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侵染我国主要蔬菜作物的病毒种类、分布与发生趋势 预览
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作者 刘勇 李凡 +26 位作者 李月月 张松柏 高希武 谢艳 燕飞 张安盛 戴良英 程兆榜 丁铭 牛颜冰 王升吉 车海彦 江彤 史晓斌 何自福 吴云锋 张德咏 青玲 严婉荣 杨学辉 汤亚飞 郑红英 唐前君 章松柏 章东方 蔡丽 陶小荣 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期239-261,共23页
【目的】对我国茄科、葫芦科、豆科和十字花科蔬菜主要病毒病开展调查、诊断,明确当前我国主要蔬菜作物病毒病的病原物、优势病毒及其分布,并对其中一些重要病毒引起的病毒病在我国的发生危害趋势进行分析。【方法】2013—2017年,对我... 【目的】对我国茄科、葫芦科、豆科和十字花科蔬菜主要病毒病开展调查、诊断,明确当前我国主要蔬菜作物病毒病的病原物、优势病毒及其分布,并对其中一些重要病毒引起的病毒病在我国的发生危害趋势进行分析。【方法】2013—2017年,对我国大陆31个省(市、自治区)开展茄科、葫芦科、豆科和十字花科等蔬菜作物主要病毒病发生情况的普查,利用血清学和分子生物学相结合的方法对主要蔬菜病毒病的病原进行鉴定。【结果】我国大陆31个省(市、自治区)共采集茄科、葫芦科、豆科和十字花科蔬菜作物疑似病毒病样品41 653份,共检出病毒63种,其中茄科蔬菜检出病毒达40种,葫芦科蔬菜检出病毒26种,豆科蔬菜检出病毒19种,十字花科蔬菜检出病毒14种。茄科的辣椒检出病毒33种,番茄检出病毒25种;葫芦科的南瓜检出病毒22种,黄瓜检出病毒19种;豆科的豇豆检出病毒14种,菜豆检出病毒12种;十字花科的萝卜检出12种病毒,大白菜检出7种病毒。蔬菜作物中普遍存在多种病毒复合侵染现象,已发现2—6种病毒复合侵染,以2种病毒复合侵染类型居多,其中辣椒、番茄和茄子上存在6种病毒复合侵染。本研究首次在国内发现番茄斑驳花叶病毒(Tomato mottle mosaic virus,To MMV)、西葫芦虎纹花叶病毒(Zucchini tigre mosaic virus,ZTMV)、辣椒脉黄化病毒(Pepper vein yellows virus,Pe VYV)、辣椒隐潜病毒1号(Pepper cryptic virus 1,PCV-1)和辣椒隐潜病毒2号(Pepper cryptic virus2,PCV-2)的侵染;首次发现To MMV、甜瓜蚜传黄化病毒(Melon aphid-borne yellows virus,MABYV)、南瓜蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)对辣椒的侵染,首次发现ZTMV对黄瓜、烟草轻绿花叶病毒(Tobacco mild green mosaic virus,TMGMV)对南瓜的侵染,首次发现番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt tospovirus,TSWV)可以侵染芹菜、曼陀罗、豇豆、豌豆、党参、大丽花、旱金 展开更多
关键词 蔬菜 病毒 种类鉴定 分布 发生趋势
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谷子高效离体再生基因型和培养基的筛选 预览
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作者 贺榆婷 卫云丰 +5 位作者 张洁 郭永正 叶玲 韩渊怀 王兴春 杨致荣 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1265-1272,共8页
谷子离体再生和遗传转化困难,极大地限制了其作为模式植物在功能基因组学研究和品种遗传改良中的应用。为筛选高效离体再生的谷子基因型,选取90份国内外的谷子种质资源,利用其成熟胚作为外植体进行离体再生培养。结果表明,不同基因型谷... 谷子离体再生和遗传转化困难,极大地限制了其作为模式植物在功能基因组学研究和品种遗传改良中的应用。为筛选高效离体再生的谷子基因型,选取90份国内外的谷子种质资源,利用其成熟胚作为外植体进行离体再生培养。结果表明,不同基因型谷子出愈率、芽分化率和再生率差异较大;不同基因型的谷子出愈率在17.67%~93.67%之间,芽分化率在0%~78.89%之间,再生率在0%~40.00%之间。从中筛选出3份高效离体再生种质资源,分别为Y41、Y176和Y145,其离体再生效率分别为40.00%、37.33%和36.00%。3份种质资源在CIM3培养基上的出愈率最高,且愈伤质量较好,CIM3培养基配方为4.43 g·L-1MS+30 g·L-1蔗糖+4 g·L-1phytagel+2 mg·L-12,4-D+0.5 mg·L-1KT。本研究结果为谷子离体再生和遗传转化,以及推动谷子作为C4禾谷类模式植物的进程奠定了一定的理论基础。 展开更多
关键词 谷子 成熟胚 离体再生 基因型 培养基
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莲草直胸跳甲OBP51的克隆及表达分析 预览
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作者 胡军 付丽 +4 位作者 王亚茹 张彬 刘艳红 贾栋 马瑞燕 《山西农业科学》 2019年第7期1126-1130,共5页
莲草直胸跳甲在防治入侵性杂草喜旱莲子草中发挥重要作用。莲草直胸跳甲主要通过气味寻找宿主植物;气味结合蛋白是昆虫气味反应的第一步。研究克隆得到莲草直胸跳甲OBP51的全长序列,进行生物信息学分析,并分析其在不同组织中的相对表达... 莲草直胸跳甲在防治入侵性杂草喜旱莲子草中发挥重要作用。莲草直胸跳甲主要通过气味寻找宿主植物;气味结合蛋白是昆虫气味反应的第一步。研究克隆得到莲草直胸跳甲OBP51的全长序列,进行生物信息学分析,并分析其在不同组织中的相对表达量。结果表明,OBP51的cDNA全长为489bp,ORF为411bp,编码136个氨基酸,具有18个氨基酸残基的信号肽;AhygOBP51编码的成熟蛋白为脂溶性蛋白,主要为α-螺旋结构,占68.6%,无规则卷曲占28.8%。定量PCR分析表明,其在触角、后足中高表达,且雄虫后足高于雌虫后足,提示AhygOBP51在触角和后足气味识别过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 莲草直胸跳甲 气味结合蛋白 表达谱
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EB和CVN抗病毒肽对PRRSV入侵细胞的抵抗作用
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作者 段月琴 张枫惠 +4 位作者 李乃峰 冯旭红 赵鹏 秦健 杜荣 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第9期140-142,共3页
为了研究EB抗病毒肽和蓝藻抗病毒蛋白-N(CVN)抗病毒肽抵抗猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的入侵作用,对分别转染了不同载体(未转染组、pcDNA3.1空载体组、pcDNA3.1-MSTNpro组、pcDNA3.1-MSTNpro-EB组和pcDNA3.1-MSTNpro-CVN组)的猴肾细... 为了研究EB抗病毒肽和蓝藻抗病毒蛋白-N(CVN)抗病毒肽抵抗猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的入侵作用,对分别转染了不同载体(未转染组、pcDNA3.1空载体组、pcDNA3.1-MSTNpro组、pcDNA3.1-MSTNpro-EB组和pcDNA3.1-MSTNpro-CVN组)的猴肾细胞(Marc-145细胞)进行PRRSV处理,检测病毒核衣壳N蛋白与细胞波形蛋白的mRNA表达差异。结果表明:在PRRSV处理后,与pcDNA3.1-MSTNpro组相比,pcDNA3.1-MSTNpro-EB组和pcDNA3.1-MSTNpro-CVN组中病毒核衣壳N蛋白和细胞波形蛋白的mRNA相对表达量极显著或显著降低(P<0.01或P<0.05)。说明EB抗病毒肽和CVN抗病毒肽具有抗PRRSV入侵细胞的作用。 展开更多
关键词 EB抗病毒肽 蓝藻抗病毒蛋白-N抗病毒肽 猪繁殖与呼吸综合征病毒 猴肾细胞 核衣壳N蛋白 波形蛋白
不同肥料配施对红凤凰桃果实品质的影响 预览
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作者 张红梅 李鹃鸽 +2 位作者 张楚捷 韩旭 席丛林 《山西农业科学》 2019年第5期845-848,853共5页
以山西特有的3年生红凤凰桃为试材,研究羊粪和海藻有机肥与不同无机肥配合施用对红凤凰桃果实品质及香气成分的影响,为山西桃树的高产优质提供理论依据。结果表明,羊粪有机肥+0.5kg螯合中微肥施用后,对红凤凰桃单果质量有显著影响,比对... 以山西特有的3年生红凤凰桃为试材,研究羊粪和海藻有机肥与不同无机肥配合施用对红凤凰桃果实品质及香气成分的影响,为山西桃树的高产优质提供理论依据。结果表明,羊粪有机肥+0.5kg螯合中微肥施用后,对红凤凰桃单果质量有显著影响,比对照提高了25%;羊粪有机肥+0.5kg果树专用肥施用后对果实硬度有显著提高,果实硬度比对照提高了6.5%;海藻有机肥+0.5kg螯合中微肥施用后,单果质量与果实硬度分别比对照提高14.5%和40.4%;羊粪有机肥+0.5kg果树专用肥与羊粪有机肥+0.5kg螯合中微肥的施用可以显著提高可溶性总糖含量,分别比对照提高33.2%与36.3%;海藻有机肥+0.5kg螯合中微肥的施用可有效增加果实中可溶性固形物、可溶性总糖和Vc含量。不同肥料配合施用不但增加了果实香气的种类,还提高了香气物质的相对含量。 展开更多
关键词 红凤凰桃 有机肥 无机肥 果实品质 香气
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绵羊HADHB基因生物信息学分析及营养应激状态下的表达变化 预览
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作者 郭丽荣 韩高链 +3 位作者 张枫惠 李俊玲 秦健 杜荣 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2019年第5期94-98,162共6页
本研究旨在探索绵羊HADHB的分子特性以及在营养应激中的作用。根据GenBank登录的基因序列(XM004005732.3)对HADHB基因进行一系列生物信息学分析。随机选取6只成年健康绵羊,分为正常组和禁食组。通过荧光定量PCR技术及NormFinder软件检测... 本研究旨在探索绵羊HADHB的分子特性以及在营养应激中的作用。根据GenBank登录的基因序列(XM004005732.3)对HADHB基因进行一系列生物信息学分析。随机选取6只成年健康绵羊,分为正常组和禁食组。通过荧光定量PCR技术及NormFinder软件检测2个常用内参基因ACTB和GAPDH的稳定性,然后测定HADHB基因的表达。结果表明:绵羊HADHB分子式为C2273H3648N630O673S24,由475个氨基酸组成,存在蛋白质跨膜区,该蛋白有91.3%位于线粒体;HADHB理论等电点(pI)为9.38,平均疏水性为-0.093,不稳定指数为34.16;HADHB基因在不同物种中保守性较高,进化树和三级结构预测结果均表明绵羊和山羊、藏羚羊、牛亲缘关系较近;荧光定量结果表明,ACTB更适合作为本实验的内参基因,禁食组绵羊HADHB基因mRNA表达量较正常组显著上升。本研究成功构建了营养缺陷应激模型,为绵羊HADHB及相关通路的进一步探索奠定了基础。 展开更多
关键词 绵羊 营养应激 HADHB基因 生物信息学分析 MRNA表达
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固氮菌肥对山西道地黄芪品质及产量的影响 预览
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作者 梁华 陈灿灿 +4 位作者 陈家炜 王梦茹 柴智 高海俊 梁建萍 《山西农业科学》 2019年第5期841-844,共4页
为研制黄芪高效固N菌肥,将山西农业大学生命科学学院实验室保存的3株优势固氮菌株G4,J1,J2混合制成固氮菌肥GJ,施于3年生蒙古黄芪根部,测定黄芪生物量及主要药效成分黄酮、皂苷、多糖含量,研究固氮菌对黄芪生长及产量、品质的影响。结... 为研制黄芪高效固N菌肥,将山西农业大学生命科学学院实验室保存的3株优势固氮菌株G4,J1,J2混合制成固氮菌肥GJ,施于3年生蒙古黄芪根部,测定黄芪生物量及主要药效成分黄酮、皂苷、多糖含量,研究固氮菌对黄芪生长及产量、品质的影响。结果表明,施用固氮菌肥可明显促进黄芪生长及药效成分的合成与积累,与对照相比,株高、根长、地上地下干质量分别提高23.24%,36.25%,34.49%,63.47%,3种药效成分黄酮、皂苷、多糖含量分别提高21.51%,21.52%,57.42%。黄芪固氮菌回接于根际土壤,能有效促进黄芪的生长和品质的提高,可为开发固氮菌肥、规范黄芪生态种植提供理论基础及技术支撑。 展开更多
关键词 蒙古黄芪 固氮菌肥 药材品质
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中华蜜蜂及意大利蜜蜂气味结合蛋白OBP12的基因克隆与差异表达分析
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作者 杜亚丽 冯宇佳 +5 位作者 马卫华 邰苗苗 李新宇 苏文婷 赵慧婷 姜玉锁 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期517-529,共13页
【目的】克隆获得中华蜜蜂Apis cerana cerana(简称中蜂)和意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica(简称意蜂)的气味结合蛋白基因OBP12序列,并对两蜂种的蛋白结构进行预测,明确该基因在两蜂种不同组织和发育阶段的表达差异。【方法】分别... 【目的】克隆获得中华蜜蜂Apis cerana cerana(简称中蜂)和意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica(简称意蜂)的气味结合蛋白基因OBP12序列,并对两蜂种的蛋白结构进行预测,明确该基因在两蜂种不同组织和发育阶段的表达差异。【方法】分别以中蜂和意蜂的触角cDNA为模板,采用RT-PCR技术扩增和克隆获得OBP12cDNA全长序列,并利用生物信息学软件对其编码蛋白的理化特性、结构特征和系统进化进行分析;采用qRT-PCR技术对OBP12在中华蜜蜂和意大利蜜蜂不同发育阶段(1、5、10、15、20、25、30日龄)各组织(触角、头、胸、腹、足和翅)中mRNA的表达情况进行比较分析。【结果】成功获得了AcerOBP12和AmelOBP12的完整开放阅读框ORF序列,全长均为453bp,共编码150个氨基酸,预测分子量分别为17.76 ku、17.42 ku;N-末端均有一段含22个氨基酸的信号肽,无跨膜结构;均含有6个保守的半胱氨酸位点,属于Classical OBP亚家族。两蛋白均包含6个α螺旋,且由Cys组成的3个二硫键连接在一起。系统进化树分析表明,中华蜜蜂AcerOBP12首先与意大利蜜蜂AmelOBP12聚在一起,再与同为膜翅目的回条蜂HlabPBPGp-9-like、印度跳蚁HsalPBPGp-9-like、阿根廷蚁LhumPBPGp-9-like和小火蚁WaurPBPGp-9-like聚为一类。荧光定量PCR结果显示,OBP12在中、意蜂不同发育阶段各组织中均有表达,且触角中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01);其他组织中,翅膀和足的表达量相对较高,头、胸和腹中呈微量表达。此外,OBP12在意蜂不同发育阶段各组织的表达量均高于中蜂。【结论】AcerOBP12和AmelOBP12均属于Classical OBP亚家族,推测其为信息素气味结合蛋白PBP。组织表达谱结果暗示,OBP12除广泛参与嗅觉相关行为之外,还可能参与味觉识别过程。 展开更多
关键词 中华蜜蜂 意大利蜜蜂 OBP12 基因克隆 生物信息学分析 时空表达
绵羊Wnt2蛋白生物信息学分析
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作者 薛丽娜 景炅婕 +2 位作者 党文庆 李鹏飞 吕丽华 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期1497-1502,共6页
Wnt2蛋白是Wnts蛋白家族的重要成员,参与卵巢的发育。本研究以NCBI蛋白质数据库中发布的Wnt2蛋白氨基酸序列为研究对象,采用生物信息学软件对Wnt2蛋白的理化性质、信号肽及跨膜结构域、糖基化和磷酸化位点、二级结构和功能结构域、亚细... Wnt2蛋白是Wnts蛋白家族的重要成员,参与卵巢的发育。本研究以NCBI蛋白质数据库中发布的Wnt2蛋白氨基酸序列为研究对象,采用生物信息学软件对Wnt2蛋白的理化性质、信号肽及跨膜结构域、糖基化和磷酸化位点、二级结构和功能结构域、亚细胞定位和功能结构分类、序列相似比对及聚类、三级结构进行预测分析。结果发现,绵羊Wnt2由360个氨基酸组成,其等电点为9.21,有糖基化位点和磷酸化位点,是一个有信号肽的稳定的蛋白;二级结构与三级结构一致,均显示Wnt2由α-螺旋、延伸链、无规则卷曲构成;绵羊Wnt2蛋白是细胞外蛋白,主要参与信号转导和转录调控。研究结果为深入探讨Wnt2基因及其编码蛋白的结构和功能提供相关依据。 展开更多
关键词 绵羊 Wnt2 生物信息学 蛋白质结构
Cry1Ia蛋白的表达与纯化 预览
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作者 郭小琴 钱红梅 +4 位作者 郭星 高佳丽 张义茹 高建华 王兴春 《山西农业科学》 2019年第5期748-750,769共4页
苏云金芽孢杆菌表达的Cry1Ia蛋白对鳞翅目和鞘翅目昆虫具有较好的杀虫活性。为便于后期评价不同的Cry1Ia蛋白,建立了Cry1Ia蛋白的表达与纯化体系。将一个cry1Ia基因的编码基因接入pET28aDel表达载体,并将其转化大肠杆菌BL21(DE3)star菌... 苏云金芽孢杆菌表达的Cry1Ia蛋白对鳞翅目和鞘翅目昆虫具有较好的杀虫活性。为便于后期评价不同的Cry1Ia蛋白,建立了Cry1Ia蛋白的表达与纯化体系。将一个cry1Ia基因的编码基因接入pET28aDel表达载体,并将其转化大肠杆菌BL21(DE3)star菌株。在大肠杆菌中诱导Cry1Ia蛋白的表达,并与Bt中的表达产物进行比较。最后,利用Cry1Ia蛋白C端包含的组氨酸标签,对大肠杆菌表达的Cry1Ia蛋白进行纯化。结果显示,大肠杆菌中Cry1Ia蛋白随着表达时间的延长,产物积累显著,并且其表达量高于Bt菌株,因此,其更适宜生产完整的Cry1Ia蛋白。对大肠杆菌表达的Cry1Ia进行纯化,获得了理想的结果。研究构建了Cry1Ia蛋白的大肠杆菌表达体系,并成功对其进行纯化,可为进一步研究此类蛋白的杀虫活性和机制奠定基础。 展开更多
关键词 苏云金芽孢杆菌 大肠杆菌 cry1Ia 蛋白表达 蛋白纯化
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Cry1Ia和Cry2Ab融合蛋白的表达 预览
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作者 郭小琴 钱红梅 +3 位作者 郭俊佩 史宗勇 高建华 王兴春 《山西农业大学学报:自然科学版》 CAS 北大核心 2019年第3期101-105,共5页
[目的]苏云金芽孢杆菌表达的杀虫蛋白Cry1Ia和Cry2Ab对鳞翅目和鞘翅目昆虫具有较好的杀虫活性。为充分利用已有Cry蛋白,本文构建了两者的融合蛋白,并对融合蛋白的原核表达进行检测。[方法]本文将两个基因的编码基因,按照两种先后顺序拼... [目的]苏云金芽孢杆菌表达的杀虫蛋白Cry1Ia和Cry2Ab对鳞翅目和鞘翅目昆虫具有较好的杀虫活性。为充分利用已有Cry蛋白,本文构建了两者的融合蛋白,并对融合蛋白的原核表达进行检测。[方法]本文将两个基因的编码基因,按照两种先后顺序拼接起来,获得cry1Ia-cry2Ab融合基因和cry2Ab-cry1Ia融合基因。另外,将Cry1Ia蛋白N端第一个α-螺旋(73个氨基酸)的编码序列删除后,接入cry2Ab基因5'端,获得第三个融合基因cry1IaD73-cry2Ab。将3个基因分别插入pHT304载体,并由cry1Ac基因的启动子和终止子调控其在Bt细胞中表达。[结果]SDS-PAGE结果显示,Cry1Ia-Cry2Ab、Cry2Ab-Cry1Ia和Cry1IaD73-Cry2Ab三个融合蛋白均能够在Bt细胞中表达,其测定分子量与预期大小一致,分别约152kDa、152kDa和144kDa。蛋白印迹法分析发现,在表达过程中,三种融合蛋白均有一定比例的降解。另外,不同温度对融合蛋白的表达也有不同程度的影响。[结论]本研究构建了3种融合杀虫基因并在Bt细胞中成功表达,为进一步解析这类融合蛋白的杀虫活性和机理奠定了基础。 展开更多
关键词 苏云金芽孢杆菌 cry1Ia CRY2AB 融合蛋白 蛋白表达
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谷子和狗尾草WOX转录因子基因的全基因组鉴定与分析 预览
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作者 李雪垠 武懿茂 张凤洁 《山西农业科学》 2019年第6期957-962,共6页
WOX转录因子主要功能涉及植物组织发育、器官形成和干细胞维持等。为了深入研究谷子和狗尾草WOX转录因子基因家族,为后续狗尾草属植物生长发育相关WOX基因的克隆和功能研究奠定理论基础,研究鉴定了谷子和狗尾草WOX转录因子家族基因,并... WOX转录因子主要功能涉及植物组织发育、器官形成和干细胞维持等。为了深入研究谷子和狗尾草WOX转录因子基因家族,为后续狗尾草属植物生长发育相关WOX基因的克隆和功能研究奠定理论基础,研究鉴定了谷子和狗尾草WOX转录因子家族基因,并进行了生物信息学分析。结果表明,谷子和狗尾草基因组分别包含13,12个WOX基因,谷子和狗尾草共有12对直系同源基因,这些同源基因具有相似的基因结构,谷子和狗尾草WOX基因内含子相位为0或1;谷子和狗尾草WOX基因蛋白质基序Motif1,Motif3,Motif4和Motif5较为保守;SiWOX1等基因启动子包含AACA_motif,CAT-box,GCN4_motif,RY-element等元件,说明它们可能参与调控胚乳或种子发育、或分生组织形成;SiWOX11和SvWOX10这2个基因在根组织中表达量非常高,说明这2个基因可能与根系发育密切相关。 展开更多
关键词 谷子 狗尾草 WOX 转录因子 生物信息学 基因表达
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三裂叶薯SPL基因家族鉴定、表达及miR156的调控分析
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作者 王婷 唐锐敏 +5 位作者 王瑞晋 贺立恒 刘霞宇 刘世芳 李润植 贾小云 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期736-749,共14页
SQUAMOSA promoter binding protein-like(SPL)是一类广泛存在于植物中的转录因子,均含有一个高度保守的SBP结构域(SQUAMOSA-PROMOTER BINDING PROTEIN)。本研究通过SBP结构域的隐马尔可夫模型、Blastp、CDD和SMART等程序从栽培甘薯的... SQUAMOSA promoter binding protein-like(SPL)是一类广泛存在于植物中的转录因子,均含有一个高度保守的SBP结构域(SQUAMOSA-PROMOTER BINDING PROTEIN)。本研究通过SBP结构域的隐马尔可夫模型、Blastp、CDD和SMART等程序从栽培甘薯的二倍体近缘野生种三裂叶薯(Ipomoea triloba L.)全基因组中鉴定出26个SPL基因家族成员。它们不均匀分布于三裂叶薯的12条染色体上。利用系统进化分析将新鉴定的26个三裂叶薯ItbSPL基因和来源于苔藓植物、单子叶植物、双子叶植物的116个SPL基因构建进化树,并根据拟南芥AtSPL基因家族的分类标准将26个ItbSPL基因家族分为7组。GSDS 2.0基因结构和MEME 4.12.0保守基序分析表明,不同进化分支中的ItbSPL基因的外显子/内含子数目及其蛋白基序组成差异明显。利用拟南芥中已知功能的SPL对ItbSPL基因的功能进行预测,发现三裂叶薯ItbSPL家族基因成员可能与植物开花、逆境胁迫、次生代谢产物等生物学过程相关。通过预测microRNA156(miR156)的作用位点发现,在26个ItbSPL基因中14个含有miR156的作用位点,其中13个ItbSPL基因具有PCR扩增产物。利用qRT-PCR检测13个候选靶基因及miR156在三裂叶薯叶、茎、根中的表达量,发现13个ItbSPL均在茎中的表达量最低,显著低于叶与根中的表达,而miR156则在茎中的表达量最高,在根中的表达量最低,初步推测这13个ItbSPL是miR156的靶基因。以上研究结果为六倍体栽培甘薯SPL基因家族成员的鉴定、进化分析及功能研究提供了方法和基础。 展开更多
关键词 三裂叶薯 SPL基因家族 全基因组鉴定 miR156 表达分析
谷子HSF转录因子基因鉴定与生物信息学分析 预览
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作者 李雪垠 武懿茂 +2 位作者 张凤洁 韩渊怀 王兴春 《山西农业大学学报:自然科学版》 CAS 北大核心 2019年第4期1-8,共8页
[目的]谷子是我国北方重要杂粮作物之一,具有丰富营养和药用价值。谷子耐旱、耐贫瘠,生长周期内经常会面临干热风等不良自然环境。热激转录因子(heat shock transcription factor, HSF)是植物一类重要转录因子,通过和热激反应相关基因... [目的]谷子是我国北方重要杂粮作物之一,具有丰富营养和药用价值。谷子耐旱、耐贫瘠,生长周期内经常会面临干热风等不良自然环境。热激转录因子(heat shock transcription factor, HSF)是植物一类重要转录因子,通过和热激反应相关基因启动子顺式作用元件结合,精确调控下游基因时空表达,调节植物热激应答。本研究旨在鉴定并分析谷子热激转录因子家族基因。[方法]采用生物信息学方法,在全基因组水平上鉴定谷子HSF转录因子家族成员,并进行系统发育、基因结构、蛋白质模体、启动子顺式作用元件和基因表达分析。[结果]谷子HSF转录因子家族共有27个基因;亲缘关系较近的谷子 HSF 基因的基因结构和蛋白质氨基酸序列也较为相似;谷子绝大多数 HSF 基因只含有2个外显子,绝大多数内含子的相位是0;谷子所有 HSF 基因都含有motif1、motif2和motif3,这3个motif在谷子HSF蛋白质序列最为保守;SiHSF20 等基因启动子区域都含有ABRE、MBS、TC-rich repeats等逆境胁迫响应元件;SiHSF1 、 SiHSF2 和 SiHSF3 基因在干旱处理根组织中表达量都较高,说明这3个基因与干旱诱导表达相关。[结论] SiHSF1 、 SiHSF2 、 SiHSF3 和 SiHSF20 基因可能参与调控谷子热激应答反应。谷子 HSF 基因家族分析有助于进一步鉴定热激应答相关基因,为挖掘抗逆基因资源提供理论依据。 展开更多
关键词 谷子 热激 转录因子 HSF 基因 生物信息学
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甘薯IbTPS1基因的克隆与活性鉴定 预览
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作者 王文斌 于欢 +1 位作者 杨燕新 邱相坡 《山西农业大学学报:自然科学版》 CAS 北大核心 2019年第4期17-23,共7页
[目的]发掘植物海藻糖合成途径关键酶基因,探究其编码蛋白TPS活性,为作物遗传改良抗多种胁迫提供优良的候选基因。[方法]本研究基于干旱条件下从甘薯转录组数据库中得到一条与拟南芥AtTPS1基因高度同源的Unigene序列,通过RT-PCR技术克... [目的]发掘植物海藻糖合成途径关键酶基因,探究其编码蛋白TPS活性,为作物遗传改良抗多种胁迫提供优良的候选基因。[方法]本研究基于干旱条件下从甘薯转录组数据库中得到一条与拟南芥AtTPS1基因高度同源的Unigene序列,通过RT-PCR技术克隆了甘薯TPS基因。利用生物信息学软件分析序列特征,酵母互补试验鉴定编码蛋白TPS活性。[结果]IbTPS1基因cDNA序列全长2811bp,编码936个氨基酸,且具有典型的GT1-TPS和HAD-TPP结构域;生物信息学预测表明IbTPS1编码的蛋白是一个不稳定亲水性蛋白,无信号肽,定位于细胞质中;二级结构元件多以无规则卷曲和α-螺旋为主;酵母互补实验证明表达IbTPS1基因的TPS突变酵母菌株(tps1Δ)和TPS,TPP双突变酵母菌株(tps1Δtps2Δ),以葡萄糖为唯一碳源的尿嘧啶缺失培养基上可恢复生长。[结论]证实甘薯IbTPS1基因的编码蛋白具有生物活性。 展开更多
关键词 甘薯 海藻糖-6-磷酸合成酶基因(TPS1) 基因克隆
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基于Illumina平台转录组测序筛选牛卵泡发育调控基因 预览
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作者 郝庆玲 景炅婕 +2 位作者 朱芷葳 吕丽华 李鹏飞 《湖南农业大学学报:自然科学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期60-67,共8页
运用超声波监测技术,采集母牛发情期出现偏差前的第一大卵泡PDF1和出现偏差后的第二大卵泡ODF2,分别分离卵泡颗粒细胞(GCs),构建RNA文库,用Illumina2000测序;测序结果经数据库搜索和差异表达筛选,采用DAVID软件GO和KEGGpathway分析,经Ge... 运用超声波监测技术,采集母牛发情期出现偏差前的第一大卵泡PDF1和出现偏差后的第二大卵泡ODF2,分别分离卵泡颗粒细胞(GCs),构建RNA文库,用Illumina2000测序;测序结果经数据库搜索和差异表达筛选,采用DAVID软件GO和KEGGpathway分析,经Genecards功能查询,筛选牛卵泡发育相关基因。结果表明:数据库搜索共获得35325个基因,其中有意义的表达基因15645个,从中筛选获得差异表达基因608个;GO分析表明,608个差异表达基因中参与生物过程的基因占60.46%,细胞组分的基因占20.08%,分子功能的基因占11.46%;KEGGpathway分析表明,608个差异表达基因通过9条信号通路参与牛卵泡发育调控(P<0.05),经Genecards功能筛选,共获得11个与牛卵泡发育密切相关的调控基因-SESN3、COL3A1、CCNE1、CAV1、CACNA1H、ITPR1、PIK3R3、MYC、PTGFR、CDK6、GAPDH,它们直接参与细胞增殖分化及信号通路调节。 展开更多
关键词 卵泡 颗粒细胞 转录组 调控基因
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不同糜子品种光合特性及农艺性状比较 预览
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作者 陈利青 张瑞杰 +2 位作者 张伟 武曌忠 张彬 《山西农业科学》 2019年第4期553-559,共7页
对山西当地糜子品种品黍1号、品黍2号和晋黍9号的农艺性状、穗部性状、光合色素含量、光合特性、水分利用效率以及荧光动力学参数进行调查分析,旨在筛选性状优良的糜子品种。结果表明,除品黍1号穗长显著低于其他2个品种以及晋黍9号的千... 对山西当地糜子品种品黍1号、品黍2号和晋黍9号的农艺性状、穗部性状、光合色素含量、光合特性、水分利用效率以及荧光动力学参数进行调查分析,旨在筛选性状优良的糜子品种。结果表明,除品黍1号穗长显著低于其他2个品种以及晋黍9号的千粒质量显著大于其他2个品种外,3个品种的主要农艺性状比较一致;对苗期、拔节期、抽穗期3个时期的叶绿素含量分析发现,3个品种的叶绿素含量在抽穗期均达到最大值,且叶绿素a和叶绿素b含量差异显著,其中,叶绿素a差异较大(晋黍9号<品黍1号<品黍2号);总体来看,品黍1号的净光合速率大于其他2个品种,且其水分利用效率较高;荧光动力学参数分析表明,晋黍9号和品黍2号的光合作用及光保护能力优于品黍1号。品黍1号穗型紧凑,籽粒数目多;品黍2号及晋黍9号的光合作用强,其可作为糜子改良材料进一步培育,以满足社会需求。 展开更多
关键词 农艺性状 穗部性状 光合色素 光合特性 水分利用率 荧光动力学参数
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中华蜜蜂嗅觉受体基因AcerOR 141的克隆与表达分析 预览
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作者 杜亚丽 徐凯 +5 位作者 龙登隆 李新宇 王春梅 兰俊 赵慧婷 姜玉锁 《山西农业大学学报:自然科学版》 CAS 北大核心 2019年第1期87-94,共8页
[目的]克隆鉴定中华蜜蜂Apis cerana cerana嗅觉受体基因AcerOR 141,并对其全长序列和表达谱进行分析,为该基因的功能研究奠定基础。[方法]利用PCR扩增和基因克隆技术获得中华蜜蜂嗅觉受体基因AcerOR 141的cDNA全长序列;利用多种生物信... [目的]克隆鉴定中华蜜蜂Apis cerana cerana嗅觉受体基因AcerOR 141,并对其全长序列和表达谱进行分析,为该基因的功能研究奠定基础。[方法]利用PCR扩增和基因克隆技术获得中华蜜蜂嗅觉受体基因AcerOR 141的cDNA全长序列;利用多种生物信息学软件对该基因编码的氨基酸序列进行结构预测、序列比对和进化树分析;利用qRT-PCR技术检测该基因在1、5、10、15、20、25和30日龄工蜂各组织中的表达情况。[结果]AcerOR141 cDNA全长为1 659 bp,ORF序列长度为1 299 bp,编码432个氨基酸,有7个跨膜结构且N端位于胞内,无信号肽,第184~421位氨基酸之间存在一个昆虫嗅觉受体7tm-6 superfamily的保守结构域。序列比对和进化树分析表明,AcerOR141与西方蜜蜂AmelOR141的亲缘关系最近,氨基酸序列一致性高达91%。荧光定量PCR结果显示,AcerOR 141 mRNA在工蜂触角和头部的表达较高,且极显著高于其他组织(P<0.01);在胸、腹、足和翅膀中仅有微量的表达。[结论]克隆获得AcerOR 141的全长cDNA序列,其编码产物具有昆虫嗅觉受体的典型结构特征;明确了该基因在中华蜜蜂成蜂触角和头部中有较高的表达,推测其表达产物为普通嗅觉受体蛋白,可能参与挥发性气味分子的识别过程。 展开更多
关键词 中华蜜蜂 嗅觉受体基因 AcerOR 141 生物信息学分析 时空表达
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不同营养生长时间对地被菊生长开花的影响 预览
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作者 聂梅 王伟 +1 位作者 牛颜冰 吕晋慧 《山西农业科学》 2019年第5期814-818,共5页
以地被菊俏粉阁为试材,分期短日照处理40d(当日17:00至次日8:00),设置5个处理(以不遮光为对照),测定植株生长发育的相关指标并记录开花进程,探求营养生长时间对菊花生长开花的影响。结果表明,光周期处理前,T4处理(营养生长40d)俏粉阁根... 以地被菊俏粉阁为试材,分期短日照处理40d(当日17:00至次日8:00),设置5个处理(以不遮光为对照),测定植株生长发育的相关指标并记录开花进程,探求营养生长时间对菊花生长开花的影响。结果表明,光周期处理前,T4处理(营养生长40d)俏粉阁根系长度、鲜质量及干质量显著高于其他处理;俏粉阁株高、冠幅随着营养生长时间的增加逐渐增加,处理22~28d,T2,T3,T4处理株高、冠幅生长量显著高于其他处理,处理36~42d,对照处理株高、冠幅生长量最大;俏粉阁花期随着营养生长时间的增加出现延迟,T4处理植株到达花期各阶段的间隔时间最短,开花最晚,但各处理植株开花总时长差异不显著;T4处理植株开花量、舌状花长度、花径、重瓣性及花粉活力显著高于其他处理。随着营养生长时间的增加,俏粉阁株高、冠幅、根系长度等逐渐增加,盛花期花朵品质提高,但开花出现延迟。当营养生长20d时进行短日诱导,生长速度最快,开花最早,花朵品质较好。 展开更多
关键词 地被菊 营养生长时间 生长 开花
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重组UK114融合蛋白的表达纯化及免疫组化定位 预览
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作者 尹淑琴 范艳 +2 位作者 朱宏 梁娟 常泓 《山西农业大学学报:自然科学版》 CAS 北大核心 2019年第3期95-100,共6页
[目的]UK114(山羊肝脏肿瘤抗原)是钙蛋白酶系统的主要成分钙蛋白酶ⅠCAPN1/S1(μ-calpain)的激活蛋白,本研究旨在利用原核表达系统体外制备重组UK114蛋白,获得融合蛋白制备抗体,对其进行组织定位,为深入研究其功能提供蛋白水平的证据。... [目的]UK114(山羊肝脏肿瘤抗原)是钙蛋白酶系统的主要成分钙蛋白酶ⅠCAPN1/S1(μ-calpain)的激活蛋白,本研究旨在利用原核表达系统体外制备重组UK114蛋白,获得融合蛋白制备抗体,对其进行组织定位,为深入研究其功能提供蛋白水平的证据。[方法]将重组质粒pGEX-4T-3-UK114转化入大肠杆菌BL21(DE3)中诱导表达、纯化,用凝血酶对GST-UK114融合蛋白进行酶切,制备抗UK114多克隆抗体,免疫组化分析重组UK114蛋白在组织中的分布情况。[结果]GST-UK114融合蛋白的分子量为40kD,酶切得到目标蛋白,其分子量为14kD;用UK114蛋白免疫家兔,得到了理想的高效价兔抗UK114多克隆抗血清,效价大于1∶125000,抗血清经纯化得到兔抗UK114多克隆抗体,效价大于1∶25000;Western blot分析结果显示,GST-UK114融合蛋白在约40kD处有一明显条带,融合蛋白酶切后在14kD附近出现一条带;免疫组织化学分析表明,免疫组化染色主要发生在细胞质中,山羊肝脏组织中肝小叶边缘区有肝细胞出现棕色的阳性着色,部分肝窦内皮细胞也有棕色的阳性着色。肾脏皮质中的肾小管上皮细胞有棕色的阳性着色出现,肾小球中没有出现着色。[结论]试验成功获得纯化后的重组UK114蛋白,制备的抗UK114抗体可以与正常山羊肝脏和肾脏组织中的UK114蛋白结合,为其后续分子伴侣特性以及抗肿瘤特性的研究提供一定的蛋白试验依据。 展开更多
关键词 重组UK114 多克隆抗体 蛋白免疫印迹 免疫组织化学定位
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