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北京市顺义区零售鸡胴体中弯曲菌分布与分子特征研究
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作者 李颖 梁昊 +4 位作者 王苗 张赫 张彦春 马红梅 张茂俊 《中国食品卫生杂志》 CSCD 北大核心 2019年第4期351-355,共5页
目的研究北京市顺义区鸡胴体中弯曲菌分布和分子特征,为顺义区弯曲菌防控提供科学依据。方法采集批发市场和零售店鸡胴体60份,采用滤膜法分离培养弯曲菌,对分离菌株进行多位点序列分型分析并构建最小生成树。结果鸡胴体中弯曲菌检出率为... 目的研究北京市顺义区鸡胴体中弯曲菌分布和分子特征,为顺义区弯曲菌防控提供科学依据。方法采集批发市场和零售店鸡胴体60份,采用滤膜法分离培养弯曲菌,对分离菌株进行多位点序列分型分析并构建最小生成树。结果鸡胴体中弯曲菌检出率为75.0%(45/60),空肠弯曲菌与结肠弯曲菌占比分别为38.0%(19/50)和62.0%(31/50)。批发市场和零售店弯曲菌检出率分别为86.0%(37/43)和47.1%(8/17),差异有统计学意义(χ2=9.877,P<0.05);5~7月空肠弯曲菌检出率分别为10.0%(2/20)、40.0%(8/20)和45.0%(9/20),差异有统计学意义(χ2=6.624,P<0.05)。19株空肠弯曲菌共分为13个ST型;28株结肠弯曲菌共分为16个ST型。空肠弯曲菌耐药率前五位由高至低依次为四环素(100.0%,19/19)、萘啶酸(100.0%,19/19)、环丙沙星(94.7%,18/19)、氟苯尼考(57.9%,11/19)、庆大霉素(36.8%,7/19);结肠弯曲菌耐药率前五位由高至低依次为萘啶酸(100.0%,31/31)、环丙沙星(100.0%,31/31)、四环素(93.5%,29/31)、链霉素(93.5%,29/31)、庆大霉素(83.9%,26/31)。空肠弯曲菌和结肠弯曲菌多重耐药率分别为68.4%(13/19)和93.5%(29/31)。结论北京市顺义区市场零售鸡胴体中弯曲菌污染水平较高,结肠弯曲菌为污染的优势菌种。批发市场鸡胴体污染弯曲菌的情况比零售店严重。 展开更多
关键词 多位点序列分型 空肠弯曲菌 萘啶酸 批发市场 北京市顺义区 分子特征 结肠弯曲菌 最小生成树
上海市宝山区2015-2018年腹泻病人沙门菌血清分型和分子分型
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作者 沈隽卿 张旭 +3 位作者 牛娜 陈洪友 许学斌 张月娟 《中国热带医学》 CAS 2019年第6期503-507,共5页
目的揭示上海市宝山区腹泻病人分离沙门菌的血清型和分子分型分布特征。方法对2015-2018年分离的118株沙门菌进行血清分型和脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分型,通过构建聚类树揭示不同血清型菌株的分子分型特... 目的揭示上海市宝山区腹泻病人分离沙门菌的血清型和分子分型分布特征。方法对2015-2018年分离的118株沙门菌进行血清分型和脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分型,通过构建聚类树揭示不同血清型菌株的分子分型特征。结果 118株沙门菌分为25种血清型,前三位为肠炎沙门菌(45株,38.1%)、鼠伤寒沙门菌(26株,22.0%)、伦敦沙门菌(11株,9.3%)。其余22种血清型分别只包含1~3株菌。118株沙门菌通过PFGE分为71个PFGE带型,每个带型分别包含1~19株菌。45株肠炎沙门菌分为8个PFGE带型,相似度为75.0%~100.0%,在聚类树上形成一个簇;26株鼠伤寒沙门菌分为21个PFGE带型,相似度为48.0%~100.0%,在聚类树上形成两个簇;11株伦敦沙门菌分为8个PFGE带型,相似度为80.0%~100.0%,在聚类树上形成一个簇。结论肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌是上海市宝山区腹泻病人沙门菌优势血清型,但近年伦敦沙门菌有增多的趋势。肠炎沙门菌在本地区传播流行过程中的遗传变异相对比较保守,鼠伤寒沙门菌基因型多态性大,而且存在两个克隆。 展开更多
关键词 沙门菌 腹泻 血清型 分子分型 脉冲场凝胶电泳
淮安市56株临床分离肺炎克雷伯菌耐药性和分子分型特征 预览
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作者 李兵兵 刘纯成 +7 位作者 高强 刘靓 李双姝 金晶 赵怀荣 胡锦流 姚海波 何南江 《江苏预防医学》 CAS 2019年第1期15-18,55共5页
目的 了解淮安市临床分离肺炎克雷伯菌的耐药特征以及分子分型特点。方法2018年1—6月,收集国家致病菌识别网络淮安市各哨点医院从临床标本中分离的肺炎克雷伯菌株,以拉丝试验测定分离菌株的黏液表型,以微量肉汤稀释法测定菌株对24种常... 目的 了解淮安市临床分离肺炎克雷伯菌的耐药特征以及分子分型特点。方法2018年1—6月,收集国家致病菌识别网络淮安市各哨点医院从临床标本中分离的肺炎克雷伯菌株,以拉丝试验测定分离菌株的黏液表型,以微量肉汤稀释法测定菌株对24种常用抗生素的耐药性,PCR检测荚膜血清型、毒力基因和碳青霉烯类耐药基因,利用脉冲场凝胶电泳进行分子分型。结果共收集临床分离肺炎克雷伯菌56株,高毒力肺炎克雷伯菌(hvKP)占55.36%,经典肺炎克雷伯菌(cKP)占44.64%。菌株多来自脓肿液(26.79%)、痰液(41.07%)。总耐药率为66.07%,多重耐药菌占58.93%,ESBLs菌株占17.86%,耐碳青霉烯类抗生素(美罗培南、亚胺培南)菌株占35.71%,3株为多粘菌素耐药菌株。除氯霉素、吉米沙星外,高毒力肺炎克雷伯菌(hvKP)MIC50均 >经典肺炎克雷伯菌(cKP)。耐药基因kpc的检出率为28.57%,cKP菌株的携带率(48.00%)大于hvKP菌株(12.90%),差异有统计学意义(P=0.004),OXA-48和NDM-1未检出。K1、K2、K5、K20、K54、K57荚膜血清型检出率分别为16.07%、10.71%、3.57%、8.93%、9.68%和3.23%。毒力基因magA、rmpA在hvKP(29.03%,80.65%)中检出率均高于cKP菌株(4.00%,24.00%),差异均有统计学意义(P值均<0.05)。菌株PFGE带型相似度为5.91%~100.00%。结论淮安市临床分离肺炎克雷伯菌多为高毒力菌株,且耐药水平较高,PFGE带型多样性较高,应加强监测及临床抗生素使用指导。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 临床来源 耐药性 毒力基因 分子分型
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3.0TMRI多b值扩散加权成像ADC直方图与乳腺癌分子分型及预后因素的相关性研究 预览
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作者 孙淑萌 邵真真 刘佩芳 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期39-43,共5页
目的:探讨3.0TMRI多b值扩散加权成像表观扩散系数(apparent diffusionc oefficient,ADC)直方图参数与乳腺癌分子分型及预后因素的相关性,并评估ADC直方图在各b值下诊断效能。方法:回顾性分析2015年3月至2016年1月114例于天津医科大学肿... 目的:探讨3.0TMRI多b值扩散加权成像表观扩散系数(apparent diffusionc oefficient,ADC)直方图参数与乳腺癌分子分型及预后因素的相关性,并评估ADC直方图在各b值下诊断效能。方法:回顾性分析2015年3月至2016年1月114例于天津医科大学肿瘤医院行乳腺MRI检查并经手术病理证实为浸润性导管癌患者的临床病理资料,共116个病灶。利用ImageJ软件对b值为0、500、800、1000、1500s/mm2时ADC进行直方图分析,记录ADC最小值(ADCmin)、ADC平均值(ADCmean)、ADC众数(ADCmode)、偏度及峰度等参数。根据肿瘤分子分型、T分期(T1vs.T2~3)、组织学级别(高级别vs.低级别)以及淋巴结转移情况(阳性vs.阴性)进行分组,采用Mann-WhitneyU检验比较不同两组间参数差异,并绘制受试者工作特征曲线(receiver operating characteristiccurve,ROC)。结果:b值为500、800、1000及1500s/mm2时,Luminal型的偏度均低于非Luminal型(均P<0.05),HER-2过表达型的ADCmin均高于非HER-2过表达型(均P<0.05),T1期肿瘤的峰度均低于T2~3期(均P<0.05),且峰度与肿瘤大小具有相关性(均P<0.05)。b值为500s/mm2时,组织学低级别组的ADCmode及ADCmean较高级别组高(均P<0.05)。在不同b值下,通过ROC曲线分析差异具有统计学意义的各直方图参数的曲线下面积(areaunderROCcurve,AUC)无显著性差异(均P >0.05)。结论:多b值扩散加权成像ADC直方图是一种肿瘤异质性的定量分析方法,在一定程度上反映乳腺癌的生物学行为和预后,各b值间ADC直方图对于乳腺癌分子分型及预后因素诊断效能无显著性差异。 展开更多
关键词 乳腺癌 磁共振扩散加权成像 分子分型 预后
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基于转录组的肝细胞癌分子分型研究进展
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作者 赵洋 张勇 +3 位作者 燕蒙 王子叶 应万涛 钱小红 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2019年第1期10-17,共8页
肝细胞癌是恶性程度极高的肿瘤之一,患者的发病率和死亡率都位居恶性肿瘤前列.虽然传统临床病理诊断和分级治疗策略得到了极大的发展,并显著改善了肝细胞癌患者的生存情况,但至今肝细胞癌患者的5年生存率仍然较低.基因测序技术的进步和... 肝细胞癌是恶性程度极高的肿瘤之一,患者的发病率和死亡率都位居恶性肿瘤前列.虽然传统临床病理诊断和分级治疗策略得到了极大的发展,并显著改善了肝细胞癌患者的生存情况,但至今肝细胞癌患者的5年生存率仍然较低.基因测序技术的进步和发展加速了肿瘤基因组学的研究,也帮助科学家认识了肿瘤的异质性及其发生、发展的分子机制.近20年,科学家基于转录组数据提出了许多与病理特征相关的肝细胞癌分子亚型,并对其生物学特性和分子特征进行了深入的挖掘.若能将转录组分子亚型与临床病理分级系统综合考虑,用于肝细胞癌病理诊断和分级治疗,将有望改善病人的生存情况,推进肝细胞癌病人的个体化医疗进程. 展开更多
关键词 肝细胞癌 转录组 分子亚型 生存率
应用机器学习方法构建平滑肌肉瘤分子分型预测标签 预览
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作者 王强 安杨 +2 位作者 张国森 董寰 郭向前 《河南大学学报:医学版》 CAS 2019年第1期26-29,共4页
[目的]应用机器学习方法,利用TCGA与GEO数据,构建平滑肌肉瘤分子分型预测标签。[方法]收集TCGA和GSE45510数据,建立机器学习模型,利用pamr包预测标签,将预测亚型与实际值对比以评估预测效果。[结果]经测试,阈值取6.639时,分类准确率为87... [目的]应用机器学习方法,利用TCGA与GEO数据,构建平滑肌肉瘤分子分型预测标签。[方法]收集TCGA和GSE45510数据,建立机器学习模型,利用pamr包预测标签,将预测亚型与实际值对比以评估预测效果。[结果]经测试,阈值取6.639时,分类准确率为87.8%,相关基因159个。[结论]利用机器学习方法构建平滑肌肉瘤分子分型预测标签,可以用于预测平滑肌肉瘤分子亚型,提高诊断精度,指导未来平滑肌肉瘤亚型特异性靶向治疗,推动精准治疗发展。 展开更多
关键词 平滑肌肉瘤 表达谱 机器学习 分子分型 预测标签
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T1~2期伴1~3个腋窝淋巴结转移术后未行放射治疗乳腺癌患者的局部复发风险及生存分析 预览
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作者 娄立平 史振东 +2 位作者 刘晶晶 杨晓楠 张瑾 《天津医药》 CAS 北大核心 2019年第7期718-723,共6页
目的通过对1~3个腋窝淋巴结(ALNs)阳性早期乳腺癌患者的分子分型与局部复发及预后相关性进行探讨,为进一步完善术后放射治疗(PMRT)的个体化适应证提供参考。方法回顾性分析2009-2012年我院就诊的489例未行PMRT的pT1~2N1M0(1~3个ALNs阳性... 目的通过对1~3个腋窝淋巴结(ALNs)阳性早期乳腺癌患者的分子分型与局部复发及预后相关性进行探讨,为进一步完善术后放射治疗(PMRT)的个体化适应证提供参考。方法回顾性分析2009-2012年我院就诊的489例未行PMRT的pT1~2N1M0(1~3个ALNs阳性)患者。采用Kaplan-Meier法计算局部复发率(LRR)、无病生存率(DFS)和总生存率(OS),采用Log-rank检验和Cox回归模型确定影响不同分子分型患者LRR及与预后的临床病理因素。结果489例未行PMRT的pT1~2N1M0乳腺癌患者中LuminalA型、LuminalB(HER-2阴性)型和三阴型分别为229、196和64例。中位随访时间为75个月(5~115个月),对分子分型进行亚组分析显示,三阴型5年LRR高于非三阴型,5年DFS和OS均低于非三阴型,差异有统计学意义(均P<0.05)。然而,在LuminalA型和LuminalB(HER-2阴性)型之间5年LRR、DFS和OS差异均无统计学意义(均P>0.05)。多因素Cox回归分析表明年龄≤35岁、pT2分期和三阴型是LRR的独立不良预后因素。结论分子分型有助于个体化区别伴1~3个ALNs转移的pT1~2N1M0乳腺癌患者的局部复发风险,对于LRR较高的年龄≤35岁、pT2分期及三阴型乳腺癌患者推荐行PMRT以改善预后。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 淋巴转移 肿瘤复发 局部 放射疗法 预后 分子分型
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2014-2017年北京市顺义区腹泻病例中沙门菌流行特征与分子分型特征分析 被引量:1
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作者 李颖 张爽 +3 位作者 王彦波 张彦春 张赫 马红梅 《疾病监测》 CAS 2018年第10期803-808,共6页
目的分析2014—2017年北京市顺义区腹泻病例中沙门菌流行特征和分子分型特征,为沙门菌的防控、预警、溯源等提供依据。方法收集北京市顺义区腹泻病例标本和流行病学数据,分离沙门菌并进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型检测,利用国家... 目的分析2014—2017年北京市顺义区腹泻病例中沙门菌流行特征和分子分型特征,为沙门菌的防控、预警、溯源等提供依据。方法收集北京市顺义区腹泻病例标本和流行病学数据,分离沙门菌并进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型检测,利用国家致病菌识别网平台进行指纹图谱比对,结合实验室检测结果、流行病学资料、临床资料对本地区沙门菌流行和分子分型特征进行描述分析。结果顺义区腹泻病例中沙门菌检出率为5.23%,21种血清型,以鼠伤寒沙门菌(32.89%)和肠炎沙门菌(30.26%)为主;沙门菌检出率呈春秋季双高峰分布;女性和男性肠炎沙门菌的检出率差异有统计学意义(χ2=5.978,P=0.014);发热体温越高的病例组,沙门菌属检出率越高,差异有统计学意义(χ2=22.579,P〈0.001);菌株PFGE分析结果显示存在多次聚集的现象。结论沙门菌在北京市顺义区腹泻病原中占有重要位置;不同血清型沙门菌的人群分布、临床症状分布和分子分型分布均具有一定特征;利用国家致病菌识别网识别、预警、评估、溯源沙门菌引起的食源性疾病和肠道传染病是本地区沙门菌防控工作的方向。 展开更多
关键词 沙门菌 腹泻 分子分型 流行特征
乳腺癌分子分型研究进展 预览
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作者 卢振东 孙晓晓 +5 位作者 谢龙祥 张璐 厉永强 韩亚莉 郭向前 闫中义 《河南大学学报:医学版》 CAS 2018年第4期229-233,共5页
乳腺癌是女性肿瘤中发生率和死亡率最高的肿瘤之一,由于乳腺癌的异质性和对治疗结果的不确定性,致使难以预测预后。随着生物技术的快速发展,乳腺癌的分子分型已在乳腺癌患者的化疗、内分泌治疗和个性化治疗中被广泛使用。分子分型给乳... 乳腺癌是女性肿瘤中发生率和死亡率最高的肿瘤之一,由于乳腺癌的异质性和对治疗结果的不确定性,致使难以预测预后。随着生物技术的快速发展,乳腺癌的分子分型已在乳腺癌患者的化疗、内分泌治疗和个性化治疗中被广泛使用。分子分型给乳腺癌患者的诊断、治疗、预后及复发的判断提供了重要参考依据,因此乳腺癌分子分型具有广泛的临床应用前景。但现有乳腺癌肿瘤标记物仍不能满足临床需求,其临床实用性有待提高,亟需对乳腺癌进行进一步精准分型和开发肿瘤标记物,以实现乳腺癌的个体化治疗。 展开更多
关键词 乳腺癌 分子分型 肿瘤标记物 流行病学
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2016年上海市市售肉制品中沙门菌耐药谱与分型研究 被引量:1
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作者 刘玥 顾其芳 +5 位作者 刘诚 朱颖莹 刘弘 陈敏 许学斌 张红芝 《中国食品卫生杂志》 北大核心 2018年第2期132-138,共7页
目的研究上海市市售肉制品中沙门菌血清型、耐药谱和分子分型特征。方法 2016年1~8月在上海市所辖16个行政区,随机选择1个密集型社区,抽取1家超市或市场作为哨点,定期采集畜、禽类肉制品,按国家食品安全风险评估中心(CFSA)食源性疾... 目的研究上海市市售肉制品中沙门菌血清型、耐药谱和分子分型特征。方法 2016年1~8月在上海市所辖16个行政区,随机选择1个密集型社区,抽取1家超市或市场作为哨点,定期采集畜、禽类肉制品,按国家食品安全风险评估中心(CFSA)食源性疾病监测方案进行沙门菌分离、血清分型、抗生素定量检测与剂量评估、优势菌的分子分型。结果 606份样品包括猪、鸡、鸭、牛、羊、鹅肉制品,共分离沙门菌158株,总阳性率为26.1%,畜肉和禽肉来源分别占52.5%(83/158)和47.5%(75/158)。前5位沙门菌血清型依次为肠炎沙门菌、鼠伤寒沙门菌、德尔卑沙门菌、罗森沙门菌和印第安纳沙门菌,畜肉和禽肉来源优势菌型间差异有统计学意义(P〈0.05);菌株对磺胺异噁唑耐药率最高(79.7%,126/158),对链霉素、萘啶酸、氨苄西林、四环素和氯霉素耐药率在38.0%~77.8%,多重耐药(MDR)菌株(≥3类)占77.8%(123/158),猪肉来源沙门菌对庆大霉素、链霉素、磺胺异噁唑、复方新诺明、氯霉素、四环素耐药率均高于鸡肉来源沙门菌,鸡肉来源沙门菌对头孢噻呋、头孢曲松、萘啶酸耐药率均高于猪肉来源沙门菌,差异均有统计学意义(P〈0.05),32.9%(52/158)的菌株对至少6种抗生素超检测限值;肠炎沙门菌有15个分型,以1型和3型为优势型;鼠伤寒沙门菌有23个分型,具有遗传多样性特征。结论上海市市售肉制品沙门菌暴露以猪肉和鸡肉来源为主,肉制品中多重耐药沙门菌污染严重。猪肉来源的罗森沙门菌和鸡肉来源的吉韦沙门菌是新输入性的血清型。 展开更多
关键词 沙门菌 血清型 多重耐药 分子分型 食源性致病菌 肉制品 上海
乳腺癌分子分型及其临床治疗意义 被引量:1
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作者 李狄航 梁运升 《中国基层医药》 CAS 2018年第17期2309-2312,共4页
乳腺癌是一种常见的严重威胁女性健康的恶性肿瘤,分子分型基于分子水平为乳腺癌的病理学分类提供了一种新的分类方式,并对临床治疗起到了极其重要的指导意义。目前,乳腺癌分子分型主要分为以下亚型:LuminalA型、LuminalB型、HER_2... 乳腺癌是一种常见的严重威胁女性健康的恶性肿瘤,分子分型基于分子水平为乳腺癌的病理学分类提供了一种新的分类方式,并对临床治疗起到了极其重要的指导意义。目前,乳腺癌分子分型主要分为以下亚型:LuminalA型、LuminalB型、HER_2过表达型和三阴性乳腺癌。不同分子分型治疗反应、预后及临床应用现状均有着不同的特征。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 分子分型 临床治疗
变性梯度凝胶电泳技术在食源性沙门氏菌分子分型中的应用研究
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作者 杨向莹 高静 +5 位作者 畅晓晖 石嵩 张惠媛 李小林 谢雪钦 张捷 《食品安全质量检测学报》 CAS 2018年第19期5044-5049,共6页
目的建立基于变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术的沙门氏菌分型方法。方法以5株代表性沙门氏菌为供试菌,用引物对GC-rpoB1/ropB3R扩增获得目的片段后,经变性凝胶电... 目的建立基于变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术的沙门氏菌分型方法。方法以5株代表性沙门氏菌为供试菌,用引物对GC-rpoB1/ropB3R扩增获得目的片段后,经变性凝胶电泳分离获得谱图,量化分析谱带多样性及均一性,依据菌株谱图量化相似性构建聚类分析图,分析该技术用于沙门氏菌分型的可行性。结果 5个供试菌的PCR-DGGE谱图差异大,其中以标准菌株肠炎沙门氏菌(ATCC9184)的多样性及丰富度最高,标准菌株鼠伤寒沙门氏菌的最低;就谱带相似性而言,分离自鸭腿样品的2株沙门氏菌的相似性最高,戴斯系数高达85.7%,而分属于不同血清型的两个标准菌株则相似度指数为0%;基于谱带相似性建立的聚类树可将供试菌株很好地分为不同簇。结论本研究所建立的基于PCR-DGGE技术的沙门氏菌分型方法准确度和分辨力均较理想,具有一定的理论及实际意义。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳 食源性沙门氏菌 分子分型
前列腺癌与精准医学 被引量:2
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作者 高旭 李晶 《第二军医大学学报》 CSCD 北大核心 2018年第6期581-590,共10页
当精准医疗的理念遇到后人类基因组计划时代,前列腺癌的临床诊疗迎来了"再解读"和"新导向"的绝佳机遇。前列腺癌作为男性肿瘤的头号杀手,其按传统理念治疗的效果提升或遇瓶颈、或待突破,而按精准医疗理念治疗初现成效。通过精准医... 当精准医疗的理念遇到后人类基因组计划时代,前列腺癌的临床诊疗迎来了"再解读"和"新导向"的绝佳机遇。前列腺癌作为男性肿瘤的头号杀手,其按传统理念治疗的效果提升或遇瓶颈、或待突破,而按精准医疗理念治疗初现成效。通过精准医疗手段对患者进行临床再分型,对前列腺癌经典的雄激素剥夺治疗(ADT)、化学治疗乃至放射治疗策略具有潜在的优化价值;当前列腺癌的传统治疗渐失效果时,前列腺癌分子分型图谱的描绘和靶向治疗的开发有望成为新的突破点;与此同时,精准医疗的探索还促使免疫环境改造、肿瘤新抗原预测以及类器官培养等新型治疗理念进入前列腺癌的研究领域。精准医学正在"加速"走进人们视野,未来在前列腺癌诊疗中或将具有广阔的应用前景。然而,现阶段肿瘤精准医疗的投入与获益比仍远低于大众的心理预期。同时,与诸多新兴理念一样,精准医疗背后潜在的巨大市场不可避免滋生了过热的商业宣传。在这种现状下,科研工作者与临床医患双方充分沟通、合作,以及政府卫生管理部门对行业的规范和引导,是保证精准医疗造福人类健康正确前行方向的必由之路。 展开更多
关键词 精准医疗 前列腺肿瘤 分子分型 高通量测序
2015—2016年淮安市售禽畜肉中沙门菌污染及其病原学特征
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作者 李兵兵 刘纯成 +5 位作者 刘靓 李双姝 范乃来 侯海燕 金晶 邢亚东 《卫生研究》 CSCD 北大核心 2018年第2期260-265,300共7页
目的了解市售禽畜肉中沙门菌的污染情况,并研究分离菌株的病原学特征。方法 2015—2016年以随机采样方式从淮安市8个县区的超市和农贸市场采集禽畜肉样品,按照GB 4789.4—2010《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》方法检... 目的了解市售禽畜肉中沙门菌的污染情况,并研究分离菌株的病原学特征。方法 2015—2016年以随机采样方式从淮安市8个县区的超市和农贸市场采集禽畜肉样品,按照GB 4789.4—2010《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》方法检测沙门菌。对分离的沙门菌株进行血清分型,耐药特性分析,毒力基因携带情况分析以及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型研究。结果 368份畜禽肉中共有37份检出沙门菌,总检出率为10.05%,其中,鸡肉、鸭肉、猪肉和牛羊肉中沙门菌的检出率分别为14.14%(14/99)、11.11%(10/90)、10.34%(12/116)和1.59%(1/63)。37株沙门菌共有8种血清型,优势血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。药敏试验说明本地禽畜源沙门菌对氨苄西林和萘啶酸的耐药率最高(72.97%),对头孢西丁的耐药率最低(8.11%),不同样本来源及不同血清型沙门菌的耐药表型存在差异。肠炎沙门菌中inv H和sop E的携带率最高,鼠伤寒沙门菌中inv H、sop E、rhu M的携带率最高。PFGE分型研究发现,所有肠炎沙门菌的带型相似度均在81.56%以上,相同样本来源的肠炎菌株之间的亲缘关系更近;鼠伤寒沙门菌的带型各不相同,分离株的基因型别呈现多样性。结论淮安市售禽畜肉中沙门菌的污染率较高,优势血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。沙门菌分离株的耐药状况严重,毒力基因携带率高。 展开更多
关键词 沙门菌 污染 血清型 耐药性 毒力基因 分子分型
从分子分型看胶质瘤的精准治疗 被引量:3
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作者 花玮 毛颖 《中华外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期63-66,共4页
在基因组学研究的推动下,胶质瘤分子分型近来有了新的进展。癌症基因组图谱(TCGA)项目依据基因表达谱将胶质母细胞瘤(WHO Ⅳ级)分为4型,依据1p/19q共缺失、异柠檬酸脱氢酶(IDH)基因突变、TERTp(端粒酶逆转录酶基因启动子区)... 在基因组学研究的推动下,胶质瘤分子分型近来有了新的进展。癌症基因组图谱(TCGA)项目依据基因表达谱将胶质母细胞瘤(WHO Ⅳ级)分为4型,依据1p/19q共缺失、异柠檬酸脱氢酶(IDH)基因突变、TERTp(端粒酶逆转录酶基因启动子区)突变将较低级别胶质瘤(WHO Ⅱ、Ⅲ级)分为5型。2016年WHO完成了新版中枢神经系统肿瘤分类的修订,将这些新的分子标志物引入到胶质瘤诊断中,并将分子诊断与传统形态学诊断整合,推动了胶质瘤精准诊断。同样在分子分型的指导下,胶质瘤精准治疗也得到了大力发展。本文就近来胶质瘤分子诊断、精准化疗、靶向治疗和免疫治疗等方面的研究进行回顾,期望为胶质瘤精准诊疗提供新的思路和策略。 展开更多
关键词 神经胶质瘤 分子分型 精准治疗
158例乳腺癌新辅助化疗疗效与Ki-67截断值的相关分析 预览 被引量:3
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作者 姬瑶 刘君 +1 位作者 杨艳芳 陆苏 《中国肿瘤临床》 CSCD 北大核心 2017年第11期547-551,共5页
目的:探讨乳腺癌分子分型、ER、PR、Ki-67表达对新辅助化疗(neoadjuvant chemotherapy,NAC)疗效的预测价值,以及不同化疗方案和周期对疗效的影响.方法:收集2015年1月至12月158例天津医科大学肿瘤医院行NAC的女性乳腺癌患者的临床资... 目的:探讨乳腺癌分子分型、ER、PR、Ki-67表达对新辅助化疗(neoadjuvant chemotherapy,NAC)疗效的预测价值,以及不同化疗方案和周期对疗效的影响.方法:收集2015年1月至12月158例天津医科大学肿瘤医院行NAC的女性乳腺癌患者的临床资料,对比各分子分型及不同化疗方案疗效的差异,分析评价影响疗效的临床指标,及ER、PR、Ki-67预测NAC疗效的价值.结果:158例患者中,其中5例HER-2阳性患者行曲妥珠单抗治疗,因病例数较少未纳入统计分析.Spearman相关分析显示,NAC疗效与ER、PR表达呈负相关,与Ki-67(截断值为25%)表达呈正相关(P〈0.05);Luminal型和非Luminal型乳腺癌患者NAC疗效的病理评价为无效分别占10.1%和1.3%,差异具有统计学意义(P=0.033);NAC〈4个疗程的疗效达Ⅲ级仅4.8%,显著低于NAC≥4个疗程的36.0%,差异具有统计学意义(P=0.016).Logistic多因素分析显示化疗前Ki-67表达是影响NAC疗效的独立预测因素.结论:根据化疗前Ki-67表达可粗略预测NAC疗效,但Ki-67截断值应依据检测机构的数据进行评定;Luminal型患者经NAC治疗后无效的概率较大,化疗不敏感时可考虑手术治疗.NAC〈4个疗程时NAC疗效降低,提示NAC足疗程是提高其疗效的条件之一. 展开更多
关键词 乳腺癌 新辅助化疗 分子分型 预测指标 KI-67抗原
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H2AFZ、MLF1IP和NEK2在乳腺癌不同亚型中的表达差异与预后相关性分析 预览
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作者 孙天一 章程 寿成超 《转化医学电子杂志》 2017年第9期23-31,共9页
目的:寻找与乳腺癌分型和预后相关的全新分子标志物,为乳腺癌的诊疗提供依据.方法:本研究借助生物信息学手段和统计学方法对多个来自肿瘤公共数据库的大样本数据进行了深度分析.结果:H2AFZ、MLF1IP和NEK2为乳腺癌不利预后因子,三者... 目的:寻找与乳腺癌分型和预后相关的全新分子标志物,为乳腺癌的诊疗提供依据.方法:本研究借助生物信息学手段和统计学方法对多个来自肿瘤公共数据库的大样本数据进行了深度分析.结果:H2AFZ、MLF1IP和NEK2为乳腺癌不利预后因子,三者皆与乳腺癌患者ER/PR/HER2表达水平具有显著的相关性.H2AFZ、MLF1IP和NEK2的mRNA水平在ER和PR阳性乳腺癌中低表达,而在HER2阳性乳腺癌中高表达.此外,H2AFZ、MLF1IP和NEK2在乳腺癌Luminal A亚型中的表达水平较低,而且与预后负相关,而在其他亚型中水平较高,与预后相关性不大.结论:作为不利预后因子,H2AFZ、MLF1IP和NEK2在乳腺癌患者不同分型人群中的表达差异可能是造成乳腺癌各分型恶性程度和预后差异的原因之一. 展开更多
关键词 乳腺癌 大样本数据分析 分子分型 预后相关基因
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乳腺浸润性导管癌不同分子分型中CD90的表达及其意义 预览 被引量:1
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作者 杨海玉 刘勇 +3 位作者 戴艳枝 吴晓霞 黄桃 袁晟 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期245-249,共5页
目的 探讨CD90在乳腺浸润性导管癌中的表达及其与临床病理特征、分子分型的相关性。方法 构建80例乳腺浸润性导管癌和20例乳腺良性病变的组织芯片,采用免疫组化MaxVision法检测乳腺不同病变组织中CD90、ER、PR、Ki-67和HER-2的表达水平... 目的 探讨CD90在乳腺浸润性导管癌中的表达及其与临床病理特征、分子分型的相关性。方法 构建80例乳腺浸润性导管癌和20例乳腺良性病变的组织芯片,采用免疫组化MaxVision法检测乳腺不同病变组织中CD90、ER、PR、Ki-67和HER-2的表达水平,并进一步分析其相关性。结果 CD90在乳腺浸润性导管癌和乳腺良性病变中的阳性率分别为62.5%和20.0%,两者差异有统计学意义(P〈0.001);CD90表达与乳腺浸润性导管癌淋巴结转移相关(P〈0.05),与患者年龄、肿瘤大小、TNM分期及组织学分级无关(P〉0.05);在乳腺浸润性导管癌不同分子亚型中,CD90阳性率以LuminalA型最低(40.0%)、三阴型最高(82.4%),各亚型之间差异有统计学意义(P〈0.05);CD90与ER(r=-0.342,P〈0.05)、PR(r=-0.374,P〈0.05)表达呈负相关,与Ki-67表达之间无相关性(r=0.084,P〉0.05)。结论 CD90表达与乳腺癌分子分型有关,其高表达提示患者预后不良。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 CD90 分子分型 转移 免疫组织化学
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淮安地区食源性沙门氏菌耐药性及分子分型研究 预览
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作者 刘靓 李兵兵 +2 位作者 李双姝 刘纯成 邢亚东 《徐州医科大学学报》 CAS 2017年第10期664-667,共4页
目的了解分离自食品的沙门氏菌的血清型分布、耐药特性以及分子分型特征。方法对分离自食品的沙门氏菌进行血清凝集分型,利用MIC法测定分离株的耐药性,通过脉冲场凝胶电泳技术对分离株进行基因分型。结果39株分离自食品的沙门氏菌分属... 目的了解分离自食品的沙门氏菌的血清型分布、耐药特性以及分子分型特征。方法对分离自食品的沙门氏菌进行血清凝集分型,利用MIC法测定分离株的耐药性,通过脉冲场凝胶电泳技术对分离株进行基因分型。结果39株分离自食品的沙门氏菌分属于5个群,9种血清型,优势血清型为肠炎沙门氏菌。经脉冲场凝胶电泳分型,按照80%相似度,39株沙门氏菌聚类为15个簇群。39株沙门氏菌中具有耐药性的菌株占69.23%,耐药率由高到低依次为氨苄西林、萘啶酸、头孢唑啉、庆大霉素、四环素、氯霉素、环丙沙星、甲氧苄氨嘧啶/磺胺甲嚼唑、头孢噻肟、头孢他啶和头孢西丁。结论本地区食源性沙门氏菌分离株的血清型和基因型呈多样性分布,并且具有多重耐药的特点。 展开更多
关键词 沙门氏菌 血清型 分子分型 耐药性
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广东省惠州市集中空调系统冷却水及冷凝水中嗜肺军团菌脉冲场凝胶电泳分型分析 被引量:1
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作者 刘思超 罗泽燕 +3 位作者 徐励琴 杨剑英 冯伟明 邬军军 《疾病监测》 CAS 2017年第5期382-386,共5页
目的分析广东省惠州市公共场所集中空调系统冷却水及冷凝水中分离的嗜肺军团菌的基因特征,初步建立惠州市嗜肺军团菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型数据库。方法采用PFGE技术,对2012-2016年惠州市公共场所集中空调系统冷却水及冷凝水中... 目的分析广东省惠州市公共场所集中空调系统冷却水及冷凝水中分离的嗜肺军团菌的基因特征,初步建立惠州市嗜肺军团菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型数据库。方法采用PFGE技术,对2012-2016年惠州市公共场所集中空调系统冷却水及冷凝水中分离的35株嗜肺军团菌进行电泳分析获得指纹图谱,并用BioNumeries6.6软件对其进行聚类分析。结果35株嗜肺军团菌分为29种不同的PFGE带型,菌株间带型相似系数为21.70%-100.00%。每种带型包含1-3株菌,存在5组带型一样的菌株,不存在优势型别;相同PFGE型别的菌株均来源于同一场所;同一场所存在2种以上不同PFGE型别;部分场所的冷却水和冷凝水中分离的菌株存在相同PFGE型别;相同血清型别的菌株经PFGE分型后得到不同的图谱,各菌株间PFGE图谱差异较大。结论惠州市公共场所集中空调冷却水及冷凝水中分离的嗜肺军团菌呈现基因多样性。 展开更多
关键词 嗜肺军团菌 脉冲场凝胶电泳 分子分型
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