期刊文献+
共找到111篇文章
< 1 2 6 >
每页显示 20 50 100
基于质谱的蛋白质N末端乙酰化程度定量方法的研究
1
作者 王洁 张旭敏 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期135-142,共8页
随着质谱技术及各种定量方法的不断完善和发展,定量蛋白质组学的方法不断地被应用到各类生物学研究中。蛋白质组学定性定量数据的处理主要通过一些多功能的商业化或者开源软件来进行,如常用的数据分析软件Proteome Discoverer和Maxquan... 随着质谱技术及各种定量方法的不断完善和发展,定量蛋白质组学的方法不断地被应用到各类生物学研究中。蛋白质组学定性定量数据的处理主要通过一些多功能的商业化或者开源软件来进行,如常用的数据分析软件Proteome Discoverer和Maxquant。但是在通过化学标记对蛋白质N末端乙酰化程度进行定量这一方面,Proteome Discoverer和Maxquant在一定程度上存在准确性不高和完整度不够的问题。于是本研究针对自己的实验特点,通过Java算法编写了相应的定量程序Acequant来完成N末端乙酰化程度的相对定量。本研究将该程序在已有相关报道的He La cell上进行了验证,Acequant共定量到1 587个蛋白质N末端,而Proteome Discoverer和Maxquant分别只定量到42个和306个N末端。同时,手动验证原始图谱也证实了Acequant定量的准确性更好。于是,本研究将此方法进一步应用到秀丽隐杆线虫N末端乙酰化的研究中,并初步发现了线虫整体的N末端乙酰化状态,为进一步的N末端研究提供了支持。 展开更多
关键词 定量蛋白质组学 质谱 化学标记相对定量 N末端乙酰化 Acequant
巴洛沙星胁迫下大肠杆菌的比较蛋白质组学研究 预览
2
作者 张良 陈小青 +3 位作者 宋佳宇 毛然然 姜倩雯 林向民 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期103-109,共7页
随着全球细菌耐药形势的日益严峻,细菌耐药机制已成为热点内容。利用iTRAQ标记的定量蛋白质组学方法,比较大肠杆菌K12 BW25113菌株在1/4 MIC巴洛沙星浓度胁迫下蛋白表达的差异。结果表明,质谱分析法共鉴定到118个差异蛋白,其中52个蛋白... 随着全球细菌耐药形势的日益严峻,细菌耐药机制已成为热点内容。利用iTRAQ标记的定量蛋白质组学方法,比较大肠杆菌K12 BW25113菌株在1/4 MIC巴洛沙星浓度胁迫下蛋白表达的差异。结果表明,质谱分析法共鉴定到118个差异蛋白,其中52个蛋白表达上升,66个表达下降;经生物信息学分析发现,细菌可能通过降低TCA循环、丙酮酸循环以及碳代谢等能量代谢来调整细菌的耐药状态;并通过提高核酸代谢等相关蛋白表达,减少巴洛沙星的杀菌压力,促进细菌存活。同时,利用qPCR技术验证碳代谢和嘧啶代谢途径的相关基因在mRNA水平的表达变化,表明大部分基因转录水平表达变化与蛋白水平一致。以上结果为深入研究细菌的耐药过程提供了理论依据,也为更好地控制和防治耐药细菌提供了药物作用靶点。 展开更多
关键词 大肠杆菌 巴洛沙星 应激耐药 定量蛋白质组学
在线阅读 免费下载
嗜水气单胞菌hfq2基因对生物被膜形成的影响
3
作者 王贵宾 蔡奇岚 +3 位作者 李泽琦 赵怡扬 林镇平 林向民 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第14期1506-1514,共9页
Hfq蛋白是一种进化上保守的sRNA分子伴侣蛋白,在转录后水平调控RNA翻译,涉及细菌重要生理功能的调节.嗜水气单胞菌ATCC 7966基因组中含有两个hfq基因拷贝(AHA0924与AHA3797),目前对AHA3797(简称hfq2)基因功能的研究比较少.本研究首先利... Hfq蛋白是一种进化上保守的sRNA分子伴侣蛋白,在转录后水平调控RNA翻译,涉及细菌重要生理功能的调节.嗜水气单胞菌ATCC 7966基因组中含有两个hfq基因拷贝(AHA0924与AHA3797),目前对AHA3797(简称hfq2)基因功能的研究比较少.本研究首先利用同源重组技术敲除该基因,发现hfq2缺失后形成生物膜的能力显著降低(P<0.001),进一步通过SWATH(sequential window acquisition of all theoretical spectra)定量蛋白质组学技术比较野生型与Δhfq2在生物膜状态下的蛋白表达差异,共鉴定出1538个蛋白,其中131个蛋白表达上调, 140个蛋白表达下调.生物信息学分析表明,生物被膜状态下Δhfq2导致细菌铁离子转运相关蛋白表达上调,趋化作用相关蛋白则大幅度下调.进一步利用Western Blotting对部分差异蛋白的表达进行了验证.最后通过铁离子螯合剂添加试验证实, Hfq2蛋白可以通过影响铁离子动态平衡过程来影响细菌生物被膜的形成.了解Hfq2蛋白在细菌生物被膜形成过程的调控机理,对病原菌的防治以及新型抑菌策略的研发具有重要的科学意义. 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 hfq2 生物被膜 SWATH 定量蛋白质组学
ISG15过表达抑制THP-1细胞的增殖与吞噬
4
作者 郭琳 宗兆运 +2 位作者 冯杉 张麟 邓海腾 《现代生物医学进展》 CAS 2019年第4期601-607,共7页
目的:干扰素刺激基因15蛋白(Interferon-stimulated Gene 15.ISG15)是由I型干扰素诱导产生的类泛素蛋白,在先天免疫中起重要作用,本文旨在阐明ISG15的表达水平对巨噬细胞功能的影响并进一步探究其作用机制。方法:构建ISG15过表达质粒并... 目的:干扰素刺激基因15蛋白(Interferon-stimulated Gene 15.ISG15)是由I型干扰素诱导产生的类泛素蛋白,在先天免疫中起重要作用,本文旨在阐明ISG15的表达水平对巨噬细胞功能的影响并进一步探究其作用机制。方法:构建ISG15过表达质粒并通过慢病毒感染的方法整合进入THP-1细胞中,通过流式细胞仪分选出单克隆ISG15过表达细胞系,利用Western Blotting的方法验证ISG15在细胞内的过表达效果。在构建成功的细胞系中进行CCK8细胞增殖实验和Latex Beads细胞吞噬实验,最后通过定量蛋白质组学的方法观察细胞内蛋白质水平上变化。结果:Western Blotting的结果验证了 ISG15在THP-1巨噬细胞系中的过表达效果,证明了 ISG15过表达巨噬细胞系的成功构建。CCK8细胞增殖实验的结果表明,ISG15过表达的细胞系与对照组细胞系相比其增殖能力减弱;Latex beads细胞吞噬实验显示ISG15过表达细胞系的吞噬能力发生下降,并在蛋白质组学数据中找到糖酵解相关酶和膜转运蛋白下调的证据。结论:ISG15过表达能够降低与糖酵解相关的蛋白从而导致增殖能力的下降;同时也引起膜转运相关蛋白下调造成吞噬能力降低。 展开更多
关键词 干扰素刺激基因15蛋白 巨噬细胞 吞噬 定量蛋白质组学
迭鞘石斛乙醚提取物对肺癌细胞抑制机制的定量蛋白质组学研究
5
作者 张雪琴 李莹 +5 位作者 刘静 赵庭梅 赵若茜 郑世刚 淳泽 胡亚东 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期765-773,共9页
迭鞘石斛Dendrobium denneanum作为名贵中药材具有悠久的使用历史,研究发现其乙醚提取物相比传统的醇或水提取物对肺癌细胞具有更强的抑制作用,具备更好的开发前景。该研究采用基于SILAC(stable isotope labeling with amino acids ince... 迭鞘石斛Dendrobium denneanum作为名贵中药材具有悠久的使用历史,研究发现其乙醚提取物相比传统的醇或水提取物对肺癌细胞具有更强的抑制作用,具备更好的开发前景。该研究采用基于SILAC(stable isotope labeling with amino acids incell cultures)的定量蛋白质组学方法,从蛋白质组层面对迭鞘石斛乙醚提取物抑制人肺癌细胞A549的作用机制进行了系统研究,共检测到A549细胞的4 855种蛋白。数据分析显示迭鞘石斛乙醚提取物导致A549细胞中237种蛋白的表达出现明显差异,其中193种蛋白含量出现明显的上调,44种蛋白含量出现明显的下调。差异表达蛋白主要与细胞内生物大分子的合成运输及代谢、分子伴侣、DNA修复、氧化还原酶、细胞黏附、细胞周期、细胞凋亡与自噬等功能相关。结果显示,迭鞘石斛乙醚提取物会严重紊乱肺癌细胞内蛋白等物质的代谢过程,诱发内质网应激反应,同时使细胞的自我修复机制出现异常,导致细胞的黏附与增殖功能受损。另一方面,乙醚提取物会引起肺癌细胞内ROS水平的剧烈升高,同时使细胞内的氧化还原系统发生紊乱。在上述多重因素的影响下,肺癌细胞启动细胞凋亡和细胞自噬等多种进程,加速细胞的死亡。该研究结果从蛋白质组层面系统阐释了迭鞘石斛乙醚提取物抑制肺癌细胞的作用机制,为迭鞘石斛乙醚提取物的抑癌作用研究提供了理论基础,有利于从迭鞘石斛乙醚提取物中开发出新型的抗癌药物。 展开更多
关键词 迭鞘石斛 乙醚提取物 肺癌细胞 作用机制 定量蛋白质组学
基于iTRAQ的定量蛋白质组学技术探索淡色库蚊越冬机制
6
作者 张倩 石桂红 +3 位作者 郭秀霞 王海防 张杰 张崇星 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期160-164,168共6页
目的比较淡色库蚊越冬后与滞育准备阶段蛋白表达差异,探索淡色库蚊越冬休眠(滞育)的机制。方法采用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术,对越冬滞育及准备阶段淡色库蚊进行定量蛋白质组学分析。结果淡色库蚊越冬滞育前后共鉴定出244种... 目的比较淡色库蚊越冬后与滞育准备阶段蛋白表达差异,探索淡色库蚊越冬休眠(滞育)的机制。方法采用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术,对越冬滞育及准备阶段淡色库蚊进行定量蛋白质组学分析。结果淡色库蚊越冬滞育前后共鉴定出244种差异表达蛋白,其中上调蛋白126种、下调蛋白118种。生物信息学分析表明,这些差异表达蛋白与能量产生及转化、脂代谢、细胞骨架重塑、糖代谢、蛋白质转运、分子伴侣、应激耐受以及各种代谢酶等有关。结论本研究首次采用现代蛋白质组学工具鉴定淡色库蚊越冬滞育相关蛋白,初步揭示了与淡色库蚊越冬滞育相关的KEGG通路及蛋白,进一步扩展了对蚊媒越冬滞育机制的理解。 展开更多
关键词 淡色库蚊 成蚊越冬 定量蛋白质组学 同位素标记相对和绝对定量
SIRT3过表达通过调控细胞代谢转换抑制肾肿瘤细胞的增殖
7
作者 刘欢 陈宇凌 +2 位作者 徐仁华 许嘉桐 邓海腾 《现代生物医学进展》 CAS 2019年第5期801-806,共6页
目的:研究SIRT3对肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)769-P细胞增殖和抗氧化能力的影响,并进一步探究其作用机制。方法:在769-P细胞的基础上构建SIRT3过表达稳转细胞系;利用CCK-8试剂检测769-P SIRT3过表达细胞的增... 目的:研究SIRT3对肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)769-P细胞增殖和抗氧化能力的影响,并进一步探究其作用机制。方法:在769-P细胞的基础上构建SIRT3过表达稳转细胞系;利用CCK-8试剂检测769-P SIRT3过表达细胞的增殖速度;利用CellROX■Deep Red染料并结合流式细胞分析检测SIRT3过表达对769-P细胞中ROS水平的影响;利用定量蛋白质组学和代谢组学的方法,探究SIRT3对769-P细胞的作用机制。结果:CCK-8实验结果表明,769-P SIRT3过表达细胞的生长速度与对照细胞相比下降了约48%;定量蛋白质组学分析显示,769-P SIRT3过表达细胞中ALDOA、ALDOA、ENO2、PKM、LDHA、LDHB表达量下调约0.4至0.7倍,SDHB和CS上调约1.3倍;代谢组学分析显示,PEP、pyruvic acid、lactate、carnitine水平下降约0.4至0.7倍,isocitric acid和acetyl-CoA水平升高分别约1.3和2.8倍;分析还显示SIRT3过表达上调SOD2、TXN、GPX4和GLRX5的表达量约1.3至2倍,降低ROS水平约40%,增强细胞对过氧化氢的耐受力。结论:SIRT3过表达引起769-P细胞的代谢转换,从而抑制其增殖;且上调769-P细胞中抗氧化酶的表达,降低ROS水平,增强细胞的抗氧化能力。 展开更多
关键词 SIRT3 肾透明细胞癌 定量蛋白质组学 代谢组学
SIRT1 facilitates amyloid beta peptide degradation by upregulating lysosome number in primary astrocytes 预览
8
作者 Min-Zhe Li Liang-Jun Zheng +5 位作者 Jian Shen Xin-Ya Li Qi Zhang Xue Bai Qing-Song Wang Jian-Guo li 《中国神经再生研究:英文版》 SCIE CAS CSCD 2018年第11期2005-2013,共9页
关键词 星形细胞 淀粉 PROTEOMICS 蛋白质检测 调查结果 模特儿 点模型
在线阅读 下载PDF
卵巢高/低级别浆液性癌的定量蛋白质组学比较研究
9
作者 曾亮 石琨 +5 位作者 古聪敏 袁理 何丽娟 高秋 陈凯 谭平萍 《现代生物医学进展》 CAS 2018年第7期1334-1338,1317共6页
目的:探讨卵巢高级别浆液性癌和低级别浆液性癌的差异表达蛋白,为阐明卵巢癌发生机制及寻找诊断和预后标志物的提供线索。方法:收集卵巢癌新鲜组织标本冻存于液氮中,经病理学确诊为高级别浆液性癌和低级别浆液性癌,两种类型各收集1... 目的:探讨卵巢高级别浆液性癌和低级别浆液性癌的差异表达蛋白,为阐明卵巢癌发生机制及寻找诊断和预后标志物的提供线索。方法:收集卵巢癌新鲜组织标本冻存于液氮中,经病理学确诊为高级别浆液性癌和低级别浆液性癌,两种类型各收集15例。应用iTRAQ定量蛋白质组学技术筛选及鉴定高/低级别浆液性癌的差异表达蛋白,并进行生物信息学分析。结果:卵巢高级别和低级别浆液性癌组织的定量蛋白质组学比较研究鉴定出差异表达蛋白314个,其中与低级别浆液性癌组比较,高级别浆液性癌组上调蛋白有97种,下调蛋白有217种。GO分析显示这些差异蛋白在分子功能、生物学功能、细胞成分方面均具有一定分布特点。KEGG分析显示这些差异蛋白涉及复杂的信号通路。结论:高/低级别浆液性癌之间存在差异表达蛋白,这些蛋白涉及复杂的功能和信号通路可能在两型卵巢癌发生机制及肿瘤生物学行为差异中具有重要意义。 展开更多
关键词 卵巢癌 高级别浆液性癌 低级别浆液性癌 定量蛋白质组学
帕金森病患者血浆蛋白质组学的初步分析及鉴定 预览
10
作者 陈曼 何开武 +2 位作者 任晓虎 杨细飞 邢红霞 《新乡医学院学报》 CAS 2018年第5期378-381,共4页
目的分析帕金森病(PD)患者血浆蛋白质组学的变化并筛选PD临床诊断和干预相关的生物学标志物。方法选择2016年7月至2017年3月于新乡医学院第一附属医院神经内科就诊的PD患者33例,按照疾病分期将患者分为早期PD组(n=19)和晚期PD组(n... 目的分析帕金森病(PD)患者血浆蛋白质组学的变化并筛选PD临床诊断和干预相关的生物学标志物。方法选择2016年7月至2017年3月于新乡医学院第一附属医院神经内科就诊的PD患者33例,按照疾病分期将患者分为早期PD组(n=19)和晚期PD组(n=14);另选取同期36例健康体检者作为对照组。分别从3组受试者中随机选取6例受试者的血样进行蛋白质组学分析。利用高效液相色谱仪(HPLC)联合Q-Exactive质谱仪筛选出早期PD组、晚期PD组、对照组样本中的蛋白质表达谱,并统计差异表达的蛋白质分子。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测早期PD组、晚期PD组和对照组受试者血浆中载脂蛋白E(APOE)、过氧化物酶蛋白-2(PRDX-2)、补体成分7(C7)蛋白表达水平。结果早期PD组与对照组之间筛选出97个差异性表达的蛋白质分子,晚期PD组与对照组之间筛选出68个差异性表达的蛋白质分子。差异表达的蛋白质生物信息学分析结果显示,这些蛋白质功能主要与氧化应激反应、炎症反应、补体激活、神经突触再生等生物学过程密切相关。3组受试者血浆中C7蛋白水平比较差异均无统计学意义(P〉0.05)。早期PD组、晚期PD组患者血浆中APOE、PRDX-2蛋白水平均低于对照组(P〈0.05)。结论 PD患者血浆中的蛋白质表达发生改变,APOE和PRDX-2可能是早期诊断PD的生物学标志物。 展开更多
关键词 蛋白质组学技术 Q-Exactive 帕金森病 生物学标志物
在线阅读 下载PDF
哺乳动物睾丸蛋白质组学研究进展
11
作者 孙武 罗静 +4 位作者 王丽 李发弟 李万宏 罗莉宁 乐祥鹏 《农业生物技术学报》 CSCD 北大核心 2018年第10期1797-1804,共8页
睾丸具有生精、分泌雄激素等重要功能,是雄性哺乳动物特有的生殖器官,其正常的结构和生理机能是繁殖活动的基础。蛋白质组学是后基因组时代蛋白质组研究的主要方法之一,可以反映细胞或者组织整体的蛋白质动态变化。因此,应用蛋白质组学... 睾丸具有生精、分泌雄激素等重要功能,是雄性哺乳动物特有的生殖器官,其正常的结构和生理机能是繁殖活动的基础。蛋白质组学是后基因组时代蛋白质组研究的主要方法之一,可以反映细胞或者组织整体的蛋白质动态变化。因此,应用蛋白质组学技术解析睾丸中蛋白质的组成意义重大。本文就蛋白质组学研究技术手段及其在动物睾丸发育、疾病等方面的应用进行综述,旨在为下一步研究控制睾丸发育和大小的基因和调控网络提供参考依据。 展开更多
关键词 蛋白质组学 哺乳动物 睾丸
矿物药青礞石对PTZ点燃癫痫大鼠海马差异蛋白表达的影响
12
作者 包敏捷 刘圣金 +4 位作者 王宇华 刘培 杨文国 房方 吴德康 《中药材》 北大核心 2018年第10期2413-2417,共5页
目的:研究矿物药青礞石对PTZ点燃癫痫大鼠海马差异蛋白的影响。方法:采用标记定量(TMT)蛋白质组学技术分析大鼠海马中蛋白的差异表达,以模型组与正常对照组之间大鼠海马蛋白表比较筛选出差异达蛋白,以同样方法筛选了青礞石组与模型组之... 目的:研究矿物药青礞石对PTZ点燃癫痫大鼠海马差异蛋白的影响。方法:采用标记定量(TMT)蛋白质组学技术分析大鼠海马中蛋白的差异表达,以模型组与正常对照组之间大鼠海马蛋白表比较筛选出差异达蛋白,以同样方法筛选了青礞石组与模型组之间差异表达蛋白。结果:本研究采用了3次生物重复,模型组和正常对照组之间共有29个差异表达蛋白,鉴定出28个差异表达蛋白。结论:通过有效的比较分析,得到青礞石治疗癫痫的差异表达蛋白,其中Mbp等蛋白有可能是其作用靶点。 展开更多
关键词 矿物药 青礞石 癫痫 海马 差异蛋白 定量蛋白质组学
定量蛋白质组分析蚯蚓血红蛋白样蛋白MSMEG_3312介导的分枝杆菌耐红霉素机制
13
作者 张玉娇 胡新玲 +2 位作者 李晓静 邓海腾 米凯霞 《微生物学报》 CSCD 北大核心 2018年第12期2186-2203,共18页
【目的】细菌耐药机制是个复杂的机制,系统生物学是系统性揭示耐药机制的有力研究手段。我们课题组前期研究结果显示,蚯蚓血红蛋白样蛋白msmeg3312基因敲除后能够增加耻垢分枝杆菌对红霉素的耐药性,本文系统研究MSMEG3312参与红霉素耐... 【目的】细菌耐药机制是个复杂的机制,系统生物学是系统性揭示耐药机制的有力研究手段。我们课题组前期研究结果显示,蚯蚓血红蛋白样蛋白msmeg3312基因敲除后能够增加耻垢分枝杆菌对红霉素的耐药性,本文系统研究MSMEG3312参与红霉素耐药性形成的机制。【方法】首先纯化MSMEG3312蛋白,利用光谱及圆二色谱描述MSMEG-3312蛋白。利用定量蛋白质组学的方法比较分析敲除菌株Δmsmeg3312与野生型菌株mc2155蛋白表达的差异,并通过qRT-PCR进行验证。利用红霉素ELASA试剂盒测定Δmsmeg3312与mc2155的胞内药物浓度。【结果】光谱及圆二色谱分析确定MSMEG3312是蚯蚓血红蛋白样蛋白。定量蛋白质组学分析发现,红霉素未处理的条件下,相比于野生型菌株mc2155,敲除菌株Δmsmeg3312有包括3种转运蛋白在内的8种蛋白表达水平上调,14种蛋白表达下调;而红霉素处理后,Δmsmeg3312中有448种蛋白差异表达,其中有11种转运蛋白表达上调,26种蛋白与氨基酸合成通路相关。胞内药物浓度检测显示敲除菌株Δmsmeg3312的胞内红霉素浓度显著低于野生型菌株。【结论】蚯蚓血红蛋白样蛋白MSMEG3312调控改变了细菌对红霉素药物处理的反应网络,其介导的红霉素耐药是一种集合抗生素耐受机制。 展开更多
关键词 定量蛋白质组 蚯蚓血红蛋白样蛋白 MSMEG_3312 分枝杆菌 红霉素 耐药性
通过定量蛋白组学研究OsGLO1对稻瘟病抗性的调控机制 预览
14
作者 于东立 宋晓欧 +5 位作者 鲍亚林 林思远 王建升 王秀娟 卢唯 赵弘巍 《南京农业大学学报》 CSCD 北大核心 2018年第1期71-78,共8页
[目的]水稻葡糖酸氧化酶1(OsGLO1)定位于水稻过氧化物酶体(peroxisome),参与过氧化氢的产生,但其是否参与水稻对稻瘟病抗性的调控还未见报道。本研究的目的是为了考察OsGLO1在水稻对稻瘟病抗性中的作用。[方法]以水稻‘日本晴’和... [目的]水稻葡糖酸氧化酶1(OsGLO1)定位于水稻过氧化物酶体(peroxisome),参与过氧化氢的产生,但其是否参与水稻对稻瘟病抗性的调控还未见报道。本研究的目的是为了考察OsGLO1在水稻对稻瘟病抗性中的作用。[方法]以水稻‘日本晴’和稻瘟病病菌互作体系为研究对象,使用定量蛋白质组学技术,比较和分析了亲和型和非亲和型稻瘟病菌菌株侵染引起的水稻蛋白质表达变化。[结果]研究发现水稻OsGLO1蛋白的表达受到亲和型稻瘟病菌侵染的特异性抑制,但是在非亲和反应中的表达量变化则不明显。水稻原生质体过表达和沉默试验证明,OsGLO1的表达与水稻活性氧积累以及胼胝质沉积量呈正相关,且OsGLO1过表达诱发水杨酸(SA)和茉莉酸(JA)等多种防卫信号通路相关基因的表达。[结论]OsGLO1可以激活水稻的早期防卫反应,并通过启动多种激素信号通路维持水稻对稻瘟病一定水平的抗性。考虑到其也参与植物对非生物胁迫抗性的调控,提示OsGLO1可能是水稻抵抗生物胁迫以及非生物胁迫中的重要因子。 展开更多
关键词 定量蛋白组学 稻瘟病 抗病性 葡糖酸氧化酶 过氧化氢 植物激素
在线阅读 免费下载
相对定量分析异烟肼、链霉素单耐药与多耐药结核分枝杆菌临床分离株的蛋白质组差异
15
作者 朱传智 赵雁林 +3 位作者 黄香玉 逄宇 庄玉辉 何秀云 《微生物学报》 CSCD 北大核心 2018年第7期1182-1190,共9页
【目的】探讨异烟肼(isoniazid,INH)、链霉素(streptomycin,SM)单耐药结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)与INH/SM多耐药MTB蛋白质组差异。【方法】应用i TRAQ结合Nano LC-MS/MS定量蛋白质组学技术,分析临床分离INH、S... 【目的】探讨异烟肼(isoniazid,INH)、链霉素(streptomycin,SM)单耐药结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)与INH/SM多耐药MTB蛋白质组差异。【方法】应用i TRAQ结合Nano LC-MS/MS定量蛋白质组学技术,分析临床分离INH、SM或INH/SM耐药MTB与H37Rv标准株间均表达差异蛋白;并以INH/SM耐药MTB与H37Rv比值为对照,相对定量分析单耐药与多耐药MTB蛋白表达差异倍数;运用DAVID 6.7分析差异蛋白生物功能;STITCH 5.0分析差异蛋白与INH和SM相互作用。【结果】与H37Rv标准株比较,58个蛋白在INH、SM耐药与INH/SM耐药MTB间均有表达差异,共同差异蛋白生物功能主要为氧化还原酶活性和转移酶活性;主要参与丙酸代谢信号通路。共同差异蛋白中,与INH/SM耐药MTB比较,Rv2986c和Rv1908c在INH、SM耐药MTB均表达上调〉1.25倍;Rv3133c和Rv0577则均表达下调&lt;0.7倍;生物信息学预测发现以上4种蛋白可直接或间接与INH、SM进行相互作用。【结论】INH、SM单耐药和INH/SM多耐药MTB蛋白表达谱有较大差异,蛋白Rv2986c、Rv1908c、Rv3133c和Rv0577表达水平及相互作用可能与INH和SM耐药有关。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 异烟肼 链霉素 定量蛋白质组
水牛卵巢黄体形成和退化的蛋白质表达谱构建及生物信息学分析 预览
16
作者 陈富美 姚顺 +6 位作者 陈东荣 徐壮壮 候振 濮黎萍 张鹏飞 赵秀玲 张明 《生物资源》 CAS 2018年第5期391-399,共9页
本研究构建了水牛卵巢黄体形成及退化过程的定量蛋白质表达谱,从中寻找与水牛发情周期相关的重要蛋白质。为研究水牛卵巢周期性变化的分子机制提供蛋白质水平的数据支撑,进而为提高水牛繁殖效率奠定实验基础。以水牛排卵后的红体期(cor... 本研究构建了水牛卵巢黄体形成及退化过程的定量蛋白质表达谱,从中寻找与水牛发情周期相关的重要蛋白质。为研究水牛卵巢周期性变化的分子机制提供蛋白质水平的数据支撑,进而为提高水牛繁殖效率奠定实验基础。以水牛排卵后的红体期(corpus hemorrhagicum,CH)、黄体期(corpus luteum,CL)和白体期(corpus fibrosum,CF)的卵巢作为研究对象,利用串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)标记结合液质联用((liquid chromatography/mass spectrometry,LC-MS/MS)的定量蛋白质组学技术,采用相关软件对得到的差异表达蛋白质进行生物信息学分析。同时对与水牛发情周期相关的重要差异蛋白质:单核巨噬细胞分化抗原(CD14)、通用转录因子Ⅱ-Ⅰ(GTF2I)、羟基类固醇(17β)脱氢酶1(HSD17B1)、U6 sn RNA相关Sm样蛋白质(LSM1)和纤溶酶原激活物抑制物(SERPINE1)进行了qRT-PCR分析验证。结果显示,共鉴定得到2 343种蛋白质,其中差异表达蛋白质有284种(差异倍数≥2.0),初步构建了水牛卵巢黄体形成和退化的定量蛋白质表达谱。对其中的五种重要差异蛋白质(CD14、GTF2I、HSD17B1、LSM1和SERPINE1)进行qRT-PCR验证,结果有四种(CD14、HSD17B1、LSM1和SERPINE1)的qPCR结果与质谱结果相一致,仅GTF2I与质谱结果不一致,可能是由于GTF2I存在转录后调控。本研究首次从蛋白质水平对水牛卵巢排卵后的周期性变化的分子机制进行了探究,同时为其他家畜品种发情周期的研究提供了新的研究思路。 展开更多
关键词 水牛 发情周期 黄体 定量蛋白质组学 生物信息学
在线阅读 下载PDF
蛋白质组学技术及其在药物成瘾研究中的应用 预览
17
作者 朱贝贝 李翔宇 +3 位作者 陈欢 张森 侯宏卫 胡清源 《生物技术通讯》 CAS 2017年第2期207-213,共7页
概述了蛋白质组学技术中分离、鉴定和定量方法及其在致瘾性药物(如酒精、烟碱、吗啡、可卡因和安非他命)研究中的应用。蛋白质组学技术是继后基因组学技术的一大重要突破。随着蛋白质分离、鉴定及定量技术的进步,尤其是覆盖范围广、... 概述了蛋白质组学技术中分离、鉴定和定量方法及其在致瘾性药物(如酒精、烟碱、吗啡、可卡因和安非他命)研究中的应用。蛋白质组学技术是继后基因组学技术的一大重要突破。随着蛋白质分离、鉴定及定量技术的进步,尤其是覆盖范围广、分离效率高的液相色谱技术和高灵敏度质谱技术的发展,使得蛋白质组学越来越广泛地应用于药物成瘾研究,将有助于了解药物依赖过程中蛋白质的变化及其参与的生物过程和相关通路,理解药物成瘾的分子机制。 展开更多
关键词 蛋白质组学 分离鉴定 定量蛋白质组学 药物成瘾
在线阅读 免费下载
基于质谱的定量蛋白质组学技术发展现状 预览 被引量:2
18
作者 牟永莹 顾培明 +3 位作者 马博 闫文秀 王道平 潘映红 《生物技术通报》 CSCD 北大核心 2017年第9期73-84,共12页
蛋白质组定量分析技术是支撑蛋白质组学研究的关键技术之一,随着蛋白质组定量分析技术的发展,基于质谱的定量蛋白质组学已成为蛋白质组学研究的重要分支。蛋白质组学定量技术可分为非靶向定量和靶向定量两类,靶向定量技术有MRM和PRM模式... 蛋白质组定量分析技术是支撑蛋白质组学研究的关键技术之一,随着蛋白质组定量分析技术的发展,基于质谱的定量蛋白质组学已成为蛋白质组学研究的重要分支。蛋白质组学定量技术可分为非靶向定量和靶向定量两类,靶向定量技术有MRM和PRM模式,非靶向定量技术有非标记定量和体内外标记定量模式,目前使用最多的同位素标记试剂是i TRAQ和TMT。蛋白质组定量技术按数据采集模式还可分DDA和DIA两类。通过对国内外相关文献收集和分析,系统介绍了蛋白质组质谱定量技术的主要特点和发展现状,旨在为生命科学研究者更好地应用定量蛋白质组学技术提供帮助。 展开更多
关键词 定量蛋白质组学 靶向定量 稳定同位素标记 非标记定量 翻译后修饰定量
在线阅读 免费下载
基于定量蛋白质组学分析迭鞘石斛对肺癌细胞的抑制作用及机理
19
作者 张华 李莹 +4 位作者 刘静 何涛 蒋伟 淳泽 胡亚东 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期100-104,共5页
以基于SILAC(Stable isotope labeling with amino acids)的定量蛋白质组学为主要研究方法,通过精确定量蛋白质含量并进行差异分析,从蛋白层面系统研究迭鞘石斛(Dendrobium denneanum)乙醇提取物对人肺癌细胞A549的影响.结果发现迭... 以基于SILAC(Stable isotope labeling with amino acids)的定量蛋白质组学为主要研究方法,通过精确定量蛋白质含量并进行差异分析,从蛋白层面系统研究迭鞘石斛(Dendrobium denneanum)乙醇提取物对人肺癌细胞A549的影响.结果发现迭鞘石斛乙醇提取物对A549细胞具有明显的抑制作用,其在降低细胞增殖速率的同时导致细胞发生死亡,24 h和48 h时的抑制率分别为35.05%和59.08%.定量蛋白质组学实验发现迭鞘石斛乙醇提取物引起A549细胞中392个蛋白质的含量出现明显下调.功能分析显示下调蛋白主要包括细胞物质和能量代谢相关蛋白,如RNA代谢与蛋白质合成、糖类代谢、脂类代谢、嘧啶与嘌呤代谢等.同时大量与细胞抵抗内源及外界不利刺激和损伤相关的蛋白,如具有氧化还原、分子伴侣、DNA修复、蛋白降解与修复等功能的蛋白含量也出现明显的下调.本研究通过定量蛋白质组学实验从全细胞蛋白层面系统解释了迭鞘石斛的抑癌作用机理,可促进石斛抗癌机理的进一步研究和石斛源抗癌新药的开发工作. 展开更多
关键词 迭鞘石斛 肺癌细胞 作用机理 SILAC 定量蛋白质组
功能蛋白质组学在神经系统疾病中的应用
20
作者 王婷婷 万慧达 廖鲁剑 《生命的化学》 CAS CSCD 2017年第1期80-85,共6页
随着生命科学的快速发展,定量蛋白质质谱技术应运而生,在基础科学研究中发挥越来越重要的作用。质谱技术检测蛋白质差异表达、蛋白质翻译后修饰以及蛋白质之间的相互作用,在不同的生物系统中解决不同的生物学问题,在临床诊断中也发挥着... 随着生命科学的快速发展,定量蛋白质质谱技术应运而生,在基础科学研究中发挥越来越重要的作用。质谱技术检测蛋白质差异表达、蛋白质翻译后修饰以及蛋白质之间的相互作用,在不同的生物系统中解决不同的生物学问题,在临床诊断中也发挥着重要的作用。随着人类社会的进步,社会及自然环境的改变,神经系统疾病的发病率逐年增加。大脑作为人类认知所特有的器官,在神经系统疾病中作为主要研究对象,具有结构的复杂性及组织功能性的严密性,对其研究更需要高产出,更系统的研究方法。质谱技术的高精确性及高灵敏度很好地满足这一需求,因此本文主要介绍基于"鸟枪法"的串联质谱技术在神经系统疾病的发病机理及临床诊断中的重要应用,并对目前的研究现状做一个展望。 展开更多
关键词 定量质谱 蛋白质翻译后修饰 蛋白质相互作用 神经系统疾病
上一页 1 2 6 下一页 到第
使用帮助 返回顶部 意见反馈