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云南德宏水牛和杂交牛(摩拉水牛×德宏水牛)血清中两种同工酶的多态性研究 预览
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作者 王婷 杨仁丹 +3 位作者 张永云 孙政 杨忠 李卫真 《中国奶牛》 2019年第5期23-26,共4页
本试验采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)对云南德宏水牛和杂交牛(摩拉水牛×德宏水牛)血清中乳酸脱氢酶(LDH)和过氧化物酶(POD)两种同工酶多态性进行研究,并采用GelDocTM.XR凝胶成像系统扫描仪对乳酸脱氢酶进行定量。结果表明两种牛血... 本试验采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)对云南德宏水牛和杂交牛(摩拉水牛×德宏水牛)血清中乳酸脱氢酶(LDH)和过氧化物酶(POD)两种同工酶多态性进行研究,并采用GelDocTM.XR凝胶成像系统扫描仪对乳酸脱氢酶进行定量。结果表明两种牛血清中的两种同工酶均出现多态性,且德宏水牛血清同工酶多态性少于杂交牛。德宏水牛LDH1、LDH2、LDH3、LDH4、LDH5相对百分含量依次为47.25±1.62%、25.41±0.75%、14.07±0.49%、10.55±0.97%、5.98±0.45%;杂交牛依次为49.27±0.85%、26.26±0.55%、12.48±0.40%、8.89±0.52%、6.35±0.27%。对LDH相对百分含量进行方差分析的结果显示,两种牛之间只有LDH3差异显著(P<0.05),其余差异均不显著(P>0.05)。该结果为进一步研究血清同工酶的多态性与生产性能之间的关系提供了理论依据。 展开更多
关键词 德宏水牛 杂交牛 乳酸脱氢酶 过氧化物酶 同工酶多态性
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版纳微型猪近交系B4GALNT2基因真核表达载体构建及亚细胞定位分析 预览
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作者 王淑燕 宋雪 +6 位作者 王配 霍海龙 张霞 张永云 李罗刚 王雪飞 霍金龙 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2019年第2期215-220,共6页
【目的】研究异种器官移植免疫排斥相关基因B4GALNT2的亚细胞定位情况。【方法】以版纳微型猪近交系(BMI)为试验对象,通过RT-PCR方法获得B4GALNT2基因cDNA序列,运用分子克隆技术构建B4GALNT2和报告基因EGFP的重组真核表达载体pEGFP-C1-B... 【目的】研究异种器官移植免疫排斥相关基因B4GALNT2的亚细胞定位情况。【方法】以版纳微型猪近交系(BMI)为试验对象,通过RT-PCR方法获得B4GALNT2基因cDNA序列,运用分子克隆技术构建B4GALNT2和报告基因EGFP的重组真核表达载体pEGFP-C1-B4GALNT2,将其转染猪肾上皮细胞PK15进行瞬时表达,同时用MitoTracker和Hoechst33342荧光染料分别对线粒体和细胞核染色,通过EGFP示踪检测B4GALNT2在PK15细胞中的表达和定位。【结果】成功构建了BMIB4GALNT2基因的绿色荧光蛋白融合表达载体pEGFP-C1-B4GALNT2,转染PK15细胞后主要在细胞质中检测到绿色荧光蛋白的表达,试验结果与PSORT Ⅱ server网站的预测一致。【结论】B4GALNT2蛋白主要定位于细胞质,揭示该蛋白主要在细胞质中发挥其功能作用。 展开更多
关键词 版纳微型猪近交系 β1 4-N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(B4GALNT2) Sda抗原 真核表达 亚细胞定位
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槟榔江水牛OXCT1基因的分子特征及组织表达谱分析 预览
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作者 何情 刘琴 +2 位作者 哈福 张永云 苗永旺 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第6期1576-1584,共9页
本研究对槟榔江水牛3-酮酸辅酶A转移酶1(3-oxoacid CoA-transferase 1,OXCT1)基因的完整CDS区进行了PCR扩增,并对其功能生物信息学和多组织差异表达进行了分析。以普通牛OXCT1基因序列(GenBank登录号:XM006076397)为参考序列,采用Primer... 本研究对槟榔江水牛3-酮酸辅酶A转移酶1(3-oxoacid CoA-transferase 1,OXCT1)基因的完整CDS区进行了PCR扩增,并对其功能生物信息学和多组织差异表达进行了分析。以普通牛OXCT1基因序列(GenBank登录号:XM006076397)为参考序列,采用Primer Premier 5.0软件设计引物序列,以提取的槟榔江水牛基因组DNA为模板,PCR扩增获得槟榔江水牛OXCT1基因mRNA序列,扩增产物经测序后利用ORF Finder软件进行开放阅读框识别,获得水牛OXCT1基因CDS区全序列,并对其进行生物信息学分析。结果显示,槟榔江水牛OXCT1基因CDS序列全长1 563 bp,编码520个氨基酸,蛋白分子式为C2509H4041N687O746S23,分子质量为56.50 ku,理论等电点(pI)为8.69,不稳定系数为27.49,平均疏水性(GRAVY)为-0.097,该蛋白属弱亲水性蛋白。OXCT1蛋白无信号肽和跨膜结构,属于线粒体膜蛋白;包含pcaJscoBfam和AtoD 2个保守结构域,且具有5个功能活性位点。槟榔江水牛与普通牛、藏羚羊等5个物种的OXCT1氨基酸序列同源性≥97%。对槟榔江水牛13个组织进行表达谱分析表明,在泌乳期,OXCT1基因在乳腺中表达量最高,在肾脏、垂体、脂肪、大脑、皮肤和肌肉中不表达;在非泌乳期,OXCT1基因在除脂肪以外的其他12个组织中都有表达。OXCT1基因在槟榔江水牛泌乳期乳腺组织中表达量最高,推测其可能参与了水牛的乳脂合成调控事件。本研究结果可为深入了解乳脂合成代谢及其调控机制提供依据。 展开更多
关键词 槟榔江水牛 OXCT1基因 克隆 生物信息学 组织表达谱
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亚洲象初乳和常乳中五种酶活性的测定及与荷斯坦奶牛常乳的比较
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作者 江俊才 代飞燕 +7 位作者 张永云 杨仁丹 王婷 秦龙欣 胡翔 何勇杰 刘永张 李卫真 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2018年第22期199-201,共3页
为了积累亚洲象乳中酶活性的基础数据,本试验对亚洲象"莫坡"第4天的初乳及30,60,90天的常乳中的碱性磷酸酶(ALP)、淀粉酶(AMS)、γ-谷氨酰胺转移酶(γ-GT)、N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(NAGase)和过氧化物酶(POD)等5种酶活... 为了积累亚洲象乳中酶活性的基础数据,本试验对亚洲象"莫坡"第4天的初乳及30,60,90天的常乳中的碱性磷酸酶(ALP)、淀粉酶(AMS)、γ-谷氨酰胺转移酶(γ-GT)、N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(NAGase)和过氧化物酶(POD)等5种酶活性进行测定,并与荷斯坦牛常乳进行对比。结果表明:亚洲象初乳中ALP、γ-GT、NAGase、POD活性均高于常乳,初乳与常乳中AMS活性相差不大。亚洲象初乳中ALP和γ-GT活性低于荷斯坦牛常乳,而AMS、NAGase以及POD活性高于荷斯坦牛常乳。亚洲象常乳中ALP、γ-GT和LP活性低于荷斯坦牛常乳,而AMS活性高于荷斯坦牛常乳,NAGase活性与荷斯坦牛常乳相差不大。 展开更多
关键词 亚洲象 荷斯坦奶牛 初乳 常乳 酶活性
猪-人异种移植相关基因CMAH的克隆、表达及功能生物信息学分析 预览
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作者 张霞 秦彩艳 +6 位作者 霍海龙 王淑燕 王配 潘伟荣 张永云 陈园园 霍金龙 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2018年第4期507-513,共7页
【目的】研究版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)CMAH基因特性,探索该基因在猪-人异种器官移植免疫排斥中的作用。【方法】采用实时荧光定量PCR技术检测BMI 27个重要组织的CMAH mRNA表达水平,采用Western blot检测BMI在... 【目的】研究版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)CMAH基因特性,探索该基因在猪-人异种器官移植免疫排斥中的作用。【方法】采用实时荧光定量PCR技术检测BMI 27个重要组织的CMAH mRNA表达水平,采用Western blot检测BMI在9个组织中的CMAH蛋白表达特征,并对CMAH编码的氨基酸进行生物信息学预测,分析CMAH蛋白质的功能。【结果】扩增得到BMI CMAH编码区序列长1 734 bp,编码577个氨基酸,序列已提交GenBank,基因登录号KM098147,对应的氨基酸登录号AIS36193。多组织相对荧光定量表达分析表明CMAH基因在颌下腺、脾及舌下腺中呈相对高表达水平,在其他组织中呈相对中、低表达水平。Western Blot分析表明CMAH蛋白在除脊髓和大脑外的其他组织都有表达。功能生物信息学分析表明CMAH蛋白质包含Rieske和UlaG保守结构域,二级结构以α螺旋为主,N末端亲水,C末端疏水,有6类功能活性位点。【结论】明确了CMAH基因的结构以及在多种组织中差异化表达情况,为深入研究其在异种器官移植方面的功能积累了基础资料。 展开更多
关键词 胞苷磷酸-N-乙酰神经氨酸羟化酶基因 版纳微型猪近交系 免疫排斥 组织表达 生物信息学
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河流型与沼泽型水牛FSHR基因密码子偏好性分析 被引量:1
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作者 周芳廷 张永云 +4 位作者 钱林东 李卫真 袁峰 滕晓红 苗永旺 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2018年第3期28-34,共7页
为了确定河流型与沼泽型水牛促卵泡素受体(FSHR)基因密码子的使用模式,试验采用PCR产物直接测序法对9头河流型水牛、15头沼泽型水牛、6头大额牛和6头中甸牦牛的FSHR基因编码区序列进行了群体变异检测和单倍型划分,并结合已发表的普通牛... 为了确定河流型与沼泽型水牛促卵泡素受体(FSHR)基因密码子的使用模式,试验采用PCR产物直接测序法对9头河流型水牛、15头沼泽型水牛、6头大额牛和6头中甸牦牛的FSHR基因编码区序列进行了群体变异检测和单倍型划分,并结合已发表的普通牛、野牛、山羊、绵羊、人和黑猩猩的同源序列,对河流型与沼泽型水牛FSHR基因密码子使用的偏好性及与其他物种的差异进行了探讨。结果表明:两类水牛FSHR基因的密码子使用特征较为相似,河流型与沼泽型水牛分别有28个和27个偏好使用的密码子,对于编码Pro的4个密码子CCC、CCA、CCU和CCG而言,河流型水牛偏好使用CCC和CCA,而沼泽型水牛偏好使用CCC。水牛与其他物种共同偏好使用的密码子有20种,均偏好使用以G/C结尾的密码子。基于密码子的同义密码子相对使用度(RSCU)构建的聚类树显示河流型水牛与沼泽型水牛先聚为一类,再与大额牛、牦牛聚为一类,普通牛与山羊、绵羊和野牛聚为一类,人和黑猩猩聚为一类,揭示聚为一类的物种间在密码子使用上的偏好性较相似。 展开更多
关键词 河流型水牛 沼泽型水牛 促卵泡素受体(FSHR)基因 密码子偏好性 RSCU 聚类分析
槟榔江水牛FSHR基因分离鉴定及其功能初步分析 预览
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作者 周芳廷 杨云 +2 位作者 刘丽仙 张永云 苗永旺 《云南农业大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2018年第6期1060-1067,共8页
【目的】揭示槟榔江水牛FSHR基因的结构与功能。【方法】采用RT-PCR法克隆了槟榔江水牛FSHR基因的编码区全序列,并利用生物信息学方法对其基因编码产物的理化特性、结构及功能进行了初步分析。【结果】槟榔江水牛FSHR基因编码区全长为20... 【目的】揭示槟榔江水牛FSHR基因的结构与功能。【方法】采用RT-PCR法克隆了槟榔江水牛FSHR基因的编码区全序列,并利用生物信息学方法对其基因编码产物的理化特性、结构及功能进行了初步分析。【结果】槟榔江水牛FSHR基因编码区全长为2088bp,编码695个氨基酸。氨基酸序列比对显示:槟榔江水牛FSHR与其他哺乳动物的同源性在89.4%以上。槟榔江水牛FSHR蛋白N-端含信号肽和7个跨膜结构,属细胞膜疏水蛋白。该蛋白含有7tmA_FSH-R、LRRNT、LRR重复单元和GnHR_trans等4个保守结构域。槟榔江水牛FSHR二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲所构成,分别占41.73%和38.71%。FSHR最有可能在细胞的转运和结合过程中发挥功能作用(概率0.827)。【结论】槟榔江水牛FSHR属于G蛋白偶联受体家族,在细胞质中合成后转运到达细胞膜,推测通过与FSH激素结合后激活G蛋白偶联作用,进而促进其精子和卵泡的发育与成熟。 展开更多
关键词 槟榔江水牛 FSHR 生物信息学分析 结构与功能
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大额牛和牦牛胃型LYZ c基因多态性及其对消化功能的适应性分析 预览
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作者 范新阳 张自芳 +4 位作者 邱立华 钱林东 刘丽仙 张永云 苗永旺 《云南农业大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2018年第5期858-866,共9页
【目的】为了阐明大额牛和牦牛胃型LYZ c基因的多态性及其对消化功能的适应。【方法】采用PCR产物直接测序技术,对35头大额牛和33头牦牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合已发表的牛科物种同源序列进行了其对消化... 【目的】为了阐明大额牛和牦牛胃型LYZ c基因的多态性及其对消化功能的适应。【方法】采用PCR产物直接测序技术,对35头大额牛和33头牦牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合已发表的牛科物种同源序列进行了其对消化功能的适应性分析。【结果】在大额牛群体内共发现6个SNP位点,分别为c.196G>A、c.267T>C、c.270C>T、c.396C>T、c.423C>T和c.438C>G。在牦牛群体内共发现10个SNP位点,其中6个与大额牛共享,非共享的SNP位点分别为c.336G>C、c.348T>G、c.351T>C和c.375A>C。SNP196和SNP348为异义替换,引起p.G66S和p.H116Q氨基酸替换,但它们对大额牛和牦牛LYZ c的功能没有影响。在大额牛LYZ c基因中,共定义6种单倍型,确定了2种LYZ c蛋白变异体(Gayal 1和Gayal 2);而在牦牛LYZ c基因中,共定义12种单倍型,确定了3种LYZ c变异体(Yak 1~Yak 3);变异体Gayal 1与Yak 3、Gayal 2与Yak 1相同,而变异体Yak 2为牦牛独有。大额牛、牦牛和普通牛胃型LYZ c变异体之间在氨基酸组成、理化特性与结构上基本一致,但大额牛和牦牛变异体LYZ c等电点比普通牛S3型LYZ c更低。【结论】大额牛和牦牛胃型LYZ c蛋白可能更适合胃中的酸性环境,具有分解胃中微生物的功能。 展开更多
关键词 大额牛和牦牛 胃型LYZ C基因 消化酶 序列分析 适应性分析
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槟榔江水牛胃型LYZ C基因分离鉴定及功能生物信息学分析 预览
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作者 黄静 保志鹏 +4 位作者 范新阳 张永云 杜平 康定富 苗永旺 《云南农业大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2018年第4期640-646,共7页
【目的】溶菌酶是一种由动物产生的抗微生物酶,构成动物体先天免疫系统的一部分,在反刍动物的皱胃中还具有消化功能。迄今,普通牛溶菌酶C基因家族的分子遗传特征已被深入解析,但有关水牛溶菌酶C的研究报道较少。【方法】采用PCR产物直... 【目的】溶菌酶是一种由动物产生的抗微生物酶,构成动物体先天免疫系统的一部分,在反刍动物的皱胃中还具有消化功能。迄今,普通牛溶菌酶C基因家族的分子遗传特征已被深入解析,但有关水牛溶菌酶C的研究报道较少。【方法】采用PCR产物直接测序技术,对槟榔江水牛胃型溶菌酶C基因编码区进行了分段扩增测序、序列组装和开放阅读框的确定,并结合已发表的其他牛科物种同源序列进行了生物信息学分析。【结果】序列分析表明:水牛胃型溶菌酶C基因编码区长444 bp,编码1个由147个氨基酸残基组成的多肽,包含1个N端信号肽和1段由129个氨基酸组成的成熟肽。水牛胃型溶菌酶C成熟肽分子量为14.41 ku,等电点为6.32,含有1个alpha-lactalbumin/lysozyme C保守结构域(19~145AA),不含有跨膜结构域,为亲水蛋白,在胞外发挥生物功能;在三维结构上与普通牛的溶菌酶模板(2z2f.1.A)有99.22%的一致性;在基于氨基酸序列构建的系统树上,水牛与普通牛、瘤牛、野牦牛和野牛聚在一起,且有较高的支持率(88%)。【结论】槟榔江水牛与其他牛科物种的胃型溶菌酶具有相似的功能。 展开更多
关键词 槟榔江水牛 溶菌酶C基因 皱胃 生物信息学分析 基因功能
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槟榔江水牛ACBP基因克隆及分子特征、组织表达谱分析 预览
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作者 盛丹 刘琴 +3 位作者 滕晓红 张永云 吉丽 苗永旺 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2018年第6期72-79,共8页
ACBP基因的编码产物是细胞内重要的长链酰基辅酶A酯转运蛋白,近年在普通奶牛中发现该基因与泌乳性状关系密切,但是在水牛中罕有报道。为了在水牛中探究ACBP基因的序列及基因表达特征,以揭示其功能。采用RT-PCR测序法对槟榔江水牛ACBP基... ACBP基因的编码产物是细胞内重要的长链酰基辅酶A酯转运蛋白,近年在普通奶牛中发现该基因与泌乳性状关系密切,但是在水牛中罕有报道。为了在水牛中探究ACBP基因的序列及基因表达特征,以揭示其功能。采用RT-PCR测序法对槟榔江水牛ACBP基因的编码区序列进行了克隆,进一步对其进行了功能生物信息学和表达谱分析。结果表明,槟榔江水牛ACBP基因完整编码区序列长264bp,其编码蛋白是具有87个氨基酸残基的多肽,拥有一个ACBP超家族的功能结构域,包含4个磷酸化位点;该蛋白无信号肽和跨膜结构,是位于胞内的亲水蛋白。氨基酸序列同源性分析显示,槟榔江水牛与牛亚科物种聚在一起,揭示它们ACBP基因功能的相似性。在检测的13个水牛组织中,ACBP基因在非泌乳期高表达于瘤胃、心脏、脾脏组织中,在泌乳期高表达于瘤胃、大脑和心脏中。此外,该基因在泌乳期乳腺、小肠、肝脏中表达,而在非泌乳期这些组织中不表达。水牛与其他物种的ACBP具有相近的氨基酸组成和结构特征,可能参与长链酰基辅酶A酯的转运,在乳脂合成中发挥重要作用。 展开更多
关键词 槟榔江水牛 ACBP基因 生物信息学分析 理化特征 基因表达谱
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抗脂肪细胞膜蛋白抗体对试验性肥胖大鼠5种激素水平的影响 预览
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作者 刘超英 胡忠梅 +7 位作者 李卫真 张永云 赵素梅 代飞燕 彭洁 俞大阔 和绍禹 周明 《动物医学进展》 北大核心 2017年第1期61-64,共4页
为了验证抗脂肪细胞膜蛋白抗体减少动物脂肪沉积的作用效果,并对该抗体用于人类肥胖的治疗提供理论依据和试验资料,本试验分别对4组试验性肥胖大鼠注射0、0.1、0.5、1.0mg/mL剂量的抗脂肪细胞膜蛋白抗体,并检测4周内大鼠血清中5... 为了验证抗脂肪细胞膜蛋白抗体减少动物脂肪沉积的作用效果,并对该抗体用于人类肥胖的治疗提供理论依据和试验资料,本试验分别对4组试验性肥胖大鼠注射0、0.1、0.5、1.0mg/mL剂量的抗脂肪细胞膜蛋白抗体,并检测4周内大鼠血清中5种激素含量及变化。结果显示,试验组血清中胰岛紊(INS)含量低于对照组,Ⅰ组与Ⅳ组4周内均差异显著(P〈0.05);试验组与对照组、胰岛素样生长因子1(IGF-1)含量无显著差异(P〉0.05);注射抗体后,试验组生长激素(GH)含量显著增高,且Ⅰ、Ⅲ组4周内均差异显著(P〈0.05);第1周内,试验组三碘甲状腺原氨酸(T3)含量与对照组无显著差异(P〉0.05),后3周内Ⅰ组和Ⅳ组差异显著(P〈0.05);第1、3、4周内,Ⅰ组和Ⅳ组四碘甲状腺原氨酸(T4)含量差异显著(P〈0.05),第2周内无显著差异,Ⅱ组和Ⅲ组差异均不显著(P〉0.05)。此外,不同组间的差异显著性随注射剂量不同而不同。 展开更多
关键词 抗脂肪细胞膜蛋白抗体 试验性肥胖大鼠 激素
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版纳微型猪近交系SLA-DOA基因克隆、mRNA表达及蛋白质功能生物信息学分析 预览
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作者 王配 王淑燕 +5 位作者 霍金龙 李罗刚 张永云 李卫真 朱宏涛 姚茂东 《中国免疫学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第6期873-878,共6页
目的:克隆版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)白细胞抗原DO座位alpha亚基(SLA-DOA)的编码序列,并对其19个重要组织mRNA表达作半定量分析。方法:RT-PCR方法获得SLA-DOA的全长cDNA序列;半定量RTPCR方法分析其在BMI... 目的:克隆版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)白细胞抗原DO座位alpha亚基(SLA-DOA)的编码序列,并对其19个重要组织mRNA表达作半定量分析。方法:RT-PCR方法获得SLA-DOA的全长cDNA序列;半定量RTPCR方法分析其在BMI重要组织的mRNA表达谱,并运用生物信息学对其核酸及蛋白序列进行分析,构建系统进化树。结果:BMI SLA-DOA cDNA长度为1 079 bp,编码250个氨基酸,蛋白质分子量为27.81 k D,等电点为6.48;位于猪7号染色体,由4个外显子和3个内含子构成;其mRNA高表达于淋巴结和胃,低表达于心脏、皮肤和十二指肠,在其他14种组织中不表达;SLA-DOA蛋白存在1个信号肽,1个跨膜螺旋,3个保守域,4个O连接的糖基化位点,18个磷酸化位点,位于细胞质的概率是94.1%;系统进化分析表明,在所选择的6个物种中,BMI(猪)与牛的亲缘关系最近。结论:本研究成功克隆了版纳微型猪近交系SLA-DOA基因并进行了生物信息学功能分析和多种组织表达分析,为版纳微型猪近交系的异种器官移植研究奠定基础。 展开更多
关键词 猪白细胞抗原DO座位alpha亚基 版纳微型猪近交系 组织表达 生物信息学
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版纳微型猪近交系TSARG7基因克隆及功能生物信息学分析 预览
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作者 王淑燕 张霞 +4 位作者 霍金龙 王配 张永云 李卫真 姚茂东 《中国畜牧兽医》 北大核心 2017年第6期1637-1644,共8页
为获得版纳微型猪近交系(Banna Mini-pig inbred line,BMI)TSATG7基因序列并分析组织表达情况,本研究以GenBank中猪及近缘物种的TSARG7基因mRNA序列为参考序列,设计特异引物扩增BMI TSARG7基因,半定量分析10个重要组织的表达谱,并对... 为获得版纳微型猪近交系(Banna Mini-pig inbred line,BMI)TSATG7基因序列并分析组织表达情况,本研究以GenBank中猪及近缘物种的TSARG7基因mRNA序列为参考序列,设计特异引物扩增BMI TSARG7基因,半定量分析10个重要组织的表达谱,并对蛋白质序列进行功能生物信息学分析。结果显示,获得了BMI TSARG7基因1 371bp的编码区序列(GenBank登录号:KU950831,对应的氨基酸登录号:AMY60405),编码456个氨基酸,蛋白质分子质量为52.05ku,等电点(pI)为9.28。多组织表达分析表明,TSARG7基因在睾丸中高表达,在其他组织中呈中、低表达。功能生物信息学分析表明,TSARG7蛋白质存在1个保守结构域,有3个跨膜螺旋结构,无信号肽序列;N末端疏水,C末端亲水;有5类功能活性位点,位于细胞质的概率是94.1%。本试验结果为进一步研究TSARG7基因在猪精子发生和性成熟方面的作用及功能奠定基础。 展开更多
关键词 版纳微型猪近交系 酰基转移酶 组织表达 生物信息学
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CRISPR-Cas9系统及其在动物生产和疾病基因治疗中的应用 预览 被引量:2
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作者 俞大阔 李卫真 +6 位作者 刘学洪 王绍卿 彭洁 刘超英 赵敏 田建云 张永云 《家畜生态学报》 北大核心 2017年第1期79-84,共6页
CRISPR-Cas9系统是生产转基因动物的有力的基因组编辑工具,具有制作相对简单、成本相对较低的优点,可快速用于基因敲除、基因定点突变和基因修复等,在动物基因组定点改造、编辑、疾病控制和治疗中具有广阔的应用前景。文章从CRISPR-Cas... CRISPR-Cas9系统是生产转基因动物的有力的基因组编辑工具,具有制作相对简单、成本相对较低的优点,可快速用于基因敲除、基因定点突变和基因修复等,在动物基因组定点改造、编辑、疾病控制和治疗中具有广阔的应用前景。文章从CRISPR-Cas9系统的技术原理、研究进展和应用等方面进行描述,旨在阐明CRISPR-Cas9系统的原理及在动物基因组编辑方面的优势和局限,为动物生产、动物基因组编辑、遗传疾病的治疗等研究提供支撑。 展开更多
关键词 CRISPR-Cas9系统 基因组编辑 动物生产 疾病治疗 局限性
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大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡mtDNA D-loop遗传多样性分析 预览
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作者 欧阳依娜 阮谦 +4 位作者 钱林东 孙利民 张永云 滕晓红 苗永旺 《云南农业大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2017年第1期70-77,共8页
大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡是近年在云南发现的地方鸡遗传资源,具有优良的种质特性,为了阐明其群体遗传背景,采用mtDNA D-loop区序列为遗传标记,对采自3个地方鸡的共257个样品进行了检测分析。结果表明:大围山微型鸡、云龙... 大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡是近年在云南发现的地方鸡遗传资源,具有优良的种质特性,为了阐明其群体遗传背景,采用mtDNA D-loop区序列为遗传标记,对采自3个地方鸡的共257个样品进行了检测分析。结果表明:大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡的单倍型多样度分别为0.083±0.018、0.851±0.029和0.784±0.039;核苷酸多样度分别为0.01467±0.00045、0.01342±0.00080、0.01166±0.00155;群体内遗传距离分别为0.014±0.003、0.014±0.003、0.012±0.003。中介网络分析显示:本研究检测的257个样品分布在A、B、C、D、E、F和G等7个世系中,其中大围山微型鸡包含A、B、C、D、E、F和G等7个世系,B、D世系为其主要世系;云龙矮脚鸡包含A、B、C、E、F和G等6个世系,E世系为其主要世系;拉伯高脚鸡包含A、B、E和G等4个世系,G世系为其主要世系。AMOVA分析表明:3个群体间遗传分化指数(Fst)分别为0.12084、0.23946、0.26368(P〈0.01),群体内遗传变异占80.61%,群体间变异为19.39%(P〈0.01)。本研究结果揭示3个地方鸡群体遗传多样性较丰富,都含有多个母系血统,支持家鸡多个母系起源的观点,但它们之间存在较大的遗传分化。 展开更多
关键词 大围山微型鸡 云龙矮脚鸡 拉伯高脚鸡 MTDNA D-LOOP 遗传多样性 遗传分化
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水牛胃型LYZ c基因多态性及功能生物信息学分析 预览
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作者 范新阳 张永云 +4 位作者 邱立华 陈涛 周芳廷 哈福 苗永旺 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期113-120,共8页
胃型LYZ c的主要功能是裂解反刍动物胃中的微生物,释放营养物质,为机体提供养分。为了揭示水牛胃型LYZ c基因的遗传特征,采用PCR产物直接测序技术,对66头河流型和158头沼泽型水牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合... 胃型LYZ c的主要功能是裂解反刍动物胃中的微生物,释放营养物质,为机体提供养分。为了揭示水牛胃型LYZ c基因的遗传特征,采用PCR产物直接测序技术,对66头河流型和158头沼泽型水牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合已发表的牛科物种同源序列进行了比较基因组学和生物信息学分析。在水牛群体内共发现9个SNP位点,分别为c.87G〉T、c.196G〉A、c.228G〉A、c.336G〉C、c.351T〉C、c.396C〉T、c.423C〉T、c.424G〉A和c.438C〉G,其中SNP87、SNP196、SNP336和SNP351仅存在于河流型水牛中,其他5个SNP为河流型和沼泽型水牛共享;SNP196和SNP424为异义替换,引起p.G66S和p.V142I氨基酸替换,但它们对水牛LYZ c的功能没有影响。在水牛胃型LYZ c基因中,共定义7种单倍型,确定了3种LYZ c变异体,其中变异体Buffalo1、Buffalo 2为两类水牛共享,Buffalo 3为河流型水牛独有。水牛这3种变异体之间在氨基酸组成、理化特性与结构上基本一致。水牛与普通牛胃型LYZ c蛋白的上述特征也极相似,但水牛胃型LYZ c的等电点比普通牛更低。结果揭示水牛胃型LYZ c蛋白可能更适合胃中的酸性环境,具有分解胃中微生物的功能。 展开更多
关键词 水牛 胃型LYZ C基因 前肠发酵 序列分析 生物信息学分析
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河流型与沼泽型水牛LEP基因同义密码子使用特征分析
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作者 范新阳 伍姗 +4 位作者 张永云 滕晓红 赵学成 李卫真 苗永旺 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2017年第6期28-33,37共7页
为了了解影响泌乳性状的重要编码基因LEP基因的密码子使用特征,试验以27头河流型水牛和41头沼泽型水牛为研究对象,并以从NCBI数据库中下载的普通牛、野牦牛、野牛、绵羊、山羊、小鼠和人的序列作对照,对两类水牛LEP基因的同义密码子... 为了了解影响泌乳性状的重要编码基因LEP基因的密码子使用特征,试验以27头河流型水牛和41头沼泽型水牛为研究对象,并以从NCBI数据库中下载的普通牛、野牦牛、野牛、绵羊、山羊、小鼠和人的序列作对照,对两类水牛LEP基因的同义密码子使用偏好性及水牛与其他物种间LEP基因密码子使用的差异和进化关系进行深入分析。结果表明:两种类型水牛LEP基因密码子使用特征相似,河流型和沼泽型水牛LEP基因均有25个偏好使用的密码子;其中两类水牛LEP基因偏好性较强的密码子均为UUC、CUG、AUC、GUC、UCC、ACC、GCC、CAC、CGG、AGG和GGG(RSCU≥2.00)。河流型水牛CCA和CCG密码子的RScu值分别为0.09和0.35,而沼泽型水牛分别为O.34和0.10。此外,所有物种LEP基因均偏好使用以G/C结尾的密码子,但不同物种之间偏好使用密码子种类和数目均有差异。密码子使用偏好聚类分析表明,河流型与沼泽型水牛亲缘关系最近,聚为一类,然后依次与其他牛、绵羊、山羊、小鼠和人等物种相聚。在密码子使用频率上,LEP基因与小鼠密码子偏好性差异小于与大肠杆菌和酵母密码子偏好性的差异,说明小鼠更适合作为水牛LEP基因的外源表达系统。 展开更多
关键词 河流型水牛 沼泽型水牛 牛科物种 LEP基因 密码子偏好性
槟榔江水牛Dmrt7基因克隆及分子特征、组织表达谱分析 预览
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作者 伍姗 吉丽 +4 位作者 张永云 杜平 康定富 哈福 苗永旺 《云南农业大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2017年第4期612-619,共8页
【目的】Dmrt7基因是Dmrt基因家族成员之一,影响公畜精子形成。迄今,有关水牛精子发生的遗传基础的研究很少,本研究旨在对槟榔江水牛Draft7基因完整CDS区进行克隆和组织差异表达分析。【方法】采用RT-PCR和功能生物信息学方法。【结... 【目的】Dmrt7基因是Dmrt基因家族成员之一,影响公畜精子形成。迄今,有关水牛精子发生的遗传基础的研究很少,本研究旨在对槟榔江水牛Draft7基因完整CDS区进行克隆和组织差异表达分析。【方法】采用RT-PCR和功能生物信息学方法。【结果】槟榔江水牛Dmrt7基因完整编码区序列长I113bp,编码370个氨基酸;Dmrt7包含DM和DMRT-like两个保守结构域,无信号肽,无跨膜结构,为核内蛋白。同源性分析显示,水牛与其他牛科物种Dmrt7氨基酸序列相似度达95%以上。在检测的10个组织中,Dmrt7基因仅在水牛睾丸组织中表达且高表达。在第6外显子发现1个SNP位点(c.665A〉G),引起了P.Q222R的替换,此位点的替换对Dmrt7蛋白功能无影响。【结论】有助于了解水牛Draft7基因的基本功能。 展开更多
关键词 槟榔江水牛 Draft7基因 DM结构域 精子生成 遗传变异 生物信息学分析
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槟榔江水牛LALBA基因克隆及序列特征分析 预览
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作者 单曦 吉丽 +4 位作者 张永云 滕晓红 袁峰 哈福 苗永旺 《云南农业大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2017年第5期830-837,共8页
【目的】α-乳清蛋白由LALBA基因编码,在乳糖合成中起着重要作用。近年在普通奶牛中发现该基因与泌乳性状关系密切,但在水牛中研究较少。为了揭示水牛LALBA基因的序列特征。【方法】本研究采用RT-PCR测序法对槟榔江水牛LALBA基因的编码... 【目的】α-乳清蛋白由LALBA基因编码,在乳糖合成中起着重要作用。近年在普通奶牛中发现该基因与泌乳性状关系密切,但在水牛中研究较少。为了揭示水牛LALBA基因的序列特征。【方法】本研究采用RT-PCR测序法对槟榔江水牛LALBA基因的编码区序列进行了克隆和生物信息学分析。【结果】槟榔江水牛LALBA基因的编码区全长429 bp,编码蛋白含142个氨基酸。其α-LA含有1个C型溶菌酶/乳蛋白家族结构域(AA20~138)和1个信号肽序列(AA19~20),无跨膜结构,是胞外分泌的亲水蛋白;其N末端疏水,C末端亲水;有4类功能活性位点。基于LALBA基因编码区序列的系统发育分析表明,槟榔江水牛与牛亚科物种聚在一起,揭示它们LALBA基因功能的相似性。在LALBA基因编码区共检测到5个SNP位点:c.63A〉G、c.107A〉G、c.147A〉G、c.249C〉T、c.291T〉C。这些变异位点全部处于Hardy-Weinberg不平衡状态,只有SNP107为异义替换,导致编码氨基酸由天冬氨酸变为甘氨酸。功能分析显示SNP107对槟榔江水牛α-LA功能没有影响。【结论】水牛LALBA基因的序列与其他牛科物种长度相同,其编码产物的结构、功能与其他牛科物种相似。本研究可为进一步研究LALBA基因在水牛泌乳过程中的作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 槟榔江水牛 α-乳清蛋白 生物信息学分析 单核苷酸多态性 蛋白质功能
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BTN1A1的研究进展
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作者 刘超英 张永云 +7 位作者 彭洁 俞大阔 王绍卿 代飞燕 赵敏 胡忠梅 和绍禹 李卫真 《饲料研究》 CAS 2016年第24期16-17,27共3页
嗜乳脂蛋白(BTN1A1)是包括BTN2A1、BTN2A2、BTN3A1、BTN3A2和BTN3A3等多个成员的乳脂肪球膜蛋白家族:BTN1A1与乳脂滴的合成和分泌密切相关,研究主要对BTN1A1基因结构和功能进行综述.并为提高乳脂率提供一定的理论支持。
关键词 嗜乳脂蛋白 乳脂 同源性
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