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膳食纤维在肉品加工中的应用 被引量:1
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作者 李可 刘俊雅 +3 位作者 李子豪 黄乐坚 张华 白艳红 《食品工业》 CAS 北大核心 2019年第1期264-268,共5页
为了提高肉类食品营养品质,改善消费者健康体质,膳食纤维在肉品加工中的研究与应用成为了近年来的研究热点。简述了膳食纤维的概念、提取方法、理化性质,论述了膳食纤维在肉品加工中的应用及其作用机制,并对膳食纤维在肉品加工中的应用... 为了提高肉类食品营养品质,改善消费者健康体质,膳食纤维在肉品加工中的研究与应用成为了近年来的研究热点。简述了膳食纤维的概念、提取方法、理化性质,论述了膳食纤维在肉品加工中的应用及其作用机制,并对膳食纤维在肉品加工中的应用与研究进行了总结与展望,以期为开发新型膳食纤维肉类食品提供一定的理论依据与技术支持。 展开更多
关键词 膳食纤维 肉品加工 脂肪 蛋白质功能特性
UniProt蛋白质数据库简介 预览
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作者 罗静初 《生物信息学》 2019年第3期131-144,共14页
UniProt(https://www.uniprot.org/)是国际知名蛋白质数据库,主要包括UniProtKB知识库、UniParc归档库和UniRef参考序列集三部分。UniProtKB知识库是UniProt的核心,除蛋白质序列数据外,还包括大量注释信息。UniProtKB知识库分Swiss-Prot... UniProt(https://www.uniprot.org/)是国际知名蛋白质数据库,主要包括UniProtKB知识库、UniParc归档库和UniRef参考序列集三部分。UniProtKB知识库是UniProt的核心,除蛋白质序列数据外,还包括大量注释信息。UniProtKB知识库分Swiss-Prot和TrEMBL两个子库。Swiss-Prot子库中50多万条序列均由人工审阅和注释,而TrEMBL子库中1.4亿多条序列是由核酸序列数据库EMBL中的蛋白质编码序列翻译所得,并由计算机根据一定规则进行注释。UniParc归档库将存放于不同数据库中的同一个蛋白质归并到一个记录中以避免冗余,并赋予序列唯一性特定标识符。UniRef参考序列集按相似性程度将UniProtKB和UniParc中的序列分为UniRef100、UniRef90和UniRef50三个数据集。UniProt网站为用户提供了高效实用的高级检索系统和大量帮助文档。UniProt数据库每4周发布新版的同时也发布统计报表,用户可通过统计报表了解该数据库的数据量及更新情况、数据类别和物种分布等基本信息,查看常规注释信息、序列特征注释信息和数据库交叉链接等统计数据。UniProt是目前国际上序列数据最完整、注释信息最丰富的非冗余蛋白质序列数据库,自本世纪初创建以来,为生命科学领域提供了宝贵资源。 展开更多
关键词 数据库 蛋白质序列 蛋白质功能 数据库注释 数据库交叉链接 数据库高级检索
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植物弹状病毒研究进展 预览
3
作者 张守杰 耿军 +3 位作者 纪国才 王黎 宋春燕 李松坚 《河北农业科学》 2019年第2期72-75,78共5页
弹状病毒是一类负义单链RNA病毒,寄主范围很广,根据侵染寄主的不同分为植物弹状病毒和动物弹状病毒两大类。其中,植物弹状病毒可以侵染小麦、马铃薯、大麦、莴苣和兰花等多种植物,为害宿主健康,给农业生产造成经济损失。综述了植物弹状... 弹状病毒是一类负义单链RNA病毒,寄主范围很广,根据侵染寄主的不同分为植物弹状病毒和动物弹状病毒两大类。其中,植物弹状病毒可以侵染小麦、马铃薯、大麦、莴苣和兰花等多种植物,为害宿主健康,给农业生产造成经济损失。综述了植物弹状病毒的分类、基因组结构、蛋白功能、生物学特性等方面的最新研究进展。认为加强N蛋白和G蛋白研究,对阻断昆虫介体的传毒途径,进而防治植物弹状病毒病具有重要意义。 展开更多
关键词 植物弹状病毒 基因组结构 蛋白功能 生物学特性 病毒病
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生物体内多胺对蛋白质影响的研究进展 被引量:1
4
作者 张玲娅 刘森 《生物工程学报》 CSCD 北大核心 2018年第3期352-359,共8页
多胺是普遍存在于生物体中的一种脂肪族阳离子胺。多胺通过离子键和氢键的形式与生物大分子结合,调节生物大分子的生物学活性,调控细胞的生长和发育。多胺对核酸的作用一直是关注热点,而针对蛋白质的影响目前研究较少。本文主针对多胺... 多胺是普遍存在于生物体中的一种脂肪族阳离子胺。多胺通过离子键和氢键的形式与生物大分子结合,调节生物大分子的生物学活性,调控细胞的生长和发育。多胺对核酸的作用一直是关注热点,而针对蛋白质的影响目前研究较少。本文主针对多胺调控代谢相关酶、通道蛋白质和其他功能性蛋白质以及相关规律和机制进行综述,并从蛋白质结构和功能角度探讨了多胺与蛋白质之间的相互作用关系,同时总结了多胺与蛋白质相互作用研究在疾病治疗中的应用前景和面临的问题。 展开更多
关键词 多胺 蛋白质结构 蛋白质功能 相互作用
基于稀疏语义的蛋白质噪声功能标注识别
5
作者 路畅 陈霞 +2 位作者 王峻 余国先 余志文 《中国科学:信息科学》 CSCD 北大核心 2018年第8期1035-1050,共16页
蛋白质功能自动标注是生物信息学领域的关键问题之一.蛋白质功能标注信息来源广泛,噪声标注信息不可避免地被引入.已有蛋白质功能预测研究更关注预测功能信息完全未知(或部分已知)蛋白质的功能,极少关注识别蛋白质的噪声功能标注.本... 蛋白质功能自动标注是生物信息学领域的关键问题之一.蛋白质功能标注信息来源广泛,噪声标注信息不可避免地被引入.已有蛋白质功能预测研究更关注预测功能信息完全未知(或部分已知)蛋白质的功能,极少关注识别蛋白质的噪声功能标注.本文提出一种基于稀疏语义相似度的蛋白质噪声功能标注识别方法 (identifying noisy functional annotations of proteins using sparse semantic similarity,NFA).NFA首先利用一个蛋白质–功能标签关联矩阵存储蛋白质功能标注信息,对不同证据的功能标注信息分别加权,再利用功能标签间层次结构关系向上传播这些权重到拓展的功能标注上;其次,在加权后的关联矩阵上利用l1-norm约束的稀疏表示计算蛋白质之间的语义相似度;最后基于一个蛋白质的语义近邻蛋白质的功能标注信息投票识别该蛋白质的噪声功能.在酵母菌和拟南芥这两个模式生物上的实验结果表明,NFA较现有算法能更准确识别蛋白质噪声功能标注,剔除NFA识别出的噪声功能标注能够提升现有蛋白质功能预测算法的精度. 展开更多
关键词 蛋白质功能 噪声功能标注 稀疏表示 语义相似度 标签结构
丝瓜果实发育过程的蛋白质差异表达分析
6
作者 陈敏氡 王彬 +3 位作者 朱海生 李永平 刘建汀 温庆放 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2018年第11期1806-1818,共13页
丝瓜果实发育过程伴随着明显的形态转变和复杂的生理生化变化,这些变化均影响着果实的采后寿命和品质。为阐明丝瓜果实发育过程中重要蛋白质的功能与调控作用,该研究以同位素标记相对定量联合液相色谱串联质谱(iTRAQ-LC-MS/MS)技术测定... 丝瓜果实发育过程伴随着明显的形态转变和复杂的生理生化变化,这些变化均影响着果实的采后寿命和品质。为阐明丝瓜果实发育过程中重要蛋白质的功能与调控作用,该研究以同位素标记相对定量联合液相色谱串联质谱(iTRAQ-LC-MS/MS)技术测定丝瓜果实发育过程三个时期(花后5天、花后15天、花后30天)蛋白的表达水平,鉴定差异蛋白,并对它们进行亚细胞定位、GO(gene oncology)和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)途径分析。共鉴定到差异蛋白709个,其中在丝瓜果实不同发育时期共同存在的差异蛋白有229个,上调蛋白有118个,下调蛋白由111个。亚细胞定位显示,差异蛋白的亚细胞主要定位于叶绿体、细胞质和细胞核。GO分析发现,四吡咯结合、过氧化物酶活性、氧化还原酶活性、血红素结合和抗氧化活性是差异蛋白5种主要的分子功能,过氧化氢代谢过程、应激反应和防御反应是差异蛋白3种主要参与的生物过程。代谢途径分析显示,丝瓜果实发育过程的差异蛋白主要富集在3个代谢途径,分别为次生代谢产物生物合成、糖代谢和DNA复制途径,从中筛选出36个在丝瓜果实发育过程发挥重要作用的目标差异蛋白。其中, PAL、C4H、4-CL、COMT和CAD可能是调控果实内酚类物质和木质素合成的5种关键蛋白。PAL、POD、PPO、CAT、APX 5种差异蛋白可能协同参与果实发育后期的酶促褐变。SS和α-AL可能在丝瓜果实蔗糖的累积和淀粉的降解过程中起着重要作用。以上研究结果为进一步阐明丝瓜的发育调控,进而指导丝瓜品种选育和生产栽培提供了理论支持。 展开更多
关键词 丝瓜 果实发育 iTRAQ-LC-MS/MS 蛋白组学 蛋白功能
蛋白质组学分析揭示玉米籽粒发育过程中胁迫相关蛋白的表达特性 预览 被引量:1
7
作者 于涛 李耕 +3 位作者 刘鹏 董树亭 张吉旺 赵斌 《中国农业科学》 CSCD 北大核心 2017年第11期2114-2128,共15页
【目的】从蛋白质组学的层面探讨玉米籽粒发育过程中胁迫相关蛋白的表达特性,分析其功能,揭示籽粒自身防御系统的分子调控机理。【方法】大田条件下,以玉米品种登海661(DH661)为供试材料,67 500株/hm~2密度下种植,开花期人工饱和授粉... 【目的】从蛋白质组学的层面探讨玉米籽粒发育过程中胁迫相关蛋白的表达特性,分析其功能,揭示籽粒自身防御系统的分子调控机理。【方法】大田条件下,以玉米品种登海661(DH661)为供试材料,67 500株/hm~2密度下种植,开花期人工饱和授粉后第3、5、10、15、20、30、40和50天(DAP)取果穗中部籽粒。TCA-丙酮沉淀法提取籽粒总蛋白,用同位素标记相对定量(i TRAQ)技术进行蛋白质组学分析。通过匹配Uniprot玉米蛋白数据库鉴定籽粒总蛋白,并且用基因本论(GO)注释按照生物过程、分子功能及细胞组件进行功能分类。分析鉴定籽粒发育过程中显著差异表达的胁迫相关蛋白,并且将其分层聚类以展示其在籽粒发育过程中的表达模式。【结果】通过匹配玉米蛋白数据库,籽粒中总计鉴定到4 751个蛋白,这些蛋白涉及多种生物过程与分子功能,其中代谢过程与分子过程是最主要的两个生物过程,而催化活性与绑定功能是最主要的两个分子功能类别,表明这些生物过程与分子功能对籽粒发育具有重要作用。定量分析检测到123个胁迫相关蛋白在玉米籽粒发育过程中显著差异表达,主要参与籽粒蛋白修饰(33个)、活性氧(ROS)体内平衡(31个)、贮藏物质保护(17个)、病虫害响应(8个)及其他胁迫响应过程(34个)。蛋白修饰相关蛋白主要包含一系列的热激蛋白、肽基脯氨酰顺反异构酶及蛋白二硫键异构酶,并且这些蛋白在籽粒不同发育阶段均显著积累,这对稳定籽粒中的蛋白结构具有重要作用。ROS相关蛋白包含不同的抗氧化酶系,并且主要在籽粒发育前、后期显著积累,维护了ROS的体内平衡。贮藏物质保护相关蛋白主要包含多种蛋白酶抑制剂、油脂体蛋白及油脂体固醇蛋白,并且这些蛋白随着籽粒发育不断上调表达,保护了贮藏物质的合成与积累。病虫害响应相关 展开更多
关键词 玉米 籽粒发育 iTRAQ蛋白质组学 胁迫相关蛋白 蛋白功能
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小鼠GnIH基因克隆及生物信息学分析 被引量:3
8
作者 曾杰 龚金秋 王水莲 《中兽医医药杂志》 2017年第4期8-12,共5页
目的:对小鼠促性腺激素抑制激素(GnIH)基因进行克隆,同时采用生物信息学方法分析其蛋白序列。方法:提取雌性小鼠卵巢总RNA,根据小鼠GnIH基因的开放性阅读框设计引物,采用逆转录PCR(RT-PCR)扩增GnIH基因,并对其产物进行鉴定;利用... 目的:对小鼠促性腺激素抑制激素(GnIH)基因进行克隆,同时采用生物信息学方法分析其蛋白序列。方法:提取雌性小鼠卵巢总RNA,根据小鼠GnIH基因的开放性阅读框设计引物,采用逆转录PCR(RT-PCR)扩增GnIH基因,并对其产物进行鉴定;利用生物信息学软件对GnIH蛋白的结构及功能进行预测。结果:GnIH基因的RT-PCR扩增产物与预期一致,大小为567 bp,测序结果与GenBank已发表序列完全一致;小鼠GnIH蛋白有188个氨基酸,其分子式为C_(926)H_(1483)N_(273)O_(273)S_8,分子量为21 065.11,理论等电点(pI)为9.86,GnIH蛋白的二级结构为alphabeta型,含有6个疏水性较高的区域(临界值2.0)。此外,GnIH蛋白为信号肽蛋白,主要分布于细胞核,具有众多的磷酸化酶位点。结论:小鼠GnIH蛋白为一种疏水性信号肽,在参与细胞信号转导及细胞凋亡调控中发挥重要作用,为其细胞功能研究提供了基础资料。 展开更多
关键词 GNIH 克隆 生物信息分析 蛋白功能
基于全基因组序列比对的枯草芽孢杆菌噬菌体侵染能力分析
9
作者 钟军华 马羊帅 +1 位作者 聂丽 杨慧林 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期651-660,共10页
目前,在美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库中已报道数量众多的枯草芽孢杆菌及其噬菌体的全基因组序列,这为我们利用全基因组比对手段研究枯草芽孢杆菌噬菌体的侵染能力提供了数据基础。本研究从NCBI基因组数据库中下载具有完整... 目前,在美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库中已报道数量众多的枯草芽孢杆菌及其噬菌体的全基因组序列,这为我们利用全基因组比对手段研究枯草芽孢杆菌噬菌体的侵染能力提供了数据基础。本研究从NCBI基因组数据库中下载具有完整序列的枯草芽孢杆菌及噬菌体的基因组及相应的蛋白质序列,利用BLAST软件进行基因组序列比对,得出枯草芽孢杆菌与噬菌体之间的关系。通过利用R语言等软件对噬菌体侵染枯草芽孢杆菌的能力进行分析。然后利用Clustalx和Treeview软件构建进化树,得出枯草芽孢杆菌之间的亲缘性关系,最后对枯草芽孢杆菌蛋白质进行COG注释。结果表明:在65株枯草芽孢杆菌噬菌体中,Bacillus_phage_SPBc2和Bacillus_phage_phIS3501的侵染能力最强,而Bacillus_phage_phiAGATE等3株噬菌体的侵染能力较弱。在37株枯草芽孢杆菌中Bacillus subtilis ATCC 49760的易感性较强,Bacillus subtilisRONN-1等8株对枯草芽孢杆菌噬菌体的抗性较强。本研究利用基因组比对的方法对枯草芽孢杆菌噬菌体侵染宿主的能力以及枯草芽孢杆的蛋白质功能进行了分析,为后续进一步研究枯草芽孢杆菌噬菌体侵染能力及其蛋白质功能提供参考。 展开更多
关键词 枯草芽孢杆菌 噬菌体 侵染能力 全基因组比对 蛋白质功能
组织蛋白酶B在水生动物中的研究进展
10
作者 黄媛 王艺磊 +2 位作者 冯建军 王国栋 林鹏 《生命科学》 CSCD 2016年第11期1384-1390,共7页
组织蛋白酶B(cathepsin B,CB;EC3.4.22.1)是组织蛋白酶超家族中特殊的一员,为同时具有肽链内切酶和羧基二肽酶活性的半胱氨酸蛋白水解酶。虽然组织蛋白酶B广泛存在于各种动植物及细菌病毒中,但对水生动物的研究表明,不同物种... 组织蛋白酶B(cathepsin B,CB;EC3.4.22.1)是组织蛋白酶超家族中特殊的一员,为同时具有肽链内切酶和羧基二肽酶活性的半胱氨酸蛋白水解酶。虽然组织蛋白酶B广泛存在于各种动植物及细菌病毒中,但对水生动物的研究表明,不同物种组织特异性并不完全相同。现综述水生动物中CB基因及蛋白结构特性、表达及功能和CB与其他酶类的相互作用。水生动物中的CB行使多方面的功能,如参与卵巢卵母细胞的发生、胚胎形成及发育、水生软体动物幼虫发育、肠道中蛋白质的降解以及免疫过程等等。 展开更多
关键词 组织蛋白酶B 水生动物 基因结构 蛋白质表达 蛋白质功能
玉米早期发育阶段粒位效应的蛋白质组学分析 预览 被引量:6
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作者 于涛 李耕 +4 位作者 刘鹏 董树亭 张吉旺 赵斌 柏晗 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期54-68,共15页
【目的】从蛋白质组学的角度研究早期发育阶段玉米上、中部籽粒差异表达的蛋白质,分析其功能,探明玉米粒位发育差异的分子机理。【方法】在大田条件下,以粒位效应显著的玉米品种登海661(DH661)为供试材料,90 000株/hm~2密度下种植,在... 【目的】从蛋白质组学的角度研究早期发育阶段玉米上、中部籽粒差异表达的蛋白质,分析其功能,探明玉米粒位发育差异的分子机理。【方法】在大田条件下,以粒位效应显著的玉米品种登海661(DH661)为供试材料,90 000株/hm~2密度下种植,在开花期人工饱和授粉后0、3、6、12 d取果穗上部与中部籽粒。采用TCA-丙酮沉淀法提取籽粒总蛋白,双向电泳分离后获得蛋白质图谱。分别以0、3、6、12 d中部籽粒的凝胶作为参考胶,将上部籽粒凝胶与其进行比对,利用Image master 2D 7.0软件分析籽粒早期发育不同阶段上、中粒位蛋白质表达的差异。通过MALDI-TOF/TOF MS质谱分析及NCBI数据库搜索,对差异表达蛋白质进行鉴定并分析其涉及的生物学功能。【结果】较高密度种植后,果穗籽粒早期发育阶段共检测到超过1000个清晰蛋白质点。通过图像处理软件成对匹配分析,果穗上、中部籽粒早期发育阶段差异蛋白质点为66个,其中52个蛋白质点与NCBI数据库匹配,鉴定率为78.8%。差异蛋白质涉及籽粒呼吸与能量代谢(10个蛋白质点,19%)、胁迫与防御(9个蛋白质点,17%)、蛋白质代谢(9个蛋白质点,17%)、氮代谢(6个蛋白质点,11%)、细胞分化与增殖(5个蛋白质点,10%)、转录与翻译(5个蛋白质点,10%)、次生物质代谢(3个蛋白质点,6%)等功能范畴。对相关的差异蛋白质表达丰度分析,与中部籽粒相比,上部籽粒涉及细胞分化与增殖、呼吸与能量代谢的大部分蛋白质在一个或多个时间段内均显著下调,说明上部籽粒胚乳细胞增殖及呼吸能量代谢能力显著降低。同时,上部籽粒涉及胁迫与防御的多种抗氧化酶系、乙二醛酶1以及涉及蛋白质代谢的4个分子伴侣蛋白质在发育早期也处于低水平表达,说明上部籽粒应对逆境条件防御能力较弱且蛋白质结构不稳定。另外,与中部籽粒相比,上部籽� 展开更多
关键词 玉米 粒位效应 早期发育 差异表达蛋白质 蛋白质功能
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带Myc、His标签的SPAG4L真核表达载体的构建与表达 被引量:1
12
作者 陈颜亮 郑治 +5 位作者 王剑龙 周晓哲 李艳 杨梦 黄利华 邢晓为 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1654-1662,共9页
为了获得带有His、Myc双标签的SPAG4L蛋白,建立能够稳定表达该蛋白的细胞系,本研究利用PCR技术从人睾丸cDNA中扩增SPAG4L开放阅读框,构建到pcDNA3.1(+)myc-his真核表达载体中进行测序和双酶切验证。将pcDNA3.1/myc—His(-)A... 为了获得带有His、Myc双标签的SPAG4L蛋白,建立能够稳定表达该蛋白的细胞系,本研究利用PCR技术从人睾丸cDNA中扩增SPAG4L开放阅读框,构建到pcDNA3.1(+)myc-his真核表达载体中进行测序和双酶切验证。将pcDNA3.1/myc—His(-)A/SPAG4L质粒和空白载体分别转染HeLa细胞,G418筛选后建立稳定转染细胞系。用Western blotting和免疫荧光技术对新建立的稳定转染细胞系进行检测。结果表明,成功扩增了SPAG4L基因,构建到pcDNA3.1/myc—His(.)A真核表达载体后,经酶切和测序验证所插入的SPAG4L序列完全正确;pcDNA3.1/myc.His(-)A/SPAG4L转染HeLa细胞后,经G418筛选后建立了稳定转染细胞系。Western blotting检测后发现,新建立的细胞系能够正确表达SPAG4L及其标签蛋白,进一步的免疫荧光实验发现,SPAG4L能够和内质网标签蛋白PDI共定位。研究结果所提供的稳定转染细胞系将为下一步进行免疫共沉淀和pull.down实验提供了有力的工具。 展开更多
关键词 SPAG4L 标签 转染 真核表达 蛋白功能
蛋白质相互作用网络分析的图聚类方法研究进展 预览 被引量:1
13
作者 李敏 武学鸿 +1 位作者 王建新 潘毅 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2012年第1期 124-136,共13页
随着可获得的大规模蛋白质相互作用数据的迅速增长,从系统水平上对细胞机制的基本组件和结构的理解成为了一种可能。如今所面临的最大挑战是如何通过分析此类复杂的相互作用数据来反映细胞组织、进程以及功能的规律。基于图理论的聚类... 随着可获得的大规模蛋白质相互作用数据的迅速增长,从系统水平上对细胞机制的基本组件和结构的理解成为了一种可能。如今所面临的最大挑战是如何通过分析此类复杂的相互作用数据来反映细胞组织、进程以及功能的规律。基于图理论的聚类方法是分析蛋白质相互作用数据的有效手段。本文将从蛋白质相互作用网络(PPI网络)的图模型、聚类算法、评估方法及应用几个方面描述PPI网络聚类分析的最新研究进展。最后,讨论该方向研究所面临的挑战及进一步的研究方向。 展开更多
关键词 系统生物学 蛋白质相互作用网络 图聚类方法 蛋白质复合物 蛋白质功能
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斜纹夜蛾铁硫亚基蛋白的表达及功能鉴定
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作者 左洪亮 陈永 +2 位作者 高璐 刘海远 钟国华 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期 139-146,共8页
铁硫亚基蛋白(rieske iron-sulfur protein,RISP)是线粒体复合物Ⅲ的关键蛋白亚基之一,在呼吸链电子传递过程中起到重要作用。本研究通过RT-PCR克隆得到斜纹夜蛾Spodoptera litura RISP基因SlitRISP的ORF,构建了pET32a-SlitRISP原核... 铁硫亚基蛋白(rieske iron-sulfur protein,RISP)是线粒体复合物Ⅲ的关键蛋白亚基之一,在呼吸链电子传递过程中起到重要作用。本研究通过RT-PCR克隆得到斜纹夜蛾Spodoptera litura RISP基因SlitRISP的ORF,构建了pET32a-SlitRISP原核表达载体,SDS-PAGE和Western blot检测结果显示,SlitRISP原核表达蛋白以包涵体的形式存在于菌体沉淀中,且RISP抗体可成功用于该蛋白的免疫印迹检测。为了进一步鉴定SlitRISP在斜纹夜蛾离体细胞系SL-1中的功能,通过向细胞内转染siRNA,利用RNAi技术沉默SL-1中的SlitRISP。qRT-PCR结果表明,分别经50nmol/L和100nmol/L siRNA处理48h后,SL-1中SlitRISP的表达均几乎完全被抑制;Western blot结果显示,SL-1中SlitRISP含量显著低于CK。当SL-1SlitRISP被成功沉默后,通过检测SL-1线粒体膜电位、细胞ATP含量和细胞增殖抑制率鉴定RISP在线粒体电子传递过程中的重要作用。流式细胞仪测定结果表明,经50nmol/L和100nmol/LsiRNA处理24h后,SL-1线粒体膜电位相对于CK分别降低23.52%和11.32%,而处理48h后,SL-1线粒体膜电位则分别升高5.58%和27.66%;siRNA处理24h和48h后,SL-1ATP含量相对于CK分别降低82.71%和84.50%,最终导致SL-1细胞增殖抑制率分别为53.64%和67.94%。这些结果表明SlitRISP在SL-1中参与线粒体膜电位的形成和细胞ATP的合成。介于RISP在线粒体电子传递链中的重要作用,其可能成为新型杀虫作用靶标,这可为研制新型呼吸抑制剂提供参考。 展开更多
关键词 斜纹夜蛾 铁硫亚基蛋白 原核表达 蛋白功能 SL-1细胞
茄科雷尔氏菌蛋白质相互作用网络预测及分析 被引量:2
15
作者 姜春雷 赵锐 +2 位作者 吕林峰 乔代蓉 曹毅 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期 139-146,共8页
细菌性青枯病是由茄科雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)引起的一种世界范围的细菌性土传病害.该细菌基因组序列的完全测序,使得从蛋白质组角度来分析其蛋白质相互作用网络成为可能.本文通过朴素贝叶斯模型整合系统发生谱法、基因邻... 细菌性青枯病是由茄科雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)引起的一种世界范围的细菌性土传病害.该细菌基因组序列的完全测序,使得从蛋白质组角度来分析其蛋白质相互作用网络成为可能.本文通过朴素贝叶斯模型整合系统发生谱法、基因邻近法、基因融合法、操纵子法、同源映射法、微阵列法、域相互作用法等7种方法,并根据约豋指数确定的阙值,预测了可信的茄科雷尔氏菌的蛋白质相互作用网络.对网络中的分泌子网络和信号转导进行了分析,提出可能的药物作用靶点(cyaB、pilD、Fli、Rsp1526、VsrA、VsrB、PilH).对于未注释的蛋白依据蛋白相互作用推测了部分蛋白质的功能.本文也提供了完全免费的在线数据库支持,提供了方便的茄科雷尔氏菌的蛋白相互作用的查询及相互作用数据和推测的蛋白质功能数据的查询和下载(http://www.scbmp.org.cn/rsoppi.php). 展开更多
关键词 茄科雷尔氏菌 蛋白质相互作用 蛋白质功能 蛋白质组学 青枯病 朴素贝叶斯模型
蛋白质相互作用的研究方法 预览 被引量:2
16
作者 张成林 李建远 《中外医学研究》 2011年第4期 115-117,共3页
通过研究蛋白质-蛋白质的相互作用,能够更好地注释蛋白质功能,解码生命现象。蛋白质相互作用研究方法的快速发展与不断完善为蛋白质间相互作用的研究奠定了坚实基础。本文对当前研究蛋白质相互作用的主要技术方法,包括酵母双杂交技术,GS... 通过研究蛋白质-蛋白质的相互作用,能够更好地注释蛋白质功能,解码生命现象。蛋白质相互作用研究方法的快速发展与不断完善为蛋白质间相互作用的研究奠定了坚实基础。本文对当前研究蛋白质相互作用的主要技术方法,包括酵母双杂交技术,GSTpull-down技术,免疫共沉淀技术、串联亲和纯化技术等多种研究方法进行综述。 展开更多
关键词 蛋白质 蛋白质相互作用 蛋白质功能
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PrP蛋白与Shadoo蛋白研究进展 预览 被引量:1
17
作者 王东旭 万家余 +2 位作者 李忠义 孟珂音 高宏伟 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第6期 215-217,共3页
朊蛋白(PrP蛋白)在传染性海绵状脑病中具有重要作用,但其生物学功能至今没有明确。Shadoo蛋白是一种与朊蛋白在N端结构上极为相似的新蛋白,SPRN是Shadoo蛋白的结构基因。由于Shadoo蛋白与PrP蛋白具有相同的生物学性质,且它们在脑组织... 朊蛋白(PrP蛋白)在传染性海绵状脑病中具有重要作用,但其生物学功能至今没有明确。Shadoo蛋白是一种与朊蛋白在N端结构上极为相似的新蛋白,SPRN是Shadoo蛋白的结构基因。由于Shadoo蛋白与PrP蛋白具有相同的生物学性质,且它们在脑组织中重叠表达,因此也被认为是研究朊蛋白的关键因素。文章主要探讨PrP蛋白与Shadoo蛋白在基因结构、蛋白功能、朊病毒感染方面的关系。 展开更多
关键词 朊蛋白 Shadoo蛋白 基因结构 蛋白功能
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人类蛋白质结构互作网络——结构域对网络拓扑与蛋白质功能的影响 被引量:5
18
作者 陈丽娜 王倩 +8 位作者 尚玉奎 张良才 孙钊 何伟明 赵研 李琬 王宏 何月涵 李霞 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第5期共10页
高通量的蛋白质互作数据与结构域互作数据的出现,使得在蛋白质组学领域内研究人类蛋白质结构互作网络,进一步揭示蛋白质结构与功能间的潜在关系成为可能.蛋白质上广泛分布的结构域被认为是蛋白质结构、功能以及进化的基本功能单元.然而... 高通量的蛋白质互作数据与结构域互作数据的出现,使得在蛋白质组学领域内研究人类蛋白质结构互作网络,进一步揭示蛋白质结构与功能间的潜在关系成为可能.蛋白质上广泛分布的结构域被认为是蛋白质结构、功能以及进化的基本功能单元.然而,结合蛋白质的结构信息(例如蛋白质结构域数目、长度和覆盖率等)来研究这些表象后的内部机制仍然面临着挑战.将蛋白质分为单结构域蛋白质与多结构域蛋白质,并进一步结合蛋白质互作信息与结构域互作信息构建了人类蛋白质结构互作网络;通过与人类蛋白质互作网络进行比较,研究了人类蛋白质结构互作网络的特殊结构特征;对于单结构域蛋白质与多结构域蛋白质,分别进行了功能富集分析、功能离散度分析以及功能一致性分析等.结果发现,将结构域互作信息综合考虑进来后,人类蛋白质结构互作网络可以提供更多的单纯的蛋白质互作网络无法提供的细节信息,揭示蛋白质互作网络的复杂性. 展开更多
关键词 结构域 蛋白质结构互作网络 蛋白质功能
水稻条纹病毒NS3蛋白与水稻3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)间的互作 预览 被引量:3
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作者 肖冬来 贾东升 +4 位作者 吴建国 杜振国 谢荔岩 吴祖建 谢联辉 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期 493-496,共4页
水稻条纹病毒(rice stripe virus,RSV)NS3蛋白为病毒的沉默抑制子。利用酵母双杂交技术,从水稻cDNA文库中筛选出一个与RSV NS3蛋白互作的基因片段。推测该基因的功能是编码水稻3-磷酸甘油醛脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydr... 水稻条纹病毒(rice stripe virus,RSV)NS3蛋白为病毒的沉默抑制子。利用酵母双杂交技术,从水稻cDNA文库中筛选出一个与RSV NS3蛋白互作的基因片段。推测该基因的功能是编码水稻3-磷酸甘油醛脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)。双分子荧光互补实验进一步验证了NS3与GAPDH存在互作。瞬时表达实验表明,GAPDH与GFP基因融合蛋白在本氏烟表皮细胞细胞质中大量积累。此外,讨论了GAPDH蛋白在RSV侵染水稻过程中可能的功能。 展开更多
关键词 水稻条纹病毒 蛋白功能 互作 酵母双杂交 双分子荧光互补
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鱼类细胞肿大病毒属全基因组结构和蛋白功能研究进展 预览
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作者 贾坤同 孔晓瑜 史成银 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2009年第2期 86-89,共4页
鱼类细胞肿大病毒隶属于虹彩病毒科,是引起重要经济淡水鱼类和海水鱼类死亡的主要病原之一。近年来,由于其对野生和养殖渔业造成的巨大经济损失及其对环境的破坏,受到人们越来越多的关注。目前,细胞肿大病毒属共报道了5株虹彩病毒... 鱼类细胞肿大病毒隶属于虹彩病毒科,是引起重要经济淡水鱼类和海水鱼类死亡的主要病原之一。近年来,由于其对野生和养殖渔业造成的巨大经济损失及其对环境的破坏,受到人们越来越多的关注。目前,细胞肿大病毒属共报道了5株虹彩病毒的全基因组序列,论文就该5株病毒的基因结构特征及其编码的蛋白功能研究进行综述,以期为研究病毒和宿主之间的相互关系提供依据,为虹彩病毒疾病的诊断和防治策略提供参考。 展开更多
关键词 虹彩病毒 基因组结构 蛋白功能
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