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志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列与毒力基因和耐药基因的关系 预览
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作者 王颖芳 王鹏飞 +3 位作者 詹煜慧 张晓萌 段广才 郗园林 《西安交通大学学报:医学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期71-75,共5页
目的探索志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)与毒力基因和耐药基因的关系。方法从GenBank数据库中获得志贺菌的基因组、毒力基因和耐药基因的序列,通过多序列比... 目的探索志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)与毒力基因和耐药基因的关系。方法从GenBank数据库中获得志贺菌的基因组、毒力基因和耐药基因的序列,通过多序列比对等方法获得志贺菌中CRISPR1、CRISPR2和CRISPR-Q1的分布情况、重复序列和间隔序列信息,通过BLAST方法获得毒力基因和耐药基因在志贺菌中的分布情况,SPSS21.0软件分析CRISPR与毒力基因和耐药基因的关系。结果志贺菌中的CRISPR1和CRISPR2在不同菌株中的间隔序列差别较大,CRISPR-Q1分布更为广泛(超过99%)。毒力基因在志贺菌中分布比较广泛(均超过56%),耐药基因中的blaOXA-1、camr、Sul2、tetB分布也比较广(超过50%)。CRISPR1/CRISPR2与是否携带9种毒力基因、4种耐药基因有关(P<0.05),CRISPR-Q1与是否携带3种毒力基因、4种耐药基因有关(P<0.05)。CRISPR1/CRISPR2和CRISPR-Q1均与志贺菌中存在的毒力基因和耐药基因的个数间有统计学关联(P<0.05)。CRISPR1/CRISPR2与CRISPR-Q1的间隔序列数目之间存在统计学关联(χ^2=61.6,P<0.001)。结论志贺菌中不同CRISPR的分布差异比较大,存在的间隔序列数目不等;志贺菌CRISPR与部分毒力基因和耐药基因之间存在负相关;CRISPR1/CRISPR2与CRISPR-Q1的间隔序列数目存在正相关。 展开更多
关键词 志贺菌 成簇的规律间隔短回文重复序列 毒力基因 耐药基因
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志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列的特点及其关联性分析 预览
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作者 王颖芳 王鹏飞 +3 位作者 段广才 郗园林 张晓萌 詹煜慧 《吉林大学学报:医学版》 CSCD 北大核心 2018年第6期1131-1137,共7页
目的:利用数据库和临床分离的志贺菌菌株分析志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR)的特点,探讨CRISPR-Q1的特性及CRISPR间的关联性。方法:根据志贺菌基因组数据库利用引物序列和PCR扩增获得志贺菌的CRISPR序列信息,采用多序列... 目的:利用数据库和临床分离的志贺菌菌株分析志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR)的特点,探讨CRISPR-Q1的特性及CRISPR间的关联性。方法:根据志贺菌基因组数据库利用引物序列和PCR扩增获得志贺菌的CRISPR序列信息,采用多序列比对等方法获得每个菌株中CRISPR的分布、间隔序列数及序列特点;利用BLAST分析CRISPR-Q1中重复序列和间隔序列,检测重复序列和间隔序列在菌株中的分布特点以及CRISPR-Q1在菌株中的位置及特征;分析数据库和实验室中志贺菌CRISPR-Q1中间隔序列数与CRISPR1或CRISPR2的关系。结果:在数据库107株志贺菌中,106株志贺菌含有CRISPR1或CRISPR2,8株志贺菌的CRISPR1或CRISPR2含有多个间隔序列;106株志贺菌含有CRISPR-Q1,其中有13株志贺菌的CRISPR-Q1中有多个间隔序列。在实验室12株志贺菌中,有6株含有CRISPR1或CRISPR2,12株均含有CRISPR-Q1;CRISPR-Q1间隔序列中的一部分(约35 bp)在同一个菌株的染色体基因组上分布广泛,重复序列同样如此,CRISPR-Q1中还存在基因外重复序列(REP)元素。数据库志贺菌中的CRISPR-Q1间隔序列数与CRISPR1和CRISPR2有关联(χ2=61.6,P<0.01),实验室志贺菌中的CRISPR-Q1间隔序列数与CRISPR1和CRISPR2有关联(P=0.015)。结论:CRISPR-Q1在志贺菌中广泛分布,其序列中存在REP元素;志贺菌的CRISPR1和CRISPR2与CRISPR-Q1有关联。 展开更多
关键词 志贺菌 成簇的规律间隔短回文重复序列 间隔序列 基因外重复序列
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肝硬化患者胆囊结石发生率及其影响因素分析 预览 被引量:6
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作者 刘晓敏 王萍 +4 位作者 王宏运 张腊梅 周新 许锦锦 张英剑 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2016年第19期3212-3215,共4页
目的:了解肝硬化患者胆囊结石的发生率,同时分析其影响因素及临床意义。方法:选择2014年10月至2015年8月在河南科技大学第一附属医院诊治的128例肝硬化患者为肝硬化组,并以同期门诊行体检者140例为健康对照组;其中肝硬化组根据肝功... 目的:了解肝硬化患者胆囊结石的发生率,同时分析其影响因素及临床意义。方法:选择2014年10月至2015年8月在河南科技大学第一附属医院诊治的128例肝硬化患者为肝硬化组,并以同期门诊行体检者140例为健康对照组;其中肝硬化组根据肝功能Child-Pugh分级标准分为肝功A级(A组)、肝功B级(B组)、肝功C级(C组)。对所有研究对象进行空腹血清ALB、空腹血清CCK水平的测定。分析肝硬化胆囊结石的发生与性别、肝功能Child-Pugh分级、腹腔积液、血清ALB及CCK的关系。结果:(1)单因素分析结果显示:肝硬化组胆囊结石的发生率明显高于健康对照组(35.2% vs 8.6%,P<0.05);且随着肝功能损害程度加重,胆囊结石的发生率随之升高,即B组和C组患者的胆囊结石发生率显著高于A组患者( A组22.9%vs B组35.0%vs C组50.0%,P<0.05)。肝硬化并发腹腔积液患者的胆囊结石发生率较无腹腔积液、健康对照组明显升高(38.6%vs 22.2%vs 8.6%,P<0.05)。肝硬化组血清ALB水平较健康对照组降低(P<0.05),且随着肝功能损害程度加重而变化;而肝硬化组血清CCK水平明显高于健康对照组(P<0.05),同样随着肝功能损害程度加重而变化。肝硬化患者胆囊结石发生率无性别差异(P>0.05)。(2)多因素Logistic回归结果显示:血清ALB含量是影响肝硬化患者胆囊结石发生的重要影响因素,结果有统计学意义(P <0.05),其他影响因素无统计学意义(P>0.05)。结论:肝硬化患者易发生胆囊结石,其发生与性别无关,而与肝功能损害程度、腹腔积液、血清ALB及CCK水平等有关,其中ALB是肝硬化患者伴胆囊结石的重要影响因素。 展开更多
关键词 肝硬化 胆囊结石 胆囊收缩素 腹水 肝功能分级
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志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列的检测及同源性分析 预览 被引量:4
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作者 王鹏飞 王颖芳 +5 位作者 段广才 王琳琳 郭向娇 薛泽润 郗园林 杨海燕 《吉林大学学报:医学版》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期261-268,I0003共9页
目的:检测志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR),并与GenBank全基因组中志贺菌重复序列和间隔序列对比,分析其结构特征及同源性。方法:利用PCR法扩增获得志贺菌CRISPR,采用生物信息学方法对重复序列及间隔序列进行同源性分析... 目的:检测志贺菌成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR),并与GenBank全基因组中志贺菌重复序列和间隔序列对比,分析其结构特征及同源性。方法:利用PCR法扩增获得志贺菌CRISPR,采用生物信息学方法对重复序列及间隔序列进行同源性分析;运用多序列比对分析间隔序列特点及其与侧翼序列间的联系;BLAST分析间隔序列与质粒和噬菌体的同源性;weblogo分析重复序列碱基频率及RNAfold预测其RNA二级结构;重复序列的同源聚类分析并用BLAST分析重复序列与其他细菌的同源性。结果:被测3株临床志贺菌及9株全基因组志贺菌中均含有不同数量CRISPR;同一个CRISPR中,间隔序列有的相似、有的完全不同,某些CRISPR间隔序列的部分序列与CRISPR侧翼序列存在同源性,某些间隔序列可能是信息基因和操纵基因的拼接重组;重复序列保守性不一致,可能与细菌进化存在一定的联系,重复序列碱基的差异影响茎的长度,从而影响二级结构的稳定性及CRISPR的功能。重复序列与个别远缘菌种具有较高的同源性。结论:志贺菌存在多样的CRISPR结构,不同CRISPR的重复序列保守性不同。某些间隔序列部分与CRISPR侧翼序列同源,某些间隔序列是多基因拼接而成。 展开更多
关键词 志贺菌 成簇的规律间隔短回文重复序列 重复序列 间隔序列 同源性
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志贺菌成簇的规律间隔的短回文重复序列系统结构特征的生物信息学分析 被引量:3
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作者 王鹏飞 王颖芳 +5 位作者 段广才 薛泽润 王琳琳 郭向娇 杨海燕 郗园林 《生物医学工程学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期343-349,共7页
利用生物信息学方法探索志贺菌成簇的规律间隔的短回文重复序列(CRISPR)系统结构的特征。本文通过BLAST、序列比对、RNA二级结构预测等方法对志贺菌CRISPR进行研究。结果显示:志贺菌的4个群中均发现有CRISPR结构,其侧翼上、下游序列... 利用生物信息学方法探索志贺菌成簇的规律间隔的短回文重复序列(CRISPR)系统结构的特征。本文通过BLAST、序列比对、RNA二级结构预测等方法对志贺菌CRISPR进行研究。结果显示:志贺菌的4个群中均发现有CRISPR结构,其侧翼上、下游序列可分为相同组群,在leader序列中存在具有回文性质、相对保守的motif;侧翼序列与重复序列具有相同的分组,重复序列有一定的保守性,可以形成以"茎"为主和以"环"为主两类不同的RNA二级结构;间隔序列与质粒或噬菌体有一定的同源性。本研究表明重复序列与侧翼序列间存在相关性,重复序列可能作为一种识别机制来介导外源元素与Cas蛋白间的相互作用。 展开更多
关键词 志贺菌 成簇的规律间隔的短回文重复序列 侧翼序列 重复序列 间隔序列
医学生心理健康水平与应对方式及其关系研究 预览 被引量:5
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作者 符幸涛 崔旭红 胡庆成 《中国社区医师》 2015年第34期155-157,159共4页
目的:了解医学生应对方式的特点与心理健康的现状,研究两者的关系,为高校医学生心理卫生工作提供科学依据。方法:抽取洛阳市某高校医学相关专业本科生357例,采用症状自评量表(SCL-90)、应对方式问卷(CSQ)进行调查并统计分析。结果... 目的:了解医学生应对方式的特点与心理健康的现状,研究两者的关系,为高校医学生心理卫生工作提供科学依据。方法:抽取洛阳市某高校医学相关专业本科生357例,采用症状自评量表(SCL-90)、应对方式问卷(CSQ)进行调查并统计分析。结果:32.49%的医学生存在不同程度的心理问题;医学生强迫、人际敏感、焦虑、敌对、偏执5个因子的得分显著高于2008年全国大学生常模(P<0.01或P<0.05);71.71%的医学生主要采用成熟型应对方式,其余常采用不成熟或混合型应对方式;成熟型应对方式解决问题、求助与SCL-90多个因子均呈显著负相关(P<0.01或P<0.05),而不成熟型、混合型应对方式(退避、幻想、自责)及混合型应对方式(合理化)与SCL-90各因子均呈非常显著的正相关(P<0.01);应对方式中解决问题、自责、幻想这3个变量能联合预测医学生心理健康39%的变异量,其中自责(β=0.57)对心理健康的影响比幻想(β=0.29)、解决问题(β=-0.15)大。结论:医学生存在较多的心理问题,其心理健康状况与应对方式密切相关,需帮助医学生及时认识和矫正其消极应对方式,有针对性地对医学生进行心理健康教育和咨询。 展开更多
关键词 医学生 应对方式 心理健康
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肝病良恶性腹腔积液前期处理后差异蛋白质组学分析 被引量:3
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作者 张英剑 王萍 +2 位作者 郭虹 郑玉峰 苏秀丽 《中国医药》 2014年第4期509-511,共3页
目的 分析肝炎后肝硬化及其相关性原发性肝癌患者腹腔积液前期处理后差异蛋白质组学,探讨肝病癌性腹腔积液具有特征性的标志蛋白组合模式.方法 应用表面加强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,对46例肝炎后肝硬化(肝硬化... 目的 分析肝炎后肝硬化及其相关性原发性肝癌患者腹腔积液前期处理后差异蛋白质组学,探讨肝病癌性腹腔积液具有特征性的标志蛋白组合模式.方法 应用表面加强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,对46例肝炎后肝硬化(肝硬化腹腔积液组)及27例肝炎后肝硬化相关性原发性肝癌患者(肝癌腹腔积液)腹腔积液前期处理后蛋白质进行检测,对蛋白质波谱进行分析,并寻找合理运算规则以确定能够区分原发性肝癌和肝炎后肝硬化腹腔积液患者的蛋白质组学图谱.结果 浓缩前肝硬化腹腔积液组的蛋白质浓度低于肝癌腹腔积液组[(8 ±4)g/L比(39±4) g/L],差异有统计学意义(P<0.05).浓缩后,肝硬化腹腔积液组蛋白质浓度与肝癌腹腔积液组的蛋白浓度接近[(54±5)g/L比(58±5)g/L],差异无统计学意义(P>0.05).离心前,肝癌腹腔积液组腹腔积液细胞计数明显多于肝硬化腹腔积液组[(3146±1362)×10^6/L比(287 ±51)×10^6/L] (P<0.05);离心1次后,肝硬化腹腔积液组腹腔积液细胞计数为(9 ±3)×10^6/L,肝癌腹腔积液组腹腔积液细胞计数为(19 ±7)×10^6/L,2组差异无统计学意义(P>0.05);离心2次后,2组腹腔积液中细胞计数均为0.在质荷比为11 467、4 475时,肝癌腹腔积液组特征峰表达值均高于肝硬化腹腔积液组,7 852时,肝癌腹腔积液组特征峰表达值低于肝硬化腹腔积液组.SELDI-TOF-MS技术检测肝癌与肝硬化的灵敏度为81.5%(22/27),特异性为87.0%(40/46).结论 腹腔积液前期处理能满足SELDI-TOF-MS技术的要求,确立的标志蛋白组合模式的特异性及敏感度较高. 展开更多
关键词 原发性肝癌 蛋白质组学 表面加强激光解析电离飞行时间质谱 腹腔积液
循证医学在医学研究生科研能力培养中的作用 预览 被引量:2
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作者 潘新娟 王颖芳 +3 位作者 王萍 冯艳铭 吕姝焱 符幸涛 《西北医学教育》 2014年第3期500-501,541共3页
根据医学研究生的培养特点,作者及所在团队在医学研究生中开设了循证医学理论与实践课。通过教学团队指导教师的指导,结合学生的临床实践及其导师的研究方向,学生运用循证医学方法针对具体临床问题,开展资料检索、文献评价、分析文献、... 根据医学研究生的培养特点,作者及所在团队在医学研究生中开设了循证医学理论与实践课。通过教学团队指导教师的指导,结合学生的临床实践及其导师的研究方向,学生运用循证医学方法针对具体临床问题,开展资料检索、文献评价、分析文献、提取数据、综合分析、系统评价撰写等实践与训练。学生学习和掌握了循证思维与相关的科研方法,科研能力得到了提高。 展开更多
关键词 循证医学 研究生 科研能力
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一氧化氮和环磷酸鸟苷与分娩发动的关系 预览
9
作者 李锋 吕姝焱 《天津医药》 CAS 北大核心 2003年第9期 602-603,共2页
一氧化氮(NO)是近年来新发现的一种细胞信使分子,它与分娩发动的关系尚不清楚,本研究通过测定临产前后孕妇外周血一氧化氮和环磷酸鸟苷(cGMP)水平,探讨其在分娩发动过程中的作用.
关键词 一氧化氮 环磷酸鸟苷 分娩发动 子宫平滑肌活动
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肝肾淀粉样变性合并胃癌1例 预览
10
作者 张腊梅 王萍 +2 位作者 刘晓敏 郭虹 张英剑 《广东医学》 2018年第5期F0003-F0003,共1页
患者男,75岁。因腹胀、纳差、恶心、腹泻1年余,加重1个月,于2016年3月313入院。1年前患者因腹胀、纳差,伴恶心,间断腹泻,大便为黑色稀水样,3~47次/d,无呕吐、呕血,多次在当地医院按“胃炎”治疗,
关键词 肾淀粉样变性 胃癌 患者 腹胀 纳差 恶心 腹泻
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SELDI-TOF-MS技术在肝脏疾病腹腔积液差异蛋白研究中的应用 预览
11
作者 王萍 张英剑 +3 位作者 吕姝炎 潘新娟 张瑜 郭虹 《现代医药卫生》 2014年第7期1043-1044,共2页
目的:探讨表面加强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术在肝脏疾病腹腔积液差异蛋白研究中的应用价值。方法应用SELDI-TOF-MS技术对肝硬化及原发性肝癌患者腹腔积液蛋白质进行测定,应用质谱仪分析蛋白质波谱。结果原发性肝... 目的:探讨表面加强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术在肝脏疾病腹腔积液差异蛋白研究中的应用价值。方法应用SELDI-TOF-MS技术对肝硬化及原发性肝癌患者腹腔积液蛋白质进行测定,应用质谱仪分析蛋白质波谱。结果原发性肝癌与肝硬化患者腹腔积液相比,质荷比为7852、11467的蛋白质波峰强度明显增强,差异有统计学意义(P<0.05),该蛋白质组对于肝癌患者腹腔积液的灵敏度为83.56%,特异性为89.82%。结论质荷比为7852、11467的蛋白质谱对于肝癌腹腔积液患者具有特征性。 展开更多
关键词 蛋白质类 腹水 肝硬化 肝肿瘤 质谱分析法
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医学心理学中的教学改革模式探索 预览 被引量:3
12
作者 王萍 张英剑 +1 位作者 潘新娟 冯艳铭 《现代医药卫生》 2014年第9期1407-1408,共2页
医学心理学是医学和心理学相结合的交叉学科,其研究心理变量与健康或疾病变量之间的关系,研究医学领域中有关健康和疾病的心理行为问题。从医学的分支来看,医学心理学研究医学中的心理行为问题,包括各种患者的心理行为特点、各种疾... 医学心理学是医学和心理学相结合的交叉学科,其研究心理变量与健康或疾病变量之间的关系,研究医学领域中有关健康和疾病的心理行为问题。从医学的分支来看,医学心理学研究医学中的心理行为问题,包括各种患者的心理行为特点、各种疾病的心理行为变化等;从心理学的分支来看,医学心理学研究如何把心理学的系统知识和技术应用于医学各方面,包括在疾病过程中如何应用有关心理科学知识和技术问题等。病案导学式教学法是一种启发式教学法之一,是有利于教学质量提高的可行方法。所谓病案导学式教学法,就是在教师指导下,学生进行自学、自练的一种方法。其把学生在教学过程中的认知活动视为教学活动的主体,让学生用自己的智慧主动地去获取知识、发展各自的潜能,从而达到在充分发挥学生主动性的基础上,渗入教师的正确引导,使教学双方各尽其能、各得其所。该研究着重探讨病案导学式教学法在医学心理学教学中的应用以及教师和学生角色的构建。 展开更多
关键词 病案 教学方法 心理学 导学式
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