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蛋白质组学在胃癌不同标本中的研究进展
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作者 李滕 王晓龙 张成武 《中国肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期295-300,共6页
胃癌是世界上因癌症死亡的主要原因之一,尽早发现肿瘤是改善胃癌预后的关键。因此,寻找胃癌相关肿瘤标志物就成了当前研究领域的热点问题。蛋白质组学的广泛应用得益于其不断革新的研究技术,使大量的胃癌标本得以被筛选,比如细胞、组织... 胃癌是世界上因癌症死亡的主要原因之一,尽早发现肿瘤是改善胃癌预后的关键。因此,寻找胃癌相关肿瘤标志物就成了当前研究领域的热点问题。蛋白质组学的广泛应用得益于其不断革新的研究技术,使大量的胃癌标本得以被筛选,比如细胞、组织、血液和幽门螺旋杆菌感染的标本等,从而鉴别出具有相对特异性及灵敏度的新型潜在肿瘤标志物。我们对既往蛋白质组学在胃癌不同标本中的研究进行了回顾,讨论了这些可能作为胃癌潜在标志物的蛋白质特征及作用,并分析了目前蛋白质组学在胃癌研究方面存在的一些问题及发展前景。 展开更多
关键词 蛋白质组学 胃癌标本 肿瘤标志物 蛋白质组学技术
Proteomics analysis of Huanglian Wendan decoction drug-containing serum on insulin resistance in 3T3-L1 cell
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作者 Peng Peng Yu-Bo Han +2 位作者 Hong-Jun Lou Zi-Jun Liu Li Liu 《海南医科大学学报(英文版)》 2019年第8期6-11,共6页
Objective:To explore possible mechanisms of Huanglian Wendan decoction drug-containing serum to improve insulin resistance.Method: 3T3-L1 fibroblasts were divided into control group, model group and TCM group. 3T3-L1 ... Objective:To explore possible mechanisms of Huanglian Wendan decoction drug-containing serum to improve insulin resistance.Method: 3T3-L1 fibroblasts were divided into control group, model group and TCM group. 3T3-L1 fibroblasts in model group and TCM group were induced to differentiation, and the 3T3-L1 adipocyte model of insulin resistance was constructed. The control group and model group were given normal serum stimulation, while the TCM group is treated with drug-containing serum. Finally, proceed bioinformatics analysis of the acquired differential expression protein by using TMT marking, liquid chromatography-mass (LC-MS) spectrometry, GO analysis and KEGG pathway analysis.Results:4982 proteins are identified in three groups of samples in this experiment, 4238 of them contain quantitative information. 210 up-regulate and 399 down-regulate proteins exist in model group and control group;221 up-regulate and 98 down-regulate ones are identified in TCM group and control group;310 up-regulate and 142 down-regulate proteins come to light with TCM group and control group. The result shows that the differentially expressed proteins were mainly distributed in s GO terms, such as DNA replication, nucleoplasm and protein binding of TCM group and control group. KEGG pathway enrichment analysis shows that, differentially expressed up-regulate proteins were enriched in 10 pathways, for instance DNA replication, cell cycle and mismatch repair, etc. Besides, differentially expressed down-regulate proteins were enriched in 25 pathways, enriched pathways are peroxisome, fatty acid degradation and metabolism process, etc.Conclusion: It is clear that Huanglian Wendan decoction drug-containing serum could improve insulin resistance by multi-targeting, multi-pathway synergy, and overall regulation. 展开更多
关键词 METABOLIC syndrome INSULIN resistance Huanglian Wendan DECOCTION PROTEOMICS
Reproducible large-scale synthesis of surface silanized nanoparticles as an enabling nanoproteomics platform: Enrichment of the human heart phosphoproteome
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作者 David S.Roberts Bifan Chen +3 位作者 Timothy N.Tiambeng Zhijie Wu Ying Ge Song Jin 《纳米研究:英文版》 SCIE EI CAS CSCD 2019年第6期1473-1481,共9页
A reproducible synthetic strategy was developed for facile large-scale (200 mg) synthesis of surface silanized magnetite (Fe3O4) nanoparticles (NPs) for biological applications.After further coupling a phosphate-speci... A reproducible synthetic strategy was developed for facile large-scale (200 mg) synthesis of surface silanized magnetite (Fe3O4) nanoparticles (NPs) for biological applications.After further coupling a phosphate-specific affinity ligand,these functionalized magnetic NPs were used for the highly specific enrichment of phosphoproteins from a complex biological mixture.Moreover,correlating the surface silane density of the silanized magnetite NPs to their resultant enrichment performance established a simple and reliable quality assurance control to ensure reproducible synthesis of these NPs routinely in large scale and optimal phosphoprotein enrichment performance from batch-to-batch.Furthermore,by successful exploitation of a top-down phosphoproteomics strategy that integrates this high throughput nanoproteomics platform with online liquid chromatography (LC) and tandem mass spectrometry (MS/MS),we were able to specifically enrich,identify,and characterize endogenous phosphoproteins from highly complex human cardiac tissue homogenate.This nanoproteomics platform possesses a unique combination of scalability,specificity,reproducibility,and efficiency for the capture and enrichment of low abundance proteins in general,thereby enabling downstream proteomics applications. 展开更多
关键词 NANOPARTICLES NANOPROTEOMICS SURFACE functionalization LARGE-SCALE phosphoprotein ENRICHMENT top-down proteomics mass spectrometry
2型糖尿病应用蛋白质组学技术的研究进展 预览
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作者 赵艳雪 闫朝丽 《心血管外科杂志(电子版)》 2019年第1期184-186,共3页
2型糖尿病是一种在遗传、环境等因素刺激下导致高糖毒性、胰岛素抵抗、糖脂代谢紊乱等多种危害机体慢性代谢性疾病。从蛋白质组学的角度来看,2型糖尿病是一种多种病理生理机制共同作用的疾病,会有多种蛋白质的异常表达,鉴于糖尿病研究... 2型糖尿病是一种在遗传、环境等因素刺激下导致高糖毒性、胰岛素抵抗、糖脂代谢紊乱等多种危害机体慢性代谢性疾病。从蛋白质组学的角度来看,2型糖尿病是一种多种病理生理机制共同作用的疾病,会有多种蛋白质的异常表达,鉴于糖尿病研究的复杂性,越来越多的学者应用此技术对2型糖尿病及相关代谢疾病进行研究。本文主要就蛋白质组学的技术方法以及在2型糖尿病应用此技术的研究进展方面进行阐述。 展开更多
关键词 蛋白质组学 2型糖尿病 差异蛋白
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天芪益智颗粒对Aβ1-42诱导的阿尔茨海默病大鼠学习记忆能力及蛋白质组的影响 预览
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作者 刘美琪 卫东锋 +3 位作者 马涛 任建廷 张占军 刘振权 《中国中医药信息杂志》 CAS CSCD 2019年第6期42-50,共9页
目的观察天芪益智颗粒对阿尔茨海默病(Alzheimer disease,AD)大鼠学习记忆能力和皮层、海马组织蛋白质组的影响,探讨其分子作用机制。方法将实验大鼠随机分为假手术组、模型组、阳性药组和天芪益智颗粒高、中、低剂量组,每组12只。灌胃... 目的观察天芪益智颗粒对阿尔茨海默病(Alzheimer disease,AD)大鼠学习记忆能力和皮层、海马组织蛋白质组的影响,探讨其分子作用机制。方法将实验大鼠随机分为假手术组、模型组、阳性药组和天芪益智颗粒高、中、低剂量组,每组12只。灌胃给药,每日1次,连续40d。给药结束后,采用Morris水迷宫实验评价大鼠学习记忆能力,应用TMT蛋白质组学方法进行质谱分析,确定天芪益智颗粒组与模型组间的差异蛋白质,应用PANTHER及STRING软件对差异蛋白进行生物信息学分析,采用Western blot对苹果酸脱氢酶和Fas相关的死亡结构域蛋白的表达变化进行验证。结果水迷宫实验结果显示,与模型组比较,天芪益智颗粒高、中剂量组定位巡航实验中逃避潜伏期缩短,空间探索实验中穿越目标区域次数显著增加(P<0.05,P<0.01);蛋白质组学结果显示,天芪益智颗粒高剂量组中成功鉴定33个差异蛋白质,这些蛋白及网络的功能涉及能量代谢、神经传递、细胞凋亡、细胞骨架、神经营养等,且Western blot蛋白表达检测结果与蛋白质组学结果一致。结论天芪益智颗粒可明显改善AD大鼠学习记忆能力,其机制与调节能量代谢、神经传递、细胞凋亡、细胞骨架及神经营养蛋白的表达密切相关。 展开更多
关键词 天芪益智颗粒 阿尔茨海默病 学习记忆能力 蛋白质组学 能量代谢 大鼠
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Regional Differences of the Urinary Proteomes in Healthy Chinese Individuals 预览
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作者 Jianqiang Wu Weiwei Qin +4 位作者 Li Pan Xiaorong Wang Biao Zhang Guangliang Shan Youhe Gao 《中国医学科学杂志:英文版》 CAS CSCD 2019年第3期157-167,共11页
Objective Urine is a promising biomarker source for clinical proteomics studies.Regional physiological differences are common in multi-center clinical studies.In this study,we investigate whether significant differenc... Objective Urine is a promising biomarker source for clinical proteomics studies.Regional physiological differences are common in multi-center clinical studies.In this study,we investigate whether significant differences are present in the urinary proteomes of individuals from different regions in China.Methods In this study,morning urine samples were collected from healthy urban residents in three regions of China(Haikou,Xi’an and Xining)and urinary proteins were preserved using a membrane-based method(Urimem).The urine proteomes of 27 normal samples were analyzed using LC-MS/MS and compared among three regions.Functional annotation of the differential proteins among the three areas was analyzed using the DAVID online database,and pathway enrichment of the differential urinary proteins was analyzed using KEGG.Results We identified 1898 proteins from Urimem samples using label-free proteome quantification,of which 56 urine proteins were differentially expressed among the three regions(P<0.05).Hierarchical clustering analysis showed that inter-regional differences caused less significant changes in the urine proteome than intersex differences.After gender stratification,16 differential proteins were identified in male samples and 84 differential proteins were identified in female samples.Among these differential proteins,several proteins have been previously reported as urinary disease biomarkers.Conclusions Urimem will facilitate urinary protein storage for large-scale urine sample collection.Regional differences are a confounding factor influencing the urine proteome and should be considered in future multicenter biomarker studies. 展开更多
关键词 URINE PROTEOMICS BIOBANK biomarkers regional differences
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植物响应盐胁迫蛋白质组学研究进展 预览
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作者 王哲 柴里昂 +1 位作者 樊怀福 杜长霞 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第6期1021-1028,共8页
盐胁迫严重影响作物生长发育,是导致作物产量和品质下降的主要逆境因子之一。蛋白质是植物生理功能的执行者和生命活动的直接体现者,明确盐胁迫下差异表达蛋白质的种类及性质,对于提高植物抗盐性研究具有重要意义。蛋白质组学技术是研... 盐胁迫严重影响作物生长发育,是导致作物产量和品质下降的主要逆境因子之一。蛋白质是植物生理功能的执行者和生命活动的直接体现者,明确盐胁迫下差异表达蛋白质的种类及性质,对于提高植物抗盐性研究具有重要意义。蛋白质组学技术是研究差异表达蛋白质的强有力工具,本文综述了国内外应用蛋白质组学技术在植物盐胁迫响应方面的研究进展,比较了甜土植物与盐生植物响应盐胁迫的差异蛋白质的种类,并对利用蛋白质组学技术在植物盐胁迫响应研究方面进行了展望。 展开更多
关键词 蛋白质组学 盐胁迫 甜土植物 盐生植物
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基于生物质谱的蛋白质组学在甲状腺乳头状癌中的应用进展 预览
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作者 赵婉君 张勇 +2 位作者 付琳茹 杨浩 朱精强 《医学综述》 2019年第15期3014-3018,共5页
随着生物质谱技术的发展和蛋白质组学的成熟,人们已经能够对疾病发生、发展过程的蛋白质组进行定性和定量分析,筛选出可用于疾病诊断、分型、疗效监测、判断预后等作用的生物标志物。甲状腺乳头状癌是最常见的甲状腺癌病理类型,目前其... 随着生物质谱技术的发展和蛋白质组学的成熟,人们已经能够对疾病发生、发展过程的蛋白质组进行定性和定量分析,筛选出可用于疾病诊断、分型、疗效监测、判断预后等作用的生物标志物。甲状腺乳头状癌是最常见的甲状腺癌病理类型,目前其存在发病机制不明、现有金标准诊断手段(细针穿刺)有创且其精准度不高、针对复杂难治型患者(如碘抵抗患者)术后放化疗效果不佳等问题。因而,应用基于生物质谱技术的蛋白质组学筛选甲状腺癌血浆、尿液等样本中的生物标志物,对于该疾病的无创或微创诊断具有推动作用。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 生物质谱 蛋白质组学 生物标志物
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蛋白质组学在中医药抗肝纤维化中的应用
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作者 蔡碧莲 张扬武 +1 位作者 陈姗 罗伟生 《中医学报》 CAS 2019年第6期1170-1173,共4页
近年来,蛋白质组学已逐渐成为中医认识肝病本质的重要手段。以蛋白质组学技术为研究手段,将肝纤维化与中医证候的研究相结合,分析和评价肝纤维化分级,可使抽象的中医理论具体化,同时在寻找药物作用靶点及中药的药理作用机制方面发挥作... 近年来,蛋白质组学已逐渐成为中医认识肝病本质的重要手段。以蛋白质组学技术为研究手段,将肝纤维化与中医证候的研究相结合,分析和评价肝纤维化分级,可使抽象的中医理论具体化,同时在寻找药物作用靶点及中药的药理作用机制方面发挥作用。但中药多成分、多层次、多靶点的特点使得其药效的物质基础不明确,缺乏科学的理论依据和阐述。同时,人体的蛋白质组学特征千变万化,蛋白质组学技术难以掌握,其运用于肝纤维化的方药筛选和中医证候仍处于探索阶段,需在依据证候理论学的前提下,运用功能蛋白质组学的方法来探讨证候,发现并揭示与证候形成相关的所有蛋白质及其特征,最终在整体蛋白质表达水平上阐明证候的本质,来指导临床方药的选择,防治肝病及慢性肝病向肝纤维化、肝硬变的发生、发展。 展开更多
关键词 蛋白质组学 中医辨证 肝纤维化 发病机制 证候
结直肠癌组织中泛素化修饰蛋白的蛋白质组学分析 预览
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作者 杨照微 王晶莹 +3 位作者 李时孟 李晓鸥 谢风 何成彦 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第3期355-362,共8页
蛋白质泛素化修饰在结直肠癌的发生、发展和转移等过程中,发挥着重要作用。本研究提取结直肠癌组织中总蛋白,经胰酶水解得到多肽混合物,利用免疫沉淀技术对其中含-GG标签的肽段富集纯化,最后利用液相色谱-质谱联用技术对富集肽段进行分... 蛋白质泛素化修饰在结直肠癌的发生、发展和转移等过程中,发挥着重要作用。本研究提取结直肠癌组织中总蛋白,经胰酶水解得到多肽混合物,利用免疫沉淀技术对其中含-GG标签的肽段富集纯化,最后利用液相色谱-质谱联用技术对富集肽段进行分析,经数据库检索鉴定蛋白。结果表明,在结直肠癌组织中,鉴定得到归属为328种蛋白的2036个肽段。其中,含-GG标签的修饰肽段数为1497个,归属287种蛋白。在鉴定得到的含有-GG标签的肽段中,除了大部分含有1个-GG标签的肽段外,还包括31个含有2个-GG标签的肽段以及3个含有3个-GG标签的肽段。在鉴定得到的泛素化修饰的蛋白中,发现许多与结直肠癌密切相关的蛋白,包括胸腺素α原(Prothymosin alpha)、转化酸性含卷曲螺旋蛋白3(Transforming acidic coiled-coil-containing protein 3)、中性氨基酸转运蛋白B(0)(Neutral amino acid transporter B(0))等。对所鉴定的泛素化修饰蛋白的生物信息学分析表明,结直肠癌组织中泛素化修饰蛋白涵盖了多种基本的生物学过程和分子功能,在细胞内的各个亚细胞器及胞外基质成分中均有分布。本研究对结直肠癌组织中的泛素修饰蛋白的种类、分布等情况提供了一种特异、有效的研究方法,研究结果为深入研究结直肠癌中泛素化修饰调控分子机制提供了基础数据。 展开更多
关键词 结直肠癌 泛素化修饰 蛋白质组
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关注蛋白质组学在肌肉病的研究
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作者 蒲传强 张羽彤 《中华神经科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期441-445,共5页
尽管肌肉病在临床上具有明显的异质性,导致各种肌肉病变的确切机制尚不完全明了,且缺乏有效的生物学标志物,但在肌肉病的基本发病机制中,均存在着某个或某些蛋白质的改变。蛋白质组学是整体水平上探讨蛋白质的组成、表达及修饰状态的学... 尽管肌肉病在临床上具有明显的异质性,导致各种肌肉病变的确切机制尚不完全明了,且缺乏有效的生物学标志物,但在肌肉病的基本发病机制中,均存在着某个或某些蛋白质的改变。蛋白质组学是整体水平上探讨蛋白质的组成、表达及修饰状态的学科,被广泛应用于生命科学的各个领域。差异蛋白质组学的研究为解释疾病的发病机制、寻找新的诊断标志物和潜在治疗靶点提供了更多科学依据。蛋白质组学技术在肌肉病研究中的应用值得神经科医生给予更多的关注。 展开更多
关键词 蛋白质组学 肌疾病 诊断 治疗 生物学标记
冠状动脉旁路移植术后并发房颤的研究进展 预览
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作者 张泽生 田荣成 +5 位作者 刘抗 胡硕 唐志贤 赖政洪 余俊键 刘子由 《赣南医学院学报》 2019年第3期283-287,共5页
冠状动脉旁路移植术(CABG)后并发房颤(POAF)一直居高不下,严重影响了冠心病患者预后及生活质量。由于年龄因素,心脏功能呈退行性改变,加之患者存在高血压、糖尿病等基础病症,冠心病患者心肌组织长期处于缺血缺氧状态,以及吸烟等,成为POA... 冠状动脉旁路移植术(CABG)后并发房颤(POAF)一直居高不下,严重影响了冠心病患者预后及生活质量。由于年龄因素,心脏功能呈退行性改变,加之患者存在高血压、糖尿病等基础病症,冠心病患者心肌组织长期处于缺血缺氧状态,以及吸烟等,成为POAF发生的易患因素。在CABG过程中,由于体外循环时间、主动脉交叉夹钳时间过长,对血管内皮造成损伤,以及持续造成心肌缺血缺氧,加重了POAF的形成。而术后维持中心静脉压的稳定,对术后心功能恢复,改善预后,减少POAF的发生奠定了基础。血清蛋白组学研究是在蛋白质水平对疾病的相关因素进行研究,冠心病患者通过CABG治疗后,心脏功能得到一定程度改善,但血液成分势必发生改变,通过血清蛋白组学分析研究,将对探究POAF的发生发展产生重要意义,值得进一步研究论证。 展开更多
关键词 冠状动脉旁路移植术 心房颤动 血清 蛋白组学 冠心病
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蛋白质组学在人乳蛋白质研究中的应用 预览
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作者 于文皓 祁艳霞 靳艳 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期471-476,共6页
人乳是新生儿最理想的天然食物,蛋白质是人乳中最主要的营养成分之一。随着蛋白质组学技术的发展,利用蛋白质组学的方法研究人乳蛋白质也取得了一些研究成果。本文综述了近年来蛋白质组学技术在人乳蛋白质研究中的应用,分别从人乳蛋白... 人乳是新生儿最理想的天然食物,蛋白质是人乳中最主要的营养成分之一。随着蛋白质组学技术的发展,利用蛋白质组学的方法研究人乳蛋白质也取得了一些研究成果。本文综述了近年来蛋白质组学技术在人乳蛋白质研究中的应用,分别从人乳蛋白质的组成研究、动态变化、人乳与其他来源乳汁的蛋白质差异比较、人乳磷酸化蛋白和糖基化蛋白研究、人乳内源肽的研究及人乳蛋白与疾病等几个方面进行了阐述。蛋白质组学技术使人乳蛋白质的研究进入了微量营养研究的时代,人乳蛋白质组学的研究成果将为母婴健康提供更好的保障。 展开更多
关键词 人乳 蛋白质组学 蛋白质 综述
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基于超高效液相色谱-八端口转子阀的微升级预分级系统的建立 预览
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作者 燕蒙 赵洋 +2 位作者 张养军 应万涛 钱小红 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期477-483,共7页
复杂生物系统蛋白质组的深度覆盖鉴定得益于近年来快速发展的高效色谱分离和串联质谱分析技术。二维高效液相色谱(2-DHPLC)是实现复杂肽混合物正交分离的有效手段,但其缺点是运行时间长,通常要求肽上样量在毫克级别,且收集时的组分体积... 复杂生物系统蛋白质组的深度覆盖鉴定得益于近年来快速发展的高效色谱分离和串联质谱分析技术。二维高效液相色谱(2-DHPLC)是实现复杂肽混合物正交分离的有效手段,但其缺点是运行时间长,通常要求肽上样量在毫克级别,且收集时的组分体积大,后续合并流程复杂,而有望替代其的StageTip技术,则由于有限的色谱分离梯度,难以达到充分的正交分离。该文探索了超高效液相色谱(UPLC)和八端口转子阀联用,作为高效、便捷肽段预分离和收集系统的可行性。研究结果显示,将UPLC的高pH反相色谱分馏与在线LC-MS/MS相结合,可以实现高pH和低pH条件下基于肽段不同色谱保留行为的正交互补分离,在蛋白质鉴定方面表现出优越的性能。应用该方法对人肝癌细胞系HepG2进行3次技术重复试验,重复试验间具有非常高的定量重现性(决定系数R^2>0.95)。与传统StageTip方法相比,肽段鉴定数提高了23.52%。该分级方法灵活、稳定,能够针对较少的样品开展蛋白质组深度覆盖分析。 展开更多
关键词 二维液相色谱 超高效液相色谱 八端口转子阀 蛋白质组学 分馏
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蛋白质组学在干眼症研究中的应用进展
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作者 韦庆波 高卫萍 +2 位作者 赵凡 丁宁 徐倩 《辽宁中医杂志》 CAS 2019年第2期429-431,共3页
干眼症是指由于各种原因引起的,多因素疾病的总称,威胁着数百万人的眼部健康。蛋白质组学是对一个细胞、组织或器官的基因组表达的所有蛋白质进行分析研究,是生命科学研究的前沿以及功能基因组学的研究重心。加强蛋白组织学的研究在眼... 干眼症是指由于各种原因引起的,多因素疾病的总称,威胁着数百万人的眼部健康。蛋白质组学是对一个细胞、组织或器官的基因组表达的所有蛋白质进行分析研究,是生命科学研究的前沿以及功能基因组学的研究重心。加强蛋白组织学的研究在眼科疾病的诊断和治疗中的应用,具有重要的指导意义,并为评估眼科疾病的发生发展以及预后提供重要依据。 展开更多
关键词 蛋白质组学 干眼症 研究进展
多组学技术揭示葡萄叶片响应灰葡萄孢菌侵染的抗性机制 预览
16
作者 方献平 和雅妮 +3 位作者 奚晓军 查倩 张丽勍 蒋爱丽 《浙江大学学报:农业与生命科学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期306-316,共11页
以葡萄灰霉病高抗品种‘申丰’叶片为试验材料,采用基于液相色谱质谱联用的非标记定量蛋白质组学和非靶向定量代谢组学技术,比较了叶片在灰葡萄孢菌侵染胁迫3d后体内蛋白质和代谢物的差异变化水平。试验结果表明,葡萄叶片中有1 374个蛋... 以葡萄灰霉病高抗品种‘申丰’叶片为试验材料,采用基于液相色谱质谱联用的非标记定量蛋白质组学和非靶向定量代谢组学技术,比较了叶片在灰葡萄孢菌侵染胁迫3d后体内蛋白质和代谢物的差异变化水平。试验结果表明,葡萄叶片中有1 374个蛋白质和33种小分子代谢物在病菌侵染后发生了1.5倍以上的差异表达(P<0.05)。功能注释和代谢通路富集等生物信息学分析发现,灰葡萄孢菌侵染对叶绿体蛋白表达影响最大,且主要集中在植病互作、植物激素与生物碱合成3条信号路径上。基于多组学数据的联合分析进一步表明,水杨酸合成与信号转导通路中的分支酸、水杨酸、异分支酸丙酮酸裂解酶pchB、转录因子TGA和病程相关蛋白PR-1表达水平显著上调。水杨酸介导的抗病信号通路的全面激活是葡萄叶片抵御灰葡萄孢菌侵染的有效手段。本研究发现为后续深入揭示葡萄灰霉病菌互作分子机制及葡萄抗病新品种选育奠定了理论研究基础。 展开更多
关键词 葡萄 灰葡萄孢菌 蛋白质组学 代谢组 水杨酸
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基于iTRAQ技术的卵巢静止奶牛血清差异蛋白分析 预览
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作者 赵畅 张江 +3 位作者 白云龙 孙书函 宋玉锡 夏成 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期972-982,共11页
旨在利用iTRAQ技术探究卵巢静止奶牛血清差异蛋白。本试验在奶牛产后60~90d,根据发情表现、直肠检查和B超检查,按判定标准将试验奶牛分为卵巢静止组(IO)和正常发情对照组(CON),每组50头,采集血清。应用同位素标记绝对定量(iTRAQ)/质谱(... 旨在利用iTRAQ技术探究卵巢静止奶牛血清差异蛋白。本试验在奶牛产后60~90d,根据发情表现、直肠检查和B超检查,按判定标准将试验奶牛分为卵巢静止组(IO)和正常发情对照组(CON),每组50头,采集血清。应用同位素标记绝对定量(iTRAQ)/质谱(MS)联用技术筛选差异蛋白,并应用免疫印迹以及ELISA方法鉴定奶牛卵巢静止血清差异蛋白。结果表明,试验共获得61种血清差异表达蛋白。GO分析表明,生物学过程包括34个注释,分子功能包括15个注释,细胞组成包括13个注释。蛋白质网络互作分析共得到57个节点,68条蛋白互作注释,蛋白质互作富集P<10-16,得到11个信号代谢通路。经过筛选发现,糖酵解/糖异生、氨基酸的生物合成、胰高血糖素信号通路,维生素的消化与吸收可能与卵巢静止的发生存在相关性。与卵巢静止相关差异表达蛋白共有14种:其中GPX3、SCGB1D和PKM2表达下调,ADIPOQ、AHSG、APOA4、FETUB、ALDOB、SPAM1、LDHB、RBP4、IGFBP2、ITIH3及GLYCAM1表达上调。ADIPOQ、IGFBP2和RBP4通过生殖激素生物过程影响卵泡发育,GPX3通过氧化应激而影响卵泡发育。 展开更多
关键词 卵巢静止 蛋白质组学 iTRAQ/LC-MS/MS 差异蛋白
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健康妊娠与子痫前期患者循环微粒体携带蛋白差异分析
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作者 张云聪 杨静 +7 位作者 杨硕 崔婵娟 赵诚 郭晗 赵扬玉 张捷 魏瑗 乔蕊 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期255-261,共7页
目的研究微粒水平及其蛋白质在子痫前期时的变化,初步探索微粒在子痫前期发生和进展中的作用机制。方法2016年12月至2018年6月,在北京大学第三医院连续入选98例子痫前期患者、54名健康妊娠女性和51名健康育龄女性,应用流式细胞术检测其... 目的研究微粒水平及其蛋白质在子痫前期时的变化,初步探索微粒在子痫前期发生和进展中的作用机制。方法2016年12月至2018年6月,在北京大学第三医院连续入选98例子痫前期患者、54名健康妊娠女性和51名健康育龄女性,应用流式细胞术检测其MPs水平,蛋白质谱检测微粒所携带蛋白质表达情况。结果健康妊娠组总MPs水平较健康育龄女性组明显升高[159.87(113.25,218.18)/μl和94.10(53.35,140.23)/μl,P=0.004],但与子痫前期组比无明显差别(P>0.05)。提取各组微粒进行蛋白质谱分析,健康妊娠女性与健康育龄女性之间有30种差异蛋白,与凝血级联反应、补体和其他免疫反应、血管生成等生物学过程联系密切;子痫前期患者与健康妊娠女性之间有14种差异蛋白,与凝血级联反应、补体和炎症反应以及血管生成等生物学过程联系密切。结论循环微粒数量变化可以反映子痫前期的高凝状态。循环微粒可能通过所携蛋白质经多种途径参与子痫前期发病机制,对子痫前期干预研究具有重要潜在价值。 展开更多
关键词 先兆子痫 细胞源性微粒 血栓形成倾向 蛋白质组学
温光诱导下甜菜蛋白质组学研究
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作者 梁乃国 程大友 +2 位作者 崔杰 代翠红 罗成飞 《中国甜菜糖业》 2019年第2期1-6,共6页
春化和光周期诱导甜菜抽薹和开花的分子机制与蛋白质稳定性和蛋白质降解作用相关.利用iTRAQ技术分别分析不同条件下甜菜不同发育时期叶片中蛋白质的表达差异.筛选出甜菜中春化和光周期协同作用的蛋白质16W时期共39个,19W时期共22个,20W... 春化和光周期诱导甜菜抽薹和开花的分子机制与蛋白质稳定性和蛋白质降解作用相关.利用iTRAQ技术分别分析不同条件下甜菜不同发育时期叶片中蛋白质的表达差异.筛选出甜菜中春化和光周期协同作用的蛋白质16W时期共39个,19W时期共22个,20W时期共8个.抽薹相关的蛋白质共22个,电子载体活性相关的蛋白质和分子结构活性相关的蛋白质是甜菜抽薹期特有的,与抽薹直接相关.开花相关的蛋白质共19个,抗氧化活性相关的蛋白质和酶活性调节因子是甜菜开花期特有的,与开花直接相关.进一步明确了春化和光周期对甜菜抽薹和开花的调控机制. 展开更多
关键词 春化 光周期 抽薑 开花 蛋白质组学
Comparative proteomics analysis of myocardium in left ventricular non-compaction cardiomyopathy
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作者 Haiwei Du Shenghua Liu +1 位作者 Chunyan Li Yingjie Wei 《生物化学与生物物理学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第6期653-655,共3页
Left ventricular non-compaction cardiomyopathy (LVNC) is a rare cardiomyopathy. The major clinical manifestations are systemic embolism ventricular arrhythmias, heart failure, and sudden death. It is characterized by ... Left ventricular non-compaction cardiomyopathy (LVNC) is a rare cardiomyopathy. The major clinical manifestations are systemic embolism ventricular arrhythmias, heart failure, and sudden death. It is characterized by left ventricular myocardium w让h two distinct layers including non-compaction and compaction [123]. The clinical diagnosis of LVNC depends on imaging studies. The absence of definitive diagnostic criteria and specific biomarkers causes LVNC misdiagnosis. 展开更多
关键词 Comparative PROTEOMICS ANALYSIS MYOCARDIUM NON-COMPACTION CARDIOMYOPATHY
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