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藏绵羊HMOX1基因表达及其多态性与低氧适应性的关联分析
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作者 何建文 张伟 +4 位作者 刘秀 李少斌 王继卿 胡江 罗玉柱 《农业生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期441-448,共8页
血红素加氧酶1(heme oxygenase 1, HMOX1)是血红素加氧酶家族的应激诱导型酶,在机体低氧胁迫代谢调控过程中扮演着重要角色。藏绵羊(Ovis aries)在长期进化过程中形成了独特的低氧适应策略来维持自身的氧平衡。为了探讨HMOX1基因的组织... 血红素加氧酶1(heme oxygenase 1, HMOX1)是血红素加氧酶家族的应激诱导型酶,在机体低氧胁迫代谢调控过程中扮演着重要角色。藏绵羊(Ovis aries)在长期进化过程中形成了独特的低氧适应策略来维持自身的氧平衡。为了探讨HMOX1基因的组织表达及其第三外显子(Exon3)区域多态性与藏绵羊高原低氧适应的关系,以寻找与藏绵羊低氧适应相关的分子标记,本研究以不同海拔地区的藏绵羊和湖羊(对照组)为研究对象,利用q RT-PCR及PCR-单链构象多态性(PCR-single-strand conformation polymorphism, PCR-SSCP)方法检测HMOX1基因的组织表达,以及Exon3区域多态位点,分析不同基因型及等位基因与绵羊血液指标的相关性,以及SNPs与绵羊血液指标的关联性。结果表明,HMOX1基因在藏绵羊和湖羊各组织中均有表达。其中同一品种内,HMOX1在藏绵羊脾脏中高表达(P<0.01),其次在肝、肾脏和背最长肌中表达量也较高(P<0.05);而在湖羊中,HMOX1在肺脏和脂肪中高表达(P<0.01),其次在脾脏、肾脏及肝脏中的表达量也较高(P<0.05)。2个品种间同一组织表达比较结果显示,HMOX1基因在肺、脂肪中的表达量差异极显著(P<0.01)。HMOX1基因Exon3区检测到4个SNPs位点和A、B及C 3个等位基因;通过2个品种间不同基因型比较发现,湖羊的AB型个体血红蛋白含量(hemoglobin, HGB)和红细胞压积(hematokrit, HCT)值明显低于藏绵羊的其他基因型(P<0.01),藏绵羊的AA和BB型个体的HGB和HCT值显著高于AB型(P<0.01),AC型血氧饱和度(oxygen saturation, SO2)值显著高于AA和BB型个体;而c.3775G>A位点上MM基因型个体的SO2、HGB、HCT值显著高于NN基因型(P<0.05)。由此说明AA、BB和AC基因型的c.3775G>A位点变异与血液指标存在相关性,且为G时更有利于对低氧环境的适应。因此,HMOX1基因可作为低氧适应的候选基因,为探索藏绵羊低氧适应分子机制提供基础资料。 展开更多
关键词 藏绵羊 血红素加氧酶1基因(HMOX1) 组织表达 多态性 血液分析
DHPLC和PCR-SSCP两种方法筛查基因变异的比较 预览
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作者 赵芳芳 张鸣明 +1 位作者 罗玉柱 李少斌 《中国草食动物科学》 CAS 2019年第4期11-14,共4页
SNP(Single nucleotide polymorphism)被认为是揭示遗传变异最理想的遗传标记,广泛应用于疾病相关的基因筛查、动植物经济性状遗传标记、群体遗传进化等。目前,筛查SNP的方法很多,文章旨在比较DHPLC(Denaturing high performance liquid... SNP(Single nucleotide polymorphism)被认为是揭示遗传变异最理想的遗传标记,广泛应用于疾病相关的基因筛查、动植物经济性状遗传标记、群体遗传进化等。目前,筛查SNP的方法很多,文章旨在比较DHPLC(Denaturing high performance liquid chromatography)和PCR-SSCP(Polymerase chain reaction-single stranded conformational polymorphism)两种方法在筛查同一基因片段变异的效果,为筛查基因突变的方法提供选择依据。以绵羊孕酮受体基因(PGR)第4外显子为突变筛查对象,以DHPLC和PCR-SSCP两种方法筛查基因变异,以直接测序作为标准,对比分析两种方法在检出率、准确率、经济性和自动化程度等方面的优劣。结果表明:在对391份藏绵羊血液样品的PGR基因进行分析后,SSCP法检出率100%,而DHPLC法检出率仅83.63%;DHPLC法准确率97.25%,高于SSCP法的94.37%;同时操作性和自动化方面DHPLC法要优于SSCP法,但其检测成本比SSCP法高20倍左右;SSCP法应用的广泛性比DHPLC高许多,其中在畜牧和动物医学这两门学科中应用最多,而DHPLC法在人类医学研究中的应用较多。结论:DHPLC法适合运用于基因突变率低和已完全测出基因序列的物种,具有准确率高、操作简单和自动化程度高等优点;SSCP法对基因序列是否已知及突变率高低无要求,具有检出率高、成本低等优点,此法在动物育种领域中应用更为广泛。 展开更多
关键词 基因 突变 DHPLC PCR-SSCP
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绵羊STAT5a基因intron10和exon12遗传特征分析 预览
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作者 郝志云 王继卿 +4 位作者 赵孟丽 刘秀 李少斌 胡江 罗玉柱 《西北农林科技大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2019年第3期7-13,共7页
【目的】研究绵羊STAT5a基因第10内含子和第12外显子的遗传多态性和群体遗传特征。【方法】以2个多羔绵羊品种湖羊(140只)和多浪羊(144只)及单羔羊藏绵羊(217只)为研究对象,应用PCR-SSCP方法分析其STAT5a基因第10内含子和第12外显子的... 【目的】研究绵羊STAT5a基因第10内含子和第12外显子的遗传多态性和群体遗传特征。【方法】以2个多羔绵羊品种湖羊(140只)和多浪羊(144只)及单羔羊藏绵羊(217只)为研究对象,应用PCR-SSCP方法分析其STAT5a基因第10内含子和第12外显子的遗传多态性和群体遗传特征。【结果】绵羊STAT5a基因第10内含子发现13210A>G突变,检测到3种基因型(AA、AG和GG)和2个等位基因(A和G);第12外显子上发现14827A>G突变,该突变属于同义突变,检测到3种基因型(MM、MN和NN)和2个等位基因(M和N)。在绵羊STAT5a基因第10内含子和第12外显子中,杂合子AG和MN分别为优势基因型,基因型频率在多羔绵羊和单羔绵羊品种间差异极显著(P<0.01)。3个绵羊品种的多态信息含量均处于中度多态,藏绵羊的卡方值处于Hardy-Weinberg平衡状态,而湖羊和多浪羊偏离了Hardy-Weinberg平衡状态。【结论】绵羊STAT5a基因具有多态性,且基因型频率在不同产羔数品种间差异极显著(P<0.01)。 展开更多
关键词 绵羊 STAT5a基因 遗传多态性 PCR-SSCP
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藏绵羊PPARα基因遗传变异特征及组织表达分析
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作者 张亚强 刘秀 +4 位作者 李少斌 王继卿 胡江 郝志云 罗玉柱 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期1519-1524,共6页
PPARα(Peroxisome proliferator activated receptorsα)基因参与调控线粒体脂肪酸β氧化,在能量代谢中具有重要作用,是动物高原低氧适应的主要候选基因之一。本研究采用PCR-SSCP和测序方法检测2个品种(藏绵羊,湖羊) PPARα基因P1区核... PPARα(Peroxisome proliferator activated receptorsα)基因参与调控线粒体脂肪酸β氧化,在能量代谢中具有重要作用,是动物高原低氧适应的主要候选基因之一。本研究采用PCR-SSCP和测序方法检测2个品种(藏绵羊,湖羊) PPARα基因P1区核苷酸变异及遗传特征。采用实时荧光定量PCR (quantitative real-time PCR, qRT-PCR)检测藏羊与湖羊心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、骨骼肌6个组织的相对表达量。检测表明:在扩增区域发现2个SNPs (c.515-22A>G, c.515-10C>T)对应的等位基因A、B。基因频率在2个群体间具有统计学意义(p<0.01),藏绵羊的优势基因型为AB,湖羊优势基因型为AA。推测AB基因型个体可能更有利于藏绵羊适应高原低氧环境,可作为藏绵羊低氧适应选育的分子标记。PPARα基因在2个绵羊的6个组织中均有不同程度的表达且具有品种间差异性。PPARα基因在藏绵羊心脏的表达量极显著的低于其余5个组织(p<0.01),而2个品种间,藏绵羊各组织的表达量均低于湖羊,其中在心脏、肝脏、肺脏3个组织表达量极显著的低于湖羊(p<0.01)。本研究可丰富绵羊基因组学内容,为藏绵羊低氧适应研究提供基础数据。 展开更多
关键词 PPARα基因 遗传特征 组织表达 适应性
牦牛LPL基因组织表达及其突变与乳质性状的关联分析 预览
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作者 蒋艳艳 石斌刚 +6 位作者 陈彦丽 张海龙 丁考仁青 刘秀 王继卿 赵志东 胡江 《西北农林科技大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2019年第12期1-9,共9页
【目的】检测牦牛脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase,LPL)基因在不同组织中的表达量及其突变位点,评估基因突变对甘南牦牛乳质性状的影响,丰富牦牛乳质性状分子遗传数据。【方法】采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测甘南牦牛LPL基因在不同... 【目的】检测牦牛脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase,LPL)基因在不同组织中的表达量及其突变位点,评估基因突变对甘南牦牛乳质性状的影响,丰富牦牛乳质性状分子遗传数据。【方法】采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测甘南牦牛LPL基因在不同组织中的相对表达量;应用单链构象多态性(single strand conformation polymorphism,SSCP)技术检测LPL基因在青海牦牛、天祝白牦牛、甘南牦牛、西藏牦牛及野血牦牛5个群体中的突变,应用一般线性模型分析基因突变与甘南牦牛乳质性状的相关性。【结果】甘南牦牛LPL基因在皮下脂肪和心脏中高表达,在背最长肌、乳腺、肝脏、脾脏、肾脏、大肠、小肠、皱胃、瘤胃中低表达,在肺脏中表达量最低。在5个牦牛群体LPL基因的exon 3区,exon 6区和exon 7区均未检测到多态性,在intron 2区检测到2处单碱基突变,形成M和N 2种等位基因,其中M为优势等位基因(频率为67.11%~83.21%);在exon 4-intron 4区也检测到2处单碱基突变,形成A和B 2种等位基因,其中等位基因A为西藏牦牛优势等位基因(频率为63.95%),其他4类群牦牛中B为优势等位基因(频率59.75%~69.71%)。5个类群牦牛LPL基因在intron 2区和exon4-intron 4区为中低度多态。关联分析表明,甘南牦牛LPL基因intron 2区基因型MM个体、exon 4-intron 4区基因型AB个体和两区域单倍型组合H1H2(M-A/M-B)的乳脂率、乳蛋白率及总固体物质含量均高于其他个体,且乳脂率显著高于其他个体(P<0.05)。【结论】5个类群牦牛LPL基因intron 2区和exon4-intron 4区各存在2处单碱基突变,且显著影响了甘南牦牛的乳脂率,可作为牦牛乳脂性状潜在的遗传标记。 展开更多
关键词 牦牛 LPL基因 组织表达 多态性分析 乳质性状
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牦牛FABP3基因组织表达、多态性及其对胴体和肉质性状的影响
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作者 胡江 曹健 +6 位作者 张丽 赵志东 王继卿 刘秀 李少斌 陈金林 罗玉柱 《农业生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1025-1033,共9页
心脏型脂肪酸结合蛋白(heart fatty acid-binding protein, FABP3)参与肌肉中脂肪酸吸收和胞内转运,通过影响肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量进而影响肌肉嫩度和多汁性。本研究采用qRT-PCR及单链构象多态性(single strand conforma... 心脏型脂肪酸结合蛋白(heart fatty acid-binding protein, FABP3)参与肌肉中脂肪酸吸收和胞内转运,通过影响肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量进而影响肌肉嫩度和多汁性。本研究采用qRT-PCR及单链构象多态性(single strand conformation polymorphism, SSCP)方法,检测牦牛(Bos grunniens)FABP3基因组织表达和突变位点,分析基因突变对胴体及肉质性状的影响。结果表明,甘南牦牛FABP3基因在16个检测组织中相对表达量依次为心脏>背最长肌>回肠>胰腺>盲肠>空肠>其他组织,且心脏中相对表达量显著高于其他组织(P<0.05)。牦牛FABP3基因5'-UTR、intron 1区各检测到1处突变,而intron 2区检测到5处突变;甘南牦牛5'-UTR-intron 1区突变影响胴体重、肌肉嫩度及熟肉率(P<0.05),等位基因B1能极显著增加胴体重、降低肌肉剪切力值(P<0.01),等位基因C1能极显著降低胴体重和熟肉率(P<0.01)。本研究为牦牛肉质性状分子遗传提供基础数据。 展开更多
关键词 牦牛 心脏型脂肪酸结合蛋白(FABP3)基因 组织表达 胴体性状 肉质性状
牦牛ACSL1基因启动子多态性及其与乳品质性状的关联分析
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作者 赵志东 田宏山 +6 位作者 蒋艳艳 石斌刚 刘秀 李旭鹏 王登哲 陈金林 胡江 《农业生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1596-1603,共8页
长链脂酰辅酶A合成酶1 (long chain acyl-CoA synthetase 1, ACSL1)在甘油三酯、磷脂、胆固醇酯的合成及脂肪酸氧化中起关键作用,是乳品质性状的重要候选基因。牦牛(Bos grunniens)乳营养丰富,乳脂率高;但受分布地域环境、经济及生产条... 长链脂酰辅酶A合成酶1 (long chain acyl-CoA synthetase 1, ACSL1)在甘油三酯、磷脂、胆固醇酯的合成及脂肪酸氧化中起关键作用,是乳品质性状的重要候选基因。牦牛(Bos grunniens)乳营养丰富,乳脂率高;但受分布地域环境、经济及生产条件制约,对其乳品质性状的遗传机理研究较少。本研究以甘南牦牛为研究对象,采用DNA测序方法,检测牦牛ACSL1基因启动子区多态位点,分析不同基因型、组合单倍型与甘南牦牛乳品质性状的相关性。结果表明,甘南牦牛群体ACSL1基因启动子区存在g.2079A>T、g.2409G>A突变和g.1235_g.1236delTG插入/缺失突变。ACSL1基因启动子F1区,基因型MN牦牛个体的乳蛋白率显著高于MM型(P<0.05),基因型BB牦牛个体的总固体物质含量、乳脂率显著高于AA和AB型(P<0.05);启动子F2区,基因型DD牦牛个体的乳脂率显著高于CC型(P<0.05);构建8种潜在的单倍型和5种组合单倍型,其中组合单倍型H4H4乳脂率和总固体物质含量最高,且显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)高于其他组合单倍型。因此,牦牛ACSL1基因启动子区突变可作为甘南牦牛乳品质性状潜在的分子遗传标记,进而为丰富牦牛乳品质性状分子遗传研究提供理论依据。 展开更多
关键词 牦牛 长链脂酰辅酶A合成酶1基因(ACSL1) 启动子多态性 乳品质性状 分子标记
绵羊KRTAP20-1基因变异及其在不同组织的表达特征 预览
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作者 李涛 李少斌 +3 位作者 王继卿 刘秀 胡江 罗玉柱 《西北农林科技大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2019年第12期28-34,共7页
【目的】研究角蛋白关联蛋白(keratin-associated proteins,KAPs)编码基因的遗传变异对绒毛性状的影响,以丰富绵羊功能基因组学并开发基因标记。【方法】采用PCR-SSCP和DNA测序技术,检测KAP20-1编码基因(KRTAP20-1)在甘肃高山细毛羊(细... 【目的】研究角蛋白关联蛋白(keratin-associated proteins,KAPs)编码基因的遗传变异对绒毛性状的影响,以丰富绵羊功能基因组学并开发基因标记。【方法】采用PCR-SSCP和DNA测序技术,检测KAP20-1编码基因(KRTAP20-1)在甘肃高山细毛羊(细毛羊)、青海半细毛羊(半细毛羊)和藏绵羊(粗毛羊)3个群体中的变异情况;利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,检测KRTAP20-1基因在甘肃高山细毛羊、小尾寒羊(粗毛羊)成年母羊和羔羊不同组织中的表达情况。【结果】3个绵羊群体KRTAP20-1基因共检测到4个SNPs,其中3个为非同义突变导致氨基酸的改变(P.Gly10Ser、P.Tyr29Phe和P.Ser61Gly),1个为同义突变。等位基因A在3个绵羊群体中均为优势等位基因,其余3个等位基因在不同绵羊群体中分布差异较大。甘肃高山细毛羊KRTAP20-1基因的遗传杂合度、有效等位基因数和多态信息含量均高于其他2个群体。KRTAP20-1基因只在绵羊皮肤中表达,在其他组织中均无表达;在小尾寒羊和甘肃高山细毛羊2个群体中,羔羊皮肤组织中KRTAP20-1表达量均高于母羊,且在小尾寒羊皮肤组织中的表达量高于同期甘肃高山细毛羊,即表现出明显的群体差异性和时空差异性。【结论】绵羊KRTAP20-1基因在不同用途毛用绵羊中的等位基因分布差异及组织表达的种群特异性和时空特异性提示,该基因对羊毛相关性状的形成和表型均有影响。 展开更多
关键词 绵羊 KRTAP20-1基因 基因表达 羊毛性状
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藏绵羊HMOX2基因克隆、表达及其耐低氧适应性进化分析 被引量:1
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作者 何建文 刘秀 +3 位作者 李少斌 王继卿 胡江 罗玉柱 《农业生物技术学报》 CSCD 北大核心 2018年第11期1890-1899,共10页
血红素加氧酶2(heme oxygenase 2, HMOX2)是血红素加氧酶家族的组成性亚型成员,HMOX2在机体低氧胁迫代谢调控过程中扮演着重要角色。本研究为了探讨HMOX2在高原动物低氧适应机制中的作用,采用反转录PCR (reverse transcription PCR... 血红素加氧酶2(heme oxygenase 2, HMOX2)是血红素加氧酶家族的组成性亚型成员,HMOX2在机体低氧胁迫代谢调控过程中扮演着重要角色。本研究为了探讨HMOX2在高原动物低氧适应机制中的作用,采用反转录PCR (reverse transcription PCR, RT-PCR)技术克隆藏绵羊(Ovis aries) HMOX2基因的CDS全长序列并对其进行了生物信息学分析,对高海拔的藏绵羊和低海拔的湖羊(对照)血气指标进行对比分析,并利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR, qRT-PCR)技术分析HMOX2基因在藏绵羊和湖羊不同组织中的表达差异。结果表明,藏绵羊HMOX2基因(GenBank No. MH358397)CDS区全长1 005 bp,编码344个氨基酸,构成具有结构域的跨膜亲水性非分泌蛋白。同源性分析结果表明:藏绵羊HMOX2氨基酸序列与绵羊、山羊(Capra hircu)、藏羚羊(Pantholops hodgsonii)的同源性最近,为99%,其次是瘤牛(Bos indicus)、黄牛(Bos taurus)、猪(Sus scrofa),分别为97%、97%、84%,与人(Homo sapiens)的同源性最远,为80%。两品种间血气分析指标比较结果显示,藏绵羊氧分压P(O2)、二氧化碳分压P(CO2)、碳酸氢根(HCO3-)、血氧饱和度(SpO2)极显著低于湖羊(P<0.01);藏绵羊血红蛋白含量(hemoglobin, HGB)和红细胞积压(hematokrit, HCT)极显著高于湖羊(P<0.01);qRT-PCR结果显示,HMOX2基因在两个绵羊品种中均有表达,藏绵羊心、肺中的表达量极显著高于湖羊(P<0.01);在肝、背最长肌及脂肪中表达量显著高于湖羊(P<0.05)。通过对藏绵羊和湖羊心、肺HMOX2基因表达量与血红蛋白含量的相关性分析表明,藏绵羊HMOX2基因表达量与血红蛋白含量呈显著正相关,相关系数为0.535 (P<0.05),湖羊HMOX2基因表达量与血红蛋白含量呈负相关,相关系数为-0.097 (P>0.05)。因此,HMOX2基因的低氧特异表达可� 展开更多
关键词 藏绵羊 血红素加氧酶2基(HMOX2) 组织表达 适应性进化
中国地方绵羊群体TYRP 1基因遗传变异研究 预览
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作者 杨广礼 付冬丽 +3 位作者 郎侠 王玉涛 王乾坤 罗玉柱 《中国畜牧兽医》 北大核心 2018年第10期2772-2786,共15页
本研究旨在了解酪氨酸酶相关蛋白1(tyrosinase related protein 1,TYRP1)基因在中国地方绵羊群体内的遗传变异,以及TYRP 1基因突变与不同毛色表型绵羊群体的相关性。通过直接测序法和PCR-RFLP技术对10个中国地方绵羊群体进行单核苷酸多... 本研究旨在了解酪氨酸酶相关蛋白1(tyrosinase related protein 1,TYRP1)基因在中国地方绵羊群体内的遗传变异,以及TYRP 1基因突变与不同毛色表型绵羊群体的相关性。通过直接测序法和PCR-RFLP技术对10个中国地方绵羊群体进行单核苷酸多态性(SNP)检测,利用Beagle、PLINK和POPGENE等软件对突变位点数据进行单倍型构建、连锁不平衡分析和遗传变异研究。突变位点检测结果表明,在绵羊TYRP 1基因内识别了13个SNPs,其中位于TYRP 1基因外显子上的10个SNPs位点,除个别位点在大尾寒羊、中国美利奴羊和岷县黑裘皮羊中没有发生突变外,其他突变位点在所有绵羊品种中均出现不同程度变异,说明中国地方绵羊群体具有较高的遗传多样性。单倍型分析结果表明,所有样本中共有42个单倍型,优势单倍型0000000000(245/918)、0100000001(91/918)在所有绵羊群体中均存在,除单倍型0101100000(93/918)在中国美利奴羊中没有出现,单倍型0001000001(69/918)在岷县黑裘皮羊、哈萨克羊群体中没有出现外,在其他群体中均存在。连锁分析结果表明,10个SNPs在所有样本中均存在2个连锁模块。群体遗传变异分析表明,中国地方绵羊群体具有较高水平的群体内遗传变异,各绵羊品种间存在明显的遗传分化模式,且各品种遗传关系与其品种传统分类结果基本一致。本研究为进一步研究TYRP 1基因对绵羊毛色遗传性状的影响提供了参考依据。 展开更多
关键词 绵羊 TYRP 1基因 单核苷酸多态性(SNP) 遗传变异 被毛表型
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牦牛KAP6-1和KAP6-4基因序列变异分析 被引量:1
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作者 石斌刚 谢建鹏 +4 位作者 胡江 高小莉 罗玉柱 李少斌 石红梅 《基因组学与应用生物学》 CSCD 北大核心 2018年第4期1383-1392,共10页
角蛋白关联蛋白(keratin-associated proteins,KAPs)是毛纤维的主要结构成分。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛和野血牦牛为研究对象,应用PCR-SSCP方法检测KAP6-1和KAP6-4基因外显子序列多态性。结果表明4个牦牛群体的KAP6-1基因外... 角蛋白关联蛋白(keratin-associated proteins,KAPs)是毛纤维的主要结构成分。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛和野血牦牛为研究对象,应用PCR-SSCP方法检测KAP6-1和KAP6-4基因外显子序列多态性。结果表明4个牦牛群体的KAP6-1基因外显子区存在c.42T〉C、c.135C〉T的同义突变及c.173G〉C、c.175G〉T的非同义突变,导致p.Cys58Ser和p.Gly59Cys的氨基酸残基改变;另外检测到1处45 bp的插入/缺失突变导致16个氨基酸残基的插入/缺失;甘南牦牛PIC值0.222 3为低度多态,其他3个牦牛群体PIC值0.393 4~0.4672为中度多态。牦牛KAP6-4基因外显子区检测到c.51C〉T、c.54C〉A、c.78T〉C、c.96T〉C和c.135T〉C的同义突变,以及c.118A〉G的非同义突变,导致编码的氨基酸残基p.Ser40Gly的改变;4类群牦牛PIC值为0.2658~0.387 2为中度多态。聚类分析表明牦牛KAP6-1基因外显子区碱基序列与普通牛、绵羊和山羊的同源性最高,其亲缘关系和系统进化远近一致。 展开更多
关键词 牦牛 KAP6-1基因 KAP6-4基因 多态性
世界羊毛业现状和发展趋势 预览
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作者 李少斌 《养殖与饲料》 2018年第11期5-8,共4页
羊毛是人类在纺织史上最早利用的天然纤维之一,羊毛业是一门古老而充满生机的产业。人造纤维的发展对羊毛业造成巨大冲击,如何提高羊毛产品的市场竞争力是羊毛业亟待解决的问题。文章回顾了羊毛业的形成和发展,从宏观和微观角度分析了... 羊毛是人类在纺织史上最早利用的天然纤维之一,羊毛业是一门古老而充满生机的产业。人造纤维的发展对羊毛业造成巨大冲击,如何提高羊毛产品的市场竞争力是羊毛业亟待解决的问题。文章回顾了羊毛业的形成和发展,从宏观和微观角度分析了国际羊毛业的现状,结合市场需求得出世界羊毛业的发展趋势:市场对超细毛的需求增加,羊毛业向规模化、标准化和品牌化方向发展,新技术助力羊毛业发展。 展开更多
关键词 羊毛 羊毛业 超细毛 品牌化 发展趋势
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中国和新西兰绵羊群体FABP4基因遗传特性比较分析
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作者 闫伟 刘海霞 +4 位作者 张力 韩大勇 朱爱文 赵旭庭 罗玉柱 《中国农业科技导报》 CSCD 北大核心 2018年第9期40-48,共9页
脂肪型脂肪酸结合蛋白(adipocyte fatty-acid binding protein,A-FABP)在家畜脂肪沉积中发挥重要作用,但在藏绵羊群体中的遗传特性和特异的作用机制尚不明确,研究不同生产方向绵羊品种的FABP4基因变异及分布有助于揭示藏绵羊独特的种... 脂肪型脂肪酸结合蛋白(adipocyte fatty-acid binding protein,A-FABP)在家畜脂肪沉积中发挥重要作用,但在藏绵羊群体中的遗传特性和特异的作用机制尚不明确,研究不同生产方向绵羊品种的FABP4基因变异及分布有助于揭示藏绵羊独特的种质特性。应用PCR-SSCP(polymerase chain reaction-single strand conformation polymerase)和测序技术检测了中国和新西兰共10个绵羊群体(575只个体)FABP4基因编码区(外显子2和外显子3)的变异,并分析其连锁不平衡状态。结果表明,两多态区域共鉴定8处单核苷酸突变,两多态区域SNPs间呈弱连锁不平衡状态(D'=0.548,r2=0.119),鉴定14种潜在的单体型。外显子2-内含子2区域A1为优势等位基因(38.4%),A1B1为优势基因型;外显子3-内含子3区域B2为优势等位基因(48.3%),A2B2为优势基因型。新西兰绵羊群体在两多态区域偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P〈0.01),而藏绵羊处于Hardy-Weinberg平衡状态(P〉0.05)。罗姆尼与派仑代群体基因型分布无显著差异(P〉0.05),美利奴与考力代群体基因型分布差异显著(P〈0.05)。新西兰绵羊群体两多态区域均为高杂合度及高度多态,藏绵羊群体均为高纯合度及中度多态。聚类分析表明欧拉和甘伽羊、考力代和美利奴羊、罗姆尼和派仑代羊分别聚在一起。c.246+37A〉G和c.348+298T〉C位点多态性在藏绵羊和新西兰绵羊群体中分布差异较大,该两处SNPs可作为潜在的分子标记应用于藏绵羊肌内脂肪含量性状选育。 展开更多
关键词 藏绵羊 FABP4基因 遗传特性
牦牛DGAT2基因intron5和intron6多态性及其对乳品质性状的影响 被引量:2
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作者 谢建鹏 石斌刚 +5 位作者 胡江 罗玉柱 刘秀 高小莉 才让闹日 赵光平 《农业生物技术学报》 CSCD 北大核心 2017年第5期758-769,共12页
乳脂是乳的重要组成部分,高乳脂率是牦牛(Bos grunniens)乳的主要特征。二酰基甘油酰基转移酶2(diacylglycerol acyltransferase 2, DGAT2)调控乳中甘油三酯(triacylglyceride,TRIG)合成,是乳脂肪性状的重要候选基因。本实验应... 乳脂是乳的重要组成部分,高乳脂率是牦牛(Bos grunniens)乳的主要特征。二酰基甘油酰基转移酶2(diacylglycerol acyltransferase 2, DGAT2)调控乳中甘油三酯(triacylglyceride,TRIG)合成,是乳脂肪性状的重要候选基因。本实验应用聚合酶链式反应-单链构象多态性(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism, PCR-SSCP)技术检测甘南牦牛、天祝白牦牛及大通牦牛DGAT2基因多态性,并分析基因突变对甘南牦牛乳品质性状影响。结果表明,三类群牦牛在DGAT2基因intron5区检测到A1、B1、C1 3种等位基因,存在c.613-214 A>G和c.613-337 C>A的SNPs;intron6区检测到A2、B2、C2 3种等位基因,存在c.787+616 G>A和c.787+691 T>G的SNPs;三类群牦牛DGAT2基因两区域均表现为中度多态,4个突变位点在群体中形成7种单倍型,各位点间存在连锁关系且接近于连锁平衡。甘南牦牛DGAT2基因intron5区突变影响乳脂率,第2胎携带等位基因B1的个体乳脂率显著高于未携带个体(P<0.05); intron6区突变影响乳脂率、乳蛋白率及总固体物质含量,携带等位基因A2的个体乳脂率、总固体物质含量较高且第2胎母牦牛显著高于未携带者(P<0.05),即选留携带等位基因A的个体有增加后代群体乳脂率及总固体物质含量的趋势;第2胎母牦牛基因型A2C2个体乳蛋白率最高,且A2C2、B2B2型个体显著高于其他基因型(P<0.05);单倍型H1H3个体的乳品质性状也高于其他单倍型。DGAT2基因intron5和intron6区突变可作为甘南牦牛乳品质性状潜在的遗传标记。本研究为牦牛乳品质性状候选基因分子遗传研究积累数据。 展开更多
关键词 牦牛 DGAT2基因 多态性 单倍型 乳品质性状
牦牛DGAT1基因组织表达及其突变与乳品质性状的关联分析 被引量:1
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作者 高小莉 赵志东 +6 位作者 石斌刚 谢建鹏 刘秀 马桂琳 杨耀 胡江 郭淑珍 《农业生物技术学报》 CSCD 北大核心 2017年第9期1443-1450,共8页
二酰基甘油酰基转移酶1(diacylglycerol acyltransferase 1,DGAT1)作为乳脂性状的重要候选基因,是合成甘油三酯的关键酶。牦牛(Bos grunniens)乳营养丰富,乳脂含量较高;但受分布局域环境、经济及生产条件制约,对其乳品质性状遗传机... 二酰基甘油酰基转移酶1(diacylglycerol acyltransferase 1,DGAT1)作为乳脂性状的重要候选基因,是合成甘油三酯的关键酶。牦牛(Bos grunniens)乳营养丰富,乳脂含量较高;但受分布局域环境、经济及生产条件制约,对其乳品质性状遗传机理研究较少。本研究采用q RT-PCR及单链构象多态性(single strand conformation polymorphism,SSCP)方法,检测牦牛DGAT1基因组织表达,以及3’-UTR和exon8区域多态位点,分析不同基因型及等位基因与甘南牦牛乳品质性状的相关性。结果表明,甘南牦牛DGAT1基因在乳腺、背最长肌、心脏和皮下脂肪高度表达,在肾脏、小肠和大肠中度表达,在脾脏表达最低;4个牦牛群体中DGAT1基因3’-UTR均检测到c.*197 T〉C的突变,基因型FF个体乳脂率显著高于基因型EE和EF(P〈0.05),携带等位基因E的个体乳脂率和总固体物质百分含量显著低于未携带者(P〈0.01或P〈0.05);甘南牦牛和天祝白牦牛exon 8区检测到c.691-c.692 AA〉GC(K232A)的双碱基突变,等位基因K为优势等位基因,青海牦牛及野血牦牛该区域内未检测到多态性,推测等位基因K的存在有利于增加牦牛乳脂率。研究结果表明,DGAT1基因3’-UTR区域对牦牛乳质性状有一定的基因效应。本研究可为牦牛乳品质性状分子遗传研究提供基础数据。 展开更多
关键词 牦牛 二酰基甘油酰基转移酶1基因(DGAT1) 组织表达 多态性 乳品质性状
牦牛DGAT1基因多态性及其与乳质性状关联分析 预览 被引量:2
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作者 高小莉 胡江 +5 位作者 郭淑珍 石斌刚 谢建鹏 罗玉柱 王继卿 牟永娟 《中国农业科学》 CSCD 北大核心 2017年第16期3215-3225,共11页
[目的]检测牦牛DGAT1基因多态性,评估基因突变对牦牛乳品质性状的影响,以期丰富牦牛重要经济性状的分子遗传研究基础。[方法]采用PCR-SSCP方法,检测甘南牦牛、天祝白牦牛、青海牦牛及野血牦牛DGAT1基因intron5-exon7和intron15-exon17... [目的]检测牦牛DGAT1基因多态性,评估基因突变对牦牛乳品质性状的影响,以期丰富牦牛重要经济性状的分子遗传研究基础。[方法]采用PCR-SSCP方法,检测甘南牦牛、天祝白牦牛、青海牦牛及野血牦牛DGAT1基因intron5-exon7和intron15-exon17区突变,分析基因突变对乳品质性状的影响。[结果]牦牛DGAT1基因intron5-exon7区发现c.562+32_c.562+33ins CCGCCC的插入/缺失,等位基因M、基因型MM频率最高为优势等位基因和基因型,各类群牦牛PIC〈0.5属中度或低度多态;intron15-exon17区检测到c.1249-23C〉T和c.1336C〉T的突变,其中exon17发现的c.1336C〉T突变导致编码氨基酸p.Arg447Cys转变,等位基因A频率最高为优势等位基因,甘南牦牛、天祝白牦牛和青海牦牛中基因型AA为优势基因型,野血牦牛基因型AB为优势基因型,各类群牦牛0.25T突变和c.1336C〉T的非同义突变。intron15-exon17区突变影响甘南牦牛乳品质性状,选留携带等位基因A的个体和淘汰携带等位基因B的个体、或选留H1H3单倍型组合及淘汰H2H2单倍型组合个体,均可显著改善后代群体的乳品质。 展开更多
关键词 牦牛 DGAT1基因 多态性 乳品质性状
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藏绵羊DQA座位基因的适应性进化研究
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作者 刘秀 胡江 +4 位作者 王继卿 李少斌 李文浩 焦丹 罗玉柱 《农业生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期1039-1046,共8页
主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)是脊椎动物重要的功能基因家族之一,其所编码的MHC分子具有维持机体世代适应环境变化的能力和功能,是研究动物适应性进化研究的最佳遗传标记。本研究选择青藏高原的主要... 主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)是脊椎动物重要的功能基因家族之一,其所编码的MHC分子具有维持机体世代适应环境变化的能力和功能,是研究动物适应性进化研究的最佳遗传标记。本研究选择青藏高原的主要畜种资源——藏绵羊(Ovis aries)为研究对象,利用聚合酶链式反应-单链构象多态(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCRSSCP)技术对甘肃(欧拉,乔科和甘加型)和青海(青海欧拉型和青海高原型)的5个藏绵羊生态群体的DQA座位基因遗传特征进行研究,以期揭示其与藏绵羊高原适应性进化的机制;结果在藏绵羊DQA座位的2个基因中发现了33个等位基因和125个核苷酸变异位点,表明5个生态群体藏绵羊的DQA座位基因均具有丰富的多态性;分析证明平衡选择是维持藏绵羊DQA座位基因多态性的主要机制之一,甘肃和青海5个藏绵羊生态群体DQA座位基因区域之间的变化(among groups)小于同一区域不同群体间的变化(among population with groups),进一步说明藏绵羊DQA座位基因发生了正选择作用和适应性进化。研究结果将为藏绵羊的遗传改良和种质创新提供基础数据。 展开更多
关键词 DQA基因 适应性进化 平衡选择 藏绵羊
甘肃高山细毛羊肉用性能杂交改良效果分析 预览 被引量:2
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作者 朱建勋 王继卿 +5 位作者 周智德 胡江 李少斌 刘秀 闫伟 罗玉柱 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期62-66,共5页
以黑萨福克、邦德和无角陶赛特3个国外优良绵羊品种作为父本,对甘肃高山细毛羊进行肉用性能杂交改良(各杂种后代分别简称"黑萨甘细"、"邦甘细"和"陶甘细"),并以甘肃高山细毛羊纯繁羔羊(简称"甘高细")作为对照组,研究各杂交... 以黑萨福克、邦德和无角陶赛特3个国外优良绵羊品种作为父本,对甘肃高山细毛羊进行肉用性能杂交改良(各杂种后代分别简称"黑萨甘细"、"邦甘细"和"陶甘细"),并以甘肃高山细毛羊纯繁羔羊(简称"甘高细")作为对照组,研究各杂交组合及对照组羔羊在6月龄前的生长性能和产肉效果。结果表明,黑萨甘细、邦甘细和陶甘细的1~2月龄体质量、6月龄体质量和全期(初生~6月龄)平均日增量均明显高于对照组,黑萨甘细、邦甘细和陶甘细的6月龄体质量达到38.11 kg、37.39 kg和36.60 kg,分别比对照组高出6.75 kg、6.03 kg和5.24 kg(P〈0.01)。黑萨甘细的6月龄体质量、断奶后平均日增量、全期平均日增量和6月龄胴体质量均最大,其6月龄胴体质量为16.36 kg,比邦甘细和陶甘细高出1.21 kg和0.96 kg(P〉0.05),比甘高细高出3.36 kg(P〈0.01)。由此表明,这3个国外优良品种都能明显改善甘肃高山细毛羊的生长速度和肉用性能,其中黑萨福克的改良效果最佳。 展开更多
关键词 甘肃高山细毛羊 肉用性能 杂交改良
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饲喂全价颗粒饲料对子午岭黑山羊生产性能的影响 预览 被引量:4
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作者 张天能 王继卿 +6 位作者 谢文章 苟占发 胡江 刘秀 李少斌 闫伟 罗玉柱 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期52-57,共6页
为建立羔羊短期最佳经济育肥饲养模式,以子午岭黑山羊羔羊作为研究对象,采用全价颗粒饲料(试验组)和当地配合饲料(对照组)进行短期育肥试验,观测其生长性能、屠宰性能和肉品质。生长结果表明:试验组羔羊的生长性能、胴体重和屠... 为建立羔羊短期最佳经济育肥饲养模式,以子午岭黑山羊羔羊作为研究对象,采用全价颗粒饲料(试验组)和当地配合饲料(对照组)进行短期育肥试验,观测其生长性能、屠宰性能和肉品质。生长结果表明:试验组羔羊的生长性能、胴体重和屠宰性能均高于对照组(P〉0.05),试验组和对照组的育肥期增重分别是5.15kg和4.51kg,胴体重分别是10.54kg和9.88kg,屠宰率分别是49.63%和48.31%。肉品质测定结果表明:试验组的部分肉品质优于对照组,试验组的失水率比对照组低5.4%(P〈0.01),熟肉率比对照组高8.15%(P〈0.01)。经济效益分析结果表明:试验组每只羔羊的纯收益较对照组高16元。由此说明,用全价颗粒饲料锕期育肥子午岭黑111羊萋羊的神果拧优. 展开更多
关键词 子午岭黑山羊 羔羊 舍饲育肥 屠宰性能 肉品质
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不同杂交组合肉牛产肉性能比较分析 预览 被引量:5
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作者 闫伟 罗玉柱 +4 位作者 李少斌 李文彬 宋积锁 朱建勋 胡江 《中国牛业科学》 2016年第1期18-22,共5页
[目的]利用杂种优势是提高肉牛产肉性能的重要方式,而杂交组合筛选是杂种优势利用的关键环节。[方法]本试验选择10-12月龄利杂牛(利木辛♂×秦川牛♀)、西杂牛(西门塔尔♂×秦川牛♀)、南杂牛(南德温♂×秦川牛♀)、... [目的]利用杂种优势是提高肉牛产肉性能的重要方式,而杂交组合筛选是杂种优势利用的关键环节。[方法]本试验选择10-12月龄利杂牛(利木辛♂×秦川牛♀)、西杂牛(西门塔尔♂×秦川牛♀)、南杂牛(南德温♂×秦川牛♀)、秦川牛和秦杂牛(秦川牛♂×本地牛♀)5组共26头牛集中肥育12个月后屠宰,比较分析不同杂交组合后代生长速度和屠宰性能。[结果]表明,利杂牛和西杂牛全期平均日增重分别为0.76Kg和0.78Kg,高于其它杂种牛和秦川牛但无显著差异(P〉0.05)。利杂牛育肥12个月后体高和体斜长显著高于西杂牛,腿臀围显著高于秦川牛(P〈0.05)。利杂牛屠宰率和净肉率分别为61.1%和44.4%,在5组肥育牛中最高。秦杂牛骨肉比显著低于利杂和南杂牛,南杂牛胴体产肉率显著低于秦川牛(P〈0.05)。5组杂种肉牛胴体产出的高档肉比例无显著差异,而利杂牛、西杂牛优质肉比例最高且显著高于秦杂牛。[结论]综合分析表明,利木辛为父本、秦川牛为母本的利杂牛产肉性能相对最好,可作为较优杂交组合推广利用。 展开更多
关键词 肉牛 杂交组合 生长速度 屠宰性能
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