1、AL139385.1和AGAP2-AS1的风险预测模型可有效预测胶质母细胞瘤患者的预后,有望用于指导临床治疗。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 LncRNA TCGA数据库 COX回归模型
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