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西藏自治区色季拉山高寒草甸牧草根腐线虫的鉴定 预览
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作者 王宏洪 卓侃 +1 位作者 薛会英 廖金铃 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期59-66,共8页
在西藏自治区色季拉山高寒草甸土壤线虫群落调查期间,从高山嵩草(Kobresia pygmaea)根际土壤中分离得到一种根腐线虫。通过形态特征观察和分子序列比对,将其鉴定为刻痕短体线虫(Pratylenchus crenatus)。其主要特征:唇环3个,口针长15.6~... 在西藏自治区色季拉山高寒草甸土壤线虫群落调查期间,从高山嵩草(Kobresia pygmaea)根际土壤中分离得到一种根腐线虫。通过形态特征观察和分子序列比对,将其鉴定为刻痕短体线虫(Pratylenchus crenatus)。其主要特征:唇环3个,口针长15.6~16.2μm,口针基部球前缘略凹,侧线6条,V值为82.5~83.2,尾圆柱形,末端环纹清晰。对该线虫rDNA的3个区段(18S部分序列、28S D2D3区和ITS区)进行特异性扩增和测序,分别得到902、774和1 013 bp的序列。将所获得的序列在GenBank数据库上进行BLAST比对,结果显示:此线虫群体与刻痕短体线虫群体的相似度分别为97.4%~99.8%、97.4%~97.8%和90.2%~99.8%。贝叶斯推断法构建的系统进化树显示:本研究的线虫群体与刻痕短体线虫聚为高度支持的分支,进一步确定此线虫群体为刻痕短体线虫。本研究获得刻痕短体线虫中国群体的分子数据。该刻痕短体线虫是西藏自治区的新纪录种。高山嵩草是刻痕短体线虫的新寄主。 展开更多
关键词 刻痕短体线虫 高山嵩草 形态特征 分子序列分析 新纪录
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转基因甘蔗红糖DNA的提取及分子鉴定
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作者 王文治 杨本鹏 +7 位作者 冯小艳 王俊刚 冯翠莲 熊国如 赵婷婷 沈林波 张树珍 许莉萍 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期1220-1227,共8页
随着不同转基因生物(GMO)制品的不断商业化,转基因成分检测技术也需不断更新。由于甘蔗红糖为甘蔗汁经高温熬煮浓缩而成,红糖中残留的DNA降解严重、含量低、片段短,且蛋白及糖分杂质含量高,所以甘蔗红糖DNA是比较难以收集并进行分子检... 随着不同转基因生物(GMO)制品的不断商业化,转基因成分检测技术也需不断更新。由于甘蔗红糖为甘蔗汁经高温熬煮浓缩而成,红糖中残留的DNA降解严重、含量低、片段短,且蛋白及糖分杂质含量高,所以甘蔗红糖DNA是比较难以收集并进行分子检测的。为了在转基因甘蔗红糖商业化前建立起转基因甘蔗红糖DNA的提取及分子鉴定技术,本研究以转基因甘蔗和非转基因甘蔗为材料,模仿传统的红糖制作工艺,分别获得了转基因甘蔗红糖与非转基因甘蔗红糖。通过对DNA提取方法进行改进,设计不同扩增片段长度的引物,并对传统PCR与荧光定量PCR进行比较,建立了稳定的甘蔗红糖DNA的提取方法及外源基因分子鉴定技术该技术对转基因甘蔗红糖与非转基因甘蔗红糖进行准确鉴别,为今后转基因甘蔗红糖的商业化所需的转基因食品鉴定提供技术支持,也为后面更为重要的转基因甘蔗白糖DNA的提取及分子鉴定提供借鉴。 展开更多
关键词 甘蔗红糖 转基因生物 外源基因 分子鉴定 荧光定量PCR
基于内转录间隔区序列对云南12株鹅膏菌的分子分析
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作者 杨菁 汤晓召 +1 位作者 许燕 杨祖顺 《食品安全质量检测学报》 CAS 2018年第18期4804-4807,共4页
目的基于内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列对云南省12株鹅膏菌进行分类鉴定。方法采用十六烷基三甲基溴化铵法(cetyltrimethyrlammonium Ammonium Bromide,CTAB)法提取1 2株鹅膏菌DNA,以ITS4和ITS5为引物进行... 目的基于内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列对云南省12株鹅膏菌进行分类鉴定。方法采用十六烷基三甲基溴化铵法(cetyltrimethyrlammonium Ammonium Bromide,CTAB)法提取1 2株鹅膏菌DNA,以ITS4和ITS5为引物进行PCR扩增,完成DNA序列测序,对序列进行分析并对发育树进行构建。结果 12个样品的ITS序列长度574+755 bp,GC含量39%+47%,平均遗传距离为0.329,YN05、YN03与其他10株鹅膏亲缘关系较远。结论ITS序列高度保守,在真菌的科属种上能够初步实现对物种的鉴定和系统发育分析,为建立云南省鹅膏属分子数据库提供基础数据。 展开更多
关键词 内转录间隔区 鹅膏菌 云南 分子分析
降香黄檀和海南黄檀的鉴别
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作者 王军 丁旭坡 +4 位作者 杨锦玲 段瑞军 洪少友 梅文莉 戴好富 《分子植物育种》 CSCD 北大核心 2018年第23期7871-7879,共9页
为了准确识别降香黄檀和海南黄檀的植株、苗木、木材和药材,采用形态学、木材解剖学、化学特征(薄层色谱TLC)、分子分析的方式对二者进行了较全面地归纳、整理和比较。结果表明,降香黄檀与海南黄檀的区别明显,其植株形态特征主要表现在... 为了准确识别降香黄檀和海南黄檀的植株、苗木、木材和药材,采用形态学、木材解剖学、化学特征(薄层色谱TLC)、分子分析的方式对二者进行了较全面地归纳、整理和比较。结果表明,降香黄檀与海南黄檀的区别明显,其植株形态特征主要表现在前者雄蕊为9枚,单体,而后者为10枚,呈(5+5)的二体。木材特征主要表现在降香黄檀的心材和边材区别明显,木材具特殊的降香气味,心材灰烬呈灰白色,散孔材至半环孔材,傍管型以翼状、聚翼状为主,离管型为极小的带状,单列木射线稍多,多数宽2细胞,而海南黄檀的心材和边材无明显区别,木材无特殊香气,心材灰烬呈黄褐色,散孔材,傍管、离管相互连接,形成明显整齐的带状,单列木射线几无,多数宽3细胞。薄层色谱分析结果表明,根据不同Rf值的显色条带可以区分降香黄檀和海南黄檀的心材;DNA条形码分析结果表明,ITS2、trnV-trnM和psbA-trnH序列可以作为鉴定此二种的分子条形码序列。本研究可适应于鉴定降香黄檀和海南黄檀不同时期的植株及木材和药材,为保护野生植物资源和规范苗木、木材和药材交易市场提供数据支撑。 展开更多
关键词 降香黄檀 海南黄檀 形态学 化学特征 分子特征
In situ diet of the copepod Calanus sinicus in coastal waters of the South Yellow Sea and the Bohai Sea 预览
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作者 YI Xiaoyan HUANG Yousong +6 位作者 ZHUANG Yunyun CHEN Hongju YANG Feifei WANG Weimin XU Donghui LIU Guangxing ZHANG Huan 《海洋学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2017年第6期68-79,共12页
Copepods are a key trophic link between primary producers and predatory animals at higher trophic levels in the marine ecosystem. Knowledge of the in situ composition of the copepod diet is critical for the accurate e... Copepods are a key trophic link between primary producers and predatory animals at higher trophic levels in the marine ecosystem. Knowledge of the in situ composition of the copepod diet is critical for the accurate evaluation of trophic relationships and energy transfer in marine food webs. In this study, we applied a PCR-based cloning technique developed previously to investigate the in situ diet of Calanus sinicus, an ecologically important largesized calanoid copepod that dominates in the shelf waters around China, Japan and Korea. Analyses of the 18 S r DNA sequences obtained from the copepod diet revealed the diverse food composition of C. sinicus from two stations(Y19 in the South Yellow Sea and B49 in the Bohai Sea). A total of 43 operational taxonomic units(OTUs)were detected, which belonged to 13 diverse lineages: Bacillariophyta, Dinoflagellata, Dictyochophyceae,Chrysophyta, Katablepharidophyta, Pelagophyceae, Apusozoa, Hydrozoa, Ctenophora, Echinodermata, Tunicata,Chaetognatha and marine fungi. The results indicate that during an algae bloom, C. sinicus can graze on the bloom causative species. When the abundance of phytoplankton in ambient water is relatively low, C. sinicus can choose eggs, larvae, or organic particles/detritus of various metazoans, especially hydrozoans and ctenophores,as alternative food sources. Our result suggests that C. sinicus is an omnivorous species, and its prey choice may depend on the food availability in the ambient waters. 展开更多
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Complete nuclear ribosomal DNA sequence amplification and molecular analyses of Bangia (Bangiales, Rhodophyta) from China
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作者 徐佳杰 姜波 +4 位作者 柴三明 何渊 朱建一 沈宗根 沈颂东 《中国海洋湖沼学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2016年第5期1044-1053,共10页
Filamentous Bangia,which are distributed extensively throughout the world,have simple and similar morphological characteristics.Scientists can classify these organisms using molecular markers in combination with morph... Filamentous Bangia,which are distributed extensively throughout the world,have simple and similar morphological characteristics.Scientists can classify these organisms using molecular markers in combination with morphology.We successfully sequenced the complete nuclear ribosomal DNA.approximately 13 kb in length,from a marine Bangia population.We further analyzed the small subunit ribosomal DNA gene(nrSSU) and the internal transcribed spacer(ITS) sequence regions along with nine other marine,and two freshwater Bangia samples from China.Pairwise distances of the nrSSU and 5.8S ribosomal DNA gene sequences show the marine samples grouping together with low divergences(0-0.003;0-0.006,respectively) from each other,but high divergences(0.123-0.126;0.198,respectively) from freshwater samples.An exception is the marine sample collected from Weihai,which shows high divergence from both other marine samples(0.063-0.065;0.129,respectively) and the freshwater samples(0.097;0.120,respectively).A maximum likelihood phylogenetic tree based on a combined SSU-ITS dataset with maximum likelihood method shows the samples divided into three clades,with the two marine sample clades containing Bangia spp.from North America,Europe,Asia,and Australia;and one freshwater clade,containing Bangia atropurpurea from North America and China. 展开更多
关键词 BANGIA molecular analysis small subunit ribosomal DNA gene(nrSSU) internal transcribed spacer(ITS) ribosomal DNA
结直肠透明细胞癌的临床病理观察及分子生物学特点 被引量:3
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作者 陈岚 肖飞 +2 位作者 孙铭钧 刘东戈 何淑蓉 《诊断病理学杂志》 CSCD 2015年第4期212-216,232共6页
目的 探讨结直肠透明细胞上皮性肿瘤的临床病理形态及分子生物学特征,探讨其发病机制与大肠腺瘤及传统腺癌的相关性.方法 比较1例乙状结肠息肉切除标本中透明细胞病变和传统腺瘤成分的组织学、免疫组化、电镜及分子生物学特点,并结合文... 目的 探讨结直肠透明细胞上皮性肿瘤的临床病理形态及分子生物学特征,探讨其发病机制与大肠腺瘤及传统腺癌的相关性.方法 比较1例乙状结肠息肉切除标本中透明细胞病变和传统腺瘤成分的组织学、免疫组化、电镜及分子生物学特点,并结合文献复习.结果 本例乙状结肠透明细胞病变与周围腺瘤病变截然分界,并浸润至黏膜下层,符合原发性结直肠透明细胞癌.其分子生物学特点与腺瘤成分不同,而与传统结直肠癌(CRC)一致,具有APC、TP53基因突变,并保持传统CRC免疫组化CK7阴性、CK20和CDX2阳性的特征,空亮的胞质不含黏液,可能为退变的脂滴.结论 结直肠原发性透明细胞癌罕见,它可能是传统CRC的一种形态学变异.鉴别诊断要除外肾脏及女性盆腔生殖系统透明细胞癌,及具有透明细胞形态改变的神经内分泌肿瘤. 展开更多
关键词 透明细胞癌 结直肠癌 分子学 APC TP53
禽坦布苏病毒包膜蛋白E的基因特征 预览 被引量:2
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作者 万春和 施少华 黄瑜 《福建农业学报》 2014年第8期715-719,共5页
为明确禽坦布苏病毒包膜蛋白E的基因特征,运用RT-PCR从已经分离鉴定的禽坦布苏病毒中扩增出其包膜蛋白E全基因,并进行克隆测序和分析。结果表明,禽坦布苏病毒包膜蛋白E全长为1503bp,编码501个氨基酸。所编码的包膜蛋白E大小为54.21... 为明确禽坦布苏病毒包膜蛋白E的基因特征,运用RT-PCR从已经分离鉴定的禽坦布苏病毒中扩增出其包膜蛋白E全基因,并进行克隆测序和分析。结果表明,禽坦布苏病毒包膜蛋白E全长为1503bp,编码501个氨基酸。所编码的包膜蛋白E大小为54.217ku,理论等电点为6.89,不稳定系数为25.48,属于稳定蛋白质类。利用TMHMM2.0进行跨膜区分析发现,该蛋白的拓扑结构为o442-464i471-489o。本试验株包膜蛋白E和北京鸭源坦布苏病毒(GenBank号:JF459991)同源性最高,达99.8%,和雌麻鸭源坦布苏病毒(GenBank号:JQ928189)核苷酸同源性最低,为98.2%,不同来源(鸡源、鸭源、鹅源、鸽源和蚊子源)坦布苏病毒包膜蛋白E同源性均较高,没有表现出宿主特异性。 展开更多
关键词 禽坦布苏病毒 包膜蛋白 基因特征
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家养野猪脑心肌炎病毒的分离、鉴定及全基因组序列分析 预览 被引量:1
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作者 常洪涛 刘慧敏 +5 位作者 赵军 陈陆 杨霞 王新卫 姚惠霞 王川庆 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期793-796,共4页
目的:分离家养野猪脑心肌炎病毒(Encephalomyocarditis virus ,EMCV),作全基因组序列测定及与相关物种同源性比较。方法用改进的“细胞接种与RT-PCR方法相结合”技术,成功分离到国内首株家养野猪EMCV JZ1202株,并对其全基因组序... 目的:分离家养野猪脑心肌炎病毒(Encephalomyocarditis virus ,EMCV),作全基因组序列测定及与相关物种同源性比较。方法用改进的“细胞接种与RT-PCR方法相结合”技术,成功分离到国内首株家养野猪EMCV JZ1202株,并对其全基因组序列进行测定和分子特征分析。结果分离毒的基因组全长为7735 bp ,与国内外不同动物源EMCV参考毒株的核苷酸同源性为81.2%~99.9%,与国内猪源EMCV分离毒的同源性高达99.4%以上。基于EMCV全基因组、ORF和VP1基因序列绘制的系统发育进化树显示,EMCV可分为 G1、G2和G33个群,JZ1202株与其他国内参考毒株同属于G1群。结论结果证实,家养野猪可感染EMCV并引起发病,提醒作野生动物养殖要考虑EMCV的传播;EMCV存在较大的地域差异,在家养野猪和鼠之间可能存在着交叉感染;EMCV在感染家养野猪时可能发生个别氨基酸突变,以适应不同的猪种。 展开更多
关键词 脑心肌炎病毒 家养野猪 全基因组 分子特征分析
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Lymph node staging in colorectal cancer:Old controversies and recent advances 预览 被引量:3
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作者 Annika Resch Cord Langner 《世界胃肠病学杂志:英文版(电子版)》 SCIE CAS 2013年第46期8515-8526,共12页
Outcome prediction based on tumor stage reflected by the American Joint Committee on Cancer(AJCC)/Union for International Cancer Control(UICC)tumor node metastasis(TNM)system is currently regarded as the strongest pr... Outcome prediction based on tumor stage reflected by the American Joint Committee on Cancer(AJCC)/Union for International Cancer Control(UICC)tumor node metastasis(TNM)system is currently regarded as the strongest prognostic parameter for patients with colorectal cancer.For affected patients,the indication for adjuvant therapy is mainly guided by the presence of regional lymph node metastasis.In addition to the extent of surgical lymph node removal and the thoroughness of the pathologist in dissecting the resection specimen,several parameters that are related to the pathological work-up of the dissected nodes may affect the clinical significance of lymph node staging.These include changing definitions of lymph nodes,involved lymph nodes,and tumor deposits in different editions of the AJCC/UICC TNM system as well as the minimum number of nodes to be dissected.Methods to increase the lymph node yield in the fatty tissue include methylene blue injection and acetone compression.Outcome prediction based on the lymph node ratio,defined as the number of positive lymph nodes divided by the total number of retrieved nodes,may be superior to the absolute numbers of involved nodes.Extracapsular invasion has been identified as additional prognostic factor.Adding step sectioning and immunohistochemistry to the pathological work-up may result in higher accuracy of histological diagnosis.The clinical value of more recent technical advances,such as sentinel lymph node biopsy and molecular analysis of lymph nodes tissue still remains to be defined. 展开更多
关键词 Colon CANCER RECTUM CANCER Tumor stag-ing LYMPH NODE metastasis Prognosis Sentinel LYMPH NODE LYMPH NODE ratio EXTRACAPSULAR invasion Im-munohistochemistry Molecular analysis
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Role of molecular analysis in the adjuvant treatment of gastrointestinal stromal tumours: It is time to define it 预览
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作者 Margherita Nannini Maria A Pantaleo Guido Biasco 《世界胃肠病学杂志:英文版(电子版)》 SCIE CAS 2013年第16期2583-2586,共4页
Sendur et al pointed out the attention on the importance of mutational analysis for adjuvant treatment of gastrointestinal stromal tumor (GIST) in an article published in World Journal of Gastroenterology . In partic... Sendur et al pointed out the attention on the importance of mutational analysis for adjuvant treatment of gastrointestinal stromal tumor (GIST) in an article published in World Journal of Gastroenterology . In particular, they suggested that the optimal dose and duration of adjuvant therapy could be defined by the mutational status of the primary disease. This comment would underline the importance of centralised laboratories, given the increasingly important role of molecular analysis in the work-flow of all GIST, and the need of retrospective analyses for subgroups population stratified for the mutational status from the available studies in the adjuvant setting, in order to define the role of mutational analysis in choosing the optimal dose and duration of adjuvant therapy. 展开更多
关键词 GASTROINTESTINAL STROMAL tumours Plateletderived growth factor receptor alpha KIT WILD-TYPE Molecular analysis IMATINIB ADJUVANT treatment
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长生存期胶质母细胞瘤患者的临床特点及分子表达分析 被引量:8
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作者 王翔 刘艳辉 +2 位作者 谢飞 游潮 毛庆 《中华外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期166-170,共5页
【目的】探讨长期生存胶质母细胞瘤患者的临床特点及肿瘤分子表达特征。【方法】选取2007年6月至2009年4月进行手术治疗的术后至少存活3年的胶质母细胞瘤患者15例纳入本研究,将同期手术且生存期低于1年的胶质母细胞瘤患者作为对照组。... 【目的】探讨长期生存胶质母细胞瘤患者的临床特点及肿瘤分子表达特征。【方法】选取2007年6月至2009年4月进行手术治疗的术后至少存活3年的胶质母细胞瘤患者15例纳入本研究,将同期手术且生存期低于1年的胶质母细胞瘤患者作为对照组。对其年龄、肿瘤大小及部位、手术切除程度、术后辅助治疗等临床特点进行总结分析。通过免疫组化的方法对肿瘤标本中表皮生长因子受体(EGFR)、肿瘤抑制基因P53、人第10号染色体缺失的磷酸酶及张力因子(PTEN)、O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)、异柠檬酸盐脱氢酶1(IDH1)和神经纤维瘤蛋白(NF-1)的蛋白表达进行检测,通过DNA直接测序法对IDH1和P53的突变情况进行检测。对两组间有差异的因素进行Kaplan-Meier生存分析,发现与预后相关的因素。【结果】15例长期生存胶质母细胞瘤患者总体生存时间为3~6年,中位生存期为3.5年。其胶质瘤确诊时的平均年龄为45.6岁,肿瘤均未累及脑深部结构,13例患者手术全切除,14例患者使用了替莫唑胺化疗。筛选分子阳性发生率依次为PTEN(13/15)、IDH1(13/15)、IDH1突变(12/15)、P53(8/15)、P53突变(7/15)、EGFR(6/15)、MGMT(4/15)和NF-1(3/15)。与对照组患者比较,年龄≤50岁(OR=0.262,95%CI:0.102~0.672)、手术全切除(OR=0.372,95%CI:0.149~0.931)、术后替莫唑胺化疗(OR=0.131,95%CI:0.044~0.390)、肿瘤表达PTEN(OR=0.201,95%CI:0.074~0.549)与IDH1(OR=0.151,95%CI:0.050~0.454)及IDH1突变(OR=0.276,95%CI:0.108~0.709)是有利于胶质母细胞瘤患者的预后因素。【结论】长期生存胶质母细胞瘤患者具有相似的临床特点和分子表达特征,更多相关研究的开展,有助于我们更好地判断胶质瘤患者的预后。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 预后 免疫组织化学 临床特点 分子表达
A New Newt of the Genus Cynops (Caudata: Salamandridae) from Guangdong, China
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作者 Zhiyong YUAN Ke JIANG +2 位作者 Limin DING Liang ZHANG Jing CHE 《亚洲两栖爬行动物研究:英文版》 SCIE 2013年第2期116-123,共8页
We describe a new species of the genus Cynops from northeastern Guangdong, China. This new species is distinguished from its congeners by a combination of morphological and molecular characters. In morphology, it is c... We describe a new species of the genus Cynops from northeastern Guangdong, China. This new species is distinguished from its congeners by a combination of morphological and molecular characters. In morphology, it is chracterized by distinctive irregular bluish grey spots on the dorsum from head to tail; irregular, bright orange blotches on venter, chin, underside of axillae, limbs, cloaca; one bright orange stripe in the middle of venter; and ventral tail orange red. Analyses of mitochondrial DNA data indicate that this new species forms one highly diverged lineage within the Chinese group of Cynops. 展开更多
关键词 广东省 蝾螈 中国 有尾目 线粒体DNA 物种形成 形态学 文特尔
广州市番禺地区育龄人群地中海贫血检测的结果分析 被引量:7
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作者 黄霜 朱文彪 +3 位作者 甘钊杏 黄志成 何桂儿 王晶晶 《中国优生与遗传杂志》 2012年第7期41-42,52共3页
目的对育龄人群进行地中海贫血筛查以预防重症地贫患儿的出生。方法对2009年1月1日至2011年12月31日本院产科门诊、婚前检查门诊的就诊者进行地中海贫血(地贫)筛查,以血常规MCV(平均红细胞体积)和/或血红蛋白电泳进行初筛,阳性者建... 目的对育龄人群进行地中海贫血筛查以预防重症地贫患儿的出生。方法对2009年1月1日至2011年12月31日本院产科门诊、婚前检查门诊的就诊者进行地中海贫血(地贫)筛查,以血常规MCV(平均红细胞体积)和/或血红蛋白电泳进行初筛,阳性者建议基因检测。结果接受电泳检查的人群中,α地贫的检出为20.3%,β地贫的检出率为11.3%,电泳与基因结果的符合率β地贫较高。结论育龄人群进行地中海贫血筛查,对优生优育,减轻社会的经济负担有重要的意义。 展开更多
关键词 地中海贫血 MCV 血红蛋白电泳 基因检测
大连长山群岛海岸带沉积物微生物群落结构特征 被引量:8
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作者 李佳霖 王中华 +1 位作者 秦松 汪光义 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期656-666,共11页
【目的】为揭示海岸带微生物群落结构在人类活动影响下的分布差异及对环境因子变化的响应趋势,【方法】本实验采用t-RFLP和DGGE技术,对大连长山群岛不同功能类型海岸潮间带沉积物中的微生物群落结构特征进行比对和分析,并通过16S rRNA... 【目的】为揭示海岸带微生物群落结构在人类活动影响下的分布差异及对环境因子变化的响应趋势,【方法】本实验采用t-RFLP和DGGE技术,对大连长山群岛不同功能类型海岸潮间带沉积物中的微生物群落结构特征进行比对和分析,并通过16S rRNA基因文库解析养殖污染站位的微生物群落结构特征。【结果】T-RFLP的t-RF分析显示,养殖污染严重站位的微生物丰度、香农指数和均匀度明显高于其它站位。通过对t-RFLP色谱峰和DGGE图谱聚类分析发现,处于旅游区的2个站位微生物群落结构相似度较高,养殖区随污染程度加重与旅游区的群落结构差异增大。对污染严重站位建立的克隆文库显示变形菌门(Proteobacteria)为优势菌群,其中γ-变形菌门是主要存在的亚门微生物。【结论】T-RFLP和DGGE技术从不同方面反映了环境中的微生物群落结构特征,研究结果表明养殖污染区的微生物群落结构发生明显变化,其影响大于地理隔离效应,污染严重区域的微生物群落中存在大量肠杆菌属,且多个物种与富营养化和赤潮相关联,如拟杆菌门和α-变形细菌红细菌目的细菌。 展开更多
关键词 海岸带 微生物群落结构 分子生物学分析方法 人类活动
Molecular analysis for diagnosis of Marfan syndrome and Marfan-associated disorders
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作者 GAO Ling-gen YAO Xiu-ping +2 位作者 ZHANG Lin HUI Ru-tai ZHOU Xian-liang 《中华医学杂志:英文版》 SCIE CAS CSCD 2011年第6期930-934,共5页
Marfan 症候群是结缔组织的全身的混乱,在 FBN1, TGFBR1 或 TGFBR2 由变化引起了基因。这症候群被三个主要系统的参与描绘,骨胳、眼睛、心血管。在分子的生物学和在临床的实践的分子的诊断的增加的可获得性的持续改进与不完全的显型... Marfan 症候群是结缔组织的全身的混乱,在 FBN1, TGFBR1 或 TGFBR2 由变化引起了基因。这症候群被三个主要系统的参与描绘,骨胳、眼睛、心血管。在分子的生物学和在临床的实践的分子的诊断的增加的可获得性的持续改进与不完全的显型在病人允许 Marfan 症候群的识别。另外,分子的分析能也被用于 preimplantation 基因诊断。一个变化的鉴定早允许诊断,预后,为未受影响的亲戚的搬运人和安慰的基因建议、预防管理。预先知道通常认为的家庭变化的地点的重要性被它的直接申请强调到出生前、出生后屏蔽。 展开更多
关键词 分子诊断 相关疾病 分子分析 综合征 基因突变 分子生物学 结缔组织 临床实践
嘉峪关魏晋墓腐蚀壁画细菌类群的分子生物学检测 被引量:8
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作者 武发思 汪万福 +4 位作者 贺东鹏 陈港泉 马燕天 张晓东 冯虎元 《敦煌研究》 CSSCI 北大核心 2011年第6期 51-58,共8页
生物腐蚀和生物降解是历史遗迹和考古现场普遍存在的问题。本研究采用分子生物学技术对嘉峪关魏晋墓腐蚀砖壁画细菌类群进行检测和分析。克隆文库测序显示,魏晋墓内细菌序列主要隶属于假诺卡氏菌、酸菌属、克里贝拉属、鞘脂杆菌属、糖... 生物腐蚀和生物降解是历史遗迹和考古现场普遍存在的问题。本研究采用分子生物学技术对嘉峪关魏晋墓腐蚀砖壁画细菌类群进行检测和分析。克隆文库测序显示,魏晋墓内细菌序列主要隶属于假诺卡氏菌、酸菌属、克里贝拉属、鞘脂杆菌属、糖单孢菌属、固氮螺菌属,其中假诺卡氏菌属和酸菌属是优势类群。墓室常年旅游开放或常年关闭均不利于砖壁画的长久保存。分子技术在研究壁画微生物群落和其潜在影响方面优势明显。 展开更多
关键词 魏晋墓 砖壁画 细菌类群 分子检测 文物保护
浓香型白酒醅中高产酒精酵母菌的定向筛选及分子鉴定 预览 被引量:6
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作者 曾娟 施思 +4 位作者 吴正云 张文学 胡峰 赵鸿飞 李波 《中国酿造》 CAS 北大核心 2011年第2期 26-28,共3页
为了获得适用于酿酒生产的高产酒精酵母菌株,从浓香型白酒醅样品中,经不同浓度乙醇和pH条件下的定向富集和耐受性筛选以及发酵实验,获得3株能在酒精度13%vol、pH3.50的条件下稳定生跃且产酒能力较强的酵母菌XP-3、XP-7和nxp-8,其... 为了获得适用于酿酒生产的高产酒精酵母菌株,从浓香型白酒醅样品中,经不同浓度乙醇和pH条件下的定向富集和耐受性筛选以及发酵实验,获得3株能在酒精度13%vol、pH3.50的条件下稳定生跃且产酒能力较强的酵母菌XP-3、XP-7和nxp-8,其中XP-3的产酒力达87。04%,粮食出酒率可达44.71%,高于一般酿酒酵母。18SrDNA序列分析结果表明,3株酵母菌均与酿酒酵母(Saccharomyccs ccrcvisiae)具有极高的相似性。 展开更多
关键词 白酒酒醅 高产酒精酵母菌 定向筛选 分子鉴定
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兼香型白云边酒高温堆积过程主要细菌的分子鉴定 预览 被引量:11
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作者 曾驰 张明春 +3 位作者 刘婷婷 缪礼鸿 熊小毛 向苇 《中国酿造》 CAS 北大核心 2010年第4期 39-41,共3页
采用曲汁培养基和牛肉膏蛋白胨培养基从白云边酒厂堆积酒醅巾分离细菌,获得了6株有明显特征差异的细菌。用PCR技术对其进行了16SrDNA序列扩增、同源对比和系统发育分析,结果表明:6株分离菌株中W-1、W-3、G-4、G-1、DJ-1C菌株分别与... 采用曲汁培养基和牛肉膏蛋白胨培养基从白云边酒厂堆积酒醅巾分离细菌,获得了6株有明显特征差异的细菌。用PCR技术对其进行了16SrDNA序列扩增、同源对比和系统发育分析,结果表明:6株分离菌株中W-1、W-3、G-4、G-1、DJ-1C菌株分别与芽孢杆菌 Bacillus am yloliquefaciens, Bacillus subtilis , Bacillus velezensis. Bacillus licheniformis, Bacillus sporothermodurans有较高的相似性,而菌株4J与5种芽孢杆菌Bacillus vireti, Bacillus bataviensis, Bacillus drentensis, Bacillus soli, Bacillus novalis 的标准菌株既有一定的相似性,也有一定的遗传距离,可能是一个不同于已知菌的芽孢杆菌新种。 展开更多
关键词 白云边酒 高温堆积 细菌 分子鉴定
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白云边酒大曲及小麦原料中主要微生物的分析 预览 被引量:9
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作者 刘婷婷 张明春 +2 位作者 曾驰 缪礼鸿 向苇 《中国酿造》 CAS 北大核心 2010年第11期 32-35,共4页
采用马丁一孟加拉红培养基、牛肉膏蛋白胨培养基和曲汁培养基,分别从白云边酒高温曲、中温曲及小麦原料中分离获得5株有明显差异的细菌和霉菌纯培养物。用PCR技术对分离得到的菌株进行了16SrDNA和18SrDNA序列扩增、同源比对和鉴定。结... 采用马丁一孟加拉红培养基、牛肉膏蛋白胨培养基和曲汁培养基,分别从白云边酒高温曲、中温曲及小麦原料中分离获得5株有明显差异的细菌和霉菌纯培养物。用PCR技术对分离得到的菌株进行了16SrDNA和18SrDNA序列扩增、同源比对和鉴定。结果显示,其叶12株细菌WB-I和IWB-2与芽孢杆菌Bacillus amyloliquefaciens和Bacillussubtilis菌株的16SrDNA相似性分别达到99%和100%;另外3株霉菌WP-1,ZP-1和ZP-2与壮观拟青霉(Paecilomycesspectabilis),伞枝犁头霉(Absidiacorymbifera)和微小根毛霉(Rhizomucor pusillus)菌株的18SrDNA序列相似性分别达到99%、100%和88%。结果表明,白云边酒高温人曲和小麦原料中的主要真菌和细菌种类基本相同,而白云边酒中温曲中的主要优势真菌和细菌与高温大曲明显不同。白云边酒高温曲中的优势霉菌为壮观拟青霉,未分离和检测到高温霉菌。 展开更多
关键词 白云边酒 大曲 小麦 真菌 细菌 分子鉴定
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