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PHC1基因敲降对小鼠胚胎干细胞多能干性的影响 预览
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作者 文欢 曾建平 《中南医学科学杂志》 CAS 2019年第2期125-129,共5页
探讨多梳家族蛋白PHC1敲降后对小鼠胚胎干细胞(mESCs)多能干性的影响,并探索其与多能干性基因nanog的转录调控机制。对mESCs细胞系进行PHC1蛋白沉默处理并设置阴性对照组(control组)和空白对照组(Empty vector组),采用qRT-PCR、Western ... 探讨多梳家族蛋白PHC1敲降后对小鼠胚胎干细胞(mESCs)多能干性的影响,并探索其与多能干性基因nanog的转录调控机制。对mESCs细胞系进行PHC1蛋白沉默处理并设置阴性对照组(control组)和空白对照组(Empty vector组),采用qRT-PCR、Western blot、免疫荧光染色检测PHC1的表达量;荧光素酶报告基因技术(Luciferase Reporter)检测PHC1与nanog reporter之间的转录活性。结果提示:实验组mESCs呈现分化状态,多能干性基因nanog、oct4、sox2的表达下调,且nanog下调最显著;荧光素酶报告基因结果提示PHC1和nanog可能会形成复合物参与nanog的转录调控( P <0.05)。实验表明,敲降PHC1基因后可能通过影响nanog转录调控,从而参与核心转录调控“铁三角”(nanog、oct4、sox2)之间的相互转录调控机制,导致mESCs出现分化,进而参与mESCs多能干性的维持。 展开更多
关键词 小鼠胚胎干细胞 PHC1基因 转录调控 多能干性
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MBD结构域和SRA结构域识别甲基化DNA的结构机理
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作者 杨娜 许瑞明 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1063-1074,共12页
DNA胞嘧啶5-甲基化修饰是表观遗传重要的修饰之一,其对基因表达的调控依赖下游的识别蛋白识别和传递甲基化信号.本文围绕两种主要的甲基化DNA识别结构域——MBD结构域和SRA结构域,综述了它们识别不同修饰形式DNA的结构基础以及发挥功能... DNA胞嘧啶5-甲基化修饰是表观遗传重要的修饰之一,其对基因表达的调控依赖下游的识别蛋白识别和传递甲基化信号.本文围绕两种主要的甲基化DNA识别结构域——MBD结构域和SRA结构域,综述了它们识别不同修饰形式DNA的结构基础以及发挥功能的分子机理. 展开更多
关键词 DNA修饰识别 5-甲基胞嘧啶 MBD结构域 SRA结构域 转录调控 结构机理
Transcriptional analysis of sex pheromone biosynthesis signal genes in Bombyx mori
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作者 Shi-Heng An Meng-Fang Du +1 位作者 Li-Juan Su Xin-Ming Yin 《中国昆虫科学:英文版》 CAS CSCD 2012年第6期621-632,共12页
六性 pheromone 合成信号基因包括酰辅酶 A ( acyl-CoA ) desaturase ( desat1 ),丰满的酰 reductase (远), pheromone 生合成激活 neuropeptide 受体( PBANR ),丰满的酸运输蛋白质( FATP ), acyl-CoA 绑定蛋白质( ACBP )和操作店... 六性 pheromone 合成信号基因包括酰辅酶 A ( acyl-CoA ) desaturase ( desat1 ),丰满的酰 reductase (远), pheromone 生合成激活 neuropeptide 受体( PBANR ),丰满的酸运输蛋白质( FATP ), acyl-CoA 绑定蛋白质( ACBP )和操作店的隧道蛋白质( Orai1A ),为他们的 transcriptional 规定被学习。在不同发展阶段的这些抄本的表示侧面(从 96 ~ 48 h ) 表明基因以一种年龄依赖者方式被表示。尽管有斩首杀头,这些基因的抄本继续增加,并且与通常发展的女性,相比,斩首杀头显著地禁止了他们的表示。有 methoprene 的进一步的实验,少年荷尔蒙(JH ) 类似物,挑战证明 JH 不是在这些基因的表示的一个关键禁止因素,并且交配被发现显著地禁止这些标记基因的表示。总的来说,结果为理解性 pheromone 合成的机制提供一本参考书。 展开更多
关键词 标记基因 性信息素 生物合成 合成信号 转录 酰基辅酶A 保幼激素类似物 家蚕
淀粉质体遗传研究的现状与展望 预览 被引量:6
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作者 陈建敏 孙德兰 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2008年第2期 258-262,271,共6页
淀粉质体来源于前质体,与叶绿体同源,具有其特有的遗传特性,是核外遗传的重要组成部分。本文综述了淀粉质体遗传研究方面取得的成果和进展。淀粉质体DNA发现于20世纪70年代,其含量随着组织发育的不同阶段有所变化,最后这些DNA作为... 淀粉质体来源于前质体,与叶绿体同源,具有其特有的遗传特性,是核外遗传的重要组成部分。本文综述了淀粉质体遗传研究方面取得的成果和进展。淀粉质体DNA发现于20世纪70年代,其含量随着组织发育的不同阶段有所变化,最后这些DNA作为贮藏的形式积累在质体中。淀粉质体基因组与叶绿体基因组同源性很高,但是不表达与光合作用有关的基因。现有的实验证据表明,淀粉质体基因组的表达调控发生在转录水平,与DNA甲基化有关。淀粉质体的发育受核基因组和质体基因组双重调控。组织发育到一定时期,淀粉质体中出现单核糖体和多聚核糖体;淀粉质体具有蛋白质合成体系。淀粉质体DNA及淀粉质体遗传的研究具有重要的理论和实际意义,对淀粉质体遗传进行深入的研究,将丰富核外遗传知识和理论。 展开更多
关键词 淀粉质体 质体遗传 淀粉质体DNA 质体核糖体 DNA甲基化 转录调控
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hGM—CSF基因及其调控研究进展 预览
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作者 申葆荷 郭冬林 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1994年第6期 497-500,共4页
人粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子基因表达受到转录调控与转录后调控。5'非转录区的一些顺式调控成分,如CATT(A/T)重复序列,富含GC序列,CK-1、CK-2、kB特异序列与可诱导的CsA敏感增强子成分等在转录水平上... 人粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子基因表达受到转录调控与转录后调控。5'非转录区的一些顺式调控成分,如CATT(A/T)重复序列,富含GC序列,CK-1、CK-2、kB特异序列与可诱导的CsA敏感增强子成分等在转录水平上调控hGM-CSF的表达。3'非翻译区有一62bp富含AU序列,这与mRNA的稳定性相关,在翻译水平调控hGM-CSF的表达,细胞因子与一些刺激因子通过不同的机制作用于hGM-CSF基 展开更多
关键词 粒细胞 巨噬细胞 集落刺激因子 基因 调控
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Transcriptional and Post-transcriptional Gene Regulation by Long Non-coding RNA
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作者 Iain M. Dykes Costanza Emanueli 《基因组蛋白质组与生物信息学报:英文版》 CAS CSCD 2017年第3期177-186,共10页
在在最近的年的 genomics 技术的进展比的导致了染色体弥漫地更加被抄录的令人吃惊的发现以前被欣赏。许多最新发现的 transcriptome 看起来代表长非编码的 RNA (lncRNA ) ,一个异构的组大部分 uncharacterised 抄本。理解这些分子的... 在在最近的年的 genomics 技术的进展比的导致了染色体弥漫地更加被抄录的令人吃惊的发现以前被欣赏。许多最新发现的 transcriptome 看起来代表长非编码的 RNA (lncRNA ) ,一个异构的组大部分 uncharacterised 抄本。理解这些分子的生物功能代表一个学生质问,在这评论,我们讨论一些迄今为止取得的进步。lncRNA 生物学的一个主要主题似乎是和 microRNA (miRNA ) 的相互作用的一个网络的存在小径。lncRNA 被显示了充当来源和 miRNA 的一个禁止的管理者。在 transcriptional 水平,一个模型正在出现 lncRNA 由此衔接 DNA 和蛋白质由对染色质有约束力、象为修改蛋白质建筑群的脚手架服务。如此的机制能衔接倡导者到 enhancers 或象提高一样由调整染色质循环,以及在由指导他们到特定的 loci 修改建筑群的 histone 上授与特性的非编码的基因。 展开更多
关键词 转录后 非编码RNA 基因调控 microRNA 基因组学技术 非编码RNA 生物学功能 MIRNA
C2Analyzer: Co-target-Co-function Analyzer
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作者 Md. Aftabuddin Chittabrata Mal +1 位作者 Arindam Deb Sudip Kundu 《基因组蛋白质组与生物信息学报:英文版》 CAS CSCD 2014年第3期133-136,共4页
MicroRNAs(miRNAs) interact with their target mRNAs and regulate biological processes at post-transcriptional level. While one miRNA can target many mRNAs, a single mRNA can also be targeted by a set of miRNAs. The tar... MicroRNAs(miRNAs) interact with their target mRNAs and regulate biological processes at post-transcriptional level. While one miRNA can target many mRNAs, a single mRNA can also be targeted by a set of miRNAs. The targeted mRNAs may be involved in different biological processes that are described by gene ontology(GO) terms. The major challenges involved in analyzing these multitude regulations include identification of the combinatorial regulation of miRNAs as well as determination of the co-functionally-enriched miRNA pairs. The C2Analyzer: Cotarget–Co-function Analyzer, is a Perl-based, versatile and user-friendly web tool with online instructions. Based on the hypergeometric analysis, this novel tool can determine whether given pairs of miRNAs are co-functionally enriched. For a given set of GO term(s), it can also identify the set of miRNAs whose targets are enriched in the given GO term(s). Moreover, C2 Analyzer can also identify the co-targeting miRNA pairs, their targets and GO processes, which they are involved in. The miRNA–miRNA co-functional relationship can also be saved as a.txt file, which can be used to further visualize the co-functional network by using other software like Cytoscape.C2 Analyzer is freely available at www.bioinformatics.org/c2analyzer. 展开更多
关键词 miRNA mRNA 网络工具 转录后水平 生物学过程 基因本体论 TXT文件 生物信息学
Characteristics of the LrhA subfamily of transcriptional regulators from Sinorhizobium meliloti
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作者 Mingsheng Qi Li Luo +2 位作者 Haiping Cheng Jiabi Zhu Guanqiao Yu 《生物化学与生物物理学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第2期166-173,共8页
在我们的以前的工作,我们识别了从 Sinorhizobium meliloti 编码 LysR 类型 transcriptional 管理者的 94 通常认为的基因。所有这些通常认为的 lysR 基因是用原生质标志插入的 mutagenized 决定他们的显型。六个LysR类型管理者,由异... 在我们的以前的工作,我们识别了从 Sinorhizobium meliloti 编码 LysR 类型 transcriptional 管理者的 94 通常认为的基因。所有这些通常认为的 lysR 基因是用原生质标志插入的 mutagenized 决定他们的显型。六个LysR类型管理者,由异种 SMa1979 , SMb20715 , SMc00820 , SMc04163 , SMc03975 ,和 SMc04315 编码了,显示出类似的氨基酸序列(30%)并且与 LrhA 分享了保存DNA有约束力的领域, HexA ,或这些基因异种的 DgdR 显型分析显示管理者控制细菌,察觉到治安法官的信号的生产,和细胞外的蛋白质的分泌物的游泳行为。这些特征这样很类似于 LrhA, HexA,和 DgdR 的那些,我们把这个组叫作 LrhA 亚科。顺序分析证明 LrhA 亚科的很多相应基因在高山是分布式的哈,贝它,和 proteobacteria 的鲸鱼群妈分,和在 actinobacteria 的一些。这些调查结果能提供新线索给 LysR 基因家庭的角色。 展开更多
关键词 LrhA亚科 DNA 候选基因 转录调节器
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